Changeset 7 for trunk/NEMOGCM/CONFIG


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cholod
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  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/AMM12/EXP00/namelist

    r1 r7  
    525525   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme                  
    526526/ 
    527 !----------------------------------------------------------------------- 
    528 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    529 !----------------------------------------------------------------------- 
    530    !                       !  Type of the operator :  
    531    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    532    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    533    !                       !  Direction of action  : 
    534    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    535    ln_traldf_hor    =  .true.   !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    536    ln_traldf_iso    =  .false.  !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    537    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp") 
    538    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") 
    539    ln_triad_iso     =  .false.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
    540    ln_botmix_grif   =  .false.  !  griffies operator with lateral mixing on bottom (require "key_ldfslp") 
    541                          !  Coefficient 
    542    rn_aht_0         =   50.     !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     527!---------------------------------------------------------------------------------- 
     528&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     529!---------------------------------------------------------------------------------- 
     530   !                       !  Operator type: 
     531   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
     532   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     533   !                       !  Direction of action: 
     534   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
     535   ln_traldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     536   ln_traldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
     537   !                       !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
     538   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
     539   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
     540   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
     541   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
     542   !                       !  Coefficients 
     543   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
     544   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
     545   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
     546   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
     547   rn_aht_0         =    50.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    543548   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    544    rn_aeiv_0        =    0.     !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     549   !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    545550/ 
    546551!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    857862    nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis 
    858863    nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis 
    859     nb_ana     = 2         ! Number of harmonics to analyse 
    860864    tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents 
    861865    tname(2)   = 'K1' 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r1 r7  
    136136        <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    137137        <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    138         <field id="uocetr_eff"   description="Effective ocean transport along i-axis"      unit="m3/s"                  /> 
     138        <field id="uocetr_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    139139        <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    140140        <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  /> 
    … …  
    154154        <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" /> 
    155155        <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  /> 
    156         <field id="vocetr_eff"   description="Effective ocean transport along j-axis"      unit="m3/s"                  /> 
     156        <field id="vocetr_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"    unit="m3/s"                 /> 
    157157        <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    158158        <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  /> 
    … …  
    171171      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W"> 
    172172        <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  /> 
    173         <field id="wocetr_eff"   description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
     173        <field id="wocetr_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 /> 
    174174        <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv --> 
    175175        <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  /> 
    … …  
    219219      <!-- ptrc on T grid --> 
    220220 
    221      <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    222        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    223        <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    224        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
    225        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
    226        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
    227        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
    228        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="molSi/L" /> 
    229        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
    230        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
    231        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="molC/L" /> 
    232        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="molC/L" /> 
    233        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
    234        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
    235        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
    236        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
    237        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
    238        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
    239        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
    240        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
    241        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
    242        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
    243        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
    244        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    245        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     221     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
     222       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     223       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    /> 
     224       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
     225       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     226       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     227       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     228       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     229       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     230       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     231       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     232       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     233       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
     234       <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     235       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
     236       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     237       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     238       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     239       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
     240       <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
     241       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     242       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" /> 
     243       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" /> 
     244       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     245       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    246246     </group> 
    247247 
    … …  
    249249 
    250250     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    251        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
    252        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
    253        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
    254        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
    255        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    256        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    257        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    258        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    259        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    260        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    261        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    262        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    263        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    264        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    265        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
    266        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
    267        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
    268        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="molSi/m2/s"     /> 
    269        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
    270        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
    271        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
    272        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
    273        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
    274        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
    275        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
    276        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"     /> 
     251       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     252       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     253       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     254       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
     255       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     256       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     257       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     258       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     259       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     260       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     261       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     262       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     263       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     264       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     265       <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     266       <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     267       <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     268       <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     269       <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     270       <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     271       <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     272       <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     273       <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     274       <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     275       <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     276       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     /> 
     277       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     /> 
     278       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     /> 
     279       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
     280       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     /> 
     281       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     /> 
     282       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     /> 
     283       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
     284       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         /> 
     285       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         /> 
     286       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            /> 
     287       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     /> 
    277288     </group> 
    278289        
    … …  
    478489          <field ref="PHY2"     /> 
    479490          <field ref="ZOO2"     /> 
    480           <field ref="BSi"      /> 
     491          <field ref="DSi"      /> 
    481492          <field ref="Fer"      /> 
    482493          <field ref="BFe"      /> 
    … …  
    484495          <field ref="SFe"      /> 
    485496          <field ref="DFe"      /> 
    486           <field ref="DSi"      /> 
     497          <field ref="GSi"      /> 
    487498          <field ref="NFe"      /> 
    488499          <field ref="NCHL"     /> 
    … …  
    507518          <field ref="DCAL"     /> 
    508519          <field ref="GRAZ"     /> 
     520          <field ref="Mumax"    /> 
     521          <field ref="MuN"      /> 
     522          <field ref="MuD"      /> 
     523          <field ref="MuNlight" /> 
     524          <field ref="MuDlight" /> 
     525          <field ref="LNnut"    /> 
     526          <field ref="LDnut"    /> 
     527          <field ref="LNFe"     /> 
     528          <field ref="LDFe"     /> 
     529          <field ref="LNlight"  /> 
     530          <field ref="LDlight"  /> 
    509531          <field ref="EPC100"   /> 
    510532          <field ref="EPFE100"  /> 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00/namelist

    r1 r7  
    525525   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme                  
    526526/ 
    527 !----------------------------------------------------------------------- 
    528 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    529 !----------------------------------------------------------------------- 
    530    !                       !  Type of the operator :  
    531    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    532    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    533    !                       !  Direction of action  : 
    534    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    535    ln_traldf_hor    =  .true.   !     horizontal (geopotential)         (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    536    ln_traldf_iso    =  .false.  !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    537    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp") 
    538    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") 
    539    ln_triad_iso     =  .false.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
    540    ln_botmix_grif   =  .false.  !  griffies operator with lateral mixing on bottom (require "key_ldfslp") 
    541                          !  Coefficient 
    542    rn_aht_0         =   50.     !     horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
     527!---------------------------------------------------------------------------------- 
     528&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     529!---------------------------------------------------------------------------------- 
     530   !                       !  Operator type: 
     531   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
     532   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     533   !                       !  Direction of action: 
     534   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
     535   ln_traldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     536   ln_traldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
     537   !                       !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
     538   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
     539   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
     540   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
     541   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
     542   !                       !  Coefficients 
     543   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
     544   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
     545   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
     546   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
     547   rn_aht_0         =    50.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    543548   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    544    rn_aeiv_0        =    0.     !     eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     549   !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    545550/ 
    546551!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    857862    nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis 
    858863    nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis 
    859     nb_ana     = 2         ! Number of harmonics to analyse 
    860864    tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents 
    861865    tname(2)   = 'K1' 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    r1 r7  
    222222!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    223223   ln_pisdmp    =  .true.     !  Relaxation fo some tracers to a mean value 
    224    nn_pisdmp    =  5475       !  Frequency of Relaxation  
     224   nn_pisdmp    =  210240     !  Frequency of Relaxation  
    225225/ 
    226226!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00/namelist_top

    r1 r7  
    1313!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    1414   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers       
    15    nn_writetrc   =  10     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     15   nn_writetrc   =  576     !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    1616   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    1717   nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    … …  
    2020   cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
    2121   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
    22    ln_trcdta     =   .false. !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
     22   ln_trcdta     =   .true. !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    2323! 
    24 !              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
    25 !              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
    26 !              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     24!                !    name   !           title of the field              ! initial data ! initial data ! save   ! 
     25!                !           !                                           !  units       ! from file    ! or not !  
     26!                !           !                                           !              ! or not       !        ! 
    2727   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    2828   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
    … …  
    3737   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    3838   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    39    sn_tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     39   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4040   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    4141   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    … …  
    4343   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4444   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    45    sn_tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4646   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4747   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    … …  
    130130!                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    131131!---------------------------------------------------------------------- 
    132    nn_trd_trc  =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
     132   nn_trd_trc  =  576      !  time step frequency and tracers trends 
    133133   nn_ctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    134134   rn_ucf_trc  =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    … …  
    142142&namtrc_dia       !   parameters for passive tracer additional diagnostics 
    143143!---------------------------------------------------------------------- 
    144    ln_diatrc     =  .false.  !  save additional diag. (T) or not (F) 
    145    nn_writedia   =  5475     !  time step frequency for diagnostics 
     144   ln_diatrc     =  .true.   !  save additional diag. (T) or not (F) 
     145   nn_writedia   =  576     !  time step frequency for diagnostics 
    146146/ 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/AA_job

    • Property svn:executable set to *

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE/EXP00/namelist

    r1 r7  
    531531   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme                  
    532532/ 
    533 !----------------------------------------------------------------------- 
    534 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    535 !----------------------------------------------------------------------- 
    536    !                       !  Type of the operator :  
    537    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    538    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    539    !                       !  Direction of action  : 
    540    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    541    ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    542    ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    543    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp") 
    544    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") 
    545    ln_triad_iso     =  .false.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
    546    ln_botmix_grif   =  .false.  !  griffies operator with lateral mixing on bottom (require "key_ldfslp") 
    547    !                       !  Coefficient 
     533!---------------------------------------------------------------------------------- 
     534&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     535!---------------------------------------------------------------------------------- 
     536   !                       !  Operator type: 
     537   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
     538   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     539   !                       !  Direction of action: 
     540   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
     541   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     542   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
     543   !                       !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
     544   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
     545   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
     546   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
     547   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
     548   !                       !  Coefficients 
     549   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
     550   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
     551   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
     552   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    548553   rn_aht_0         =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    549554   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    550    rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coef. [m2/s]   (require "key_traldf_eiv") 
     555   !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    551556/ 
    552557!----------------------------------------------------------------------- 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/AA_job

    • Property svn:executable set to *

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/1_namelist

    r1 r7  
    9494/ 
    9595!----------------------------------------------------------------------- 
    96 &namdta_tem    !   data : temperature                                   ("key_dtatem") 
    97 !----------------------------------------------------------------------- 
    98 !              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    99 !              !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    100    sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ''      , ' ' 
    101    ! 
    102    cn_dir       = './'     !  root directory for the location of the runoff files 
    103 / 
    104 !----------------------------------------------------------------------- 
    105 &namdta_sal    !   data : salinity                                      ("key_dtasal") 
    106 !----------------------------------------------------------------------- 
    107 !              ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
    108 !              !           !  (if <0  months)     !   name   !   (logical)  ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
    109    sn_sal      =  'data_1m_salinity_nomask',  -1  ,'vosaline',    .true.    , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
    110    ! 
    111    cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files 
    112 / 
    113  
     96&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98!          ! file name ! frequency (hours)    ! variable ! time interp. ! clim  !'yearly' or ! weights  ! rotation ! 
     99!          !           !  (if <0  months)     !   name   !  (logical)   ! (T/F) ! 'monthly'  ! filename ! pairing  ! 
     100   sn_tem  = 'data_1m_potential_temperature_nomask', -1,'votemper',  .true.  , .true., 'yearly'   , ' '      , ' ' 
     101   sn_sal  = 'data_1m_salinity_nomask'             , -1,'vosaline',  .true.  , .true., 'yearly'   , ''       , ' ' 
     102/ 
    114103!!====================================================================== 
    115104!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  *** 
    … …  
    751740   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench 
    752741                           !     (no physical validity of the results) 
     742   nn_timing =      0 
    753743/ 
    754744 
    … …  
    906896    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments 
    907897/ 
     898!----------------------------------------------------------------------- 
     899&namsbc_wave   ! External fields from wave model 
     900!----------------------------------------------------------------------- 
     901!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     902!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     903   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' , .true.   , .false. , 'daily'  ,''         , '' 
     904! 
     905   cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files 
     906/ 
     907!----------------------------------------------------------------------- 
     908&namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed) 
     909!----------------------------------------------------------------------- 
     910   ! Suggested lengthscale values are those of Eby & Holloway (1994) for a coarse model 
     911   ln_neptsimp       = .false.  ! yes/no use simplified neptune 
     912 
     913   ln_smooth_neptvel = .false.  ! yes/no smooth zunep, zvnep 
     914   rn_tslse          =  1.2e4   ! value of lengthscale L at the equator 
     915   rn_tslsp          =  3.0e3   ! value of lengthscale L at the pole 
     916   ! Specify whether to ramp down the Neptune velocity in shallow 
     917   ! water, and if so the depth range controlling such ramping down 
     918   ln_neptramp       = .true.   ! ramp down Neptune velocity in shallow water 
     919   rn_htrmin         =  100.0   ! min. depth of transition range 
     920   rn_htrmax         =  200.0   ! max. depth of transition range 
     921/ 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/AA_job

    • Property svn:executable set to *

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef.xml

    r1 r7  
    4848        <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    4949        <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  /> 
     50    <!-- tidal composante --> 
     51    <field id="M2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     52    <field id="M2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     53    <field id="S2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     54    <field id="S2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     55    <field id="N2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     56    <field id="N2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     57    <field id="K1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     58    <field id="K1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     59    <field id="O1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     60    <field id="O1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     61    <field id="Q1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     62    <field id="Q1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     63    <field id="M4x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     64    <field id="M4y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     65    <field id="K2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     66    <field id="K2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     67    <field id="P1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     68    <field id="P1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     69    <field id="Mfx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     70    <field id="Mfy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     71    <field id="Mmx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     72    <field id="Mmy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     73 
     74    <field id="M2x_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     75    <field id="M2y_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     76    <field id="S2x_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     77    <field id="S2y_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     78    <field id="N2x_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     79    <field id="N2y_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     80    <field id="K1x_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     81    <field id="K1y_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     82    <field id="O1x_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     83    <field id="O1y_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     84    <field id="Q1x_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     85    <field id="Q1y_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     86    <field id="M4x_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     87    <field id="M4y_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     88    <field id="K2x_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     89    <field id="K2y_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     90    <field id="P1x_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     91    <field id="P1y_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     92    <field id="Mfx_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     93    <field id="Mfy_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     94    <field id="Mmx_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     95    <field id="Mmy_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     96 
     97    <field id="M2x_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     98    <field id="M2y_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     99    <field id="S2x_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     100    <field id="S2y_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     101    <field id="N2x_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     102    <field id="N2y_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     103    <field id="K1x_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     104    <field id="K1y_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     105    <field id="O1x_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     106    <field id="O1y_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     107    <field id="Q1x_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     108    <field id="Q1y_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     109    <field id="M4x_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     110    <field id="M4y_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     111    <field id="K2x_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     112    <field id="K2y_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     113    <field id="P1x_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     114    <field id="P1y_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     115    <field id="Mfx_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     116    <field id="Mfy_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     117    <field id="Mmx_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     118    <field id="Mmy_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    50119     </group> 
    51120 
    … …  
    128197        <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  /> 
    129198        <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  /> 
    130  
    131  
    132         <!-- tidal composante --> 
    133         <field id="M2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    134         <field id="M2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    135         <field id="S2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    136         <field id="S2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    137         <field id="N2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    138         <field id="N2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    139         <field id="K1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    140         <field id="K1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    141         <field id="O1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    142         <field id="O1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    143         <field id="Q1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    144         <field id="Q1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    145         <field id="M4x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    146         <field id="M4y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    147         <field id="K2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    148         <field id="K2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    149         <field id="P1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    150         <field id="P1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    151         <field id="Mfx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    152         <field id="Mfy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    153         <field id="Mmx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
    154         <field id="Mmy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
    155  
    156         <field id="M2x_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    157         <field id="M2y_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    158         <field id="S2x_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    159         <field id="S2y_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    160         <field id="N2x_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    161         <field id="N2y_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    162         <field id="K1x_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    163         <field id="K1y_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    164         <field id="O1x_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    165         <field id="O1y_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    166         <field id="Q1x_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    167         <field id="Q1y_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    168         <field id="M4x_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    169         <field id="M4y_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    170         <field id="K2x_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    171         <field id="K2y_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    172         <field id="P1x_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    173         <field id="P1y_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    174         <field id="Mfx_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    175         <field id="Mfy_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    176         <field id="Mmx_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    177         <field id="Mmy_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    178  
    179         <field id="M2x_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    180         <field id="M2y_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    181         <field id="S2x_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    182         <field id="S2y_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    183         <field id="N2x_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    184         <field id="N2y_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    185         <field id="K1x_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    186         <field id="K1y_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    187         <field id="O1x_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    188         <field id="O1y_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    189         <field id="Q1x_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    190         <field id="Q1y_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    191         <field id="M4x_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    192         <field id="M4y_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    193         <field id="K2x_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    194         <field id="K2y_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    195         <field id="P1x_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    196         <field id="P1y_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    197         <field id="Mfx_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    198         <field id="Mfy_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    199         <field id="Mmx_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
    200         <field id="Mmy_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    201199      </group> 
    202200 
    … …  
    349347 
    350348        <!-- variables available with key_float, instantaneous fields --> 
     349<!-- 
    351350        <file id="floats"  description="floats variables"> 
    352351            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="86400" /> 
    … …  
    358357            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="86400" /> 
    359358        </file> 
    360  
     359--> 
    361360      </group> 
    362361       
    … …  
    705704        <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     /> 
    706705        <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  /> 
     706    <!-- tidal composante --> 
     707    <field id="M2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     708    <field id="M2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     709    <field id="S2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     710    <field id="S2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     711    <field id="N2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     712    <field id="N2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     713    <field id="K1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     714    <field id="K1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     715    <field id="O1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     716    <field id="O1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     717    <field id="Q1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     718    <field id="Q1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     719    <field id="M4x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     720    <field id="M4y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     721    <field id="K2x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     722    <field id="K2y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     723    <field id="P1x"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     724    <field id="P1y"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     725    <field id="Mfx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     726    <field id="Mfy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     727    <field id="Mmx"          description="M2 Elevation harmonic real part "                             unit="m"        /> 
     728    <field id="Mmy"          description="M2 Elevation harmonic imaginary part"                         unit="m"        /> 
     729 
     730    <field id="M2x_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     731    <field id="M2y_u"          description="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     732    <field id="S2x_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     733    <field id="S2y_u"          description="S2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     734    <field id="N2x_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     735    <field id="N2y_u"          description="N2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     736    <field id="K1x_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     737    <field id="K1y_u"          description="K1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     738    <field id="O1x_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     739    <field id="O1y_u"          description="O1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     740    <field id="Q1x_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     741    <field id="Q1y_u"          description="Q1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     742    <field id="M4x_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     743    <field id="M4y_u"          description="M4 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     744    <field id="K2x_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     745    <field id="K2y_u"          description="K2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     746    <field id="P1x_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     747    <field id="P1y_u"          description="P1 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     748    <field id="Mfx_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     749    <field id="Mfy_u"          description="Mf current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     750    <field id="Mmx_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     751    <field id="Mmy_u"          description="Mm current barotrope along i-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     752 
     753    <field id="M2x_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     754    <field id="M2y_v"          description="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     755    <field id="S2x_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     756    <field id="S2y_v"          description="S2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     757    <field id="N2x_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     758    <field id="N2y_v"          description="N2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     759    <field id="K1x_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     760    <field id="K1y_v"          description="K1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     761    <field id="O1x_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     762    <field id="O1y_v"          description="O1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     763    <field id="Q1x_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     764    <field id="Q1y_v"          description="Q1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     765    <field id="M4x_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     766    <field id="M4y_v"          description="M4 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     767    <field id="K2x_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     768    <field id="K2y_v"          description="K2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     769    <field id="P1x_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     770    <field id="P1y_v"          description="P1 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     771    <field id="Mfx_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     772    <field id="Mfy_v"          description="Mf current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
     773    <field id="Mmx_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic real part "      unit="m/s"        /> 
     774    <field id="Mmy_v"          description="Mm current barotrope along j-axis harmonic imaginary part " unit="m/s"        /> 
    707775     </group> 
    708776 
    … …  
    863931      </group> 
    864932 
     933      <!-- variables available with key_float --> 
     934      <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point"> 
     935        <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"   operation="inst(X)" /> 
     936        <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   operation="inst(X)"  /> 
     937        <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     operation="inst(X)"  /> 
     938        <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  operation="inst(X)"  /> 
     939        <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   operation="inst(X)"  /> 
     940        <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" operation="inst(X)"  /> 
     941        <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  operation="inst(X)"  /> 
     942      </group> 
     943 
    865944    </field_definition> 
    866945     
    … …  
    897976............................................................................................................ 
    898977    --> 
    899         <!-- automatic definition of the name based on id="1d_grid_T"  
    900              => this name is used as the radical for all file names of this group 
    901              => add a suffix to be sure that all files names of this group are different   --> 
    902         <group id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
    903           <!-- mooring: automatic definition of the file name suffix based on id="0n180wT"  --> 
    904           <file id="0n180wT" name_suffix="auto" > 
    905             <group id="0n180wT" zoom_ref="0n180wT" >    <!-- group of variables sharing the same zoom --> 
    906               <field ref="toce" name="votemper"  /> 
    907               <field ref="uoce" name="vozocrtx"  />     <!-- include a U-grid variable in the list => switch to T-grid --> 
    908             </group> 
    909           </file> 
    910           <!-- Equatorial section: automatic definition of the file name suffix based on id="EqT" --> 
     978        <!-- automatic definition of the name based on id="1d_grid_T" 
     979             => this name is used as the radical for all file names of this group 
     980             => add a suffix to be sure that all files names of this group are different   --> 
     981        <group id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" > 
     982          <!-- global file with different operations on data   --> 
     983          <file id="global" > 
     984            <field ref="sst"    name="sst_1d_ave"                       />     <!-- mean --> 
     985            <field ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="t_max(X)" />     <!-- max --> 
     986            <field ref="M2x"     name="M2_x_elev"  /> 
     987            <field ref="M2y"     name="M2_y_elev"  /> 
     988          </file> 
     989        </group> 
     990 
     991        <!-- variables available with key_float, instantaneous fields --> 
    911992<!-- 
    912           <file id="EqT" name_suffix="auto" > 
    913             <group id="EqT" zoom_ref="EqT" > 
    914               <field ref="toce" name="votemper"  /> 
    915             </group> 
    916           </file> 
    917 -->        
    918           <!-- global file with different operations on data   --> 
    919           <file id="global" > 
    920             <field ref="sst"    name="sst_1d_ave"                       />     <!-- mean --> 
    921             <field ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="t_max(X)" />     <!-- max --> 
    922           </file> 
    923         </group> 
    924  
     993        <file id="floats"  description="floats variables"> 
     994            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="86400" /> 
     995            <field ref="traj_lat"   name="floats_latitude"    freq_op="86400" /> 
     996            <field ref="traj_dep"   name="floats_depth"       freq_op="86400" /> 
     997            <field ref="traj_temp"  name="floats_temperature" freq_op="86400" /> 
     998            <field ref="traj_salt"  name="floats_salinity"    freq_op="86400" /> 
     999            <field ref="traj_dens"  name="floats_density"     freq_op="86400" /> 
     1000            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="86400" /> 
     1001        </file> 
     1002--> 
    9251003      </group> 
    9261004       
    … …  
    10491127      <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" positive=".false." /> 
    10501128      <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" /> 
     1129      <axis id="nfloat" description="Number of float"   unit="no unit" positive=".false." /> 
    10511130    </axis_definition>  
    10521131     

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/namelist

    r1 r7  
    526526   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme                  
    527527/ 
    528 !----------------------------------------------------------------------- 
    529 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    530 !----------------------------------------------------------------------- 
    531    !                       !  Type of the operator :  
    532    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    533    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    534    !                       !  Direction of action  : 
    535    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    536    ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    537    ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    538    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp") 
    539    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") 
    540    ln_triad_iso     =  .false.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
    541    ln_botmix_grif   =  .false.  !  griffies operator with lateral mixing on bottom (require "key_ldfslp") 
    542                          !  Coefficient 
     528!---------------------------------------------------------------------------------- 
     529&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     530!---------------------------------------------------------------------------------- 
     531   !                       !  Operator type: 
     532   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
     533   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     534   !                       !  Direction of action: 
     535   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
     536   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     537   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
     538   !                       !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
     539   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
     540   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
     541   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
     542   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
     543   !                       !  Coefficients 
     544   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
     545   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
     546   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
     547   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    543548   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    544549   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    545    rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     550   !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    546551/ 
    547552!----------------------------------------------------------------------- 
    … …  
    852857    nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis 
    853858    nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis 
    854     nb_ana     = 2         ! Number of harmonics to analyse 
    855859    tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents 
    856860    tname(2)   = 'K1' 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/IDL_scripts/std_main.sh

    • Property svn:executable set to *

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/AA_job

    • Property svn:executable set to *

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml

    r1 r7  
    219219      <!-- ptrc on T grid --> 
    220220 
    221      <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    222        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    223        <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    224        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
    225        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
    226        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
    227        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
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    229        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
    230        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
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    233        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
    234        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
    235        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
    236        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
    237        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
    238        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
    239        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
    240        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
    241        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
    242        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
    243        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
    244        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    245        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     221     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
     222       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" /> 
     223       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    /> 
     224       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" /> 
     225       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     226       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     227       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     228       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     229       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     230       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     231       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" /> 
     232       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" /> 
     233       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" /> 
     234       <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" /> 
     235       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" /> 
     236       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     237       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" /> 
     238       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" /> 
     239       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" /> 
     240       <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" /> 
     241       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" /> 
     242       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" /> 
     243       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" /> 
     244       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
     245       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" /> 
    246246     </group> 
    247247 
    … …  
    249249 
    250250     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    251        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
    252        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
    253        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
    254        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
    255        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    256        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    257        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    258        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    259        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    260        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    261        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    262        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    263        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    264        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    265        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
    266        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
    267        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
    268        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="molSi/m2/s"     /> 
    269        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
    270        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
    271        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
    272        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
    273        <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
    274        <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
    275        <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
    276        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"     /> 
     251       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     252       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     253       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" /> 
     254       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" /> 
     255       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     256       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     257       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     258       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     259       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     260       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     261       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     262       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     263       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     264       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     265       <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     266       <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     267       <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     268       <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     269       <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" /> 
     270       <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     271       <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     272       <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     273       <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     274       <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     275       <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" /> 
     276       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     /> 
     277       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     /> 
     278       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     /> 
     279       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     /> 
     280       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     /> 
     281       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     /> 
     282       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     /> 
     283       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                /> 
     284       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         /> 
     285       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         /> 
     286       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            /> 
     287       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     /> 
    277288     </group> 
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    … …  
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    … …  
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    26 !              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     24!                !    name   !           title of the field              ! initial data ! initial data ! save   ! 
     25!                !           !                                           !  units       ! from file    ! or not !  
     26!                !           !                                           !              ! or not       !        ! 
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    … …  
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    152163          <field ref="BFe"      /> 
    … …  
    154165          <field ref="SFe"      /> 
    155166          <field ref="DFe"      /> 
    156           <field ref="DSi"      /> 
     167          <field ref="GSi"      /> 
    157168          <field ref="NFe"      /> 
    158169          <field ref="NCHL"     /> 
    … …  
    177188          <field ref="DCAL"     /> 
    178189          <field ref="GRAZ"     /> 
     190          <field ref="Mumax"    /> 
     191          <field ref="MuN"      /> 
     192          <field ref="MuD"      /> 
     193          <field ref="MuNlight" /> 
     194          <field ref="MuDlight" /> 
     195          <field ref="LNnut"    /> 
     196          <field ref="LDnut"    /> 
     197          <field ref="LNFe"     /> 
     198          <field ref="LDFe"     /> 
     199          <field ref="LNlight"  /> 
     200          <field ref="LDlight"  /> 
    179201          <field ref="EPC100"   /> 
    180202          <field ref="EPFE100"  /> 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist

    r1 r7  
    508508   ln_traadv_qck    =  .false.  !  QUICKEST scheme 
    509509/ 
    510 !----------------------------------------------------------------------- 
    511 &namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracer  
    512 !----------------------------------------------------------------------- 
    513    !                       !  Type of the operator :  
    514    ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator        
    515    ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator      
    516    !                       !  Direction of action  : 
    517    ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level                 
    518    ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
    519    ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp") 
    520    ln_traldf_grif   =  .false.  !  griffies skew flux formulation       (require "key_ldfslp") 
    521    ln_traldf_gdia   =  .false.  !  griffies operator strfn diagnostics  (require "key_ldfslp") 
    522    ln_triad_iso     =  .false.  !  griffies operator calculates triads twice => pure lateral mixing in ML (require "key_ldfslp") 
    523    ln_botmix_grif   =  .false.  !  griffies operator with lateral mixing on bottom (require "key_ldfslp") 
    524                          !  Coefficient 
     510!---------------------------------------------------------------------------------- 
     511&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers 
     512!---------------------------------------------------------------------------------- 
     513   !                       !  Operator type: 
     514   ln_traldf_lap    =  .true.   !  laplacian operator 
     515   ln_traldf_bilap  =  .false.  !  bilaplacian operator 
     516   !                       !  Direction of action: 
     517   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level 
     518   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T) 
     519   ln_traldf_iso    =  .true.   !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp") 
     520   !                       !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp") 
     521   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads 
     522   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities 
     523   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML 
     524   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom 
     525   !                       !  Coefficients 
     526   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv" 
     527   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv 
     528   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05) 
     529   rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s] 
    525530   rn_aht_0         =  2000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    526531   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    527    rn_aeiv_0        =  2000.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]    (require "key_traldf_eiv") 
     532   !                                           (normally=0; not used with Griffies) 
    528533/ 
    529534!----------------------------------------------------------------------- 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_top

    r1 r7  
    2222   ln_trcdta     =   .true. !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    2323! 
    24 !              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
    25 !              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
    26 !              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     24!                !    name   !           title of the field              ! initial data ! initial data ! save   ! 
     25!                !           !                                           !  units       ! from file    ! or not !  
     26!                !           !                                           !              ! or not       !        ! 
    2727   sn_tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    2828   sn_tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
    … …  
    3737   sn_tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    3838   sn_tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    39    sn_tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     39   sn_tracer(13)  = 'DSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4040   sn_tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.     ,  .true. 
    4141   sn_tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    … …  
    4343   sn_tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4444   sn_tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    45    sn_tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   sn_tracer(19)  = 'GSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4646   sn_tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 
    4747   sn_tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.    ,  .true. 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/cfg.txt

    r1 r7  
    44AMM12 OPA_SRC 
    55ORCA2_LIM_PISCES OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC TOP_SRC 
    6 ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 
    76AMM12_PISCES OPA_SRC TOP_SRC 
    87ORCA2_LIM OPA_SRC LIM_SRC_2 NST_SRC 
     8ORCA2_OFF_PISCES OPA_SRC OFF_SRC TOP_SRC 

  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/makenemo

    • Property svn:executable set to *
    r1 r7  
    6969# ========== 
    7070# 
    71 # $Id: makenemo 3219 2011-12-13 10:32:08Z smasson $ 
     71# $Id: makenemo 3294 2012-01-28 16:44:18Z rblod $ 
    7272# 
    7373# 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.