source: XIOS/dev/branch_openmp/src/node/axis.hpp @ 1464

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  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:executable set to *
File size: 8.0 KB
RevLine 
[591]1#ifndef __XIOS_CAxis__
2#define __XIOS_CAxis__
[219]3
[591]4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
[219]6#include "group_factory.hpp"
[619]7#include "virtual_node.hpp"
[219]8
9#include "declare_group.hpp"
[540]10#include "declare_ref_func.hpp"
[619]11#include "declare_virtual_node.hpp"
[369]12#include "attribute_array.hpp"
[399]13#include "attribute_enum.hpp"
14#include "attribute_enum_impl.hpp"
[567]15#include "server_distribution_description.hpp"
[619]16#include "transformation.hpp"
17#include "transformation_enum.hpp"
[219]18
[1460]19#include "mpi_std.hpp"
20
[335]21namespace xios {
[219]22   /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
23
24   class CAxisGroup;
25   class CAxisAttributes;
26   class CAxis;
27
28   ///--------------------------------------------------------------
29
30   // Declare/Define CAxisAttribute
31   BEGIN_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CAxis)
[231]32#  include "axis_attribute.conf"
[821]33#  include "axis_attribute_private.conf"
[219]34   END_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CAxis)
35
36   ///--------------------------------------------------------------
37
38   class CAxis
39      : public CObjectTemplate<CAxis>
40      , public CAxisAttributes
41   {
[1460]42               /// typedef ///
43         typedef CObjectTemplate<CAxis>   SuperClass;
44         typedef CAxisAttributes SuperClassAttribute;
45         
46      public:
[567]47         enum EEventId
48         {
[1460]49           EVENT_ID_DISTRIBUTION_ATTRIBUTE,           
[633]50           EVENT_ID_DISTRIBUTED_VALUE,
[1460]51           EVENT_ID_NON_DISTRIBUTED_VALUE,
52           EVENT_ID_NON_DISTRIBUTED_ATTRIBUTES,
53           EVENT_ID_DISTRIBUTED_ATTRIBUTES
[567]54         } ;
55
[1460]56      public:
[219]57         typedef CAxisAttributes RelAttributes;
58         typedef CAxisGroup      RelGroup;
[621]59         typedef CTransformation<CAxis>::TransformationMapTypes TransMapTypes;
[219]60
[621]61      public:
[219]62         /// Constructeurs ///
63         CAxis(void);
64         explicit CAxis(const StdString & id);
65         CAxis(const CAxis & axis);       // Not implemented yet.
66         CAxis(const CAxis * const axis); // Not implemented yet.
67
[622]68         static CAxis* createAxis();
69
[219]70         /// Accesseurs ///
71         const std::set<StdString> & getRelFiles(void) const;
72
[1460]73         int getNumberWrittenIndexes(ep_lib::MPI_Comm writtenCom);
74         int getTotalNumberWrittenIndexes(ep_lib::MPI_Comm writtenCom);
75         int getOffsetWrittenIndexes(ep_lib::MPI_Comm writtenCom);
76         CArray<int, 1>& getCompressedIndexToWriteOnServer(ep_lib::MPI_Comm writtenCom);
[676]77
[1460]78         std::map<int, StdSize> getAttributesBufferSize(CContextClient* client, const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
79                                                        CServerDistributionDescription::ServerDistributionType disType = CServerDistributionDescription::BAND_DISTRIBUTION);
[731]80
[219]81         /// Test ///
82         bool IsWritten(const StdString & filename) const;
[676]83         bool isWrittenCompressed(const StdString& filename) const;
[594]84         bool isDistributed(void) const;
[676]85         bool isCompressible(void) const;
[219]86
87         /// Mutateur ///
88         void addRelFile(const StdString & filename);
[676]89         void addRelFileCompressed(const StdString& filename);
[219]90
91         /// Vérifications ///
92         void checkAttributes(void);
93
94         /// Destructeur ///
95         virtual ~CAxis(void);
96
[619]97         virtual void parse(xml::CXMLNode & node);
98
[1460]99         void setContextClient(CContextClient* contextClient);
100
[219]101         /// Accesseurs statiques ///
102         static StdString GetName(void);
103         static StdString GetDefName(void);
104         static ENodeType GetType(void);
105
[1460]106         static bool dispatchEvent(CEventServer& event);         
107         
[742]108         void checkAttributesOnClient();
[927]109         void checkAttributesOnClientAfterTransformation(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
110                                                         CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType = CServerDistributionDescription::BAND_DISTRIBUTION);
[567]111         void sendCheckedAttributes(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
112                                    CServerDistributionDescription::ServerDistributionType disType = CServerDistributionDescription::BAND_DISTRIBUTION);
[619]113
[676]114         void checkEligibilityForCompressedOutput();
[1460]115         size_t getGlobalWrittenSize(void) ;
[676]116
[1460]117         void computeWrittenIndex();
118         void computeWrittenCompressedIndex(ep_lib::MPI_Comm);
[619]119         bool hasTransformation();
120         void solveInheritanceTransformation();
[1460]121         TransMapTypes getAllTransformations();         
[836]122         void duplicateTransformation(CAxis*);
123         CTransformation<CAxis>* addTransformation(ETranformationType transType, const StdString& id="");
[1106]124         bool isEqual(CAxis* axis);
[1460]125         bool zoomByIndex();
[619]126
[1460]127      public: 
128        bool hasValue;       
129        CArray<size_t,1> localIndexToWriteOnServer;       
[676]130
131      private:
[551]132         void checkData();
133         void checkMask();
[631]134         void checkZoom();
[633]135         void checkBounds();
[1460]136         void checkLabel();
137         void sendAttributes(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
138                             CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
139         void sendDistributionAttribute(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
140                                        CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
141         void computeConnectedClients(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
[815]142                                     CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
[595]143
[1460]144         void sendNonDistributedAttributes(void);
145         void sendDistributedAttributes(void);
[619]146
[1460]147         static void recvNonDistributedAttributes(CEventServer& event);
148         static void recvDistributedAttributes(CEventServer& event);
149         static void recvDistributionAttribute(CEventServer& event);
150         void recvNonDistributedAttributes(int rank, CBufferIn& buffer);
151         void recvDistributedAttributes(vector<int>& rank, vector<CBufferIn*> buffers);
152         void recvDistributionAttribute(CBufferIn& buffer);
153
[621]154         void setTransformations(const TransMapTypes&);
[676]155
[567]156      private:
[1460]157
158/** Clients that have to send a domain. There can be multiple clients in case of secondary server, otherwise only one client. */
159         std::list<CContextClient*> clients;
160         std::set<CContextClient*> clientsSet;
161
[219]162         bool isChecked;
[567]163         bool areClientAttributesChecked_;
[927]164         bool isClientAfterTransformationChecked;
[676]165         std::set<StdString> relFiles, relFilesCompressed;
[1460]166         TransMapTypes transformationMap_;         
[676]167         //! True if and only if the data defined on the axis can be outputted in a compressed way
168         bool isCompressible_;
[1460]169         std::map<int, map<int,int> > nbSenders; // Mapping of number of communicating client to a server
170         std::map<int, boost::unordered_map<int, vector<size_t> > > indSrv_; // Global index of each client sent to server
171         // std::map<int, vector<int> > indWrittenSrv_; // Global written index of each client sent to server
172         boost::unordered_map<size_t,size_t> globalLocalIndexMap_;
[676]173         std::vector<int> indexesToWrite;
[1460]174         std::map<int,int> numberWrittenIndexes_, totalNumberWrittenIndexes_, offsetWrittenIndexes_;
175         std::map<int, CArray<int, 1> > compressedIndexToWriteOnServer;
176         std::map<int, std::vector<int> > connectedServerRank_;
177         bool hasBounds;
178         bool hasLabel;         
179         bool computedWrittenIndex_;                 
[836]180
181       private:
182         static bool initializeTransformationMap(std::map<StdString, ETranformationType>& m);
[1134]183         static bool initializeTransformationMap();
184         static std::map<StdString, ETranformationType> *transformationMapList_ptr;
[1331]185         #pragma omp threadprivate(transformationMapList_ptr)
[1328]186         static bool dummyTransformationMapList_;
[1331]187         #pragma omp threadprivate(dummyTransformationMapList_)
[1134]188
[540]189         DECLARE_REF_FUNC(Axis,axis)
[219]190   }; // class CAxis
191
192   ///--------------------------------------------------------------
193
194   // Declare/Define CAxisGroup and CAxisDefinition
195   DECLARE_GROUP(CAxis);
[335]196} // namespace xios
[219]197
[591]198#endif // __XIOS_CAxis__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.