wiki:PerformancesIPSLCM6

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Performances IPSL-CM6 et demandes d'heures y compris CMIP6

Cette page liste quelques performances mesurées et estimées du modèle IPSLCM6. Il rappelle également les ressources calcul disponibles au niveau national en 2017 et les dates clés. Enfin, il inclut les informations pour l'allocation dédiée à CMIP6.

Modifications

  • 5/10/2016 : simplifications et précisions pour demandes DARI d'octobre 2016
  • 10/10/2016 : ajout des infos sur le call 14 de Prace
  • 11/10/2016 : ajout de l'exposé de E. Millour au LMD.

Exposé DARI 2017

  1. Millour a présenté au LMD la campagne DARI 2017. Voir [exposé en pdf

Ressources calcul disponibles en 2017

Estimation des ressources disponibles Estimation des ressources disponibles
Centre Supercalculateurs DARI 2017 - A1 DARI 2017 - A2
CINES Bull - Occigen 239 455 000 313 468 000
IDRIS IBM Noeuds larges - Ada 31 134 000 40 757 000
IBM BG/Q - Turing 303 217 000 396 939 000
TGCC Bull - Curie nœuds fins 201 376 000 -

Tableau : PRACE systems available in this Call:

System Architecture Site (Country) Core Hours Node Hours
Curie Bull Bullx cluster GENCI@CEA (FR) 113 million 7 million
Hazel Hen Cray XC40 System GCS@HLRS (DE) 57 million 2.4 million
Juqueen IBM BlueGene/Q system GCS@JSC (DE) 350 million 4.6 million
Marconi Lenovo System CINECA (IT) 630 million (KNL) 9.2 million
35 million (Broadwell) 1 million
MareNostrum IBM System X iDataplex BSC (ES) 316 million T.B.D.
Piz Daint Cray XC30 System CSCS (CH) 476 million 7 million
SuperMUC IBM System X iDataplex/ Lenovo NextScale GCS@LRZ (DE) 30 million (SuperMUC 1) 1.9 million
14 million (SuperMUC 2) 0.5 million

Projet gencmip6

Voir détails des ressources pour le projet CMIP6 à l'IPSL en fin de page.

Mésocentre IPSL

Nous avons fait apparaître le mésocentre IPSL dans la liste des méso-centres. N'hésitez pas à le citer dans votre demande d'heures. Il suffit juste de le sélectionner dans la liste des mésocentres proposés sur le site WWW.

Projet 0826

Le projet 0826, intitulé : "Développement du système couplé IPSL et partage de données." demande un petit peu d'heures sur toutes les machines disponibles et les espaces nécessaires pour les données partagées. Si vous voulez tester une machine : turing ou occigen, par exemple, n'hésitez pas à demander à en faire partie. contact MA Foujols.

Mais aussi à l'UPMC/SU

Dossier technique

Dossier technique pour les demandes d'heures 2017. Avec les performances IPSLCM6. Version 1 du 6/10/2016 : dossier technique IPSL en pdf et dossier technique IPSL en doc

Performances estimées :

Les 3 machines ada (IDRIS), curie (TGCC) et occigen (CINES) ont presque les mêmes performances. Par souci de simplicité on donne un seul tableau de performances. Voir plus loin les spécificités des centres.

IPSLCM6

Tableau des résolutions

Configuration Océan Atmosphère Nb OpenMP atm Nb MPI atm Nb MPI oce Nb IO server Nb total de coeurs
IPSLCM5A2 (idem IPSLCM5A-LR CMIP5) 182 142 31 96 95 39 8 32 45 1 304
IPSLCM5A2-chimie 182 142 31 96 95 39 8 32 45 1 304
IPSLCM6-LR 362 332 75 144 142 79 8 47 180 1 (557) 560
IPSLCM6-LR et aérosols interactifs 362 332 75 144 142 79 8 47 180 1 560
IPSLCM6-MR 362 332 75 256 256 79 8 86 180 1 (869) 880
IPSLCM6-HR / atmosphère seule 512 360 79 8 120 1 (961) 976

Tableau des performances IPSLCM6

Configuration Nb total de coeurs Temps réel pour 10 ans Temps à demander pour 10 ans
IPSLCM5A2 304 4.5 h 1 500 h
IPSLCM5A2-chimie 304 70h 21300h
IPSLCM6-LR 560 44 h 27 000 h
IPSLCM6-LR et aérosols interactifs 560 130 h 72800 h
IPSLCM6-MR 880 80 h 76 000 h (estimation revue en 2016)
IPSLCM6-HR / atmosphère seule 976 180 h 195 000 h (estimation revue en 2016)

Tableau des performances LMDZOR_v6

Configuration Resolution Nb total de coeurs Temps réel pour 10 ans Temps à demander pour 10 ans Comment
LMDZOR_v6 144x142x79 377 (47mpi*8omp gcm +1mpi xios, soit 12 noeuds entiers) 34 h 13 500 h Mise en place comme pour IPSLCM6.0.6
LMDZOR_v6 96x95x39 125 (31mpi*4omp gcm +1mpi xios, soit 4 noeuds entiers) 14 h 1 700 h Mise en place avec NPv3.2 et CWRR

Tableau des performances NEMO_v6

Configuration Nb total de coeurs Temps réel pour 10 ans Temps à demander pour 10 ans
eORCA1-LIM3-PISCES 512 ( 496 nemo + 16 xios ) 14 h 7200 h
eORCA1-OFF-PISCES 498 ( 496 nemo + 2 xios ) 4 h 2000 h

Et pour les fichiers ?

Configuration Océan Atmosphère Facteur multiplicatif fichiers atm 3D atm 2D Facteur multiplicatif fichiers océan 3D océan 2D Commentaire
IPSLCM5A2 182 142 31 96 95 39 1 1 1 1
IPSLCM6-LR 362 332 75 144 142 79 4,5 2,2 10 4 100 Go pour 10 ans avec sorties par défaut 2016
IPSLCM6-LR et aérosols interactifs 362 332 75 144 142 39 2,2 et aérosols 2,2 et aérosols 10 4
IPSLCM6-LR et chimie 362 332 75 144 142 39 2,2 et chimie 2,2 et chimie 10 4
IPSLCM6-MR 362 332 75 280 280 79 17 4 10 4
IPSLCM6-HR 1442 1021 75 280 280 79 17 4 130 54

Particularités des centres

IDRIS IBM - Ada

  • La machine aussi vite que curie.
  • Les post-traitements se font sur des noeuds dédiés adapp et ne sont pas comptés. Il n'est donc pas nécessaire de demander des ressources pour les post-traitements.
  • Rappel : il faut de l'ordre de 20 To par personne sur le WORKDIR pour faire tourner les chaînes de calcul. Demander les quotas nécessaires dès que possible sur le serveur intranet de l'IDRIS.

TGCC Bull curie

  • Il faut bien préciser les besoins, en particulier en production :
    • Pour faire de la production, il faut enchaîner les jobs de calcul. Le calcul de priorité actuel tient compte des heures déjà consommées, autrement dit plus on a consommé, plus on attendra avant de rentrer en exécution. Ceci rend impossible la production basée sur l'enchaînement de jobs lancés les uns par les autres lorsque le projet est 'en avance' dans sa consommation (ccc_myproject).
  • Une demande collective unique d'extension du nombre d'inodes IPSL sera faite fin 2016. A suivre.
    • Pour avoir plus de quotas sur CCCSTOREDIR, il faut avoir un bon score ( noté sur 20 : 13/20 dans l'exemple) pour les obtenir. De plus, toute dérogation a une date limite. 31/1/2017 pour la plupart. Attention à être inclus dans la demande d'extension inodes IPSL annuelle.
    • ccc_quota vous donne votre occupation sur les différents espaces, en espace et en nombre d'inodes.
      > ccc_quota
      Disk quotas for user xxxxxx (uid xxxxx):
      
                   ------------------- SPACE --------------------  ------------------- INODE --------------------
       Filesystem       usage        soft        hard       grace     entries        soft        hard       grace
       ----------       -----        ----        ----       -----     -------        ----        ----       -----
             home     543.34M          3G          3G           -           -           -           -           - 
          scratch       1.56T         20T         20T           -      76.03k          2M          2M           - 
             work     328.15G       9.31T       9.31T           -       1.13M          3M          3M           - 
            store           -           -           -           -     512.61k        550k        551k           - 
      
      Account scoring:
      ----------------
      Filesystem volume(TB)  inodes non_files files<32M  files<1G avg_fsize(MB)    score      score_detail
      store         822.325  512612     2.44%    20.14%    43.50%          1724    13/20      6/6, 3/7, 1/3, 3/4
      
      ...
      

post-traitement aussi

  • Dans la chaîne IPSL, les post-traitements se feront sur curie. Il faut donc demander quelques heures en plus (5%) pour le post-traitement.

CINES Bull occigen

Il est possible de demander des heures en 2017 sur cette machine. La chaîne complète ne sera pas portée mais il est possible de compiler les modèles IPSL sur occigen. A savoir :

  • peu d'expérience des serveurs de fichiers du CINES à ce jour.
  • un datanode ESGF existe au CINES

Ressources dédiées CMIP6 à l'IPSL

Demande

Voir note n° 32 : stratégie calcul en modélisation du climat (synthèse et document technique) http://icmc.ipsl.fr/index.php/publications/reports-notes/scientific-notes

2017 et 2018

Mise en réserve :

  • 2017 :
    • 8 millions d'heures ada
    • 96 millions d'heures curie
  • 2018 :
    • 8 millions d'heures ada
    • 96 millions d'heures curie

2016

Voir suivi consommation IDRIS et TGCC là : https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/igcmg/ConsoGENCI/index.html

En 2016, la 1ère phase des espaces dédiés CMIP6 a été installée au TGCC. Il s'agit de GENCMIP6_HOME GENCMIP6_CCCWORKDIR et GENCMIP6_CCCSTOREDIR et ils sont gérés par quota groupe.

2015

  • 2eme semestre :
    • 12 millions d’heures curie_nf, sorties minimales (700 To), cela correspond à 6000 ans de couplé IPSLCM6-LR.
    • 2 millions d’heures ada, sorties normales, cela correspond à 1000 ans de couplé IPSLCM6-LR et cela produit 300 To.
  • 1er semestre :
    • 5 millions d'heures curie_nf et 270 To.

Historique

  • 18/3/2016 ajout informations ressources dédiées CMIP6 à l'IPSL
  • 20/10/2015 : vérification des ressources IPSLCM6-VLR et IPSLCM6-LR et mise à jour doc technique.
  • 5/10/2015 : Ressources disponibles en 2016
  • 7/10/2014 :
    • modification chiffrage IPSLCM6-VLR
    • ajout chiffrage IPSLCM6-XLR, idem IPSLCM5A-MR, configuration a priori non supportée.

Pour mémoire : les performances de 2014 pour IPSL-CM5A : wiki:PerformancesIPSLCM5A.

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