source: XIOS/trunk/src/input/inetcdf4.hpp @ 314

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Préparation nouvelle arborescence
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Line 
1#ifndef __XMLIO_INETCDF4__
2#define __XMLIO_INETCDF4__
3
4/// xmlioserver headers ///
5#include "xmlioserver_spl.hpp"
6#include "exception.hpp"
7#include "array.hpp"
8
9#include <mpi.h>
10#define MPI_INCLUDED
11#include <netcdf.h>
12
13#ifndef UNLIMITED_DIM
14   #define UNLIMITED_DIM (size_t)(-1)
15#endif  //UNLIMITED_DIM
16
17namespace xmlioserver
18{
19   namespace io
20   {
21      /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
22      typedef std::vector<StdString> CVarPath;
23
24      class CINetCDF4
25      {
26         public :
27
28            /// Constructeurs ///
29            CINetCDF4(void);                             // Not implemented.
30            CINetCDF4(const StdString & filename);
31            CINetCDF4(const CINetCDF4 & inetcdf4);       // Not implemented.
32            CINetCDF4(const CINetCDF4 * const inetcdf4); // Not implemented.
33
34         //-------------------------------------------------------------
35
36            /// Accesseurs ///
37            StdSize getNbOfTimestep(const CVarPath  * const path = NULL);
38
39            StdString getUnlimitedDimensionName(const CVarPath  * const path = NULL);
40
41            StdString getCoordinatesId(const StdString & name,
42                                       const CVarPath  * const path = NULL);
43
44            StdString getBoundsId(const StdString & name,
45                                  const CVarPath  * const path = NULL);
46
47            StdString getLonCoordName(const StdString & varname,
48                                      const CVarPath  * const path = NULL);
49            StdString getLatCoordName(const StdString & varname,
50                                       const CVarPath  * const path = NULL);
51            StdString getVertCoordName(const StdString & varname,
52                                       const CVarPath  * const path = NULL);
53
54            std::set<StdString> getCoordVariables(const CVarPath * const path = NULL);
55            std::set<StdString> getBoundVariables(const CVarPath * const path = NULL);
56
57            std::list<StdString> getGroups   (const CVarPath * const path = NULL);
58            std::list<StdString> getVariables(const CVarPath * const path = NULL);
59
60            std::list<StdString> getDataVariables(bool _is3D       = true,
61                                                  bool _isRecti    = true,
62                                                  bool _isCurvi    = true,
63                                                  bool _isUnstr    = true,
64                                                  bool _isCellData = true,
65                                                  bool _isTemporal = true,
66                                                  const CVarPath * const path = NULL);
67
68            std::list<StdString> getAttributes
69                                (const StdString * const var  = NULL,
70                                 const CVarPath  * const path = NULL);
71
72            std::list<StdString> getDimensionsList
73                                (const StdString * const var  = NULL,
74                                 const CVarPath  * const path = NULL);
75
76            std::list<StdString> getCoordinatesIdList(const StdString & name,
77                                                      const CVarPath  * const path = NULL);
78
79            std::map<StdString, StdSize> getDimensions (const StdString * const var  = NULL,
80                                                        const CVarPath  * const path = NULL);
81
82            StdSize getNbVertex(const StdString & name,
83                                const CVarPath  * const path = NULL);
84         //-------------------------------------------------------------
85
86            template <class T>
87               T getMissingValue(const StdString & name,
88                                 const CVarPath  * const path = NULL);
89
90            template <class T>
91               T getAttributeValue(const StdString & name,
92                                   const StdString * const var  = NULL,
93                                   const CVarPath  * const path = NULL);
94
95            template <class T>
96               void getData(ARRAY(T, 1) data,
97                            const StdString & var,
98                            const CVarPath  * const path = NULL,
99                            StdSize record   = UNLIMITED_DIM);
100
101         //-------------------------------------------------------------
102
103            /// Tests ///
104            bool hasMissingValue(const StdString & name,
105                                 const CVarPath  * const path = NULL);
106
107            bool hasAttribute(const StdString & name,
108                              const StdString * const var  = NULL,
109                              const CVarPath  * const path = NULL);
110
111            bool hasVariable(const StdString & name,
112                             const CVarPath  * const path = NULL);
113
114            bool hasCoordinates(const StdString & name,
115                                const CVarPath  * const path = NULL);
116
117            bool hasTemporalDim(const CVarPath  * const path = NULL);
118
119            bool hasBounds(const StdString & name,
120                           const CVarPath  * const path = NULL);
121
122         //-------------------------------------------------------------
123
124            bool isBound(const StdString & name,
125                         const CVarPath  * const path = NULL);
126            bool isCoordinate(const StdString & name,
127                              const CVarPath  * const path = NULL);
128            bool isRectilinear(const StdString & name,
129                               const CVarPath  * const path = NULL);
130            bool isCurvilinear(const StdString & name,
131                               const CVarPath  * const path = NULL);
132            bool isUnknown(const StdString & name,
133                               const CVarPath  * const path = NULL);
134            bool isUnstructured(const StdString & name,
135                                const CVarPath  * const path = NULL);
136
137            bool isTemporal(const StdString & name,
138                            const CVarPath  * const path = NULL);
139            bool is3Dim(const StdString & name,
140                        const CVarPath  * const path = NULL);
141            bool isCellGrid(const StdString & name,
142                            const CVarPath  * const path = NULL);
143
144         //-------------------------------------------------------------
145
146            /// Destructeur ///
147            virtual ~CINetCDF4(void);
148
149         protected :
150
151         //-------------------------------------------------------------
152
153            /// Accesseurs ///
154            int getGroup   (const CVarPath * const path = NULL);
155            int getVariable(const StdString & varname,
156                            const CVarPath * const path = NULL);
157            int getDimension(const StdString & dimname,
158                             const CVarPath  * const path = NULL);
159            int getUnlimitedDimension(const CVarPath  * const path = NULL);
160            int getAttributeId(const StdString & name,
161                               const StdString * const var  = NULL,
162                               const CVarPath  * const path = NULL);
163
164            std::pair<nc_type , StdSize> getAttribute(const StdString & attname,
165                                                      const StdString * const var  = NULL,
166                                                      const CVarPath  * const path = NULL);
167
168         //-------------------------------------------------------------
169
170            void getDataInfo(const StdString & var, const CVarPath  * const path, StdSize record,
171                             std::vector<StdSize> & start, std::vector<StdSize> & count,
172                             StdSize & array_size);
173
174         private :
175
176            /// Vérification des erreurs NetCDF ///
177            static void CheckError(int status);
178
179            int ncidp; // Identifiant de fichier netcdf.
180
181      }; // class CINetCDF4
182
183      ///--------------------------------------------------------------
184      template <>
185         StdString CINetCDF4::getAttributeValue
186            (const StdString & name, const StdString * const var,
187                                     const CVarPath  * const path);
188
189      template <>
190         std::vector<double> CINetCDF4::getAttributeValue
191            (const StdString & name, const StdString * const var,
192                                     const CVarPath  * const path);
193
194      template <>
195         std::vector<float> CINetCDF4::getAttributeValue
196            (const StdString & name, const StdString * const var,
197                                     const CVarPath  * const path);
198
199      template <>
200         std::vector<int>  CINetCDF4::getAttributeValue
201            (const StdString & name, const StdString * const var,
202                                     const CVarPath  * const path);
203
204      template <>
205         std::vector<char>  CINetCDF4::getAttributeValue
206            (const StdString & name, const StdString * const var,
207                                     const CVarPath  * const path);
208
209      //---------------------------------------------------------------
210      template <>
211         int CINetCDF4::getMissingValue
212            (const StdString & name, const CVarPath  * const path);
213
214      template <>
215         double CINetCDF4::getMissingValue
216            (const StdString & name, const CVarPath  * const path);
217
218      template <>
219         float CINetCDF4::getMissingValue
220            (const StdString & name, const CVarPath  * const path);
221
222      //---------------------------------------------------------------
223      template <>
224         void CINetCDF4::getData(ARRAY(int, 1) data, const StdString & var,
225                                 const CVarPath  * const path, StdSize record);
226
227      template <>
228         void CINetCDF4::getData(ARRAY(double, 1) data, const StdString & var,
229                                 const CVarPath  * const path, StdSize record);
230
231      template <>
232         void CINetCDF4::getData(ARRAY(float, 1) data, const StdString & var,
233                                 const CVarPath  * const path, StdSize record);
234      ///--------------------------------------------------------------
235
236   } // namespace io
237} // namespace xmlioserver
238
239#endif //__XMLIO_INETCDF4__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.