source: XIOS/dev/branch_openmp/extern/ep_dev/ep_alltoall.cpp @ 1527

Last change on this file since 1527 was 1527, checked in by yushan, 6 years ago

save dev

File size: 2.1 KB
Line 
1#include "ep_lib.hpp"
2#include <mpi.h>
3#include "ep_mpi.hpp"
4
5
6namespace ep_lib
7{
8
9  int MPI_Alltoall(const void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
10  {
11    if(!comm->is_ep) return ::MPI_Alltoall(sendbuf, sendcount, to_mpi_type(sendtype), recvbuf, recvcount, to_mpi_type(recvtype), to_mpi_comm(comm->mpi_comm));
12    if(comm->is_intercomm) return MPI_Alltoall_intercomm(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype, comm);
13
14
15    assert(valid_type(sendtype) && valid_type(recvtype));
16    assert(sendcount == recvcount);
17
18    ::MPI_Aint datasize, llb;
19    ::MPI_Type_get_extent(to_mpi_type(sendtype), &llb, &datasize);
20
21    int count = sendcount;
22   
23    int ep_rank = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[0].first;
24    int ep_rank_loc = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[1].first;
25    int mpi_rank = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[2].first;
26    int ep_size = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[0].second;
27    int num_ep = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[1].second;
28    int mpi_size = comm->ep_comm_ptr->size_rank_info[2].second;
29
30    void* tmp_recvbuf;
31    if(ep_rank == 0) tmp_recvbuf = new void*[count * ep_size * ep_size * datasize];
32
33    MPI_Gather(sendbuf, count*ep_size, sendtype, tmp_recvbuf, count*ep_size, recvtype, 0, comm);
34   
35    // reorder tmp_buf
36    void* tmp_sendbuf;
37    if(ep_rank == 0) tmp_sendbuf = new void*[count * ep_size * ep_size * datasize];
38
39    if(ep_rank == 0)
40    for(int i=0; i<ep_size; i++)
41    {
42      for(int j=0; j<ep_size; j++)
43      {
44        memcpy(tmp_sendbuf + j*ep_size*count*datasize + i*count*datasize, tmp_recvbuf + i*ep_size*count*datasize + j*count*datasize, count*datasize);
45      }
46    }
47
48    MPI_Scatter(tmp_sendbuf, ep_size*count, sendtype, recvbuf, ep_size*recvcount, recvtype, 0, comm);
49
50    if(ep_rank == 0)
51    {
52      delete[] tmp_recvbuf;
53      delete[] tmp_sendbuf;
54    }
55  }
56
57
58  int MPI_Alltoall_intercomm(const void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
59  {
60    printf("MPI_Alltoall_intercomm not yet implemented\n");
61    MPI_Abort(comm, 0);
62  }
63}
64
65
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.