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04/26/17 11:39:50 (4 years ago)
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flavoni
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update for trunk of NEMO_v7_dev

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CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM
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  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-lim3.xml

    r3186 r3219  
    2828      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    2929 
    30       </file_group> 
    31  
    32       <file_group id="1y" output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    33          
    34  
    35         <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
     30        <file id="file36" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
    3631          <field field_ref="snowthic_cea"    name="snthic" /> 
    3732          <field field_ref="icethic_cea"     name="sithic" /> 
     
    121116        </file> 
    122117 
    123         <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     118        <file id="file37" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    124119          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
    125120          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
     
    141136        </file> 
    142137 
    143         <file id="file8" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     138        <file id="file38" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    144139          <!-- global contents --> 
    145140          <field field_ref="ibgvol_tot"    name="ibgvol_tot"   /> 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-opa.xml

    r3186 r3219  
    2323      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    2424 
    25       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    26        
     25      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 1d files --> 
     26        <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     27          <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
     28          <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     29          <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     30          <field field_ref="sst"          name="tosstd"   long_name="sea_surface_temperature_standard_deviation"         operation="average" freq_op="1d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     31          <field field_ref="ssh"          name="zosstd"   long_name="sea_surface_height_above_geoid_standard_deviation"  operation="average" freq_op="1d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     32          <field field_ref="sst"          name="sstdcy"   long_name="amplitude of sst diurnal cycle" operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     33          <field field_ref="mldr10_1"     /> 
     34          <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle" operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     35        </file> 
     36   </file_group> 
     37 
     38       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files --> 
     39         <file id="file2" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     40          <field field_ref="e3t"  /> 
     41          <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"      operation="average" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     42          <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                   operation="average" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     43          <field field_ref="hdiv"         name="hdivtr"   long_name="horizontal divergence transport"      operation="average" freq_op="5d" > @hdiv * @e3t </field> 
     44          <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1"/> 
     45          <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
     46          <field field_ref="qsr"          name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux" /> 
     47          <field field_ref="wspd"         name="windsp"  /> 
     48          <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
     49          <field field_ref="empbmr"       name="wfob"     long_name="water_flux_into_sea_water at prev time-step"    /> 
     50          <field field_ref="runoffs"      name="runoffs"  /> 
     51          <field field_ref="fmmflx"       name="fmmflx"  /> 
     52        </file> 
     53   </file_group> 
     54 
    2755      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files --> 
     56 
    2857      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    29  
    30         <file id="file20" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     58  
     59       <file id="file3" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     60          <field field_ref="e3t"      /> 
     61          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     62          <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     63          <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
     64          <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
     65          <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
     66          <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     67          <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     68          <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     69          <field field_ref="mldkz5"   /> 
     70          <field field_ref="mldr10_1" /> 
     71          <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     72          <field field_ref="sbt"      /> 
     73          <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
     74          <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
     75        </file> 
     76 
     77 
     78        <file id="file4" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    3179          <field field_ref="DIC"      /> 
    3280          <field field_ref="Alkalini" /> 
     
    4088        </file> 
    4189 
    42         <file id="file21" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     90        <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    4391          <field field_ref="Cflx"     /> 
    4492          <field field_ref="Dpco2"    /> 
     
    4997      <file_group id="1y" output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    5098         
    51         <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     99        <file id="file10" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    52100          <field field_ref="e3t"      /> 
    53101          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     
    67115        </file> 
    68116 
    69         <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
     117        <file id="file11" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    70118          <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
    71119          <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
     
    86134        </file> 
    87135 
    88         <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     136        <file id="file12" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    89137          <field field_ref="e3u" /> 
    90138          <field field_ref="ssu"          name="uos"      /> 
     
    98146        </file> 
    99147         
    100         <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     148        <file id="file13" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    101149          <field field_ref="e3v" /> 
    102150          <field field_ref="ssv"          name="vos"      /> 
     
    110158        </file> 
    111159         
    112         <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
     160        <file id="file14" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    113161          <field field_ref="e3w" /> 
    114162          <field field_ref="woce"         name="wo"       /> 
     
    124172        </file> 
    125173 
    126         <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     174        <file id="file15" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    127175          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
    128176          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
     
    144192        </file> 
    145193 
    146         <file id="file12" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     194        <file id="file16" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    147195          <field field_ref="DIC"      /> 
    148196          <field field_ref="Alkalini" /> 
     
    171219        </file> 
    172220 
    173         <file id="file13" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     221        <file id="file17" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    174222          <field field_ref="PH"       /> 
    175223          <field field_ref="PAR"      /> 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-pisces.xml

    r3186 r3219  
    4949      <file_group id="1y" output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    5050         
    51         <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     51        <file id="file22" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    5252          <field field_ref="e3t"      /> 
    5353          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     
    6767        </file> 
    6868 
    69         <file id="file9" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
     69        <file id="file23" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
    7070          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
    7171          <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 
     
    9191        --> 
    9292 
    93         <file id="file12" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
     93        <file id="file24" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    9494          <field field_ref="DIC"      /> 
    9595          <field field_ref="Alkalini" /> 
     
    118118        </file> 
    119119 
    120         <file id="file13" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
     120        <file id="file25" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    121121          <field field_ref="PH"       /> 
    122122          <field field_ref="PAR"      /> 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/namelist_top_cfg

    r3186 r3219  
    5656!          !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      ! 
    5757   sn_trcdta(1)  = 'data_DIC_nomask'        ,        -12        ,  'DIC'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    58    sn_trcdta(2)  = 'data_Alkalini_nomask'   ,        -12        ,  'Alkalini',    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    59    sn_trcdta(3)  = 'data_O2_nomask'         ,        -1         ,  'O2'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
     58   sn_trcdta(2)  = 'data_ALK_nomask'   ,        -12        ,  'Alkalini',    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
     59   sn_trcdta(3)  = 'data_OXY_nomask'         ,        -1         ,  'O2'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    6060   sn_trcdta(5)  = 'data_PO4_nomask'        ,        -1         ,  'PO4'     ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    61    sn_trcdta(7)  = 'data_Si_nomask'         ,        -1         ,  'Si'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
     61   sn_trcdta(7)  = 'data_SIL_nomask'         ,        -1         ,  'Si'      ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    6262   sn_trcdta(10) = 'data_DOC_nomask'        ,        -12        ,  'DOC'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    63    sn_trcdta(14) = 'data_Fer_nomask'        ,        -12        ,  'Fer'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
     63   sn_trcdta(14) = 'data_FER_nomask'        ,        -12        ,  'Fer'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    6464   sn_trcdta(23) = 'data_NO3_nomask'        ,        -1         ,  'NO3'     ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''   , '' 
    6565   rn_trfac(1)   =   1.0e-06  !  multiplicative factor 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.