source: XIOS/dev/branch_openmp/src/transformation/domain_algorithm_interpolate.hpp @ 1482

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Line 
1/*!
2   \file domain_algorithm_interpolate_from_file.hpp
3   \author Ha NGUYEN
4   \since 09 July 2015
5   \date 09 Sep 2015
6
7   \brief Algorithm for interpolation on a domain.
8 */
9#ifndef __XIOS_DOMAIN_ALGORITHM_INTERPOLATE_HPP__
10#define __XIOS_DOMAIN_ALGORITHM_INTERPOLATE_HPP__
11#include "mpi_std.hpp"
12#include "domain_algorithm_transformation.hpp"
13#include "transformation.hpp"
14#include "nc4_data_output.hpp"
15
16namespace xios {
17
18class CDomain;
19class CInterpolateDomain;
20
21
22/*!
23  \class CDomainAlgorithmInterpolate
24  Reading interpolation from file then apply on a domain
25*/
26class CDomainAlgorithmInterpolate : public CDomainAlgorithmTransformation
27{
28public:
29  CDomainAlgorithmInterpolate(CDomain* domainDestination, CDomain* domainSource, CInterpolateDomain* interpDomain);
30
31  virtual ~CDomainAlgorithmInterpolate() {}
32
33  virtual void apply(const std::vector<std::pair<int,double> >& localIndex,
34                     const double* dataInput,
35                     CArray<double,1>& dataOut,
36                     std::vector<bool>& flagInitial,                     
37                     bool ignoreMissingValue, bool firstPass);
38  virtual void updateData(CArray<double,1>& dataOut);
39
40  static bool registerTrans();
41protected:
42  void computeIndexSourceMapping_(const std::vector<CArray<double,1>* >& dataAuxInputs);
43
44private:
45  void readInterpolationInfo(std::string& filename, std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >& interpMapValue);
46  void writeInterpolationInfo(std::string& filename, std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >& interpMapValue);
47  void processPole(std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >& interMapValuePole,
48                   int nbGlobalPointOnPole);
49  void computeRemap();
50  void readRemapInfo();
51  void writeRemapInfo(std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >&);
52  void exchangeRemapInfo(std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >& interpMapValue);
53  void convertRemapInfo(std::map<int,std::vector<std::pair<int,double> > >& interpMapValue);
54
55private:
56  CArray<double,1> renormalizationFactor ;
57  CArray<bool,1> allMissing ;
58  bool detectMissingValue ;
59  bool renormalize ;
60  bool quantity ;
61 
62  CInterpolateDomain* interpDomain_;
63  bool writeToFile_;
64  bool readFromFile_;
65  StdString fileToReadWrite_;
66  bool fortranConvention ;
67
68  // class WriteNetCdf;
69  class WriteNetCdf : public CNc4DataOutput
70  {
71  public:
72    WriteNetCdf(const StdString& filename, const ep_lib::MPI_Comm comm);
73    int addDimensionWrite(const StdString& name, const StdSize size = UNLIMITED_DIM);
74    int addVariableWrite(const StdString& name, nc_type type,
75                         const std::vector<StdString>& dim);
76    void endDefinition();
77    void writeDataIndex(const CArray<int,1>& data, const StdString& name,
78                        bool collective, StdSize record,
79                        const std::vector<StdSize>* start = NULL,
80                        const std::vector<StdSize>* count = NULL);
81    void writeDataIndex(const CArray<double,1>& data, const StdString& name,
82                        bool collective, StdSize record,
83                        const std::vector<StdSize>* start = NULL,
84                        const std::vector<StdSize>* count = NULL);
85  };
86
87
88private:
89
90  static CGenericAlgorithmTransformation* create(CGrid* gridDst, CGrid* gridSrc,
91                                                CTransformation<CDomain>* transformation,
92                                                int elementPositionInGrid,
93                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridSrc2ScalarPosition,
94                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridSrc2AxisPosition,
95                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridSrc2DomainPosition,
96                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridDst2ScalarPosition,
97                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridDst2AxisPosition,
98                                                std::map<int, int>& elementPositionInGridDst2DomainPosition);
99};
100
101}
102#endif // __XIOS_DOMAIN_ALGORITHM_INTERPOLATE_HPP__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.