source: XIOS3/branches/xios-3.0-beta/src/server.cpp @ 2427

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Backport the system to log the memory consumption (commit ID [2418-2420,2425-2426])

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:eol-style set to native
File size: 18.3 KB
Line 
1#include "globalScopeData.hpp"
2#include "xios_spl.hpp"
3#include "cxios.hpp"
4#include "server.hpp"
5#include "client.hpp"
6#include "type.hpp"
7#include "context.hpp"
8#include "object_template.hpp"
9#include "oasis_cinterface.hpp"
10#include <boost/functional/hash.hpp>
11#include <boost/algorithm/string.hpp>
12#include "mpi.hpp"
13#include "tracer.hpp"
14#include "timer.hpp"
15#include "mem_checker.hpp"
16#include "event_scheduler.hpp"
17#include "string_tools.hpp"
18#include "ressources_manager.hpp"
19#include "services_manager.hpp"
20#include "contexts_manager.hpp"
21#include "servers_ressource.hpp"
22#include "services.hpp"
23#include <cstdio>
24#include "workflow_graph.hpp"
25#include "release_static_allocation.hpp"
26#include <sys/stat.h>
27#include <unistd.h>
28
29
30
31namespace xios
32{
33    MPI_Comm CServer::intraComm_ ;
34    MPI_Comm CServer::serversComm_ ;
35    std::list<MPI_Comm> CServer::interCommLeft ;
36    std::list<MPI_Comm> CServer::interCommRight ;
37    std::list<MPI_Comm> CServer::contextInterComms;
38    std::list<MPI_Comm> CServer::contextIntraComms;
39    int CServer::serverLevel = 0 ;
40    int CServer::nbContexts = 0;
41    bool CServer::isRoot = false ;
42    int CServer::rank_ = INVALID_RANK;
43    StdOFStream CServer::m_infoStream;
44    StdOFStream CServer::m_errorStream;
45    map<string,CContext*> CServer::contextList ;
46    vector<int> CServer::sndServerGlobalRanks;
47    bool CServer::finished=false ;
48    bool CServer::is_MPI_Initialized ;
49    CEventScheduler* CServer::eventScheduler = 0;
50    CServersRessource* CServer::serversRessource_=nullptr ;
51    CThirdPartyDriver* CServer::driver_ =nullptr ;
52
53       
54    void CServer::initialize(void)
55    {
56     
57      MPI_Comm serverComm ;
58      int initialized ;
59      MPI_Initialized(&initialized) ;
60      if (initialized) is_MPI_Initialized=true ;
61      else is_MPI_Initialized=false ;
62      MPI_Comm globalComm=CXios::getGlobalComm() ;
63      CTimer::get("XIOS server").resume() ;
64      /////////////////////////////////////////
65      ///////////// PART 1 ////////////////////
66      /////////////////////////////////////////
67      // don't use OASIS
68      if (!CXios::usingOasis)
69      {
70        if (!is_MPI_Initialized) MPI_Init(NULL, NULL);
71       
72        // split the global communicator
73        // get hash from all model to attribute a unique color (int) and then split to get client communicator
74        // every mpi process of globalComm (MPI_COMM_WORLD) must participate
75         
76        int commRank, commSize ;
77        MPI_Comm_rank(globalComm,&commRank) ;
78        MPI_Comm_size(globalComm,&commSize) ;
79
80        std::hash<string> hashString ;
81        size_t hashServer=hashString(CXios::xiosCodeId) ;
82         
83        size_t* hashAll = new size_t[commSize] ;
84        MPI_Allgather(&hashServer,1,MPI_SIZE_T,hashAll,1,MPI_SIZE_T,globalComm) ;
85         
86        int color=0 ;
87        map<size_t,int> listHash ;
88        for(int i=0 ; i<=commSize ; i++) 
89          if (listHash.count(hashAll[i])==0) 
90          {
91            listHash[hashAll[i]]=color ;
92            color=color+1 ;
93          }
94        color=listHash[hashServer] ;
95        delete[] hashAll ;
96
97        MPI_Comm_split(globalComm, color, commRank, &serverComm) ;
98      }
99      else // using OASIS
100      {
101        if (!is_MPI_Initialized) driver_ = new CThirdPartyDriver();
102
103        driver_->getComponentCommunicator( serverComm );
104      }
105      MPI_Comm_dup(serverComm, &intraComm_);
106     
107      CTimer::get("XIOS").resume() ;
108      CTimer::get("XIOS initialize").resume() ;
109 
110      /////////////////////////////////////////
111      ///////////// PART 2 ////////////////////
112      /////////////////////////////////////////
113     
114
115      // Create the XIOS communicator for every process which is related
116      // to XIOS, as well on client side as on server side
117      MPI_Comm xiosGlobalComm ;
118      string strIds=CXios::getin<string>("clients_code_id","") ;
119      vector<string> clientsCodeId=splitRegex(strIds,"\\s*,\\s*") ;
120      if (strIds.empty())
121      {
122        // no code Ids given, suppose XIOS initialisation is global           
123        int commRank, commGlobalRank, serverLeader, clientLeader,serverRemoteLeader,clientRemoteLeader ;
124        MPI_Comm splitComm,interComm ;
125        MPI_Comm_rank(globalComm,&commGlobalRank) ;
126        MPI_Comm_split(globalComm, 1, commGlobalRank, &splitComm) ;
127        MPI_Comm_rank(splitComm,&commRank) ;
128        if (commRank==0) serverLeader=commGlobalRank ;
129        else serverLeader=0 ;
130        clientLeader=0 ;
131        MPI_Allreduce(&clientLeader,&clientRemoteLeader,1,MPI_INT,MPI_SUM,globalComm) ;
132        MPI_Allreduce(&serverLeader,&serverRemoteLeader,1,MPI_INT,MPI_SUM,globalComm) ;
133        MPI_Intercomm_create(splitComm, 0, globalComm, clientRemoteLeader,1341,&interComm) ;
134        MPI_Intercomm_merge(interComm,false,&xiosGlobalComm) ;
135        CXios::setXiosComm(xiosGlobalComm) ;
136      }
137      else
138      {
139
140        xiosGlobalCommByFileExchange(serverComm) ;
141
142      }
143     
144      /////////////////////////////////////////
145      ///////////// PART 4 ////////////////////
146      //  create servers intra communicator  //
147      /////////////////////////////////////////
148     
149      int commRank ;
150      MPI_Comm_rank(CXios::getXiosComm(), &commRank) ;
151      MPI_Comm_split(CXios::getXiosComm(),true,commRank,&serversComm_) ;
152     
153      CXios::setUsingServer() ;
154
155      /////////////////////////////////////////
156      ///////////// PART 5 ////////////////////
157      //       redirect files output         //
158      /////////////////////////////////////////
159     
160      CServer::openInfoStream(CXios::serverFile);
161      CServer::openErrorStream(CXios::serverFile);
162
163      CMemChecker::logMem( "CServer::initialize" );
164
165      /////////////////////////////////////////
166      ///////////// PART 4 ////////////////////
167      /////////////////////////////////////////
168
169      CXios::launchDaemonsManager(true) ;
170     
171      /////////////////////////////////////////
172      ///////////// PART 5 ////////////////////
173      /////////////////////////////////////////
174
175      // create the services
176
177      auto ressourcesManager=CXios::getRessourcesManager() ;
178      auto servicesManager=CXios::getServicesManager() ;
179      auto contextsManager=CXios::getContextsManager() ;
180      auto daemonsManager=CXios::getDaemonsManager() ;
181      auto serversRessource=CServer::getServersRessource() ;
182
183      int rank;
184      MPI_Comm_rank(intraComm_, &rank) ;
185      if (rank==0) isRoot=true;
186      else isRoot=false;
187
188      if (serversRessource->isServerLeader())
189      {
190        int nbRessources = ressourcesManager->getRessourcesSize() ;
191        if (!CXios::usingServer2)
192        {
193          ressourcesManager->createPool(CXios::defaultPoolId, nbRessources) ;
194          servicesManager->createServices(CXios::defaultPoolId, CXios::defaultServerId, CServicesManager::IO_SERVER,nbRessources,1) ;
195        }
196        else
197        {
198          int nprocsServer = nbRessources*CXios::ratioServer2/100.;
199          int nprocsGatherer = nbRessources - nprocsServer ;
200         
201          int nbPoolsServer2 = CXios::nbPoolsServer2 ;
202          if (nbPoolsServer2 == 0) nbPoolsServer2 = nprocsServer;
203          ressourcesManager->createPool(CXios::defaultPoolId, nbRessources) ;
204          servicesManager->createServices(CXios::defaultPoolId,  CXios::defaultGathererId, CServicesManager::GATHERER, nprocsGatherer, 1) ;
205          servicesManager->createServices(CXios::defaultPoolId,  CXios::defaultServerId, CServicesManager::OUT_SERVER, nprocsServer, nbPoolsServer2) ;
206
207
208        }
209        servicesManager->createServices(CXios::defaultPoolId,  CXios::defaultServicesId, CServicesManager::ALL_SERVICES, nbRessources, 1) ;
210      }
211      CTimer::get("XIOS initialize").suspend() ;
212
213      /////////////////////////////////////////
214      ///////////// PART 5 ////////////////////
215      /////////////////////////////////////////
216      // loop on event loop
217
218      bool finished=false ;
219      CTimer::get("XIOS event loop").resume() ;
220
221      while (!finished)
222      {
223        finished=daemonsManager->eventLoop() ;
224      }
225      CTimer::get("XIOS event loop").suspend() ;
226
227      // Delete CContext
228      //CObjectTemplate<CContext>::cleanStaticDataStructure();
229    }
230
231
232
233
234
235    void  CServer::xiosGlobalCommByFileExchange(MPI_Comm serverComm)
236    {
237       
238      MPI_Comm globalComm=CXios::getGlobalComm() ;
239      MPI_Comm xiosGlobalComm ;
240     
241      string strIds=CXios::getin<string>("clients_code_id","") ;
242      vector<string> clientsCodeId=splitRegex(strIds,"\\s*,\\s*") ;
243     
244      int commRank, globalRank ;
245      MPI_Comm_rank(serverComm, &commRank) ;
246      MPI_Comm_rank(globalComm, &globalRank) ;
247      string serverFileName("__xios_publisher::"+CXios::xiosCodeId+"__to_remove__") ;
248
249      if (commRank==0) // if root process publish name
250      { 
251        std::ofstream ofs (serverFileName, std::ofstream::out);
252        ofs<<globalRank ;
253        ofs.close();
254      }
255       
256      vector<int> clientsRank(clientsCodeId.size()) ;
257      for(int i=0;i<clientsRank.size();i++)
258      {
259        std::ifstream ifs ;
260        string fileName=("__xios_publisher::"+clientsCodeId[i]+"__to_remove__") ;
261        struct stat buffer;
262        do {
263        } while( stat(fileName.c_str(), &buffer) != 0 );
264        sleep(1);
265        ifs.open(fileName, ifstream::in) ;
266        ifs>>clientsRank[i] ;
267        //cout <<  "\t\t read: " << clientsRank[i] << " in " << fileName << endl;
268        ifs.close() ; 
269      }
270
271      MPI_Comm intraComm ;
272      MPI_Comm_dup(serverComm,&intraComm) ;
273      MPI_Comm interComm ;
274      for(int i=0 ; i<clientsRank.size(); i++)
275      { 
276        MPI_Intercomm_create(intraComm, 0, globalComm, clientsRank[i], 3141, &interComm);
277        interCommLeft.push_back(interComm) ;
278        MPI_Comm_free(&intraComm) ;
279        MPI_Intercomm_merge(interComm,false, &intraComm ) ;
280      }
281      xiosGlobalComm=intraComm ; 
282      MPI_Barrier(xiosGlobalComm);
283      if (commRank==0) std::remove(serverFileName.c_str()) ;
284      MPI_Barrier(xiosGlobalComm);
285
286      CXios::setXiosComm(xiosGlobalComm) ;
287     
288    }
289
290
291    void  CServer::xiosGlobalCommByPublishing(MPI_Comm serverComm)
292    {
293        // untested, need to be tested on a true MPI-2 compliant library
294
295        // try to discover other client/server
296/*
297        // publish server name
298        char portName[MPI_MAX_PORT_NAME];
299        int ierr ;
300        int commRank ;
301        MPI_Comm_rank(serverComm, &commRank) ;
302       
303        if (commRank==0) // if root process publish name
304        { 
305          MPI_Open_port(MPI_INFO_NULL, portName);
306          MPI_Publish_name(CXios::xiosCodeId.c_str(), MPI_INFO_NULL, portName);
307        }
308
309        MPI_Comm intraComm=serverComm ;
310        MPI_Comm interComm ;
311        for(int i=0 ; i<clientsCodeId.size(); i++)
312        { 
313          MPI_Comm_accept(portName, MPI_INFO_NULL, 0, intraComm, &interComm);
314          MPI_Intercomm_merge(interComm,false, &intraComm ) ;
315        }
316*/     
317    }
318
319   /*!
320    * Root process is listening for an order sent by client to call "oasis_enddef".
321    * The root client of a compound send the order (tag 5). It is probed and received.
322    * When the order has been received from each coumpound, the server root process ping the order to the root processes of the secondary levels of servers (if any).
323    * After, it also inform (asynchronous call) other processes of the communicator that the oasis_enddef call must be done
324    */
325   
326     void CServer::listenOasisEnddef(void)
327     {
328        int flag ;
329        MPI_Status status ;
330        list<MPI_Comm>::iterator it;
331        int msg ;
332        static int nbCompound=0 ;
333        int size ;
334        static bool sent=false ;
335        static MPI_Request* allRequests ;
336        static MPI_Status* allStatus ;
337
338
339        if (sent)
340        {
341          MPI_Comm_size(intraComm_,&size) ;
342          MPI_Testall(size,allRequests, &flag, allStatus) ;
343          if (flag==true)
344          {
345            delete [] allRequests ;
346            delete [] allStatus ;
347            sent=false ;
348          }
349        }
350       
351
352        for(it=interCommLeft.begin();it!=interCommLeft.end();it++)
353        {
354           MPI_Status status ;
355           traceOff() ;
356           MPI_Iprobe(0,5,*it,&flag,&status) ;  // tags oasis_endded = 5
357           traceOn() ;
358           if (flag==true)
359           {
360              MPI_Recv(&msg,1,MPI_INT,0,5,*it,&status) ; // tags oasis_endded = 5
361              nbCompound++ ;
362              if (nbCompound==interCommLeft.size())
363              {
364                MPI_Comm_size(intraComm_,&size) ;
365                allRequests= new MPI_Request[size] ;
366                allStatus= new MPI_Status[size] ;
367                for(int i=0;i<size;i++) MPI_Isend(&msg,1,MPI_INT,i,5,intraComm_,&allRequests[i]) ; // tags oasis_endded = 5
368                sent=true ;
369              }
370           }
371        }
372}
373     
374   /*!
375    * Processes probes message from root process if oasis_enddef call must be done.
376    * When the order is received it is scheduled to be treated in a synchronized way by all server processes of the communicator
377    */
378     void CServer::listenRootOasisEnddef(void)
379     {
380       int flag ;
381       MPI_Status status ;
382       const int root=0 ;
383       int msg ;
384       static bool eventSent=false ;
385
386       if (eventSent)
387       {
388         boost::hash<string> hashString;
389         size_t hashId = hashString("oasis_enddef");
390         if (CXios::getPoolRessource()->getService(CXios::defaultServicesId,0)->getEventScheduler()->queryEvent(0,hashId))
391         {
392           CXios::getPoolRessource()->getService(CXios::defaultServicesId,0)->getEventScheduler()->popEvent() ;
393           driver_->endSynchronizedDefinition() ;
394           eventSent=false ;
395         }
396       }
397         
398       traceOff() ;
399       MPI_Iprobe(root,5,intraComm_, &flag, &status) ;
400       traceOn() ;
401       if (flag==true)
402       {
403           MPI_Recv(&msg,1,MPI_INT,root,5,intraComm_,&status) ; // tags oasis_endded = 5
404           boost::hash<string> hashString;
405           size_t hashId = hashString("oasis_enddef");
406           CXios::getPoolRessource()->getService(CXios::defaultServicesId,0)->getEventScheduler()->registerEvent(0,hashId);
407           eventSent=true ;
408       }
409     }
410
411    void CServer::finalize(void)
412    {
413      CTimer::get("XIOS").suspend() ;
414      CTimer::get("XIOS server").suspend() ;
415      delete eventScheduler ;
416
417      for (std::list<MPI_Comm>::iterator it = contextInterComms.begin(); it != contextInterComms.end(); it++)
418        MPI_Comm_free(&(*it));
419
420      for (std::list<MPI_Comm>::iterator it = contextIntraComms.begin(); it != contextIntraComms.end(); it++)
421        MPI_Comm_free(&(*it));
422
423        for (std::list<MPI_Comm>::iterator it = interCommRight.begin(); it != interCommRight.end(); it++)
424          MPI_Comm_free(&(*it));
425
426//      MPI_Comm_free(&intraComm);
427      CXios::finalizeDaemonsManager();
428      finalizeServersRessource();
429     
430      CContext::removeAllContexts() ; // free memory for related context
431         
432      CXios::getMpiGarbageCollector().release() ; // release unfree MPI ressources
433
434      CMemChecker::logMem( "CServer::finalize", true );
435      if (!is_MPI_Initialized)
436      {
437        if (CXios::usingOasis) delete driver_;
438        else MPI_Finalize() ;
439      }
440      report(0)<<"Performance report : Time spent for XIOS : "<<CTimer::get("XIOS server").getCumulatedTime()<<endl  ;
441      report(0)<<"Performance report : Time spent in processing events : "<<CTimer::get("Process events").getCumulatedTime()<<endl  ;
442      report(0)<<"Performance report : Ratio : "<<CTimer::get("Process events").getCumulatedTime()/CTimer::get("XIOS server").getCumulatedTime()*100.<<"%"<<endl  ;
443      report(100)<<CTimer::getAllCumulatedTime()<<endl ;
444      report(100)<<CMemChecker::getAllCumulatedMem()<<endl ;
445     
446      CWorkflowGraph::drawWorkFlowGraph_server();
447      xios::releaseStaticAllocation() ; // free memory from static allocation
448    }
449
450    /*!
451    * Open a file specified by a suffix and an extension and use it for the given file buffer.
452    * The file name will be suffix+rank+extension.
453    *
454    * \param fileName[in] protype file name
455    * \param ext [in] extension of the file
456    * \param fb [in/out] the file buffer
457    */
458    void CServer::openStream(const StdString& fileName, const StdString& ext, std::filebuf* fb)
459    {
460      StdStringStream fileNameServer;
461      int numDigit = 0;
462      int commSize = 0;
463      int commRank ;
464      int id;
465     
466      MPI_Comm_size(CXios::getGlobalComm(), &commSize);
467      MPI_Comm_rank(CXios::getGlobalComm(), &commRank);
468
469      while (commSize)
470      {
471        commSize /= 10;
472        ++numDigit;
473      }
474      id = commRank;
475
476      fileNameServer << fileName << "_" << std::setfill('0') << std::setw(numDigit) << id << ext;
477      fb->open(fileNameServer.str().c_str(), std::ios::out);
478      if (!fb->is_open())
479        ERROR("void CServer::openStream(const StdString& fileName, const StdString& ext, std::filebuf* fb)",
480              << std::endl << "Can not open <" << fileNameServer.str() << "> file to write the server log(s).");
481    }
482
483    /*!
484    * \brief Open a file stream to write the info logs
485    * Open a file stream with a specific file name suffix+rank
486    * to write the info logs.
487    * \param fileName [in] protype file name
488    */
489    void CServer::openInfoStream(const StdString& fileName)
490    {
491      std::filebuf* fb = m_infoStream.rdbuf();
492      openStream(fileName, ".out", fb);
493
494      info.write2File(fb);
495      report.write2File(fb);
496    }
497
498    //! Write the info logs to standard output
499    void CServer::openInfoStream()
500    {
501      info.write2StdOut();
502      report.write2StdOut();
503    }
504
505    //! Close the info logs file if it opens
506    void CServer::closeInfoStream()
507    {
508      if (m_infoStream.is_open()) m_infoStream.close();
509    }
510
511    /*!
512    * \brief Open a file stream to write the error log
513    * Open a file stream with a specific file name suffix+rank
514    * to write the error log.
515    * \param fileName [in] protype file name
516    */
517    void CServer::openErrorStream(const StdString& fileName)
518    {
519      std::filebuf* fb = m_errorStream.rdbuf();
520      openStream(fileName, ".err", fb);
521
522      error.write2File(fb);
523    }
524
525    //! Write the error log to standard error output
526    void CServer::openErrorStream()
527    {
528      error.write2StdErr();
529    }
530
531    //! Close the error log file if it opens
532    void CServer::closeErrorStream()
533    {
534      if (m_errorStream.is_open()) m_errorStream.close();
535    }
536
537    void CServer::launchServersRessource(MPI_Comm serverComm)
538    {
539      serversRessource_ = new CServersRessource(serverComm) ;
540    }
541
542    void  CServer::finalizeServersRessource(void) 
543    { 
544      delete serversRessource_; serversRessource_=nullptr ;
545    }
546}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.