Entête des jobs et commandes SX

Cette page décrit les entêtes des jobs sur SX (mercure SX9) ainsi que les commandes à lancer pour avoir un exécutable simple ou un couplé.

Un executable séquentiel

• Entête du job : peu importe
• Commande :

  ./create_etat0_limit.e
  

• Résultat : un programme en séquentiel

Un executable parallélisé avec MPI seulement

• Entête du job

  #PBS -v BATCH_NUM_PROC_TOT=4
  #PBS -l cpunum_job=${BATCH_NUM_PROC_TOT} 
  

• Commande

  mpirun -np ${BATCH_NUM_PROC_TOT}  ./gcm.e
  

• Résultat : un programme : gcm.e lancé sur 4 procs.

Un couplé avec Oasis sur 1 proc, NEMO sur 1 proc et LMDZ sur 3 procs, MPI seul

• Entête du job

  #PBS -v BATCH_NUM_PROC_TOT=4
  #PBS -l cpunum_job=${BATCH_NUM_PROC_TOT} 
  

• Commande

   mpirun -f ./run_file
  

  • avec run_file contenant

    -p $NUM_PROC_OASIS -e ./oasis  # 1
    -p $NUM_PROC_ATM -e ./lmdz.x # BATCH_NUM_PROC_TOT-1
    -p $NUM_PROC_OCE -e ./opa.xx # 1
    

• Résultat : 5 tâches lancées : 1 oasis, 3 lmdz et 1 opa