Sources/phylmd/phytrac.f

module phytrac_m

  IMPLICIT none

  private
  public phytrac

contains

  SUBROUTINE phytrac(itap, lmt_pas, julien, gmtime, firstcal, lafin, pdtphys, &
       t_seri, paprs, pplay, pmfu, pmfd, pde_u, pen_d, coefh, fm_therm, &
       entr_therm, yu1, yv1, ftsol, pctsrf, frac_impa, frac_nucl, pphis, da, &
       phi, mp, upwd, dnwd, tr_seri, zmasse)

    ! From phylmd/phytrac.F, version 1.15 2006/02/21 08:08:30 (SVN revision 679)

    ! Authors: Fr\'ed\'eric Hourdin, Abderrahmane Idelkadi, Marie-Alice
    ! Foujols, Olivia

    ! Objet : moniteur g\'en\'eral des tendances des traceurs

    ! L'appel de "phytrac" se fait avec "nqmx - 2" donc nous avons
    ! bien les vrais traceurs, sans la vapeur d'eau ni l'eau liquide.

    ! Modifications pour les traceurs :
    ! - uniformisation des parametrisations dans phytrac
    ! - stockage des moyennes des champs n\'ecessaires en mode traceur off-line 

    use abort_gcm_m, only: abort_gcm
    use clesphys, only: ecrit_tra
    use clesphys2, only: iflag_con
    use cltrac_m, only: cltrac
    use cltracrn_m, only: cltracrn
    use ctherm, only: iflag_thermals
    use cvltr_m, only: cvltr
    use dimens_m, only: llm, nqmx
    use dimphy, only: klon
    use indicesol, only: nbsrf
    use ini_histrac_m, only: ini_histrac
    use initrrnpb_m, only: initrrnpb
    use minmaxqfi_m, only: minmaxqfi
    use nflxtr_m, only: nflxtr
    use nr_util, only: assert
    use o3_chem_m, only: o3_chem
    use phyetat0_m, only: rlat
    use press_coefoz_m, only: press_coefoz
    use radiornpb_m, only: radiornpb
    use regr_pr_comb_coefoz_m, only: regr_pr_comb_coefoz
    use SUPHEC_M, only: rg

    integer, intent(in):: itap ! number of calls to "physiq"
    integer, intent(in):: lmt_pas ! number of time steps of "physics" per day
    integer, intent(in):: julien !jour julien, 1 <= julien <= 360
    real, intent(in):: gmtime ! heure de la journ\'ee en fraction de jour
    logical, intent(in):: firstcal ! first call to "calfis"
    logical, intent(in):: lafin ! fin de la physique
    real, intent(in):: pdtphys ! pas d'integration pour la physique (s)
    real, intent(in):: t_seri(klon, llm) ! temperature, in K

    real, intent(in):: paprs(klon, llm+1)
    ! (pression pour chaque inter-couche, en Pa)

    real, intent(in):: pplay(klon, llm)
    ! (pression pour le mileu de chaque couche, en Pa)

    ! convection:

    REAL, intent(in):: pmfu(klon, llm) ! flux de masse dans le panache montant

    REAL, intent(in):: pmfd(klon, llm)
    ! flux de masse dans le panache descendant

    REAL pde_u(klon, llm) ! flux detraine dans le panache montant
    REAL pen_d(klon, llm) ! flux entraine dans le panache descendant
    REAL coefh(klon, llm) ! coeff melange couche limite

    ! thermiques:
    real fm_therm(klon, llm+1), entr_therm(klon, llm)

    ! Couche limite:
    REAL yu1(klon) ! vents au premier niveau
    REAL yv1(klon) ! vents au premier niveau

    ! Arguments n\'ecessaires pour les sources et puits de traceur :
    real, intent(in):: ftsol(klon, nbsrf) ! Temperature du sol (surf)(Kelvin)
    real pctsrf(klon, nbsrf) ! Pourcentage de sol f(nature du sol)

    ! Lessivage pour le on-line
    REAL frac_impa(klon, llm) ! fraction d'aerosols impactes
    REAL frac_nucl(klon, llm) ! fraction d'aerosols nuclees

    real, intent(in):: pphis(klon)

    ! Kerry Emanuel
    real, intent(in):: da(klon, llm), phi(klon, llm, llm), mp(klon, llm)
    REAL, intent(in):: upwd(klon, llm) ! saturated updraft mass flux
    REAL, intent(in):: dnwd(klon, llm) ! saturated downdraft mass flux

    real, intent(inout):: tr_seri(:, :, :) ! (klon, llm, nqmx - 2)
    ! (mass fractions of tracers, excluding water, at mid-layers)

    real, intent(in):: zmasse(:, :) ! (klon, llm)
    ! (column-density of mass of air in a cell, in kg m-2)

    ! Variables local to the procedure:

    integer nsplit

    ! TRACEURS

    ! Sources et puits des traceurs:

    ! Pour l'instant seuls les cas du rn et du pb ont ete envisages.

    REAL source(klon) ! a voir lorsque le flux est prescrit 
    ! 
    ! Pour la source de radon et son reservoir de sol

    REAL, save:: trs(klon, nqmx - 2) ! Concentration de traceur dans le sol

    REAL masktr(klon, nqmx - 2) ! Masque reservoir de sol traceur
    ! Masque de l'echange avec la surface
    ! (1 = reservoir) ou (possible => 1)
    SAVE masktr
    REAL fshtr(klon, nqmx - 2) ! Flux surfacique dans le reservoir de sol
    SAVE fshtr
    REAL hsoltr(nqmx - 2) ! Epaisseur equivalente du reservoir de sol
    SAVE hsoltr
    REAL tautr(nqmx - 2) ! Constante de decroissance radioactive
    SAVE tautr
    REAL vdeptr(nqmx - 2) ! Vitesse de depot sec dans la couche Brownienne
    SAVE vdeptr
    REAL scavtr(nqmx - 2) ! Coefficient de lessivage
    SAVE scavtr

    CHARACTER itn
    INTEGER, save:: nid_tra

    ! nature du traceur

    logical aerosol(nqmx - 2) ! Nature du traceur
    ! ! aerosol(it) = true => aerosol 
    ! ! aerosol(it) = false => gaz 
    logical clsol(nqmx - 2) ! couche limite sol calcul\'ee
    logical radio(nqmx - 2) ! d\'ecroisssance radioactive
    save aerosol, clsol, radio

    ! convection tiedtke
    INTEGER i, k, it
    REAL delp(klon, llm)

    ! Variables liees a l'ecriture de la bande histoire physique

    ! Variables locales pour effectuer les appels en serie

    REAL d_tr(klon, llm), d_trs(klon) ! tendances de traceurs 
    REAL d_tr_cl(klon, llm, nqmx - 2) ! tendance de traceurs couche limite

    REAL d_tr_cv(klon, llm, nqmx - 2) 
    ! tendance de traceurs conv pour chq traceur

    REAL d_tr_th(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance des thermiques
    REAL d_tr_dec(klon, llm, 2) ! la tendance de la decroissance 
    ! ! radioactive du rn - > pb 
    REAL d_tr_lessi_impa(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance du lessivage 
    ! ! par impaction
    REAL d_tr_lessi_nucl(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance du lessivage 
    ! ! par nucleation 
    REAL flestottr(klon, llm, nqmx - 2) ! flux de lessivage 
    ! ! dans chaque couche 

    real ztra_th(klon, llm)
    integer isplit

    ! Controls:
    logical:: couchelimite = .true.
    logical:: convection = .true.
    logical:: lessivage = .true.
    logical, save:: inirnpb

    !--------------------------------------

    call assert(shape(zmasse) == (/klon, llm/), "phytrac zmasse")
    call assert(shape(tr_seri) == (/klon, llm, nqmx - 2/), "phytrac tr_seri")

    if (firstcal) then
       print *, 'phytrac: pdtphys = ', pdtphys
       PRINT *, 'Frequency of tracer output: ecrit_tra = ', ecrit_tra
       inirnpb = .true.

       ! Initialisation des sorties :
       call ini_histrac(nid_tra, pdtphys, nqmx - 2, lessivage)

       ! Initialisation de certaines variables pour le radon et le plomb 
       ! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
       trs(:, :) = 0.

       open (unit=99, file='starttrac', status='old', err=999, &
            form='formatted')
       read(unit=99, fmt=*) (trs(i, 1), i=1, klon)
999    continue
       close(unit=99)

       ! Initialisation de la fraction d'aerosols lessivee

       d_tr_lessi_impa = 0.
       d_tr_lessi_nucl = 0. 

       ! Initialisation de la nature des traceurs

       DO it = 1, nqmx - 2
          aerosol(it) = .FALSE. ! Tous les traceurs sont des gaz par defaut
          radio(it) = .FALSE. ! par d\'efaut pas de passage par "radiornpb"
          clsol(it) = .FALSE. ! Par defaut couche limite avec flux prescrit
       ENDDO

       if (nqmx >= 5) then
          call press_coefoz ! read input pressure levels for ozone coefficients
       end if
    ENDIF

    if (inirnpb) THEN
       ! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
       radio(1)= .true.
       radio(2)= .true.
       clsol(1)= .true.
       clsol(2)= .true.
       aerosol(2) = .TRUE. ! le Pb est un aerosol 
       call initrrnpb(pctsrf, masktr, fshtr, hsoltr, tautr, vdeptr, scavtr)
       inirnpb=.false.
    endif

    if (convection) then
       ! Calcul de l'effet de la convection
       DO it=1, nqmx - 2
          if (iflag_con == 2) then
             ! Tiedke
             CALL nflxtr(pdtphys, pmfu, pmfd, pde_u, pen_d, paprs, &
                  tr_seri(:, :, it), d_tr_cv(:, :, it))
          else if (iflag_con == 3) then
             ! Emanuel
             call cvltr(pdtphys, da, phi, mp, paprs, tr_seri(:, :, it), upwd, &
                  dnwd, d_tr_cv(:, :, it))
          endif

          DO k = 1, llm
             DO i = 1, klon
                tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cv(i, k, it)
             ENDDO
          ENDDO
          WRITE(unit=itn, fmt='(i1)') it
          CALL minmaxqfi(tr_seri(:, :, it), 0., 1e33, &
               'convection, tracer index = ' // itn)
       ENDDO
    endif

    ! Calcul de l'effet des thermiques

    do it=1, nqmx - 2
       do k=1, llm
          do i=1, klon
             d_tr_th(i, k, it)=0.
             tr_seri(i, k, it)=max(tr_seri(i, k, it), 0.)
             tr_seri(i, k, it)=min(tr_seri(i, k, it), 1e10)
          enddo
       enddo
    enddo

    if (iflag_thermals > 0) then
       nsplit=10
       DO it=1, nqmx - 2
          do isplit=1, nsplit
             ! Thermiques 
             call dqthermcell(klon, llm, pdtphys/nsplit &
                  , fm_therm, entr_therm, zmasse &
                  , tr_seri(1:klon, 1:llm, it), d_tr, ztra_th)

             do k=1, llm
                do i=1, klon
                   d_tr(i, k)=pdtphys*d_tr(i, k)/nsplit
                   d_tr_th(i, k, it)=d_tr_th(i, k, it)+d_tr(i, k)
                   tr_seri(i, k, it)=max(tr_seri(i, k, it)+d_tr(i, k), 0.)
                enddo
             enddo
          enddo
       ENDDO
    endif

    ! Calcul de l'effet de la couche limite

    if (couchelimite) then
       DO k = 1, llm
          DO i = 1, klon
             delp(i, k) = paprs(i, k)-paprs(i, k+1)
          ENDDO
       ENDDO

       ! MAF modif pour tenir compte du cas traceur
       DO it=1, nqmx - 2
          if (clsol(it)) then 
             ! couche limite avec quantite dans le sol calculee
             CALL cltracrn(it, pdtphys, yu1, yv1, coefh, t_seri, ftsol, &
                  pctsrf, tr_seri(:, :, it), trs(:, it), paprs, pplay, delp, &
                  masktr(1, it), fshtr(1, it), hsoltr(it), tautr(it), &
                  vdeptr(it), rlat, d_tr_cl(1, 1, it), d_trs)
             DO k = 1, llm
                DO i = 1, klon
                   tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cl(i, k, it)
                ENDDO
             ENDDO

             trs(:, it) = trs(:, it) + d_trs
          else
             ! couche limite avec flux prescrit
             !MAF provisoire source / traceur a creer
             DO i=1, klon
                source(i) = 0. ! pas de source, pour l'instant
             ENDDO

             CALL cltrac(pdtphys, coefh, t_seri, tr_seri(:, :, it), source, &
                  paprs, pplay, delp, d_tr_cl(1, 1, it))
             DO k = 1, llm
                DO i = 1, klon
                   tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cl(i, k, it)
                ENDDO
             ENDDO
          endif
       ENDDO
    endif

    ! Calcul de l'effet du puits radioactif

    ! MAF il faudrait faire une modification pour passer dans radiornpb 
    ! si radio=true
    d_tr_dec = radiornpb(tr_seri, pdtphys, tautr)
    DO it = 1, nqmx - 2
       if (radio(it)) then
          tr_seri(:, :, it) = tr_seri(:, :, it) + d_tr_dec(:, :, it)
          WRITE(unit=itn, fmt='(i1)') it
          CALL minmaxqfi(tr_seri(:, :, it), 0., 1e33, 'puits rn it='//itn)
       endif
    ENDDO

    if (nqmx >= 5) then
       ! Ozone as a tracer:
       if (mod(itap - 1, lmt_pas) == 0) then
          ! Once per day, update the coefficients for ozone chemistry:
          call regr_pr_comb_coefoz(julien)
       end if
       call o3_chem(julien, gmtime, t_seri, zmasse, pdtphys, tr_seri(:, :, 3))
    end if

    ! Calcul de l'effet de la precipitation

    IF (lessivage) THEN
       d_tr_lessi_nucl = 0. 
       d_tr_lessi_impa = 0. 
       flestottr = 0. 

       ! tendance des aerosols nuclees et impactes 

       DO it = 1, nqmx - 2
          IF (aerosol(it)) THEN
             DO k = 1, llm
                DO i = 1, klon
                   d_tr_lessi_nucl(i, k, it) = d_tr_lessi_nucl(i, k, it) + &
                        (1 - frac_nucl(i, k))*tr_seri(i, k, it)
                   d_tr_lessi_impa(i, k, it) = d_tr_lessi_impa(i, k, it) + &
                        (1 - frac_impa(i, k))*tr_seri(i, k, it)
                ENDDO
             ENDDO
          ENDIF
       ENDDO

       ! Mises a jour des traceurs + calcul des flux de lessivage 
       ! Mise a jour due a l'impaction et a la nucleation

       DO it = 1, nqmx - 2
          IF (aerosol(it)) THEN
             DO k = 1, llm
                DO i = 1, klon
                   tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) * frac_impa(i, k) &
                        * frac_nucl(i, k)
                ENDDO
             ENDDO
          ENDIF
       ENDDO

       ! Flux lessivage total 

       DO it = 1, nqmx - 2
          DO k = 1, llm
             DO i = 1, klon
                flestottr(i, k, it) = flestottr(i, k, it) &
                     - (d_tr_lessi_nucl(i, k, it) + d_tr_lessi_impa(i, k, it)) &
                     * (paprs(i, k)-paprs(i, k+1)) / (RG * pdtphys)
             ENDDO
          ENDDO
       ENDDO
    ENDIF

    ! Ecriture des sorties
    call write_histrac(lessivage, itap, nid_tra)

    if (lafin) then
       print *, "C'est la fin de la physique."
       open(unit=99, file='restarttrac', form='formatted')
       do i=1, klon
          write(unit=99, fmt=*) trs(i, 1)
       enddo
       PRINT *, 'Ecriture du fichier restarttrac'
       close(unit=99)
    endif

  contains

    subroutine write_histrac(lessivage, itap, nid_tra)

      ! From phylmd/write_histrac.h, version 1.9 2006/02/21 08:08:30

      use dimens_m, only: iim, jjm, llm
      use histsync_m, only: histsync
      use histwrite_m, only: histwrite
      use temps, only: itau_phy
      use iniadvtrac_m, only: tname
      use comgeomphy, only: airephy
      use dimphy, only: klon
      use grid_change, only: gr_phy_write_2d
      use gr_phy_write_3d_m, only: gr_phy_write_3d

      logical, intent(in):: lessivage
      integer, intent(in):: itap ! number of calls to "physiq"
      integer, intent(in):: nid_tra

      ! Variables local to the procedure:
      integer it
      integer itau_w ! pas de temps ecriture
      logical, parameter:: ok_sync = .true.

      !-----------------------------------------------------

      itau_w = itau_phy + itap

      CALL histwrite(nid_tra, "phis", itau_w, gr_phy_write_2d(pphis))
      CALL histwrite(nid_tra, "aire", itau_w, gr_phy_write_2d(airephy))
      CALL histwrite(nid_tra, "zmasse", itau_w, gr_phy_write_3d(zmasse))

      DO it=1, nqmx - 2
         CALL histwrite(nid_tra, tname(it+2), itau_w, &
              gr_phy_write_3d(tr_seri(:, :, it)))
         if (lessivage) THEN
            CALL histwrite(nid_tra, "fl"//tname(it+2), itau_w, &
                 gr_phy_write_3d(flestottr(:, :, it)))
         endif
         CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_th_"//tname(it+2), itau_w, &
              gr_phy_write_3d(d_tr_th(:, :, it)))
         CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_cv_"//tname(it+2), itau_w, &
              gr_phy_write_3d(d_tr_cv(:, :, it)))
         CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_cl_"//tname(it+2), itau_w, &
              gr_phy_write_3d(d_tr_cl(:, :, it)))
      ENDDO

      CALL histwrite(nid_tra, "pplay", itau_w, gr_phy_write_3d(pplay))
      CALL histwrite(nid_tra, "T", itau_w, gr_phy_write_3d(t_seri))

      if (ok_sync) then
         call histsync(nid_tra)
      endif

    end subroutine write_histrac

  END SUBROUTINE phytrac

end module phytrac_m
1	guez	3	module phytrac_m
2
3			IMPLICIT none
4
5			private
6			public phytrac
7
8			contains
9
10	guez	98	SUBROUTINE phytrac(itap, lmt_pas, julien, gmtime, firstcal, lafin, pdtphys, &
11	guez	118	t_seri, paprs, pplay, pmfu, pmfd, pde_u, pen_d, coefh, fm_therm, &
12			entr_therm, yu1, yv1, ftsol, pctsrf, frac_impa, frac_nucl, pphis, da, &
13			phi, mp, upwd, dnwd, tr_seri, zmasse)
14	guez	3
15	guez	47	! From phylmd/phytrac.F, version 1.15 2006/02/21 08:08:30 (SVN revision 679)
16	guez	3
17	guez	90	! Authors: Fr\'ed\'eric Hourdin, Abderrahmane Idelkadi, Marie-Alice
18	guez	3	! Foujols, Olivia
19	guez	78
20	guez	90	! Objet : moniteur g\'en\'eral des tendances des traceurs
21	guez	3
22	guez	78	! L'appel de "phytrac" se fait avec "nqmx - 2" donc nous avons
23	guez	98	! bien les vrais traceurs, sans la vapeur d'eau ni l'eau liquide.
24	guez	3
25	guez	47	! Modifications pour les traceurs :
26	guez	62	! - uniformisation des parametrisations dans phytrac
27	guez	90	! - stockage des moyennes des champs n\'ecessaires en mode traceur off-line
28	guez	47
29	guez	78	use abort_gcm_m, only: abort_gcm
30	guez	12	use clesphys, only: ecrit_tra
31			use clesphys2, only: iflag_con
32	guez	120	use cltrac_m, only: cltrac
33	guez	78	use cltracrn_m, only: cltracrn
34	guez	3	use ctherm, only: iflag_thermals
35	guez	120	use cvltr_m, only: cvltr
36	guez	98	use dimens_m, only: llm, nqmx
37			use dimphy, only: klon
38	guez	78	use indicesol, only: nbsrf
39	guez	34	use ini_histrac_m, only: ini_histrac
40	guez	98	use initrrnpb_m, only: initrrnpb
41	guez	17	use minmaxqfi_m, only: minmaxqfi
42	guez	78	use nflxtr_m, only: nflxtr
43	guez	36	use nr_util, only: assert
44	guez	78	use o3_chem_m, only: o3_chem
45			use phyetat0_m, only: rlat
46	guez	17	use press_coefoz_m, only: press_coefoz
47	guez	78	use radiornpb_m, only: radiornpb
48			use regr_pr_comb_coefoz_m, only: regr_pr_comb_coefoz
49			use SUPHEC_M, only: rg
50	guez	3
51	guez	78	integer, intent(in):: itap ! number of calls to "physiq"
52	guez	7	integer, intent(in):: lmt_pas ! number of time steps of "physics" per day
53	guez	3	integer, intent(in):: julien !jour julien, 1 <= julien <= 360
54	guez	90	real, intent(in):: gmtime ! heure de la journ\'ee en fraction de jour
55	guez	78	logical, intent(in):: firstcal ! first call to "calfis"
56			logical, intent(in):: lafin ! fin de la physique
57			real, intent(in):: pdtphys ! pas d'integration pour la physique (s)
58			real, intent(in):: t_seri(klon, llm) ! temperature, in K
59	guez	3
60			real, intent(in):: paprs(klon, llm+1)
61			! (pression pour chaque inter-couche, en Pa)
62
63	guez	10	real, intent(in):: pplay(klon, llm)
64			! (pression pour le mileu de chaque couche, en Pa)
65
66	guez	78	! convection:
67	guez	3
68	guez	62	REAL, intent(in):: pmfu(klon, llm) ! flux de masse dans le panache montant
69	guez	72
70			REAL, intent(in):: pmfd(klon, llm)
71			! flux de masse dans le panache descendant
72
73	guez	78	REAL pde_u(klon, llm) ! flux detraine dans le panache montant
74			REAL pen_d(klon, llm) ! flux entraine dans le panache descendant
75			REAL coefh(klon, llm) ! coeff melange couche limite
76	guez	3
77	guez	78	! thermiques:
78	guez	3	real fm_therm(klon, llm+1), entr_therm(klon, llm)
79
80	guez	78	! Couche limite:
81			REAL yu1(klon) ! vents au premier niveau
82			REAL yv1(klon) ! vents au premier niveau
83	guez	3
84	guez	90	! Arguments n\'ecessaires pour les sources et puits de traceur :
85	guez	104	real, intent(in):: ftsol(klon, nbsrf) ! Temperature du sol (surf)(Kelvin)
86	guez	78	real pctsrf(klon, nbsrf) ! Pourcentage de sol f(nature du sol)
87	guez	3
88	guez	78	! Lessivage pour le on-line
89			REAL frac_impa(klon, llm) ! fraction d'aerosols impactes
90			REAL frac_nucl(klon, llm) ! fraction d'aerosols nuclees
91	guez	3
92	guez	78	real, intent(in):: pphis(klon)
93	guez	3
94	guez	78	! Kerry Emanuel
95	guez	99	real, intent(in):: da(klon, llm), phi(klon, llm, llm), mp(klon, llm)
96	guez	78	REAL, intent(in):: upwd(klon, llm) ! saturated updraft mass flux
97			REAL, intent(in):: dnwd(klon, llm) ! saturated downdraft mass flux
98	guez	3
99	guez	98	real, intent(inout):: tr_seri(:, :, :) ! (klon, llm, nqmx - 2)
100	guez	78	! (mass fractions of tracers, excluding water, at mid-layers)
101	guez	3
102	guez	78	real, intent(in):: zmasse(:, :) ! (klon, llm)
103	guez	17	! (column-density of mass of air in a cell, in kg m-2)
104	guez	3
105	guez	17	! Variables local to the procedure:
106	guez	3
107	guez	17	integer nsplit
108
109	guez	78	! TRACEURS
110	guez	17
111	guez	3	! Sources et puits des traceurs:
112
113			! Pour l'instant seuls les cas du rn et du pb ont ete envisages.
114
115	guez	78	REAL source(klon) ! a voir lorsque le flux est prescrit
116	guez	3	!
117			! Pour la source de radon et son reservoir de sol
118
119	guez	156	REAL, save:: trs(klon, nqmx - 2) ! Concentration de traceur dans le sol
120	guez	3
121	guez	98	REAL masktr(klon, nqmx - 2) ! Masque reservoir de sol traceur
122	guez	78	! Masque de l'echange avec la surface
123			! (1 = reservoir) ou (possible => 1)
124	guez	3	SAVE masktr
125	guez	98	REAL fshtr(klon, nqmx - 2) ! Flux surfacique dans le reservoir de sol
126	guez	3	SAVE fshtr
127	guez	98	REAL hsoltr(nqmx - 2) ! Epaisseur equivalente du reservoir de sol
128	guez	3	SAVE hsoltr
129	guez	98	REAL tautr(nqmx - 2) ! Constante de decroissance radioactive
130	guez	3	SAVE tautr
131	guez	98	REAL vdeptr(nqmx - 2) ! Vitesse de depot sec dans la couche Brownienne
132	guez	3	SAVE vdeptr
133	guez	98	REAL scavtr(nqmx - 2) ! Coefficient de lessivage
134	guez	3	SAVE scavtr
135
136			CHARACTER itn
137			INTEGER, save:: nid_tra
138
139			! nature du traceur
140
141	guez	98	logical aerosol(nqmx - 2) ! Nature du traceur
142	guez	78	! ! aerosol(it) = true => aerosol
143			! ! aerosol(it) = false => gaz
144	guez	98	logical clsol(nqmx - 2) ! couche limite sol calcul\'ee
145			logical radio(nqmx - 2) ! d\'ecroisssance radioactive
146	guez	3	save aerosol, clsol, radio
147
148			! convection tiedtke
149			INTEGER i, k, it
150			REAL delp(klon, llm)
151
152			! Variables liees a l'ecriture de la bande histoire physique
153
154			! Variables locales pour effectuer les appels en serie
155
156			REAL d_tr(klon, llm), d_trs(klon) ! tendances de traceurs
157	guez	98	REAL d_tr_cl(klon, llm, nqmx - 2) ! tendance de traceurs couche limite
158	guez	156
159			REAL d_tr_cv(klon, llm, nqmx - 2)
160			! tendance de traceurs conv pour chq traceur
161
162	guez	98	REAL d_tr_th(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance des thermiques
163	guez	3	REAL d_tr_dec(klon, llm, 2) ! la tendance de la decroissance
164	guez	78	! ! radioactive du rn - > pb
165	guez	98	REAL d_tr_lessi_impa(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance du lessivage
166	guez	78	! ! par impaction
167	guez	98	REAL d_tr_lessi_nucl(klon, llm, nqmx - 2) ! la tendance du lessivage
168	guez	78	! ! par nucleation
169	guez	98	REAL flestottr(klon, llm, nqmx - 2) ! flux de lessivage
170	guez	78	! ! dans chaque couche
171	guez	3
172			real ztra_th(klon, llm)
173			integer isplit
174
175			! Controls:
176			logical:: couchelimite = .true.
177			logical:: convection = .true.
178			logical:: lessivage = .true.
179			logical, save:: inirnpb
180
181			!--------------------------------------
182
183	guez	18	call assert(shape(zmasse) == (/klon, llm/), "phytrac zmasse")
184	guez	98	call assert(shape(tr_seri) == (/klon, llm, nqmx - 2/), "phytrac tr_seri")
185	guez	3
186	guez	7	if (firstcal) then
187	guez	3	print *, 'phytrac: pdtphys = ', pdtphys
188	guez	91	PRINT *, 'Frequency of tracer output: ecrit_tra = ', ecrit_tra
189	guez	98	inirnpb = .true.
190	guez	3
191			! Initialisation des sorties :
192	guez	98	call ini_histrac(nid_tra, pdtphys, nqmx - 2, lessivage)
193	guez	3
194			! Initialisation de certaines variables pour le radon et le plomb
195			! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
196			trs(:, :) = 0.
197
198			open (unit=99, file='starttrac', status='old', err=999, &
199			form='formatted')
200			read(unit=99, fmt=*) (trs(i, 1), i=1, klon)
201			999 continue
202			close(unit=99)
203
204			! Initialisation de la fraction d'aerosols lessivee
205
206	guez	98	d_tr_lessi_impa = 0.
207			d_tr_lessi_nucl = 0.
208	guez	3
209			! Initialisation de la nature des traceurs
210
211	guez	98	DO it = 1, nqmx - 2
212	guez	78	aerosol(it) = .FALSE. ! Tous les traceurs sont des gaz par defaut
213	guez	90	radio(it) = .FALSE. ! par d\'efaut pas de passage par "radiornpb"
214	guez	78	clsol(it) = .FALSE. ! Par defaut couche limite avec flux prescrit
215	guez	3	ENDDO
216	guez	17
217	guez	98	if (nqmx >= 5) then
218	guez	17	call press_coefoz ! read input pressure levels for ozone coefficients
219			end if
220	guez	3	ENDIF
221
222			if (inirnpb) THEN
223	guez	62	! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
224	guez	3	radio(1)= .true.
225			radio(2)= .true.
226			clsol(1)= .true.
227			clsol(2)= .true.
228			aerosol(2) = .TRUE. ! le Pb est un aerosol
229	guez	98	call initrrnpb(pctsrf, masktr, fshtr, hsoltr, tautr, vdeptr, scavtr)
230	guez	3	inirnpb=.false.
231			endif
232
233			if (convection) then
234	guez	62	! Calcul de l'effet de la convection
235	guez	98	DO it=1, nqmx - 2
236	guez	62	if (iflag_con == 2) then
237			! Tiedke
238	guez	78	CALL nflxtr(pdtphys, pmfu, pmfd, pde_u, pen_d, paprs, &
239			tr_seri(:, :, it), d_tr_cv(:, :, it))
240	guez	62	else if (iflag_con == 3) then
241			! Emanuel
242	guez	120	call cvltr(pdtphys, da, phi, mp, paprs, tr_seri(:, :, it), upwd, &
243			dnwd, d_tr_cv(:, :, it))
244	guez	3	endif
245
246			DO k = 1, llm
247			DO i = 1, klon
248			tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cv(i, k, it)
249			ENDDO
250			ENDDO
251			WRITE(unit=itn, fmt='(i1)') it
252	guez	78	CALL minmaxqfi(tr_seri(:, :, it), 0., 1e33, &
253	guez	3	'convection, tracer index = ' // itn)
254			ENDDO
255			endif
256
257			! Calcul de l'effet des thermiques
258
259	guez	98	do it=1, nqmx - 2
260	guez	3	do k=1, llm
261			do i=1, klon
262			d_tr_th(i, k, it)=0.
263			tr_seri(i, k, it)=max(tr_seri(i, k, it), 0.)
264	guez	78	tr_seri(i, k, it)=min(tr_seri(i, k, it), 1e10)
265	guez	3	enddo
266			enddo
267			enddo
268
269			if (iflag_thermals > 0) then
270			nsplit=10
271	guez	98	DO it=1, nqmx - 2
272	guez	3	do isplit=1, nsplit
273			! Thermiques
274			call dqthermcell(klon, llm, pdtphys/nsplit &
275			, fm_therm, entr_therm, zmasse &
276			, tr_seri(1:klon, 1:llm, it), d_tr, ztra_th)
277
278			do k=1, llm
279			do i=1, klon
280			d_tr(i, k)=pdtphys*d_tr(i, k)/nsplit
281			d_tr_th(i, k, it)=d_tr_th(i, k, it)+d_tr(i, k)
282			tr_seri(i, k, it)=max(tr_seri(i, k, it)+d_tr(i, k), 0.)
283			enddo
284			enddo
285			enddo
286			ENDDO
287			endif
288
289	guez	78	! Calcul de l'effet de la couche limite
290	guez	3
291			if (couchelimite) then
292			DO k = 1, llm
293			DO i = 1, klon
294			delp(i, k) = paprs(i, k)-paprs(i, k+1)
295			ENDDO
296			ENDDO
297
298	guez	98	! MAF modif pour tenir compte du cas traceur
299			DO it=1, nqmx - 2
300	guez	3	if (clsol(it)) then
301			! couche limite avec quantite dans le sol calculee
302	guez	156	CALL cltracrn(it, pdtphys, yu1, yv1, coefh, t_seri, ftsol, &
303			pctsrf, tr_seri(:, :, it), trs(:, it), paprs, pplay, delp, &
304			masktr(1, it), fshtr(1, it), hsoltr(it), tautr(it), &
305			vdeptr(it), rlat, d_tr_cl(1, 1, it), d_trs)
306	guez	3	DO k = 1, llm
307			DO i = 1, klon
308			tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cl(i, k, it)
309			ENDDO
310			ENDDO
311
312	guez	156	trs(:, it) = trs(:, it) + d_trs
313			else
314			! couche limite avec flux prescrit
315	guez	3	!MAF provisoire source / traceur a creer
316			DO i=1, klon
317	guez	156	source(i) = 0. ! pas de source, pour l'instant
318	guez	3	ENDDO
319
320	guez	120	CALL cltrac(pdtphys, coefh, t_seri, tr_seri(:, :, it), source, &
321			paprs, pplay, delp, d_tr_cl(1, 1, it))
322	guez	3	DO k = 1, llm
323			DO i = 1, klon
324			tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) + d_tr_cl(i, k, it)
325			ENDDO
326			ENDDO
327			endif
328			ENDDO
329	guez	98	endif
330	guez	3
331	guez	78	! Calcul de l'effet du puits radioactif
332	guez	3
333			! MAF il faudrait faire une modification pour passer dans radiornpb
334	guez	98	! si radio=true
335			d_tr_dec = radiornpb(tr_seri, pdtphys, tautr)
336			DO it = 1, nqmx - 2
337			if (radio(it)) then
338			tr_seri(:, :, it) = tr_seri(:, :, it) + d_tr_dec(:, :, it)
339			WRITE(unit=itn, fmt='(i1)') it
340			CALL minmaxqfi(tr_seri(:, :, it), 0., 1e33, 'puits rn it='//itn)
341			endif
342			ENDDO
343	guez	3
344	guez	98	if (nqmx >= 5) then
345	guez	6	! Ozone as a tracer:
346	guez	7	if (mod(itap - 1, lmt_pas) == 0) then
347			! Once per day, update the coefficients for ozone chemistry:
348			call regr_pr_comb_coefoz(julien)
349			end if
350	guez	6	call o3_chem(julien, gmtime, t_seri, zmasse, pdtphys, tr_seri(:, :, 3))
351			end if
352	guez	3
353			! Calcul de l'effet de la precipitation
354
355			IF (lessivage) THEN
356	guez	98	d_tr_lessi_nucl = 0.
357			d_tr_lessi_impa = 0.
358			flestottr = 0.
359	guez	3
360			! tendance des aerosols nuclees et impactes
361
362	guez	98	DO it = 1, nqmx - 2
363	guez	3	IF (aerosol(it)) THEN
364			DO k = 1, llm
365			DO i = 1, klon
366			d_tr_lessi_nucl(i, k, it) = d_tr_lessi_nucl(i, k, it) + &
367	guez	78	(1 - frac_nucl(i, k))*tr_seri(i, k, it)
368	guez	3	d_tr_lessi_impa(i, k, it) = d_tr_lessi_impa(i, k, it) + &
369	guez	78	(1 - frac_impa(i, k))*tr_seri(i, k, it)
370	guez	3	ENDDO
371			ENDDO
372			ENDIF
373			ENDDO
374
375			! Mises a jour des traceurs + calcul des flux de lessivage
376			! Mise a jour due a l'impaction et a la nucleation
377
378	guez	98	DO it = 1, nqmx - 2
379	guez	3	IF (aerosol(it)) THEN
380			DO k = 1, llm
381			DO i = 1, klon
382	guez	78	tr_seri(i, k, it) = tr_seri(i, k, it) * frac_impa(i, k) &
383			* frac_nucl(i, k)
384	guez	3	ENDDO
385			ENDDO
386			ENDIF
387			ENDDO
388
389			! Flux lessivage total
390
391	guez	98	DO it = 1, nqmx - 2
392	guez	3	DO k = 1, llm
393			DO i = 1, klon
394	guez	78	flestottr(i, k, it) = flestottr(i, k, it) &
395			- (d_tr_lessi_nucl(i, k, it) + d_tr_lessi_impa(i, k, it)) &
396			* (paprs(i, k)-paprs(i, k+1)) / (RG * pdtphys)
397	guez	3	ENDDO
398			ENDDO
399			ENDDO
400			ENDIF
401
402	guez	78	! Ecriture des sorties
403	guez	98	call write_histrac(lessivage, itap, nid_tra)
404	guez	3
405			if (lafin) then
406			print *, "C'est la fin de la physique."
407	guez	78	open(unit=99, file='restarttrac', form='formatted')
408	guez	3	do i=1, klon
409			write(unit=99, fmt=*) trs(i, 1)
410			enddo
411			PRINT *, 'Ecriture du fichier restarttrac'
412	guez	78	close(unit=99)
413	guez	3	endif
414
415			contains
416
417	guez	98	subroutine write_histrac(lessivage, itap, nid_tra)
418	guez	3
419			! From phylmd/write_histrac.h, version 1.9 2006/02/21 08:08:30
420
421			use dimens_m, only: iim, jjm, llm
422	guez	61	use histsync_m, only: histsync
423	guez	30	use histwrite_m, only: histwrite
424	guez	3	use temps, only: itau_phy
425	guez	131	use iniadvtrac_m, only: tname
426	guez	3	use comgeomphy, only: airephy
427			use dimphy, only: klon
428	guez	32	use grid_change, only: gr_phy_write_2d
429			use gr_phy_write_3d_m, only: gr_phy_write_3d
430	guez	3
431			logical, intent(in):: lessivage
432	guez	78	integer, intent(in):: itap ! number of calls to "physiq"
433	guez	3	integer, intent(in):: nid_tra
434
435			! Variables local to the procedure:
436			integer it
437	guez	78	integer itau_w ! pas de temps ecriture
438	guez	3	logical, parameter:: ok_sync = .true.
439
440			!-----------------------------------------------------
441
442	guez	7	itau_w = itau_phy + itap
443	guez	3
444	guez	20	CALL histwrite(nid_tra, "phis", itau_w, gr_phy_write_2d(pphis))
445			CALL histwrite(nid_tra, "aire", itau_w, gr_phy_write_2d(airephy))
446			CALL histwrite(nid_tra, "zmasse", itau_w, gr_phy_write_3d(zmasse))
447	guez	3
448	guez	98	DO it=1, nqmx - 2
449	guez	131	CALL histwrite(nid_tra, tname(it+2), itau_w, &
450	guez	20	gr_phy_write_3d(tr_seri(:, :, it)))
451	guez	3	if (lessivage) THEN
452	guez	131	CALL histwrite(nid_tra, "fl"//tname(it+2), itau_w, &
453	guez	20	gr_phy_write_3d(flestottr(:, :, it)))
454	guez	3	endif
455	guez	131	CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_th_"//tname(it+2), itau_w, &
456	guez	20	gr_phy_write_3d(d_tr_th(:, :, it)))
457	guez	131	CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_cv_"//tname(it+2), itau_w, &
458	guez	20	gr_phy_write_3d(d_tr_cv(:, :, it)))
459	guez	131	CALL histwrite(nid_tra, "d_tr_cl_"//tname(it+2), itau_w, &
460	guez	20	gr_phy_write_3d(d_tr_cl(:, :, it)))
461	guez	3	ENDDO
462
463	guez	20	CALL histwrite(nid_tra, "pplay", itau_w, gr_phy_write_3d(pplay))
464	guez	22	CALL histwrite(nid_tra, "T", itau_w, gr_phy_write_3d(t_seri))
465	guez	3
466			if (ok_sync) then
467			call histsync(nid_tra)
468			endif
469
470			end subroutine write_histrac
471
472			END SUBROUTINE phytrac
473
474			end module phytrac_m