1 | #!/bin/bash |
---|
2 | ##SBATCH --nodes=2 |
---|
3 | #SBATCH --ntasks=8 # Nombre total de processus MPI |
---|
4 | #SBATCH --ntasks-per-node=16 |
---|
5 | ##SBATCH --cpus-per-task=1 |
---|
6 | #SBATCH --hint=nomultithread |
---|
7 | #SBATCH -t 00:10:00 # Temps elapsed maximum d'exécution |
---|
8 | #SBATCH -o output.out # Nom du fichier de sortie |
---|
9 | #SBATCH -e error.err # Nom du fichier d'erreur |
---|
10 | ##SBATCH -p cpu_port # Nom de la partition d'exécution |
---|
11 | ##SBATCH -A sos@cpu |
---|
12 | ##SBATCH --distribution=arbitrary |
---|
13 | #SBATCH --account=psl@cpu |
---|
14 | |
---|
15 | |
---|
16 | cd ${SLURM_SUBMIT_DIR} |
---|
17 | module unload intel-all hdf5 netcdf netcdf-cxx netcdf-fortran |
---|
18 | module load intel-all/19.0.4 |
---|
19 | module load hdf5/1.10.5/intel-19.0.4-mpi |
---|
20 | module load netcdf/4.7.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
21 | module load netcdf-cxx/4.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
22 | module load netcdf-fortran/4.5.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
23 | |
---|
24 | #module purge |
---|
25 | #module load intel-all/19.0.4 |
---|
26 | #module load netcdf/4.7.0/intel-19.0.4-mpi |
---|
27 | #module load netcdf-cxx/4.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
28 | #module load netcdf-fortran/4.4.5/intel-19.0.4-mpi |
---|
29 | #module load gcc/6.5.0/gcc-4.8.5 |
---|
30 | module load cmake |
---|
31 | module load cdo |
---|
32 | module load subversion |
---|
33 | #module load arm-forge |
---|
34 | |
---|
35 | ulimit -c 0 |
---|
36 | #export ALLINEA_NO_TIMEOUT=1 |
---|
37 | |
---|
38 | #ddt --connect srun --mpi=pmi2 -K1 -m block:block --multi-prog ./mpmd_srun.conf |
---|
39 | #srun --mpi=pmi2 -K1 --multi-prog -m cyclic ./mpmd_srun.conf |
---|
40 | export machine_name=jeanzay |
---|
41 | export xios_dir=/gpfswork/rech/psl/rpsl954/xios/dev_trunk_omp |
---|
42 | export build_dir=build_prod |
---|
43 | |
---|
44 | # python user_config.py |
---|
45 | |
---|
46 | rm -f plein_report.txt |
---|
47 | echo -n "#revision " >> plein_report.txt |
---|
48 | svn info --show-item revision .. >> plein_report.txt |
---|
49 | # echo -n "#url " >> plein_report.txt |
---|
50 | # svn info --show-item url .. >> plein_report.txt |
---|
51 | echo -n "#relurl " >> plein_report.txt |
---|
52 | svn info --show-item relative-url .. >> plein_report.txt |
---|
53 | echo -n "#machine " >> plein_report.txt |
---|
54 | echo $machine_name >> plein_report.txt |
---|
55 | echo -n "#build_dir " >> plein_report.txt |
---|
56 | echo $build_dir >> plein_report.txt |
---|
57 | |
---|
58 | export arch_dir=$(readlink ../$build_dir/arch.fcm .. 2>&1) |
---|
59 | echo $arch_dir |
---|
60 | my_arch=$(echo $arch_dir | sed 's|.*/arch-||' | sed 's|\(.*\).fcm.*|\1|' 2>&1) |
---|
61 | echo $my_arch |
---|
62 | |
---|
63 | |
---|
64 | echo -n "#arch " >> plein_report.txt |
---|
65 | echo $my_arch >> plein_report.txt |
---|
66 | |
---|
67 | export xios_revision=$(svn info --show-item revision .. 2>&1) |
---|
68 | echo $xios_revision |
---|
69 | |
---|
70 | rm -f setup.sh |
---|
71 | touch setup.sh |
---|
72 | >setup.sh |
---|
73 | for i in $(ls -d test_*/) |
---|
74 | do |
---|
75 | cp setup.py ${i%%/} |
---|
76 | cp run_sub_test.sh ${i%%/} |
---|
77 | echo "bash -c \"cd " ${i%%/} " && python setup.py \" ">> setup.sh |
---|
78 | echo "echo \"setup.py called from " ${i%%/} "\"">> setup.sh |
---|
79 | done |
---|
80 | |
---|
81 | export output=$(python user_config.py 2>&1 >/dev/null) |
---|
82 | |
---|
83 | if [ "$output" -ne 0 ] |
---|
84 | then |
---|
85 | echo "user_config.py failed" |
---|
86 | exit |
---|
87 | else |
---|
88 | echo "user_config.py OK" |
---|
89 | fi |
---|
90 | |
---|
91 | |
---|
92 | cmake . |
---|
93 | ctest -V |
---|
94 | #ctest --output-on-failure |
---|
95 | make report |
---|
96 | |
---|
97 | #echo "Generic testcase report" | mailx -s "report" -a report.html yushan.wang@lsce.ipsl.fr |
---|
98 | |
---|
99 | rm -f test_*/setup.py |
---|
100 | rm -f test_*/run_sub_test.sh |
---|
101 | rm -f test_*/run_test_*.py |
---|
102 | rm -f test_*/CMakeLists.txt |
---|
103 | rm -f test_*/context_grid_dynamico.xml |
---|
104 | rm -f test_*/dynamico_grid.nc |
---|
105 | rm -f test_*/default_param.pyc |
---|
106 | rm -f test_*/user_param.pyc |
---|
107 | rm -f test_*/user_param.py.* |
---|
108 | |
---|
109 | |
---|
110 | #srun --mpi=pmi2 -K1 --multi-prog -m cyclic ./srun.conf |
---|
111 | #srun --mpi=pmi2 ../bin/test_client.exe |
---|
112 | |
---|
113 | #cp plein_report.txt ../Web/plein_report_$xios_revision.txt |
---|