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05/11/18 12:56:28 (2 years ago)
Author:
flavoni
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update libigcm for dev_merge_2017 of NEMO

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CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev
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  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/COMP/lim3.card

    r3271 r3809  
    2929[OutputFiles] 
    3030List=   (${PREFIX}_1m_icemod.nc    , ${R_OUT_ICE_O_M}/${PREFIX}_1M_icemod.nc     , NONE  ),\ 
    31         (${PREFIX}_1m_SBC_scalar.nc, ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1M_SBC_scalar.nc , NONE  ),\ 
    32         (${PREFIX}_1m_SBC.nc       , ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1M_SBC.nc        , NONE  ) 
     31        (${PREFIX}_1m_SBC_scalar.nc, ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1M_SBC_scalar.nc , NONE  ) 
    3332 
    3433 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/COMP/opa9.card

    r3416 r3809  
    99#-- NOTE: if you use COMMON ACCOUNT you have to de-comment it 
    1010#OPA_version=v4_0_alpha 
    11 R_FORCING=${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version} 
     11R_FORCING=${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName} 
     12#R_FORCING=${R_BC} 
    1213mesh_mask=y  
    1314#============================================================== 
     
    3233ListNonDel= (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/ahmcoef.nc, .), \ 
    3334            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/ORCA_R2_zps_domcfg.nc, .), \ 
    34             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/potT_PHC3WOA_ORCA2_IOVI.nc, data_1m_potential_temperature_nomask.nc), \ 
    35             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/Salt_corr_PHC3WOA09.nc, data_1m_salinity_nomask.nc), \ 
     35            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/data_1m_potential_temperature_nomask.nc, data_1m_potential_temperature_nomask.nc), \ 
     36            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/data_1m_salinity_nomask.nc, data_1m_salinity_nomask.nc), \ 
    3637            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/geothermal_heating.nc, .),\ 
    3738            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/runoff_core_monthly.nc, .),\ 
    38             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sss_corr_PHC3WOA09.nc, sss_data.nc),\ 
    39             (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sst_PHC3WOA_ORCA2_IOVI.nc, sst_data.nc),\ 
     39            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sss_data.nc, sss_data.nc),\ 
     40            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sst_data.nc, sst_data.nc),\ 
    4041            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/sali_ref_clim_monthly.nc, .),\ 
    4142            (${R_BC}/OCE/${config_UserChoices_TagName}/${opa9_UserChoices_OPA_version}/chlorophyll.nc, .),\ 
     
    6566[RestartFiles] 
    6667List=   (${config_UserChoices_JobName}_${NEMO_END}_restart.nc,  restart.nc, restart.nc), \ 
    67         (${config_UserChoices_JobName}_icebergs_${NEMO_END}_restart.nc,  restart_icebergs.nc, restart_icebergs.nc), \ 
     68        (${config_UserChoices_JobName}_icebergs_${NEMO_END}_restart.nc,  restart_icebergs.nc, restart_icebergs.nc), \ 
    6869        (EMPave.dat,  EMPave.dat, EMPave_old.dat) 
    6970 
    7071[OutputText] 
    71 List=   (ocean.output, solver.stat, STRAIT.dat, namelist_ref, namelist_cfg ) 
     72List=   (ocean.output, run.stat, STRAIT.dat, namelist_ref, namelist_cfg ) 
    7273 
    7374[OutputFiles] 
     
    7980        (${PREFIX}_1m_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_M}/${PREFIX}_1M_grid_T.nc     , NONE          ),\ 
    8081        (${PREFIX}_5d_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_5D_grid_T.nc     , NONE          ),\ 
    81         (${PREFIX}_1d_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_1D_grid_T.nc     , NONE          ),\ 
    82         (mesh_mask.nc     , ${R_OUT_OCE_O}/${config_UserChoices_JobName}_mesh_mask.nc                       , NONE),\ 
    83         (runoffs.nc       , ${R_OUT_OCE_O}/${config_UserChoices_JobName}_runoffs.nc                         , NONE),\ 
    84         (damping.coeff.nc , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_damping.coeff.nc                                     , NONE),\ 
    85         (output.abort.nc  , ${R_OUT_OCE_D}/${PREFIX}_output.abort.nc                                        , NONE),\ 
    86         (output.init.nc   , ${R_OUT_OCE_O_I}/${config_UserChoices_JobName}_${PeriodDateBegin}_output.init.nc, NONE) 
     82            (${PREFIX}_1d_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_1D_grid_T.nc     , NONE          ),\ 
     83        (mesh_mask.nc              , ${R_OUT_OCE_O}/${config_UserChoices_JobName}_mesh_mask.nc                       , NONE),\ 
     84        (runoffs.nc                , ${R_OUT_OCE_O}/${config_UserChoices_JobName}_runoffs.nc                         , NONE),\ 
     85        (damping.coeff.nc          , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_damping.coeff.nc                                     , NONE),\ 
     86        (output.abort.nc           , ${R_OUT_OCE_D}/${PREFIX}_output.abort.nc                                        , NONE),\ 
     87        (output.init.nc            , ${R_OUT_OCE_O_I}/${config_UserChoices_JobName}_${PeriodDateBegin}_output.init.nc, NONE) 
    8788 
    8889# Monthly analysis 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/config.card

    r3416 r3809  
    1414#----- DEVT TEST PROD 
    1515SpaceName=DEVT 
    16 LongName="ORCA2_LIM3_PISCES NEMO configuration, FORCED config, trunk tests" 
     16LongName="ORCA2_LIM3_PISCES NEMO configuration, FORCED config, dev_merge_2017 tests" 
    1717TagName=ORCA2_LIM3_PISCES 
    1818#D- Choice of experiment in EXPERIEMENTS directory 
     
    3131# config.card configuration options : 
    3232#R_BC=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC 
    33 R_BC=/workgpfs/rech/gzi/rgzi011/IGCM/BC 
     33R_BC=/ccc/work/cont003/gen0826/flavoni/FORCING 
    3434#R_INIT=$WORKDIR/../../gzi/rgzi002/IGCM/BC 
    3535#======================================================================== 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/DRIVER/opa9.driver

    r3186 r3809  
    128128    fi 
    129129    
    130     OPA_NMSH=0 
     130    #OPA_NMSH=0 
     131    OPA_NMSH=.FALSE. 
    131132    if [ "${opa9_UserChoices_mesh_mask}" = "y" ]; then 
    132         OPA_NMSH=1 
     133        #OPA_NMSH=1 
     134        OPA_NMSH=.TRUE. 
    133135        IGCM_card_WriteOption ${SUBMIT_DIR}/COMP/opa9.card UserChoices mesh_mask "n" 
    134136    fi 
     
    144146   NEMO_END=$( echo $( awk "BEGIN { printf \"%0${PRECIS}d\",${OPA_NITEND} }" ) )  
    145147 
    146    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg cn_exp    ${config_UserChoices_JobName} 
    147    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_it000  ${OPA_NIT000} 
    148    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_itend  ${OPA_NITEND} 
    149    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg ln_rstart ${OPA_LRSTAR} 
    150    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_stock ${OPA_NSTOCK} 
    151    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_rstctl ${OPA_NRSTDT} 
    152    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_date0 ${PeriodDateBegin} 
    153    IGCM_comp_modifyNamelist nonblocker namelist_cfg nn_msh    ${OPA_NMSH} 
    154    IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_leapy  ${OPA_NLEAPY}   
     148   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg cn_exp       ${config_UserChoices_JobName} 
     149   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_it000     ${OPA_NIT000} 
     150   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_itend     ${OPA_NITEND} 
     151   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg ln_rstart    ${OPA_LRSTAR} 
     152   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_stock     ${OPA_NSTOCK} 
     153   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_rstctl    ${OPA_NRSTDT} 
     154   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_date0     ${PeriodDateBegin} 
     155   #IGCM_comp_modifyNamelist nonblocker namelist_cfg nn_msh    ${OPA_NMSH} 
     156   IGCM_comp_modifyNamelist nonblocker namelist_cfg ln_meshmask  ${OPA_NMSH} 
     157   IGCM_comp_modifyNamelist blocker    namelist_cfg nn_leapy     ${OPA_NLEAPY}   
    155158 
    156159   IGCM_debug_PopStack "OCE_Update" 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-lim3.xml

    r3271 r3809  
    11<?xml version="1.0"?> 
    2  
    3     <!--  
     2    <!-- $id$ --> 
     3     
     4 <!-- 
    45============================================================================================================ 
    56=                                           output files definition                                        = 
    6 =                                            Define your own files                                         = 
     7=                                            Define your own files for lim3                                = 
    78=                                         put the variables you want...                                    = 
    89============================================================================================================ 
    9     --> 
     10 --> 
    1011     
    11     <file_definition type="one_file" name="@expname@_@startdate@_@enddate@_@freq@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    12      
    13       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     12 <file_definition type="one_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1mo" min_digits="4"> 
     13    
     14   <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->          
     15     <file id="file31" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
    1416 
    15       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    16  
    17       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    18  
    19       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    20  
    21       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    22  
    23       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    24  
    25       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    26        
    27       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files --> 
    28       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    29  
    30         <file id="file36" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
    31           <field field_ref="snowthic_cea"    name="snthic" /> 
    32           <field field_ref="icethic_cea"     name="sithic" /> 
    33           <field field_ref="icevolu"         name="sivolu" /> 
    34           <field field_ref="snowvol"         name="snvolu" /> 
    35           <field field_ref="iceconc"         name="siconc" /> 
    36  
    37           <field field_ref="vfxbog"          name="vfxbog" /> 
    38           <field field_ref="vfxdyn"          name="vfxdyn" /> 
    39           <field field_ref="vfxopw"          name="vfxopw" /> 
    40           <field field_ref="vfxsni"          name="vfxsni" /> 
    41           <field field_ref="vfxsum"          name="vfxsum" /> 
    42           <field field_ref="vfxbom"          name="vfxbom" /> 
    43           <field field_ref="vfxres"          name="vfxres" /> 
    44           <field field_ref="vfxice"          name="vfxice" /> 
    45           <field field_ref="vfxsnw"          name="vfxsnw" /> 
    46           <field field_ref="vfxsub"          name="vfxsub" /> 
    47           <field field_ref="vfxspr"          name="vfxspr" /> 
    48  
    49           <field field_ref="icetrp"          name="sivtrp" /> 
    50           <field field_ref="snwtrp"          name="snvtrp" /> 
    51           <field field_ref="saltrp"          name="saltrp" /> 
    52           <field field_ref="deitrp"          name="deitrp" /> 
    53           <field field_ref="destrp"          name="destrp" /> 
    54  
    55           <field field_ref="sfxbri"          name="sfxbri" /> 
    56           <field field_ref="sfxdyn"          name="sfxdyn" /> 
    57           <field field_ref="sfxres"          name="sfxres" /> 
    58           <field field_ref="sfxbog"          name="sfxbog" /> 
    59           <field field_ref="sfxbom"          name="sfxbom" /> 
    60           <field field_ref="sfxsum"          name="sfxsum" /> 
    61           <field field_ref="sfxsni"          name="sfxsni" /> 
    62           <field field_ref="sfxopw"          name="sfxopw" /> 
    63           <field field_ref="sfx"             name="sfx"    /> 
    64  
    65           <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"     /> 
    66           <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"     /> 
    67           <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"     /> 
    68           <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"     /> 
    69           <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"     /> 
    70           <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"     /> 
    71           <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"      /> 
    72           <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"     /> 
    73           <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"     /> 
    74           <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem" /> 
    75  
    76           <!-- ice-ocean heat flux from mass exchange --> 
    77           <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn" /> 
    78           <field field_ref="hfxres"          name="hfxres" /> 
    79           <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd" /> 
    80           <!-- ice-atm. heat flux from mass exchange --> 
    81           <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub" /> 
    82           <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr" /> 
    83  
    84           <!-- diags --> 
    85           <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc" /> 
    86           <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur" /> 
    87  
    88           <field field_ref="isst"            name="sst"    /> 
    89           <field field_ref="isss"            name="sss"    /> 
    90           <field field_ref="micesalt"        name="sisali" /> 
    91           <field field_ref="micet"           name="sitemp" /> 
    92           <field field_ref="icest"           name="sistem" /> 
    93           <field field_ref="icehc"           name="siheco" /> 
    94           <field field_ref="isnowhc"         name="snheco" /> 
    95           <field field_ref="miceage"         name="siages" /> 
    96  
    97           <field field_ref="uice_ipa"        name="sivelu" /> 
    98           <field field_ref="vice_ipa"        name="sivelv" /> 
    99           <field field_ref="icevel"          name="sivelo" /> 
    100           <field field_ref="idive"           name="sidive" /> 
    101           <field field_ref="ishear"          name="sishea" /> 
    102           <field field_ref="icestr"          name="sistre" /> 
    103  
    104           <field field_ref="ibrinv"          name="sibrin" /> 
    105           <field field_ref="icecolf"         name="sicolf" /> 
    106  
    107           <field field_ref="iceage_cat"      name="siagecat" /> 
    108           <field field_ref="iceconc_cat"     name="siconcat" /> 
    109           <field field_ref="icethic_cat"     name="sithicat" /> 
    110           <field field_ref="snowthic_cat"    name="snthicat" /> 
    111           <field field_ref="salinity_cat"    name="salincat" /> 
    112           <field field_ref="brinevol_cat"    name="sibricat" /> 
    113           <field field_ref="icetemp_cat"     name="sitemcat" /> 
    114           <field field_ref="snwtemp_cat"     name="sntemcat" /> 
    115  
    116         </file> 
    117  
    118  
    119        <file id="file37" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    120           <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
    121           <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
    122           <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
    123           <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  /> 
    124           <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  /> 
    125           <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  /> 
    126           <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   /> 
    127           <!-- ice and snow --> 
    128           <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" /> 
    129           <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" /> 
    130         </file> 
    131  
    132  
    133      <file id="file38" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    134           <!-- global contents --> 
    135           <field field_ref="ibgvol_tot"    name="ibgvol_tot"   /> 
    136           <field field_ref="sbgvol_tot"    name="sbgvol_tot"   /> 
    137           <field field_ref="ibgarea_tot"   name="ibgarea_tot"  /> 
    138           <field field_ref="ibgsalt_tot"   name="ibgsalt_tot"  /> 
    139           <field field_ref="ibgheat_tot"   name="ibgheat_tot"  /> 
    140           <field field_ref="sbgheat_tot"   name="sbgheat_tot"  /> 
    141  
    142           <!-- global drifts (conservation checks) --> 
    143           <field field_ref="ibgvolume"     name="ibgvolume"    /> 
    144           <field field_ref="ibgsaltco"     name="ibgsaltco"    /> 
    145           <field field_ref="ibgheatco"     name="ibgheatco"    /> 
    146           <field field_ref="ibgheatfx"     name="ibgheatfx"    /> 
    147  
    148           <!-- global forcings  --> 
    149           <field field_ref="ibgfrcvoltop"  name="ibgfrcvoltop" /> 
    150           <field field_ref="ibgfrcvolbot"  name="ibgfrcvolbot" /> 
    151           <field field_ref="ibgfrctemtop"  name="ibgfrctemtop" /> 
    152           <field field_ref="ibgfrctembot"  name="ibgfrctembot" /> 
    153           <field field_ref="ibgfrcsal"     name="ibgfrcsal"    /> 
    154           <field field_ref="ibgfrchfxtop"  name="ibgfrchfxtop" /> 
    155           <field field_ref="ibgfrchfxbot"  name="ibgfrchfxbot" /> 
    156         </file> 
    157  
    158         <!-- 
    159         <file id="file20" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
    160           <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
    161           <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
    162           <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
    163           <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
    164           <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
    165           <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
    166         </file> 
    167         --> 
    168  
    169      </file_group>    
    170  
    171       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    172       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    173       <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    174  
    175    </file_definition> 
    176      
    177    
     17       <!-- ice mask --> 
     18       <field field_ref="icemask"          name="simsk"   /> 
     19       <field field_ref="icemask05"        name="simsk05" /> 
     20       <field field_ref="icemask15"        name="simsk15" /> 
     21        
     22       <!-- general --> 
     23       <field field_ref="snwvolu"          name="snvolu" /> 
     24       <field field_ref="icethic"          name="sithic" /> 
     25       <field field_ref="icevolu"          name="sivolu" /> 
     26       <field field_ref="iceconc"          name="siconc" /> 
     27       <field field_ref="icesalt"          name="sisali" /> 
     28       <field field_ref="iceapnd"          name="siapnd" /> 
     29       <field field_ref="icevpnd"          name="sivpnd" /> 
     30       <field field_ref="sst_m"            name="sst_m"  /> 
     31       <field field_ref="sss_m"            name="sss_m"  /> 
     32        
     33       <!-- heat --> 
     34       <field field_ref="icetemp"          name="sitemp" /> 
     35       <field field_ref="icettop"          name="sittop" /> 
     36       <field field_ref="icetbot"          name="sitbot" /> 
     37       <field field_ref="icetsni"          name="sitsni" /> 
     38        
     39       <!-- momentum --> 
     40       <field field_ref="uice"             name="sivelu"  /> 
     41       <field field_ref="vice"             name="sivelv"  /> 
     42       <field field_ref="icevel"           name="sivelo"  /> 
     43       <field field_ref="utau_ai"          name="utau_ai" /> 
     44       <field field_ref="vtau_ai"          name="vtau_ai" /> 
     45       <field field_ref="utau_oi"          name="utau_oi" /> 
     46       <field field_ref="vtau_oi"          name="vtau_oi" /> 
     47        
     48       <!-- rheology --> 
     49       <field field_ref="icediv"           name="sidive"  /> 
     50       <field field_ref="iceshe"           name="sishea"  /> 
     51       <field field_ref="icestr"           name="sistre"  /> 
     52       <field field_ref="normstr"          name="normstr" /> 
     53       <field field_ref="sheastr"          name="sheastr" /> 
     54       <field field_ref="isig1"            name="isig1"   /> 
     55       <field field_ref="isig2"            name="isig2"   /> 
     56       <field field_ref="isig3"            name="isig3"   /> 
     57        
     58       <!-- heat fluxes --> 
     59       <field field_ref="qt_oce_ai"        name="qt_oce_ai"  /> 
     60       <field field_ref="qt_atm_oi"        name="qt_atm_oi"  /> 
     61       <field field_ref="qtr_ice_top"      name="qtr_ice_top"/> 
     62       <field field_ref="qtr_ice_bot"      name="qtr_ice_bot"/> 
     63       <field field_ref="qt_ice"           name="qt_ice"     /> 
     64       <field field_ref="qsr_ice"          name="qsr_ice"    /> 
     65       <field field_ref="qns_ice"          name="qns_ice"    /> 
     66       <field field_ref="qemp_ice"         name="qemp_ice"   /> 
     67       <field field_ref="albedo"           name="albedo"     /> 
     68        
     69       <field field_ref="hfxcndtop"        name="hfxcndtop"  /> 
     70       <field field_ref="hfxcndbot"        name="hfxcndbot"  /> 
     71       <field field_ref="hfxsensib"        name="hfxsensib"  /> 
     72        
     73       <!-- salt fluxes --> 
     74       <field field_ref="sfxice"           name="sfxice" /> 
     75        
     76       <!-- mass fluxes --> 
     77       <field field_ref="vfxice"           name="vfxice" /> 
     78       <field field_ref="vfxsnw"           name="vfxsnw" /> 
     79        
     80       <!-- categories --> 
     81       <field field_ref="icemask_cat"      name="simskcat"/> 
     82       <field field_ref="snwthic_cat"      name="snthicat"/> 
     83       <field field_ref="iceconc_cat"      name="siconcat"/> 
     84       <field field_ref="icethic_cat"      name="sithicat"/> 
     85       <field field_ref="icesalt_cat"      name="sisalcat"/> 
     86       <field field_ref="icetemp_cat"      name="sitemcat"/> 
     87        
     88     </file> 
     89      
     90     <file id="file32" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     91       <!-- global contents --> 
     92       <field field_ref="ibgvol_tot"       name="ibgvol_tot"   /> 
     93       <field field_ref="sbgvol_tot"       name="sbgvol_tot"   /> 
     94       <field field_ref="ibgarea_tot"      name="ibgarea_tot"  /> 
     95       <field field_ref="ibgsalt_tot"      name="ibgsalt_tot"  /> 
     96       <field field_ref="ibgheat_tot"      name="ibgheat_tot"  /> 
     97       <field field_ref="sbgheat_tot"      name="sbgheat_tot"  /> 
     98        
     99       <!-- global drifts (conservation checks) --> 
     100       <field field_ref="ibgvolume"        name="ibgvolume"    /> 
     101       <field field_ref="ibgsaltco"        name="ibgsaltco"    /> 
     102       <field field_ref="ibgheatco"        name="ibgheatco"    /> 
     103       <field field_ref="ibgheatfx"        name="ibgheatfx"    /> 
     104        
     105       <!-- global forcings  --> 
     106       <field field_ref="ibgfrcvoltop"     name="ibgfrcvoltop" /> 
     107       <field field_ref="ibgfrcvolbot"     name="ibgfrcvolbot" /> 
     108       <field field_ref="ibgfrctemtop"     name="ibgfrctemtop" /> 
     109       <field field_ref="ibgfrctembot"     name="ibgfrctembot" /> 
     110       <field field_ref="ibgfrcsal"        name="ibgfrcsal"    /> 
     111       <field field_ref="ibgfrchfxtop"     name="ibgfrchfxtop" /> 
     112       <field field_ref="ibgfrchfxbot"     name="ibgfrchfxbot" /> 
     113     </file> 
     114      
     115   </file_group> 
     116    
     117   <file_group id="1ts" output_freq="1ts" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     118   <file_group id="1h"  output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
     119   <file_group id="2h"  output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
     120   <file_group id="3h"  output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
     121   <file_group id="4h"  output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
     122   <file_group id="6h"  output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->         
     123   <file_group id="1m"  output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
     124   <file_group id="2m"  output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
     125   <file_group id="3m"  output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
     126   <file_group id="4m"  output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
     127   <file_group id="6m"  output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
     128   <file_group id="1y"  output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
     129   <file_group id="2y"  output_freq="2y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
     130   <file_group id="5y"  output_freq="5y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
     131   <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
     132    
     133 </file_definition> 
     134  
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-opa.xml

    r3416 r3809  
    11<?xml version="1.0"?> 
    22 
    3     <!--  
     3<!-- 
    44============================================================================================================ 
    55=                                           output files definition                                        = 
    6 =                                            Define your own files                                         = 
     6=                                            Define your own filesfor ocean dynamics context               = 
    77=                                         put the variables you want...                                    = 
    88============================================================================================================ 
    99    --> 
    10      
    11     <file_definition type="one_file" name="@expname@_@startdate@_@enddate@_@freq@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    12      
    13       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     10    
     11    <file_definition type="one_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="1d" min_digits="4"> 
    1412 
    15       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    16  
    17       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    18  
    19       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    20  
    21       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    22  
    23       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    24  
    25       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 1d files --> 
    26         <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     13   <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 1d files --> 
     14        <file id="file10" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    2715          <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                       /> 
    2816          <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                          /> 
     
    3523        </file> 
    3624   </file_group> 
     25     
     26      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
     27        <file id="file11" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     28          <field field_ref="e3t"      /> 
     29          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     30          <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     31          <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
     32          <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
     33          <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
     34          <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     35          <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     36          <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     37          <field field_ref="mldkz5"   /> 
     38          <field field_ref="mldr10_1" /> 
     39          <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     40          <field field_ref="sbt"      /> 
     41          <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
     42          <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    3743 
    38        <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files --> 
    39          <file id="file2" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    40           <field field_ref="e3t"  /> 
    41           <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"      operation="average" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
    42           <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                   operation="average" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
    43           <field field_ref="hdiv"         name="hdivtr"   long_name="horizontal divergence transport"      operation="average" freq_op="5d" > @hdiv * @e3t </field> 
    44           <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1"/> 
    45           <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                /> 
    46           <field field_ref="qsr"          name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux" /> 
    47           <field field_ref="wspd"         name="windsp"  /> 
    48           <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                     /> 
    49           <field field_ref="empbmr"       name="wfob"     long_name="water_flux_into_sea_water at prev time-step"    /> 
    50           <field field_ref="runoffs"      name="runoffs"  /> 
    51           <field field_ref="fmmflx"       name="fmmflx"  /> 
    52         </file> 
    53    </file_group> 
     44          <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
     45          <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
     46          <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
     47          <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
     48          <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
     49          <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
     50          <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
     51          <field field_ref="precip"       name="precip"   /> 
     52          <!-- ice and snow --> 
     53          <field field_ref="snowpre" /> 
     54        </file> 
     55      </file_group>  
    5456 
    55       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files --> 
    5657 
    5758      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files --> 
    58   
    59        <file id="file3" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     59 
     60       <file id="file12" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    6061          <field field_ref="e3t"      /> 
    6162          <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="average" freq_op="1mo" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     
    7475          <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    7576        </file> 
    76  
    77  
    7877      </file_group> 
    7978 
    80       <file_group id="1y" output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 1 year files -->    
    81          
    82         <file id="file10" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    83           <field field_ref="e3t"      /> 
    84           <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="average" freq_op="1y" > @toce_e3t / @e3t </field> 
    85           <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="average" freq_op="1y" > @soce_e3t / @e3t </field> 
    86           <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
    87           <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
    88           <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
    89           <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="average" freq_op="1y" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
    90           <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="average" freq_op="1y" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
    91           <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
    92           <field field_ref="mldkz5"   /> 
    93           <field field_ref="mldr10_1" /> 
    94           <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
    95           <field field_ref="sbt"      /> 
    96           <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
    97           <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    98           <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
     79      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files --> 
     80 
     81    <file id="file13" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     82      <field field_ref="e3t"      /> 
     83      <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="average" freq_op="1y" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     84      <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="average" freq_op="1y" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     85      <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
     86      <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
     87      <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
     88      <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="average" freq_op="1y" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
     89      <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="average" freq_op="1y" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
     90      <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
     91      <field field_ref="mldkz5"   /> 
     92      <field field_ref="mldr10_1" /> 
     93      <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
     94      <field field_ref="sbt"      /> 
     95      <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
     96      <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
     97      <field field_ref="empmr"        name="wfo"    /> 
    9998          <field field_ref="erp"          name="wfcorr" /> 
    10099          <!-- add from SBC --> 
     
    104103          <field field_ref="emp_oce"      name="emp"  /> 
    105104          <!-- end add from SBC --> 
    106           <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
    107           <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
    108           <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
    109           <field field_ref="precip"       name="precip"   /> 
    110         </file> 
     105      <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
     106      <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
     107      <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
     108      <field field_ref="precip"       name="precip"   /> 
     109    </file> 
    111110 
     111    <file id="file14" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     112      <field field_ref="e3u" /> 
     113      <field field_ref="ssu"          name="uos"      /> 
     114      <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="average" freq_op="1y" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
     115      <field field_ref="utau"         name="tauuo"    /> 
     116      <field field_ref="uocetr_eff" /> 
     117    </file> 
    112118 
    113         <file id="file12" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    114           <field field_ref="e3u" /> 
    115           <field field_ref="ssu"          name="uos"      /> 
    116           <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="average" freq_op="1y" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
    117           <field field_ref="utau"         name="tauuo"    /> 
    118           <field field_ref="uocetr_eff" /> 
     119    <file id="file15" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     120      <field field_ref="e3v" /> 
     121      <field field_ref="ssv"          name="vos"      /> 
     122      <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="average" freq_op="1y" > @voce_e3v / @e3v </field> 
     123      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    /> 
     124      <field field_ref="vocetr_eff" /> 
    119125          <!-- available with diaar5 --> 
    120           <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" /> 
    121           <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" /> 
    122           <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" /> 
    123         </file> 
    124          
    125         <file id="file13" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    126           <field field_ref="e3v" /> 
    127           <field field_ref="ssv"          name="vos"      /> 
    128           <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="average" freq_op="1y" > @voce_e3v / @e3v </field> 
    129           <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    /> 
    130           <field field_ref="vocetr_eff" /> 
    131           <!-- available with diaar5 --> 
    132           <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
    133           <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
    134           <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
    135         </file> 
    136          
    137         <file id="file14" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    138           <field field_ref="e3w" /> 
    139           <field field_ref="woce"         name="wo"       /> 
    140           <field field_ref="avt"          name="difvho"   /> 
    141           <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" /> 
    142           <!-- variables available with key_zdftmx_new --> 
     126      <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
     127      <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
     128      <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
     129    </file> 
     130 
     131    <file id="file16" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
     132      <field field_ref="e3w" /> 
     133      <field field_ref="woce"         name="wo"       /> 
     134      <field field_ref="avt"          name="difvho"   /> 
     135      <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" /> 
     136    <!-- variables available with ln_zdfiwm =T --> 
    143137          <field field_ref="av_wave"      name="av_wave"    /> 
    144138          <field field_ref="bn2"          name="bn2"        /> 
    145           <field field_ref="bflx_tmx"     name="bflx_tmx"   /> 
    146           <field field_ref="pcmap_tmx"    name="pcmap_tmx"  /> 
    147           <field field_ref="emix_tmx"     name="emix_tmx"   /> 
     139          <field field_ref="bflx_iwm"     name="bflx_iwm"   /> 
     140          <field field_ref="pcmap_iwm"    name="pcmap_iwm"  /> 
     141          <field field_ref="emix_iwm"     name="emix_iwm"   /> 
    148142          <field field_ref="av_ratio"     name="av_ratio"   /> 
    149         </file> 
     143    </file> 
    150144 
    151         <file id="file15" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     145       <file id="file17" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    152146          <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
    153147          <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
     
    162156          <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   /> 
    163157          <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   /> 
    164           <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />  
     158          <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   /> 
    165159          <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   /> 
    166160          <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   /> 
     
    168162          <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   /> 
    169163        </file> 
    170  
    171  
    172      </file_group>    
    173  
    174       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    175       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
     164      </file_group> 
     165         
     166       
     167      <file_group id="1ts" output_freq="1ts" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     168      <file_group id="2h"  output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
     169      <file_group id="3h"  output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
     170      <file_group id="4h"  output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
     171      <file_group id="6h"  output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
     172      <file_group id="2m"  output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
     173      <file_group id="3m"  output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
     174      <file_group id="4m"  output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
     175      <file_group id="6m"  output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
     176      <file_group id="2y"  output_freq="2y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
     177      <file_group id="5y"  output_freq="5y"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    176178      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    177179 
    178180   </file_definition> 
    179181     
    180    
     182 
     183 
     184 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/namelist_ORCA2clim_cfg

    r3186 r3809  
    22!! NEMO/OPA  Configuration namelist : used to overwrite defaults values defined in SHARED/namelist_ref 
    33!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    4 ! 
    54!----------------------------------------------------------------------- 
    65&namrun        !   parameters of the run 
     
    1918/ 
    2019!----------------------------------------------------------------------- 
    21 &namcfg     !   parameters of the configuration 
     20&namcfg        !   parameters of the configuration                      (default: user defined GYRE) 
    2221!----------------------------------------------------------------------- 
    2322   ln_read_cfg = .true.    !  (=T) read the domain configuration file 
    2423      !                    !  (=F) user defined configuration  ==>>>  see usrdef(_...) modules 
    2524      cn_domcfg = "ORCA_R2_zps_domcfg"    ! domain configuration filename 
    26 / 
    27 !----------------------------------------------------------------------- 
    28 &namzgr        !   vertical coordinate 
    29 !----------------------------------------------------------------------- 
    30    ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps 
    31 / 
    32 !----------------------------------------------------------------------- 
    33 &namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep) 
     25      ! 
     26      ln_closea    = .false.    !  T => keep closed seas (defined by closea_mask field) in the   
     27      !                         !       domain and apply special treatment of freshwater fluxes. 
     28      !                         !  F => suppress closed seas (defined by closea_mask field)  
     29      !                         !       from the bathymetry at runtime. 
     30      !                         !  If closea_mask field doesn't exist in the domain_cfg file 
     31      !                         !       then this logical does nothing. 
     32/ 
     33!----------------------------------------------------------------------- 
     34&namdom        !   time and space domain 
    3435!----------------------------------------------------------------------- 
    3536   ln_linssh   = .false.   !  =T  linear free surface  ==>>  model level are fixed in time 
    36    ! 
    37    nn_msh      =  _AUTO_   !  create (>0) a mesh file or not (=0) 
    38    ! 
    39    rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0) 
    40 / 
    41 !----------------------------------------------------------------------- 
    42 &namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or 
    43                !   passive tracer coarsened online simulations 
    44 !----------------------------------------------------------------------- 
    45 / 
    46 !----------------------------------------------------------------------- 
    47 &namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
     37   rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics and tracer 
     38   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter 
     39   ln_meshmask = .true.   !  =T create a mesh file 
     40/ 
     41!----------------------------------------------------------------------- 
     42&namtsd        !   data : Temperature  & Salinity 
     43!----------------------------------------------------------------------- 
     44/ 
     45!----------------------------------------------------------------------- 
     46&namwad        !   Wetting and drying  default is no WAD 
     47!----------------------------------------------------------------------- 
     48/ 
     49!----------------------------------------------------------------------- 
     50&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              (ln_crs =T) 
     51!----------------------------------------------------------------------- 
     52/ 
     53!----------------------------------------------------------------------- 
     54&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d") 
     55!----------------------------------------------------------------------- 
     56/ 
     57!----------------------------------------------------------------------- 
     58&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d") 
     59!----------------------------------------------------------------------- 
     60/ 
     61!----------------------------------------------------------------------- 
     62&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d") 
    4863!----------------------------------------------------------------------- 
    4964/ 
     
    5469/ 
    5570!----------------------------------------------------------------------- 
    56 &namsbc_blk   !   namsbc_blk  Bulk formulae 
     71&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation 
     72!----------------------------------------------------------------------- 
     73/ 
     74!----------------------------------------------------------------------- 
     75&namsbc_blk   !   namsbc_blk  generic Bulk formula                      (ln_blk =T) 
    5776!----------------------------------------------------------------------- 
    5877   ln_NCAR     = .true.   ! "NCAR"      algorithm   (Large and Yeager 2008) 
    5978/ 
    6079!----------------------------------------------------------------------- 
    61 &namtra_qsr    !   penetrative solar radiation 
    62 !----------------------------------------------------------------------- 
    63 / 
    64 !----------------------------------------------------------------------- 
    65 &namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition 
    66 !----------------------------------------------------------------------- 
    67 / 
    68 !----------------------------------------------------------------------- 
    69 &namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring 
    70 !----------------------------------------------------------------------- 
    71 / 
    72 !----------------------------------------------------------------------- 
    73 &namsbc_alb    !   albedo parameters 
    74 !----------------------------------------------------------------------- 
    75 / 
    76 !----------------------------------------------------------------------- 
    77 &namberg       !   iceberg parameters 
    78 !----------------------------------------------------------------------- 
    79       ln_icebergs              = .true.               ! iceberg floats or not 
    80       ln_bergdia               = .true.               ! Calculate budgets 
     80&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3") 
     81!----------------------------------------------------------------------- 
     82/ 
     83!----------------------------------------------------------------------- 
     84&namsbc_sas    !   Stand-Alone Surface boundary condition 
     85!----------------------------------------------------------------------- 
     86/ 
     87!----------------------------------------------------------------------- 
     88&namsbc_iif    !   Ice-IF : use observed ice cover                      (nn_ice = 1) 
     89!----------------------------------------------------------------------- 
     90/ 
     91!----------------------------------------------------------------------- 
     92&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr =T) 
     93!----------------------------------------------------------------------- 
     94/ 
     95!----------------------------------------------------------------------- 
     96&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition          (ln_rnf =T) 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98/ 
     99!----------------------------------------------------------------------- 
     100&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (nn_isf >0) 
     101!----------------------------------------------------------------------- 
     102/ 
     103!----------------------------------------------------------------------- 
     104&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                      
     105!----------------------------------------------------------------------- 
     106/ 
     107!----------------------------------------------------------------------- 
     108&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing           (ln_apr_dyn =T) 
     109!----------------------------------------------------------------------- 
     110/ 
     111!----------------------------------------------------------------------- 
     112&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr =T) 
     113!----------------------------------------------------------------------- 
     114/ 
     115!----------------------------------------------------------------------- 
     116&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T) 
     117!----------------------------------------------------------------------- 
     118/ 
     119!----------------------------------------------------------------------- 
     120&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: No iceberg) 
     121!----------------------------------------------------------------------- 
     122      ln_icebergs              = .false.               ! iceberg floats or not 
     123      ln_bergdia               = .false.               ! Calculate budgets 
    81124      nn_verbose_level         = 1                    ! Turn on more verbose output if level > 0 
    82125      nn_verbose_write         = 15                   ! Timesteps between verbose messages 
     
    113156/ 
    114157!----------------------------------------------------------------------- 
    115 &nambfr        !   bottom friction 
     158&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif") 
     159!----------------------------------------------------------------------- 
     160/ 
     161!----------------------------------------------------------------------- 
     162&nam_tide      !   tide parameters 
     163!----------------------------------------------------------------------- 
     164/ 
     165!----------------------------------------------------------------------- 
     166&nambdy        !  unstructured open boundaries                           
     167!----------------------------------------------------------------------- 
     168/ 
     169!----------------------------------------------------------------------- 
     170&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                        
     171!----------------------------------------------------------------------- 
     172/ 
     173!----------------------------------------------------------------------- 
     174&nambdy_tide   !  tidal forcing at open boundaries 
     175!----------------------------------------------------------------------- 
     176/ 
     177!----------------------------------------------------------------------- 
     178&namdrg        !   top/bottom drag coefficient                          (default: NO selection) 
     179!----------------------------------------------------------------------- 
     180   ln_lin = .true.         !     linear  drag: Cd = Cd0 Uc0 
     181/ 
     182!----------------------------------------------------------------------- 
     183&namdrg_top    !   TOP friction                                         (ln_isfcav=T) 
     184!----------------------------------------------------------------------- 
     185/ 
     186!----------------------------------------------------------------------- 
     187&namdrg_bot    !   BOTTOM friction                                   
    116188!----------------------------------------------------------------------- 
    117189/ 
     
    122194/ 
    123195!----------------------------------------------------------------------- 
    124 &nambbl        !   bottom boundary layer scheme 
    125 !----------------------------------------------------------------------- 
    126 / 
    127 !----------------------------------------------------------------------- 
    128 &nameos        !   ocean physical parameters 
    129 !----------------------------------------------------------------------- 
    130    ln_teos10    = .true.         !  = Use TEOS-10 equation of state 
    131 / 
    132 !----------------------------------------------------------------------- 
    133 &namtra_adv    !   advection scheme for tracer 
    134 !----------------------------------------------------------------------- 
    135    ln_traadv_fct =  .true.    !  FCT scheme 
     196&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         (default: NO) 
     197!----------------------------------------------------------------------- 
     198   ln_trabbl   = .true.    !  Bottom Boundary Layer parameterisation flag 
     199   nn_bbl_ldf  =  1        !  diffusive bbl (=1)   or not (=0) 
     200   nn_bbl_adv  =  0        !  advective bbl (=1/2) or not (=0) 
     201   rn_ahtbbl   =  1000.    !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s] 
     202   rn_gambbl   =  10.      !  advective bbl coefficient                 [s] 
     203/ 
     204!----------------------------------------------------------------------- 
     205&nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: NO) 
     206!----------------------------------------------------------------------- 
     207   ln_teos10   = .false.         !  = Use TEOS-10 equation of state 
     208   ln_eos80    = .true.          !  = Use EOS80 
     209   ln_seos     = .false.         !  = Use S-EOS (simplified Eq.) 
     210/ 
     211!----------------------------------------------------------------------- 
     212&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO selection) 
     213!----------------------------------------------------------------------- 
     214   ln_traadv_fct = .true.     !  FCT scheme 
    136215      nn_fct_h   =  2               !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order  
    137216      nn_fct_v   =  2               !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order  
    138       nn_fct_zts =  0               !  > 1 , 2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping 
    139       !                             !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts) 
    140 / 
    141 !----------------------------------------------------------------------- 
    142 &namtra_adv_mle !  mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) 
     217/ 
     218!----------------------------------------------------------------------- 
     219&namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) (default: NO) 
    143220!----------------------------------------------------------------------- 
    144221   ln_mle      = .true.   ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation 
    145222/ 
    146 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    147 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
    148 !---------------------------------------------------------------------------------- 
     223!----------------------------------------------------------------------- 
     224&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO selection) 
     225!----------------------------------------------------------------------- 
    149226   !                       !  Operator type: 
     227   ln_traldf_NONE  =  .false.  !           No operator (no explicit advection) 
    150228   ln_traldf_lap   =  .true.   !    laplacian operator 
    151229   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator 
     
    175253   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s] 
    176254/ 
    177 !---------------------------------------------------------------------------------- 
    178 &namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param. 
    179 !---------------------------------------------------------------------------------- 
     255!----------------------------------------------------------------------- 
     256&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param.                         (default: NO) 
     257!----------------------------------------------------------------------- 
    180258   ln_ldfeiv     =.true.   ! use eddy induced velocity parameterization 
    181259   ln_ldfeiv_dia =.true.   ! diagnose eiv stream function and velocities 
     
    194272/ 
    195273!----------------------------------------------------------------------- 
    196 &namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection 
    197 !----------------------------------------------------------------------- 
    198 / 
    199 !----------------------------------------------------------------------- 
    200 &namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys) 
     274&nam_vvl       !   vertical coordinate options                          (default: z-star) 
     275!----------------------------------------------------------------------- 
     276/ 
     277!----------------------------------------------------------------------- 
     278&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: NO selection) 
     279!----------------------------------------------------------------------- 
     280   ln_dynadv_NONE= .false. !  linear dynamics (no momentum advection) 
     281   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form - 2nd centered scheme 
     282     nn_dynkeg     = 0        ! grad(KE) scheme: =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction 
     283   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme 
     284   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme 
     285/ 
     286!----------------------------------------------------------------------- 
     287&namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: NO) 
    201288!----------------------------------------------------------------------- 
    202289   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme 
     
    207294/ 
    208295!----------------------------------------------------------------------- 
    209 &namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option 
     296&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: NO selection) 
    210297!----------------------------------------------------------------------- 
    211298   ln_hpg_sco  = .true.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation) 
    212299/ 
    213300!----------------------------------------------------------------------- 
    214 &namdyn_spg    !   surface pressure gradient 
     301&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO) 
    215302!----------------------------------------------------------------------- 
    216303   ln_dynspg_ts  = .true.  !  split-explicit free surface 
    217304/ 
    218305!----------------------------------------------------------------------- 
    219 &namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum 
     306&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO selection) 
    220307!----------------------------------------------------------------------- 
    221308   !                       !  Type of the operator : 
    222    !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F  
     309   ln_dynldf_NONE=  .false.    !           No operator (no explicit diffusion) 
    223310   ln_dynldf_lap =  .true.     !    laplacian operator 
    224311   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator 
     
    243330/ 
    244331!----------------------------------------------------------------------- 
    245 &namzdf        !   vertical physics 
    246 !----------------------------------------------------------------------- 
    247 / 
    248 !----------------------------------------------------------------------- 
    249 &namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  ("key_zdftke") 
    250 !----------------------------------------------------------------------- 
    251 / 
    252 !----------------------------------------------------------------------- 
    253 &namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm") 
    254 !----------------------------------------------------------------------- 
    255 / 
    256 !----------------------------------------------------------------------- 
    257 &namzdf_tmx    !   tidal mixing parameterization                        ("key_zdftmx") 
    258 !----------------------------------------------------------------------- 
    259 / 
    260 !----------------------------------------------------------------------- 
    261 &namzdf_tmx_new !   internal wave-driven mixing parameterization        ("key_zdftmx_new" & "key_zdfddm") 
     332&namzdf        !   vertical physics                                     (default: NO selection) 
     333!----------------------------------------------------------------------- 
     334   !                       ! type of vertical closure 
     335   ln_zdfcst   = .false.      !  constant mixing 
     336   ln_zdfric   = .false.      !  local Richardson dependent formulation (T =>   fill namzdf_ric) 
     337   ln_zdftke   = .true.       !  Turbulent Kinetic Energy closure       (T =>   fill namzdf_tke) 
     338   ln_zdfgls   = .false.      !  Generic Length Scale closure           (T =>   fill namzdf_gls) 
     339   ln_zdfosm   = .false.      !  OSMOSIS BL closure                     (T =>   fill namzdf_osm) 
     340   ! 
     341   !                       ! convection 
     342   ln_zdfevd   = .true.       !  Enhanced Vertical Diffusion scheme 
     343      nn_evdm  =    0            !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1) 
     344      rn_evd   =  100.           !  evd mixing coefficient [m2/s] 
     345   ! 
     346   ln_zdfddm   = .true.    ! double diffusive mixing 
     347      rn_avts  =    1.e-4     !  maximum avs (vertical mixing on salinity) 
     348      rn_hsbfr =    1.6       !  heat/salt buoyancy flux ratio 
     349   ! 
     350   !                       ! gravity wave-driven vertical mixing 
     351   ln_zdfiwm   = .true.       ! internal wave-induced mixing            (T =>   fill namzdf_iwm) 
     352   ln_zdfswm   = .false.      ! surface  wave-induced mixing            (T => ln_wave=ln_sdw=T ) 
     353   ! 
     354   !                       !  Coefficients 
     355   rn_avm0     =   1.2e-4     !  vertical eddy viscosity   [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     356   rn_avt0     =   1.2e-5     !  vertical eddy diffusivity [m2/s]       (background Kz if ln_zdfcst=F) 
     357   nn_avb      =    0         !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0) 
     358   nn_havtb    =    1         !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0) 
     359/ 
     360!----------------------------------------------------------------------- 
     361&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       (ln_zdfric =T) 
     362!----------------------------------------------------------------------- 
     363/ 
     364!----------------------------------------------------------------------- 
     365&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  (ln_zdftke =T) 
     366!----------------------------------------------------------------------- 
     367/ 
     368!----------------------------------------------------------------------- 
     369&namzdf_gls    !   GLS vertical diffusion                               (ln_zdfgls =T) 
     370!----------------------------------------------------------------------- 
     371/ 
     372!----------------------------------------------------------------------- 
     373&namzdf_osm    !   OSM vertical diffusion                               (ln_zdfosm =T) 
     374!----------------------------------------------------------------------- 
     375/ 
     376!----------------------------------------------------------------------- 
     377&namzdf_iwm    !    internal wave-driven mixing parameterization        (ln_zdfiwm =T) 
    262378!----------------------------------------------------------------------- 
    263379   nn_zpyc     = 2         !  pycnocline-intensified dissipation scales as N (=1) or N^2 (=2) 
     
    266382/ 
    267383!----------------------------------------------------------------------- 
    268 &nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi) 
    269 !----------------------------------------------------------------------- 
    270 / 
    271 !----------------------------------------------------------------------- 
    272 &namctl        !   Control prints & Benchmark 
    273 !----------------------------------------------------------------------- 
    274 / 
    275 !----------------------------------------------------------------------- 
    276 &namptr       !   Poleward Transport Diagnostic 
    277 !----------------------------------------------------------------------- 
    278 / 
    279 !----------------------------------------------------------------------- 
    280 &namhsb       !  Heat and salt budgets                                  (default F) 
     384&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi") 
     385!----------------------------------------------------------------------- 
     386/ 
     387!----------------------------------------------------------------------- 
     388&namctl        !   Control prints  
     389!----------------------------------------------------------------------- 
     390   ln_ctl      = .false.   !  trends control print (expensive!) 
     391   nn_print    =    0      !  level of print (0 no extra print) 
     392   ln_timing   = .false.   !  timing by routine write out in timing.output file 
     393   ln_diacfl   = .false.   !  CFL diagnostics write out in cfl_diagnostics.ascii 
     394/ 
     395!----------------------------------------------------------------------- 
     396&namsto        ! Stochastic parametrization of EOS                      (default: NO) 
     397!----------------------------------------------------------------------- 
     398/ 
     399!----------------------------------------------------------------------- 
     400&namtrd        !   trend diagnostics                                    (default F) 
     401!----------------------------------------------------------------------- 
     402/ 
     403!----------------------------------------------------------------------- 
     404&namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                        (default F) 
     405!----------------------------------------------------------------------- 
     406/ 
     407!----------------------------------------------------------------------- 
     408&namhsb        !  Heat and salt budgets                                 (default F) 
    281409!----------------------------------------------------------------------- 
    282410   ln_diahsb  = .true.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F) 
    283411/ 
    284412!----------------------------------------------------------------------- 
    285 &namobs       !  observation usage                                      ('key_diaobs') 
    286 !----------------------------------------------------------------------- 
    287 / 
    288 !----------------------------------------------------------------------- 
    289 &nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc') 
    290 !----------------------------------------------------------------------- 
    291 / 
     413&namdiu        !   Cool skin and warm layer models                      (default F) 
     414!----------------------------------------------------------------------- 
     415/ 
     416!----------------------------------------------------------------------- 
     417&namflo        !   float parameters                                     ("key_float") 
     418!----------------------------------------------------------------------- 
     419/ 
     420!----------------------------------------------------------------------- 
     421&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents              ("key_diaharm") 
     422!----------------------------------------------------------------------- 
     423/ 
     424!----------------------------------------------------------------------- 
     425&namdct        ! transports through some sections                       ("key_diadct") 
     426!----------------------------------------------------------------------- 
     427/ 
     428!----------------------------------------------------------------------- 
     429&nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                              (default F) 
     430!----------------------------------------------------------------------- 
     431/ 
     432!----------------------------------------------------------------------- 
     433&nam_dia25h    !  25h Mean Output                                       (default F) 
     434!----------------------------------------------------------------------- 
     435/ 
     436!----------------------------------------------------------------------- 
     437&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4") 
     438!----------------------------------------------------------------------- 
     439/ 
     440!----------------------------------------------------------------------- 
     441&namobs        !  observation usage switch 
     442!----------------------------------------------------------------------- 
     443/ 
     444!----------------------------------------------------------------------- 
     445&nam_asminc    !   assimilation increments                              ('key_asminc') 
     446!----------------------------------------------------------------------- 
     447/ 
     448!----------------------------------------------------------------------- 
     449&namdta_dyn    !   offline dynamics read in files                       ("key_offline") 
     450!----------------------------------------------------------------------- 
     451/ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.