= Machine specific installations instructions =

== Installation de iLOVECLIM sur avakas (Université de Bordeaux)==

Pour installer iloveclim sur les machines avakas, il faut :

* Créer un compte MCIA : http://www.mcia.univ-bordeaux.fr/index.php?id=inscriptions

* Avoir ou créer un compte forge pour ludus

* Se connecter sur avakas : login@avakas.mcia.univ-bordeaux.fr

* Récupérer le code iLOVECLIM avec svn :[[BR]]
{{{ 
svn co svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/ludus/svn/trunk iloveclim/.
}}}

* Copier (cp) le fichier config pour avakas qui se trouve dans : /home/nbouttes/iloveclim/iloveclim/config/config.avakas 

* Changer config/make.macros-maitre ligne 40 :[[BR]]
Remplacer ${MKLROOT}/lib/em64 par ${MKLROOT}/lib/intel64

* Avoir installé netcdf4 compilé avec INTEL  et udunits version 1 (pas 2)[[BR]]
Pour udunits c’est un module privé venant de vmarieu (Vincent Marieu) à récupérer[[BR]]
Copier (cp –r) les modules privés qui sont dans : /home/nbouttes/privatemodules/[[BR]]
Puis charger les modules :[[BR]]
{{{ 
module load use.own
}}}
{{{
module load intel/compiler+mkl/64/12.1/2012.0.032
}}}
{{{
module load intel-mpi/64/stable/003[[BR]]
}}}
{{{
module load netcdf+hdf5/intel/4.1.2 
}}}

* Pour tout installer lancer :
{{{
./install_ludus.sh 
}}}

* '''Pour lancer un run test en interactif:'''[[BR]]
demander une session interactive (30 minutes) avec un processeur, 1 cœur: [[BR]]
{{{
qsub -I -X -V -l nodes=1:ppn=1,walltime=00:30:00
}}}

Loader les modules
{{{
module load use.own
}}}
{{{
module load intel/compiler+mkl/64/12.1/2012.0.032
}}}
{{{
module load intel-mpi/64/stable/003
}}}
{{{
module load netcdf+hdf5/intel/4.1.2
}}}
Changer le chemin :
{{{
LD_LIBRARY_PATH=/home/vmarieu/Librairies/intel/lib:/home/vmarieu/Librairies/udunits-1.12.11/lib:$LD_LIBRARY_PATH
}}}
Lancer le run test :
{{{
./bin/loveclim-new-run
}}}

Si tout va bien le run test a tourné.

* '''Pour soumettre un job en queue :'''[[BR]]
Modifier un fichier job type iloveclim_exemple.qsub[[BR]]
Exemple : /home/nbouttes/iloveclim/iloveclim/iloveclim_exemple.qsub[[BR]]
Penser à changer l’adresse email (merci pour ma boite)[[BR]]
Pour soumettre :
{{{
qsub iloveclim_exemple.qsub
}}}
Pour voir ou en est le job :
{{{
qstat –u login
}}}
Pour supprimer le job :
{{{
qdel numero_job
}}}


'''Plus d’info…'''

Info sur avakas : https://redmine.mcia.univ-bordeaux.fr/projects/cluster-avakas/wiki/Guide_de_l'utilisateur

Infos sur ludus (iLOVECMI) : http://forge.ipsl.jussieu.fr/ludus

Pour voir les modules disponibles :
{{{
module avail
}}}

Pour avoir des infos sur les jobs soumis :[[BR]]
Loader le module maui
{{{
module load maui
}}}

Pour avoir l’heure estimée à laquelle le job devrait partir :
{{{
showstart NumeroJob
}}}
Plus d’infos sur le job :
{{{
checkjob NumeroJob 
}}}