source: XIOS/trunk/src/output/nc4_data_output.cpp @ 340

Last change on this file since 340 was 337, checked in by ymipsl, 12 years ago

remove "io" namespace

YM
File size: 27.7 KB
Line 
1
2#include "nc4_data_output.hpp"
3
4#include <boost/lexical_cast.hpp>
5#include "attribute_template_impl.hpp"
6#include "group_template_impl.hpp"
7
8#include "file.hpp"
9#include "calendar.hpp"
10#include "context.hpp"
11#include "context_server.hpp"
12
13namespace xios
14{
15      /// ////////////////////// Définitions ////////////////////// ///
16      CNc4DataOutput::CNc4DataOutput
17         (const StdString & filename, bool exist)
18            : SuperClass()
19            , SuperClassWriter(filename, exist)
20            , filename(filename)
21      {
22         StdString timeid = StdString("time_counter");
23         SuperClass::type = MULTI_FILE;
24         if (!exist)
25            SuperClassWriter::addDimension(timeid);
26      }
27
28      CNc4DataOutput::CNc4DataOutput
29         (const StdString & filename, bool exist, MPI_Comm comm_server,bool multifile, bool isCollective)
30            : SuperClass()
31            , SuperClassWriter(filename, exist, &comm_server,multifile)
32            , comm_server(comm_server)
33            , filename(filename)
34            , isCollective(isCollective)
35      {
36         StdString timeid = StdString("time_counter");
37
38         SuperClass::type = (multifile) ? MULTI_FILE : ONE_FILE;
39         
40         if (!exist)
41            SuperClassWriter::addDimension(timeid);
42      }
43
44
45      CNc4DataOutput::~CNc4DataOutput(void)
46      { /* Ne rien faire de plus */ }
47
48      ///--------------------------------------------------------------
49
50      const StdString & CNc4DataOutput::getFileName(void) const
51      {
52         return (this->filename);
53      }
54
55      //---------------------------------------------------------------
56
57      void CNc4DataOutput::writeDomain_(const boost::shared_ptr<tree::CDomain> domain)
58      {
59         shared_ptr<CContext> context=CObjectFactory::GetObject<CContext>(CObjectFactory::GetCurrentContextId()) ;
60         CContextServer* server=context->server ;
61         
62         if (domain->IsWritten(this->filename)) return;
63         domain->checkAttributes();
64         
65         if (domain->isEmpty()) 
66           if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return ;
67
68         std::vector<StdString> dim0, dim1;
69         StdString domid     = (!domain->name.isEmpty())
70                             ? domain->name.getValue() : domain->getId();
71         StdString appendDomid  = (singleDomain) ? "" : "_"+domid ;
72
73         StdString lonid     = StdString("lon").append(appendDomid);
74         StdString latid     = StdString("lat").append(appendDomid);
75         StdString lonid_loc = (server->intraCommSize > 1)
76                             ? StdString("lon").append(appendDomid).append("_local")
77                             : lonid;
78         StdString latid_loc = (server->intraCommSize > 1)
79                             ? StdString("lat").append(appendDomid).append("_local")
80                             : latid;
81// supress mask         StdString maskid    = StdString("mask_").append(domid).append("_local");
82
83// supress mask         ARRAY(int, 2) mask = domain->getLocalMask();
84
85//         unsigned int ssize = domain->zoom_ni_loc.getValue() * domain->zoom_nj_loc.getValue();
86//         bool isCurvilinear = (domain->lonvalue.getValue()->size() == ssize);
87         bool isCurvilinear = true ; //for moment
88
89         switch (SuperClass::type)
90         {
91            case (MULTI_FILE) :
92            {
93//               if (domain->isEmpty()) return;
94               
95               if (server->intraCommSize > 1)
96               {
97                 SuperClassWriter::addDimension(lonid, domain->zoom_ni.getValue());
98                 SuperClassWriter::addDimension(latid, domain->zoom_nj.getValue());
99               }
100
101               if (isCurvilinear)
102               {
103                 dim0.push_back(latid_loc); dim0.push_back(lonid_loc);
104                 lonid = StdString("nav_lon").append(appendDomid);
105                 latid = StdString("nav_lat").append(appendDomid);
106               }
107               else
108               {
109                 dim0.push_back(latid_loc);
110                 dim1.push_back(lonid_loc);
111               }
112
113               SuperClassWriter::addDimension(lonid_loc, domain->zoom_ni_srv);
114               SuperClassWriter::addDimension(latid_loc, domain->zoom_nj_srv);
115               if (server->intraCommSize > 1)
116               {
117                  this->writeLocalAttributes(domain->zoom_ibegin_srv,
118                                             domain->zoom_ni_srv,
119                                             domain->zoom_jbegin_srv,
120                                             domain->zoom_nj_srv,
121                                             appendDomid);
122               }
123               
124               if (isCurvilinear)
125               {
126                  SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
127                  SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
128               }
129               else
130               {
131                  SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
132                  SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim1);
133               }
134               this->writeAxisAttributes
135                  (lonid, "X", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
136               this->writeAxisAttributes
137                  (latid, "Y", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
138
139               dim0.clear();
140               dim0.push_back(latid_loc);
141               dim0.push_back(lonid_loc);
142
143
144// supress mask               if (server->intraCommSize > 1)
145// supress mask               {
146// supress mask                  SuperClassWriter::addVariable(maskid, NC_INT, dim0);
147// supress mask
148// supress mask                  this->writeMaskAttributes(maskid,
149// supress mask                     domain->data_dim.getValue()/*,
150// supress mask                     domain->data_ni.getValue(),
151// supress mask                     domain->data_nj.getValue(),
152// supress mask                     domain->data_ibegin.getValue(),
153// supress mask                     domain->data_jbegin.getValue()*/);
154// supress mask               }
155                 
156               //SuperClassWriter::setDefaultValue(maskid, &dvm);
157
158               SuperClassWriter::definition_end();
159               SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0);
160               SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0);
161// supress mask               if (server->intraCommSize > 1) SuperClassWriter::writeData(mask, maskid);
162               SuperClassWriter::definition_start();
163
164               break;
165            }
166            case (ONE_FILE) :
167            {
168               SuperClassWriter::addDimension(lonid, domain->zoom_ni.getValue());
169               SuperClassWriter::addDimension(latid, domain->zoom_nj.getValue());
170
171               
172               if (isCurvilinear)
173               {
174                  dim0.push_back(latid); dim0.push_back(lonid);
175                  lonid = StdString("nav_lon").append(appendDomid);
176                  latid = StdString("nav_lat").append(appendDomid);
177                  SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
178                  SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
179               }
180               else
181               {
182                  dim0.push_back(latid);
183                  dim1.push_back(lonid);
184                  SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
185                  SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim1);
186               }
187               this->writeAxisAttributes
188                  (latid, "X", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
189               this->writeAxisAttributes
190                  (lonid, "Y", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
191
192
193               SuperClassWriter::definition_end();
194               std::vector<StdSize> start(2) ; 
195               std::vector<StdSize> count(2) ;
196               if (domain->isEmpty())
197               {
198                 start[0]=0 ; start [1]=0 ; 
199                 count[0]=0 ; count[1]=0 ; 
200               }
201               else
202               {
203                 start[1]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->zoom_ibegin.getValue() ; start [0]=domain->zoom_jbegin_srv-domain->zoom_jbegin.getValue() ; 
204                 count[1]=domain->zoom_ni_srv ; count[0]=domain->zoom_nj_srv ; 
205               }
206               
207               SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0,&start,&count);
208               SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0,&start,&count);
209               SuperClassWriter::definition_start();
210
211               break;
212            }           
213            default :
214               ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
215                     << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
216                     << " not implemented yet !");
217         }
218         domain->addRelFile(this->filename);
219      }
220
221      //--------------------------------------------------------------
222
223      void CNc4DataOutput::writeAxis_(const boost::shared_ptr<tree::CAxis> axis)
224      {
225         if (axis->IsWritten(this->filename)) return;
226         axis->checkAttributes();
227         std::vector<StdString> dims;
228         StdString axisid = (!axis->name.isEmpty())
229                           ? axis->name.getValue() : axis->getId();
230         SuperClassWriter::addDimension(axisid, axis->size.getValue());
231         dims.push_back(axisid);
232         
233         switch (SuperClass::type)
234         {
235            case (MULTI_FILE ) :
236            {}
237            case (ONE_FILE) :
238            {
239               SuperClassWriter::addVariable(axisid, NC_FLOAT, dims);
240
241               SuperClassWriter::addAttribute("axis", StdString("Z"), &axisid);
242
243               if (!axis->standard_name.isEmpty())
244                  SuperClassWriter::addAttribute
245                     ("standard_name",  axis->standard_name.getValue(), &axisid);
246
247               if (!axis->long_name.isEmpty())
248                  SuperClassWriter::addAttribute
249                     ("long_name", axis->long_name.getValue(), &axisid);
250
251               if (!axis->unit.isEmpty())
252                  SuperClassWriter::addAttribute
253                     ("units", axis->unit.getValue(), &axisid);
254
255               SuperClassWriter::definition_end();
256               SuperClassWriter::writeData(axis->value.getValue(), axisid, isCollective, 0);
257               SuperClassWriter::definition_start();
258
259               break;
260            }
261            default :
262               ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
263                     << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
264                     << " not implemented yet !");
265         }
266         axis->addRelFile(this->filename);
267      }
268
269      //--------------------------------------------------------------
270
271      void CNc4DataOutput::writeField_(const boost::shared_ptr<tree::CField> field)
272      {
273         shared_ptr<CContext> context=CObjectFactory::GetObject<CContext>(CObjectFactory::GetCurrentContextId()) ;
274         CContextServer* server=context->server ;
275
276         std::vector<StdString> dims, coodinates;
277         boost::shared_ptr<CGrid> grid = field->grid;
278         boost::shared_ptr<CDomain> domain = grid->domain;
279           
280         if (domain->isEmpty()) 
281           if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return ;
282
283         StdString timeid    = StdString("time_counter");
284         StdString domid     = (!domain->name.isEmpty())
285                             ? domain->name.getValue() : domain->getId();
286         StdString appendDomid  = (singleDomain) ? "" : "_"+domid ;
287
288         StdString lonid     = StdString("lon").append(appendDomid);
289         StdString latid     = StdString("lat").append(appendDomid);
290         StdString lonid_loc = (server->intraCommSize > 1)
291                             ? StdString("lon").append(appendDomid).append("_local")
292                             : lonid;
293         StdString latid_loc = (server->intraCommSize > 1)
294                             ? StdString("lat").append(appendDomid).append("_local")
295                             : latid;
296         StdString fieldid   = (!field->name.isEmpty())
297                             ? field->name.getValue() : field->getBaseFieldReference()->getId();
298
299//         unsigned int ssize = domain->zoom_ni_loc.getValue() * domain->zoom_nj_loc.getValue();
300//         bool isCurvilinear = (domain->lonvalue.getValue()->size() == ssize);
301          bool isCurvilinear = true ; // for moment
302         
303         nc_type type = (!field->prec.isEmpty() &&
304                        ( field->prec.getValue() == 4))
305                        ? NC_FLOAT : NC_DOUBLE;
306         bool wtime   = !(!field->operation.isEmpty() &&
307                         ( field->operation.getValue().compare("once") == 0));
308                         
309         if (wtime)
310         {
311            StdOStringStream oss;
312            oss << "time_" << field->operation.getValue()
313                << "_" << field->getRelFile()->output_freq.getValue();
314
315            coodinates.push_back(oss.str());
316            dims.push_back(timeid);
317         }
318
319         if (!grid->axis_ref.isEmpty())
320         {
321            boost::shared_ptr<CAxis> axis = grid->axis ;
322            StdString axisid = (!axis->name.isEmpty()) ? axis->name.getValue() : axis->getId();
323            dims.push_back(axisid);
324            coodinates.push_back(axisid);
325         }
326
327         if (isCurvilinear)
328         {
329            coodinates.push_back(StdString("nav_lat").append(appendDomid));
330            coodinates.push_back(StdString("nav_lon").append(appendDomid));
331         }
332         else
333         {
334            coodinates.push_back(latid);
335            coodinates.push_back(lonid);
336         }
337
338         switch (SuperClass::type)
339         {
340            case (MULTI_FILE) :
341            {
342               dims.push_back(latid_loc);
343               dims.push_back(lonid_loc);
344               break ;
345            }
346            case (ONE_FILE) :
347            {
348               dims.push_back(latid);
349               dims.push_back(lonid);
350               break;
351            }
352            default :
353               ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
354                     << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
355                     << " not implemented yet !");
356         }
357         
358         SuperClassWriter::addVariable(fieldid, type, dims);
359         
360         if (!field->standard_name.isEmpty())
361            SuperClassWriter::addAttribute
362               ("standard_name",  field->standard_name.getValue(), &fieldid);
363
364         if (!field->long_name.isEmpty())
365            SuperClassWriter::addAttribute
366               ("long_name", field->long_name.getValue(), &fieldid);
367
368         if (!field->unit.isEmpty())
369            SuperClassWriter::addAttribute
370               ("units", field->unit.getValue(), &fieldid);
371               
372         SuperClassWriter::addAttribute
373               ("online_operation", field->operation.getValue(), &fieldid);
374               
375         if (wtime)
376         {
377            SuperClassWriter::addAttribute
378                  ("interval_operation", field->freq_op.getValue(), &fieldid);
379            SuperClassWriter::addAttribute
380                  ("interval_write", field->getRelFile()->output_freq.getValue(), &fieldid);
381         }
382         
383         if (!field->default_value.isEmpty())
384         {
385            double default_value = field->default_value.getValue();
386            float fdefault_value = (float)default_value;
387            if (type == NC_DOUBLE)
388               SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, &default_value);
389            else
390               SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, &fdefault_value);
391         }
392         else
393         {
394            double * default_value = NULL;
395            SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, default_value);
396         }             
397
398         {  // Ecriture des coordonnées
399         
400            StdString coordstr; //boost::algorithm::join(coodinates, " ")
401            std::vector<StdString>::iterator
402               itc = coodinates.begin(), endc = coodinates.end();
403           
404            for (; itc!= endc; itc++)
405            {
406               StdString & coord = *itc;
407               if (itc+1 != endc)
408                     coordstr.append(coord).append(" ");
409               else  coordstr.append(coord);
410            }
411
412            SuperClassWriter::addAttribute("coordinates", coordstr, &fieldid);
413
414         }
415
416      }
417
418      //--------------------------------------------------------------
419
420      void CNc4DataOutput::writeFile_ (const boost::shared_ptr<tree::CFile> file)
421      {
422         StdString filename = (!file->name.isEmpty())
423                            ? file->name.getValue() : file->getId();
424         StdString description = (!file->description.isEmpty())
425                               ? file->description.getValue()
426                               : StdString("Created by xios");
427         this->writeFileAttributes(filename, description,
428                                   StdString ("CF-1.1"),
429                                   StdString("An IPSL model"),
430                                   this->getTimeStamp());
431         if (file->nbDomain==1) singleDomain=true ;
432         else singleDomain=false ;
433      }
434 
435      void CNc4DataOutput::syncFile_ (void)
436      {
437         SuperClassWriter::sync() ;
438      }
439
440      void CNc4DataOutput::closeFile_ (void)
441      {
442         SuperClassWriter::close() ;
443      }
444
445      //---------------------------------------------------------------
446
447      StdString CNc4DataOutput::getTimeStamp(void) const
448      {
449         const int buffer_size = 100;
450         time_t rawtime;
451         struct tm * timeinfo = NULL;
452         char buffer [buffer_size];
453
454         time ( &rawtime );
455         timeinfo = localtime ( &rawtime );
456         strftime (buffer, buffer_size, "%Y-%b-%d %H:%M:%S %Z", timeinfo);
457
458         return (StdString(buffer));
459      }
460     
461      //---------------------------------------------------------------
462     
463      void CNc4DataOutput::writeFieldData_ (const boost::shared_ptr<tree::CField>  field)
464      {
465         shared_ptr<CContext> context=CObjectFactory::GetObject<CContext>(CObjectFactory::GetCurrentContextId()) ;
466//          if (field->getRelFile()->isSyncTime()) SuperClassWriter::sync() ;
467
468         boost::shared_ptr<CGrid> grid = field->grid ;
469         boost::shared_ptr<CDomain> domain = grid->domain ;
470         
471         if(SuperClass::type==MULTI_FILE || !isCollective) if (domain->isEmpty()) return;
472
473
474         StdString fieldid   = (!field->name.isEmpty()) 
475                             ? field->name.getValue() 
476                             : field->getBaseFieldReference()->getId();
477                             
478         StdOStringStream oss;
479         oss << "time_" << field->operation.getValue()
480             << "_" << field->getRelFile()->output_freq.getValue();
481             
482 //        ARRAY(double, 1) field_data = field->data_srv;
483         ARRAY_CREATE(time_data, double, 1, [1]);
484         if (field->operation.getValue()=="instant") (*time_data)[0] = date::Time(*field->last_Write_srv)
485                                                                      -date::Time(context->calendar->getTimeOrigin());
486         else (*time_data)[0] = (date::Time(*field->last_Write_srv)+date::Time(*field->lastlast_Write_srv))/2
487                               -date::Time(context->calendar->getTimeOrigin());
488           
489         if (grid->hasAxis()) // 3D
490         {
491            boost::shared_ptr<CAxis> axis = grid->axis ;
492            ARRAY_CREATE(field_data3D,double,3,[domain->zoom_ni_srv][domain->zoom_nj_srv][axis->size.getValue()]) ;
493            field->outputField(field_data3D);
494            switch (SuperClass::type)
495           {
496              case (MULTI_FILE) :
497              {
498                 SuperClassWriter::writeData(field_data3D, fieldid, isCollective, field->getNStep()-1);
499                 SuperClassWriter::writeData(time_data, oss.str(), isCollective, field->getNStep()-1);
500                 break ;
501              }
502              case (ONE_FILE) :
503              {
504                 std::vector<StdSize> start(3) ; 
505                 std::vector<StdSize> count(3) ;
506                 if (domain->isEmpty())
507                 {
508                   start[0]=0 ; start[1]=0 ; start[2]=0 ;
509                   count[0]=0 ; count[1]=0 ; start[2]=0 ;
510                 }
511                 else
512                 {
513//                 start[2]=domain->zoom_ibegin_loc.getValue()-domain->zoom_ibegin.getValue() ; start [1]=domain->zoom_jbegin_loc.getValue()-domain->zoom_jbegin.getValue() ; start[0]=0 ;
514                   start[2]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->zoom_ibegin.getValue() ; start [1]=domain->zoom_jbegin_srv-domain->zoom_jbegin.getValue() ; start[0]=0 ;
515                   count[2]=domain->zoom_ni_srv ; count[1]=domain->zoom_nj_srv ; count[0] = axis->size.getValue();
516                 }
517                 SuperClassWriter::writeData(field_data3D, fieldid, isCollective, field->getNStep()-1,&start,&count );
518                 SuperClassWriter::writeData(time_data, oss.str(), isCollective, field->getNStep()-1 );
519                 break;
520              }
521            }
522           
523         }
524         else // 2D
525         {
526            ARRAY_CREATE(field_data2D,double,2,[domain->zoom_ni_srv][domain->zoom_nj_srv]) ;
527            field->outputField(field_data2D);
528            switch (SuperClass::type)
529            {
530              case (MULTI_FILE) :
531              {
532                SuperClassWriter::writeData(field_data2D, fieldid, isCollective, field->getNStep()-1);
533                SuperClassWriter::writeData(time_data, oss.str(), isCollective, field->getNStep()-1);
534                break;
535              }
536              case (ONE_FILE) :
537              {
538                 std::vector<StdSize> start(2) ; 
539                 std::vector<StdSize> count(2) ;
540                 if (domain->isEmpty())
541                 {
542                   start[0]=0 ; start[1]=0 ;
543                   count[0]=0 ; count[1]=0 ;
544                 }
545                 else
546                 {
547                   start[1]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->zoom_ibegin.getValue() ; start[0]=domain->zoom_jbegin_srv-domain->zoom_jbegin.getValue() ; 
548                   count[1]=domain->zoom_ni_srv ; count[0]=domain->zoom_nj_srv ;
549                 }
550
551                 SuperClassWriter::writeData(field_data2D, fieldid, isCollective, field->getNStep()-1,&start,&count);
552                 SuperClassWriter::writeData(time_data, oss.str(), isCollective, field->getNStep()-1);
553                 break;
554             
555              }
556            }
557         }
558      }
559
560      //---------------------------------------------------------------
561
562      void CNc4DataOutput::writeTimeAxis_
563                  (const boost::shared_ptr<tree::CField>    field,
564                   const boost::shared_ptr<date::CCalendar> cal)
565      {
566         StdOStringStream oss;
567         oss << "time_" << field->operation.getValue()
568             << "_" << field->getRelFile()->output_freq.getValue();
569
570         std::vector<StdString> dims;
571         StdString axisid = oss.str();
572         StdString timeid = StdString("time_counter");
573
574         dims.push_back(timeid);
575         if (!SuperClassWriter::varExist(axisid))
576         {
577            SuperClassWriter::addVariable(axisid, NC_DOUBLE, dims);
578            date::CDate timeOrigin=cal->getTimeOrigin() ;
579//            StdOStringStream oss2;
580//            oss2<<initDate.getYear()<<"-"<<initDate.getMonth()<<"-"<<initDate.getDay()<<" "
581//                <<initDate.getHour()<<"-"<<initDate.getMinute()<<"-"<<initDate.getSecond() ;
582//            StdString strInitdate=oss2.str() ;
583            StdString strTimeOrigin=timeOrigin.toString() ;
584            this->writeTimeAxisAttributes
585               (axisid, cal->getType(),
586                StdString("seconds since ").append(strTimeOrigin),
587                strTimeOrigin);
588         }
589
590      }
591
592      //---------------------------------------------------------------
593     
594      void CNc4DataOutput::writeTimeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
595                                                   const StdString & calendar,
596                                                   const StdString & units,
597                                                   const StdString & time_origin,
598                                                   const StdString & standard_name,
599                                                   const StdString & long_name,
600                                                   const StdString & title)
601      {
602         SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", standard_name, &axis_name);
603         SuperClassWriter::addAttribute("long_name",     long_name    , &axis_name);
604         SuperClassWriter::addAttribute("title",         title        , &axis_name);
605         SuperClassWriter::addAttribute("calendar",      calendar     , &axis_name);
606         SuperClassWriter::addAttribute("units",         units        , &axis_name);
607         SuperClassWriter::addAttribute("time_origin",   time_origin  , &axis_name);
608      }
609     
610      //---------------------------------------------------------------
611
612      void CNc4DataOutput::writeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
613                                               const StdString & axis,
614                                               const StdString & standard_name,
615                                               const StdString & long_name,
616                                               const StdString & units,
617                                               const StdString & nav_model)
618      {
619         SuperClassWriter::addAttribute("axis"         , axis         , &axis_name);
620         SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", standard_name, &axis_name);
621         SuperClassWriter::addAttribute("long_name"    , long_name    , &axis_name);
622         SuperClassWriter::addAttribute("units"        , units        , &axis_name);
623         SuperClassWriter::addAttribute("nav_model"    , nav_model    , &axis_name);
624      }
625
626      //---------------------------------------------------------------
627     
628      void CNc4DataOutput::writeLocalAttributes
629         (int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, StdString domid)
630      {
631         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("ibegin").append(domid), ibegin);
632         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("ni"    ).append(domid), ni);
633         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("jbegin").append(domid), jbegin);
634         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("nj"    ).append(domid), nj);
635      }
636
637      //---------------------------------------------------------------
638
639      void CNc4DataOutput:: writeFileAttributes(const StdString & name,
640                                                const StdString & description,
641                                                const StdString & conventions,
642                                                const StdString & production,
643                                                const StdString & timeStamp)
644      {
645         SuperClassWriter::addAttribute("name"       , name);
646         SuperClassWriter::addAttribute("description", description);
647         SuperClassWriter::addAttribute("conventions", conventions);
648         SuperClassWriter::addAttribute("production" , production);
649         SuperClassWriter::addAttribute("timeStamp"  , timeStamp);
650      }
651
652      //---------------------------------------------------------------
653
654      void CNc4DataOutput::writeMaskAttributes(const StdString & mask_name,
655                                               int data_dim,
656                                               int data_ni,
657                                               int data_nj,
658                                               int data_ibegin,
659                                               int data_jbegin)
660      {
661         SuperClassWriter::addAttribute("data_dim"   , data_dim   , &mask_name);
662         SuperClassWriter::addAttribute("data_ni"    , data_ni    , &mask_name);
663         SuperClassWriter::addAttribute("data_nj"    , data_nj    , &mask_name);
664         SuperClassWriter::addAttribute("data_ibegin", data_ibegin, &mask_name);
665         SuperClassWriter::addAttribute("data_jbegin", data_jbegin, &mask_name);
666      }
667
668      ///--------------------------------------------------------------
669
670} // namespace xios
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.