Changes between Version 1 and Version 2 of machineInstall

Timestamp:

11/27/15 14:45:08 (8 years ago)

Author:

nbouttes

Comment:

--

machineInstall

@@ -1 +1 @@
 = Machine specific installations instructions =
 
+== Installation de iLOVECLIM sur avakas (Université de Bordeaux)==
+
+Pour installer iloveclim sur les machines avakas, il faut :
+
+* Créer un compte MCIA : http://www.mcia.univ-bordeaux.fr/index.php?id=inscriptions
+
+* Avoir ou créer un compte forge pour ludus
+
+* Se connecter sur avakas : login@avakas.mcia.univ-bordeaux.fr
+
+* Récupérer le code iLOVECLIM avec svn :[[BR]]
+$ svn co svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/ludus/svn/trunk iloveclim/.
+
+* Copier (cp) le fichier config pour avakas qui se trouve dans : /home/nbouttes/iloveclim/iloveclim/config/config.avakas 
+
+* Changer config/make.macro-maitre ligne 40 :[[BR]]
+Remplacer ${MKLROOT}/lib/em64 par ${MKLROOT}/lib/intel64
+
+* Avoir installé netcdf4 compilé avec INTEL  et udunits version 1 (pas 2)[[BR]]
+Pour udunits c’est un module privé venant de vmarieu (Vincent Marieu) à récupérer[[BR]]
+Copier (cp –r) les modules privés qui sont dans : /home/nbouttes/privatemodules/[[BR]]
+Puis charger les modules :[[BR]]
+$ module load use.own[[BR]]
+$ module load intel/compiler+mkl/64/12.1/2012.0.032[[BR]]
+$ module load intel-mpi/64/stable/003[[BR]]
+$ module load netcdf+hdf5/intel/4.1.2 
+
+* Pour tout installer lancer : [[BR]]
+$ ./install_ludus.sh 
+
+* '''Pour lancer un run test en interactif:'''[[BR]]
+demander une session interactive (30 minutes) avec un processeur, 1 cœur: [[BR]]
+$ qsub -I -X -V -l modes=1 : ppm=1, walltime=00 :30 :00[[BR]]
+Loader les modules[[BR]]
+$ module load use.own[[BR]]
+$ module load intel/compiler+mkl/64/12.1/2012.0.032[[BR]]
+$ module load intel_mpi/64/stable/003[[BR]]
+$ module load netcdf+hdf5/intel/4.1.2 [[BR]]
+Changer le chemin :[[BR]]
+$ LD_LIBRARY_PATH=/home/vmarieu/Librairies/intel/lib:/home/vmarieu/Librairies/udunits-1.12.11/lib:$LD_LIBRARY_PATH[[BR]]
+Lancer le run test :[[BR]]
+$ ./bin/loveclim-new-run
+
+Si tout va bien le run test a tourné.
+
+* '''Pour soumettre un job en queue :'''[[BR]]
+Modifier un fichier job type iloveclim_exemple.qsub[[BR]]
+Exemple : /home/nbouttes/iloveclim/iloveclim/iloveclim_exemple.qsub[[BR]]
+Penser à changer l’adresse email (merci pour ma boite)[[BR]]
+Pour soumettre :[[BR]]
+$ qsub iloveclim_exemple.qsub[[BR]]
+Pour voir ou en est le job :[[BR]]
+$ qstat –u login[[BR]]
+Pour supprimer le job :[[BR]]
+$ qdel numero_job
+
+
+'''Plus d’info…'''
+
+Info sur avakas : https://redmine.mcia.univ-bordeaux.fr/projects/cluster-avakas/wiki/Guide_de_l'utilisateur
+
+Infos sur ludus (iLOVECMI) : http://forge.ipsl.jussieu.fr/ludus
+
+Pour voir les modules disponibles :[[BR]] 
+$ module avail
+
+Pour avoir des infos sur les jobs soumis :[[BR]]
+Loader le module maui[[BR]]
+$ module load maui[[BR]]
+Pour avoir l’heure estimée à laquellele job devrait partir :[[BR]]
+$ showstart NumeroJob  [[BR]]
+Plus d’infos sur le job :[[BR]]
+$ checkjob NumeroJob