--- trunk/libf/phylmd/phytrac.f90	2011/01/06 17:52:19	38
+++ trunk/libf/phylmd/phytrac.f90	2012/07/26 14:37:37	62
@@ -8,13 +8,12 @@
 contains
 
   SUBROUTINE phytrac(rnpb, itap, lmt_pas, julien, gmtime, firstcal, lafin, &
-       nq_phys, pdtphys, u, t_seri, paprs, pplay, pmfu, pmfd, pen_u, &
-       pde_u, pen_d, pde_d, coefh, fm_therm, entr_therm, yu1, yv1, ftsol, &
-       pctsrf, frac_impa, frac_nucl, pphis, pphi, albsol, rh, cldfra, rneb, &
-       diafra, cldliq, pmflxr, pmflxs, prfl, psfl, da, &
-       phi, mp, upwd, dnwd, tr_seri, zmasse)
+       nq_phys, pdtphys, u, t_seri, paprs, pplay, pmfu, pmfd, pen_u, pde_u, &
+       pen_d, pde_d, coefh, fm_therm, entr_therm, yu1, yv1, ftsol, pctsrf, &
+       frac_impa, frac_nucl, pphis, albsol, rh, cldfra, rneb, diafra, cldliq, &
+       pmflxr, pmflxs, prfl, psfl, da, phi, mp, upwd, dnwd, tr_seri, zmasse)
 
-    ! From phylmd/phytrac.F, version 1.15 2006/02/21 08:08:30
+    ! From phylmd/phytrac.F, version 1.15 2006/02/21 08:08:30 (SVN revision 679)
 
     ! Authors: Frédéric Hourdin, Abderrahmane Idelkadi, Marie-Alice
     ! Foujols, Olivia
@@ -24,6 +23,10 @@
     ! les vrais traceurs (en nombre "nbtr", sans la vapeur d'eau ni l'eau
     ! liquide) dans "phytrac".
 
+    ! Modifications pour les traceurs :
+    ! - uniformisation des parametrisations dans phytrac
+    ! - stockage des moyennes des champs nécessaires en mode traceur off-line 
+
     use dimens_m, only: llm
     use indicesol, only: nbsrf
     use dimphy, only: klon, nbtr
@@ -56,7 +59,7 @@
     real, intent(inout):: tr_seri(:, :, :) ! (klon, llm, nbtr)
     ! (mass fractions of tracers, excluding water, at mid-layers)
 
-    real u(klon, llm)
+    real, intent(in):: u(klon, llm)
     real rh(klon, llm)     ! humidite relative
     real cldliq(klon, llm) ! eau liquide nuageuse
     real cldfra(klon, llm) ! fraction nuageuse (tous les nuages)
@@ -73,8 +76,7 @@
     real, intent(in):: pplay(klon, llm)
     ! (pression pour le mileu de chaque couche, en Pa)
 
-    real pphi(klon, llm) ! geopotentiel
-    real pphis(klon)
+    real, intent(in):: pphis(klon)
     logical, intent(in):: firstcal ! first call to "calfis"
     logical, intent(in):: lafin ! fin de la physique
 
@@ -82,7 +84,7 @@
     REAL prfl(klon, llm+1),   psfl(klon, llm+1)     !--lessivage large-scale
 
     !   convection:
-    REAL pmfu(klon, llm)  ! flux de masse dans le panache montant
+    REAL, intent(in):: pmfu(klon, llm) ! flux de masse dans le panache montant
     REAL pmfd(klon, llm)  ! flux de masse dans le panache descendant
     REAL pen_u(klon, llm) ! flux entraine dans le panache montant
 
@@ -93,10 +95,10 @@
     REAL pde_u(klon, llm) ! flux detraine dans le panache montant
     REAL pen_d(klon, llm) ! flux entraine dans le panache descendant
     REAL pde_d(klon, llm) ! flux detraine dans le panache descendant
-    ! KE
+    ! Kerry Emanuel
     real da(klon, llm), phi(klon, llm, llm), mp(klon, llm)
-    REAL upwd(klon, llm)      ! saturated updraft mass flux
-    REAL dnwd(klon, llm)      ! saturated downdraft mass flux
+    REAL, intent(in):: upwd(klon, llm) ! saturated updraft mass flux
+    REAL, intent(in):: dnwd(klon, llm) ! saturated downdraft mass flux
 
     !   Couche limite:
 
@@ -234,32 +236,29 @@
        end if
     ENDIF
 
-    ! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
     if (inirnpb) THEN
-
+       ! Initialisation du traceur dans le sol (couche limite radonique)
        radio(1)= .true.
        radio(2)= .true.
        clsol(1)= .true.
        clsol(2)= .true.
        aerosol(2) = .TRUE. ! le Pb est un aerosol 
-
        call initrrnpb(ftsol, pctsrf, masktr, fshtr, hsoltr, tautr, vdeptr, &
             scavtr)
        inirnpb=.false.
     endif
 
-    ! Calcul de l'effet de la convection
-
     if (convection) then
+       ! Calcul de l'effet de la convection
        DO it=1, nq_phys
-          if (iflag_con.eq.2) then
-             ! tiedke
+          if (iflag_con == 2) then
+             ! Tiedke
              CALL nflxtr(pdtphys, pmfu, pmfd, pen_u, pde_u, pen_d, pde_d, &
                   paprs, tr_seri(1, 1, it), d_tr_cv(1, 1, it))
-          else if (iflag_con.eq.3) then
-             ! KE
-             call cvltr(pdtphys, da, phi, mp, paprs, &
-                  tr_seri(1, 1, it), upwd, dnwd, d_tr_cv(1, 1, it))
+          else if (iflag_con == 3) then
+             ! Emanuel
+             call cvltr(pdtphys, da, phi, mp, paprs, tr_seri(1, 1, it), upwd, &
+                  dnwd, d_tr_cv(1, 1, it))
           endif
 
           DO k = 1, llm
@@ -453,7 +452,7 @@
       ! From phylmd/write_histrac.h, version 1.9 2006/02/21 08:08:30
 
       use dimens_m, only: iim, jjm, llm
-      use histcom, only: histsync
+      use histsync_m, only: histsync
       use histwrite_m, only: histwrite
       use temps, only: itau_phy
       use iniadvtrac_m, only: tnom