Changeset 3996


Ignore:
Timestamp:
08/16/18 13:17:43 (2 years ago)
Author:
cetlod
Message:

Updating PISCES offline configuration

Location:
CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6
Files:
9 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_OFF_PISCES/ia/COMP/pisces.card

    r3992 r3996  
    5252 
    5353[ParametersFiles] 
    54 List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                                    , namelist_ref                  ), \ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref                                , namelist_top_ref              ), \ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref                             , namelist_pisces_ref           ), \ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo_offline.xml       , context_nemo.xml              ), \ 
    58         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml            , domain_def_nemo.xml           ), \ 
    59         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml              , axis_def_nemo.xml             ), \ 
    60         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml             , grids_def_nemo.xml            ), \ 
    61         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml         , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
    62         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    63         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    64         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    65         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_${RESOL_OCE}piC_cfg                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    66         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_${RESOL_OCE}_cfg                                     , namelist_pisces_cfg           ), \ 
    67         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    68         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces.xml                                             , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
     54List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                                   , namelist_ref                  ), \ 
     55        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref                               , namelist_top_ref              ), \ 
     56        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref                            , namelist_pisces_ref           ), \ 
     57        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/context_nemo.xml               , context_nemo.xml              ), \ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml            , domain_def_nemo.xml           ), \ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml              , axis_def_nemo.xml             ), \ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml             , grids_def_nemo.xml            ), \ 
     61        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml         , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
     62        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
     63        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml     , field_def_nemo-inerttrc.xml  ), \ 
     64        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_offline_${exptype}_cfg                , namelist_cfg                 ), \ 
     65        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_top_cfg                               , namelist_top_cfg             ), \ 
     66        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/namelist_pisces_cfg                                         , namelist_pisces_cfg          ), \ 
     67        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml                    ), \ 
     68        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                 , file_def_nemo-pisces.xml     ) 
    6969 
    7070[RestartFiles] 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_OFF_PISCES/clim/COMP/pisces.card

    r3992 r3996  
    2727            (${pisces_UserChoices_R_DYN}/dyna_grid_V.nc, .), \ 
    2828            (${pisces_UserChoices_R_DYN}/dyna_grid_W.nc, .), \ 
    29             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TDIC_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_DIC_nomask.nc ), \ 
    30             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TALK_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_ALK_nomask.nc ), \ 
    31             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/O2_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_OXY_nomask.nc ), \ 
    32             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/PO4_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_PO4_nomask.nc ), \ 
    33             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Si_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_SIL_nomask.nc ), \ 
    34             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/DOC_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_DOC_nomask.nc ), \ 
    35             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Fer_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_FER_nomask.nc ), \ 
    36             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/NO3_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_NO3_nomask.nc ), \ 
    37             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/weights_3D_r360x180_orca2_bilinear.nc, weights_3D_r360x180_bilin.nc ), \ 
    38             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/DUST_INCA_LOI6012-histAER_1M_1850.nc, dust.orca.nc       ), \ 
    39             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/weights_LMD144142_ORCA2_bilinear.nc , weights_lmd144142_bilin.nc ), \ 
    40             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/bathy.orca.nc                           , bathy.orca.nc)      , \ 
    41             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/rivernew_OA_orca2.nc                    , river.orca.nc)      , \ 
    42             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/Ndep_input4MIPs_surfaceFluxes_CMIP_NCAR-CCMI-2-0_gn_185001-185012-clim.nc, ndeposition.orca.nc), \ 
    43             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/weights_CMIP_NCAR-CCMI_ORCA2_bilinear.nc, weights_2d_bilin.nc), \ 
    44             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/par_fraction_gewex_orca_r2_clim90s00s.nc, par.orca.nc)        , \ 
    45             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/solubility1_T62-ORCA2_Mahowald.nc       , solubility.orca.nc) 
     29            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TDIC_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_DIC_nomask.nc ), \ 
     30            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TALK_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_ALK_nomask.nc ), \ 
     31            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/O2_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_OXY_nomask.nc ), \ 
     32            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/PO4_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_PO4_nomask.nc ), \ 
     33            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Si_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_SIL_nomask.nc ), \ 
     34            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/DOC_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_DOC_nomask.nc ), \ 
     35            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Fer_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_FER_nomask.nc ), \ 
     36            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/NO3_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_NO3_nomask.nc ), \ 
     37            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/weights_3D_r360x180_orca2_bilinear.nc, weights_3D_r360x180_bilin.nc ), \ 
     38            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/DUST_INCA_LOI6012-histAER_1M_1850.nc, dust.orca.nc       ), \ 
     39            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/weights_LMD144142_ORCA2_bilinear.nc , weights_lmd144142_bilin.nc ), \ 
     40            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/bathy.orca.nc                           , bathy.orca.nc)      , \ 
     41            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/rivernew_OA_orca2.nc                    , river.orca.nc)      , \ 
     42            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/Ndep_input4MIPs_surfaceFluxes_CMIP_NCAR-CCMI-2-0_gn_185001-185012-clim.nc, ndeposition.orca.nc), \ 
     43            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/weights_CMIP_NCAR-CCMI_ORCA2_bilinear.nc, weights_2d_bilin.nc), \ 
     44            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/par_fraction_gewex_orca_r2_clim90s00s.nc, par.orca.nc)        , \ 
     45            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/solubility1_T62-ORCA2_Mahowald.nc       , solubility.orca.nc) 
    4646 
    4747 
     
    5050        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref                                , namelist_top_ref              ), \ 
    5151        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref                             , namelist_pisces_ref           ), \ 
    52         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo_offline.xml       , context_nemo.xml              ), \ 
    53         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml            , domain_def_nemo.xml           ), \ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml              , axis_def_nemo.xml             ), \ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml             , grids_def_nemo.xml            ), \ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml         , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    58         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml    , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    59         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    60         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_cfg                                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    61         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_cfg                                                  , namelist_pisces_cfg           ), \ 
    62         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml               ), \ 
    63         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                     , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
     52        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/context_nemo_offline.xml        , context_nemo.xml              ), \ 
     53        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml             , domain_def_nemo.xml           ), \ 
     54        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml               , axis_def_nemo.xml             ), \ 
     55        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml              , grids_def_nemo.xml            ), \ 
     56        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml          , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
     57        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml       , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml     , field_def_nemo-inerttrc.xml   ), \ 
     59        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_offline_${exptype}_cfg                , namelist_cfg                  ), \ 
     60        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_top_cfg                               , namelist_top_cfg              ), \ 
     61        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/namelist_pisces_cfg                                         , namelist_pisces_cfg           ), \ 
     62        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml                     ), \ 
     63        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                 , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
     64 
    6465 
    6566 
     
    6869 
    6970[OutputText] 
    70 List=   (namelist_top_ref, namelist_top_cfg, namelist_pisces_ref, namelist_pisces_cfg, tracer.stat) 
     71List=   (ocean.output, namelist_top_ref, namelist_top_cfg, namelist_pisces_ref, namelist_pisces_cfg, tracer.stat) 
    7172 
    7273[OutputFiles] 
     
    7576        (${config_UserChoices_JobName}_1y_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_Y}/${PREFIX}_1Y_bioscalar.nc , NONE) , \ 
    7677        (${config_UserChoices_JobName}_1m_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_bioscalar.nc , Post_1M_bioscalar) , \ 
    77         (${config_UserChoices_JobName}_1m_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_ptrc_T.nc    , NONE   ) , \ 
    78         (${config_UserChoices_JobName}_1m_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_diad_T.nc    , NONE   ) , \ 
     78        (${config_UserChoices_JobName}_1m_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_ptrc_T.nc    , Post_1M_ptrc_T   ) , \ 
     79        (${config_UserChoices_JobName}_1m_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_diad_T.nc    , Post_1M_diad_T   ) , \ 
    7980        (${config_UserChoices_JobName}_1d_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_D}/${PREFIX}_1D_bioscalar.nc , NONE) 
    8081 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_OFF_PISCES/ia/COMP/pisces.card

    r3992 r3996  
    2525 
    2626 
    27 ListNonDel= (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mask.nc), \ 
    28             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mesh_hgr.nc), \ 
    29             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mesh_zgr.nc), \ 
    30             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TDIC_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_DIC_nomask.nc ), \ 
    31             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TALK_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_ALK_nomask.nc ), \ 
    32             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/O2_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_OXY_nomask.nc ), \ 
    33             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/PO4_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_PO4_nomask.nc ), \ 
    34             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Si_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_SIL_nomask.nc ), \ 
    35             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/DOC_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_DOC_nomask.nc ), \ 
    36             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Fer_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_FER_nomask.nc ), \ 
    37             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/NO3_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_NO3_nomask.nc ), \ 
    38             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/weights_3D_r360x180_orca2_bilinear.nc, weights_3D_r360x180_bilin.nc ), \ 
    39             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/DUST_INCA_LOI6012-histAER_1M_1850.nc, dust.orca.nc       ), \ 
    40             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/weights_LMD144142_ORCA2_bilinear.nc , weights_lmd144142_bilin.nc ), \ 
    41             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/bathy.orca.nc                           , bathy.orca.nc)      , \ 
    42             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/rivernew_OA_orca2.nc                    , river.orca.nc)      , \ 
    43             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/Ndep_input4MIPs_surfaceFluxes_CMIP_NCAR-CCMI-2-0_gn_185001-185012-clim.nc, ndeposition.orca.nc), \ 
    44             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/weights_CMIP_NCAR-CCMI_ORCA2_bilinear.nc, weights_2d_bilin.nc), \ 
    45             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/par_fraction_gewex_orca_r2_clim90s00s.nc, par.orca.nc)        , \ 
    46             (${R_IN}/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/solubility1_T62-ORCA2_Mahowald.nc       , solubility.orca.nc) 
    47  
     27ListNonDel= (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mask.nc), \ 
     28            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mesh_hgr.nc), \ 
     29            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/dyna/cmip5/piControl2_mesh_mask_v36st.nc, mesh_zgr.nc), \ 
     30            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TDIC_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_DIC_nomask.nc ), \ 
     31            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/TALK_GLODAPv2.1_annual_r360x180xl31.nc, data_ALK_nomask.nc ), \ 
     32            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/O2_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_OXY_nomask.nc ), \ 
     33            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/PO4_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_PO4_nomask.nc ), \ 
     34            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Si_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc    , data_SIL_nomask.nc ), \ 
     35            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/DOC_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_DOC_nomask.nc ), \ 
     36            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Fer_PISCES_monthly_r360x180xl31.nc    , data_FER_nomask.nc ), \ 
     37            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/NO3_WOA2009_monthly_r360x180xl31.nc   , data_NO3_nomask.nc ), \ 
     38            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/weights_3D_r360x180_orca2_bilinear.nc, weights_3D_r360x180_bilin.nc ), \ 
     39            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/DUST_INCA_LOI6012-histAER_1M_1850.nc, dust.orca.nc       ), \ 
     40            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Dust_inca_LOI/weights_LMD144142_ORCA2_bilinear.nc , weights_lmd144142_bilin.nc ), \ 
     41            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/bathy.orca.nc                           , bathy.orca.nc)      , \ 
     42            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/rivernew_OA_orca2.nc                    , river.orca.nc)      , \ 
     43            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/Ndep_input4MIPs_surfaceFluxes_CMIP_NCAR-CCMI-2-0_gn_185001-185012-clim.nc, ndeposition.orca.nc), \ 
     44            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/Ndep_input4MIPs/weights_CMIP_NCAR-CCMI_ORCA2_bilinear.nc, weights_2d_bilin.nc), \ 
     45            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/par_fraction_gewex_orca_r2_clim90s00s.nc, par.orca.nc)        , \ 
     46            (${R_IN}/OCE/NEMO/${config_UserChoices_TagName}/${pisces_UserChoices_version}/solubility1_T62-ORCA2_Mahowald.nc       , solubility.orca.nc) 
    4847 
    4948[ParametersFiles] 
     
    5150        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_top_ref                                , namelist_top_ref              ), \ 
    5251        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref                             , namelist_pisces_ref           ), \ 
    53         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo_offline.xml       , context_nemo.xml              ), \ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml            , domain_def_nemo.xml           ), \ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml              , axis_def_nemo.xml             ), \ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml             , grids_def_nemo.xml            ), \ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml         , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
    58         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    59         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    60         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    61         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_cfg                                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    62         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_cfg                                                  , namelist_pisces_cfg           ), \ 
    63         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml               ), \ 
    64         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                     , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
    65  
     52        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/context_nemo_offline.xml        , context_nemo.xml              ), \ 
     53        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml             , domain_def_nemo.xml           ), \ 
     54        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/axis_def_nemo.xml               , axis_def_nemo.xml             ), \ 
     55        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/grids_def_nemo.xml              , grids_def_nemo.xml            ), \ 
     56        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml          , field_def_nemo-opa.xml        ), \ 
     57        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml       , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_OFF_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml     , field_def_nemo-inerttrc.xml   ), \ 
     59        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_offline_${exptype}_cfg                , namelist_cfg                  ), \ 
     60        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_top_cfg                               , namelist_top_cfg              ), \ 
     61        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/namelist_pisces_cfg                                         , namelist_pisces_cfg           ), \ 
     62        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml                     ), \ 
     63        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                 , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
    6664 
    6765 
     
    7068 
    7169[OutputText] 
    72 List=   (namelist_top_ref, namelist_top_cfg, namelist_pisces_ref, namelist_pisces_cfg, tracer.stat) 
     70List=   (ocean.output, namelist_top_ref, namelist_top_cfg, namelist_pisces_ref, namelist_pisces_cfg, tracer.stat) 
    7371 
    7472 
     
    7876        (${config_UserChoices_JobName}_1y_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_Y}/${PREFIX}_1Y_bioscalar.nc , NONE) , \ 
    7977        (${config_UserChoices_JobName}_1m_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_bioscalar.nc , Post_1M_bioscalar) , \ 
    80         (${config_UserChoices_JobName}_1m_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_ptrc_T.nc    , NONE   ) , \ 
    81         (${config_UserChoices_JobName}_1m_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_diad_T.nc    , NONE   ) , \ 
     78        (${config_UserChoices_JobName}_1m_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_ptrc_T.nc    , Post_1M_ptrc_T   ) , \ 
     79        (${config_UserChoices_JobName}_1m_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_diad_T.nc    , Post_1M_diad_T   ) , \ 
    8280        (${config_UserChoices_JobName}_1d_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_D}/${PREFIX}_1D_bioscalar.nc , NONE) 
    8381 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/DRIVER/pisces.driver

    r3961 r3996  
    1919       IGCM_debug_Print 1 "EXPERIMENT TYPE  : ${exptype}" 
    2020 
    21        OPA_RDT=$( supergrep rn_rdt  ${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}$/namelist_offline_${exptype}_cfg | sed 's/ *rn_rdt *=//' | sed 's/\. *,//' ) 
     21       OPA_RDT=$( supergrep rn_rdt  ${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_offline_${exptype}_cfg | sed 's/ *rn_rdt *=//' | sed 's/\. *,//' ) 
    2222       # Period Length In Days between DateBegin and first day of calendar 0001 01 01 
    2323       # /!\ Needed by OPA namelist to compute file names /!\ 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/DRIVER/xios.driver

    r3992 r3996  
    2222    if [ X"$( echo ${config_UserChoices_ExpType} | grep CMIP6 )" != "X" ] ; then 
    2323       IGCM_comp_modifyXmlFile force iodef.xml using_server2 NONE true 
     24       
     25       # Add include of cmip6 context in iodef.xml 
     26       # In iodef.xml add on next line after "CMIP6 CONTEXT" 
     27      if [ X"$( echo ${config_UserChoices_ExpType} | grep CMIP6 )" != "X" ] ; then 
     28         echo '<context id="nemo" src="./ping_nemo.xml"/>' >> add.tmp 
     29         echo '<context id="nemo" src="./dr2xml_opa9.xml"/>' >> add.tmp 
     30      fi 
     31      cp iodef.xml iodef.xml.tmp 
     32      sed -e "/CMIP6 CONTEXT/r add.tmp" \ 
     33        iodef.xml.tmp > iodef.xml 
     34      rm iodef.xml.tmp add.tmp 
     35 
    2436    fi 
    2537 
    26    # Add include of nemo context in iodef.xml 
    27     # In iodef.xml add on next line after "COMPONENT CONTEXT" 
    28     #  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/> 
    29     echo '<context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>' > add.tmp 
    30     if [ X"$( echo ${config_UserChoices_ExpType} | grep CMIP6 )" != "X" ] ; then 
    31         echo '<context id="nemo" src="./ping_nemo.xml"/>' >> add.tmp 
    32         echo '<context id="nemo" src="./dr2xml_opa9.xml"/>' >> add.tmp 
    33     fi 
    34     cp iodef.xml iodef.xml.tmp 
    35     sed -e "/ALL CONTEXT/r add.tmp" \ 
    36         iodef.xml.tmp > iodef.xml 
    37     rm iodef.xml.tmp add.tmp 
    3838 
    3939    IGCM_debug_PopStack "IOS_Update" 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/PARAM/NAMELIST/ORCA1/namelist_offline_ia_cfg

    r3854 r3996  
    1212   nn_stock    =  _AUTO_ 
    1313   ln_mskland  = .true. 
    14    ln_mskutil  = .false. 
    1514   ln_clobber  = .true. 
    1615   ln_cfmeta   = .true. 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/PARAM/NAMELIST/ORCA2/namelist_offline_clim_cfg

    r3854 r3996  
    1212   nn_stock    =  _AUTO_ 
    1313   ln_mskland  = .true. 
    14    ln_mskutil  = .false. 
    1514   ln_clobber  = .true. 
    1615   ln_cfmeta   = .true. 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/PARAM/NAMELIST/ORCA2/namelist_offline_ia_cfg

    r3854 r3996  
    1212   nn_stock    =  _AUTO_ 
    1313   ln_mskland  = .true. 
    14    ln_mskutil  = .false. 
    1514   ln_clobber  = .true. 
    1615   ln_cfmeta   = .true. 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/PARAM/XML/iodef.xml

    r3992 r3996  
    4444  <!-- =========================================================================================================== --> 
    4545 
    46   <!-- ALL CONTEXT : the context will be add automatically by xios.driver               --> 
     46  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>       <!--  NEMO       --> 
     47  <!-- CMIP6 CONTEXT : the context will be add automatically by opa.driver --> 
    4748   
    4849</simulation> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.