Changeset 863 for codes


Ignore:
Timestamp:
05/09/19 01:37:55 (5 years ago)
Author:
dubos
Message:

devel : split read_dump_partition into open_local_mesh_file and read_local_mesh

Location:
codes/icosagcm/devel/src
Files:
3 edited
1 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • codes/icosagcm/devel/src/base/init_grid_param.f90

    r830 r863  
    77    USE grid_param 
    88    USE ioipsl, ONLY : getin 
    9     USE init_unstructured_mod, ONLY : read_dump_partition 
     9    USE init_unstructured_mod, ONLY : open_local_mesh_file 
    1010    LOGICAL :: is_mpi_root 
    1111    CHARACTER(len=255) :: grid_type_var 
    … …  
    2424       !       is_omp_level_master=.TRUE. 
    2525       !       omp_level_size=1 
    26        CALL read_dump_partition 
     26       CALL open_local_mesh_file 
    2727       IF (is_mpi_root) PRINT *,'DYNAMICO mesh is unstructured/LAM.' 
    2828    CASE DEFAULT 

  • codes/icosagcm/devel/src/sphere/compute_geometry.f90

    r860 r863  
    1 MODULE geometry 
    2   USE field_mod 
     1MODULE compute_geometry_mod 
     2  USE geometry 
    33  IMPLICIT NONE 
    4  
    5   TYPE t_geometry 
    6     TYPE(t_field),POINTER :: centroid(:) 
    7     TYPE(t_field),POINTER :: xyz_i(:) 
    8     TYPE(t_field),POINTER :: xyz_e(:) 
    9     TYPE(t_field),POINTER :: xyz_v(:) 
    10     TYPE(t_field),POINTER :: lon_i(:) 
    11     TYPE(t_field),POINTER :: lon_e(:) 
    12     TYPE(t_field),POINTER :: lat_i(:) 
    13     TYPE(t_field),POINTER :: lat_e(:) 
    14     TYPE(t_field),POINTER :: ep_e(:) 
    15     TYPE(t_field),POINTER :: et_e(:) 
    16     TYPE(t_field),POINTER :: elon_i(:) 
    17     TYPE(t_field),POINTER :: elat_i(:) 
    18     TYPE(t_field),POINTER :: elon_e(:) 
    19     TYPE(t_field),POINTER :: elat_e(:) 
    20     TYPE(t_field),POINTER :: Ai(:) 
    21     TYPE(t_field),POINTER :: Av(:) 
    22     TYPE(t_field),POINTER :: de(:) 
    23     TYPE(t_field),POINTER :: le(:) 
    24     TYPE(t_field),POINTER :: le_de(:) ! le/de, 0. if de=0. 
    25     TYPE(t_field),POINTER :: Riv(:) 
    26     TYPE(t_field),POINTER :: S1(:) 
    27     TYPE(t_field),POINTER :: S2(:) 
    28     TYPE(t_field),POINTER :: Riv2(:) 
    29     TYPE(t_field),POINTER :: ne(:) 
    30     TYPE(t_field),POINTER :: Wee(:) 
    31     TYPE(t_field),POINTER :: bi(:) 
    32     TYPE(t_field),POINTER :: fv(:) 
    33   END TYPE t_geometry     
    34  
    35   TYPE(t_geometry),SAVE,TARGET :: geom 
    36  
    37    
    38   REAL(rstd),POINTER :: Ai(:)          ! area of a cell 
    39 !$OMP THREADPRIVATE(Ai) 
    40   REAL(rstd),POINTER :: centroid(:,:)  ! coordinate of the centroid of the cell 
    41 !$OMP THREADPRIVATE(centroid) 
    42   REAL(rstd),POINTER :: xyz_i(:,:)     ! coordinate of the center of the cell (voronoi) 
    43 !$OMP THREADPRIVATE(xyz_i) 
    44   REAL(rstd),POINTER :: xyz_e(:,:)     ! coordinate of a wind point on the cell on a edge 
    45 !$OMP THREADPRIVATE(xyz_e) 
    46   REAL(rstd),POINTER :: xyz_v(:,:)     ! coordinate of a vertex (center of the dual mesh) 
    47 !$OMP THREADPRIVATE(xyz_v) 
    48   REAL(rstd),POINTER :: lon_i(:)       ! longitude of the center of the cell (voronoi) 
    49 !$OMP THREADPRIVATE(lon_i) 
    50   REAL(rstd),POINTER :: lon_e(:)       ! longitude of a wind point on the cell on a edge 
    51 !$OMP THREADPRIVATE(lon_e) 
    52   REAL(rstd),POINTER :: lat_i(:)       ! latitude of the center of the cell (voronoi) 
    53 !$OMP THREADPRIVATE(lat_i) 
    54   REAL(rstd),POINTER :: lat_e(:)       ! latitude of a wind point on the cell on a edge 
    55 !$OMP THREADPRIVATE(lat_e) 
    56   REAL(rstd),POINTER :: ep_e(:,:)      ! perpendicular unit vector of a edge (outsider) 
    57 !$OMP THREADPRIVATE(ep_e) 
    58   REAL(rstd),POINTER :: et_e(:,:)      ! tangeantial unit vector of a edge 
    59 !$OMP THREADPRIVATE(et_e) 
    60   REAL(rstd),POINTER :: elon_i(:,:)    ! unit longitude vector on the center  
    61 !$OMP THREADPRIVATE(elon_i) 
    62   REAL(rstd),POINTER :: elat_i(:,:)    ! unit latitude vector on the center  
    63 !$OMP THREADPRIVATE(elat_i) 
    64   REAL(rstd),POINTER :: elon_e(:,:)    ! unit longitude vector on a wind point  
    65 !$OMP THREADPRIVATE(elon_e) 
    66   REAL(rstd),POINTER :: elat_e(:,:)    ! unit latitude vector on a wind point 
    67 !$OMP THREADPRIVATE(elat_e) 
    68   REAL(rstd),POINTER :: Av(:)          ! area of dual mesk cell 
    69 !$OMP THREADPRIVATE(Av) 
    70   REAL(rstd),POINTER :: de(:)          ! distance from a neighbour == lenght of an edge of the dual mesh 
    71 !$OMP THREADPRIVATE(de) 
    72   REAL(rstd),POINTER :: le(:)          ! lenght of a edge 
    73 !$OMP THREADPRIVATE(le) 
    74   REAL(rstd),POINTER :: le_de(:)       ! le/de 
    75 !$OMP THREADPRIVATE(le_de) 
    76   REAL(rstd),POINTER :: S1(:,:)        ! area of sub-triangle 
    77 !$OMP THREADPRIVATE(S1) 
    78   REAL(rstd),POINTER :: S2(:,:)        ! area of sub-tirangle 
    79 !$OMP THREADPRIVATE(S2) 
    80   REAL(rstd),POINTER :: Riv(:,:)       ! weight 
    81 !$OMP THREADPRIVATE(Riv) 
    82   REAL(rstd),POINTER :: Riv2(:,:)      ! weight 
    83 !$OMP THREADPRIVATE(Riv2) 
    84   INTEGER,POINTER    :: ne(:,:)        ! convention for the way on the normal wind on an edge  
    85 !$OMP THREADPRIVATE(ne) 
    86   REAL(rstd),POINTER :: Wee(:,:,:)     ! weight 
    87 !$OMP THREADPRIVATE(Wee) 
    88   REAL(rstd),POINTER :: bi(:)          ! orographie 
    89 !$OMP THREADPRIVATE(bi) 
    90   REAL(rstd),POINTER :: fv(:)          ! coriolis (evaluted on a vertex) 
    91 !$OMP THREADPRIVATE(fv) 
    92       
    93  
    94   INTEGER, PARAMETER :: ne_right=1 
    95   INTEGER, PARAMETER :: ne_rup=-1 
    96   INTEGER, PARAMETER :: ne_lup=1 
    97   INTEGER, PARAMETER :: ne_left=-1 
    98   INTEGER, PARAMETER :: ne_ldown=1 
    99   INTEGER, PARAMETER :: ne_rdown=-1 
     4  PRIVATE 
     5  SAVE 
     6 
     7  PUBLIC :: compute_geometry 
    1008 
    1019CONTAINS 
    102  
    103   SUBROUTINE allocate_geometry 
    104   USE field_mod 
    105   IMPLICIT NONE 
    106    
    107     CALL allocate_field(geom%Ai,field_t,type_real,name='Ai') 
    108  
    109     CALL allocate_field(geom%xyz_i,field_t,type_real,3) 
    110     CALL allocate_field(geom%lon_i,field_t,type_real) 
    111     CALL allocate_field(geom%lat_i,field_t,type_real) 
    112     CALL allocate_field(geom%elon_i,field_t,type_real,3) 
    113     CALL allocate_field(geom%elat_i,field_t,type_real,3) 
    114     CALL allocate_field(geom%centroid,field_t,type_real,3) 
    115  
    116     CALL allocate_field(geom%xyz_e,field_u,type_real,3) 
    117     CALL allocate_field(geom%lon_e,field_u,type_real) 
    118     CALL allocate_field(geom%lat_e,field_u,type_real) 
    119     CALL allocate_field(geom%elon_e,field_u,type_real,3) 
    120     CALL allocate_field(geom%elat_e,field_u,type_real,3) 
    121     CALL allocate_field(geom%ep_e,field_u,type_real,3) 
    122     CALL allocate_field(geom%et_e,field_u,type_real,3) 
    123  
    124     CALL allocate_field(geom%xyz_v,field_z,type_real,3) 
    125     CALL allocate_field(geom%de,field_u,type_real) 
    126     CALL allocate_field(geom%le,field_u,type_real) 
    127     CALL allocate_field(geom%le_de,field_u,type_real) 
    128     CALL allocate_field(geom%bi,field_t,type_real) 
    129     CALL allocate_field(geom%Av,field_z,type_real) 
    130     CALL allocate_field(geom%S1,field_t,type_real,6) 
    131     CALL allocate_field(geom%S2,field_t,type_real,6) 
    132     CALL allocate_field(geom%Riv,field_t,type_real,6) 
    133     CALL allocate_field(geom%Riv2,field_t,type_real,6) 
    134     CALL allocate_field(geom%ne,field_t,type_integer,6) 
    135     CALL allocate_field(geom%Wee,field_u,type_real,5,2) 
    136     CALL allocate_field(geom%bi,field_t,type_real) 
    137     CALL allocate_field(geom%fv,field_z,type_real) 
    138  
    139   END SUBROUTINE allocate_geometry 
    140    
    141    
    142   SUBROUTINE swap_geometry(ind) 
    143   USE field_mod 
    144   USE domain_mod, ONLY : swap_needed 
    145   IMPLICIT NONE 
    146     INTEGER,INTENT(IN) :: ind 
    147  
    148     IF(.NOT. swap_needed) RETURN 
    149  
    150 !!$OMP MASTER 
    151     Ai=geom%Ai(ind) 
    152     xyz_i=geom%xyz_i(ind) 
    153     centroid=geom%centroid(ind) 
    154     xyz_e=geom%xyz_e(ind) 
    155     ep_e=geom%ep_e(ind) 
    156     et_e=geom%et_e(ind) 
    157     lon_i=geom%lon_i(ind) 
    158     lat_i=geom%lat_i(ind) 
    159     lon_e=geom%lon_e(ind) 
    160     lat_e=geom%lat_e(ind) 
    161     elon_i=geom%elon_i(ind) 
    162     elat_i=geom%elat_i(ind) 
    163     elon_e=geom%elon_e(ind) 
    164     elat_e=geom%elat_e(ind) 
    165     xyz_v=geom%xyz_v(ind) 
    166     de=geom%de(ind) 
    167     le=geom%le(ind) 
    168     le_de=geom%le_de(ind) 
    169     Av=geom%Av(ind) 
    170     S1=geom%S1(ind) 
    171     S2=geom%S2(ind) 
    172     Riv=geom%Riv(ind) 
    173     Riv2=geom%Riv2(ind) 
    174     ne=geom%ne(ind) 
    175     Wee=geom%Wee(ind) 
    176     bi=geom%bi(ind) 
    177     fv=geom%fv(ind) 
    178 !!$OMP END MASTER 
    179 !!$OMP BARRIER     
    180   END SUBROUTINE swap_geometry 
    18110 
    18211  SUBROUTINE update_circumcenters  
    … …  
    729558   
    730559  SUBROUTINE compute_geometry 
    731   IMPLICIT NONE 
     560    USE grid_param 
     561    USE domain_mod, ONLY : swap_needed 
     562    USE init_unstructured_mod, ONLY : read_local_mesh 
     563    IMPLICIT NONE 
     564 
    732565    CALL allocate_geometry 
    733     CALL set_geometry 
    734      
     566 
     567    SELECT CASE(grid_type) 
     568    CASE(grid_ico) 
     569       CALL set_geometry 
     570    CASE(grid_unst) 
     571       swap_needed=.FALSE. 
     572       CALL read_local_mesh 
     573    CASE DEFAULT 
     574       STOP 'Invalid value of grid_type encountered in compute_geometry' 
     575    END SELECT 
    735576  END SUBROUTINE compute_geometry 
    736577   
    737 END MODULE geometry 
     578END MODULE compute_geometry_mod 

  • codes/icosagcm/devel/src/sphere/geometry.f90

    r856 r863  
    180180  END SUBROUTINE swap_geometry 
    181181 
    182   SUBROUTINE update_circumcenters  
    183     USE domain_mod 
    184     USE dimensions 
    185     USE spherical_geom_mod 
    186     USE vector 
    187     USE transfert_mod 
    188     USE omp_para 
    189  
    190     IMPLICIT NONE 
    191     REAL(rstd) :: x1(3),x2(3) 
    192     REAL(rstd) :: vect(3,6) 
    193     REAL(rstd) :: centr(3) 
    194     INTEGER :: ind,i,j,n,k 
    195     TYPE(t_message),SAVE :: message0, message1 
    196     LOGICAL, SAVE :: first=.TRUE. 
    197 !$OMP THREADPRIVATE(first)     
    198      
    199     IF (first) THEN 
    200       CALL init_message(geom%xyz_i, req_i0 ,message0) 
    201       CALL init_message(geom%xyz_i, req_i1 ,message1) 
    202       first=.FALSE. 
    203     ENDIF 
    204      
    205     CALL transfert_message(geom%xyz_i,message0) 
    206     CALL transfert_message(geom%xyz_i,message1) 
    207      
    208     DO ind=1,ndomain 
    209       IF (.NOT. assigned_domain(ind) .OR. .NOT. is_omp_level_master) CYCLE 
    210       CALL swap_dimensions(ind) 
    211       CALL swap_geometry(ind) 
    212       DO j=jj_begin,jj_end 
    213         DO i=ii_begin,ii_end 
    214           n=(j-1)*iim+i 
    215           DO k=0,5 
    216             x1(:) = xyz_i(n+t_pos(k+1),:) 
    217             x2(:) = xyz_i(n+t_pos(MOD(k+1,6)+1),:) 
    218             if (norm(x1-x2)<1e-16) x2(:) = xyz_i(n+t_pos(MOD(k+2,6)+1),:) 
    219             CALL circumcenter(xyz_i(n,:), x1, x2, xyz_v(n+z_pos(k+1),:)) 
    220           ENDDO 
    221         ENDDO 
    222       ENDDO 
    223     ENDDO 
    224  
    225   END SUBROUTINE update_circumcenters 
    226  
    227   SUBROUTINE remap_schmidt_loc 
    228     USE spherical_geom_mod 
    229     USE getin_mod 
    230     USE omp_para 
    231     USE domain_mod 
    232     USE dimensions 
    233     IMPLICIT NONE 
    234     INTEGER :: ind,i,j,n 
    235     REAL(rstd) :: schmidt_factor, schmidt_lon, schmidt_lat 
    236  
    237     ! Schmidt transform parameters 
    238     schmidt_factor = 1. 
    239     CALL getin('schmidt_factor', schmidt_factor) 
    240     schmidt_factor =  schmidt_factor**2. 
    241      
    242     schmidt_lon = 0. 
    243     CALL getin('schmidt_lon', schmidt_lon) 
    244     schmidt_lon = schmidt_lon * pi/180. 
    245  
    246     schmidt_lat = 45. 
    247     CALL getin('schmidt_lat', schmidt_lat) 
    248     schmidt_lat = schmidt_lat * pi/180. 
    249  
    250     DO ind=1,ndomain 
    251       IF (.NOT. assigned_domain(ind) .OR. .NOT. is_omp_level_master) CYCLE 
    252       CALL swap_dimensions(ind) 
    253       CALL swap_geometry(ind) 
    254       DO j=jj_begin,jj_end 
    255         DO i=ii_begin,ii_end 
    256           n=(j-1)*iim+i 
    257           CALL schmidt_transform(xyz_i(n,:), schmidt_factor, schmidt_lon, schmidt_lat) 
    258         ENDDO 
    259       ENDDO 
    260     ENDDO 
    261   END SUBROUTINE remap_schmidt_loc 
    262  
    263   SUBROUTINE optimize_geometry 
    264   USE metric 
    265   USE spherical_geom_mod 
    266   USE domain_mod 
    267   USE dimensions 
    268   USE transfert_mod 
    269   USE vector 
    270   USE getin_mod 
    271   USE omp_para 
    272   IMPLICIT NONE 
    273     INTEGER :: nb_it=0 
    274     TYPE(t_domain),POINTER :: d 
    275     INTEGER :: ind,it,i,j,n,k 
    276     REAL(rstd) :: x1(3),x2(3) 
    277     REAL(rstd) :: vect(3,6) 
    278     REAL(rstd) :: centr(3) 
    279     REAL(rstd) :: sum 
    280     LOGICAL    :: check 
    281      
    282      
    283     CALL getin('optim_it',nb_it) 
    284      
    285     DO ind=1,ndomain 
    286       IF (.NOT. assigned_domain(ind)  .OR. .NOT. is_omp_level_master) CYCLE 
    287       d=>domain(ind) 
    288       CALL swap_dimensions(ind) 
    289       CALL swap_geometry(ind) 
    290       xyz_i(:,1) = 0 ; xyz_i(:,2) = 0 ;  xyz_i(:,3) = 1 
    291        
    292       DO j=jj_begin,jj_end 
    293         DO i=ii_begin,ii_end 
    294           n=(j-1)*iim+i 
    295           xyz_i(n,:)=d%xyz(:,i,j)  
    296         ENDDO 
    297       ENDDO 
    298     ENDDO 
    299      
    300     CALL update_circumcenters 
    301  
    302     DO ind=1,ndomain 
    303       IF (.NOT. assigned_domain(ind)  .OR. .NOT. is_omp_level_master ) CYCLE 
    304       d=>domain(ind) 
    305       CALL swap_dimensions(ind) 
    306       CALL swap_geometry(ind) 
    307       DO j=jj_begin,jj_end 
    308         DO i=ii_begin,ii_end 
    309           n=(j-1)*iim+i 
    310           DO k=0,5 
    311             x1(:) = xyz_v(n+z_pos(k+1),:) 
    312             x2(:) = d%vertex(:,k,i,j)  
    313             IF (norm(x1-x2)>1e-10) THEN 
    314               PRINT*,"vertex diff ",ind,i,j,k 
    315               PRINT*,x1 
    316               PRINT*,x2 
    317             ENDIF 
    318           ENDDO 
    319         ENDDO 
    320       ENDDO 
    321     ENDDO 
    322      
    323      
    324     DO it=1,nb_it 
    325       IF (MOD(it,100)==0) THEN  
    326         check=is_master 
    327       ELSE 
    328         check=.FALSE. 
    329       ENDIF 
    330        
    331       sum=0 
    332       DO ind=1,ndomain 
    333       IF (.NOT. assigned_domain(ind)  .OR. .NOT. is_omp_level_master ) CYCLE 
    334         CALL swap_dimensions(ind) 
    335         CALL swap_geometry(ind) 
    336         DO j=jj_begin,jj_end 
    337           DO i=ii_begin,ii_end 
    338             n=(j-1)*iim+i 
    339             vect(:,1)=xyz_v(n+z_rup,:) 
    340             vect(:,2)=xyz_v(n+z_up,:) 
    341             vect(:,3)=xyz_v(n+z_lup,:) 
    342             vect(:,4)=xyz_v(n+z_ldown,:) 
    343             vect(:,5)=xyz_v(n+z_down,:) 
    344             vect(:,6)=xyz_v(n+z_rdown,:) 
    345             CALL compute_centroid(vect,6,centr) 
    346             IF (check) THEN 
    347               sum=MAX(sum,norm(xyz_i(n,:)-centr(:))) 
    348             ENDIF 
    349             xyz_i(n,:)=centr(:) 
    350           ENDDO 
    351         ENDDO 
    352          
    353       ENDDO 
    354  
    355       IF (check) PRINT *,"it = ",it,"  diff centroid circumcenter ",sum 
    356  
    357      CALL update_circumcenters 
    358  
    359     ENDDO 
    360      
    361   END SUBROUTINE optimize_geometry 
    362  
    363   SUBROUTINE update_domain  
    364     ! copy position of generators and vertices back into domain(:)%xyz/vertex 
    365     ! so that XIOS/create_header_gen gets the right values 
    366     USE omp_para 
    367     USE dimensions 
    368     USE domain_mod  
    369     USE transfert_mpi_mod 
    370  
    371     INTEGER :: ind,i,j,k,n 
    372     TYPE(t_domain),POINTER :: d 
    373     TYPE(t_field),POINTER,SAVE :: xyz_glo(:), xyz_loc(:), vertex_glo(:), vertex_loc(:) 
    374     REAL(rstd), POINTER :: xyz(:,:), vertex(:,:) 
    375      
    376     CALL allocate_field(xyz_loc, field_t, type_real, 3) 
    377     CALL allocate_field(vertex_loc, field_z, type_real, 3) 
    378  
    379     DO ind=1,ndomain 
    380        IF (.NOT. assigned_domain(ind)  .OR. .NOT. is_omp_level_master ) CYCLE 
    381        CALL swap_dimensions(ind) 
    382        CALL swap_geometry(ind) 
    383        xyz = xyz_loc(ind) 
    384        xyz(:,:) = xyz_i(:,:) 
    385        vertex = vertex_loc(ind) 
    386        vertex(:,:) = xyz_v(:,:) 
    387     END DO 
    388  
    389 !$OMP BARRIER     
    390 !$OMP MASTER 
    391     CALL allocate_field_glo(xyz_glo, field_t, type_real, 3) 
    392     CALL allocate_field_glo(vertex_glo, field_z, type_real, 3) 
    393  
    394     CALL gather_field(xyz_loc, xyz_glo) 
    395     CALL gather_field(vertex_loc, vertex_glo) 
    396  
    397     CALL bcast_field(xyz_glo) 
    398     CALL bcast_field(vertex_glo) 
    399  
    400     DO ind=1,ndomain_glo 
    401        d=>domain_glo(ind) 
    402        xyz = xyz_glo(ind) 
    403        vertex = vertex_glo(ind) 
    404        DO j=d%jj_begin,d%jj_end 
    405           DO i=d%ii_begin,d%ii_end           
    406              n=(j-1)*d%iim+i 
    407              d%xyz(:,i,j)=xyz(n,:) 
    408              DO k=0,5 
    409                 d%vertex(:,k,i,j) = vertex(n+d%z_pos(k+1),:) 
    410              END DO 
    411           END DO 
    412        END DO 
    413     END DO 
    414  
    415     CALL deallocate_field_glo(vertex_glo) 
    416     CALL deallocate_field_glo(xyz_glo) 
    417 !$OMP END MASTER 
    418 !$OMP BARRIER 
    419     CALL deallocate_field(vertex_loc) 
    420     CALL deallocate_field(xyz_loc) 
    421  
    422   END SUBROUTINE update_domain 
    423    
    424   SUBROUTINE set_geometry 
    425   USE metric 
    426   USE vector 
    427   USE spherical_geom_mod 
    428   USE domain_mod 
    429   USE dimensions 
    430   USE transfert_mod 
    431   USE getin_mod 
    432   USE omp_para 
    433   IMPLICIT NONE 
    434  
    435     REAL(rstd) :: surf(6) 
    436     REAL(rstd) :: surf_v(6) 
    437     REAL(rstd) :: vect(3,6) 
    438     REAL(rstd) :: centr(3) 
    439     REAL(rstd) :: vet(3),vep(3), vertex(3) 
    440     INTEGER :: ind,i,j,k,n 
    441     TYPE(t_domain),POINTER :: d 
    442     REAL(rstd) ::  S12 
    443     REAL(rstd) :: w(6) 
    444     REAL(rstd) :: lon,lat 
    445     INTEGER :: ii_glo,jj_glo 
    446     REAL(rstd) :: S 
    447            
    448        
    449     CALL optimize_geometry 
    450     CALL remap_schmidt_loc 
    451     CALL update_circumcenters 
    452     ! copy position of generators and vertices back into domain(:)%xyz/vertex 
    453     ! so that XIOS gets the right values 
    454     CALL update_domain 
    455  
    456     DO ind=1,ndomain 
    457       IF (.NOT. assigned_domain(ind)  .OR. .NOT. is_omp_level_master ) CYCLE 
    458       d=>domain(ind) 
    459       CALL swap_dimensions(ind) 
    460       CALL swap_geometry(ind) 
    461       lon_i(:)=0 ; lat_i(:)=0 
    462       lon_e(:)=0 ; lat_e(:)=0 
    463       DO j=jj_begin-1,jj_end+1 
    464         DO i=ii_begin-1,ii_end+1 
    465           n=(j-1)*iim+i 
    466  
    467           DO k=0,5 
    468             ne(n,k+1)=d%ne(k,i,j) 
    469           ENDDO 
    470  
    471           vect(:,1)=xyz_v(n+z_rup,:) 
    472           vect(:,2)=xyz_v(n+z_up,:) 
    473           vect(:,3)=xyz_v(n+z_lup,:) 
    474           vect(:,4)=xyz_v(n+z_ldown,:) 
    475           vect(:,5)=xyz_v(n+z_down,:) 
    476           vect(:,6)=xyz_v(n+z_rdown,:) 
    477           CALL compute_centroid(vect,6,centr) 
    478           centroid(n,:)=centr(:) 
    479  
    480                 
    481           CALL xyz2lonlat(xyz_v(n+z_up,:),lon,lat) 
    482           fv(n+z_up)=2*sin(lat)*omega 
    483           CALL xyz2lonlat(xyz_v(n+z_down,:),lon,lat) 
    484           fv(n+z_down)=2*sin(lat)*omega 
    485            
    486           bi(n)=0.  
    487          
    488           CALL dist_cart(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_right,:),de(n+u_right)) 
    489           CALL dist_cart(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_lup,:),de(n+u_lup)) 
    490           CALL dist_cart(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_ldown,:),de(n+u_ldown)) 
    491            
    492           CALL div_arc_bis(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_right,:),0.5,xyz_e(n+u_right,:)) 
    493           CALL div_arc_bis(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_lup,:),0.5,xyz_e(n+u_lup,:)) 
    494           CALL div_arc_bis(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_ldown,:),0.5,xyz_e(n+u_ldown,:)) 
    495  
    496           CALL dist_cart(xyz_v(n+z_rdown,:), xyz_v(n+z_rup,:),le(n+u_right)) 
    497           CALL dist_cart(xyz_v(n+z_up,:), xyz_v(n+z_lup,:),le(n+u_lup)) 
    498           CALL dist_cart(xyz_v(n+z_ldown,:), xyz_v(n+z_down,:),le(n+u_ldown)) 
    499  
    500           le_de(n+u_right)=le(n+u_right)/de(n+u_right) ! NaN possible but should be harmless 
    501           le_de(n+u_lup)  =le(n+u_lup)  /de(n+u_lup) 
    502           le_de(n+u_ldown)=le(n+u_ldown)/de(n+u_ldown) 
    503  
    504           Ai(n)=0 
    505           DO k=0,5 
    506             CALL surf_triangle(xyz_i(n,:),xyz_i(n+t_pos(k+1),:),xyz_i(n+t_pos(MOD((k+1+6),6)+1),:),surf_v(k+1)) 
    507             CALL surf_triangle(xyz_i(n,:),xyz_v(n+z_pos(MOD((k-1+6),6)+1),:),xyz_v(n+z_pos(k+1),:),surf(k+1)) 
    508             Ai(n)=Ai(n)+surf(k+1) 
    509             IF (i==ii_end .AND. j==jj_begin) THEN 
    510               IF (Ai(n)<1e20) THEN 
    511               ELSE 
    512                 PRINT *,"PB !!",Ai(n),k,surf(k+1) 
    513                 PRINT*,xyz_i(n,:),xyz_v(n+z_pos(MOD((k-1+6),6)+1),:),xyz_v(n+z_pos(k+1),:) 
    514               ENDIF 
    515             ENDIF 
    516           ENDDO 
    517  
    518           ! Sign convention : Ringler et al., JCP 2010, eq. 21 p. 3071 
    519           ! Normal component is along outgoing normal vector if ne=1 
    520  
    521           CALL cross_product2(xyz_v(n+z_rdown,:),xyz_v(n+z_rup,:),vep) 
    522           IF (norm(vep)>1e-30) THEN 
    523             vep(:)=vep(:)/norm(vep)                         ! Inward normal vector 
    524             CALL cross_product2(vep,xyz_e(n+u_right,:),vet) ! Counter-clockwise tangent vector  
    525             vet(:)=vet(:)/norm(vet) 
    526             ep_e(n+u_right,:)=-vep(:)*ne(n,right) 
    527             et_e(n+u_right,:)=vet(:)*ne(n,right) 
    528           ENDIF 
    529  
    530           CALL cross_product2(xyz_v(n+z_up,:),xyz_v(n+z_lup,:),vep) 
    531           IF (norm(vep)>1e-30) THEN 
    532             vep(:)=vep(:)/norm(vep) 
    533             CALL cross_product2(vep,xyz_e(n+u_lup,:),vet) 
    534             vet(:)=vet(:)/norm(vet) 
    535             ep_e(n+u_lup,:)=-vep(:)*ne(n,lup) 
    536             et_e(n+u_lup,:)=vet(:)*ne(n,lup) 
    537           ENDIF 
    538  
    539           CALL cross_product2(xyz_v(n+z_ldown,:),xyz_v(n+z_down,:),vep) 
    540           IF (norm(vep)>1e-30) THEN 
    541             vep(:)=vep(:)/norm(vep) 
    542             CALL cross_product2(vep,xyz_e(n+u_ldown,:),vet) 
    543             vet(:)=vet(:)/norm(vet) 
    544             ep_e(n+u_ldown,:)=-vep(:)*ne(n,ldown) 
    545             et_e(n+u_ldown,:)=vet(:)*ne(n,ldown) 
    546           ENDIF 
    547  
    548           CALL xyz2lonlat(xyz_i(n,:),lon,lat) 
    549           lon_i(n)=lon 
    550           lat_i(n)=lat 
    551           elon_i(n,1) = -sin(lon) 
    552           elon_i(n,2) = cos(lon) 
    553           elon_i(n,3) = 0 
    554           elat_i(n,1) = -cos(lon)*sin(lat) 
    555           elat_i(n,2) = -sin(lon)*sin(lat) 
    556           elat_i(n,3) = cos(lat) 
    557  
    558            
    559           CALL xyz2lonlat(xyz_e(n+u_right,:),lon,lat) 
    560           lon_e(n+u_right)=lon 
    561           lat_e(n+u_right)=lat 
    562           elon_e(n+u_right,1) = -sin(lon) 
    563           elon_e(n+u_right,2) = cos(lon) 
    564           elon_e(n+u_right,3) = 0 
    565           elat_e(n+u_right,1) = -cos(lon)*sin(lat) 
    566           elat_e(n+u_right,2) = -sin(lon)*sin(lat) 
    567           elat_e(n+u_right,3) = cos(lat) 
    568            
    569           CALL xyz2lonlat(xyz_e(n+u_lup,:),lon,lat) 
    570           lon_e(n+u_lup)=lon 
    571           lat_e(n+u_lup)=lat 
    572           elon_e(n+u_lup,1) = -sin(lon) 
    573           elon_e(n+u_lup,2) = cos(lon) 
    574           elon_e(n+u_lup,3) = 0 
    575           elat_e(n+u_lup,1) = -cos(lon)*sin(lat) 
    576           elat_e(n+u_lup,2) = -sin(lon)*sin(lat) 
    577           elat_e(n+u_lup,3) = cos(lat) 
    578   
    579           CALL xyz2lonlat(xyz_e(n+u_ldown,:),lon,lat) 
    580           lon_e(n+u_ldown)=lon 
    581           lat_e(n+u_ldown)=lat 
    582           elon_e(n+u_ldown,1) = -sin(lon) 
    583           elon_e(n+u_ldown,2) = cos(lon) 
    584           elon_e(n+u_ldown,3) = 0 
    585           elat_e(n+u_ldown,1) = -cos(lon)*sin(lat) 
    586           elat_e(n+u_ldown,2) = -sin(lon)*sin(lat) 
    587           elat_e(n+u_ldown,3) = cos(lat) 
    588   
    589            
    590           DO k=0,5 
    591             CALL surf_triangle(xyz_i(n,:), xyz_v(n+z_pos(k+1),:), xyz_i(n+t_pos(k+1),:),S1(n,k+1) ) 
    592             CALL surf_triangle(xyz_i(n,:), xyz_v(n+z_pos(k+1),:), xyz_i(n+t_pos(MOD(k+1+6,6)+1),:),S2(n,k+1) ) 
    593             S12 = .5*(S1(n,k+1)+S2(n,k+1)) 
    594             Riv(n,k+1)=S12/Ai(n) 
    595             Riv2(n,k+1)=S12/surf_v(k+1) 
    596           ENDDO 
    597  
    598           DO k=1,6 
    599             IF (ABS(surf_v(k))<1e-30) THEN 
    600               Riv(n,k)=0. 
    601             ENDIF 
    602           ENDDO 
    603            
    604           Av(n+z_up)=surf_v(vup)+1e-100 
    605           Av(n+z_down)=surf_v(vdown)+1e-100 
    606          
    607         ENDDO 
    608       ENDDO 
    609        
    610       DO j=jj_begin,jj_end 
    611         DO i=ii_begin,ii_end 
    612           n=(j-1)*iim+i 
    613     
    614           CALL compute_wee(n,right,w) 
    615           Wee(n+u_right,:,1)=w(1:5) 
    616  
    617           CALL compute_wee(n+t_right,left,w) 
    618           Wee(n+u_right,:,2)=w(1:5) 
    619  
    620  
    621           CALL compute_wee(n,lup,w) 
    622           Wee(n+u_lup,:,1)=w(1:5) 
    623  
    624           CALL compute_wee(n+t_lup,rdown,w) 
    625           Wee(n+u_lup,:,2)=w(1:5) 
    626  
    627  
    628           CALL compute_wee(n,ldown,w) 
    629           Wee(n+u_ldown,:,1)=w(1:5) 
    630  
    631           CALL compute_wee(n+t_ldown,rup,w) 
    632           Wee(n+u_ldown,:,2)=w(1:5) 
    633  
    634         ENDDO 
    635       ENDDO 
    636        
    637       DO j=jj_begin,jj_end 
    638         DO i=ii_begin,ii_end 
    639           n=(j-1)*iim+i 
    640           ii_glo=d%ii_begin_glo-d%ii_begin+i 
    641           jj_glo=d%jj_begin_glo-d%jj_begin+j 
    642            
    643           IF (ii_glo==1 .AND. jj_glo==1) THEN 
    644             le(n+u_ldown)=0 
    645             le_de(n+u_ldown)=0 
    646             xyz_v(n+z_ldown,:)=xyz_v(n+z_down,:) 
    647                         
    648           ENDIF 
    649  
    650           IF (ii_glo==iim_glo .AND. jj_glo==1) THEN 
    651             le(n+u_right)=0 
    652             le_de(n+u_right)=0 
    653             xyz_v(n+z_rdown,:)=xyz_v(n+z_rup,:) 
    654           ENDIF 
    655  
    656           IF (ii_glo==iim_glo .AND. jj_glo==jjm_glo) THEN 
    657             le(n+u_rup)=0 
    658             le_de(n+u_rup)=0 
    659             xyz_v(n+z_rup,:)=xyz_v(n+z_up,:) 
    660           ENDIF 
    661  
    662           IF (ii_glo==1 .AND. jj_glo==jjm_glo) THEN 
    663             le(n+u_lup)=0 
    664             le_de(n+u_lup)=0 
    665             xyz_v(n+z_up,:)=xyz_v(n+z_lup,:) 
    666           ENDIF 
    667            
    668         ENDDO 
    669       ENDDO 
    670  
    671       DO j=jj_begin-1,jj_end+1 
    672         DO i=ii_begin-1,ii_end+1 
    673           n=(j-1)*iim+i 
    674           xyz_i(n,:)=xyz_i(n,:) * radius 
    675           xyz_v(n+z_up,:)=xyz_v(n+z_up,:) * radius 
    676           xyz_v(n+z_down,:)=xyz_v(n+z_down,:) *radius 
    677           de(n+u_right)=de(n+u_right) * radius 
    678           de(n+u_lup)=de(n+u_lup)*radius 
    679           de(n+u_ldown)=de(n+u_ldown)*radius 
    680           xyz_e(n+u_right,:)=xyz_e(n+u_right,:)*radius 
    681           xyz_e(n+u_lup,:)=xyz_e(n+u_lup,:)*radius 
    682           xyz_e(n+u_ldown,:)=xyz_e(n+u_ldown,:)*radius 
    683           le(n+u_right)=le(n+u_right)*radius 
    684           le(n+u_lup)=le(n+u_lup)*radius 
    685           le(n+u_ldown)=le(n+u_ldown)*radius 
    686           Ai(n)=Ai(n)*radius**2 
    687           Av(n+z_up)=Av(n+z_up)*radius**2 
    688           Av(n+z_down)=Av(n+z_down)*radius**2 
    689         ENDDO 
    690       ENDDO 
    691                   
    692     ENDDO 
    693  
    694     CALL transfert_request(geom%Ai,req_i1) 
    695     CALL transfert_request(geom%centroid,req_i1) 
    696  
    697 !    CALL surf_triangle(d%xyz(:,ii_begin,jj_begin),d%xyz(:,ii_begin,jj_end),d%xyz(:,ii_end,jj_begin),S) 
    698   
    699   END SUBROUTINE set_geometry 
    700    
    701   SUBROUTINE compute_wee(n,pos,w) 
    702   IMPLICIT NONE 
    703     INTEGER,INTENT(IN) :: n 
    704     INTEGER,INTENT(IN) :: pos 
    705     REAL(rstd),INTENT(OUT) ::w(6) 
    706  
    707     REAL(rstd) :: ne_(0:5) 
    708     REAL(rstd) :: Riv_(6) 
    709     INTEGER    :: k 
    710      
    711      
    712     DO k=0,5 
    713       ne_(k)=ne(n,MOD(pos-1+k+6,6)+1)   
    714       Riv_(k+1)=Riv(n,MOD(pos-1+k+6,6)+1) 
    715     ENDDO 
    716            
    717     w(1)=-ne_(0)*ne_(1)*(Riv_(1)-0.5) 
    718     w(2)=-ne_(2)*(ne_(0)*Riv_(2)-w(1)*ne_(1)) 
    719     w(3)=-ne_(3)*(ne_(0)*Riv_(3)-w(2)*ne_(2)) 
    720     w(4)=-ne_(4)*(ne_(0)*Riv_(4)-w(3)*ne_(3)) 
    721     w(5)=-ne_(5)*(ne_(0)*Riv_(5)-w(4)*ne_(4)) 
    722     w(6)=ne_(0)*ne_(5)*(Riv_(6)-0.5) 
    723      
    724 !    IF ( ABS(w(5)-w(6))>1e-20) PRINT *, "pb pour wee : w(5)!=w(6)",sum(Riv_(:)) 
    725  
    726    END SUBROUTINE compute_wee 
    727              
    728  
    729    
    730   SUBROUTINE compute_geometry 
    731   IMPLICIT NONE 
    732     CALL allocate_geometry 
    733     CALL set_geometry 
    734      
    735   END SUBROUTINE compute_geometry 
    736    
    737182END MODULE geometry 

  • codes/icosagcm/devel/src/unstructured/init_unstructured.f90

    r856 r863  
    22  USE mpipara, ONLY : is_mpi_master 
    33  USE data_unstructured_mod 
     4  USE geometry, ONLY : de 
    45  IMPLICIT NONE 
    56  SAVE 
    … …  
    1011  INTEGER, ALLOCATABLE :: Idata_read1(:),Idata_read2(:,:),Idata_read3(:,:,:) 
    1112 
    12   PUBLIC :: read_dump_partition 
     13  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: meshfile="input/mesh_information.nc" 
     14  INTEGER :: id_nc ! NetCDF id of mesh file open by open_local_mesh_file 
     15 
     16  PUBLIC :: open_local_mesh_file, read_local_mesh 
    1317 
    1418CONTAINS 
    … …  
    9296 
    9397 
    94   SUBROUTINE read_dump_partition 
    95     use netcdf_mod 
    96     USE ioipsl 
    97     USE field_mod 
    98     USE geometry, ONLY : lon_i, lat_i, lon_e, lat_e, ep_e 
    99     IMPLICIT NONE 
    100  
    101     !!-------------Declare local variables------------------- 
    102     CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: f="input/mesh_information.nc" 
    103     INTEGER :: id_nc, ierr, status, descriptionLength, ij 
     98  SUBROUTINE open_local_mesh_file 
     99    USE netcdf_mod 
    104100    CHARACTER(LEN= 80) :: description 
    105     REAL(rstd), ALLOCATABLE :: angle_e(:) 
    106     REAL(rstd) :: clon, slon, clat, slat, & ! COS/SIN of lon/lat 
    107          elon(3), elat(3) ! lon/lat unit vectors 
    108     print *,"------------------ READING FILE " , f, "----------------------- " 
     101    INTEGER :: ierr, status, descriptionLength 
     102 
     103    PRINT *,"------------------ READING FILE " , meshfile, "----------------------- " 
    109104    !open and read the input file 
    110     ierr = nf90_open(f, NF90_NOWRITE, id_nc) 
     105    ierr = nf90_open(meshfile, NF90_NOWRITE, id_nc) 
    111106    if (ierr /= nf90_noerr) then 
    112107      print *, trim(nf90_strerror(ierr)) 
    … …  
    114109    end if 
    115110 
    116     status = nf90_inquire_attribute(id_nc, nf90_global, "description", len =descriptionLength) 
     111    status = nf90_inquire_attribute(id_nc, nf90_global, "description", len=descriptionLength) 
    117112    IF(status /= 0 .or. len(description) < descriptionLength) THEN 
    118113        print *, "Not enough space to put NetCDF attribute values." 
    … …  
    124119    print *,"Data file description :",description 
    125120 
     121    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'integer', 'primal_deg') 
     122    primal_num = SIZE(Idata_read1) 
     123    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'integer', 'dual_deg') 
     124    dual_num = SIZE(Idata_read1) 
     125    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'integer', 'trisk_deg') 
     126    edge_num = SIZE(Idata_read1) 
     127  END SUBROUTINE open_local_mesh_file 
     128 
     129 
     130  SUBROUTINE read_local_mesh 
     131    USE field_mod 
     132    USE geometry, ONLY : lon_i, lat_i, lon_e, lat_e, ep_e 
     133    IMPLICIT NONE 
     134    INTEGER :: ij 
     135    REAL(rstd), ALLOCATABLE :: angle_e(:) 
     136    REAL(rstd) :: clon, slon, clat, slat, & ! COS/SIN of lon/lat 
     137         elon(3), elat(3) ! lon/lat unit vectors 
     138     
    126139    !status = nf90_get_att(id_nc, nf90_global, "primal_num", primal_num) 
    127140    !status = nf90_get_att(id_nc, nf90_global, "dual_num", dual_num) 
    … …  
    161174    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'float', 'le_de') 
    162175    ALLOCATE(le_de, source = Ddata_read1) 
     176    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'float', 'le') 
     177    ALLOCATE(le, source = Ddata_read1) 
     178    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'float', 'de') 
     179    ALLOCATE(de, source = Ddata_read1) 
    163180    CALL read_from_gridfile(id_nc, 'float', 'Riv2') 
    164181    ALLOCATE(Riv2, source = Ddata_read2) 
    … …  
    204221     
    205222    DEALLOCATE(angle_e) 
    206   END SUBROUTINE read_dump_partition 
    207  
    208   SUBROUTINE init_grid_type 
    209     USE grid_param, ONLY : grid_type, grid_unst, grid_ico    
    210     USE getin_mod, ONLY : getin 
    211     CHARACTER(len=255) :: grid_type_var 
    212     grid_type_var='icosahedral' 
    213     CALL getin("grid_type",grid_type_var) 
    214     SELECT CASE(grid_type_var) 
    215     CASE('unstructured') 
    216        grid_type = grid_unst 
    217 !       is_omp_level_master=.TRUE. 
    218 !       omp_level_size=1 
    219        CALL read_dump_partition 
    220        IF (is_mpi_master) PRINT *,'Using unstructured grid type' 
    221     CASE DEFAULT 
    222        grid_type = grid_ico 
    223        IF (is_mpi_master) PRINT *,'Using default grid type' 
    224     END SELECT   
    225   END SUBROUTINE init_grid_type 
     223  END SUBROUTINE read_local_mesh 
    226224 
    227225END MODULE init_unstructured_mod 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.