source: XIOS/trunk/src/node/domain.hpp @ 1131

Last change on this file since 1131 was 1106, checked in by mhnguyen, 7 years ago

Fixing bug of referencing to an object.

+) From now on, two objects of a same grid element (domain, axis, scalar) are equal if
they have the same non-empty attributes and the same transformations.
(This is very common case with inheritance by *_ref).

Test
+) On Curie
+) Ok with toy_cmip6

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
File size: 8.1 KB
RevLine 
[591]1#ifndef __XIOS_CDomain__
2#define __XIOS_CDomain__
[219]3
[591]4/// XIOS headers ///
5#include "xios_spl.hpp"
[219]6#include "group_factory.hpp"
7
8#include "declare_group.hpp"
[540]9#include "declare_ref_func.hpp"
[300]10#include "event_client.hpp"
11#include "event_server.hpp"
12#include "buffer_in.hpp"
[369]13#include "array_new.hpp"
14#include "attribute_array.hpp"
[449]15#include "attribute_enum.hpp"
[631]16#include "transformation.hpp"
17#include "transformation_enum.hpp"
[219]18
[878]19#include "mesh.hpp"
20
[335]21namespace xios {
[509]22
[219]23   /// ////////////////////// Déclarations ////////////////////// ///
24
25   class CDomainGroup;
26   class CDomainAttributes;
27   class CDomain;
[878]28   class CFile;
[219]29
30   ///--------------------------------------------------------------
31
32   // Declare/Define CDomainAttribute
33   BEGIN_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CDomain)
34#  include "domain_attribute.conf"
[775]35#  include "domain_attribute_private.conf"
[219]36   END_DECLARE_ATTRIBUTE_MAP(CDomain)
37
38   ///--------------------------------------------------------------
39
40   class CDomain
41      : public CObjectTemplate<CDomain>
42      , public CDomainAttributes
43   {
[878]44
[300]45         enum EEventId
46         {
[611]47           EVENT_ID_SERVER_ATTRIBUT, EVENT_ID_INDEX, EVENT_ID_LON, EVENT_ID_LAT, EVENT_ID_AREA
[300]48         } ;
[509]49
[219]50         /// typedef ///
51         typedef CObjectTemplate<CDomain>   SuperClass;
52         typedef CDomainAttributes SuperClassAttribute;
53
[676]54      public:
[219]55
56         typedef CDomainAttributes RelAttributes;
57         typedef CDomainGroup      RelGroup;
[631]58         typedef CTransformation<CDomain>::TransformationMapTypes TransMapTypes;
[219]59
60         /// Constructeurs ///
61         CDomain(void);
62         explicit CDomain(const StdString & id);
63         CDomain(const CDomain & domain);       // Not implemented yet.
64         CDomain(const CDomain * const domain); // Not implemented yet.
65
[622]66         static CDomain* createDomain();
[878]67         
68         CMesh* mesh;
[924]69         void assignMesh(const StdString, const int);
[878]70       
[631]71         virtual void parse(xml::CXMLNode & node);
72
[219]73         /// Vérifications ///
74         void checkAttributes(void);
75
[509]76         void checkAttributesOnClient();
[657]77         void checkAttributesOnClientAfterTransformation();
[509]78
[676]79         void checkEligibilityForCompressedOutput(void);
80
[509]81         void sendCheckedAttributes();
82
[631]83         bool hasTransformation();
84         void solveInheritanceTransformation();
85         TransMapTypes getAllTransformations();
[687]86         void redistribute(int nbLocalDomain);
[823]87         void duplicateTransformation(CDomain*);
[836]88         CTransformation<CDomain>* addTransformation(ETranformationType transType, const StdString& id="");
[631]89
[676]90      public:
[219]91         const std::set<StdString> & getRelFiles(void) const;
92         bool IsWritten(const StdString & filename) const;
[676]93         bool isWrittenCompressed(const StdString& filename) const;
94
95         const std::vector<int>& getIndexesToWrite(void) const;
96         int getNumberWrittenIndexes() const;
97         int getTotalNumberWrittenIndexes() const;
98         int getOffsetWrittenIndexes() const;
99
[731]100         std::map<int, StdSize> getAttributesBufferSize();
101
[219]102         bool isEmpty(void) const;
[594]103         bool isDistributed(void) const;
[676]104         bool isCompressible(void) const;
[1064]105         bool distributionAttributesHaveValue() const;
[509]106
[300]107         int ni_srv,ibegin_srv,iend_srv ;
108         int zoom_ni_srv,zoom_ibegin_srv,zoom_iend_srv ;
109
110         int nj_srv,jbegin_srv,jend_srv ;
111         int zoom_nj_srv,zoom_jbegin_srv,zoom_jend_srv ;
112
[369]113         CArray<double, 1> lonvalue_srv, latvalue_srv ;
[449]114         CArray<double, 2> bounds_lon_srv, bounds_lat_srv ;
[664]115         CArray<double, 1> lonvalue_client, latvalue_client;
116         CArray<double, 2> bounds_lon_client, bounds_lat_client;
[611]117         CArray<double, 1> area_srv;
[509]118
119        vector<int> connectedServer ; // list of connected server
[467]120        vector<int> nbSenders ; // for each communication with a server, number of communicating client
[509]121        vector<int> nbDataSrv ; // size of data to send to each server
[467]122        vector< vector<int> > i_indSrv ; // for each server, i global index to send
123        vector< vector<int> > j_indSrv ; // for each server, j global index to send
[509]124
[1078]125         std::vector<int> getNbGlob();
[1106]126         bool isEqual(CDomain* domain);
[676]127      public:
[219]128         /// Mutateur ///
129         void addRelFile(const StdString & filename);
[676]130         void addRelFileCompressed(const StdString& filename);
[266]131         void completeLonLatClient(void);
[300]132         void sendServerAttribut(void) ;
[611]133         void sendLonLatArea(void);
[300]134         void computeConnectedServer(void) ;
[1106]135         void computeLocalMask(void) ;
136         
[821]137         void AllgatherRectilinearLonLat(CArray<double,1>& lon, CArray<double,1>& lat,
[809]138                                         CArray<double,1>& lon_g, CArray<double,1>& lat_g);
[821]139
140         void fillInRectilinearBoundLonLat(CArray<double,1>& lon, CArray<double,1>& lat,
[809]141                                           CArray<double,2>& boundsLon, CArray<double,2>& boundsLat);
[1064]142         
143         void fillInLonLat();
[611]144
[610]145         static bool dispatchEvent(CEventServer& event);
146         static void recvServerAttribut(CEventServer& event);
147         static void recvIndex(CEventServer& event);
148         static void recvLon(CEventServer& event);
149         static void recvLat(CEventServer& event);
[611]150         static void recvArea(CEventServer& event);
[610]151         void recvServerAttribut(CBufferIn& buffer);
152         void recvIndex(int rank, CBufferIn& buffer);
153         void recvLon(int rank, CBufferIn& buffer);
154         void recvLat(int rank, CBufferIn& buffer);
[611]155         void recvArea(int rank, CBufferIn& buffer);
[509]156
[219]157         /// Destructeur ///
158         virtual ~CDomain(void);
159
160         /// Accesseurs statiques ///
161         static StdString GetName(void);
162         static StdString GetDefName(void);
[509]163
[219]164         static ENodeType GetType(void);
[657]165         const std::map<int, vector<size_t> >& getIndexServer() const;
[893]166         CArray<bool, 1> localMask;
[384]167         bool isCurvilinear ;
[449]168         bool hasBounds ;
[611]169         bool hasArea;
[665]170         bool hasLonLat;
[953]171         bool hasPole ;
172
[631]173      private:
[667]174         void checkDomain(void);
175         void checkLocalIDomain(void);
176         void checkLocalJDomain(void);
177
178         void checkMask(void);
179         void checkDomainData(void);
180         void checkCompression(void);
181
182         void checkBounds(void);
183         void checkArea(void);
184         void checkLonLat();
[1106]185         void checkZoom(void);   
186         
[631]187         void setTransformations(const TransMapTypes&);
[657]188         void computeNGlobDomain();
[631]189
[665]190         void sendIndex();
191         void sendArea();
192         void sendLonLat();
193
[1064]194         void fillInRectilinearLonLat();
195         void fillInCurvilinearLonLat();
196         void fillInUnstructuredLonLat();
[676]197       private:
[219]198         bool isChecked;
[676]199         std::set<StdString> relFiles, relFilesCompressed;
[551]200         bool isClientChecked; // Verify whether all attributes of domain on the client side are good
[657]201         bool isClientAfterTransformationChecked;
[610]202         std::map<int, CArray<int,1> > indiSrv, indjSrv;
[553]203         std::map<int,int> nbConnectedClients_; // Mapping of number of communicating client to a server
204         std::map<int, vector<size_t> > indSrv_; // Global index of each client sent to server
[676]205         std::map<int, vector<int> > indWrittenSrv_; // Global written index of each client sent to server
206         std::vector<int> indexesToWrite;
207         int numberWrittenIndexes_, totalNumberWrittenIndexes_, offsetWrittenIndexes_;
[584]208         std::vector<int> connectedServerRank_;
[594]209         bool isDistributed_;
[676]210         //! True if and only if the data defined on the domain can be outputted in a compressed way
211         bool isCompressible_;
[715]212         bool isRedistributed_;
[1078]213         TransMapTypes transformationMap_;         
[657]214         bool isUnstructed_;
[953]215       
[836]216       private:
217         static bool initializeTransformationMap(std::map<StdString, ETranformationType>& m);
218         static std::map<StdString, ETranformationType> transformationMapList_;
219         static bool _dummyTransformationMapList;
220
[540]221         DECLARE_REF_FUNC(Domain,domain)
222
[219]223   }; // class CDomain
224
225   ///--------------------------------------------------------------
226
227   // Declare/Define CDomainGroup and CDomainDefinition
228   DECLARE_GROUP(CDomain);
229
230   ///--------------------------------------------------------------
231
[335]232} // namespace xios
[219]233
[878]234#endif //__XIOS_CDomain__
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.