| 1 | ====================================================================== |
|---|
| 2 | Note pour l'utilisation des sorties Netcdf: |
|---|
| 3 | ====================================================================== |
|---|
| 4 | |
|---|
| 5 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 6 | 1- Diffrentiation des variables par classes: |
|---|
| 7 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 8 | |
|---|
| 9 | Nous avons choisi de classifier les varibles manipules dans le |
|---|
| 10 | modele. Les familles des varaibles sont choisis suivant des criteres |
|---|
| 11 | telques les dimmensions, types (etats, ), frequence de sortie ... |
|---|
| 12 | |
|---|
| 13 | On attribut a chaques classe les idetificateur suivant |
|---|
| 14 | |
|---|
| 15 | 0 = coordonnees et geometrie (x,y,lat,long...) |
|---|
| 16 | 1 = Var 2D A sortir regulierement (variables etats,...) |
|---|
| 17 | 2 = Var 2D A sortir+ Debug |
|---|
| 18 | 3 = Var 3D |
|---|
| 19 | 4 = Var de debug |
|---|
| 20 | 5 = sortie juste une fois au debut et une fois a la fin |
|---|
| 21 | |
|---|
| 22 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 23 | 2- Differentiation des varibles par type des noeuds |
|---|
| 24 | sur lesquels sont calcules: |
|---|
| 25 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 26 | |
|---|
| 27 | Les varibles dans Grisli ne sont pas toutes calcules sur les memes |
|---|
| 28 | point de grille. |
|---|
| 29 | |
|---|
| 30 | --o---->----o-- |
|---|
| 31 | ' ' |
|---|
| 32 | ^ x ^ |
|---|
| 33 | ' ' |
|---|
| 34 | --o---->----o-- |
|---|
| 35 | |
|---|
| 36 | On donne les symboles pour les differents types des noeuds sur la |
|---|
| 37 | grille. |
|---|
| 38 | |
|---|
| 39 | 'o' : noeud majeur en x et en y |
|---|
| 40 | '>' : noeud mineur en x |
|---|
| 41 | '^' : noeud mineur en y |
|---|
| 42 | 'x' : noeud mineur en x et en y |
|---|
| 43 | |
|---|
| 44 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 45 | 3- Le fichier "Description_Variables.dat" |
|---|
| 46 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 47 | |
|---|
| 48 | Ce fichier se trouve dans "SOURCES/Netdcf-routines/" |
|---|
| 49 | |
|---|
| 50 | Ce fichier contient les variables dont les sorties netcdf nous serons utiles. |
|---|
| 51 | On donne pour chaque variable different types d'informations que nous |
|---|
| 52 | ecrivons dans les fichier ".nc". |
|---|
| 53 | |
|---|
| 54 | |
|---|
| 55 | ----> Organisation au sein du fichier |
|---|
| 56 | |
|---|
| 57 | Dans ce fichier vous pouvez ajouter vos commentaires sans aucun regles |
|---|
| 58 | de format (saut de ligne, separateur ...) |
|---|
| 59 | |
|---|
| 60 | L'indicateur des fin des commentaires est la ligne '~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~'. |
|---|
| 61 | |
|---|
| 62 | Les descriptions des variables dans ce fichier sont comprisent dans un |
|---|
| 63 | bloc comme le suivant: |
|---|
| 64 | ------------------------------------------------------ |
|---|
| 65 | .... |
|---|
| 66 | ------------------------------------------------------ |
|---|
| 67 | |
|---|
| 68 | Les informations qu'on donne pour les variables sont: |
|---|
| 69 | |
|---|
| 70 | "Variable name" !~ info non obligatoire |
|---|
| 71 | "n°" "name in Grisli" "Class" !! info obligatoire |
|---|
| 72 | "Node type" !! info obligatoire |
|---|
| 73 | "Long name" !~ info non obligatoire |
|---|
| 74 | "Standard name" !~ info non obligatoire |
|---|
| 75 | "Unit" !~ info non obligatoire |
|---|
| 76 | "Description" !~ info non obligatoire |
|---|
| 77 | |
|---|
| 78 | Remarques: |
|---|
| 79 | --------- |
|---|
| 80 | - L'ordre de ces informations est important. |
|---|
| 81 | - Les informations avec en face "!~ info non obligatoire" ne sont |
|---|
| 82 | pas obligatoires. Donc quand on connait pas l'information |
|---|
| 83 | correspondant on remplit le champ par "xxx" |
|---|
| 84 | |
|---|
| 85 | exemples: |
|---|
| 86 | ------------------------------------------------------ |
|---|
| 87 | "Altitude surface" |
|---|
| 88 | 1 S 1 |
|---|
| 89 | "o" |
|---|
| 90 | "surface_topography_or_elevation (Searise)" |
|---|
| 91 | "surface_altitude (cf,Searise)" |
|---|
| 92 | "m" |
|---|
| 93 | "Surface topography or elevation" |
|---|
| 94 | ------------------------------------------------------ |
|---|
| 95 | "xxx" |
|---|
| 96 | 82 "Chaldef_maj" 3 |
|---|
| 97 | "o" |
|---|
| 98 | "Cahleur de deformation" |
|---|
| 99 | "xxx" |
|---|
| 100 | "xxx" |
|---|
| 101 | "xxx" |
|---|
| 102 | ------------------------------------------------------ |
|---|
| 103 | |
|---|
| 104 | **Fin exp |
|---|
| 105 | |
|---|
| 106 | Remarques: |
|---|
| 107 | ---------- |
|---|
| 108 | |
|---|
| 109 | - Le n° de variable doit correspondre au if (...) tab(:,:)= .... |
|---|
| 110 | dans sortie_netcdf_GRISLI_mod.0.2-hassine.f90 |
|---|
| 111 | - L'ordre des varaibles n'a pas d'importance |
|---|
| 112 | |
|---|
| 113 | |
|---|
| 114 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 115 | 4- Le fichier "TEMPS-NETCDF.dat" |
|---|
| 116 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 117 | |
|---|
| 118 | Ce fichier se trouve dans "SOURCES/Fichiers-parametres" |
|---|
| 119 | |
|---|
| 120 | Ce fichier permet de definir le nombre et le numero des classes des |
|---|
| 121 | variables a sortir pour le run. |
|---|
| 122 | Ce fichier permet aussi ensuite de definir les temps auxquels ont lieu |
|---|
| 123 | les sorties netcdf selon deux methodes complementaires: |
|---|
| 124 | |
|---|
| 125 | |
|---|
| 126 | ----> Organisation au sein du fichier |
|---|
| 127 | |
|---|
| 128 | Dans ce fichier vous pouvez ajouter vos commentaires sans aucun regles |
|---|
| 129 | de format (saut de ligne, separateur ...) |
|---|
| 130 | |
|---|
| 131 | L'indicateur des fin des commentaires est la ligne '~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~'. |
|---|
| 132 | |
|---|
| 133 | Apres on deffinit le nombre des classes a sortir pour ce run et sur la |
|---|
| 134 | ligne suivnates les numero des classes d'interet. |
|---|
| 135 | |
|---|
| 136 | exemple: |
|---|
| 137 | -------- |
|---|
| 138 | 3 nbr de classes a sortir dans ce run |
|---|
| 139 | 3 2 1 5 class (voir les classes et variables dans LISTE_VAR_NCDF.dat) |
|---|
| 140 | ------------------------------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 141 | |
|---|
| 142 | **Fin exp |
|---|
| 143 | |
|---|
| 144 | Remarque: |
|---|
| 145 | --------- |
|---|
| 146 | On peut mettre des commentaires comme vous l'avez vu a la fin de la |
|---|
| 147 | ligne des informations. |
|---|
| 148 | |
|---|
| 149 | Apres on parmetrise le temps des sorties netcdf. |
|---|
| 150 | Deux methodes complementaires sont utilisees pour cette parametrisation. |
|---|
| 151 | |
|---|
| 152 | 1) La premiere methode consiste a definir le tableau "dtncdf "de sortie |
|---|
| 153 | reguliere. Dans ce tableau on definit des frequences de sortie |
|---|
| 154 | des varaibles. |
|---|
| 155 | La dimension est donnee par le nombre ndtsortie. Apres on remplit |
|---|
| 156 | le tableau par les pas temps qu'on veut observer (Les pas sont |
|---|
| 157 | separes par des sauts de ligne). |
|---|
| 158 | |
|---|
| 159 | exemple: |
|---|
| 160 | -------- |
|---|
| 161 | 2 ndtsortie lecture de dtncdf de sortie |
|---|
| 162 | 10. |
|---|
| 163 | 20. |
|---|
| 164 | 330. |
|---|
| 165 | 1.e10 |
|---|
| 166 | ------------------------------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 167 | |
|---|
| 168 | **Fin exp |
|---|
| 169 | |
|---|
| 170 | |
|---|
| 171 | 2) Les sorties netcdf on peut aussi les faires sortir avec des |
|---|
| 172 | pas de temps predefinis dans le tableau "predef_tsort". Le |
|---|
| 173 | dimension de ce dernier est donnee par npredeft. |
|---|
| 174 | |
|---|
| 175 | |
|---|
| 176 | exemple: |
|---|
| 177 | -------- |
|---|
| 178 | 4 npredeft dimension predef_tsort |
|---|
| 179 | 1 |
|---|
| 180 | 5 |
|---|
| 181 | 25 |
|---|
| 182 | 35 |
|---|
| 183 | 66 |
|---|
| 184 | 100 |
|---|
| 185 | ------------------------------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 186 | |
|---|
| 187 | **Fin exp |
|---|
| 188 | |
|---|
| 189 | Remarque: |
|---|
| 190 | --------- |
|---|
| 191 | Comme vous avez remarquez pour les deux tableaux on peut definir |
|---|
| 192 | plus d'elements a utiliser que les dimensions. Que ndtsortie ou |
|---|
| 193 | npredeft seront utilisé. |
|---|
| 194 | |
|---|
| 195 | |
|---|
| 196 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 197 | 5- Le fichier "LISTE-VAR-NETCDF.dat" |
|---|
| 198 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 199 | |
|---|
| 200 | Ce fichier se trouve dans "SOURCES/Fichiers-parametres" |
|---|
| 201 | |
|---|
| 202 | Liste des variables a sortir sur les fichier netcdf. |
|---|
| 203 | Toutes les variables pour lesquelle une sortie est prevue sont dans cette liste. |
|---|
| 204 | Les variables dans ce fichier sont regroupees par classe. |
|---|
| 205 | |
|---|
| 206 | Une variable est sortie si : |
|---|
| 207 | le module correspondant est active (exemple eau basale) |
|---|
| 208 | et isortie=1 |
|---|
| 209 | |
|---|
| 210 | La periodicite avec laquelle ces variables sont sorties |
|---|
| 211 | ainsi que les temps predefinis eventuels sont donnes dans |
|---|
| 212 | TEMPS-NETCDF.dat |
|---|
| 213 | |
|---|
| 214 | 2 ligne par classe sous la forme : |
|---|
| 215 | ------------------------------------------ |
|---|
| 216 | classnumber snapmax ntypenode |
|---|
| 217 | typenod1 typenod2 typenod3 ... |
|---|
| 218 | |
|---|
| 219 | classnumber : presente l'identificateur des classes des variables voir section 1 de ce document |
|---|
| 220 | |
|---|
| 221 | snapmax : nombre de snapshot max a sortir dans un fichier |
|---|
| 222 | netcdf si plus, il reouvre un nouveau fichier. |
|---|
| 223 | |
|---|
| 224 | ntypenode : nombre de type de noeud qu'on veut sortir |
|---|
| 225 | |
|---|
| 226 | typenodi : presente le type du noeud voir section 2 de ce document |
|---|
| 227 | |
|---|
| 228 | exemple: |
|---|
| 229 | -------- |
|---|
| 230 | ============================================ classe 1 |
|---|
| 231 | 1 100 4 ! class 1 snapmax=10 4 type de noeud |
|---|
| 232 | 'o' '>' '^' 'x' ! les types de noeuds |
|---|
| 233 | ------------------------------------------ |
|---|
| 234 | ** Fin exp |
|---|
| 235 | |
|---|
| 236 | 2 lignes par variable sous la forme : |
|---|
| 237 | |
|---|
| 238 | varname1 !attention varname1 5 caract maxi et pas de TAB apres |
|---|
| 239 | numero |
|---|
| 240 | isortie dtncdf interv |
|---|
| 241 | !!! Possibilite de mettre des commentaires |
|---|
| 242 | ligne vide |
|---|
| 243 | ------------------------- |
|---|
| 244 | varname2 |
|---|
| 245 | numero |
|---|
| 246 | isortie dtncdf interv |
|---|
| 247 | ------------------------- |
|---|
| 248 | |
|---|
| 249 | |
|---|
| 250 | varname : 5 caracteres maxi |
|---|
| 251 | |
|---|
| 252 | isortie : 1-> oui, 0->non (pas de sortie du tout) |
|---|
| 253 | |
|---|
| 254 | dtncdf : donne la periodicite avec laquelle ces variables sont sorties |
|---|
| 255 | indice pointe dans dtsortie_ncdf definie dans TEMPS-NETCDF.dat |
|---|
| 256 | si 0 ne sort que sur les pas de temps intermediaires |
|---|
| 257 | |
|---|
| 258 | interv : pour cette variable |
|---|
| 259 | interv=-1 premier+dernier |
|---|
| 260 | interv= 0 ne sort que le premier pas de temps |
|---|
| 261 | interv= 1 premier + dernier + predefinis |
|---|
| 262 | |
|---|
| 263 | exemples: |
|---|
| 264 | -------- |
|---|
| 265 | 1 1 0 sort avec periodicite 1 + premier pas de temps |
|---|
| 266 | 1 0 -1 sort seulement premier et dernier |
|---|
| 267 | 0 1 1 ne sort pas du tout |
|---|
| 268 | 1 0 0 ne sort que le premier |
|---|
| 269 | |
|---|
| 270 | ** Fin exp |
|---|
| 271 | |
|---|
| 272 | |
|---|
| 273 | |
|---|
| 274 | Remarques: |
|---|
| 275 | ---------- |
|---|
| 276 | |
|---|
| 277 | - Entre les classes, le separateur est la ligne ========== |
|---|
| 278 | - Entre les variables, le separateur est la ligne ---------- |
|---|
| 279 | - Le programme ne teste que les 10 premiers caracteres de ========== et |
|---|
| 280 | de ---------- |
|---|
| 281 | |
|---|
| 282 | |
|---|
| 283 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 284 | 6- Comment ajouter une nouvelle variable pour |
|---|
| 285 | les sorties netcdf |
|---|
| 286 | ---------------------------------------------------------------------- |
|---|
| 287 | |
|---|
| 288 | Si on veut ajouter une variable pour la faire sortir en netcdf. Il |
|---|
| 289 | faut ajouter cette variables dans le fichier |
|---|
| 290 | "SOURCES/Netdcf-routines/Description_Variables.dat" dans un premier |
|---|
| 291 | temps suivant la facon qu'on a decrit precedement. |
|---|
| 292 | |
|---|
| 293 | Remarque: |
|---|
| 294 | --------- |
|---|
| 295 | L'emplacement de l'ajout n'a pas d'importance. |
|---|
| 296 | |
|---|
| 297 | Dans un deuxieme temps il faut ajouter cette variables dans |
|---|
| 298 | "SOURCES/Fichiers-parametres/LISTE-VAR-NETCDF.dat" suivant aussi les |
|---|
| 299 | consignes donnees precedement. |
|---|
| 300 | |
|---|
| 301 | Remarque: |
|---|
| 302 | --------- |
|---|
| 303 | L'emplacement de l'ajout cette fois est important il faut ajouter la |
|---|
| 304 | variables dans la bonne classe. L'ordre des variables dans une classes |
|---|
| 305 | n'a pas d'importance. |
|---|
| 306 | |
|---|
| 307 | Finalement il faut ajouter if (...) tab(:,:)= .... |
|---|
| 308 | dans le code sortie_netcdf_GRISLI_mod.0.2-hassine.f90. |
|---|
![(please configure the [header_logo] section in trac.ini)](/grisli/chrome/site/Laurentide-16km-3D-Umag-water-bordure-GRISLI-small.png)
