#!/bin/sh ##set -xv # stephane.senesi 'at' meteo.fr, CNRM-GAME/GMGEC, mars-avril 2010 doc="\nScript d'analyse d'une liste de fichiers pour y trouver des formes \n\ de nom de fichier avec dates, les dates, et des sequences de dates. \n\ \n\n\t Syntaxe : $(basename $0) [-d] [-v/q] file_liste \n\n\ -q pour n avoir aucun message / -v pour avoir les patterns et erreurs a l ecran \n -d pour activer l echo des commandes \n On separe par simulation\n Exemple :\n $(basename $0) file_list # verification des noms de la liste contenue dans file_list\n " #La presence d'une annee+mois impose la presence de l'annee entiere [ $# -eq 0 ] && echo -e $doc && exit -1 debugflag=0 quiet=0 #--------------------------------------------- while [ $# -ne 0 ] do case $1 in -h|--help|-help) echo -e $doc exit -1 ;; -d|--debug) set -x debugflag=1 shift ;; -q|--quiet) quiet=1 shift ;; -v|--verbose) quiet=0 shift ;; *) liste=$1 break ;; esac done ## on separe les simus : for simu in $( awk -F/ '$4 != "dods" && /SORTIES_CPL_IPSL/ {print $6} $4 != "dods" && /IGCM_OUT/ {print $9} ' $liste | sort -u ) ; do grep /$simu/ $liste > /tmp/$$.ldir echo $simu ###head /tmp/$$.ldir ; head /tmp/$$.size ; rm /tmp/$$* # For debugging purpose ... #head -n 2 /tmp/$$.ldir > /tmp/$$.aa ; mv /tmp/$$.aa /tmp/$$.ldir #set -x # On remplace les / en ~ dans la liste des fichiers cat /tmp/$$.ldir | tr "/" "~" > /tmp/$$.aa ; mv /tmp/$$.aa /tmp/$$.ldir # On deduit de la liste des fichiers des patterns de annee+mois, annee, intervalles de date ... sed -r \ -e 's/[0-2][0-9]{3}[01][0-9]/YYMM/g' \ -e 's/YYMM01_YYMM(28|29|30|31)/YYmmdd_YYmmdd/g' \ -e 's/YYMM(28|29|30|31)/YYmmdd/g' \ /tmp/$$.ldir | sort -u > /tmp/$$.lpat # Ci-dessus, il faudrait compter les nb d'occ de chqaue pattern pour signaler et # ne pas retenir ceux qui n'apparaissent qu'une fois (sauf les decennaux ?) # On ote les patterns sans date du tout sed -i -e '/YY/!d' /tmp/$$.lpat # On rend compte des patterns identifies #echo "Formes de fichier identifiees: " ; awk '{printf "\t%s\n",$1}' /tmp/$$.lpat # Une fonction pour associer un nom de fichier a chaque pattern : on remplace les / par des ~ tmpfic (){ echo -n "/tmp/$$." ; echo $1 | tr "/" "_" } # Pour chaque pattern, on liste les dates pertinentes: annees de debut et fin pour les # intervalles d'annees, ou annee ou annee+mois pour les autres cat /dev/null > /tmp/$$.dates #set -x while read pattern ; do if [ $(echo $pattern | grep "YYmmdd_YYmmdd") ] ; then # On transforme le pattern pour mettre une sequences # de capture des annees de debut et fin d'intervalle p2=$(echo $pattern | sed -e 's/YYmmdd_YYmmdd/([0-2][0-9]{3}[01][0-9])01_[0-2][0-9]{3}[01][0-9](28|29|30|31)/g' ) # On balaye le repertoire avec le(s) pattern(s) transforme(s) pour capturer les annees grep -E $p2 /tmp/$$.ldir | sed -r -e "s/$p2/\1/g" >> /tmp/$$.$pattern.tmp else p2=$(echo $pattern | sed -e 's/YYmmdd/([0-2][0-9]{3}[01][0-9])(28|29|30|31)/g' ) # On balaye le repertoire avec le(s) pattern(s) transforme(s) pour capturer les annees grep -E "$p2" /tmp/$$.ldir | sed -r -e "s/$p2/\1/g" >> /tmp/$$.$pattern.tmp fi sort -n -u /tmp/$$.$pattern.tmp > /tmp/$$.$pattern.list # Si la liste des date (annees ou annes+mois) pour le pattern est # de taille > 1, on l'integre a la liste generale des dates # en supprimant au prealable les dates isolees # ... ca reste a faire cat /tmp/$$.$pattern.list | cut -c 1-4 >> /tmp/$$.dates done < /tmp/$$.lpat # Fonction pour completer et rendre sequentielle une liste d'annees (une par ligne) force_sequence (){ awk '{ if (NR==1) {avant=$1; print $1} else { for (i=avant+1 ; i<=$1 ; i++) print i}}' } sort -u /tmp/$$.dates > /tmp/$$.toutes_dates # On enleve les trous dans la liste des dates force_sequence < /tmp/$$.toutes_dates > /tmp/$$.tmp ; sort -u /tmp/$$.tmp > /tmp/$$.toutes_dates # Fonction d'analyse de sequences de nombres (annees, ou annees+mois # On transforme les series continues a a+1 a+2....b (a raison d'un par # ligne) en : "a-b" sequence (){ awk -v pas=${1:-1} '{ if (NR==1) {avant=$1;nb=1; printf "%s",$1} else { suivant=avant+pas # Pour les nombres sur 6 chiffres, on suppose que c est du YYYMM # et on gere le passage de decembre a janvier if ((length(avant)==6) && (substr(avant,5,2)=="12")) { avant4=substr(avant,1,4) ; suivant=sprintf("%4d01",avant4+1)} if ($1 > suivant) { if (nb>1) printf "-%s",avant nb=1 ; printf ", %s",$1} else { nb=nb+1 } avant=$1 }} END { if (nb >1) printf "-%s\n",avant ; else print ""} ' } [ $quiet = 0 ] && echo $(wc -l /tmp/$$.ldir | cut -d \ -f 1) files proceeded. [ $quiet = 0 ] && echo -n "Years occurring : " && sequence 1 < /tmp/$$.toutes_dates # On liste tous les mois qui doivent etre presents (au motif qu'une annee est presente) > /tmp/$$.toutes_dates_et_mois while read an ; do i=1 while [ $i -le 12 ] ; do printf "%s%02d\n" ${an} $i >> /tmp/$$.toutes_dates_et_mois i=$(( i + 1 )) done done < /tmp/$$.toutes_dates # Pour chaque pattern, on analyse si toutes les dates sont presentes en bon nombre (decennie, an, an+mois) touch /tmp/$$.synthese [ $quiet = 0 ] && echo "File name patterns and holes (if any) :" #set -x while read pattern ; do [ `echo $pattern | grep -E "(YYmmdd_YYmmdd|YYmmdd)"` ] && pas=1 && \ join -v 1 /tmp/$$.toutes_dates_et_mois /tmp/$$.$pattern.list > /tmp/$$.$pattern.manques sequence $pas < /tmp/$$.$pattern.list > /tmp/$$.$pattern.synthese truepattern=$(echo $pattern | tr "~" "/") [ $quiet = 0 ] && printf "%80s : " $truepattern && cat /tmp/$$.$pattern.synthese cat /tmp/$$.$pattern.synthese >> /tmp/$$.synthese done < /tmp/$$.lpat # reste a analyser par annee en sus de par pattern, pour presenter le plus clair # Penser a forunir l'option d'imposer des patterns et des annees en entree rm -f /tmp/$$.* /tmp/$$.ldir done # Changes # - 20 april 2010 : add handling of pattern year1-year2, which is a generalization of decades # - janvier 2011 (MA Foujols) : suppression des caracteres accentues # mise en place pour prefix de type libIGCM / IPSL # ajout de la verification des tailles des fichiers mensuels # ajout des options -d -q/-v -R -S subdir -I maxyear # - juin 2011 (MA Foujols) : adapte a une liste des fichiers par exemple detruits sur bande du CCRT