source: tags/libIGCM_v2.0_rc1/AA_atlas_PISCES @ 1137

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  • use xlarge class on curie
  • comment header tweaking for ensemble due to bas side effect
  • Property svn:keywords set to Revision Author Date
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Line 
1#-Q- cesium #!/bin/ksh
2#-Q- cesium ######################
3#-Q- cesium ## CESIUM   CEA ##
4#-Q- cesium ######################
5#-Q- cesium #MSUB -r ATL_PIS        # Nom du job               
6#-Q- cesium #MSUB -N 1              # Reservation du noeud
7#-Q- cesium #MSUB -n 1              # Reservation du processus
8#-Q- cesium #MSUB -T 86400          # Limite de temps elapsed du job
9#-Q- cesium #MSUB -E "-j o"
10#-Q- cesium #MSUB -E "-S /bin/ksh"
11#-Q- curie ######################
12#-Q- curie ## CURIE   TGCC/CEA ##
13#-Q- curie ######################
14#-Q- curie #MSUB -r ATL_PIS        # Nom du job               
15#-Q- curie #MSUB -eo
16#-Q- curie #MSUB -n 1              # Reservation du processus
17#-Q- curie #MSUB -T 86400          # Limite de temps elapsed du job
18#-Q- curie #MSUB -E '--no-requeue'
19#-Q- curie #MSUB -q xlarge
20#-Q- curie #MSUB -Q normal
21#-Q- curie set +x
22#-Q- platine #!/usr/bin/ksh
23#-Q- platine ##################
24#-Q- platine ## PLATINE   CEA ##
25#-Q- platine ##################
26#-Q- platine #BSUB -J ATL_PIS           # Nom du job
27#-Q- platine #BSUB -N                   # message a la fin du job
28#-Q- platine #BSUB -n 1                 # reservation des processeurs pour le job
29#-Q- platine #BSUB -W 1:00              # Limite temps
30#-Q- platine #BSUB -q post              # Passage en queue post
31#-Q- platine #BSUB -L /bin/ksh
32#-Q- sx8brodie #!/bin/ksh
33#-Q- sx8brodie #######################
34#-Q- sx8brodie ## SX8BRODIE   IDRIS ##
35#-Q- sx8brodie #######################
36#-Q- sx8brodie # Temps Elapsed max. d'une requete hh:mm:ss
37#-Q- sx8brodie # @ wall_clock_limit = 1:00:00
38#-Q- sx8brodie # Nom du travail LoadLeveler
39#-Q- sx8brodie # @ job_name   = ATL_PIS
40#-Q- sx8brodie # Fichier de sortie standard du travail       
41#-Q- sx8brodie # @ output     = $(job_name).$(jobid)
42#-Q- sx8brodie # Fichier de sortie d'erreur du travail
43#-Q- sx8brodie # @ error      =  $(job_name).$(jobid)
44#-Q- sx8brodie # pour recevoir un mail en cas de depassement du temps Elapsed (ou autre pb.)
45#-Q- sx8brodie # @ notification = error
46#-Q- sx8brodie # @ environment  = $POST_DIR ; $SUBMIT_DIR ; $libIGCM ; $R_INIT ; $R_BC ; $StandAlone ; $RESOL_ATM ; $RESOL_OCE ; $RESOL_ICE ; $RESOL_MBG ; $RESOL_SRF ; $R_SAVE ; $config_UserChoices_JobName ; $config_UserChoices_TagName ; $YEARS ; $DIR_OUT ; $MASTER ; $libIGCM_SX
47#-Q- sx8brodie # @ queue
48#-Q- aix6 #!/bin/ksh
49#-Q- aix6 #######################
50#-Q- aix6 ##   VARGAS   IDRIS  ##
51#-Q- aix6 #######################
52#-Q- aix6 # Temps Elapsed max. d'une requete hh:mm:ss
53#-Q- aix6 # @ wall_clock_limit = 1:00:00
54#-Q- aix6 # Nom du travail LoadLeveler
55#-Q- aix6 # @ job_name   = ATL_PIS
56#-Q- aix6 # Fichier de sortie standard du travail       
57#-Q- aix6 # @ output     = $(job_name).$(jobid)
58#-Q- aix6 # Fichier de sortie d'erreur du travail
59#-Q- aix6 # @ error      =  $(job_name).$(jobid)
60#-Q- aix6 # pour recevoir un mail en cas de depassement du temps Elapsed (ou autre pb.)
61#-Q- aix6 # @ notification = error
62#-Q- aix6 # @ environment  = $POST_DIR ; $SUBMIT_DIR ; $libIGCM ; $R_INIT ; $R_BC ; $StandAlone ; $RESOL_ATM ; $RESOL_OCE ; $RESOL_ICE ; $RESOL_MBG ; $RESOL_SRF ; $R_SAVE ; $config_UserChoices_JobName ; $config_UserChoices_TagName ; $YEARS ; $DIR_OUT ; $MASTER ; $libIGCM_SX
63#-Q- aix6 # @ queue
64#-Q- ulam #!/bin/ksh
65#-Q- ulam #######################
66#-Q- ulam ##   ULAM   IDRIS  ##
67#-Q- ulam #######################
68#-Q- ulam # Temps Elapsed max. d'une requete hh:mm:ss
69#-Q- ulam # @ wall_clock_limit = 1:00:00
70#-Q- ulam # Nom du travail LoadLeveler
71#-Q- ulam # @ job_name   = ATL_PIS
72#-Q- ulam # Fichier de sortie standard du travail       
73#-Q- ulam # @ output     = $(job_name).$(jobid)
74#-Q- ulam # Fichier de sortie d'erreur du travail
75#-Q- ulam # @ error      =  $(job_name).$(jobid)
76#-Q- ulam # pour recevoir un mail en cas de depassement du temps Elapsed (ou autre pb.)
77#-Q- ulam # @ notification = error
78#-Q- ulam # @ environment  = $POST_DIR ; $SUBMIT_DIR ; $libIGCM ; $R_INIT ; $R_BC ; $StandAlone ; $RESOL_ATM ; $RESOL_OCE ; $RESOL_ICE ; $RESOL_MBG ; $RESOL_SRF ; $R_SAVE ; $config_UserChoices_JobName ; $config_UserChoices_TagName ; $YEARS ; $DIR_OUT ; $MASTER ; $libIGCM_SX
79#-Q- ulam # @ queue
80#-Q- sx8mercure #!/bin/ksh
81#-Q- sx8mercure ######################
82#-Q- sx8mercure ## SX8MERCURE   CEA ##
83#-Q- sx8mercure ######################
84#-Q- sx8mercure #PBS -N  ATL_PIS             # Nom du job
85#-Q- sx8mercure #PBS -j o                    # regroupement des stdout et stderr
86#-Q- sx8mercure #PBS -S /usr/bin/ksh         # shell de soumission
87#-Q- sx8mercure #PBS -l memsz_job=1gb        # Limite memoire a 1 Go
88#-Q- sx8mercure #PBS -l cputim_job=2:00:00   # Limite temps a 2 heures
89#-Q- sx8mercure #PBS -q scalaire
90#-Q- sx8mercure #PBS -r n
91#-Q- sx9mercure #!/bin/ksh
92#-Q- sx9mercure ######################
93#-Q- sx9mercure ## SX9MERCURE  CCRT ##
94#-Q- sx9mercure ######################
95#-Q- sx9mercure #PBS -N  ATL_PIS             # Nom du job
96#-Q- sx9mercure #PBS -j o                    # regroupement des stdout et stderr
97#-Q- sx9mercure #PBS -S /usr/bin/ksh         # shell de soumission
98#-Q- sx9mercure #PBS -l memsz_job=1gb        # Limite memoire a 1 Go
99#-Q- sx9mercure #PBS -l elapstim_req=2:00:00   # Limite temps a 2 heures
100#-Q- sx9mercure #PBS -q scalaire
101#-Q- sx9mercure #PBS -r n
102#-Q- titane #!/bin/ksh
103#-Q- titane ######################
104#-Q- titane ## TITANE   CEA ##
105#-Q- titane ######################
106#-Q- titane #MSUB -r ATL_PIS        # Nom du job
107#-Q- titane #MSUB -eo
108#-Q- titane #MSUB -n 1              # Reservation du processus
109#-Q- titane #MSUB -T 86400          # Limite de temps elapsed du job
110#-Q- titane #MSUB -q mono
111#-Q- titane #MSUB -E '-rn'
112#-Q- default #!/bin/ksh
113#-Q- default ##################
114#-Q- default ## DEFAULT HOST ##
115#-Q- default ##################
116
117#**************************************************************
118# Author: Christian Ethe
119# Contact: Christian.Ethe__at__ipsl.jussieu.fr
120# $Revision::                                          $ Revision of last commit
121# $Author::                                            $ Author of last commit
122# $Date::                                              $ Date of last commit
123# IPSL (2006)
124#  This software is governed by the CeCILL licence see libIGCM/libIGCM_CeCILL.LIC
125#
126#**************************************************************
127
128#set -eu
129#set -vx
130
131date
132
133#-Q- sx8brodie export OMP_NUM_THREADS=1
134#-Q- aix6 export OMP_NUM_THREADS=1
135#-Q- ulam export OMP_NUM_THREADS=1
136
137#D- Task type (computing or post-processing)
138TaskType=post-processing
139
140########################################################################
141
142. ${libIGCM}/libIGCM_debug/libIGCM_debug.ksh
143      ( ${DEBUG_debug} ) && IGCM_debug_Check
144. ${libIGCM}/libIGCM_card/libIGCM_card.ksh
145     ( ${DEBUG_debug} ) && IGCM_card_Check
146. ${libIGCM}/libIGCM_date/libIGCM_date.ksh
147     ( ${DEBUG_debug} ) && IGCM_date_Check
148#-------
149. ${libIGCM}/libIGCM_sys/libIGCM_sys.ksh
150. ${libIGCM}/libIGCM_config/libIGCM_config.ksh
151
152########################################################################
153
154#set -vx
155
156IGCM_sys_MkdirWork ${RUN_DIR_PATH}
157IGCM_sys_Cd ${RUN_DIR_PATH}
158
159# ------------------------------------------------------------------
160# Test if all was right before proceeding further
161# ------------------------------------------------------------------
162IGCM_debug_Verif_Exit_Post
163
164if [ ${StandAlone} = true ] ; then
165    CARD_DIR=${SUBMIT_DIR}
166else
167    CARD_DIR=${RUN_DIR_PATH}
168    IGCM_sys_Get_Master ${SUBMIT_DIR}/config.card ${RUN_DIR_PATH}
169    IGCM_sys_Get_Master ${SUBMIT_DIR}/run.card    ${RUN_DIR_PATH}
170    IGCM_sys_Get_Master ${SUBMIT_DIR}/COMP        ${RUN_DIR_PATH}
171    IGCM_sys_Get_Master ${SUBMIT_DIR}/POST        ${RUN_DIR_PATH}
172fi
173
174#==================================
175# First of all
176#
177# Read libIGCM compatibility version in config.card
178# Read UserChoices section
179# Read Ensemble section
180# Read Post section
181# Define all netcdf output directories
182#==================================
183IGCM_config_CommonConfiguration ${CARD_DIR}/config.card
184
185IGCM_sys_MkdirArchive ${R_FIGR}
186
187R_ATLAS=ATLAS/SE_${YEARS}
188R_OUT_MBG=${R_SAVE}/MBG
189DIR_OUT=${DIR_OUT:=SE}
190
191RUN_DIR=${RUN_DIR_PATH}/ATLAS_PISCES_${YEARS}
192IGCM_sys_MkdirWork ${RUN_DIR}
193IGCM_sys_Cd ${RUN_DIR}
194
195# --------------------------------------------
196# Insert your commands between III...III lines
197# and precise produced directories to save
198# IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
199
200IGCM_sys_Get ${R_OUT_MBG}/Analyse/${DIR_OUT}/${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_ptrc_T.nc  ${RUN_DIR}
201IGCM_sys_Get ${R_OUT_MBG}/Analyse/${DIR_OUT}/${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_diad_T.nc  ${RUN_DIR}
202
203atlas -o ${RUN_DIR}/${R_ATLAS}/MBG_T -l ${FER_ATLAS}/atlas_p_PISCES_diag1_*.cfg  \
204                                        ${FER_ATLAS}/atlas_p_PISCES_diag0_a.cfg  ${RUN_DIR}/${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_ptrc_T.nc
205atlas -o ${RUN_DIR}/${R_ATLAS}/MBG_F -l ${FER_ATLAS}/atlas_p_PISCES_diag2_a.cfg  \
206                                        ${FER_ATLAS}/atlas_p_PISCES_diag0_b.cfg  ${RUN_DIR}/${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_diad_T.nc
207
208# IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
209
210# Put ferret journal files together
211for file in $( ls ${R_ATLAS}/MBG_T/*/*jnl ) ; do
212    echo -e "\n\n################################" ;
213    echo -e "$file\n" ; cat $file ;
214done  > ${R_ATLAS}/MBG_T/allferretscript.txt
215
216for file in $( ls ${R_ATLAS}/MBG_F/*/*jnl ) ; do
217    echo -e "\n\n################################" ;
218    echo -e "$file\n" ; cat $file ;
219done  > ${R_ATLAS}/MBG_F/allferretscript.txt
220# Clear some files
221find . \( -name "*.stdout" -o -name "*.jnl" \) -print -exec rm -f {} \;
222
223# Save files
224IGCM_sys_Put_Dir ATLAS ${R_FIGR}
225
226IGCM_sys_Rm -Rf ATLAS
227IGCM_sys_Rm ${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_ptrc_T.nc
228IGCM_sys_Rm ${config_UserChoices_JobName}_SE_${YEARS}_1M_diad_T.nc
229
230# DODS copy
231IGCM_sys_TestDirArchive ${R_FIGR}/${R_ATLAS}
232[ $? = 0 ] && IGCM_sys_Put_Dods ${R_ATLAS}
233
234# Clean RUN_DIR_PATH (necessary for cesium and titane only)
235IGCM_sys_RmRunDir -Rf ${RUN_DIR_PATH}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.