source: XIOS/dev/dev_ym/XIOS_COUPLING/src/node/file.hpp @ 2326

Last change on this file since 2326 was 2326, checked in by ymipsl, 2 years ago

Fix Deadlock from reading phase.
YM

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
File size: 7.8 KB
RevLine 
[591]1#ifndef __XIOS_CFile__
2#define __XIOS_CFile__
[219]3
[591]4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
[219]6#include "field.hpp"
[300]7#include "data_output.hpp"
[599]8#include "data_input.hpp"
[219]9#include "declare_group.hpp"
[318]10#include "date.hpp"
[369]11#include "attribute_enum.hpp"
12#include "attribute_enum_impl.hpp"
[1021]13#include "context_client.hpp"
[382]14#include "mpi.hpp"
[219]15
[335]16namespace xios {
[509]17
[219]18   /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
19
20   class CFileGroup;
21   class CFileAttributes;
22   class CFile;
23
[640]24   class CGarbageCollector;
25
[219]26   ///--------------------------------------------------------------
27
28   // Declare/Define CFileAttribute
29   BEGIN_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CFile)
30#  include "file_attribute.conf"
31   END_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CFile)
32
33   ///--------------------------------------------------------------
34
[509]35   /*!
36   \class CFile
37   This class corresponds to file component of the xml.
38   The class contains all the nessceary information to write data into a netcdf file: The most important thing
39   is the field(s) which will be written into file. Besides, there are some options to write
40   data into file, e.g: writting into only one file or multiple file; splitting a running into several files.
41   Moreover, there are some other attributes of netcdf file which are also stored in this class
42   */
[219]43   class CFile
44      : public CObjectTemplate<CFile>
45      , public CFileAttributes
46   {
47         /// typedef ///
48         typedef CObjectTemplate<CFile>   SuperClass;
49         typedef CFileAttributes SuperClassAttribute;
[509]50
[219]51      public :
[300]52         enum EEventId
53         {
[2326]54           EVENT_ID_COLLECTIVE=100,
[651]55           EVENT_ID_ADD_FIELD, EVENT_ID_ADD_FIELD_GROUP, EVENT_ID_ADD_VARIABLE,
[2326]56           EVENT_ID_ADD_VARIABLE_GROUP, EVENT_ID_CREATE_ENABLED_FIELDS,
57           EVENT_ID_NO_COLLECTIVE=1000,
[651]58         };
[509]59
[219]60         typedef CFileAttributes RelAttributes;
61         typedef CFileGroup      RelGroup;
62
63         /// Constructeurs ///
64         CFile(void);
[651]65         explicit CFile(const StdString& id);
66         CFile(const CFile& file);       // Not implemented yet.
67         CFile(const CFile* const file); // Not implemented yet.
[219]68
[509]69         /// Destructeur ///
70         virtual ~CFile(void);
71
72      public:
[219]73         /// Accesseurs ///
[1158]74         const StdString getFileOutputName(void) const;
[1542]75         std::shared_ptr<CDataOutput> getDataOutput(void) const;
76         std::shared_ptr<CDataInput> getDataInput(void) const;
[347]77         CFieldGroup* getVirtualFieldGroup(void) const;
[472]78         CVariableGroup* getVirtualVariableGroup(void) const;
[347]79         std::vector<CField*> getAllFields(void) const;
[472]80         std::vector<CVariable*> getAllVariables(void) const;
[219]81
[347]82         std::vector<CField* > getEnabledFields(int default_outputlevel = 5,
83                                                int default_level = 1,
84                                                bool default_enabled = true);
[219]85
[1622]86         StdString dumpClassAttributes(void);
87
[219]88      public :
[509]89         // Some functions to verify state of file
[651]90         bool isSyncTime(void);
91         bool checkSplit(void);
92         bool checkSync(void);
[1136]93         void checkWriteFile(void);
94         void checkReadFile(void);
[1232]95         void initWrite(void);
96         void initRead(void);
97         bool isEmptyZone();
[219]98
99         /// Mutateurs ///
[509]100         // Set some root definitions in a file
[347]101         void setVirtualFieldGroup(CFieldGroup* newVFieldGroup);
[472]102         void setVirtualVariableGroup(CVariableGroup* newVVariableGroup);
[509]103
[300]104         void createHeader(void);
[1232]105         void openInReadMode(void);
[651]106         void close(void);
[775]107         void readAttributesOfEnabledFieldsInReadMode();
[1871]108         void readFieldAttributesMetaData(CField* field) ;
109         void readFieldAttributesValues(CField* field) ;
[509]110         // Some processing on file
[445]111         void solveFieldRefInheritance(bool apply);
[651]112         void processEnabledFile(void);
[1129]113         
[1358]114         void postProcessFilterGraph();
[598]115         void prefetchEnabledReadModeFields();
[1358]116         void doPreTimestepOperationsForEnabledReadModeFields();
[1318]117         void doPostTimestepOperationsForEnabledReadModeFields();
[219]118
[1025]119         void checkGridOfEnabledFields();
120         void sendGridOfEnabledFields();
[1494]121         void sendGridComponentOfEnabledFields();
[1025]122
[1494]123         void sortEnabledFieldsForUgrid();
124
[509]125         // Add component into file
[651]126         CField* addField(const string& id = "");
127         CFieldGroup* addFieldGroup(const string& id = "");
128         CVariable* addVariable(const string& id = "");
129         CVariableGroup* addVariableGroup(const string& id = "");
[1021]130         void setContextClient(CContextClient* newContextClient);
131         CContextClient* getContextClient();
[509]132
[1232]133         void setReadContextClient(CContextClient* newContextClient);
134         CContextClient* getReadContextClient();
135
[1144]136         // Send info to server         
137         void sendEnabledFields(CContextClient* client);         
138         void sendAddField(const string& id, CContextClient* client);         
139         void sendAddFieldGroup(const string& id, CContextClient* client);                           
[1021]140         void sendAddVariable(const string& id, CContextClient* client);
[1132]141         void sendAddVariableGroup(const string& id, CContextClient* client);
[1144]142         void sendAddAllVariables(CContextClient* client);
[1870]143      public:
144         void sendFileToFileServer(CContextClient* client) ;
145      private:
146         std::set<CContextClient*> sendFileToFileServer_done_ ;
147
148      public:
[509]149         // Receive info from client
[651]150         static void recvAddField(CEventServer& event);
151         void recvAddField(CBufferIn& buffer);
152         static void recvAddFieldGroup(CEventServer& event);
153         void recvAddFieldGroup(CBufferIn& buffer);
154         static void recvAddVariable(CEventServer& event);
155         void recvAddVariable(CBufferIn& buffer);
156         static void recvAddVariableGroup(CEventServer& event);
157         void recvAddVariableGroup(CBufferIn& buffer);
[509]158
159         // Dispatch event
[651]160         static bool dispatchEvent(CEventServer& event);
[509]161
162      public:
163         /// Accesseurs statiques ///
164         static StdString GetName(void);
165         static StdString GetDefName(void);
166
167         static ENodeType GetType(void);
168      public:
169         /// Traitements ///
[651]170         virtual void solveDescInheritance(bool apply, const CAttributeMap* const parent = 0);
[509]171
172          /// Autres ///
[651]173         virtual void parse(xml::CXMLNode& node);
[509]174         virtual StdString toString(void) const;
175      public:
176
[651]177         CDate lastSync;
178         CDate lastSplit;
[1961]179         
180         const CDate& getLastSplit(void) { return lastSplit ; }
181       
[609]182         int nbAxis, nbDomains;
[1232]183         bool isOpen;         
[1639]184         MPI_Comm fileComm;
[509]185
[1232]186      private:
187         void createSubComFile();
188         bool checkRead;
189         bool allZoneEmpty;
190         
[219]191      private :
192         /// Propriétés privées ///
[1054]193         CContextClient* client;
[1232]194         CContextClient* read_client; // Context client for reading (channel between server 1 and client)
[347]195         CFieldGroup* vFieldGroup;
[651]196         CVariableGroup* vVariableGroup;
[1542]197         std::shared_ptr<CDataOutput> data_out;
198         std::shared_ptr<CDataInput> data_in;
[347]199         std::vector<CField*> enabledFields;
[219]200
[1871]201       private: 
202         bool isClientSide_ ; // the file is on client side or on server side ?
203       public:
204         bool isClientSide(void) { return isClientSide_ ;}
205         bool isServerSide(void) { return !isClientSide_ ;}
206         void setClientSide(void) { isClientSide_=true ;}
207         void setServerSide(void) { isClientSide_=false ;}
208       
209       private:
[1232]210
[1871]211
[509]212      public:
[651]213        //         virtual void toBinary  (StdOStream& os) const;
214        //         virtual void fromBinary(StdIStream& is);
[509]215
[219]216   }; // class CFile
217
218   ///--------------------------------------------------------------
219
220   // Declare/Define CFileGroup and CFileDefinition
221   DECLARE_GROUP(CFile);
222
223   ///--------------------------------------------------------------
224
[335]225} // namespace xios
[219]226
[591]227#endif // __XIOS_CFile__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.