--- trunk/phylmd/clmain.f	2014/07/07 17:45:21	101
+++ trunk/Sources/phylmd/clmain.f	2015/06/18 12:23:44	149
@@ -19,13 +19,13 @@
 
     ! Tout ce qui a trait aux traceurs est dans "phytrac". Le calcul
     ! de la couche limite pour les traceurs se fait avec "cltrac" et
-    ! ne tient pas compte de la différentiation des sous-fractions de
-    ! sol.
+    ! ne tient pas compte de la diff\'erentiation des sous-fractions
+    ! de sol.
 
-    ! Pour pouvoir extraire les coefficients d'échanges et le vent
-    ! dans la première couche, trois champs ont été créés : "ycoefh",
-    ! "zu1" et "zv1". Nous avons moyenné les valeurs de ces trois
-    ! champs sur les quatre sous-surfaces du modèle.
+    ! Pour pouvoir extraire les coefficients d'\'echanges et le vent
+    ! dans la premi\`ere couche, trois champs ont \'et\'e cr\'e\'es : "ycoefh",
+    ! "zu1" et "zv1". Nous avons moyenn\'e les valeurs de ces trois
+    ! champs sur les quatre sous-surfaces du mod\`ele.
 
     use clqh_m, only: clqh
     use clvent_m, only: clvent
@@ -38,6 +38,7 @@
     USE dimsoil, ONLY: nsoilmx
     use hbtm_m, only: hbtm
     USE indicesol, ONLY: epsfra, is_lic, is_oce, is_sic, is_ter, nbsrf
+    use stdlevvar_m, only: stdlevvar
     USE suphec_m, ONLY: rd, rg, rkappa
     use ustarhb_m, only: ustarhb
     use vdif_kcay_m, only: vdif_kcay
@@ -56,11 +57,13 @@
     INTEGER, INTENT(IN):: jour ! jour de l'annee en cours
     REAL, intent(in):: rmu0(klon) ! cosinus de l'angle solaire zenithal     
     REAL, intent(in):: co2_ppm ! taux CO2 atmosphere
-    REAL, INTENT(IN):: ts(klon, nbsrf) ! input-R- temperature du sol (en Kelvin)
+    REAL, INTENT(IN):: ts(klon, nbsrf) ! temperature du sol (en Kelvin)
     REAL, INTENT(IN):: cdmmax, cdhmax ! seuils cdrm, cdrh
     REAL, INTENT(IN):: ksta, ksta_ter
     LOGICAL, INTENT(IN):: ok_kzmin
-    REAL ftsoil(klon, nsoilmx, nbsrf)
+
+    REAL, INTENT(inout):: ftsoil(klon, nsoilmx, nbsrf)
+    ! soil temperature of surface fraction
 
     REAL, INTENT(inout):: qsol(klon)
     ! column-density of water in soil, in kg m-2
@@ -83,7 +86,7 @@
 
     REAL, INTENT(IN):: solsw(klon, nbsrf), sollw(klon, nbsrf)
     REAL fder(klon)
-    REAL, INTENT(IN):: rlat(klon) ! latitude en degrés
+    REAL, INTENT(IN):: rlat(klon) ! latitude en degr\'es
 
     REAL rugos(klon, nbsrf)
     ! rugos----input-R- longeur de rugosite (en m)
@@ -99,8 +102,7 @@
     REAL, intent(out):: d_u(klon, klev), d_v(klon, klev)
     ! changement pour "u" et "v"
 
-    REAL d_ts(klon, nbsrf)
-    ! d_ts-----output-R- le changement pour "ts"
+    REAL, intent(out):: d_ts(klon, nbsrf) ! le changement pour "ts"
 
     REAL flux_t(klon, klev, nbsrf), flux_q(klon, klev, nbsrf)
     ! flux_t---output-R- flux de chaleur sensible (CpT) J/m**2/s (W/m**2)
@@ -217,7 +219,7 @@
     INTEGER ni(klon), knon, j
 
     REAL pctsrf_pot(klon, nbsrf)
-    ! "pourcentage potentiel" pour tenir compte des éventuelles
+    ! "pourcentage potentiel" pour tenir compte des \'eventuelles
     ! apparitions ou disparitions de la glace de mer
 
     REAL zx_alf1, zx_alf2 !valeur ambiante par extrapola.
@@ -305,11 +307,9 @@
     y_dflux_q = 0.
     ytsoil = 999999.
     yrugoro = 0.
-    ! -- LOOP
     yu10mx = 0.
     yu10my = 0.
     ywindsp = 0.
-    ! -- LOOP
     d_ts = 0.
     yfluxlat = 0.
     flux_t = 0.
@@ -322,9 +322,9 @@
     d_v = 0.
     ycoefh = 0.
 
-    ! Initialisation des "pourcentages potentiels". On considère ici qu'on
-    ! peut avoir potentiellement de la glace sur tout le domaine océanique
-    ! (à affiner)
+    ! Initialisation des "pourcentages potentiels". On consid\`ere ici qu'on
+    ! peut avoir potentiellement de la glace sur tout le domaine oc\'eanique
+    ! (\`a affiner)
 
     pctsrf_pot = pctsrf
     pctsrf_pot(:, is_oce) = 1. - zmasq
@@ -337,7 +337,7 @@
        ni = 0
        knon = 0
        DO i = 1, klon
-          ! Pour déterminer le domaine à traiter, on utilise les surfaces
+          ! Pour d\'eterminer le domaine \`a traiter, on utilise les surfaces
           ! "potentielles"
           IF (pctsrf_pot(i, nsrf) > epsfra) THEN
              knon = knon + 1
@@ -424,8 +424,8 @@
           END IF
 
           IF (iflag_pbl >= 3) THEN
-             ! Mellor et Yamada adapté à Mars, Richard Fournier et
-             ! Frédéric Hourdin
+             ! Mellor et Yamada adapt\'e \`a Mars, Richard Fournier et
+             ! Fr\'ed\'eric Hourdin
              yzlay(:knon, 1) = rd * yt(:knon, 1) / (0.5 * (ypaprs(:knon, 1) &
                   + ypplay(:knon, 1))) &
                   * (ypaprs(:knon, 1) - ypplay(:knon, 1)) / rg
@@ -455,12 +455,12 @@
              CALL ustarhb(knon, yu, yv, coefm(:knon, 1), yustar)
              IF (prt_level > 9) PRINT *, 'USTAR = ', yustar
 
-             ! iflag_pbl peut être utilisé comme longueur de mélange
+             ! iflag_pbl peut \^etre utilis\'e comme longueur de m\'elange
 
              IF (iflag_pbl >= 11) THEN
-                CALL vdif_kcay(knon, dtime, rg, rd, ypaprs, yt, yzlev, yzlay, &
-                     yu, yv, yteta, coefm(:knon, 1), yq2, q2diag, ykmm, ykmn, &
-                     yustar, iflag_pbl)
+                CALL vdif_kcay(knon, dtime, rg, ypaprs, yzlev, yzlay, yu, yv, &
+                     yteta, coefm(:knon, 1), yq2, q2diag, ykmm, ykmn, yustar, &
+                     iflag_pbl)
              ELSE
                 CALL yamada4(knon, dtime, rg, yzlev, yzlay, yu, yv, yteta, &
                      coefm(:knon, 1), yq2, ykmm, ykmn, ykmq, yustar, iflag_pbl)
@@ -477,13 +477,14 @@
                ypplay, ydelp, y_d_v, y_flux_v)
 
           ! calculer la diffusion de "q" et de "h"
-          CALL clqh(dtime, itap, jour, debut, rlat, knon, nsrf, ni, pctsrf, &
-               ytsoil, yqsol, rmu0, co2_ppm, yrugos, yrugoro, &
-               yu1, yv1, coefh(:knon, :), yt, yq, yts, ypaprs, ypplay, ydelp, &
+          CALL clqh(dtime, itap, jour, debut, rlat, knon, nsrf, ni(:knon), &
+               pctsrf, ytsoil, yqsol, rmu0, co2_ppm, yrugos, yrugoro, yu1, &
+               yv1, coefh(:knon, :), yt, yq, yts, ypaprs, ypplay, ydelp, &
                yrads, yalb, yalblw, ysnow, yqsurf, yrain_f, ysnow_f, yfder, &
-               ysolsw, yfluxlat, pctsrf_new, yagesno, y_d_t, y_d_q, y_d_ts, &
-               yz0_new, y_flux_t, y_flux_q, y_dflux_t, y_dflux_q, &
-               y_fqcalving, y_ffonte, y_run_off_lic_0, y_flux_o, y_flux_g)
+               ysolsw, yfluxlat, pctsrf_new, yagesno, y_d_t, y_d_q, &
+               y_d_ts(:knon), yz0_new, y_flux_t, y_flux_q, y_dflux_t, &
+               y_dflux_q, y_fqcalving, y_ffonte, y_run_off_lic_0, y_flux_o, &
+               y_flux_g)
 
           ! calculer la longueur de rugosite sur ocean
           yrugm = 0.
@@ -556,7 +557,7 @@
                 run_off_lic_0(i) = y_run_off_lic_0(j)
              END DO
           END IF
-          !$$$ PB ajout pour soil
+
           ftsoil(:, :, nsrf) = 0.
           DO k = 1, nsoilmx
              DO j = 1, knon
@@ -612,7 +613,7 @@
 
           END DO
 
-          CALL hbtm(knon, ypaprs, ypplay, yt2m, yt10m, yq2m, yq10m, yustar, &
+          CALL hbtm(knon, ypaprs, ypplay, yt2m, yq2m, yustar, &
                y_flux_t, y_flux_q, yu, yv, yt, yq, ypblh, ycapcl, yoliqcl, &
                ycteicl, ypblt, ytherm, ytrmb1, ytrmb2, ytrmb3, ylcl)
 
@@ -652,7 +653,7 @@
           IF (nsrf == is_sic) THEN
              DO j = 1, knon
                 i = ni(j)
-                ! On pondère lorsque l'on fait le bilan au sol :
+                ! On pond\`ere lorsque l'on fait le bilan au sol :
                 IF (pctsrf_new(i, is_sic)>epsfra) THEN
                    flux_g(i) = y_flux_g(j)
                 ELSE