}}}
(Auteur : Anne Cozic)
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[[PageOutline]]
# extraire le modèle et la configuration correspondante #
* Extraire modipsl
* modifier le fichier ''modipsl/util/mod.def'' ainsi
{{{
#-H- LMDZORINCA_v5 libIGCM tag libIGCM_v2.0
#-M- LMDZORINCA_v5 Anne.Cozic@lsce.ipsl.fr
#-C- LMDZORINCA_v5 IOIPSL/tags/v2_2_2/src HEAD 8 IOIPSL/src modeles
-#-C- LMDZORINCA_v5 tags/ORCHIDEE_1_9_5/ORCHIDEE HEAD 14 ORCHIDEE modeles
+#-C- LMDZORINCA_v5 branches/ORCHIDEE-BCOV/ORCHIDEE HEAD 14 ORCHIDEE modeles
#-C- LMDZORINCA_v5 LMDZ5/trunk 1729 11 LMDZ modeles
-#-C- LMDZORINCA_v5 tags/INCA4.1.2 HEAD 9 INCA modeles
+#-C- LMDZORINCA_v5 branches/INCA4_BCOV HEAD 9 INCA modeles
#-C- LMDZORINCA_v5 tags/libIGCM_v2.0 HEAD 10 libIGCM .
-#-C- LMDZORINCA_v5 CONFIG/UNIFORM/v5/LMDZORINCA_v5 HEAD 8 LMDZORINCA_v5 config
+#-C- LMDZORINCA_v5 CONFIG/UNIFORM/v5_dev/LMDZORINCA_v5/BCOV HEAD 8 LMDZORINCA_v5 config
}}}
# compiler #
Avant de compiler il faut également modifier l'appel à chemini depuis ''modipsl/modeles/LMDZ/libf/phylmd/physiq.F90''
{{{
- CALL chemini(
+ CALL chemini( mth_len,
}}}
Pour la compilation vous avez le choix entre deux résolutions :
AERxLMD9695-L39 et NMHC_AERxLMD9695-L39
{{{
cd modipsl/config/LMDZORINCA_v5
gmake AERxLMD9695-L39
ou
gmake NMHC_AERxLMD9695-L39
}}}
# Préparation d'une expérience #
Toutes les étapes sont disponibles dans la [http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/wiki/platform/en/documentation documentation igcmg]
## créer un répertoire d'expérience ##
* Rappel : dans le répertoire ''modipsl/config/LMDZORINCA_v5/'' il y a un fichier ''README'' qui redonne les grandes lignes de la création d'un répertoire d'expérience.
{{{
cd modipsl/config/LMDZORINCA_v5
cp EXPERIMENTS/LMDZORINCA/AER/config.card .
ou
cp EXPERIMENTS/LMDZORINCA/NMHC_AER/config.card .
vi config.card >> modifier le JobName
../../util/ins_job >> creation du répertoire d'expérience correspondant au config.card choisit
}}}
## Préparation de la simulation ##
Les paramètres de couplage entre inca et orchidee sont définis dans le fichier ''LMDZORINCA_v5/MyExp/PARAM/inca.def''
{{{
#######################################################################
# Couplage avec Orchidee
#######################################################################
#nombre de pft
nbveget=13
#nombre de flux transferes depuis orchidee vers inca
nbFlux_FromOrch=13
##nbFlux_FromOrch=0
#noms des flus a transferer
# flx_iso - flx_mono - flx_ORVOC - flx_MBO - flx_methanol
# flx_acetone - flx_acetal - flx_formal - flx_acetic - flx_formic
# flx_no_soil - flx_no - flx_fertil_no
emi_FromOrch=iso mono ORVOC MBO methanol acetone acetal formal acetic formic no_soil nox fertil_no
##emi_FromOrch=
}}}
Dans ce fichier on peut également définir les fréquences de sorties pour les fichiers d'output de INCA.
* un fichier veget contenant les données issues du couplage sera créé et il est géré par les paramètres suivants :
{{{
#frequence d'ecriture du fichier veget (1.mth, 1.day ou other, si other --> renseigner freq_write_veget_second)
freq_write_veget=1.day
#frequence d'ecriture en seconde du fichier veget (pris en compte uniquement si freq_write_veget = other
freq_write_veget_second=1800
}}}
* pour le fichier classique inca_avgr il faut utiliser le paramètre, lu dans inca.def mais défini dans inca.card :
{{{
Dans inca.def :
#freq_write_chem --> write frequency for inca_inst and inca_avgr (86400 = 1/day)
freq_write_chem=_AUTO_
Dans inca.card :
# Set climatological to choose the write_frequency for inca output (inca_avgr, forcage, inca_inst)
# 86400 = daily output
freq_write_chem=86400
}}}
Les autres paramètres sont utilisés pour la lecture ou le calcul des vents à 10m
# Trucs et astuces #
* si la compilation plante les erreurs et les numéros de lignes font références aux fichiers pré-processé par le compilateur et stockés dans ''modipsl/modeles/INCA/config/ppsrc''. Attention : il faut bien modifier le fichier d'origine et non pas le fichier pré-processé avant de recompiler
* la simulation tourne sur le scratchdir
{{{
cd $SCRATCHDIR/RUN_DIR/n°IDJob_****/****/
}}}
* Tous les prints sont stockés dans le fichier out_execution (Fichier stocké au final dans IGCM_OUT/.../JobName/DEBUG/)
* Les write du modèle INCA sont stockés dans le fichier inca_out. (Fichier stocké au final dans IGCM_OUT/..../JobName/DEBUG/)
* Pour savoir analyser un fichier Script_Output il faut se référer à la documentation [http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/wiki/platform/en/documentation/G_suivi#AnalyzingtheJoboutput:Script_Output suivante]