Ignore:
Timestamp:
04/08/24 16:04:54 (3 weeks ago)
Author:
acosce
Message:

update Experiments with chemistry in IPSLCM6.3 subconfigurations IPSLESM and LMDZORINCA

  • EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_CoupOceAtm_TEST :
    • coupling n2o between pisces and inca
    • activate n chemistry in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
    • coupling n2o between orchidee and inca
  • EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_TEST/
    • activate n chemistry in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
  • EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_CoupOceAtm_TEST/
    • coupling n2o and dms between pisces and inca
    • activate n chemistrty in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
    • activate cov chemistry in orchidee sechiba (chemistry_bvoc=y)
    • coupling n2o, dms, h2s between orchidee and inca
  • EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_TEST/
    • activate n chemistrty in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
    • activate cov chemistry in orchidee sechiba (chemistry_bvoc=y)
    • coupling dms, h2s between orchidee and inca
  • EXPERIMENTS/LMDZORINCA/GES/
    • activate n chemistry in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
  • EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/
    • activate n chemistrty in orchidee stomate (stomate_impose_cn=n)
    • activate cov chemistry in orchidee sechiba (chemistry_bvoc=y)
    • coupling dms, h2s between orchidee and inca

remove GENERAL/PARAM/orchidee.def_Choi not use any more
add parameter for N stomate chemistry in GENERAL/PARAM/orchidee.def_CWRR
create two inca.def for coupling between orchidee and inca (for dms and h2s only (cov), and for dms, h2s and n2o (cov_n2o)

Add initial states files for atm, srf, and sbg for all experiments

Location:
CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3
Files:
16 added
1 deleted
21 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_CoupOceAtm_TEST/COMP/inca.card

    r6794 r6795  
    1515#be careful name of sflx file change with the choice of emi_interp_time ( no file / sflx_p2p.nc)  
    1616emi_interp_time=1 
     17#choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
     18multi_sources_nat=y 
    1719 
    1820 
    19 #coupled model with Orchidee and Pisces 
    20 #if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
     21#  LAND -> ATM cycle  
     22#for coupling with Orchidee you need to modify inca.def to specify flux between the two composantes 
    2123CoupOrchInca=y 
     24 
     25# OCEAN -> ATM cycle  
    2226CoupOceAtm=y 
    2327#choice of species transfer from ocean to atmosphere (via lmdz)  
    2428transm_dms_oa=n 
    2529transm_n2o_oa=y 
    26  
    27 #choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
    28 multi_sources_nat=y 
    29  
    3030 
    3131# Specify output frequency for output files  
    … …  
    4242         
    4343[BoundaryFiles] 
    44 List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
    45      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
    46      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc,   sflx_NAT.nc     )\ 
    47      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc           ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
    48      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_${year}.nc,   oxydants.nc         ) 
     44List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc      ,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     45     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc      ,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     46     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc   ,   sflx_NAT.nc         ),\ 
     47     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc                                ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
     48     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_${year}.nc                ,   oxydants.nc         ) 
    4949 
    5050 
    51 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                      ,   npp.nc          )\ 
    52             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc  ,   sflx_GHG.nc     )\ 
    53             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc ,   sflx_MISC.nc    )\ 
    54             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                         ,   lglived.dat     ),\ 
    55             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                        ,   landuse.nc      )\ 
    56             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                         ,   andres.nc       )\ 
    57             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                         ,   casa_m.nc       )\ 
    58             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                           ,   taka.nc         )\ 
    59             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                         ,   casa_h.nc       )\ 
    60             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                ,   phototable.dat  ) 
     51ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                                          ,   npp.nc              ),\ 
     52            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc      ,   sflx_GHG.nc         ),\ 
     53            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc     ,   sflx_MISC.nc        ),\ 
     54            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat         ),\ 
     55            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc          ),\ 
     56            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                                     ,   andres.nc           ),\ 
     57            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                                     ,   casa_m.nc           ),\ 
     58            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                                       ,   taka.nc             ),\ 
     59            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                                     ,   casa_h.nc           ),\ 
     60            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat      ) 
    6161 
    6262 
    … …  
    8282 
    8383[OutputFiles] 
    84 List=   (inca1d_ges.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc        , Post_1D_inca_ges  ),\ 
    85         (inca1d_coupling.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_coupling.nc   , NONE              ),\ 
    86         (inca1mo_ges.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc        , NONE              ),\ 
    87         (inca1mo_coupling.nc    ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_coupling.nc   , NONE              ),\ 
    88         (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE              ) 
    89  
     84List=   (inca1d_ges.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc        , Post_1D_inca_ges      ),\ 
     85        (inca1d_coupling.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_coupling.nc   , Post_1D_inca_coupling ),\ 
     86        (inca1mo_ges.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc        , Post_1M_inca_ges      ),\ 
     87        (inca1mo_coupling.nc    ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_coupling.nc   , Post_1M_inca_coupling ),\ 
     88        (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE                  ) 
    9089 
    9190 
    … …  
    9695TimeSeriesVars2D = () 
    9796ChunckJob2D = NONE 
    98 TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf) 
     97TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
    9998ChunckJob3D = NONE 
    10099Seasonal=OFF 
     100 
     101 
     102 
     103[Post_1M_inca_ges] 
     104Patches= () 
     105GatherWithInternal = (lon, lat, presnivs, , time_centered, time_centered_bounds, time_counter, area) 
     106TimeSeriesVars2D = () 
     107ChunckJob2D = NONE 
     108TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
     109ChunckJob3D = NONE 
     110Seasonal=OFF 
     111 
     112 
     113[Post_1D_inca_coupling] 
     114Patches= () 
     115GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     116TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     117ChunckJob2D = NONE 
     118TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o, ocean_flx_n2o) 
     119ChunckJob3D = NONE 
     120Seasonal=OFF 
     121 
     122 
     123[Post_1M_inca_coupling] 
     124Patches= () 
     125GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     126TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     127ChunckJob2D = NONE 
     128TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o, ocean_flx_n2o) 
     129ChunckJob3D = NONE 
     130Seasonal=OFF 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_CoupOceAtm_TEST/COMP/orchidee.card

    r6628 r6795  
    3030output_freq_sechiba_history_4dim = 1d 
    3131 
     32# Specify if you want to calculate chemistry of COV in orchidee  
     33CHEMISTRY_BVOC=n 
    3234 
    3335[InitialStateFiles] 
    34 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc, . ), \ 
    35     (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc , .), \ 
    36         (${R_IN}/SRF/reftemp.nc, . ), \ 
    37         (${R_IN}/SRF/routing.nc, . ), \ 
    38         (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc, alb_bg.nc ), \ 
    39         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     36List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc                             , .              ), \ 
     37        (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc                   , .              ), \ 
     38        (${R_IN}/SRF/reftemp.nc                                 , .              ), \ 
     39        (${R_IN}/SRF/routing.nc                                 , .              ), \ 
     40        (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc        , alb_bg.nc      ), \ 
     41        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc                      , .              ) 
    4042 
    4143[BoundaryFiles] 
    4244List= () 
    43 ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc, PFTmap.nc),\ 
    44             (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc,           woodharvest.nc) 
     45ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc    , PFTmap.nc     ),\ 
     46            (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc              , woodharvest.nc),\ 
     47            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc                          , .             ),\ 
     48            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc                                 , .             ) 
    4549 
    4650 
    … …  
    4953 
    5054[ParametersFiles] 
    51 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)  ,\ 
    52     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml, . )                      ,\ 
    53     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml, dr2xml_orchidee.xml)                    ,\ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .) ,\ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml, .) ,\ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)  ,\ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     55List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}                  , orchidee.def          ) ,\ 
     56        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml                          , .                     ) ,\ 
     57        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml                   , dr2xml_orchidee.xml   ) ,\ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml      , .                     ) ,\ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml , .                     ) ,\ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml       , .                     ) ,\ 
     61        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml     , .                     ) 
    5862 
    5963[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_CoupOceAtm_TEST/COMP/stomate.card

    r6628 r6795  
    55# NINPUT_UPDATE=1Y: change in nitrogen input maps every year. 
    66# Nitrogen input maps should be set in BoundaryFiles/List for 1Y or in InitialStateFile for 0Y. 
    7 NINPUT_UPDATE=0Y 
     7NINPUT_UPDATE=1Y 
    88 
    99# STOMATE_IMPOSE_CN: impose nitrogen 
    1010# If STOMATE_IMPOSE_CN=y the file leaf_cn.nc must be available 
    1111# If STOMATE_IMPOSE_CN=n the other N-input files are needed, see commented files below 
    12 STOMATE_IMPOSE_CN=y 
     12STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    1313 
    1414# Specify output level for output files 
    … …  
    2727 
    2828[InitialStateFiles] 
    29 [InitialStateFiles] 
    30 List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc, cnleaf_map.nc) 
    31  
    32 # Following files are needed if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    33 # #List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_2000.nc, nfert_pasture.nc) ,\ 
    34 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_2000.nc, nfert_cropland.nc) ,\ 
    35 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_2000.nc, nmanure_pasture.nc) ,\ 
    36 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_2000.nc, nmanure_cropland.nc) ,\ 
    37 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_2000.nc, ndep_nhx.nc), \ 
    38 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_2000.nc, ndep_noy.nc), \ 
    39 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc, bnf.nc) 
    40 # 
     29List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc       , cnleaf_map.nc         ) 
    4130 
    4231[BoundaryFiles] 
    43 List=   () 
    44 ListNonDel= () 
     32List=  () 
     33 
     34ListNonDel=     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_1900.nc    , nfert_pasture.nc      ),\ 
     35                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_1900.nc   , nfert_cropland.nc     ),\ 
     36                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_1900.nc    , nmanure_pasture.nc    ),\ 
     37                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_1900.nc   , nmanure_cropland.nc   ),\ 
     38                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_1900.nc           , ndep_nhx.nc           ),\ 
     39                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_1900.nc           , ndep_noy.nc           ),\ 
     40                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc                                                   , bnf.nc                ) 
    4541 
    4642[SmoothFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_CoupOceAtm_TEST/config.card

    r6696 r6795  
    6767[ATM] 
    6868# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    69 Restart= n 
    70 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    71 RestartDate=1849-12-31 
    72 #D- Define restart simulation name for this component 
    73 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    74 #D- Path Server Group Login 
    75 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     69Restart= y 
     70# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     71RestartDate=1990-12-31 
     72#D- Define restart simulation name for this component 
     73RestartJobName=Rescaled-79-washout 
     74#D- Path Server Group Login 
     75RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S 
    7676 
    7777#======================================================================== 
    … …  
    117117[SRF] 
    118118# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    119 Restart= n 
    120 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    121 RestartDate=1849-12-31 
    122 #D- Define restart simulation name for this component 
    123 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    124 #D- Path Server Group Login 
    125 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     119Restart= y 
     120# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     121RestartDate=2006-12-31 
     122#D- Define restart simulation name for this component 
     123RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     124#D- Path Server Group Login 
     125RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    126126 
    127127#======================================================================== 
    … …  
    129129[SBG] 
    130130# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    131 Restart= n 
    132 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    133 RestartDate=1849-12-31 
    134 #D- Define restart simulation name for this component 
    135 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    136 #D- Path Server Group Login 
    137 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     131Restart= y 
     132# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     133RestartDate=2006-12-31 
     134#D- Define restart simulation name for this component 
     135RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     136#D- Path Server Group Login 
     137RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    138138 
    139139#======================================================================== 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_TEST/COMP/inca.card

    r6683 r6795  
    1515#be careful name of sflx file change with the choice of emi_interp_time ( no file / sflx_p2p.nc)  
    1616emi_interp_time=1 
     17#choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
     18multi_sources_nat=y 
    1719 
    1820 
    19 #coupled model with Orchidee and Pisces 
    20 #if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
     21 
     22#  LAND -> ATM cycle  
     23#for coupling with Orchidee you need to modify inca.def to specify flux between the two composantes 
    2124CoupOrchInca=n 
    22 #CoupOceAtm 
     25 
     26# OCEAN -> ATM cycle  
    2327CoupOceAtm=n 
     28#choice of species transfer from ocean to atmosphere (via lmdz)  
    2429transm_dms_oa=n 
     30transm_n2o_oa=n 
    2531 
    2632 
    … …  
    3137# if you choose another frequency, the file will be store in CHM/Output/DA by default 
    3238output_frequency_ges=1d 
     39output_frequency_coupling=NONE 
    3340 
    3441 
    … …  
    3845         
    3946[BoundaryFiles] 
    40 List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/ANT/sflx_lmdz_ANT_1850_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
    41      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/BBG/sflx_lmdz_BBG_1850_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
    42      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_1850_phy.nc           ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
    43      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_1850.nc,   oxydants.nc         ) 
     47List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc      ,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     48     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc      ,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     49     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc   ,   sflx_NAT.nc         ),\ 
     50     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc                                ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
     51     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_${year}.nc                ,   oxydants.nc         ) 
    4452 
    4553 
    46 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                      ,   npp.nc          )\ 
    47             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_GHG.nc  ,   sflx_GHG.nc     )\ 
    48             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_MISC.nc ,   sflx_MISC.nc    )\ 
    49             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_NAT.nc  ,   sflx_NAT.nc     )\ 
    50             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                         ,   lglived.dat     )\ 
    51     (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                        ,   landuse.nc      )\ 
    52             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                         ,   andres.nc       )\ 
    53             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                         ,   casa_m.nc       )\ 
    54             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                           ,   taka.nc         )\ 
    55             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                         ,   casa_h.nc       )\ 
    56             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                ,   phototable.dat  ) 
     54ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                                          ,   npp.nc              ),\ 
     55            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc      ,   sflx_GHG.nc         ),\ 
     56            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc     ,   sflx_MISC.nc        ),\ 
     57            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat         ),\ 
     58            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc          ),\ 
     59            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                                     ,   andres.nc           ),\ 
     60            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                                     ,   casa_m.nc           ),\ 
     61            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                                       ,   taka.nc             ),\ 
     62            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                                     ,   casa_h.nc           ),\ 
     63            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat      ) 
    5764 
    5865 
    … …  
    7885 
    7986[OutputFiles] 
    80 List=   (inca1d_ges.nc,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc, Post_1D_inca_ges  ),\ 
    81         (inca1mo_ges.nc,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc, NONE  ),\ 
    82         (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE) 
     87List=   (inca1d_ges.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc        , Post_1D_inca_ges  ),\ 
     88        (inca1d_coupling.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_coupling.nc   , NONE              ),\ 
     89        (inca1mo_ges.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc        , Post_1M_inca_ges  ),\ 
     90        (inca1mo_coupling.nc    ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_coupling.nc   , NONE              ),\ 
     91        (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE              ) 
    8392 
    8493 
    … …  
    9099TimeSeriesVars2D = () 
    91100ChunckJob2D = NONE 
    92 TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf) 
     101TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
    93102ChunckJob3D = NONE 
    94103Seasonal=OFF 
     104 
     105 
     106 
     107[Post_1M_inca_ges] 
     108Patches= () 
     109GatherWithInternal = (lon, lat, presnivs, , time_centered, time_centered_bounds, time_counter, area) 
     110TimeSeriesVars2D = () 
     111ChunckJob2D = NONE 
     112TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
     113ChunckJob3D = NONE 
     114Seasonal=OFF 
     115 
     116 
     117[Post_1D_inca_coupling] 
     118Patches= () 
     119GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     120TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     121ChunckJob2D = NONE 
     122TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o) 
     123ChunckJob3D = NONE 
     124Seasonal=OFF 
     125 
     126 
     127[Post_1M_inca_coupling] 
     128Patches= () 
     129GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     130TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     131ChunckJob2D = NONE 
     132TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o) 
     133ChunckJob3D = NONE 
     134Seasonal=OFF 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_TEST/COMP/orchidee.card

    r6556 r6795  
    3030output_freq_sechiba_history_4dim = 1d 
    3131 
     32# Specify if you want to calculate chemistry of COV in orchidee  
     33CHEMISTRY_BVOC=n 
    3234 
    3335[InitialStateFiles] 
    34 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc, . ), \ 
    35     (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc , .), \ 
    36         (${R_IN}/SRF/reftemp.nc, . ), \ 
    37         (${R_IN}/SRF/routing.nc, . ), \ 
    38         (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc, alb_bg.nc ), \ 
    39         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     36List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc                             , .              ), \ 
     37        (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc                   , .              ), \ 
     38        (${R_IN}/SRF/reftemp.nc                                 , .              ), \ 
     39        (${R_IN}/SRF/routing.nc                                 , .              ), \ 
     40        (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc        , alb_bg.nc      ), \ 
     41        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc                      , .              ) 
    4042 
    4143[BoundaryFiles] 
    4244List= () 
    43 ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc, PFTmap.nc),\ 
    44             (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc,           woodharvest.nc) 
     45ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc    , PFTmap.nc     ),\ 
     46            (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc              , woodharvest.nc),\ 
     47            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc                          , .             ),\ 
     48            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc                                 , .             ) 
    4549 
    4650 
    … …  
    4953 
    5054[ParametersFiles] 
    51 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)  ,\ 
    52     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml, . )                      ,\ 
    53     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml, dr2xml_orchidee.xml)                    ,\ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .) ,\ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml, .) ,\ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)  ,\ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     55List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}                  , orchidee.def          ) ,\ 
     56        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml                          , .                     ) ,\ 
     57        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml                   , dr2xml_orchidee.xml   ) ,\ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml      , .                     ) ,\ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml , .                     ) ,\ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml       , .                     ) ,\ 
     61        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml     , .                     ) 
    5862 
    5963[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/GES/piControl_GES_TEST/COMP/stomate.card

    r6556 r6795  
    55# NINPUT_UPDATE=1Y: change in nitrogen input maps every year. 
    66# Nitrogen input maps should be set in BoundaryFiles/List for 1Y or in InitialStateFile for 0Y. 
    7 NINPUT_UPDATE=0Y 
     7NINPUT_UPDATE=1Y 
    88 
    99# STOMATE_IMPOSE_CN: impose nitrogen 
    1010# If STOMATE_IMPOSE_CN=y the file leaf_cn.nc must be available 
    1111# If STOMATE_IMPOSE_CN=n the other N-input files are needed, see commented files below 
    12 STOMATE_IMPOSE_CN=y 
     12STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    1313 
    1414# Specify output level for output files 
    … …  
    2727 
    2828[InitialStateFiles] 
    29 [InitialStateFiles] 
    30 List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc, cnleaf_map.nc) 
    31  
    32 # Following files are needed if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    33 # #List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_2000.nc, nfert_pasture.nc) ,\ 
    34 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_2000.nc, nfert_cropland.nc) ,\ 
    35 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_2000.nc, nmanure_pasture.nc) ,\ 
    36 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_2000.nc, nmanure_cropland.nc) ,\ 
    37 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_2000.nc, ndep_nhx.nc), \ 
    38 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_2000.nc, ndep_noy.nc), \ 
    39 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc, bnf.nc) 
    40 # 
     29List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc       , cnleaf_map.nc         ) 
    4130 
    4231[BoundaryFiles] 
    43 List=   () 
    44 ListNonDel= () 
     32List=  () 
     33 
     34ListNonDel=     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_1900.nc    , nfert_pasture.nc      ),\ 
     35                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_1900.nc   , nfert_cropland.nc     ),\ 
     36                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_1900.nc    , nmanure_pasture.nc    ),\ 
     37                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_1900.nc   , nmanure_cropland.nc   ),\ 
     38                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_1900.nc           , ndep_nhx.nc           ),\ 
     39                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_1900.nc           , ndep_noy.nc           ),\ 
     40                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc                                                   , bnf.nc                ) 
    4541 
    4642[SmoothFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_CoupOceAtm_TEST/COMP/inca.card

    r6794 r6795  
    1919#be careful name of sflx file change with the choice of emi_interp_time ( no file / sflx_p2p.nc )  
    2020emi_interp_time=1 
     21#choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
     22multi_sources_nat=y 
    2123 
    22 #coupled model with Orchidee and Pisces 
    23 #if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
     24#  LAND -> ATM cycle  
     25#for coupling with Orchidee you need to modify inca.def to specify flux between the two composantes 
    2426CoupOrchInca=y 
     27 
     28# OCEAN -> ATM cycle  
    2529CoupOceAtm=y 
    2630#choice of species transfer from ocean to atmosphere (via lmdz)  
    2731transm_dms_oa=y 
    2832transm_n2o_oa=y 
    29  
    30 #choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
    31 multi_sources_nat=y 
    32  
    3333 
    3434# Specify output frequency for output files  
    … …  
    5656         
    5757[BoundaryFiles] 
    58 List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
    59      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
    60      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc,   sflx_NAT.nc     )\ 
    61      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_1850_phy.nc           ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
    62      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SAD/${RESOL_CHM}/sad_cmip6_1850.nc                     ,   sad.nc               ) 
     58List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc      ,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     59     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc      ,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     60     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc   ,   sflx_NAT.nc         ),\ 
     61     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_1850_phy.nc                                   ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
     62     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SAD/${RESOL_CHM}/sad_cmip6_1850.nc                                           ,   sad.nc              ) 
    6363 
    6464     
    65 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                            ,   npp.nc          )\ 
    66             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc  ,   sflx_GHG.nc     )\ 
    67             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc ,   sflx_MISC.nc    )\ 
    68             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc         ,   o3lin.nc        )\ 
    69             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                         ,   lglived.dat     )\ 
    70             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_sc0_lmdz_phy.nc      ,   aircraft_hs.nc  )\ 
    71             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                        ,   landuse.nc      )\ 
    72             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt                         ,   rhvEC.txt       )\ 
    73             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wthEC.txt                         ,   wthEC.txt       )\ 
    74             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/clyEC.txt                         ,   clyEC.txt       )\ 
    75             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wth.dat                           ,   wth.dat         )\ 
    76             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/cly.dat                           ,   cly.dat         )\ 
    77             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhv.dat                           ,   rhv.dat         )\ 
    78             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                ,   phototable.dat  ) 
     65ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                                        ,   npp.nc          ),\ 
     66            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc      ,   sflx_GHG.nc     ),\ 
     67            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc     ,   sflx_MISC.nc    ),\ 
     68            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc                     ,   o3lin.nc        ),\ 
     69            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat     ),\ 
     70            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_sc0_lmdz_phy.nc                  ,   aircraft_hs.nc  ),\ 
     71            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc      ),\ 
     72            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt                                     ,   rhvEC.txt       ),\ 
     73            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wthEC.txt                                     ,   wthEC.txt       ),\ 
     74            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/clyEC.txt                                     ,   clyEC.txt       ),\ 
     75            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wth.dat                                       ,   wth.dat         ),\ 
     76            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/cly.dat                                       ,   cly.dat         ),\ 
     77            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhv.dat                                       ,   rhv.dat         ),\ 
     78            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat  ) 
    7979 
    8080 
    8181[ParametersFiles] 
    82 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def_N2O                                       , inca.def                      ),\ 
    83         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml          , .                     ),\ 
    84         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml        , .                     ),\ 
    85         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml , file_def_inca_restart.xml ), \ 
    86         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER.xml, file_def_inca.xml     ),\ 
    87         (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat                                    , inca.dat              ) 
     82List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def_COV_N2O                           , inca.def                      ),\ 
     83        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml          , .                             ),\ 
     84        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml        , .                             ),\ 
     85        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml , file_def_inca_restart.xml     ),\ 
     86        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER.xml, file_def_inca.xml             ),\ 
     87        (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat                            , inca.dat                      ) 
    8888 
    8989[RestartFiles] 
    … …  
    103103        (inca1d_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_dep.nc        ,  NONE                  ),\ 
    104104        (inca1d_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_chem.nc       ,  Post_1D_inca_chem     ),\ 
    105         (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc       ,  Post_1D_inca_aero    ),\ 
     105        (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc       ,  NONE                  ),\ 
    106106        (inca1d_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_phtrate.nc    ,  NONE                  ),\ 
    107107        (inca1d_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_reacflux.nc   ,  NONE                  ),\ 
    108108        (inca1d_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_washrate.nc   ,  NONE                  ),\ 
    109         (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc    ,  Post_1D_inca_forcage ),\ 
     109        (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc    ,  NONE                  ),\ 
    110110        (inca1d_coupling.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_coupling.nc   ,  Post_1D_inca_coupling ),\ 
    111111        (inca1mo_aero_chem.nc   ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_aero_chem.nc  ,  NONE                  ),\ 
    … …  
    140140TimeSeriesVars2D = () 
    141141ChunckJob2D = NONE 
    142 TimeSeriesVars3D = (vmrno,vmrno2,vmro3,vmrch4,vmrco,,mmrso4cs, mmrso4as, mmrdms, mmrssss, vmrno3, vmrhno3, mmrbcai, mmrdustci) 
     142TimeSeriesVars3D = (vmrno,vmrno2,vmro3,vmrch4,vmrco,mmrso4cs, mmrso4as, mmrdms, mmrssss, vmrno3, vmrhno3, mmrbcai, mmrdustci) 
    143143ChunckJob3D = NONE 
    144144Seasonal=OFF 
    … …  
    168168TimeSeriesVars2D = (hdry,snowfromOrch,emi_isop,emi_mono) 
    169169ChunckJob2D = NONE 
    170 TimeSeriesVars3D = (flx_iso,flx_mono,flx_ORVOC,flx_acetal) 
     170TimeSeriesVars3D = (land_flx_DMS, land_flx_n2o, land_flx_H2S, ocean_flx_n2o, ocean_flx_DMS) 
    171171ChunckJob3D = NONE 
    172172Seasonal=OFF 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_CoupOceAtm_TEST/COMP/orchidee.card

    r6697 r6795  
    3030output_freq_sechiba_history_4dim = 1d 
    3131 
    32  
     32# Specify if you want to calculate chemistry of COV in orchidee  
     33CHEMISTRY_BVOC=y 
    3334[InitialStateFiles] 
    34 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc, . ), \ 
    35         (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc , .), \ 
    36         (${R_IN}/SRF/reftemp.nc, . ), \ 
    37         (${R_IN}/SRF/routing.nc, . ), \ 
    38         (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc, alb_bg.nc ), \ 
    39         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     35List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc                             , .              ), \ 
     36        (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc                   , .              ), \ 
     37        (${R_IN}/SRF/reftemp.nc                                 , .              ), \ 
     38        (${R_IN}/SRF/routing.nc                                 , .              ), \ 
     39        (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc        , alb_bg.nc      ), \ 
     40        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc                      , .              ) 
    4041 
    4142[BoundaryFiles] 
    4243List= () 
    43 ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc, PFTmap.nc),\ 
    44             (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc,           woodharvest.nc) 
     44ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc    , PFTmap.nc     ),\ 
     45            (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc              , woodharvest.nc),\ 
     46            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc                          , .             ),\ 
     47            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc                                 , .             ) 
    4548 
    4649 
    … …  
    4952 
    5053[ParametersFiles] 
    51 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)  ,\ 
    52     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml, . )                      ,\ 
    53     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml, dr2xml_orchidee.xml)                    ,\ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .) ,\ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml, .) ,\ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)  ,\ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     54List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}                  , orchidee.def          ) ,\ 
     55        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml                          , .                     ) ,\ 
     56        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml                   , dr2xml_orchidee.xml   ) ,\ 
     57        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml      , .                     ) ,\ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml , .                     ) ,\ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml       , .                     ) ,\ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml     , .                     ) 
    5861 
    5962[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_CoupOceAtm_TEST/COMP/stomate.card

    r6697 r6795  
    55# NINPUT_UPDATE=1Y: change in nitrogen input maps every year. 
    66# Nitrogen input maps should be set in BoundaryFiles/List for 1Y or in InitialStateFile for 0Y. 
    7 NINPUT_UPDATE=0Y 
     7NINPUT_UPDATE=1Y 
    88 
    99# STOMATE_IMPOSE_CN: impose nitrogen 
    1010# If STOMATE_IMPOSE_CN=y the file leaf_cn.nc must be available 
    1111# If STOMATE_IMPOSE_CN=n the other N-input files are needed, see commented files below 
    12 STOMATE_IMPOSE_CN=y 
     12STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    1313 
    1414# Specify output level for output files 
    … …  
    2727 
    2828[InitialStateFiles] 
    29 [InitialStateFiles] 
    30 List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc, cnleaf_map.nc) 
    31  
    32 # Following files are needed if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    33 # #List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_2000.nc, nfert_pasture.nc) ,\ 
    34 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_2000.nc, nfert_cropland.nc) ,\ 
    35 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_2000.nc, nmanure_pasture.nc) ,\ 
    36 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_2000.nc, nmanure_cropland.nc) ,\ 
    37 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_2000.nc, ndep_nhx.nc), \ 
    38 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_2000.nc, ndep_noy.nc), \ 
    39 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc, bnf.nc) 
    40 # 
     29List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc       , cnleaf_map.nc         ) 
    4130 
    4231[BoundaryFiles] 
    43 List=   () 
    44 ListNonDel= () 
     32List=  () 
     33 
     34ListNonDel=     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_1900.nc    , nfert_pasture.nc      ),\ 
     35                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_1900.nc   , nfert_cropland.nc     ),\ 
     36                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_1900.nc    , nmanure_pasture.nc    ),\ 
     37                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_1900.nc   , nmanure_cropland.nc   ),\ 
     38                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_1900.nc           , ndep_nhx.nc           ),\ 
     39                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_1900.nc           , ndep_noy.nc           ),\ 
     40                (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc                                                   , bnf.nc                ) 
    4541 
    4642[SmoothFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/IPSLESM/NMHC_AER_S/piControl_NAS_CoupOceAtm_TEST/config.card

    r6697 r6795  
    6868[ATM] 
    6969# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    70 Restart= n 
    71 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    72 RestartDate=1849-12-31 
    73 #D- Define restart simulation name for this component 
    74 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    75 #D- Path Server Group Login 
    76 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     70Restart= y 
     71# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     72RestartDate=1990-12-31 
     73#D- Define restart simulation name for this component 
     74RestartJobName=Rescaled-79-washout 
     75#D- Path Server Group Login 
     76RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S 
    7777 
    7878#======================================================================== 
    … …  
    118118[SRF] 
    119119# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    120 Restart= n 
    121 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    122 RestartDate=1849-12-31 
    123 #D- Define restart simulation name for this component 
    124 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    125 #D- Path Server Group Login 
    126 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     120Restart= y 
     121# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     122RestartDate=2006-12-31 
     123#D- Define restart simulation name for this component 
     124RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     125#D- Path Server Group Login 
     126RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    127127 
    128128#======================================================================== 
    … …  
    130130[SBG] 
    131131# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    132 Restart= n 
    133 # Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    134 RestartDate=1849-12-31 
    135 #D- Define restart simulation name for this component 
    136 RestartJobName=CM61-pre-pi-01 
    137 #D- Path Server Group Login 
    138 RestartPath=${R_IN}/RESTART/IPSLCM6/PROD/piControl-spinup 
     132Restart= y 
     133# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     134RestartDate=2006-12-31 
     135#D- Define restart simulation name for this component 
     136RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     137#D- Path Server Group Login 
     138RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    139139 
    140140#======================================================================== 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/GES/COMP/inca.card

    r6683 r6795  
    1515#be careful name of sflx file change with the choice of emi_interp_time ( no file / sflx_p2p.nc)  
    1616emi_interp_time=1 
     17#choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
     18multi_sources_nat=y 
    1719 
    18 #coupled model with Orchidee and Pisces 
    19 #if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
     20#  LAND -> ATM cycle  
     21#for coupling with Orchidee you need to modify inca.def to specify flux between the two composantes 
    2022CoupOrchInca=n 
    21 #CoupOceAtm 
     23 
     24# OCEAN -> ATM cycle  
    2225CoupOceAtm=n 
     26#choice of species transfer from ocean to atmosphere (via lmdz)  
    2327transm_dms_oa=n 
    24  
     28transm_n2o_oa=n 
    2529 
    2630 
    … …  
    3135# if you choose another frequency, the file will be store in CHM/Output/DA by default 
    3236output_frequency_ges=1d 
     37output_frequency_coupling=NONE 
    3338 
    3439 
    … …  
    3843         
    3944[BoundaryFiles] 
    40 List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
    41      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
    42      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc           ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
    43      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_${year}.nc,   oxydants.nc         ) 
     45List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc      ,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     46     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc      ,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     47     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc   ,   sflx_NAT.nc         ),\ 
     48     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc                                ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
     49     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/OXYDANTS/${RESOL_CHM}_yearly_interpolated/oxydants_${year}.nc                ,   oxydants.nc         ) 
    4450 
    4551 
    46 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                      ,   npp.nc          )\ 
    47             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_GHG.nc  ,   sflx_GHG.nc     )\ 
    48             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_MISC.nc ,   sflx_MISC.nc    )\ 
    49             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS2/${RESOL_CHM}/sflx_lmdz_NAT.nc  ,   sflx_NAT.nc     )\ 
    50             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                         ,   lglived.dat     )\ 
    51             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                        ,   landuse.nc      )\ 
    52             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                         ,   andres.nc       )\ 
    53             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                         ,   casa_m.nc       )\ 
    54             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                           ,   taka.nc         )\ 
    55             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                         ,   casa_h.nc       )\ 
    56             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                ,   phototable.dat  ) 
     52ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA144142-L39/npp.nc                                          ,   npp.nc              ),\ 
     53            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc      ,   sflx_GHG.nc         ),\ 
     54            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc     ,   sflx_MISC.nc        ),\ 
     55            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat         ),\ 
     56            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc          ),\ 
     57            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/andres.nc                                     ,   andres.nc           ),\ 
     58            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_m.nc                                     ,   casa_m.nc           ),\ 
     59            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/taka.nc                                       ,   taka.nc             ),\ 
     60            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/casa_h.nc                                     ,   casa_h.nc           ),\ 
     61            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat      ) 
    5762 
    5863 
    … …  
    6065[ParametersFiles] 
    6166List= (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def, .),\ 
    62         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml, .)   ,\ 
    63         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml, .) ,\ 
    64         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml, file_def_inca_restart.xml ), \ 
    65         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_GES.xml, file_def_inca.xml ), \ 
    66         (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat, inca.dat) 
     67      (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml, .)   ,\ 
     68      (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml, .) ,\ 
     69      (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml, file_def_inca_restart.xml ), \ 
     70      (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_GES.xml, file_def_inca.xml ), \ 
     71      (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat, inca.dat) 
    6772 
    6873         
    … …  
    7883 
    7984[OutputFiles] 
    80 List=   (inca1d_ges.nc,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc, Post_1D_inca_ges  ),\ 
    81         (inca1mo_ges.nc,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc, NONE ),\ 
    82         (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE) 
    83  
    84  
     85List=   (inca1d_ges.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_ges.nc        , Post_1D_inca_ges      ),\ 
     86        (inca1d_coupling.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_coupling.nc   , Post_1D_inca_coupling ),\ 
     87        (inca1mo_ges.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_ges.nc        , Post_1M_inca_ges      ),\ 
     88        (inca1mo_coupling.nc    ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_coupling.nc   , Post_1M_inca_coupling ),\ 
     89        (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE                  ) 
    8590 
    8691 
    … …  
    9095TimeSeriesVars2D = () 
    9196ChunckJob2D = NONE 
    92 TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf) 
     97TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,jn2o,jmcf,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
    9398ChunckJob3D = NONE 
    9499Seasonal=OFF 
     100 
     101 
     102 
     103[Post_1M_inca_ges] 
     104Patches= () 
     105GatherWithInternal = (lon, lat, presnivs, , time_centered, time_centered_bounds, time_counter, area) 
     106TimeSeriesVars2D = () 
     107ChunckJob2D = NONE 
     108TimeSeriesVars3D = (vmrch4,vmrco,vmrco2oc,vmrco2bim,vmrco2bih,vmrn2o,phtrate_jN2O, emin2o) 
     109ChunckJob3D = NONE 
     110Seasonal=OFF 
     111 
     112 
     113[Post_1D_inca_coupling] 
     114Patches= () 
     115GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     116TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     117ChunckJob2D = NONE 
     118TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o) 
     119ChunckJob3D = NONE 
     120Seasonal=OFF 
     121 
     122 
     123[Post_1M_inca_coupling] 
     124Patches= () 
     125GatherWithInternal = (lon, lat, veget, time_counter) 
     126TimeSeriesVars2D = (snowfromOrch,emi_fromOrch_n2o,emi_notfromOrch_n2o) 
     127ChunckJob2D = NONE 
     128TimeSeriesVars3D = (land_flx_n2o) 
     129ChunckJob3D = NONE 
     130Seasonal=OFF 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/GES/COMP/orchidee.card

    r6550 r6795  
    3131 
    3232 
     33# Specify if you want to calculate chemistry of COV in orchidee  
     34CHEMISTRY_BVOC=n 
     35 
    3336[InitialStateFiles] 
    34 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc, . ), \ 
    35     (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc , .), \ 
    36         (${R_IN}/SRF/reftemp.nc, . ), \ 
    37         (${R_IN}/SRF/routing.nc, . ), \ 
    38         (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc, alb_bg.nc ), \ 
    39         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     37List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc                             , .              ), \ 
     38        (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc                   , .              ), \ 
     39        (${R_IN}/SRF/reftemp.nc                                 , .              ), \ 
     40        (${R_IN}/SRF/routing.nc                                 , .              ), \ 
     41        (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc        , alb_bg.nc      ), \ 
     42        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc                      , .              ) 
    4043 
    4144[BoundaryFiles] 
    42 List= () 
    43 ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc, PFTmap.nc),\ 
    44             (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc,           woodharvest.nc) 
     45List= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_${year}.nc       , PFTmap.nc     ),\ 
     46      (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_${year}.nc                 , woodharvest.nc) 
     47             
     48ListNonDel= (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc                          , .             ),\ 
     49            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc                                 , .             ) 
    4550 
    4651 
    … …  
    4954 
    5055[ParametersFiles] 
    51 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)  ,\ 
    52     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml, . )                      ,\ 
    53     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml, dr2xml_orchidee.xml)                    ,\ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .) ,\ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml, .) ,\ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)  ,\ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     56List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}                  , orchidee.def          ) ,\ 
     57        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml                          , .                     ) ,\ 
     58        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml                   , dr2xml_orchidee.xml   ) ,\ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml      , .                     ) ,\ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml , .                     ) ,\ 
     61        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml       , .                     ) ,\ 
     62        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml     , .                     ) 
    5863 
    5964[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/GES/COMP/stomate.card

    r6550 r6795  
    55# NINPUT_UPDATE=1Y: change in nitrogen input maps every year. 
    66# Nitrogen input maps should be set in BoundaryFiles/List for 1Y or in InitialStateFile for 0Y. 
    7 NINPUT_UPDATE=0Y 
     7NINPUT_UPDATE=1Y 
    88 
    99# STOMATE_IMPOSE_CN: impose nitrogen 
    1010# If STOMATE_IMPOSE_CN=y the file leaf_cn.nc must be available 
    1111# If STOMATE_IMPOSE_CN=n the other N-input files are needed, see commented files below 
    12 STOMATE_IMPOSE_CN=y 
     12STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    1313 
    1414# Specify output level for output files 
    … …  
    2525output_freq_stomate_ipcc_history = 1mo 
    2626 
    27  
    28 [InitialStateFiles] 
    2927[InitialStateFiles] 
    3028List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc, cnleaf_map.nc) 
    3129 
    32 # Following files are needed if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    33 # #List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_2000.nc, nfert_pasture.nc) ,\ 
    34 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_2000.nc, nfert_cropland.nc) ,\ 
    35 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_2000.nc, nmanure_pasture.nc) ,\ 
    36 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_2000.nc, nmanure_cropland.nc) ,\ 
    37 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_2000.nc, ndep_nhx.nc), \ 
    38 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_2000.nc, ndep_noy.nc), \ 
    39 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc, bnf.nc) 
    40 # 
     30[BoundaryFiles] 
     31List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_${year}.nc , nfert_pasture.nc      ),\ 
     32        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_${year}.nc, nfert_cropland.nc     ),\ 
     33        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_${year}.nc , nmanure_pasture.nc    ),\ 
     34        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_${year}.nc, nmanure_cropland.nc   ),\ 
     35        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_${year}.nc        , ndep_nhx.nc           ),\ 
     36        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_${year}.nc        , ndep_noy.nc           ),\ 
    4137 
    42 [BoundaryFiles] 
    43 List=   () 
    44 ListNonDel= () 
     38 
     39ListNonDel= (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc       , bnf.nc) 
    4540 
    4641[SmoothFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/GES/config.card

    r6568 r6795  
    9696SeasonalFrequencyOffset=0 
    9797 
     98 
    9899#======================================================================== 
    99100#D-- ATM - 
    100101[ATM] 
    101 # If config_Restarts_OverRule == 'n' all params are read 
    102 Restart= n 
    103 # Last day of the experience used as restart 
    104 RestartDate=2000-01-01 
    105 # Define restart simulation name 
    106 RestartJobName=JobName 
    107 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZORINCA/NMHC_AER 
    108  
     102# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
     103Restart= y 
     104# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     105RestartDate=1990-12-31 
     106#D- Define restart simulation name for this component 
     107RestartJobName=Rescaled-79-washout 
     108#D- Path Server Group Login 
     109RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S 
    109110 
    110111#======================================================================== 
    … …  
    112113[SRF] 
    113114# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    114 Restart=n 
    115 ##-- Last day of the experience used as restart 
    116 RestartDate=1999-12-30 
    117 # Define restart simulation name 
    118 RestartJobName=JobName 
    119 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZORINCA/NMHC_AER 
     115Restart= y 
     116# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     117RestartDate=2006-12-31 
     118#D- Define restart simulation name for this component 
     119RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     120#D- Path Server Group Login 
     121RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    120122 
    121123#======================================================================== 
    … …  
    123125[SBG] 
    124126# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    125 Restart=n 
    126 #-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    127 RestartDate=2000-01-31 
    128 # Define restart simulation name for this component 
    129 RestartJobName=EXP00 
    130 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZOR/DEVT/amip 
     127Restart= y 
     128# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     129RestartDate=2006-12-31 
     130#D- Define restart simulation name for this component 
     131RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     132#D- Path Server Group Login 
     133RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    131134 
    132135#======================================================================== 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/COMP/inca.card

    r6794 r6795  
    55[UserChoices] 
    66#choose if input file will be regrid by xios, or read without regrid with netcdf 
    7 xios_read=y 
     7xios_read=n 
    88# Set LMDZ_10m_winds to choose if the simulation will use online 10m wind (=y) or offline (=n) 
    99LMDZ_10m_winds=y 
    … …  
    1212# heat fluxes computed with feedback corresponding to 0 --> no aerosol effects, 1--> aerosol effects selected by ok_ade, ok_aie 
    1313feedb=0 
    14 #coupled model with ORCH 
    15 #if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
    16 CoupOrchInca=n 
    1714#active or not chemistry flux in output  
    1815calcul_flux=n 
    … …  
    2219#be careful name of sflx file change with the choice of emi_interp_time ( no file / sflx_p2p.nc )  
    2320emi_interp_time=1 
     21#choose which type of sflx_nat.nc file we are using  
     22multi_sources_nat=y 
     23 
     24#  LAND -> ATM cycle  
     25#for coupling with Orchidee you need to modify inca.def to specify flux between the two composantes 
     26CoupOrchInca=y 
     27 
     28# OCEAN -> ATM cycle  
     29CoupOceAtm=n 
     30#choice of species transfer from ocean to atmosphere (via lmdz)  
     31transm_dms_oa=n 
     32transm_n2o_oa=n 
    2433 
    2534 
    … …  
    3847output_frequency_dep=1d 
    3948output_frequency_washrate=NONE 
    40 output_frequency_coupling=NONE 
     49output_frequency_coupling=1d 
    4150output_frequency_reacflux=NONE 
    4251output_frequency_phtrate=NONE 
    … …  
    4857         
    4958[BoundaryFiles] 
    50 List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_${year}_phy.nc           ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
    51      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS3/144142-L79/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_dyn.nc       ,   sflx_ANT_LR.nc ),\ 
    52      (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS3/144142-L79/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_dyn.nc       ,   sflx_BBG_LR.nc ) 
     59List=(${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/ANT/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc      ,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     60     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/BBG/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc      ,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     61     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/Historical/NAT_v2/sflx_lmdz_NAT_${year}_phy.nc   ,   sflx_NAT.nc         ),\ 
     62     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/AIRCRAFT/${RESOL_CHM}/aircraft_1850_phy.nc                                   ,   aircraft_mth.nc     ),\ 
     63     (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SAD/${RESOL_CHM}/sad_cmip6_1850.nc                                           ,   sad.nc              ) 
    5364 
    5465     
    55 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/FILES_LONxLAT/landuse_lmdz_dyn.nc                              ,   landuse.nc  ),\ 
    56             (${R_IN}/CHM/FILES_LONxLAT/npp_dyn.nc                                       ,   npp.nc      ),\ 
    57             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc                     ,   o3lin.nc    ),\ 
    58             (${R_IN}/CHM/FILES_LONxLAT/sad_dyn.nc                                       ,   sad.nc      ),\ 
    59             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat ),\ 
    60             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS3/144142-L79/sflx_lmdz_GHG_dyn.nc            ,   sflx_GHG_LR.nc ),\ 
    61             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS3/144142-L79/sflx_lmdz_NAT_dyn.nc            ,   sflx_NAT_LR.nc ),\ 
    62             (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS3/144142-L79/sflx_lmdz_MISC_dyn.nc           ,   sflx_MISC_LR.nc),\ 
    63             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_sc0_lmdz_phy.nc                  ,   aircraft_hs.nc ),\ 
    64             (${R_IN}/CHM/FILES_LONxLAT/dustincaEC.nc                                    ,   dustEC.nc      ),\ 
    65             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat ) 
     66ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                                        ,   npp.nc          ),\ 
     67            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_GHG_phy.nc      ,   sflx_GHG.nc     ),\ 
     68            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/SFLX/VERS4/${RESOL_CHM}/phy/sflx_lmdz_MISC_phy.nc     ,   sflx_MISC.nc    ),\ 
     69            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc                     ,   o3lin.nc        ),\ 
     70            (${R_IN}/CHM/IPCC_AR6/lglived_CMIP6.dat                                     ,   lglived.dat     ),\ 
     71            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_sc0_lmdz_phy.nc                  ,   aircraft_hs.nc  ),\ 
     72            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc      ),\ 
     73            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt                                     ,   rhvEC.txt       ),\ 
     74            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wthEC.txt                                     ,   wthEC.txt       ),\ 
     75            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/clyEC.txt                                     ,   clyEC.txt       ),\ 
     76            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wth.dat                                       ,   wth.dat         ),\ 
     77            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/cly.dat                                       ,   cly.dat         ),\ 
     78            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhv.dat                                       ,   rhv.dat         ),\ 
     79            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                            ,   phototable.dat  ) 
    6680 
    6781 
    6882[ParametersFiles] 
    69 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def                                   , .                     ),\ 
    70         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml          , .                     ),\ 
    71         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_input_inca.xml, .)   ,\ 
    72         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_sflx_inca.xml, .)   ,\ 
    73         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_dust_inca.xml, .)   ,\ 
    74         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_sad_inca.xml      , .),\ 
    75         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_start_NAS_inca.xml, context_start_inca.xml)   ,\ 
    76         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml        , .                     ),\ 
    77         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml , file_def_inca_restart.xml ), \ 
    78         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER.xml, file_def_inca.xml     ),\ 
    79         (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat                                    , inca.dat              ) 
     83List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def_COV                               , inca.def                      ),\ 
     84        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml          , .                             ),\ 
     85        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml        , .                             ),\ 
     86        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml , file_def_inca_restart.xml     ),\ 
     87        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER.xml, file_def_inca.xml             ),\ 
     88        (${MODIPSL}/bin/inca_${ConfChem}.dat                            , inca.dat                      ) 
    8089 
    8190[RestartFiles] 
    … …  
    113122        (inca1mo_coupling.nc    ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_coupling.nc   ,  NONE                  ),\ 
    114123        (aerosols_from_inca.nc  ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_aerosols_from_inca.nc,  NONE                ),\ 
    115         (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc   ,  NONE                  )  
     124        (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc   ,  NONE                  ),\ 
     125        (mmr_ce0l_ico.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_mmr_ce0l_ico.nc    , NONE)  
    116126 
    117127 
    … …  
    159169TimeSeriesVars2D = (hdry,snowfromOrch,emi_isop,emi_mono) 
    160170ChunckJob2D = NONE 
    161 TimeSeriesVars3D = (flx_iso,flx_mono,flx_ORVOC,flx_acetal) 
     171TimeSeriesVars3D = (land_flx_iso,land_flx_mono,land_flx_ORVOC,land_flx_acetal, land_flx_n2o, land_flx_DMS, land_flx_H2S) 
    162172ChunckJob3D = NONE 
    163173Seasonal=OFF 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/COMP/lmdz.card

    r6750 r6795  
    6565 
    6666[InitialStateFiles] 
    67 List=   (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/start_NAS_H2O.nc  , start.nc      ) \ 
     67List=   (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/start_NAS_H2O.nc          , start.nc      ),\ 
    6868        (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/startphy_o2a_noTer.nc     , startphy.nc   ) 
    6969 
    7070 
    7171[BoundaryFiles] 
    72 List=       (${R_IN}/ATM/LIMIT/AMIP.v20180427/interpol/${RESOL_ATM_XY}_eORCA1.2_gregorian/limit_${year}.nc, limit.nc),\ 
    73             (${R_IN}/ATM/OZONE/UReading/historical.v20160711.v2/interpol/${RESOL_ATM_XY}/climoz_LMDZ_${year}.nc, climoz_LMDZ.nc),\ 
    74             (${R_IN}/ATM/SOLAR/CMIP6/v3.1corr/Historical/solarforcing_v3.1_daily_6bands_${year}.nc,        solarforcing.nc),\ 
    75             (${R_IN}/ATM/STRATAERO/CMIP6/v3/${RESOL_ATM_XY}/L${RESOL_ATM_Z}/taulwstrat.2D.${year}.nc, taulwstrat.2D.nc),\ 
    76             (${R_IN}/ATM/STRATAERO/CMIP6/v3/${RESOL_ATM_XY}/L${RESOL_ATM_Z}/tauswstrat.2D.${year}.nc, tauswstrat.2D.nc) 
     72List=       (${R_IN}/ATM/LIMIT/AMIP.v20180427/interpol/${RESOL_ATM_XY}_eORCA1.2_gregorian/limit_${year}.nc      , limit.nc              ),\ 
     73            (${R_IN}/ATM/OZONE/UReading/historical.v20160711.v2/interpol/${RESOL_ATM_XY}/climoz_LMDZ_${year}.nc , climoz_LMDZ.nc        ),\ 
     74            (${R_IN}/ATM/SOLAR/CMIP6/v3.1corr/Historical/solarforcing_v3.1_daily_6bands_${year}.nc              , solarforcing.nc       ),\ 
     75            (${R_IN}/ATM/STRATAERO/CMIP6/v3/${RESOL_ATM_XY}/L${RESOL_ATM_Z}/taulwstrat.2D.${year}.nc            , taulwstrat.2D.nc      ),\ 
     76            (${R_IN}/ATM/STRATAERO/CMIP6/v3/${RESOL_ATM_XY}/L${RESOL_ATM_Z}/tauswstrat.2D.${year}.nc            , tauswstrat.2D.nc      ) 
    7777 
    7878  
    79 ListNonDel= (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CO2_CMIP6_0000_2014.txt, CO2.txt),\ 
    80             (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CH4_CMIP6_0000_2014.txt, CH4.txt),\ 
    81             (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/N2O_CMIP6_0000_2014.txt, N2O.txt),\ 
    82             (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CFC11eq_CMIP6_0000_2014.txt, CFC11.txt),\ 
    83             (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CFC12eq_CMIP6_0000_2014.txt, CFC12.txt) 
     79ListNonDel= (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CO2_CMIP6_0000_2014.txt           , CO2.txt       ),\ 
     80            (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CH4_CMIP6_0000_2014.txt           , CH4.txt       ),\ 
     81            (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/N2O_CMIP6_0000_2014.txt           , N2O.txt       ),\ 
     82            (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CFC11eq_CMIP6_0000_2014.txt       , CFC11.txt     ),\ 
     83            (${R_IN}/ATM/GHG/CMIP6/historical/CFC12eq_CMIP6_0000_2014.txt       , CFC12.txt     ) 
    8484 
    8585[ParametersFiles] 
    86 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/physiq.def_${LMDZ_Physics}, physiq.def),       \ 
    87         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/gcm.def_${RESOL_ATM_XY}_${LMDZ_Physics}, gcm.def),\ 
    88         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/vert.def_L${RESOL_ATM_Z},   vert.def),         \ 
    89         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/cosp_input_nl.txt, .),            \ 
    90         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/cosp_output_nl.txt, .),           \ 
    91         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/config.def_${ConfType},  config.def),          \ 
    92         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/guide.def, .),                                 \ 
    93         (${SUBMIT_DIR}/PARAM/run.def, .),                                   \ 
    94         (${MODIPSL}/bin/tracer_${ConfChem}.def, tracer.def),                \ 
    95         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/context_lmdz.xml, . ),            \ 
    96         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/field_def_lmdz.xml, . ),          \ 
    97         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/field_def_cosp1.xml, . ),         \ 
    98         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmth_lmdz.xml, . ),   \ 
    99         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmthCOSP_lmdz.xml, .),\ 
    100         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmthNMC_lmdz.xml, . ),\ 
    101         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histday_lmdz.xml, . ),   \ 
    102         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdayCOSP_lmdz.xml, .),\ 
    103         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdayNMC_lmdz.xml, . ),\ 
    104         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhf_lmdz.xml, . ),    \ 
    105         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhfCOSP_lmdz.xml, .), \ 
    106         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhfNMC_lmdz.xml, . ), \ 
    107         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histstn_lmdz.xml, . ),   \ 
    108         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histstrataer_lmdz.xml, . ),\ 
    109         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdaystrataer_lmdz.xml, . ),\ 
    110         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histins_lmdz.xml, . ),   \ 
    111         (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histLES_lmdz.xml, . ) 
     86List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/physiq.def_${LMDZ_Physics}                         , physiq.def    ),\ 
     87        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/gcm.def_${RESOL_ATM_XY}_${LMDZ_Physics}            , gcm.def       ),\ 
     88        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/vert.def_L${RESOL_ATM_Z}                           ,   vert.def    ),\ 
     89        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/cosp_input_nl.txt                     , .             ),\ 
     90        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/cosp_output_nl.txt                    , .             ),\ 
     91        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/config.def_${ConfType}                             ,  config.def   ),\ 
     92        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/guide.def                                          , .             ),\ 
     93        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/run.def                                            , .             ),\ 
     94        (${MODIPSL}/bin/tracer_${ConfChem}.def                                  , tracer.def    ),\ 
     95        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/context_lmdz.xml                      , .             ),\ 
     96        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/field_def_lmdz.xml                    , .             ),\ 
     97        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/field_def_cosp1.xml                   , .             ),\ 
     98        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmth_lmdz.xml             , .             ),\ 
     99        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmthCOSP_lmdz.xml         , .             ),\ 
     100        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histmthNMC_lmdz.xml          , .             ),\ 
     101        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histday_lmdz.xml             , .             ),\ 
     102        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdayCOSP_lmdz.xml         , .             ),\ 
     103        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdayNMC_lmdz.xml          , .             ),\ 
     104        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhf_lmdz.xml              , .             ),\ 
     105        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhfCOSP_lmdz.xml          , .             ),\ 
     106        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histhfNMC_lmdz.xml           , .             ),\ 
     107        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histstn_lmdz.xml             , .             ),\ 
     108        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histstrataer_lmdz.xml        , .             ),\ 
     109        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histdaystrataer_lmdz.xml     , .             ),\ 
     110        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histins_lmdz.xml             , .             ),\ 
     111        (${MODIPSL}/modeles/LMDZ/DefLists/file_def_histLES_lmdz.xml             , .             ) 
    112112 
    113113[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/COMP/orchidee.card

    r6750 r6795  
    3030output_freq_sechiba_history_4dim = 1d 
    3131 
     32# Specify if you want to calculate chemistry of COV in orchidee  
     33CHEMISTRY_BVOC=y 
    3234 
    3335[InitialStateFiles] 
    34 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc, . ), \ 
    35         (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc , .), \ 
    36         (${R_IN}/SRF/reftemp.nc, . ), \ 
    37         (${R_IN}/SRF/routing.nc, . ), \ 
    38         (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc, alb_bg.nc ), \ 
    39         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     36List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc                             , .              ), \ 
     37        (${R_IN}/SRF/SOIL/soil_bulk_and_ph.nc                   , .              ), \ 
     38        (${R_IN}/SRF/reftemp.nc                                 , .              ), \ 
     39        (${R_IN}/SRF/routing.nc                                 , .              ), \ 
     40        (${R_IN}/SRF/albedo/alb_bg_modisopt_2D_ESA_v2.nc        , alb_bg.nc      ), \ 
     41        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc                      , .              ) 
    4042 
    4143[BoundaryFiles] 
    42 List= () 
    43 ListNonDel= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_1850.nc, PFTmap.nc),\ 
    44             (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_1850.nc,           woodharvest.nc) 
    45  
     44List= (${R_IN}/SRF/PFTMAPS/CMIP6/ESA-LUH2v2/historical/15PFT.v1/PFTmap_${year}.nc       , PFTmap.nc     ),\ 
     45      (${R_IN}/SRF/WOODHARVEST/LUH2v2/historical/woodharvest_${year}.nc                 , woodharvest.nc) 
     46             
     47ListNonDel= (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc                          , .             ),\ 
     48            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc                                 , .             ) 
    4649 
    4750[SmoothFiles] 
    … …  
    4952 
    5053[ParametersFiles] 
    51 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)  ,\ 
    52     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml, . )                      ,\ 
    53     (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml, dr2xml_orchidee.xml)                    ,\ 
    54         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .) ,\ 
    55         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml, .) ,\ 
    56         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)  ,\ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     54List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}                  , orchidee.def          ) ,\ 
     55        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/ping_orchidee.xml                          , .                     ) ,\ 
     56        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/dr2xml_IPSL_orchidee.xml                   , dr2xml_orchidee.xml   ) ,\ 
     57        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml      , .                     ) ,\ 
     58        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_input_orchidee.xml , .                     ) ,\ 
     59        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml       , .                     ) ,\ 
     60        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml     , .                     ) 
    5861 
    5962[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/COMP/stomate.card

    r6750 r6795  
    55# NINPUT_UPDATE=1Y: change in nitrogen input maps every year. 
    66# Nitrogen input maps should be set in BoundaryFiles/List for 1Y or in InitialStateFile for 0Y. 
    7 NINPUT_UPDATE=0Y 
     7NINPUT_UPDATE=1Y 
    88 
    99# STOMATE_IMPOSE_CN: impose nitrogen 
    1010# If STOMATE_IMPOSE_CN=y the file leaf_cn.nc must be available 
    1111# If STOMATE_IMPOSE_CN=n the other N-input files are needed, see commented files below 
    12 STOMATE_IMPOSE_CN=y 
     12STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    1313 
    1414# Specify output level for output files 
    … …  
    2727 
    2828[InitialStateFiles] 
    29 [InitialStateFiles] 
    30 List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc, cnleaf_map.nc) 
    31  
    32 # Following files are needed if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    33 # #List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_2000.nc, nfert_pasture.nc) ,\ 
    34 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_2000.nc, nfert_cropland.nc) ,\ 
    35 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_2000.nc, nmanure_pasture.nc) ,\ 
    36 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_2000.nc, nmanure_cropland.nc) ,\ 
    37 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_2000.nc, ndep_nhx.nc), \ 
    38 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_2000.nc, ndep_noy.nc), \ 
    39 # #     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc, bnf.nc) 
    40 # 
     29List=    (${R_IN}/SRF/NITROGEN/CN_LEAF/cn_leaf_1850_v0.nc       , cnleaf_map.nc         ) 
    4130 
    4231[BoundaryFiles] 
    43 List=   () 
    44 ListNonDel= () 
     32List=   (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_pasture_${year}.nc         , nfert_pasture.nc      ),\ 
     33        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/synthetic/historical/Nfer_cropland_${year}.nc        , nfert_cropland.nc     ),\ 
     34        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_pasture_${year}.nc         , nmanure_pasture.nc    ),\ 
     35        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_FERTILISATION/NMIP/manure/historical/Nmanure_cropland_${year}.nc        , nmanure_cropland.nc   ),\ 
     36        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_nhx_${year}.nc                , ndep_nhx.nc           ),\ 
     37        (${R_IN}/SRF/NITROGEN/N_DEPOSITION/CCMI_ndep/historical/CCMI_ndep_noy_${year}.nc                , ndep_noy.nc           ) 
     38 
     39ListNonDel=     (${R_IN}/SRF/NITROGEN/BNF/bnf_1850.nc                                                   , bnf.nc                ) 
    4540 
    4641[SmoothFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER_S/config.card

    r6750 r6795  
    11#- $Id: config.card 69 2007-06-21 14:08:22Z acosce $ 
    22#======================================================================== 
    3 #D-- Carte pour run AR5WERF --  
    4 #D-- Les fichiers sflx - aircraft - start - startphy créés par S. Szopa 
     3#D-- 
     4#D-- configuration sans ocean et chimie atm NMHC_AER_S  pour IPSLCM6.3  
    55#D-- 
    66#======================================================================== 
    … …  
    101101#D-- ATM - 
    102102[ATM] 
    103 # If config_Restarts_OverRule == 'n' all params are read 
    104 Restart= n 
    105 # Last day of the experience used as restart 
    106 RestartDate=2000-01-01 
    107 # Define restart simulation name 
    108 RestartJobName=JobName 
    109 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZORINCA/NMHC_AER 
     103# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
     104Restart= y 
     105# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     106RestartDate=1990-12-31 
     107#D- Define restart simulation name for this component 
     108RestartJobName=Rescaled-79-washout 
     109#D- Path Server Group Login 
     110RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S 
    110111 
    111112#======================================================================== 
    112113#D-- SRF - 
    113114[SRF] 
    114 # If config_Restarts_OverRule == 'n' all params are read 
    115 Restart=n 
    116 ##-- Last day of the experience used as restart 
    117 RestartDate=1999-12-30 
    118 # Define restart simulation name 
    119 RestartJobName=JobName 
    120 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZORINCA/NMHC_AER 
     115# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
     116Restart= y 
     117# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     118RestartDate=2006-12-31 
     119#D- Define restart simulation name for this component 
     120RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     121#D- Path Server Group Login 
     122RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    121123 
    122124#======================================================================== 
    … …  
    124126[SBG] 
    125127# If config_Restarts_OverRule == 'n' next 4 params are read 
    126 Restart=n 
    127 #-- Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
    128 RestartDate=2000-01-31 
    129 # Define restart simulation name for this component 
    130 RestartJobName=EXP00 
    131 RestartPath=${ARCHIVE}/IGCM_OUT/LMDZOR/DEVT/amip 
     128Restart= y 
     129# Last day of the experience used as restart for this component if Restart=y 
     130RestartDate=2006-12-31 
     131#D- Define restart simulation name for this component 
     132RestartJobName=LOIv6.coupl.orchinca.last-notfromScratch-TRANS 
     133#D- Path Server Group Login 
     134RestartPath=${R_IN}/RESTART/LMDZORINCA/DEVT/NMHC_AER_S/ 
    132135 
    133136#======================================================================== 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM6.3/GENERAL/PARAM/orchidee.def_CWRR

    r6695 r6795  
    271271 
    272272# File and variable name for nitrogen input files 
    273 # Following files are read if STOMATE_IMPOSE_CN=n 
    274273#************************************************************************** 
    275274Nammonium_FILE = ndep_nhx.nc 
    … …  
    279278Nnitrate_VAR = noy 
    280279 
     280WETNHX_FILE= NONE 
     281WETNHX_VAR=wetnhx 
     282 
     283DRYNHX_FILE= NONE 
     284DRYNHX_VAR=drynhx 
     285 
     286WETNOY_FILE= NONE 
     287WETNOY_VAR=wetnoy 
     288 
     289DRYNOY_FILE= NONE 
     290DRYNOY_VAR=drynoy 
     291 
    281292Nfert_FILE = NONE 
    282293Nfert_VAR = nfer 
    … …  
    288299Nfert_cropland_VAR = nfer 
    289300 
     301Nfert_ammo_cropland_FILE = NONE 
     302Nfert_ammo_cropland_VAR = nfer_crop_nh4 
     303Nfert_nitr_cropland_FILE = NONE 
     304Nfert_nitr_cropland_VAR = nfer_crop_no3 
     305 
     306Nfert_cropC3_FILE = NONE 
     307Nfert_cropC3_VAR = fertc3 
     308 
     309Nfert_cropC4_FILE = NONE 
     310Nfert_cropC4_VAR = fertc4 
     311 
    290312Nmanure_cropland_FILE = nmanure_cropland.nc 
    291313Nmanure_cropland_VAR = Nmanure 
    … …  
    294316Nfert_pasture_VAR = Nfer 
    295317 
     318Nfert_ammo_pasture_FILE = NONE 
     319Nfert_ammo_pasture_VAR = nfer_pas_nh4 
     320Nfert_nitr_pasture_FILE = NONE 
     321Nfert_nitr_pasture_VAR = nfer_pas_no3 
     322 
    296323Nmanure_pasture_FILE = nmanure_pasture.nc 
    297324Nmanure_pasture_VAR = Nmanure 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.