= Introduction de PISCES dans IPSLCM5 =

== Création de la configuration IPSLCM5_v3 pour tests ==

 * Fait le 3 mars 2010. 
   * Voir les fichiers de la  [http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/browser/CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5/branches/IPSLCM5_v3 config IPSLCM5_v3]
   * Voir [928] et extrait de [https://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/browser/modipsl/trunk/util/mod.def mod.def] 
   * 10 mn par mois, NEMO avec PISCES prend 300 s (100 s sans) et tourne à 16 Gflops! 12 GB de mémoire, 100 Mo de sorties supplémentaires par mois.

== Test de mise en place ==
 * Extraction de IPSLCM5_v3 
 * Démarrage de PISCES depuis restart :1100-12-31 de la simu ORCA_PISCES_OFFLINE : ST11RP
 * Démarrage autres composantes : états initiaux
 * Test de un an (noleap) avec monitoring et atlas : [http://dods.extra.cea.fr/data/p86maf/IPSLCM5/CM5V3F CM5V3F]

== Simulations lancées ==

Protocole souhaité : 

[[Image(protocole-simus-mars2010.png)]]

=== ST11RR ===
 * pour voir en actuel
 * Idem ST11RQ mais avec une seule option pour ln_qsr : ln_qsr_bio.
 * 10 ans
 * modif dans namelist_ORCA2 :
 {{{
+   ln_qsr_rgb  = .false.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration
    ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration
    ln_qsr_bio  = .true.    !  bio-model light penetration
}}}
 * Voir : http://dods.extra.cea.fr/data/p86maf/IPSLCM5/ST11RR/MONITORING

=== CM53PI2 ===
 * repérer aussi impact restart Pisces actuel en simu préind
 * 10 ans
 * Idem CM53PI mais avec une seule option pour ln_qsr : ln_qsr_bio.
 * Voir : http://dods.extra.cea.fr/data/p86maf/IPSLCM5/CM53PI2/MONITORING

=== CM53PI3 ===
 * idem CM53PI2 pour vérifier que PISCES activé mais sans rétroaction donne les mêmes résultats que CM5PIRC3 avec restart OCE modifié pour mer fermées (SSS Levitus)
 * ln_qsr_rgb and nn_chldta   =      1 
 * 10 ans

=== ST11RQ ===
 * But : voir l'impact de l'ajout de PISCES
 * calendrier 360d
 * démarrage depuis 2299-12-30 de ST11R sauf OCE
 * C'est là : $SCRATCHDIR/IPSLCM5_v3/T5/modipsl/config/IPSLCM5_v3/ST11RQ
 * Modif fichier restart OCE pour avoir la Salinité Levitus. Fichier restart océan modifié et pris chez moi.
 * Monitoring : http://dods.extra.cea.fr/data/p86maf/IPSLCM5/ST11RQ/MONITORING
 * différences namelist_ORCA2 : qq commentaires et ce qu'il faut pour PISCES :
 {{{
<    ln_qsr_bio  = .true.    !  bio-model light penetration
<    nn_chldta   =      0    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0)
---
>    ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration
>    nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0)
}}}
 * différence dans la namcouple_ORCA2xLMD9695 :
 {{{
< tlmd    torc  LAG=1800
---
> tlmd    vorc  LAG=1800
}}}
 * différence dans orchidee.def car on va chercher le fichier PFTmap contenant une seule année :
{{{
< # If LAND_USE (11 = 1860 - 1850 +1 for PFTmap.20C3M.nc, 1 for PFTmap_IPCC_2000.nc) 
< VEGET_YEAR = 1
---
> # If LAND_USE (11 = 1860 - 1850 +1 for PFTmap.20C3M.nc) 
> VEGET_YEAR = 151
}}}
 * différences LMDZ : les variables déplacées pour avoir le même physiq.def en couplé et forcé {{{ type_ocean=couple version_ocean=nemo cpl_current=y VEGET=y }}}


=== CM53PI ===
 * But : voir l'impact de l'ajout de PISCES sur le contrôle préindustriel, avec un état initial PISCES produit en offline avec un contrôle actuel. idem ST11RP.
 * C'est là : $SCRATCHDIR/IPSLCM5_v3/T5/modipsl/config/IPSLCM5_v3/CM53PI
 * calendrier noleap
 * Démarrage depuis 1999-12-31 de CM5PIRC3 sauf OCE.
 * Modif fichier Restart OCE pour avoir la Salinité Levitus. 
 * Monitoring : http://dods.extra.cea.fr/data/p86maf/IPSLCM5/CM53PI/MONITORING
 * Différences avec la référence IPSLCM5_v3 du 3 mars 2010 : 
  * différence dans physiq.def_L39 :
 {{{
##  Facteur additif pour l'albedo
pmagic=0.0
### co2_ppm =    taux CO2 en ppm
co2_ppm = 280.
### CH4_ppb =    taux CH4 en ppb
CH4_ppb = 790.
### N2O_ppb =    taux N2O en ppb
N2O_ppb = 270.
### CFC11_ppt =  taux CFC11 en ppt
CFC11_ppt = 0.
### CFC12_ppt =  taux CFC12 en ppt
CFC12_ppt = 0.
### aer_type =   Aerosol variation type : actuel / preind / scenario / annuel
aer_type=preind
}}}
  * différence dans orchidee.card :
{{{
-       (${R_INIT}/SRF/${config_UserChoices_TagName}/PFTmap_IPCC_2000.nc, PFTmap.nc)
+       (${R_INIT}/SRF/${config_UserChoices_TagName}/PFTmap_IPCC_1860.nc, PFTmap.nc)
}}}
  * différences dans lmdz.card :
 {{{
-       (${R_INIT}/ATM/${config_UserChoices_TagName}/climO3_LMDZORINCAREPRO_1995.nc, climoz.nc), \
+       (${R_INIT}/ATM/${config_UserChoices_TagName}/climO3_LMDZORINCAREPRO_1855.nc, climoz.nc), \
...
-           (${R_BC}/ATM/${config_UserChoices_TagName}/${RESOL_ATM}/AR5/HISTORIQUE/climoz_LMDZ_1995.nc, climoz_LMDZ.nc)
+           (${R_BC}/ATM/${config_UserChoices_TagName}/${RESOL_ATM}/AR5/HISTORIQUE/climoz_LMDZ_1855.nc, climoz_LMDZ.nc)
...
-       (histday.nc,      ${R_OUT_ATM_O_D}/${PREFIX}_1D_histday.nc,      NONE), \
+       (histday.nc,      ${R_OUT_ATM_O_D}/${PREFIX}_1D_histday.nc,      Post_1D_histday), \
...
-ChunckJob2D = NONE
+ChunckJob2D = 200Y
}}}