source: XIOS/trunk/xios_test_suite/TEST_SUITE/step1.py @ 1906

Last change on this file since 1906 was 1906, checked in by yushan, 4 years ago

trunk : cleanup
File size: 11.4 KB
Line 
1import glob
2import sys
3import subprocess
4import os
5import json
6import itertools
7import copy
8
9param_list = ["ATMdomain", "UsingServer2", "NumberClients", "NumberServers", "RatioServer2", "NumberPoolsServer2", "Duration"]
10param_short_list = ["ATMdom", "Srv2", "NbClnt", "NbSrv", "RatioSrv2", "NbPlSrv2", "Duration"]
11
12mode=os.getenv("mode")
13arch=os.getenv("arch")
14machine=os.getenv("xios_machine_name")
15
16nb_proc_irene=40 # this must be >= NumberClients+NumberServers for all configs for all test folders
17nb_proc_jz=40 # to run completly in parallel, this must be set to 40 for the moment
18              # otherwise, jobs should be regrouped by test folder. jobs in folder are parallel, folders are sequential
19              # in this case,nb_proc_jz >= sum(NumberClients+NumberServers) for each test folder
20
21def OSinfo(runthis):
22    red = lambda text: '\033[0;31m' + text + '\033[0m'
23    osstdout = subprocess.Popen(runthis, shell=True, stdin=subprocess.PIPE, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.STDOUT, close_fds=True)
24    theInfo = osstdout.communicate()[0].strip()
25    if osstdout.returncode!=0:
26        print(red(runthis+" FAILED"))
27        print(theInfo)
28        sys.exit()
29
30def product_dict(**kwargs):
31    keys = kwargs.keys()
32    vals = kwargs.values()
33    for instance in itertools.product(*vals):
34        yield dict(zip(keys, instance))
35
36def get_default_param():
37    f=open("default_param.json", 'r')
38    default_param = json.load(f)
39    f.close()
40    return default_param[0]
41
42def generate_job(fn, n):
43    if machine=="irene":
44        with open(fn, "w") as fh:
45            fh.write("#!/bin/bash\n")
46            fh.write("#====================================================\n")
47            fh.write("# Generated by step1.py\n")
48            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
49            fh.write("# For Irene\n")
50            fh.write("#====================================================\n")
51            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
52            fh.write("#MSUB -eo\n")
53            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
54            fh.write("#MSUB -e client_error.out\n")
55            fh.write("#MSUB -c 1\n")
56            fh.write("#MSUB -n "+str(n)+"\n")
57            fh.write("#MSUB -X\n")
58            fh.write("#MSUB -x\n")
59            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
60            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
61            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
62            fh.write("#MSUB -Q test\n")
63            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
64            fh.write("source ../../../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
65            fh.write("ccc_mprun -n "+str(n)+" generic_testcase.exe\n")
66
67    if machine=="jeanzay":
68        with open(fn, "w") as fh:
69            fh.write("#!/bin/bash\n")
70            fh.write("#====================================================\n")
71            fh.write("# Generated by step1.py\n")
72            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
73            fh.write("# For Jean-Zay\n")
74            fh.write("#====================================================\n")
75            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(n)+"\n")
76            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
77            fh.write("#SBATCH -o output.out\n")
78            fh.write("#SBATCH -e error.out\n")
79            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
80            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
81            fh.write("ulimit -c 0\n")
82            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
83            fh.write("source ../../../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
84            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
85            fh.write("srun generic_testcase.exe")
86
87
88def update_full_job(location, n):
89    global my_counter
90    if machine=="irene":
91        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
92            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; ccc_mprun -E \'--exclusive\' -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output.out 2> error.out &\n")
93            fh.write("PIDS+=($!)\n")
94            fh.write("CONFIGS+=("+location+")\n")
95    if machine=="jeanzay":
96        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
97            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; srun --exclusive -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output.out 2> error.out &\n")
98
99def main():
100
101    if machine=="irene":
102        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
103            fh.write("#!/bin/bash\n")
104            fh.write("#====================================================\n")
105            fh.write("# Generated by step1.py\n")
106            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
107            fh.write("#====================================================\n")
108            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
109            fh.write("#MSUB -eo\n")
110            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
111            fh.write("#MSUB -e client_error.err\n")
112            fh.write("#MSUB -c 1\n")
113            fh.write("#MSUB -n "+str(nb_proc_irene)+"\n")
114            fh.write("#MSUB -X\n")
115            fh.write("#MSUB -x\n")
116            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
117            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
118            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
119            fh.write("#MSUB -Q test\n")
120            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
121            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
122            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
123            fh.write("source ../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
124            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
125            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
126     
127    if machine=="jeanzay":
128        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
129            fh.write("#!/bin/bash\n")
130            fh.write("#====================================================\n")
131            fh.write("# Generated by step1.py\n")
132            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
133            fh.write("#====================================================\n")
134            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(nb_proc_jz)+"\n")
135            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
136            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
137            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
138            fh.write("ulimit -c 0\n")
139            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
140            fh.write("source ../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
141            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
142            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
143            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
144            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
145            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
146
147
148
149    test_folder_list = glob.glob('test_*')
150    #all_config=dict()
151
152    default_param = get_default_param()
153    # print(default_param)
154
155    for test_folder in test_folder_list:
156        config_list=[]
157        config_name=[]
158        with open(test_folder+"/user_param.json", "r") as f:
159            config_dict = json.load(f)
160
161        for i in range(len(config_dict)):
162            config_list.extend(list(product_dict(**config_dict[i])))
163            #print(config_list)
164        for i in range(len(config_list)):
165            # print(config_list[i])
166            keylist = list(config_list[i].keys())
167            # print(keylist)
168            full_config = copy.deepcopy(default_param)
169            for j in range(len(keylist)):
170                full_config[ keylist[j] ] = config_list[i][keylist[j]]
171
172            #print(full_config)
173            mystr = str(full_config)
174            mystr = mystr.replace("{", "")
175            mystr = mystr.replace("}", "")
176            mystr = mystr.replace("[", "")
177            mystr = mystr.replace("]", "")
178            mystr = mystr.replace(",", "")
179            mystr = mystr.replace(":", "")
180            mystr = mystr.replace("'", "")
181            mystr = mystr.replace("b'", "")
182            mystr = mystr.replace(" ", "_")
183            for j in range(len(param_list)):
184                mystr = mystr.replace(param_list[j], param_short_list[j])
185            if not mystr in config_name:
186                config_name.append(mystr)
187            #print(mystr)
188            OSinfo("mkdir -p "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
189            OSinfo("cp build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
190            OSinfo("cp iodef.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
191
192            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp", "r") as f:
193                lines = f.readlines()
194                for i in range(len(lines)):
195                    if "XIOS::" in lines[i]:
196                        config_keys = list(full_config.keys())
197                        for idx in range(len(config_keys)):
198                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
199                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml", "w") as g:
200                    for line in lines:
201                        g.write(line)
202
203            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
204            OSinfo("cp "+test_folder+"/context_atm.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
205            OSinfo("cp context_grid_dynamico.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
206            OSinfo("cp dynamico_grid.nc "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
207            OSinfo("cp "+test_folder+"/checkfile.def "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
208            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/param.def", "w") as fh:
209                fh.write("&params_run\n")
210                fh.write("duration=\'"+full_config["Duration"]+"\'\n")
211                fh.write("nb_proc_atm="+str(full_config["NumberClients"])+"\n")
212                fh.write("/\n")
213            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/all_param.def", "w") as fh:
214                fh.write("&params_run\n")
215                for param in param_list:
216                    fh.write(param+"="+str(full_config[param])+"\n")
217                fh.write("/\n")
218
219            generate_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/job_"+arch+"_"+mode+".sh", full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
220            update_full_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr, full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
221
222        #if machine=="jeanzay":
223        #    with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
224        #        fh.write("wait\nwait\n")
225        #        fh.write("echo \"tests in "+test_folder+" finished\"\n")
226        #all_config[test_folder] = config_name
227 
228
229    if machine=="irene":
230        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
231            #fh.write("\nfor pid in ${PIDS[@]}; do\n")
232            #fh.write("wait ${pid}\n")
233            #fh.write("STATUS+=($?)\ndone\n")
234            #fh.write("\ni=0\n")
235            #fh.write("#for st in ${STATUS[@]}; do\n")
236            #fh.write("#if [[ ${st} -ne 0 ]]; then\n")
237            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} -1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
238            #fh.write("#else\n")
239            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} 1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
240            #fh.write("#fi\n")
241            #fh.write("#((i+=1))\n")
242            #fh.write("#done\n\n")
243            fh.write("wait\nwait\n")
244            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
245    if machine=="jeanzay":
246        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
247            fh.write("wait\nwait\n")
248            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
249
250
251if __name__== "__main__":
252  main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.