source: XIOS/trunk/src/node/field.cpp @ 731

Last change on this file since 731 was 731, checked in by rlacroix, 9 years ago

Correctly estimate the needed buffer sizes.

The attributes were not considered which could lead to incorrect estimations.

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:executable set to *
File size: 31.7 KB
Line 
1#include "field.hpp"
2
3#include "attribute_template.hpp"
4#include "object_template.hpp"
5#include "group_template.hpp"
6
7#include "node_type.hpp"
8#include "calendar_util.hpp"
9#include "message.hpp"
10#include "xios_spl.hpp"
11#include "type.hpp"
12#include "timer.hpp"
13#include "context_client.hpp"
14#include "context_server.hpp"
15#include <set>
16#include "garbage_collector.hpp"
17#include "source_filter.hpp"
18#include "store_filter.hpp"
19#include "file_writer_filter.hpp"
20#include "pass_through_filter.hpp"
21#include "filter_expr_node.hpp"
22#include "lex_parser.hpp"
23#include "temporal_filter.hpp"
24#include "spatial_transform_filter.hpp"
25
26namespace xios{
27
28   /// ////////////////////// Définitions ////////////////////// ///
29
30   CField::CField(void)
31      : CObjectTemplate<CField>(), CFieldAttributes()
32      , refObject(), baseRefObject()
33      , grid(), file()
34      , written(false)
35      , nstep(0), nstepMax(0)
36      , hasOutputFile(false)
37      , domAxisIds_("", ""), areAllReferenceSolved(false)
38      , useCompressedOutput(false)
39      , isReadDataRequestPending(false)
40   { setVirtualVariableGroup(); }
41
42   CField::CField(const StdString& id)
43      : CObjectTemplate<CField>(id), CFieldAttributes()
44      , refObject(), baseRefObject()
45      , grid(), file()
46      , written(false)
47      , nstep(0), nstepMax(0)
48      , hasOutputFile(false)
49      , domAxisIds_("", ""), areAllReferenceSolved(false)
50      , useCompressedOutput(false)
51      , isReadDataRequestPending(false)
52   { setVirtualVariableGroup(); }
53
54   CField::~CField(void)
55   {}
56
57  //----------------------------------------------------------------
58
59   void CField::setVirtualVariableGroup(CVariableGroup* newVVariableGroup)
60   {
61      this->vVariableGroup = newVVariableGroup;
62   }
63
64   void CField::setVirtualVariableGroup(void)
65   {
66      this->setVirtualVariableGroup(CVariableGroup::create());
67   }
68
69   CVariableGroup* CField::getVirtualVariableGroup(void) const
70   {
71      return this->vVariableGroup;
72   }
73
74
75   std::vector<CVariable*> CField::getAllVariables(void) const
76   {
77      return this->vVariableGroup->getAllChildren();
78   }
79
80   void CField::solveDescInheritance(bool apply, const CAttributeMap* const parent)
81   {
82      SuperClassAttribute::setAttributes(parent, apply);
83      this->getVirtualVariableGroup()->solveDescInheritance(apply, NULL);
84   }
85
86  //----------------------------------------------------------------
87
88  bool CField::dispatchEvent(CEventServer& event)
89  {
90    if (SuperClass::dispatchEvent(event)) return true;
91    else
92    {
93      switch(event.type)
94      {
95        case EVENT_ID_UPDATE_DATA :
96          recvUpdateData(event);
97          return true;
98          break;
99
100        case EVENT_ID_READ_DATA :
101          recvReadDataRequest(event);
102          return true;
103          break;
104
105        case EVENT_ID_READ_DATA_READY :
106          recvReadDataReady(event);
107          return true;
108          break;
109
110        case EVENT_ID_ADD_VARIABLE :
111          recvAddVariable(event);
112          return true;
113          break;
114
115        case EVENT_ID_ADD_VARIABLE_GROUP :
116          recvAddVariableGroup(event);
117          return true;
118          break;
119
120        default :
121          ERROR("bool CField::dispatchEvent(CEventServer& event)", << "Unknown Event");
122          return false;
123      }
124    }
125  }
126
127  void CField::sendUpdateData(const CArray<double,1>& data)
128  {
129    CTimer::get("XIOS Send Data").resume();
130
131    CContext* context = CContext::getCurrent();
132    CContextClient* client = context->client;
133
134    CEventClient event(getType(), EVENT_ID_UPDATE_DATA);
135
136    map<int, CArray<int,1> >::iterator it;
137    list<CMessage> list_msg;
138    list<CArray<double,1> > list_data;
139
140    if (!grid->doGridHaveDataDistributed())
141    {
142       if (0 == client->clientRank)
143       {
144          for (it = grid->storeIndex_toSrv.begin(); it != grid->storeIndex_toSrv.end(); it++)
145          {
146            int rank = it->first;
147            CArray<int,1>& index = it->second;
148
149            list_msg.push_back(CMessage());
150            list_data.push_back(CArray<double,1>(index.numElements()));
151
152            CArray<double,1>& data_tmp = list_data.back();
153            for (int n = 0; n < data_tmp.numElements(); n++) data_tmp(n) = data(index(n));
154
155            list_msg.back() << getId() << data_tmp;
156            event.push(rank, 1, list_msg.back());
157          }
158          client->sendEvent(event);
159       } else client->sendEvent(event);
160    }
161    else
162    {
163      for (it = grid->storeIndex_toSrv.begin(); it != grid->storeIndex_toSrv.end(); it++)
164      {
165        int rank = it->first;
166        CArray<int,1>& index = it->second;
167
168        list_msg.push_back(CMessage());
169        list_data.push_back(CArray<double,1>(index.numElements()));
170
171        CArray<double,1>& data_tmp = list_data.back();
172        for (int n = 0; n < data_tmp.numElements(); n++) data_tmp(n) = data(index(n));
173
174        list_msg.back() << getId() << data_tmp;
175        event.push(rank, grid->nbSenders[rank], list_msg.back());
176      }
177      client->sendEvent(event);
178    }
179
180    CTimer::get("XIOS Send Data").suspend();
181  }
182
183  void CField::recvUpdateData(CEventServer& event)
184  {
185    vector<int> ranks;
186    vector<CBufferIn*> buffers;
187
188    list<CEventServer::SSubEvent>::iterator it;
189    string fieldId;
190
191    for (it = event.subEvents.begin(); it != event.subEvents.end(); ++it)
192    {
193      int rank = it->rank;
194      CBufferIn* buffer = it->buffer;
195      *buffer >> fieldId;
196      ranks.push_back(rank);
197      buffers.push_back(buffer);
198    }
199    get(fieldId)->recvUpdateData(ranks,buffers);
200  }
201
202  void  CField::recvUpdateData(vector<int>& ranks, vector<CBufferIn*>& buffers)
203  {
204    if (data_srv.empty())
205    {
206      for (map<int, CArray<size_t, 1> >::iterator it = grid->outIndexFromClient.begin(); it != grid->outIndexFromClient.end(); ++it)
207      {
208        int rank = it->first;
209        data_srv.insert(std::make_pair(rank, CArray<double,1>(it->second.numElements())));
210        foperation_srv.insert(pair<int,boost::shared_ptr<func::CFunctor> >(rank,boost::shared_ptr<func::CFunctor>(new func::CInstant(data_srv[rank]))));
211      }
212    }
213
214    CContext* context = CContext::getCurrent();
215    const CDate& currDate = context->getCalendar()->getCurrentDate();
216    const CDate opeDate      = last_operation_srv + freq_operation_srv;
217    const CDate writeDate    = last_Write_srv     + freq_write_srv;
218
219    if (opeDate <= currDate)
220    {
221      for (int n = 0; n < ranks.size(); n++)
222      {
223        CArray<double,1> data_tmp;
224        *buffers[n] >> data_tmp;
225        (*foperation_srv[ranks[n]])(data_tmp);
226      }
227      last_operation_srv = currDate;
228    }
229
230    if (writeDate < (currDate + freq_operation_srv))
231    {
232      for (int n = 0; n < ranks.size(); n++)
233      {
234        this->foperation_srv[ranks[n]]->final();
235      }
236
237      last_Write_srv = writeDate;
238      writeField();
239      lastlast_Write_srv = last_Write_srv;
240    }
241  }
242
243  void CField::writeField(void)
244  {
245    if (!getRelFile()->allDomainEmpty)
246    {
247      if (grid->doGridHaveDataToWrite() || getRelFile()->type == CFile::type_attr::one_file)
248      {
249        getRelFile()->checkFile();
250        this->incrementNStep();
251        getRelFile()->getDataOutput()->writeFieldData(CField::get(this));
252      }
253    }
254  }
255
256  void CField::sendReadDataRequest(void)
257  {
258    CContext* context = CContext::getCurrent();
259    CContextClient* client = context->client;
260
261    lastDataRequestedFromServer = context->getCalendar()->getCurrentDate();
262    isReadDataRequestPending = true;
263
264    CEventClient event(getType(), EVENT_ID_READ_DATA);
265    if (client->isServerLeader())
266    {
267      CMessage msg;
268      msg << getId();
269      const std::list<int>& ranks = client->getRanksServerLeader();
270      for (std::list<int>::const_iterator itRank = ranks.begin(), itRankEnd = ranks.end(); itRank != itRankEnd; ++itRank)
271        event.push(*itRank, 1, msg);
272      client->sendEvent(event);
273    }
274    else client->sendEvent(event);
275  }
276
277  /*!
278  Send request new data read from file if need be, that is the current data is out-of-date.
279  \return true if and only if some data was requested
280  */
281  bool CField::sendReadDataRequestIfNeeded(void)
282  {
283    const CDate& currentDate = CContext::getCurrent()->getCalendar()->getCurrentDate();
284
285    bool requestData = (currentDate >= lastDataRequestedFromServer + file->output_freq.getValue());
286
287    if (requestData)
288      sendReadDataRequest();
289
290    return requestData;
291  }
292
293  void CField::recvReadDataRequest(CEventServer& event)
294  {
295    CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
296    StdString fieldId;
297    *buffer >> fieldId;
298    get(fieldId)->recvReadDataRequest();
299  }
300
301  void CField::recvReadDataRequest(void)
302  {
303    CContext* context = CContext::getCurrent();
304    CContextClient* client = context->client;
305
306    CEventClient event(getType(), EVENT_ID_READ_DATA_READY);
307    std::list<CMessage> msgs;
308
309    bool hasData = readField();
310
311    map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
312    for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
313    {
314      msgs.push_back(CMessage());
315      CMessage& msg = msgs.back();
316      msg << getId();
317      if (hasData)
318        msg << getNStep() - 1 << it->second;
319      else
320        msg << size_t(-1);
321      event.push(it->first, grid->nbSenders[it->first], msg);
322    }
323    client->sendEvent(event);
324  }
325
326  bool CField::readField(void)
327  {
328    if (!getRelFile()->allDomainEmpty)
329    {
330      if (grid->doGridHaveDataToWrite() || getRelFile()->type == CFile::type_attr::one_file)
331      {
332        if (data_srv.empty())
333        {
334          for (map<int, CArray<size_t, 1> >::iterator it = grid->outIndexFromClient.begin(); it != grid->outIndexFromClient.end(); ++it)
335            data_srv.insert(std::make_pair(it->first, CArray<double,1>(it->second.numElements())));
336        }
337
338        getRelFile()->checkFile();
339        this->incrementNStep();
340
341        if (!nstepMax)
342        {
343          nstepMax = getRelFile()->getDataInput()->getFieldNbRecords(CField::get(this));
344        }
345
346        if (getNStep() > nstepMax)
347          return false;
348
349        getRelFile()->getDataInput()->readFieldData(CField::get(this));
350      }
351    }
352
353    return true;
354  }
355
356  void CField::recvReadDataReady(CEventServer& event)
357  {
358    string fieldId;
359    vector<int> ranks;
360    vector<CBufferIn*> buffers;
361
362    list<CEventServer::SSubEvent>::iterator it;
363    for (it = event.subEvents.begin(); it != event.subEvents.end(); ++it)
364    {
365      ranks.push_back(it->rank);
366      CBufferIn* buffer = it->buffer;
367      *buffer >> fieldId;
368      buffers.push_back(buffer);
369    }
370    get(fieldId)->recvReadDataReady(ranks, buffers);
371  }
372
373  void CField::recvReadDataReady(vector<int> ranks, vector<CBufferIn*> buffers)
374  {
375    CContext* context = CContext::getCurrent();
376    StdSize record;
377    std::map<int, CArray<double,1> > data;
378
379    bool isEOF = false;
380
381    for (int i = 0; i < ranks.size(); i++)
382    {
383      int rank = ranks[i];
384      *buffers[i] >> record;
385      isEOF = (record == size_t(-1));
386
387      if (!isEOF)
388        *buffers[i] >> data[rank];
389      else
390        break;
391    }
392
393    if (isEOF)
394      serverSourceFilter->signalEndOfStream(lastDataRequestedFromServer);
395    else
396      serverSourceFilter->streamDataFromServer(lastDataRequestedFromServer, data);
397
398    isReadDataRequestPending = false;
399  }
400
401   //----------------------------------------------------------------
402
403   void CField::setRelFile(CFile* _file)
404   {
405      this->file = _file;
406      hasOutputFile = true;
407   }
408
409   //----------------------------------------------------------------
410
411   StdString CField::GetName(void)    { return StdString("field"); }
412   StdString CField::GetDefName(void) { return CField::GetName(); }
413   ENodeType CField::GetType(void)    { return eField; }
414
415   //----------------------------------------------------------------
416
417   CGrid* CField::getRelGrid(void) const
418   {
419      return this->grid;
420   }
421
422   //----------------------------------------------------------------
423
424   CFile* CField::getRelFile(void) const
425   {
426      return this->file;
427   }
428
429   StdSize CField::getNStep(void) const
430   {
431      return this->nstep;
432   }
433
434   func::CFunctor::ETimeType CField::getOperationTimeType() const
435   {
436     return operationTimeType;
437   }
438
439   //----------------------------------------------------------------
440
441   void CField::incrementNStep(void)
442   {
443      this->nstep++;
444   }
445
446   void CField::resetNStep(StdSize nstep /*= 0*/)
447   {
448      this->nstep = nstep;
449   }
450
451   void CField::resetNStepMax(void)
452   {
453      this->nstepMax = 0;
454   }
455
456   //----------------------------------------------------------------
457
458   bool CField::isActive(void) const
459   {
460      return !this->refObject.empty();
461   }
462
463   //----------------------------------------------------------------
464
465   bool CField::wasWritten() const
466   {
467     return written;
468   }
469
470   void CField::setWritten()
471   {
472     written = true;
473   }
474
475   //----------------------------------------------------------------
476
477   bool CField::getUseCompressedOutput() const
478   {
479     return useCompressedOutput;
480   }
481
482   void CField::setUseCompressedOutput()
483   {
484     useCompressedOutput = true;
485   }
486
487   //----------------------------------------------------------------
488
489   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getInstantDataFilter()
490   {
491     return instantDataFilter;
492   }
493
494   //----------------------------------------------------------------
495
496   void CField::solveAllReferenceEnabledField(bool doSending2Sever)
497   {
498     CContext* context = CContext::getCurrent();
499     if (!areAllReferenceSolved)
500     {
501        areAllReferenceSolved = true;
502
503        if (context->hasClient)
504        {
505          solveRefInheritance(true);
506          solveBaseReference();
507          if (hasDirectFieldReference()) getDirectFieldReference()->solveAllReferenceEnabledField(false);
508        }
509        else if (context->hasServer)
510          solveServerOperation();
511
512        solveGridReference();
513     }
514     if (context->hasClient)
515     {
516       solveGenerateGrid();
517     }
518
519     solveGridDomainAxisRef(doSending2Sever);
520
521     if (context->hasClient)
522     {
523       solveTransformedGrid();
524     }
525
526     solveCheckMaskIndex(doSending2Sever);
527   }
528
529   std::map<int, StdSize> CField::getGridAttributesBufferSize()
530   {
531     return grid->getAttributesBufferSize();
532   }
533
534   std::map<int, StdSize> CField::getGridDataBufferSize()
535   {
536     return grid->getDataBufferSize(getId());
537   }
538
539   //----------------------------------------------------------------
540
541   void CField::solveServerOperation(void)
542   {
543      CContext* context = CContext::getCurrent();
544
545      if (!context->hasServer || !hasOutputFile) return;
546
547      if (freq_op.isEmpty())
548        freq_op.setValue(TimeStep);
549
550      if (freq_offset.isEmpty())
551        freq_offset.setValue(NoneDu);
552
553      freq_operation_srv = file->output_freq.getValue();
554      freq_write_srv     = file->output_freq.getValue();
555
556      lastlast_Write_srv = context->getCalendar()->getInitDate();
557      last_Write_srv     = context->getCalendar()->getInitDate();
558      last_operation_srv = context->getCalendar()->getInitDate();
559
560      const CDuration toffset = freq_operation_srv - freq_offset.getValue() - context->getCalendar()->getTimeStep();
561      last_operation_srv     = last_operation_srv - toffset;
562
563      if (operation.isEmpty())
564        ERROR("void CField::solveServerOperation(void)",
565              << "An operation must be defined for field \"" << getId() << "\".");
566
567      boost::shared_ptr<func::CFunctor> functor;
568      CArray<double, 1> dummyData;
569
570#define DECLARE_FUNCTOR(MType, mtype) \
571      if (operation.getValue().compare(#mtype) == 0) \
572      { \
573        functor.reset(new func::C##MType(dummyData)); \
574      }
575
576#include "functor_type.conf"
577
578      if (!functor)
579        ERROR("void CField::solveServerOperation(void)",
580              << "\"" << operation << "\" is not a valid operation.");
581
582      operationTimeType = functor->timeType();
583   }
584
585   //----------------------------------------------------------------
586
587   /*!
588    * Constructs the graph filter for the field, enabling or not the data output.
589    * This method should not be called more than once with enableOutput equal to true.
590    *
591    * \param gc the garbage collector to use when building the filter graph
592    * \param enableOutput must be true when the field data is to be
593    *                     read by the client or/and written to a file
594    */
595   void CField::buildFilterGraph(CGarbageCollector& gc, bool enableOutput)
596   {
597     if (!areAllReferenceSolved) solveAllReferenceEnabledField(false);
598
599     // Start by building a filter which can provide the field's instant data
600     if (!instantDataFilter)
601     {
602       // Check if we have an expression to parse
603       if (!content.empty())
604       {
605         boost::scoped_ptr<IFilterExprNode> expr(parseExpr(content + '\0'));
606         instantDataFilter = expr->reduce(gc, *this);
607       }
608       // Check if we have a reference on another field
609       else if (!field_ref.isEmpty())
610       {
611         CField* fieldRef = CField::get(field_ref);
612         fieldRef->buildFilterGraph(gc, false);
613
614         std::pair<boost::shared_ptr<CFilter>, boost::shared_ptr<CFilter> > filters;
615         // Check if a spatial transformation is needed
616         if (!grid_ref.isEmpty() && !fieldRef->grid_ref.isEmpty() && grid_ref.getValue() != fieldRef->grid_ref.getValue())
617           filters = CSpatialTransformFilter::buildFilterGraph(gc, fieldRef->grid, grid);
618         else
619           filters.first = filters.second = boost::shared_ptr<CFilter>(new CPassThroughFilter(gc));
620
621         fieldRef->getInstantDataFilter()->connectOutput(filters.first, 0);
622         instantDataFilter = filters.second;
623       }
624       // Check if the data is to be read from a file
625       else if (file && !file->mode.isEmpty() && file->mode == CFile::mode_attr::read)
626         instantDataFilter = serverSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(grid));
627       else // The data might be passed from the model
628         instantDataFilter = clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(grid));
629     }
630
631     // If the field data is to be read by the client or/and written to a file
632     if (enableOutput && !storeFilter && !fileWriterFilter)
633     {
634       if (!read_access.isEmpty() && read_access.getValue())
635       {
636         storeFilter = boost::shared_ptr<CStoreFilter>(new CStoreFilter(gc, CContext::getCurrent(), grid));
637         instantDataFilter->connectOutput(storeFilter, 0);
638       }
639
640       if (file && (file->mode.isEmpty() || file->mode == CFile::mode_attr::write))
641       {
642         fileWriterFilter = boost::shared_ptr<CFileWriterFilter>(new CFileWriterFilter(gc, this));
643         getTemporalDataFilter(gc, file->output_freq)->connectOutput(fileWriterFilter, 0);
644       }
645     }
646   }
647
648   /*!
649    * Returns the source filter to handle a self reference in the field's expression.
650    * If the needed source filter does not exist, it is created, otherwise it is reused.
651    * This method should only be called when building the filter graph corresponding
652    * to the field's expression.
653    *
654    * \param gc the garbage collector to use
655    * \return the output pin corresponding to a self reference
656    */
657   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getSelfReference(CGarbageCollector& gc)
658   {
659     if (instantDataFilter || content.empty())
660       ERROR("COutputPin* CField::getSelfReference(CGarbageCollector& gc)",
661             "Impossible to add a self reference to a field which has already been parsed or which does not have an expression.");
662
663     if (!clientSourceFilter)
664       clientSourceFilter = boost::shared_ptr<CSourceFilter>(new CSourceFilter(grid));
665
666     return clientSourceFilter;
667   }
668
669   /*!
670    * Returns the temporal filter corresponding to the field's temporal operation
671    * for the specified operation frequency. The filter is created if it does not
672    * exist, otherwise it is reused.
673    *
674    * \param gc the garbage collector to use
675    * \param outFreq the operation frequency, i.e. the frequency at which the output data will be computed
676    * \return the output pin corresponding to the requested temporal filter
677    */
678   boost::shared_ptr<COutputPin> CField::getTemporalDataFilter(CGarbageCollector& gc, CDuration outFreq)
679   {
680     std::map<CDuration, boost::shared_ptr<COutputPin> >::iterator it = temporalDataFilters.find(outFreq);
681
682     if (it == temporalDataFilters.end())
683     {
684       if (operation.isEmpty())
685         ERROR("void CField::getTemporalDataFilter(CGarbageCollector& gc, CDuration outFreq)",
686               << "An operation must be defined for field \"" << getId() << "\".");
687
688       if (freq_op.isEmpty())
689         freq_op.setValue(TimeStep);
690       if (freq_offset.isEmpty())
691         freq_offset.setValue(NoneDu);
692
693       const bool ignoreMissingValue = (!detect_missing_value.isEmpty() && !default_value.isEmpty() && detect_missing_value == true);
694
695       boost::shared_ptr<CTemporalFilter> temporalFilter(new CTemporalFilter(gc, operation,
696                                                                             CContext::getCurrent()->getCalendar()->getInitDate(),
697                                                                             freq_op, freq_offset, outFreq,
698                                                                             ignoreMissingValue, ignoreMissingValue ? default_value : 0.0));
699       instantDataFilter->connectOutput(temporalFilter, 0);
700
701       it = temporalDataFilters.insert(std::make_pair(outFreq, temporalFilter)).first;
702     }
703
704     return it->second;
705   }
706
707   //----------------------------------------------------------------
708/*
709   void CField::fromBinary(StdIStream& is)
710   {
711      SuperClass::fromBinary(is);
712#define CLEAR_ATT(name_)\
713      SuperClassAttribute::operator[](#name_)->reset()
714
715         CLEAR_ATT(domain_ref);
716         CLEAR_ATT(axis_ref);
717#undef CLEAR_ATT
718
719   }
720*/
721   //----------------------------------------------------------------
722
723   void CField::solveGridReference(void)
724   {
725      CDomain* domain;
726      CAxis* axis;
727      std::vector<CDomain*> vecDom;
728      std::vector<CAxis*> vecAxis;
729      std::vector<std::string> domList, axisList;
730
731      if (!domain_ref.isEmpty())
732      {
733         if (CDomain::has(domain_ref.getValue()))
734         {
735           domain = CDomain::get(domain_ref.getValue());
736           vecDom.push_back(domain);
737         }
738         else
739            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
740                  << "Reference to the domain \'"
741                  << domain_ref.getValue() << "\' is wrong");
742      }
743
744      if (!axis_ref.isEmpty())
745      {
746         if (CAxis::has(axis_ref.getValue()))
747         {
748           axis = CAxis::get(axis_ref.getValue());
749           vecAxis.push_back(axis);
750         }
751         else
752            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
753                  << "Reference to the axis \'"
754                  << axis_ref.getValue() <<"\' is wrong");
755      }
756
757      if (!grid_ref.isEmpty())
758      {
759         if (CGrid::has(grid_ref.getValue()))
760         {
761           this->grid = CGrid::get(grid_ref.getValue());
762           domList = grid->getDomainList();
763           axisList = grid->getAxisList();
764           if (domList.empty() && axisList.empty())
765           {
766             this->grid = CGrid::createGrid(vecDom, vecAxis);
767           }
768         }
769         else
770            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
771                  << "Reference to the grid \'"
772                  << grid_ref.getValue() << "\' is wrong");
773      }
774      else
775      {
776         this->grid = CGrid::createGrid(vecDom, vecAxis);
777      }
778
779      if (grid_ref.isEmpty() && domain_ref.isEmpty() && axis_ref.isEmpty())
780      {
781            ERROR("CField::solveGridReference(void)",
782                  << "At least one dimension must be defined for this field.");
783      }
784   }
785
786   void CField::solveGridDomainAxisRef(bool checkAtt)
787   {
788     grid->solveDomainAxisRef(checkAtt);
789   }
790
791   void CField::solveCheckMaskIndex(bool doSendingIndex)
792   {
793     grid->checkMaskIndex(doSendingIndex);
794   }
795
796   void CField::solveTransformedGrid()
797   {
798     if (!grid_ref.isEmpty() && hasDirectFieldReference() && !getDirectFieldReference()->grid_ref.isEmpty()
799         && grid_ref.getValue() != getDirectFieldReference()->grid_ref.getValue() && !grid->isTransformed())
800       grid->transformGrid(getDirectFieldReference()->grid);
801   }
802
803   void CField::solveGenerateGrid()
804   {
805     if (!grid_ref.isEmpty() && hasDirectFieldReference() && !getDirectFieldReference()->grid_ref.isEmpty()
806         && grid_ref.getValue() != getDirectFieldReference()->grid_ref.getValue() && !grid->isTransformed())
807       grid->completeGrid(getDirectFieldReference()->grid);
808   }
809
810   ///-------------------------------------------------------------------
811
812   template <>
813   void CGroupTemplate<CField, CFieldGroup, CFieldAttributes>::solveRefInheritance(void)
814   {
815      if (this->group_ref.isEmpty()) return;
816      StdString gref = this->group_ref.getValue();
817
818      if (!CFieldGroup::has(gref))
819         ERROR("CGroupTemplate<CField, CFieldGroup, CFieldAttributes>::solveRefInheritance(void)",
820               << "[ gref = " << gref << "]"
821               << " invalid group name !");
822
823      CFieldGroup* group = CFieldGroup::get(gref);
824      CFieldGroup* owner = CFieldGroup::get(boost::polymorphic_downcast<CFieldGroup*>(this));
825
826      std::vector<CField*> allChildren  = group->getAllChildren();
827      std::vector<CField*>::iterator it = allChildren.begin(), end = allChildren.end();
828
829      for (; it != end; it++)
830      {
831         CField* child = *it;
832         if (child->hasId()) owner->createChild()->field_ref.setValue(child->getId());
833
834      }
835   }
836
837   void CField::scaleFactorAddOffset(double scaleFactor, double addOffset)
838   {
839     map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
840     for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++) it->second = (it->second - addOffset) / scaleFactor;
841   }
842
843   void CField::invertScaleFactorAddOffset(double scaleFactor, double addOffset)
844   {
845     map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
846     for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++) it->second = it->second * scaleFactor + addOffset;
847   }
848
849   void CField::outputField(CArray<double,3>& fieldOut)
850   {
851      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
852      for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
853      {
854        grid->outputField(it->first, it->second, fieldOut.dataFirst());
855      }
856   }
857
858   void CField::outputField(CArray<double,2>& fieldOut)
859   {
860      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
861      for(it=data_srv.begin();it!=data_srv.end();it++)
862      {
863         grid->outputField(it->first, it->second, fieldOut.dataFirst());
864      }
865   }
866
867   void CField::outputField(CArray<double,1>& fieldOut)
868   {
869      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
870
871      for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
872      {
873         grid->outputField(it->first, it->second, fieldOut.dataFirst());
874      }
875   }
876
877   void CField::inputField(CArray<double,3>& fieldOut)
878   {
879      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
880      for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
881      {
882        grid->inputField(it->first, fieldOut.dataFirst(), it->second);
883      }
884   }
885
886   void CField::inputField(CArray<double,2>& fieldOut)
887   {
888      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
889      for(it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
890      {
891         grid->inputField(it->first, fieldOut.dataFirst(), it->second);
892      }
893   }
894
895   void CField::inputField(CArray<double,1>& fieldOut)
896   {
897      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
898      for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
899      {
900         grid->inputField(it->first, fieldOut.dataFirst(), it->second);
901      }
902   }
903
904   void CField::outputCompressedField(CArray<double,1>& fieldOut)
905   {
906      map<int, CArray<double,1> >::iterator it;
907
908      for (it = data_srv.begin(); it != data_srv.end(); it++)
909      {
910         grid->outputCompressedField(it->first, it->second, fieldOut.dataFirst());
911      }
912   }
913
914   ///-------------------------------------------------------------------
915
916   void CField::parse(xml::CXMLNode& node)
917   {
918      SuperClass::parse(node);
919      if (!node.getContent(this->content))
920      {
921        if (node.goToChildElement())
922        {
923          do
924          {
925            if (node.getElementName() == "variable" || node.getElementName() == "variable_group") this->getVirtualVariableGroup()->parseChild(node);
926          } while (node.goToNextElement());
927          node.goToParentElement();
928        }
929      }
930    }
931
932   /*!
933     This function retrieves Id of corresponding domain_ref and axis_ref (if any)
934   of a field. In some cases, only domain exists but axis doesn't
935   \return pair of Domain and Axis id
936   */
937   const std::pair<StdString,StdString>& CField::getRefDomainAxisIds()
938   {
939     CGrid* cgPtr = getRelGrid();
940     if (NULL != cgPtr)
941     {
942       std::vector<StdString>::iterator it;
943       if (!domain_ref.isEmpty())
944       {
945         std::vector<StdString> domainList = cgPtr->getDomainList();
946         it = std::find(domainList.begin(), domainList.end(), domain_ref.getValue());
947         if (domainList.end() != it) domAxisIds_.first = *it;
948       }
949
950       if (!axis_ref.isEmpty())
951       {
952         std::vector<StdString> axisList = cgPtr->getAxisList();
953         it = std::find(axisList.begin(), axisList.end(), axis_ref.getValue());
954         if (axisList.end() != it) domAxisIds_.second = *it;
955       }
956     }
957     return (domAxisIds_);
958   }
959
960   CVariable* CField::addVariable(const string& id)
961   {
962     return vVariableGroup->createChild(id);
963   }
964
965   CVariableGroup* CField::addVariableGroup(const string& id)
966   {
967     return vVariableGroup->createChildGroup(id);
968   }
969
970   void CField::sendAddAllVariables()
971   {
972     if (!getAllVariables().empty())
973     {
974       // Firstly, it's necessary to add virtual variable group
975       sendAddVariableGroup(getVirtualVariableGroup()->getId());
976
977       // Okie, now we can add to this variable group
978       std::vector<CVariable*> allVar = getAllVariables();
979       std::vector<CVariable*>::const_iterator it = allVar.begin();
980       std::vector<CVariable*>::const_iterator itE = allVar.end();
981
982       for (; it != itE; ++it)
983       {
984         this->sendAddVariable((*it)->getId());
985         (*it)->sendAllAttributesToServer();
986         (*it)->sendValue();
987       }
988     }
989   }
990
991   void CField::sendAddVariable(const string& id)
992   {
993    CContext* context = CContext::getCurrent();
994
995    if (!context->hasServer)
996    {
997       CContextClient* client = context->client;
998
999       CEventClient event(this->getType(),EVENT_ID_ADD_VARIABLE);
1000       if (client->isServerLeader())
1001       {
1002         CMessage msg;
1003         msg << this->getId();
1004         msg << id;
1005         const std::list<int>& ranks = client->getRanksServerLeader();
1006         for (std::list<int>::const_iterator itRank = ranks.begin(), itRankEnd = ranks.end(); itRank != itRankEnd; ++itRank)
1007           event.push(*itRank,1,msg);
1008         client->sendEvent(event);
1009       }
1010       else client->sendEvent(event);
1011    }
1012   }
1013
1014   void CField::sendAddVariableGroup(const string& id)
1015   {
1016    CContext* context = CContext::getCurrent();
1017    if (!context->hasServer)
1018    {
1019       CContextClient* client = context->client;
1020
1021       CEventClient event(this->getType(),EVENT_ID_ADD_VARIABLE_GROUP);
1022       if (client->isServerLeader())
1023       {
1024         CMessage msg;
1025         msg << this->getId();
1026         msg << id;
1027         const std::list<int>& ranks = client->getRanksServerLeader();
1028         for (std::list<int>::const_iterator itRank = ranks.begin(), itRankEnd = ranks.end(); itRank != itRankEnd; ++itRank)
1029           event.push(*itRank,1,msg);
1030         client->sendEvent(event);
1031       }
1032       else client->sendEvent(event);
1033    }
1034   }
1035
1036   void CField::recvAddVariable(CEventServer& event)
1037   {
1038
1039      CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
1040      string id;
1041      *buffer >> id;
1042      get(id)->recvAddVariable(*buffer);
1043   }
1044
1045   void CField::recvAddVariable(CBufferIn& buffer)
1046   {
1047      string id;
1048      buffer >> id;
1049      addVariable(id);
1050   }
1051
1052   void CField::recvAddVariableGroup(CEventServer& event)
1053   {
1054
1055      CBufferIn* buffer = event.subEvents.begin()->buffer;
1056      string id;
1057      *buffer >> id;
1058      get(id)->recvAddVariableGroup(*buffer);
1059   }
1060
1061   void CField::recvAddVariableGroup(CBufferIn& buffer)
1062   {
1063      string id;
1064      buffer >> id;
1065      addVariableGroup(id);
1066   }
1067
1068   DEFINE_REF_FUNC(Field,field)
1069} // namespace xios
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.