source: XIOS/trunk/src/node/axis.hpp @ 821

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Making some improvements of transformation algorithm

+) Correct the way to enlisting transformations in an element (domain, axis)
+) Optimize generic transformation to make sure temporary grid to be created on demand
+) Update some mpi tag to prevent conflict
+) Correct some minor stuffs
+) Update documents

Test
+) On Curie
+) all test pass

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:executable set to *
File size: 6.3 KB
Line 
1#ifndef __XIOS_CAxis__
2#define __XIOS_CAxis__
3
4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
6#include "group_factory.hpp"
7#include "virtual_node.hpp"
8
9#include "declare_group.hpp"
10#include "declare_ref_func.hpp"
11#include "declare_virtual_node.hpp"
12#include "attribute_array.hpp"
13#include "attribute_enum.hpp"
14#include "attribute_enum_impl.hpp"
15#include "server_distribution_description.hpp"
16#include "transformation.hpp"
17#include "transformation_enum.hpp"
18
19namespace xios {
20   /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
21
22   class CAxisGroup;
23   class CAxisAttributes;
24   class CAxis;
25
26   ///--------------------------------------------------------------
27
28   // Declare/Define CAxisAttribute
29   BEGIN_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CAxis)
30#  include "axis_attribute.conf"
31#  include "axis_attribute_private.conf"
32   END_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CAxis)
33
34   ///--------------------------------------------------------------
35
36   class CAxis
37      : public CObjectTemplate<CAxis>
38      , public CAxisAttributes
39   {
40         enum EEventId
41         {
42           EVENT_ID_SERVER_ATTRIBUT,
43           EVENT_ID_INDEX,
44           EVENT_ID_DISTRIBUTED_VALUE,
45           EVENT_ID_NON_DISTRIBUTED_VALUE
46         } ;
47
48         /// typedef ///
49         typedef CObjectTemplate<CAxis>   SuperClass;
50         typedef CAxisAttributes SuperClassAttribute;
51
52      public :
53
54         typedef CAxisAttributes RelAttributes;
55         typedef CAxisGroup      RelGroup;
56         typedef CTransformation<CAxis>::TransformationMapTypes TransMapTypes;
57
58      public:
59         /// Constructeurs ///
60         CAxis(void);
61         explicit CAxis(const StdString & id);
62         CAxis(const CAxis & axis);       // Not implemented yet.
63         CAxis(const CAxis * const axis); // Not implemented yet.
64
65         static CAxis* createAxis();
66
67         /// Accesseurs ///
68         const std::set<StdString> & getRelFiles(void) const;
69
70         const std::vector<int>& getIndexesToWrite(void) const;
71         int getNumberWrittenIndexes() const;
72         int getTotalNumberWrittenIndexes() const;
73         int getOffsetWrittenIndexes() const;
74
75         std::map<int, StdSize> getAttributesBufferSize();
76
77         /// Test ///
78         bool IsWritten(const StdString & filename) const;
79         bool isWrittenCompressed(const StdString& filename) const;
80         bool isDistributed(void) const;
81         bool isCompressible(void) const;
82
83         /// Mutateur ///
84         void addRelFile(const StdString & filename);
85         void addRelFileCompressed(const StdString& filename);
86
87         /// Vérifications ///
88         void checkAttributes(void);
89
90         /// Destructeur ///
91         virtual ~CAxis(void);
92
93         virtual void parse(xml::CXMLNode & node);
94
95         /// Accesseurs statiques ///
96         static StdString GetName(void);
97         static StdString GetDefName(void);
98         static ENodeType GetType(void);
99
100         void sendServerAttribut(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
101                                 CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
102         static bool dispatchEvent(CEventServer& event);
103         static void recvServerAttribut(CEventServer& event);
104         void recvServerAttribut(CBufferIn& buffer) ;
105         void checkAttributesOnClient();
106         void sendCheckedAttributes(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
107                                    CServerDistributionDescription::ServerDistributionType disType = CServerDistributionDescription::BAND_DISTRIBUTION);
108
109         void checkEligibilityForCompressedOutput();
110
111         bool hasTransformation();
112         void solveInheritanceTransformation();
113         TransMapTypes getAllTransformations();
114         void fillInValues(const CArray<double,1>& values);
115
116      public:
117        int zoom_begin_srv, zoom_end_srv, zoom_size_srv;
118        int ni_srv, begin_srv, end_srv;
119        CArray<double,1> value_srv;
120        CArray<double,2> bound_srv;
121        bool hasValue;
122
123      private:
124         void checkData();
125         void checkMask();
126         void checkZoom();
127         void checkBounds();
128         void checkTransformations();
129         void computeServerIndex(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
130                                 CServerDistributionDescription::ServerDistributionType disType);
131         void sendValue(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
132                        CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
133         void computeConnectedServer(const std::vector<int>& globalDim, int orderPositionInGrid,
134                                     CServerDistributionDescription::ServerDistributionType distType);
135         void sendDistributedValue();
136         void sendNonDistributedValue();
137
138         static void recvIndex(CEventServer& event);
139         static void recvDistributedValue(CEventServer& event);
140         static void recvNonDistributedValue(CEventServer& event);
141         void recvIndex(int rank, CBufferIn& buffer);
142         void recvDistributedValue(int rank, CBufferIn& buffer);
143         void recvNonDistributedValue(int rank, CBufferIn& buffer);
144
145         void setTransformations(const TransMapTypes&);
146
147      private:
148         bool isChecked;
149         bool areClientAttributesChecked_;
150         std::set<StdString> relFiles, relFilesCompressed;
151         TransMapTypes transformationMap_;
152         bool isDistributed_;
153         //! True if and only if the data defined on the axis can be outputted in a compressed way
154         bool isCompressible_;
155         std::map<int,int> nbConnectedClients_; // Mapping of number of communicating client to a server
156         std::map<int, vector<size_t> > indSrv_; // Global index of each client sent to server
157         std::map<int, vector<int> > indWrittenSrv_; // Global written index of each client sent to server
158         std::vector<int> indexesToWrite;
159         int numberWrittenIndexes_, totalNumberWrittenIndexes_, offsetWrittenIndexes_;
160         std::vector<int> connectedServerRank_;
161         std::map<int, CArray<int,1> > indiSrv_;
162         bool hasBounds_;
163         DECLARE_REF_FUNC(Axis,axis)
164   }; // class CAxis
165
166   ///--------------------------------------------------------------
167
168   // Declare/Define CAxisGroup and CAxisDefinition
169   DECLARE_GROUP(CAxis);
170} // namespace xios
171
172#endif // __XIOS_CAxis__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.