source: XIOS/dev/branch_openmp/src/io/nc4_data_output.hpp @ 1545

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    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
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RevLine 
[591]1#ifndef __XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
2#define __XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
[219]3
[591]4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
[1328]6#include "mpi_std.hpp"
[219]7#include "onetcdf4.hpp"
8#include "data_output.hpp"
9
[335]10namespace xios
[219]11{
12      /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
13
14      class CNc4DataOutput
15         : protected CONetCDF4
16         , public virtual CDataOutput
17      {
18         public :
19
20            /// Définition de type ///
21            typedef CONetCDF4   SuperClassWriter;
22            typedef CDataOutput SuperClass;
23
24            /// Constructeurs ///
25            CNc4DataOutput
[1046]26               (CFile* file, const StdString & filename, bool exist);
[219]27            CNc4DataOutput
[1046]28               (CFile* file, const StdString & filename, bool exist, bool useClassicFormat,
[1328]29                bool useCFConvention,
30                ep_lib::MPI_Comm comm_file, bool multifile, bool isCollective = true,
31                const StdString& timeCounterName = "time_counter");
[219]32
33            CNc4DataOutput(const CNc4DataOutput & dataoutput);       // Not implemented.
34            CNc4DataOutput(const CNc4DataOutput * const dataoutput); // Not implemented.
[878]35           
[219]36            /// Accesseur ///
37            const StdString & getFileName(void) const;
38
39            /// Destructeur ///
40            virtual ~CNc4DataOutput(void);
[878]41           
[318]42            bool singleDomain ;
[335]43            bool isCollective ;
[1460]44            int compressionLevel ;
[878]45                     
46            CFile* file;
47                     
[219]48         protected :
49
50            /// Ecriture ///
[676]51            virtual void writeDomain_   (CDomain* domain);
52            virtual void writeAxis_     (CAxis* axis);
[887]53            virtual void writeScalar_   (CScalar* scalar);
[676]54            virtual void writeGridCompressed_(CGrid* grid);
[391]55            virtual void writeTimeDimension_(void);
[676]56            virtual void writeField_    (CField* field);
57            virtual void writeAttribute_(CVariable* var);
58            virtual void writeAttribute_(CVariable* var, const string& fieldId);
59            virtual void writeFieldData_(CField* field);
60            virtual void writeFile_     (CFile* file);
61            virtual void closeFile_     (void);
[321]62            virtual void syncFile_      (void);
[676]63            virtual void writeTimeAxis_ (CField* field,
[1545]64                                         const std::shared_ptr<CCalendar> cal);
[219]65
66         protected :
[488]67            void writeUnstructuredDomain (CDomain* domain);
[878]68            void writeUnstructuredDomainUgrid (CDomain* domain);
[219]69            void writeLocalAttributes(int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, StdString domid);
[628]70            void writeLocalAttributes_IOIPSL(const StdString& dimXid, const StdString& dimYid,
71                                             int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, int ni_glo, int nj_glo, int rank, int size);
[219]72            void writeTimeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
73                                         const StdString & calendar,
74                                         const StdString & units,
75                                         const StdString & time_origin,
[488]76                                         const StdString & time_bounds   = StdString("bounds"),
[219]77                                         const StdString & standard_name = StdString("time"),
[613]78                                         const StdString & long_name     = StdString("Time axis"));
[219]79
80            void writeFileAttributes(const StdString & name,
81                                     const StdString & description,
82                                     const StdString & conventions,
83                                     const StdString & production,
84                                     const StdString & timeStamp);
85
86            void writeMaskAttributes(const StdString & mask_name,
87                                     int data_dim,
88                                     int data_ni     = 0,
89                                     int data_nj     = 0,
90                                     int data_ibegin = 0,
91                                     int data_jbegin = 0);
92
93            void writeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
94                                     const StdString & axis,
95                                     const StdString & standard_name,
96                                     const StdString & long_name,
97                                     const StdString & units,
98                                     const StdString & nav_model);
[369]99
[1044]100            StdSize getRecordFromTime(Time time, double factorUnit);
[707]101
[219]102         private :
103
104            /// Traitement ///
105            StdString getTimeStamp(void) const;
106
[774]107            bool isWrittenDomain(const std::string& domainName) const;
108            bool isWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName) const;
109            bool isWrittenAxis(const std::string& axisName) const;
110            bool isWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName) const;
[887]111            bool isWrittenScalar(const std::string& scalarName) const;
[774]112
113            void setWrittenDomain(const std::string& domainName);
114            void setWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName);
115            void setWrittenAxis(const std::string& axisName);
116            void setWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName);
[887]117            void setWrittenScalar(const std::string& scalarName);
[774]118
[219]119            /// Propriétés privées ///
[1328]120            ep_lib::MPI_Comm comm_file;
[219]121            const StdString filename;
[707]122            std::map<Time, StdSize> timeToRecordCache;
123
[774]124            std::set<std::string> writtenDomains, writtenCompressedDomains;
125            std::set<std::string> writtenAxis, writtenCompressedAxis;
[887]126            std::set<std::string> writtenScalar;
[1096]127
128            enum { none, centered, instant, record} timeCounterType ;
129            bool hasTimeInstant ;
130            bool hasTimeCentered ;
[219]131      }; // class CNc4DataOutput
132
[335]133} // namespace xios
[219]134
[591]135#endif //__XIOS_NC4_DATA_OUTPUT__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.