= Entête des jobs et commandes vargas =

Cette page décrit les entêtes des jobs sur vargas ainsi que les commandes à lancer pour avoir un exécutable simple ou un couplé.

[[PageOutline]]

== Un executable séquentiel ==
 * Entête du job
{{{

}}}
 * Commande 
{{{
time ./create_etat0_limit.e
}}}

== Un executable parallélisé avec OpenMP seulement ==
 * Entête du job
{{{
# @ job_type = serial
# @ parallel_threads = 4
}}}
 * Commande 
{{{
time ./gcm.e
}}}
 * Résultat : poe lance 1 tâche et 4 threads avec le programme : gcm.e

== Un executable parallélisé avec MPI seulement ==
 * Entête du job
{{{
# @ job_type = parallel
# @ total_tasks = 32
# @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
# @ resources = ConsumableCpus(1)
}}}
 * Commande 
{{{
time ./gcm.e
}}}
 * Résultat : poe lance 32 tâches, avec toute le même programme : gcm.e
 * On peut tourner sur moitié moins de processeurs en ajoutant cette ligne là dans l'entête. Pas prévu dans libIGCM actuellement :
{{{
# @ task_affinity = cpu
}}}

== Un executable parallélisé avec MPI seulement ayant besoin de plus de mémoire ==
 * On peut demander plus de threads sans les utiliser pour avoir plus de mémoire. Attention cela est facturé.
 * Entête du job
{{{
# @ job_type = parallel
# @ total_tasks = 32
# @ parallel_threads = 2
# @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
##### @ resources = ConsumableCpus(1)
}}}
 

== Un executable parallélisé avec MPI et OpenMP ==

 * Entête du job
{{{
# @ job_type = parallel
# @ total_tasks = 16
# @ parallel_threads = 4
# @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=48"
}}}
 * Commande 
{{{
time ./gcm.e
}}}
 * Résultat : poe lance 16 tâches, avec toute le même programme : gcm.e sur 4 threads

== Un couplé avec Oasis sur 1 proc, NEMO sur 5 procs et LMDZ sur 26 procs, MPI seul ==
 * Entête du job
{{{
# @ total_tasks = 32
# @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
# @ resources = ConsumableCpus(1)
}}}
 * Commande 
{{{
 time poe -pgmmodel mpmd -cmdfile ./run_file
}}}
  * avec run_file contenant, oasis en premier obligatoirement:
{{{
./oasis
./opa.xx  #==> 5 fois
...
./lmdz.x   #===> 26 fois
...
}}}
 * Résultat : poe lance 32 tâches : 1 oasis, 26 lmdz et 5 opa

== Un couplé avec Oasis sur 1 proc, NEMO sur 5 procs et LMDZ sur 12 procs MPI et 4 tâches OpenMP ==

La méthode reste à valider.

 * Entête du job :
{{{
# NEW : 2 Noeuds
# @ task_geometry={(0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11)(12,13,14,15,16,17)}
}}}
 * Commande :
{{{
time poe -pgmmodel mpmd -cmdfile ./run_file
}}}
   * avec run_file contenant, oasis en premier :
{{{
./oasis
./opa.xx   #==> 5 fois
...
env OMP_NUM_THREADS=4 ./lmdz.x     #====> 12 fois
...
}}}

== Entête du couplé IPSLCM5A sur SX9 ==

{{{
#!/usr/bin/ksh
# ######################
# ##   VARGAS IDRIS   ##
# ######################
# Nom de la requete
# @ job_name = piControl2V
# Type de travail
# @ job_type = parallel
# Fichier de sortie standard
# @ output = Script_Output_piControl2V.000001
# Fichier de sortie erreur (le meme)
# @ error = Script_Output_piControl2V.000001
# Nombre de processus demandes
# @ total_tasks = 32
# @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
# Temps CPU max. par processus MPI hh:mm:ss
# @ wall_clock_limit = 10:00:00
# Memoire max. utilisee par processus
# @ data_limit = 3.2gb
# Memoire stack demandee
# @ stack_limit = 0.3gb,0.3gb
# Pas d OpenMP
# @ resources = ConsumableCpus(1)
# Fin de l entete
# @ queue
}}}