source: XIOS/dev/dev_trunk_omp/src/test/test_remap_omp.f90 @ 1702

Last change on this file since 1702 was 1665, checked in by yushan, 5 years ago

MARK: branch merged with trunk @1660. Add option --omp to enable multithreading.

  • Property svn:executable set to *
File size: 9.0 KB
Line 
1PROGRAM test_remap_omp
2
3  USE xios
4  USE mod_wait
5  USE omp_lib
6  USE netcdf
7
8  IMPLICIT NONE
9  INCLUDE "mpif.h"
10  INTEGER :: rank
11  INTEGER :: size
12  INTEGER :: ierr
13
14  CHARACTER(len=*),PARAMETER :: id="client"
15  INTEGER :: comm
16  TYPE(xios_duration) :: dtime
17  TYPE(xios_context) :: ctx_hdl
18
19  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lon(:), dst_lon(:)
20  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lat(:), dst_lat(:)
21  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslon(:,:), dst_boundslon(:,:)
22  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslat(:,:), dst_boundslat(:,:)
23  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_2D(:)
24  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: tmp_field_0(:), tmp_field_1(:), tmp_field_2(:)
25  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_3D(:,:), src_field_4D(:,:,:), lval(:), lval1(:), lval2(:), src_field_pression(:,:)
26  LOGICAL,ALLOCATABLE :: src_mask_2D(:)
27  INTEGER :: src_ni_glo, dst_ni_glo;
28  INTEGER :: src_nvertex, dst_nvertex;
29  INTEGER :: src_ibegin, dst_ibegin;
30  INTEGER :: src_ni, dst_ni;
31  INTEGER :: src_tmp_ni, src_tmp_nj, src_tmp_n;
32  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: src_file="h14.nc"
33  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: dst_file="r180x90.nc"
34  INTEGER :: ncid
35  INTEGER :: dimids(2)
36  INTEGER :: div,remain
37  INTEGER :: varid
38  INTEGER :: ts
39  INTEGER :: i
40  INTEGER,PARAMETER :: llm=5, interpolatedLlm = 4, llm2 = 6
41  DOUBLE PRECISION, PARAMETER :: missing_value = 100000
42  INTEGER :: provided
43 
44  integer :: num_args, ix, nb_servers
45  character(len=12), dimension(:), allocatable :: args
46
47  num_args = command_argument_count()
48  if(num_args<1) then
49    print*, "please give the number of servers as argument."
50    call abort
51  endif
52
53  allocate(args(num_args))  ! I've omitted checking the return status of the allocation
54
55  do ix = 1, num_args
56    call get_command_argument(ix,args(ix))
57    ! now parse the argument as you wish
58  end do
59
60  READ(args(1),*) nb_servers
61
62  CALL MPI_INIT_THREAD(3, provided, ierr)
63    if(provided .NE. 3) then
64      print*, "provided thread level = ", provided
65      call MPI_Abort()
66    endif
67  CALL init_wait
68
69  CALL MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD,rank,ierr)
70  CALL MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD,size,ierr)
71  if(rank < size-nb_servers) then
72 
73  !$omp parallel default(firstprivate)
74
75!!! XIOS Initialization (get the local communicator)
76
77  CALL xios_initialize(id,return_comm=comm)
78  CALL MPI_COMM_RANK(comm,rank,ierr)
79  CALL MPI_COMM_SIZE(comm,size,ierr)
80 
81  rank = rank*omp_get_num_threads() + omp_get_thread_num()
82  size = size*omp_get_num_threads()
83
84  print*, "rank = ", rank, " size = ", size
85
86  !$omp critical (open_file)
87  ierr=NF90_OPEN(src_file, NF90_NOWRITE, ncid)
88  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
89  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
90  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=src_nvertex)
91  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=src_ni_glo)
92
93  div    = src_ni_glo/size
94  remain = MOD( src_ni_glo, size )
95  IF (rank < remain) THEN
96    src_ni=div+1 ;
97    src_ibegin=rank*(div+1) ;
98  ELSE
99    src_ni=div ;
100    src_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
101  ENDIF
102
103  ALLOCATE(src_lon(src_ni))
104  ALLOCATE(src_lat(src_ni))
105  ALLOCATE(src_boundslon(src_nvertex,src_ni))
106  ALLOCATE(src_boundslat(src_nvertex,src_ni))
107  ALLOCATE(src_field_2D(src_ni))
108  ALLOCATE(src_field_3D(src_ni,llm))
109  ALLOCATE(src_field_4D(src_ni,llm,llm2))
110  ALLOCATE(src_mask_2D(src_ni))
111  ALLOCATE(src_field_pression(src_ni,llm))
112  ALLOCATE(lval(llm))
113  ALLOCATE(lval1(interpolatedLlm))
114  ALLOCATE(lval2(llm2))
115  lval2 = 0
116  lval=0
117  lval1=0
118
119  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
120  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lon, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
121  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
122  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lat, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
123  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
124  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,src_boundslon, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
125  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
126  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_boundslat, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
127  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"val",varid)
128  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_field_2D, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
129  DO i=1,src_ni
130    src_field_3D(i,:) = src_field_2D(i)
131    IF (MOD(i,10)==0) THEN
132      src_mask_2D(i)=.FALSE.
133    ELSE
134      src_mask_2D(i)=.TRUE.
135    ENDIF
136  ENDDO
137
138  DO i=1,llm
139    lval(i) = i*100
140    src_field_pression(:,i) = i * 100
141    src_field_3D(:,i) = src_field_3D(:,i) + i * 10   
142  ENDDO
143
144  DO i=1,llm2
145    src_field_4D(:,:,i) = src_field_3D(:,:)
146  ENDDO
147
148  DO i=1,interpolatedLlm
149    lval2(i) = i*10
150    lval1(i) = i*10 + 2
151  ENDDO
152
153  print*, "ID = ", rank, "src_ni = ", src_ni, "src_nvertex = ", src_nvertex, "src_ni_glo = ", src_ni_glo
154
155  ierr=NF90_OPEN(dst_file, NF90_NOWRITE, ncid)
156  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
157  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
158  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=dst_nvertex)
159  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=dst_ni_glo)
160
161  div    = dst_ni_glo/size
162  remain = MOD( dst_ni_glo, size )
163  IF (rank < remain) THEN
164    dst_ni=div+1 ;
165    dst_ibegin=rank*(div+1) ;
166  ELSE
167    dst_ni=div ;
168    dst_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
169  ENDIF
170
171  ALLOCATE(dst_lon(dst_ni))
172  ALLOCATE(dst_lat(dst_ni))
173  ALLOCATE(dst_boundslon(dst_nvertex,dst_ni))
174  ALLOCATE(dst_boundslat(dst_nvertex,dst_ni))
175
176  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
177  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lon, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
178  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
179  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lat, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
180  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
181  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,dst_boundslon, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
182  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
183  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_boundslat, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
184 
185  !$omp end critical (open_file)
186 
187  !$omp barrier
188
189  !$omp master
190  CALL MPI_barrier(comm, ierr)
191  !$omp end master
192
193  !$omp barrier
194
195  CALL xios_context_initialize("test",comm)
196  CALL xios_get_handle("test",ctx_hdl)
197  CALL xios_set_current_context(ctx_hdl)
198
199  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
200  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
201                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex)
202
203  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
204  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
205                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex, &
206                            mask_1d=src_mask_2D)
207
208  CALL xios_set_axis_attr("src_axis", n_glo=llm, value=lval)
209  CALL xios_set_axis_attr("nq", n_glo=llm2, value=lval2)
210
211  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", ni_glo=dst_ni_glo, ibegin=dst_ibegin, ni=dst_ni, type="unstructured")
212  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", lonvalue_1D=dst_lon, latvalue_1D=dst_lat, &
213                            bounds_lon_1D=dst_boundslon, bounds_lat_1D=dst_boundslat, nvertex=dst_nvertex)
214
215  dtime%second = 3600
216  CALL xios_set_timestep(dtime)
217
218  CALL xios_close_context_definition()
219  print *, "xios_close_context_definition OK "
220 
221  CALL xios_get_domain_attr("src_domain_regular_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
222  ALLOCATE(tmp_field_0(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
223
224  !CALL xios_get_axis_attr("src_axis_curvilinear_read", n=src_tmp_n)
225  !CALL xios_get_domain_attr("src_domain_curvilinear_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
226  !ALLOCATE(tmp_field_1(src_tmp_ni*src_tmp_nj*src_tmp_n))
227
228  !CALL xios_get_domain_attr("src_domain_unstructured_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
229  !ALLOCATE(tmp_field_2(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
230
231  DO ts=1,1
232    CALL xios_recv_field("src_field_regular", tmp_field_0)
233    !CALL xios_recv_field("src_field_curvilinear", tmp_field_1)
234    !CALL xios_recv_field("src_field_unstructured", tmp_field_2)
235    CALL xios_update_calendar(ts)
236    CALL xios_send_field("src_field_2D",src_field_2D)
237    CALL xios_send_field("src_field_2D_clone",src_field_2D)
238    CALL xios_send_field("src_field_3D",src_field_3D)
239    !CALL xios_send_field("src_field_4D",src_field_4D)
240    !CALL xios_send_field("src_field_3D_pression",src_field_pression)
241    CALL xios_send_field("tmp_field_0",tmp_field_0)
242    !CALL xios_send_field("tmp_field_1",tmp_field_1)
243    !CALL xios_send_field("tmp_field_2",tmp_field_2)
244    CALL wait_us(5000) ;
245   ENDDO
246
247  CALL xios_context_finalize()
248
249  DEALLOCATE(src_lon, src_lat, src_boundslon,src_boundslat, src_field_2D)
250  DEALLOCATE(dst_lon, dst_lat, dst_boundslon,dst_boundslat)
251  ! DEALLOCATE(tmp_field_0, tmp_field_1, tmp_field_2)
252 
253  CALL xios_finalize() 
254  print *, "Client : xios_finalize OK", rank, size
255 
256  !$omp barrier
257
258  !$omp master
259  CALL MPI_COMM_FREE(comm, ierr)
260  !$omp end master
261
262  !$omp barrier
263
264  !$omp end parallel
265 
266  else
267
268    CALL xios_init_server
269    print *, "Server : xios_finalize ", rank
270 
271  endif
272
273 
274
275  CALL MPI_FINALIZE(ierr)
276
277END PROGRAM test_remap_omp
278
279
280
281
282
283
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.