wiki:Calculateurs/IreneAmd

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Portage IreneAmd

Validation

IPSLCM6.1.11-LR

Configuration IPSL-CM6-LR
Critère contrôlé Restart historique (H1C=H2C)
Résultats OK
Commentaires OK pour 5D + 5D = 10D, 1M + 1M +... = 1Y + 1Y

La configuration IPSLCM6.1.11-LR a été validée sur 50 ans d'expérience piControl. Un inter-monitoring avec les simulations piControl CMIP6 qui ont tourné sur Curie (TGCC) et Jeanzay (IDRIS) est là : http://webservices2017.ipsl.fr/interMonitoring/tmp/interMonitoring_plot01_EiRj0s_prod/

Performances

IPSLCM6.1.11-LR

A retenir pour IPSLCM6.1.11-LR :

  • 20% plus lent que sur Irene-SKL à nombre de coeurs équivalent
  • le dépeuplement x2 permet d'aller 60% plus vite
  • les noeuds dédiés pour XIOS sont nécessaires lorsqu'il y a beaucoup d'IOs.

Les détails :

  • IOs standards (sans workflow CMIP6) :
    • Irene AMD sur 976 coeurs : 17 SYPD
    • Irene AMD sur 976 coeurs dépeuplés (= 1952 coeurs) : 28 SYPD
    • Rappel : Irene SKL sur 976 coeurs : 21 SYPD
  • IO CMIP6 (sans noeud dediés à XIOS = sur un même noeud il y a des process NEMO et XIOS)
    • Irene AMD sur 976 coeurs : 10 SYPD
    • Irene AMD sur 976 coeurs dépeuplés x 2 (= 1952 coeurs) : 12 SYPD
    • Irene AMD sur 976 coeurs dépeuplés x 4 (= 3904 coeurs) : 13.5 SYPD
  • IO CMIP6 (avec noeud dédies à XIOS = sur un même noeud il n'y a que des process clients ou serveurs)
    • Irene AMD sur 976 coeurs : 15 SYPD
    • Irene AMD sur 976 coeurs dépeuplés x 2 (= 1952 coeurs) : 24 SYPD
    • Rappel : Irene SKL sur 976 coeurs : 19 SYPD

A noter que les fonctionalités de dépeuplement et d'utilisation de noeuds dédiés pour les serveurs XIOS ont été implémentées dans libIGCM (voir [documentation https://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg_doc/wiki/Doc/ComputingCenters/TGCC/IreneAmd#Useofspecificoptionstoincreasecomputingperformances]

Problèmes rencontrés

  • XIOS : des bloquages ont lieu à l'initialisation et à la finalisation. Le problème vient de la libération des communicateurs qui est "en théorie" une communication globale et donc bloquante. La librairie mpi d'irene-amd semble respecter cette règle alors que la librairie mpi d'irene-skl était moins stricte puisqu'il n'y avait pas de blocage. Ces problèmes de blocage arrivent lorsqu'on utilise plusieurs serveurs XIOS (> 6 serveurs). Ces libérations de communicateurs ont été supprimés dans les versions https://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver/changeset/1867/XIOS/branchs/xios-2.5 et https://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver/changeset/1866/XIOS/trunk.
  • Des instabilités sur les performances ont été constatées

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