Modipsl

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Extraire modipsl en mode utilisateur

svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn/modipsl/trunk modipsl

Pour vous simplifier la vie et éviter de retaper cette ligne de commande à chaque nouvelle extraction de modipsl, nous vous conseillons de vous créer un alias :

alias svn_ano='svn co http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn/modipsl/trunk modipsl'

La commande d'extraction devient alors juste

svn_ano

Attention sur vargas (IDRIS) il faut explicitement demander l'accès à svn :

module load subversion 

Extraire modipsl en mode administrateur

svn co svn+ssh://yourlogin@forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/igcmg/svn/modipsl/trunk modipsl

D'autres commandes en bas de cette page : igcmg/Documentation

Pour en savoir plus sur SVN

• Le site officiel de subversion : ​http://subversion.tigris.org/
• Présentation de SVN (Jacques Bellier)
• SVN commandes
• SVN quick reference guide
• Mémo sur la gestion des clés ssh
• ​Quelques commandes de base pour SVN (Anne Cozic)
• ​Point sur l'utilisation de SVN (Marie-Alice Foujols) (accès restreint)

Présentation des répertoires de modipsl

Après avoir extrait Modipsl vous avez un répertoire contenant 7 sous-répertoires :

• bin/
• config/
• doc/
• lib/
• modeles/
• tmp/
• util/

Tous ces répertoires sont vides excepté le répertoire doc/ contenant le texte de la licence CECILL (license sous laquelle sont placés les modèles de l'IPSL) et le répertoire util/ qui contient les scripts nécessaires à une installation complète de n'importe quelle configuration disponible des modèles de l'IPSL.

mod.def         >>>>>> Définition pour chaque configuration de leurs composantes et de leurs tags
model           >>>>>> Extraction des modèles validés disponibles
ins_make        >>>>>> Installation et configuration des Makefiles 
ins_job         >>>>>> Installation et configuration des scripts de lancement

Voir le transparent 26 de la présentation.

Liste des configurations disponibles via modipsl

Via modipsl vous pouvez avoir accès à un grand nombre de configurations regroupant différents modèles de l'IPSL. Pour connaître cette liste il vous suffit dans le répertoire util/ de passer la commande suivante :

cd modipsl/util
./model -h 

Pour avoir plus d'informations sur une configuration en particulier (modèles utilisés, versions CVS ou SVN utilisées ...) il faut passer la commande

./model -h nom_de_la_config

Exemple avec LMDZ4OR_v2 :

>> ./model -h LMDZ4OR_v2

>> model : LMDZ4OR_v2
 
LMDZ4OR_v2 configuration with parallel LMDZ4 and ORCHIDEE
working configuration
Official beta release
IOIPSL/src svn tags/v2_1_1
LMDZ4 tag LMDZ4_V3_1
ORCHIDEE tag orchidee_1_9_1
LMDZ4OR_v2 svn trunk
libIGCM HEAD
 
model manager email address : blabla@blabla
 
Component 1 : IOIPSL/tags/v2_1_1/src
Tag       1 : HEAD
System    1 : svn
Server    1 : http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn
Directory 1 : IOIPSL/src
Local Dir 1 : modeles
Component 2 : ORCHIDEE
Tag       2 : orchidee_1_9_1
System    2 : cvs
Server    2 : sechiba@cvs.ipsl.jussieu.fr:/home/ssipsl/CVSREP
Directory 2 : .
Local Dir 2 : modeles
Component 3 : LMDZ4
Tag       3 : LMDZ4_V3_1
System    3 : cvs
Server    3 : lmdzbrowse@cvs.lmd.jussieu.fr:/home/cvsroot
Directory 3 : .
Local Dir 3 : modeles
Component 4 : CONFIG/trunk/LMDZ4OR_v2
Tag       4 : HEAD
System    4 : svn
Server    4 : http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/svn
Directory 4 : LMDZ4OR_v2
Local Dir 4 : config
Component 5 : libIGCM
Tag       5 : ?
System    5 : cvs
Server    5 : anonymous@cvs.ipsl.jussieu.fr:/home/ioipsl/CVSROOT
Directory 5 : .
Local Dir 5 : .

La première partie indique les modèles utilisés dans la configuration ainsi que leurs numéros de version sur CVS ou SVN. Ensuite est donnée l'adresse e-mail du responsable de cette configuration, puis tous les paths des composantes.

Travailler avec une configuration choisie

Dans ce paragraphe nous prendrons comme exemple le modèle couplé IPSLCM5A. Les autres configurations utilisant modipsl (IPSL_ESM_V1, LMDZ4OR_v2, LMDZINCA_v2, LMDZORINCA ...) suivent le même principe. Quand des cas particuliers existent nous vous les indiquerons.

Extraction

cd modipsl/util
./model -h               >>>> indique toutes les configurations dispo
./model IPSLCM5A       >>>> on choisit d'extraire la configuration IPSLCM5A

Lors de cette extraction plusieurs logins et mots de passe vous seront demandés. Pour les récupérer adressez vous au responsable de la configuration (voir ci-dessus model manager email address)
En cas d'urgence, vous pouvez aussi récupérer le fichier ~/.cvspass et le répertoire ~/.subversion d'un autre utilisateur. Cette commande récupère sur CVS et/ou SVN les différents modèles composant la configuration demandée. Les sources de ces modèles sont installées dans le répertoire modipsl/modeles/. Pour notre exemple vous obtenez les répertoires suivants :

• modipsl/modeles/IOIPSL/
• modipsl/modeles/LMDZ4/
• modipsl/modeles/NEMO/
• modipsl/modeles/UTIL/
• modipsl/modeles/ORCHIDEE/
• modipsl/modeles/XMLF90
• modipsl/modeles/XMLIO_SERVER

Modipsl installe également ce que l'on appelle une configuration. Elle est dans le répertoire modipsl/config/ (ici modipsl/config/IPSLCM5A/).
Cette configuration vous permettra de compiler l'ensemble des modèles, puis de lancer une simulation;

Mots de passe

Pour connaitre les mots de passe d'extraction s'adresser au model manager email address. Il est indiqué lors de la commande

 ./model -h IPSLCM5A