= __Utiliser Modipsl sur les machines mercure__ = 
'''[wiki:platform/documentation_2012 Index]/[wiki:Modipsl_envCalc Environnement de Calcul]/[wiki:Modipsl_mercure Mercure]'''
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[[BR]][[BR]]



== Compilation sur la SX8 ==
Pour compiler pour la SX8, il faut explicitement charger netcdf pour SX8. Le plus simple est de se préparer une fonction pour cela, par exemple sx8 :
{{{
sx8 () {  module load netcdf_sx8 ; export PS1="SX8"' - $PWD : ' ; }
}}}
Ou en ligne de commande : 
{{{
module load netcdf_sx8
}}}


[[BR]] [[BR]]
== Compilation sur la  SX9 ==
Pour compiler pour la SX9, il faut vous placer dans l'environnement SX9. Le plus simple est de se préparer une fonction pour cela, par exemple sx9 :
{{{
sx9 () { module switch SX8 SX9 ; module load netcdf_sx9 ; export PS1="SX9"' - $PWD : ' ; }
}}}
Ou en ligne de commande : 
{{{
module switch SX8 SX9
module load netcdf_sx9
}}}

A noter : si vous recompilez en restant en SX8 alors que tout a été fait en SX9 jusque là, vous aurez le message suivant d'erreur et aucune recompilation ne se fera.
{{{
****************************************************************
INFO -  This Makefile is for host type : sx9mercure
INFO -  Host used has type :             sx8mercure
****************************************************************
ERROR - This Makefile is not compatible whith the host !
****************************************************************
Makefile:22: *** .  Stop.
}}}

Plus d'informations sur la compilation SX9/SX8 : [http://wiki.ipsl.jussieu.fr/Pole/Couple/CCRT/SX9 là (Intranet)]


[[BR]][[BR]]
== Modifications à apporter dans un Job == 
N'oubliez pas de modifier les variables '''elapstim_req''' et '''memsz_job''' en entête de job si nécessaire (voir documentation
sur les machines de calculs du CCRT.
{{{
#PBS -l memsz_job=15.0gb       # limite memoire
#PBS -l elapstim_req=02:00:00 # limite en temps elapsed
}}}
Remarque : Pour connaître les temps autorisés sur les différentes queues de la machine vous pouvez utiliser la commande
'''class'''.
[[BR]]
Par défaut la simulation tournera sur le disque tmpdir de la machine. 
Si vous voulez qu'elle ait lieu sur le scratchir ou workdir, vous devez
modifier la variable RUN_DIR_PATH dans le fichier Job_nom_simul 
{{{
RUN_DIR_PATH=$SCRATCHDIR
}}}

[[BR]]
== Soumission du job == 
{{{
qsub Job_nom_simul
}}}

=== Retour d'expérience ===

La simulation de 150 ans v5.rcp45MR1, juin 2012, 8 procs, post-traitements reduits à pack et rebuild :
 * 1% des jobs de calcul ont du être resoumis à la main (1/100).
 * 0,6 % de l'ensembles des jobs de calcul et de post-traitements ont du être resoumis à la main (19/700).