| 1 | #!/bin/bash |
|---|
| 2 | |
|---|
| 3 | |
|---|
| 4 | #on veut archiver les fichiers restart |
|---|
| 5 | #Dans le cadre du demenagement ils seront renommes |
|---|
| 6 | #ATM/Restart/****.nc |
|---|
| 7 | #OCE/Restart/****.nc |
|---|
| 8 | #... |
|---|
| 9 | #sous la forme |
|---|
| 10 | #RESTART/ATM_****.nc |
|---|
| 11 | #RESTART/OCE_****.nc |
|---|
| 12 | #Attention de bien conserver les dates d'origines |
|---|
| 13 | # |
|---|
| 14 | #Dans le cadre de la production nouvelle chaine |
|---|
| 15 | #ils auront directement le bon nom |
|---|
| 16 | # |
|---|
| 17 | #On veut egalement que l'archive soit par periode de temps |
|---|
| 18 | # cette periode est definie par la taille du pack donc connue |
|---|
| 19 | # en entree du script (1M, 1Y, 5Y, 10Y etc...) |
|---|
| 20 | # |
|---|
| 21 | |
|---|
| 22 | |
|---|
| 23 | # $1= PATH/config_card d'une simulation avec |
|---|
| 24 | # TagName/JobName/ExperimentName/SpaceName/DateBegin/DateEnd/PATH_SIMUL |
|---|
| 25 | # $2=period_pack en M/m ou Y/y |
|---|
| 26 | |
|---|
| 27 | config_card=${1} |
|---|
| 28 | LISTE_DMNFS=${2} |
|---|
| 29 | |
|---|
| 30 | |
|---|
| 31 | export JOB_DIR=${JOB_DIR:-${TMP_MIGR_DATA}} |
|---|
| 32 | export IGCM_DEM=${IGCM_DEM:-${SCRATCHDIR}/IGCM_DEM} |
|---|
| 33 | export IGCM_TMP=${IGCM_TMP:-${IGCM_DEM}/tmp} |
|---|
| 34 | mkdir -p ${IGCM_DEM} |
|---|
| 35 | mkdir -p ${IGCM_TMP} |
|---|
| 36 | clean_tmp=${clean_tmp:-yes} |
|---|
| 37 | EXE_DIR=$(dirname ${0}) |
|---|
| 38 | SCRIPT_NAME=$(basename ${0} ) |
|---|
| 39 | |
|---|
| 40 | source ${EXE_DIR}/DEM_utilities.sh |
|---|
| 41 | |
|---|
| 42 | # gpdebug : verif si le present script a ete execute jusqu'au bout ######### |
|---|
| 43 | MonitoringInfo="${SCRIPT_NAME}-->OK" |
|---|
| 44 | simuMonitoring_check "$MonitoringInfo" "$config_card" |
|---|
| 45 | |
|---|
| 46 | DEM_log -0 "Demarrage de ${SCRIPT_NAME}" |
|---|
| 47 | |
|---|
| 48 | |
|---|
| 49 | #### 0- lecture de config.card |
|---|
| 50 | #### on veut les renseignements suivants : |
|---|
| 51 | #### JobName, PATH_SIMUL, DateBegin et DateEnd |
|---|
| 52 | eval $(grep JobName ${config_card}) |
|---|
| 53 | eval $(grep PATH_SIMUL_FULL ${config_card}) |
|---|
| 54 | eval $(grep DateBegin ${config_card}) |
|---|
| 55 | eval $(grep DateEnd ${config_card}) |
|---|
| 56 | eval $(grep IGCM_DEM_SIMU ${config_card}) |
|---|
| 57 | |
|---|
| 58 | |
|---|
| 59 | #### Preparation de l'environnement |
|---|
| 60 | # repertoire dans lequel seront renommes les fichiers de restart |
|---|
| 61 | STORE_RESTART=$IGCM_DEM_SIMU/RESTART |
|---|
| 62 | mkdir -p ${STORE_RESTART} |
|---|
| 63 | |
|---|
| 64 | # repertoire dans lequel nous stockerons les listes de restart a archiver |
|---|
| 65 | RESTART_TAR=$IGCM_DEM_SIMU/restart_tar |
|---|
| 66 | mkdir -p ${RESTART_TAR} |
|---|
| 67 | |
|---|
| 68 | # lecture de periodpack dans ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt |
|---|
| 69 | period_pack=`awk '{print $0} ' ${IGCM_DEM_SIMU}/period_pack.txt` |
|---|
| 70 | |
|---|
| 71 | DEM_log -1 "Period pack = ${period_pack}" |
|---|
| 72 | #### 1- renommer les fichiers ###### |
|---|
| 73 | DEM_log -1 "Renommer les fichiers de Restart" |
|---|
| 74 | |
|---|
| 75 | cd ${STORE_RESTART} |
|---|
| 76 | if [ "x${STORE_RESTART}" != "x" ] |
|---|
| 77 | then |
|---|
| 78 | rm -rf * |
|---|
| 79 | fi |
|---|
| 80 | # On les copie sur le scratchdir en changeant le nom et conservant la date |
|---|
| 81 | awk '{print $2}' ${IGCM_DEM_SIMU}/liste_restart_files_config.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt |
|---|
| 82 | #grep ${PATH_SIMUL_FULL} ${LISTE_DMNFS} | grep Restart | awk '{print $3}' | sed '/^.*Restart$/d' >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt |
|---|
| 83 | |
|---|
| 84 | |
|---|
| 85 | gawk -F/ '{dest_name=$(NF-2)("_") $(NF); system("ln -s " $0 " "dest_name)}' ${IGCM_TMP}/${$}.liste_restart_files.txt |
|---|
| 86 | |
|---|
| 87 | ls -l ${STORE_RESTART} > ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt |
|---|
| 88 | |
|---|
| 89 | ### 2- creer les listes de fichiers par periode #### |
|---|
| 90 | DEM_log -1 "Creation des listes de fichiers par periode" |
|---|
| 91 | ### 2.1- extraire l'annee et le mois de DateBegin ### |
|---|
| 92 | date_begin=${DateBegin} |
|---|
| 93 | date_end=${DateEnd} |
|---|
| 94 | |
|---|
| 95 | year_begin=$(echo ${date_begin} | cut -c 1-4 ) |
|---|
| 96 | month_begin=$(echo ${date_begin} | cut -c 5-6 ) |
|---|
| 97 | year_end=$(echo ${date_end} | cut -c 1-4 ) |
|---|
| 98 | month_end=$(echo ${date_end} | cut -c 5-6 ) |
|---|
| 99 | |
|---|
| 100 | |
|---|
| 101 | ### 2.2- creation des listes ### |
|---|
| 102 | date_begin_pack=${date_begin} |
|---|
| 103 | date_end_simulation=${date_end} |
|---|
| 104 | |
|---|
| 105 | month_begin_pack=${month_begin} |
|---|
| 106 | year_begin_pack=${year_begin} |
|---|
| 107 | |
|---|
| 108 | number_pack=1 |
|---|
| 109 | while [ ${date_begin_pack} -le ${date_end_simulation} ] |
|---|
| 110 | do |
|---|
| 111 | |
|---|
| 112 | DEM_log -1 "On calcule la date de fin du pack " |
|---|
| 113 | |
|---|
| 114 | month_end_pack=${month_begin_pack} |
|---|
| 115 | year_end_pack=`expr ${year_begin_pack} + ${period_pack}` |
|---|
| 116 | |
|---|
| 117 | |
|---|
| 118 | date_end_pack=${year_end_pack}${month_end_pack}01 |
|---|
| 119 | |
|---|
| 120 | if [ "x${ON_IDRIS}" == "xno" ] |
|---|
| 121 | then |
|---|
| 122 | for file in `awk '{print $9}' ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt`; do |
|---|
| 123 | extract_date_file=`echo ${file} | sed -e "s/.*\${JobName}_//"` |
|---|
| 124 | date_file=`echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g'` |
|---|
| 125 | |
|---|
| 126 | # DEM_log "date_file = ${date_file}" |
|---|
| 127 | if [ ${date_file} -lt ${date_end_pack} ] |
|---|
| 128 | then |
|---|
| 129 | if [ ${date_file} -ge ${date_begin_pack} ] |
|---|
| 130 | then |
|---|
| 131 | # DEM_log "${file} ${date_file} dans ${date_begin_pack} ${date_end_pack} " |
|---|
| 132 | echo ${file} >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt |
|---|
| 133 | fi |
|---|
| 134 | fi |
|---|
| 135 | done |
|---|
| 136 | else |
|---|
| 137 | for file in `awk '{print $8}' ${IGCM_TMP}/${$}.new_liste_restart_files.txt`; do |
|---|
| 138 | extract_date_file=`echo ${file} | sed -e "s/.*\${JobName}_//"` |
|---|
| 139 | date_file=`echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g'` |
|---|
| 140 | |
|---|
| 141 | # DEM_log "date_file = ${date_file}" |
|---|
| 142 | if [ ${date_file} -lt ${date_end_pack} ] |
|---|
| 143 | then |
|---|
| 144 | if [ ${date_file} -ge ${date_begin_pack} ] |
|---|
| 145 | then |
|---|
| 146 | # DEM_log "${file} ${date_file} dans ${date_begin_pack} ${date_end_pack} " |
|---|
| 147 | echo ${file} >> ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt |
|---|
| 148 | fi |
|---|
| 149 | fi |
|---|
| 150 | done |
|---|
| 151 | fi |
|---|
| 152 | |
|---|
| 153 | #on archive les restart - le nom de l'archive contiendra ${yearbegin}${monthbegin}_${yearend}${monthend} |
|---|
| 154 | # end etant la date du dernier fichier contenu et non pas la premiere date suivant |
|---|
| 155 | DEM_log -1 "Recherche de la date de fin reel pour nommer l'archive " |
|---|
| 156 | #On classe par ordre alphabetique les fichiers contenus dans liste_pack_restart |
|---|
| 157 | #la date du dernier fichier donnera la date de fin du pack |
|---|
| 158 | if [[ -f ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt ]] ; then |
|---|
| 159 | sort ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt > ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp |
|---|
| 160 | |
|---|
| 161 | first_file=$(head -n 1 ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp ) |
|---|
| 162 | extract_date_file=$( echo ${first_file} | sed -e "s/.*${JobName}_//" ) |
|---|
| 163 | DateBegin_Restart=$(echo ${extract_date_file}| sed 's%\([0-9]\{8\}\)_.*$%\1%g' ) |
|---|
| 164 | |
|---|
| 165 | last_file=$(tail -n 1 ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp ) |
|---|
| 166 | extract_date_file=$( echo ${last_file} | sed -e "s/.*${JobName}_//" ) |
|---|
| 167 | DateEnd_Restart=$( echo ${extract_date_file}| sed 's/\([0-9]\{8\}\)_.*$/\1/g' ) |
|---|
| 168 | mv ${IGCM_TMP}/${$}.liste_pack_restart_${number_pack}.txt.tmp ${RESTART_TAR}/${JobName}_restart_${DateBegin_Restart}_${DateEnd_Restart}.list |
|---|
| 169 | fi |
|---|
| 170 | |
|---|
| 171 | DEM_log -1 "Passage de la commande Tar pour archiver la liste creee" |
|---|
| 172 | # tar -cf ${JobName}_${date_begin_pack}_${DateEnd_Restart}_restart.tar --dereference --files-from ${RESTART_TAR}/tar_restart_${date_begin_pack}_${DateEnd_Restart}.list |
|---|
| 173 | # cat ${RESTART_TAR}/tar_restart_${number_pack}.list | xargs rm |
|---|
| 174 | |
|---|
| 175 | |
|---|
| 176 | DEM_log -1 "On definit le datebegin de la prochaine periode pack" |
|---|
| 177 | #on definit la periode pack suivante |
|---|
| 178 | month_begin_pack=${month_end_pack} |
|---|
| 179 | year_begin_pack=${year_end_pack} |
|---|
| 180 | |
|---|
| 181 | date_begin_pack=${year_begin_pack}${month_begin_pack}01 |
|---|
| 182 | |
|---|
| 183 | number_pack=`expr ${number_pack} + 1` |
|---|
| 184 | |
|---|
| 185 | done |
|---|
| 186 | |
|---|
| 187 | cd ${EXE_DIR} |
|---|
| 188 | |
|---|
| 189 | # gpdebug : le script n'a pas rencontre d'erreur. On l'inscrit dans le fichier de suivi |
|---|
| 190 | simuMonitoring_OK "$MonitoringInfo" "$config_card" |
|---|
