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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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namelist_REUNION12 on Topic #5 – Attachment – NEMO

Topic #5: namelist_REUNION12

File namelist_REUNION12, 96.7 KB (added by jpaul, 8 years ago)
Line 
1!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
2!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun)
3!! namelists    2 - Domain           (namcfg, namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd)
4!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas
5!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf,
6!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb)
7!!              4 - lateral boundary (namlbc, namcla, namobc, namagrif, nambdy, nambdy_tide)
8!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl)
9!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_dmp)
10!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf)
11!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_kpp, namzdf_ddm, namzdf_tmx)
12!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namptr, namhsb)
13!!             10 - miscellaneous    (namsol, nammpp, namctl)
14!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc)
15!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
16
17!!======================================================================
18!!                   ***  Run management namelists  ***
19!!======================================================================
20!!   namrun       parameters of the run
21!!======================================================================
22!
23!-----------------------------------------------------------------------
24&namrun        !   parameters of the run
25!-----------------------------------------------------------------------
26   nn_no       =   RUN_NBR !  job number (no more used...)
27   cn_exp      = "REUNION12" !  experience name
28   nn_it000    =    NIT000 !  first time step
29   nn_itend    =    NITEND !  last  time step (std 5475)
30   nn_date0    =    NDATE0 !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1)
31   nn_leapy    =         1 !  Leap year calendar (1) or not (0)
32   ln_rstart   = .RESTART. !  start from rest (F) or from a restart file (T)
33   ln_hotrestart = .RAMP.  !  start from a light parent restart (eventually with a coarse resolution)
34   nn_euler    =       1   !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T
35   nn_rstctl   =       0   !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T
36                           !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist
37                           !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart
38                           !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart
39   cn_ocerst_in  = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input)
40   !cn_ocerst_indir ='./"       ! Path to read restart file
41   cn_ocerst_out = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output)
42   cn_ocerst_outdir = "PATH_RST/" ! Path to write restart file
43   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0)
44   nn_stock    =   69120   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1)
45   nn_write    =    9999   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000)
46   ln_dimgnnn  = .false.   !  DIMG file format: 1 file for all processors (F) or by processor (T)
47   ln_mskland  = .true.    !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%)
48   ln_clobber  = .false.   !  clobber (overwrite) an existing file
49   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines)
50/
51!
52!!======================================================================
53!!                      ***  Domain namelists  ***
54!!======================================================================
55!!   namcfg       parameters of the configuration     
56!!   namzgr       vertical coordinate
57!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate
58!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep)
59!!   namtsd       data: temperature & salinity
60!!======================================================================
61!
62!-----------------------------------------------------------------------
63&namcfg     !   parameters of the configuration     
64!-----------------------------------------------------------------------
65   cp_cfg      =     "orca"            !  name of the configuration
66   cp_cfz      =  "no zoom"            !  name of the zoom of configuration
67   jp_cfg      =      12               !  resolution of the configuration
68   jpidta      =     JJPI              !  1st lateral dimension ( >= jpi )
69   jpjdta      =     JJPJ              !  2nd    "         "    ( >= jpj )
70   jpkdta      =      50               !  number of levels      ( >= jpk )
71   jpiglo      =     JJPI              !  1st dimension of global domain --> i =jpidta
72   jpjglo      =     JJPJ              !  2nd    -                  -    --> j  =jpjdta
73   jpizoom     =       1               !  left bottom (i,j) indices of the zoom
74   jpjzoom     =       1               !  in data domain indices
75   jperio      =       0               !  lateral cond. type (between 0 and 6)
76                                       !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West
77                                       !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot
78                                       !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot
79                                       !  = 5 North fold F-point pivot
80                                       !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot
81   ln_use_jattr = .false.              !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present
82                                       !  in netcdf input files, as the start j-row for reading
83/
84!-----------------------------------------------------------------------
85&namzgr        !   vertical coordinate
86!-----------------------------------------------------------------------
87   ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps   (T/F)      ("key_zco" may also be defined)
88   ln_zps      = .true.    !  z-coordinate - partial steps   (T/F)
89   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate    (T/F)
90   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity               (T/F)
91/
92!-----------------------------------------------------------------------
93&namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate
94!-----------------------------------------------------------------------
95   ln_s_sh94   = .true.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)|
96   ln_s_sf12   = .false.   !  Siddorn & Furner 2012 hybrid S-z-sigma (T)| if both are false the NEMO tanh stretching is applied
97   ln_sigcrit  = .false.   !  use sigma coordinates below critical depth (T) or Z coordinates (F) for Siddorn & Furner stretch
98                           !  stretching coefficients for all functions
99   rn_sbot_min =  300.0    !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m)
100   rn_sbot_max = 5250.0    !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m)
101   rn_hc       =  150.0    !  critical depth for transition to stretched coordinates
102                        !!!!!!!  Envelop bathymetry
103   rn_rmax     =    0.15   !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1)
104                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.)
105   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20)
106   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma   
107                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.)
108   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma
109   rn_efold    =    0.0    !  efold length scale for transition to stretched coord
110   rn_zs       =    1.0    !  depth of surface grid box
111                           !  bottom cell depth (Zb) is a linear function of water depth Zb = H*a + b
112   rn_zb_a     =    0.024  !  bathymetry scaling factor for calculating Zb
113   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb
114                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above]
115   rn_thetb    =    0.75   !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)
116/
117!-----------------------------------------------------------------------
118&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep)
119!-----------------------------------------------------------------------
120   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file
121   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1
122   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA)
123   nn_msh      =    0      !  create (=1) a mesh file or not (=0)
124   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0)
125   rn_e3zps_min=   25.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of
126   rn_e3zps_rat=    0.2    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1
127                           !
128   rn_rdt      =  360.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0)
129   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter
130   nn_acc      =    0      !  acceleration of convergence : =1      used, rdt < rdttra(k)
131                                 !                          =0, not used, rdt = rdttra
132   rn_rdtmin   =  360.     !  minimum time step on tracers (used if nn_acc=1)
133   rn_rdtmax   =  360.     !  maximum time step on tracers (used if nn_acc=1)
134   rn_rdth     =  360.     !  depth variation of tracer time step  (used if nn_acc=1)
135   ln_crs      = .false.   !  Logical switch for coarsening module
136   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh
137                                       !  = 0 curvilinear coordinate on the sphere read in coordinate.nc
138                                       !  = 1 geographical mesh on the sphere with regular grid-spacing
139                                       !  = 2 f-plane with regular grid-spacing
140                                       !  = 3 beta-plane with regular grid-spacing
141                                       !  = 4 Mercator grid with T/U point at the equator
142   ppglam0     =  999999.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1)
143   ppgphi0     =  999999.0             ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1)
144   ppe1_deg    =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees)
145   ppe2_deg    =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees)
146   ppe1_m      =  999999.0             !  zonal      grid-spacing (degrees)
147   ppe2_m      =  999999.0             !  meridional grid-spacing (degrees)
148   ppsur       =    -8494.48           !  ORCA r4, r2 and r05 coefficients
149   ppa0        =      257.609          ! (default coefficients)
150   ppa1        =      256.819          !
151   ppkth       =       40.             !
152   ppacr       =       10.0            !
153   ppdzmin     =  999999.0             !  Minimum vertical spacing
154   pphmax      =  999999.0             !  Maximum depth
155   ldbletanh   =    .FALSE.            !  Use/do not use double tanf function for vertical coordinates
156   ppa2        =  999999.0             !  Double tanh function parameters
157   ppkth2      =  999999.0             !
158   ppacr2      =  999999.0             !
159/
160!-----------------------------------------------------------------------
161&namsplit      !   time splitting parameters                            ("key_dynspg_ts")
162!-----------------------------------------------------------------------
163   ln_bt_fw      =    .TRUE.           !  Forward integration of barotropic equations
164   ln_bt_av      =    .TRUE.           !  Time filtering of barotropic variables
165   ln_bt_nn_auto =   .FALSE.           !  Set nn_baro automatically to be just below
166                                       !  a user defined maximum courant number (rn_bt_cmax)
167   nn_baro       =    60               !  Number of iterations of barotropic mode
168                                       !  during rn_rdt seconds. Only used if ln_bt_nn_auto=F
169   rn_bt_cmax    =    0.8              !  Maximum courant number allowed if ln_bt_nn_auto=T
170   nn_bt_flt     =    1                !  Time filter choice
171                                       !  = 0 None
172                                       !  = 1 Boxcar over   nn_baro barotropic steps
173                                       !  = 2 Boxcar over 2*nn_baro     "        " 
174/
175!-----------------------------------------------------------------------
176&namcrs        !   Grid coarsening for dynamics output and/or
177               !   passive tracer coarsened online simulations
178!-----------------------------------------------------------------------
179   nn_factx    = 3         !  Reduction factor of x-direction
180   nn_facty    = 3         !  Reduction factor of y-direction
181   nn_binref   = 0         !  Bin centering preference: NORTH or EQUAT
182                           !  0, coarse grid is binned with preferential treatment of the north fold
183                           !  1, coarse grid is binned with centering at the equator
184                           !    Symmetry with nn_facty being odd-numbered. Asymmetry with even-numbered nn_facty.
185   nn_msh_crs  = 1         !  create (=1) a mesh file or not (=0)
186   nn_crs_kz   = 0         ! 0, MEAN of volume boxes
187                           ! 1, MAX of boxes
188                           ! 2, MIN of boxes
189   ln_crs_wn   = .true.    ! wn coarsened (T) or computed using horizontal divergence ( F )
190/
191!-----------------------------------------------------------------------
192&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d")
193!-----------------------------------------------------------------------
194   rn_lat1d    =      50   !  Column latitude (default at PAPA station)
195   rn_lon1d    =    -145   !  Column longitude (default at PAPA station)
196   ln_c1d_locpt=  .true.   ! Localization of 1D config in a grid (T) or independant point (F)
197/
198!-----------------------------------------------------------------------
199&namtsd    !   data : Temperature  & Salinity
200!-----------------------------------------------------------------------
201!-----------------------------------------------------------------------
202!          !  file name                            ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
203!          !                                       !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
204   sn_tem  = 'data_1m_potential_temperature_nomask',         -1        ,'votemper' ,    .true.    , .true. , 'yearly'   , ''       ,   ''    ,    ''
205   sn_sal  = 'data_1m_salinity_nomask'             ,         -1        ,'vosaline' ,    .true.    , .true. , 'yearly'   , ''       ,   ''    ,    ''
206   !
207   cn_dir        = './'     !  root directory for the location of the runoff files
208   ln_tsd_init   = .false.  !  Initialisation of ocean T & S with T &S input data (T) or not (F)
209   ln_tsd_tradmp = .false.  !  damping of ocean T & S toward T &S input data (T) or not (F)
210/
211!!======================================================================
212!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  ***
213!!======================================================================
214!!   namsbc          surface boundary condition
215!!   namsbc_ana      analytical         formulation
216!!   namsbc_flx      flux               formulation
217!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation
218!!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation
219!!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation
220!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_coupled")
221!!   namsbc_sas      StAndalone Surface module
222!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation
223!!   namsbc_rnf      river runoffs
224!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing
225!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure
226!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S)
227!!   namsbc_alb      albedo parameters
228!!======================================================================
229!
230!-----------------------------------------------------------------------
231&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module)
232!-----------------------------------------------------------------------
233   nn_fsbc     = 2         !  frequency of surface boundary condition computation
234                           !     (also = the frequency of sea-ice model call)
235   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )
236   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx )
237   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)
238   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)
239   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs )
240   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation
241
242   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr )
243   nn_ice      = 0         !  =0 no ice boundary condition   ,
244                           !  =1 use observed ice-cover      ,
245                           !  =2 ice-model used                         ("key_lim3" or "key_lim2")
246   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect)
247                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect
248                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure)
249   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave
250   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T   => fill namsbc_rnf)
251   nn_isf      = 0         !  ice shelf melting/freezing                (/=0 => fill namsbc_isf)
252                           !  0 =no isf                  1 = presence of ISF
253                           !  2 = bg03 parametrisation   3 = rnf file for isf   
254                           !  4 = ISF fwf specified
255                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr)
256   ln_ssr      = .false.   !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr)
257   nn_fwb      = 0         !  FreshWater Budget: =0 unchecked
258                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step
259                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero
260   ln_wave = .false.       !  Activate coupling with wave (either Stokes Drift or Drag coefficient, or both)  (T => fill namsbc_wave)
261   ln_cdgw = .false.       !  Neutral drag coefficient read from wave model (T => fill namsbc_wave)
262   ln_bulk_strec = .true.  !  time-interpolated variables are taken in account at the start of the record
263   ln_sdw  = .false.       !  Computation of 3D stokes drift                (T => fill namsbc_wave)
264   nn_lsm  = 0             !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) ,
265                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field)
266   nn_limflx = -1          !  LIM3 Multi-category heat flux formulation (use -1 if LIM3 is not used)
267                           !  =-1  Use per-category fluxes, bypass redistributor, forced mode only, not yet implemented coupled
268                           !  = 0  Average per-category fluxes (forced and coupled mode)
269                           !  = 1  Average and redistribute per-category fluxes, forced mode only, not yet implemented coupled
270                           !  = 2  Redistribute a single flux over categories (coupled mode only)
271/
272!-----------------------------------------------------------------------
273&namsbc_ana    !   analytical surface boundary condition
274!-----------------------------------------------------------------------
275   nn_tau000   =   0       !  gently increase the stress over the first ntau_rst time-steps
276   rn_utau0    =   0.5     !  uniform value for the i-stress
277   rn_vtau0    =   0.e0    !  uniform value for the j-stress
278   rn_qns0     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux
279   rn_qsr0     =   0.e0    !  uniform value for the solar radiation
280   rn_emp0     =   0.e0    !  uniform value for the freswater budget (E-P)
281/
282!-----------------------------------------------------------------------
283&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation
284!-----------------------------------------------------------------------
285!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
286!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
287   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
288   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
289   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
290   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
291   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
292
293   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files
294/
295!-----------------------------------------------------------------------
296&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulae
297!-----------------------------------------------------------------------
298!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
299!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
300   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
301   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
302   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
303   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
304   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
305   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
306   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
307
308   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are
309/
310!-----------------------------------------------------------------------
311&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae
312!-----------------------------------------------------------------------
313!              !  file name                  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation !
314!              !                             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  !
315   sn_wndi     = 'ECMWF_BULKU10M_ORCA025'    ,      3     , 'sowinu10', .true.   , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
316   sn_wndj     = 'ECMWF_BULKV10M_ORCA025'    ,      3     , 'sowinv10', .true.   , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
317   sn_qsr      = 'ECMWF_FLUXSSRD_ORCA025'    ,      3     , 'sosudosw', .false.  , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
318   sn_qlw      = 'ECMWF_FLUXSTRD_ORCA025'    ,      3     , 'sosudolw', .false.  , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
319   sn_tair     = 'ECMWF_BULKTAIR_ORCA025'    ,      3     , 'sotemair', .true.   , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
320   sn_humi     = 'ECMWF_BULKHUMI_ORCA025'    ,      3     , 'sohumrel', .true.   , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
321   sn_prec     = 'ECMWF_FLUXPRE_ORCA025'     ,      3     , 'sowaprec', .false.  , .false. , 'daily' , 'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
322   cn_dir      = 'atm_forcing/'      !  root directory for the location of the bulk files
323   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data
324   rn_zqt      =      2.   !  Air temperature and humidity reference height (m)
325   rn_zu       =     10.   !  Wind vector reference height (m)                 
326   rn_pfac     =      1.   !  multiplicative factor for precipitation (total & snow)
327   rn_efac     =      1.   !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.)
328   rn_vfac     =      0.   !  multiplicative factor for ocean/ice velocity
329                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds)
330   ln_tair_celsius =  .true.
331   ln_humi_rel     =  .true.   ! Read relative humidity (T) or specific humidity (F)
332   ln_read_snow    = .false.
333   ln_cohum_arc    = .true.   !uniquement en ete
334   ln_corad_antar  = .true.
335   ln_cowind_arc   = .false.
336   ln_cotair_arc   = .true.   !uniquement en ete
337/
338!-----------------------------------------------------------------------
339&namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae
340!-----------------------------------------------------------------------
341!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask !
342!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      !
343   sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , ''
344   sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , ''
345   sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , ''
346   sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'     ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , ''
347   sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , ''
348   sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'      ,    .true.    , .false. , 'daily'  ,'bilinear.nc', ''       , ''
349   sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip'  ,    .true.    , .true.  , 'daily'  ,'bicubic.nc' , ''       , ''
350
351   cn_dir      = './ECMWF/'      !  root directory for the location of the bulk files
352/
353!-----------------------------------------------------------------------
354&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_coupled")
355!-----------------------------------------------------------------------
356!                    !     description       !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector !
357!                    !                       ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  !
358! send
359   sn_snd_temp   =       'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
360   sn_snd_alb    =       'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
361   sn_snd_thick  =       'none'                 ,    'no'   ,     ''      ,         ''           ,   ''
362   sn_snd_crt    =       'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T'
363   sn_snd_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
364! receive
365   sn_rcv_w10m   =       'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
366   sn_rcv_taumod =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
367   sn_rcv_tau    =       'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V'
368   sn_rcv_dqnsdt =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
369   sn_rcv_qsr    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
370   sn_rcv_qns    =       'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
371   sn_rcv_emp    =       'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
372   sn_rcv_rnf    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
373   sn_rcv_cal    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
374   sn_rcv_co2    =       'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
375!
376   nn_cplmodel   =     1     !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data
377   ln_usecplmask = .false.   !  use a coupling mask file to merge data received from several models
378                             !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel)
379/
380!-----------------------------------------------------------------------
381&namsbc_sas    !   analytical surface boundary condition
382!-----------------------------------------------------------------------
383!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
384!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
385   sn_usp      = 'sas_grid_U' ,    120           , 'vozocrtx' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''     
386   sn_vsp      = 'sas_grid_V' ,    120           , 'vomecrty' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''
387   sn_tem      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosstsst' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''
388   sn_sal      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sosaline' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''
389   sn_ssh      = 'sas_grid_T' ,    120           , 'sossheig' ,  .true.    , .true. ,   'yearly'  , ''       , ''             , ''
390
391   ln_3d_uv    = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v field
392   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are
393/
394!-----------------------------------------------------------------------
395&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation
396!-----------------------------------------------------------------------
397!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
398!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
399   sn_chl      = 'chlorophyll',       -1,         'CHLA',        .true.,    .true.,   'yearly',  '' , '', ''
400
401   cn_dir      = './'      ! root directory for the location of the runoff files   
402   ln_traqsr   = .true.    ! Light penetration (T) or not (F)
403   ln_qsr_rgb  = .true.    ! RGB (Red-Gree-Blue) light penetration
404   ln_qsr_2bd  = .false.   ! 2 bands             light penetration
405   nn_chltype  = 0         ! In 2 band case read chlorophyll field (0) , depth (1) or attenuation coefficient (2)
406   ln_qsr_bio  = .false.   ! bio-model light penetration
407   ln_qsr_ice  = .false.   ! light penetration for ice-model LIM3
408   nn_chldta   =      1    ! RGB : Chl data (=1) or cst value (=0)
409   rn_abs      =   0.58    ! RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1)
410   rn_si0      =   0.35    ! RGB & 2 bands: shortess depth of extinction
411   rn_si1      =   23.0    ! 2 bands: longest depth of extinction
412/
413!-----------------------------------------------------------------------
414&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition
415!-----------------------------------------------------------------------
416!              !  file name           ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
417!              !                      !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
418   sn_rnf      = 'runoff'             ,        -1         , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
419   sn_cnf      = 'runoff'             ,         0         , 'socoefr' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
420   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
421   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
422   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,         0         , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
423
424   cn_dir       = './'      !  root directory for the location of the runoff files
425   ln_rnf_mouth = .true.    !  specific treatment at rivers mouths
426   rn_hrnf      =  10.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used
427   rn_avt_rnf   =   6.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s]
428   rn_rfact     =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff
429   ln_rnf_depth = .false.   !  read in depth information for runoff
430   ln_rnf_tem   = .false.   !  read in temperature information for runoff
431   ln_rnf_sal   = .false.   !  read in salinity information for runoff
432   ln_rnf_depth_ini = .false.  ! compute depth at initialisation from runoff file
433   rn_rnf_max   = 5.735e-4  !  max value of the runoff climatologie over global domain ( ln_rnf_depth_ini = .true )
434   rn_dep_max   = 150.      !  depth over which runoffs is spread ( ln_rnf_depth_ini = .true )
435   nn_rnf_depth_file = 0    !  create (=1) a runoff depth file or not (=0)
436/
437!-----------------------------------------------------------------------
438&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)
439!-----------------------------------------------------------------------
440!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation !
441!              !           !  (if <0  months)  !   name   !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  !
442! nn_isf == 4
443   sn_qisf      = 'rnfisf' ,         -12      ,'sohflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
444   sn_fwfisf    = 'rnfisf' ,         -12      ,'sowflisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
445! nn_isf == 3
446   sn_rnfisf    = 'runoffs' ,         -12      ,'sofwfisf',    .false.      , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
447! nn_isf == 2 and 3
448   sn_depmax_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmax' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
449   sn_depmin_isf = 'runoffs' ,       -12        ,'sozisfmin' ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
450! nn_isf == 2
451   sn_Leff_isf = 'rnfisf' ,       0          ,'Leff'         ,   .false.  , .true.  , 'yearly'  ,  ''      ,   ''
452! for all case
453   ln_divisf   = .true.  ! apply isf melting as a mass flux or in the salinity trend. (maybe I should remove this option as for runoff?)
454! only for nn_isf = 1 or 2
455   rn_gammat0  = 1.0e-4   ! gammat coefficient used in blk formula
456   rn_gammas0  = 1.0e-4   ! gammas coefficient used in blk formula
457! only for nn_isf = 1
458   nn_isfblk   =  1       ! 1 ISOMIP ; 2 conservative (3 equation formulation, Jenkins et al. 1991 ??)
459   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer           (Losh et al. 2008)
460                          ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell
461   ln_conserve = .true.   ! conservative case (take into account meltwater advection)
462   nn_gammablk = 1        ! 0 = cst Gammat (= gammat/s)
463                          ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010)
464                          !     if you want to keep the cd as in global config, adjust rn_gammat0 to compensate
465                          ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    Holland et al. 1999
466/
467!-----------------------------------------------------------------------
468&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk
469!-----------------------------------------------------------------------
470!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
471!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
472   sn_apr      = 'ECMWF_PRES_ORCA025'  ,  3     ,'somslpre',    .true.      , .false. , 'daily'  ,  'weights_bilinear_atmo.nc' , '', ''
473
474   cn_dir      = 'atm_forcing/'      !  root directory for the location of the bulk files
475   rn_pref     = 100970.    !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/
476   ln_ref_apr  = .false.    !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F)
477   ln_apr_obc  =  .FALSE.   !  inverse barometer added to OBC ssh data
478/
479!-----------------------------------------------------------------------
480&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring
481!-----------------------------------------------------------------------
482!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
483!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
484   sn_sst      = 'sst_data'  ,        24         ,  'sst'    ,    .false.   , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
485   sn_sss      = 'sss_data'  ,        -1         ,  'sss'    ,    .true.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
486
487   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
488   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0)
489   nn_sssr     =     0     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)
490                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0)
491   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K]
492   rn_deds     =  -166.67  !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day]
493   ln_sssr_bnd =   .true.  !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2)
494   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day]
495/
496!-----------------------------------------------------------------------
497&namsbc_alb    !   albedo parameters
498!-----------------------------------------------------------------------
499   rn_cloud    =    0.06   !  cloud correction to snow and ice albedo
500   rn_albice   =    0.53   !  albedo of melting ice in the arctic and antarctic
501   rn_alphd    =    0.80   !  coefficients for linear interpolation used to
502   rn_alphc    =    0.65   !  compute albedo between two extremes values
503   rn_alphdi   =    0.72   !  (Pyane, 1972)
504/
505!-----------------------------------------------------------------------
506&namberg       !   iceberg parameters
507!-----------------------------------------------------------------------
508      ln_icebergs              = .false.
509      ln_bergdia               = .true.               ! Calculate budgets
510      nn_verbose_level         = 1                    ! Turn on more verbose output if level > 0
511      nn_verbose_write         = 15                   ! Timesteps between verbose messages
512      nn_sample_rate           = 1                    ! Timesteps between sampling for trajectory storage
513                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class
514      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11
515                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class 
516      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02
517                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim)
518                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point         
519      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1
520                                                      ! thickness of newly calved bergs (m)
521      rn_initial_thickness     = 40., 67., 133., 175., 250., 250., 250., 250., 250., 250.
522      rn_rho_bergs             = 850.                 ! Density of icebergs
523      rn_LoW_ratio             = 1.5                  ! Initial ratio L/W for newly calved icebergs
524      ln_operator_splitting    = .true.               ! Use first order operator splitting for thermodynamics
525      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits
526      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1)
527      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling   
528      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no)
529                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2)
530      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0
531      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg   
532
533!              ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
534!              !           !  (if <0  months)  !     name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
535      sn_icb =  'calving' ,       -1           , 'calvingmask',  .true.        , .true.  , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
536   
537      cn_dir = './'
538/
539
540!!======================================================================
541!!               ***  Lateral boundary condition  ***
542!!======================================================================
543!!   namlbc        lateral momentum boundary condition
544!!   namcla        cross land advection
545!!   namobc        open boundaries parameters                           ("key_obc")
546!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif")
547!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy")
548!!   namtide       Tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides")
549!!======================================================================
550!
551!-----------------------------------------------------------------------
552&namlbc        !   lateral momentum boundary condition
553!-----------------------------------------------------------------------
554   rn_shlat    =     0     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat
555                           !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip
556   ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical eqs.
557/
558!-----------------------------------------------------------------------
559&namcla        !   cross land advection
560!-----------------------------------------------------------------------
561   nn_cla      =    0      !  advection between 2 ocean pts separates by land
562/
563!-----------------------------------------------------------------------
564&namobc        !   open boundaries parameters                           ("key_obc")
565!-----------------------------------------------------------------------
566   ln_obc_clim = .false.   !  climatological obc data files (T) or not (F)
567   ln_vol_cst  = .true.    !  impose the total volume conservation (T) or not (F)
568   ln_obc_fla  = .false.   !  Flather open boundary condition
569   nn_obcdta   =    0      !  = 0 the obc data are equal to the initial state
570                           !  = 1 the obc data are read in 'obc.dta' files
571   cn_obcdta   = 'annual'  !  set to annual if obc datafile hold 1 year of data
572                           !  set to monthly if obc datafile hold 1 month of data
573   rn_dpein    =    1.     !  damping time scale for inflow at east  open boundary
574   rn_dpwin    =    1.     !     -           -         -       west    -      -
575   rn_dpnin    =    1.     !     -           -         -       north   -      -
576   rn_dpsin    =    1.     !     -           -         -       south   -      -
577   rn_dpeob    = 3000.     !  time relaxation (days) for the east  open boundary
578   rn_dpwob    =   15.     !     -           -         -     west    -      -
579   rn_dpnob    = 3000.     !     -           -         -     north   -      -
580   rn_dpsob    =   15.     !     -           -         -     south   -      -
581   rn_volemp   =    1.     !  = 0 the total volume change with the surface flux (E-P-R)
582                           !  = 1 the total volume remains constant
583/
584!-----------------------------------------------------------------------
585&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif")
586!-----------------------------------------------------------------------
587   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency
588   ln_spc_dyn    = .true.  !  use 0 as special value for dynamics
589   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s]
590   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s]
591/
592!-----------------------------------------------------------------------
593&nam_tide      !   tide parameters (#ifdef key_tide)
594!-----------------------------------------------------------------------
595   ln_tide_pot   = .true.   !  use tidal potential forcing
596   ln_tide_ramp  = .RAMP.   !
597   rdttideramp   =    1.    !
598   clname(1)     =   'M2'   !  name of constituent
599   clname(2)     =   'S2'
600   clname(3)     =   'N2'
601   clname(4)     =   'K1'
602   clname(5)     =   'O1'
603   clname(6)     =   'Q1'
604   clname(7)     =   'M4'
605   clname(8)     =   'K2'
606   clname(9)     =   'P1'
607   clname(10)    =   'Mf'
608   clname(11)    =   'Mm'
609/
610!-----------------------------------------------------------------------
611&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy")
612!-----------------------------------------------------------------------
613    nb_bdy         =  3                   !  number of open boundary sets
614    ln_coords_file = .false.,.false.,.false. !  =T : read bdy coordinates from file
615    cn_coords_file =  '','',''            !  bdy coordinates files
616    ln_mask_file   = .false.              !  =T : read mask from file
617    cn_mask_file   = ''                   !  name of mask file (if ln_mask_file=.TRUE.)
618    cn_dyn2d       =  'flather','flather','flather'         !
619    nn_dyn2d_dta   =  1,1,1             !  = 0, bdy data are equal to the initial state
620                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
621                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files
622                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing
623    cn_dyn3d      =  'specified','specified','specified'          ! 
624    nn_dyn3d_dta  =  1,1,1              !  = 0, bdy data are equal to the initial state
625                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
626    cn_tra        =  'specified','specified','specified'          !
627    nn_tra_dta    =  1,1,1              !  = 0, bdy data are equal to the initial state
628                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
629    cn_ice_lim      =  'none'             ! 
630    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state
631                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
632    rn_ice_tem      = 270.                !  lim3 only: arbitrary temperature of incoming sea ice
633    rn_ice_sal      = 10.                 !  lim3 only:      --   salinity           --
634    rn_ice_age      = 30.                 !  lim3 only:      --   age                --
635                                          !
636    cn_trc        =  'specified','specified','specified'          !
637    nn_trc_dta    =  1,1,1              !  = 0, bdy data are equal to the initial state
638                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
639    ln_tra_dmp    =.true.,.true.,.true.   !  open boudaries conditions for tracers
640    ln_dyn3d_dmp  =.true.,.true.,.true.   !  open boundary condition for baroclinic velocities
641    ln_trc_dmp    =.true.,.true.,.true.   !  open boudaries conditions for tracers
642    rn_time_dmp     =  1.,1.,1.  ! Damping time scale in days
643    rn_time_dmp_out =  1.,1.,1.  ! Outflow damping time scale
644    nn_rimwidth   = 10,10,10     !  width of the relaxation zone
645    ln_vol        = .false.               !  total volume correction (see nn_volctl parameter)
646    nn_volctl     = 1                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero
647/
648!-----------------------------------------------------------------------
649&nambdy_index  !  structured open boundaries definition     ("key_bdy")
650!-----------------------------------------------------------------------
651    ctypebdy ='S'                   ! Open boundary type (W,E,S or N)
652    nbdyind  = 2                    ! indice of velocity row or column
653                                    ! if ==-1, set obc at the domain boundary
654                                    !        , discard start and end indices
655    nbdybeg  = 72                   ! indice of segment start
656    nbdyend  = 842                  ! indice of segment end
657/
658!-----------------------------------------------------------------------
659&nambdy_index  !  structured open boundaries definition     ("key_bdy")
660!-----------------------------------------------------------------------
661    ctypebdy ='N'                   ! Open boundary type (W,E,S or N)
662    nbdyind  = 440                  ! indice of velocity row or column
663                                    ! if ==-1, set obc at the domain boundary
664                                    !        , discard start and end indices
665    nbdybeg  = 281                  ! indice of segment start
666    nbdyend  = 842                  ! indice of segment end
667/
668!-----------------------------------------------------------------------
669&nambdy_index  !  structured open boundaries definition     ("key_bdy")
670!-----------------------------------------------------------------------
671    ctypebdy ='E'                   ! Open boundary type (W,E,S or N)
672    nbdyind  = 841                  ! indice of velocity row or column
673                                    ! if ==-1, set obc at the domain boundary
674                                    !        , discard start and end indices
675    nbdybeg  = 2                    ! indice of segment start
676    nbdyend  = 441                  ! indice of segment end
677/
678!-----------------------------------------------------------------------
679&nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy")
680!-----------------------------------------------------------------------
681!              !   file name    ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation !
682!              !                !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  !
683   bn_ssh =     'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
684   bn_u2d =     'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
685   bn_v2d =     'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
686   bn_u3d  =    'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
687   bn_v3d  =    'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
688   bn_tem  =    'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
689   bn_sal  =    'REUNION12_obcdta_south' , 24   , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
690   cn_dir  =    'bdy_forcing/'
691   ln_full_vel = .true.
692/
693!-----------------------------------------------------------------------
694&nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy")
695!-----------------------------------------------------------------------
696!              !   file name    ! frequency (hours) !  variable  ! time interpol. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation !
697!              !                !  (if <0  months)  !    name    !    (logical)   !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  !
698   bn_ssh =     'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
699   bn_u2d =     'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
700   bn_v2d =     'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
701   bn_u3d  =    'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
702   bn_v3d  =    'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
703   bn_tem  =    'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
704   bn_sal  =    'REUNION12_obcdta_north' , 24   , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
705   cn_dir  =    'bdy_forcing/'
706   ln_full_vel = .true.
707/
708!-----------------------------------------------------------------------
709&nambdy_dta      !  open boundaries - external data           ("key_bdy")
710!-----------------------------------------------------------------------
711!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable   ! time interp.   !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
712!              !                 !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)    !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
713   bn_ssh =     'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'sossheig' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
714   bn_u2d =     'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'vobtcrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
715   bn_v2d =     'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'vobtcrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
716   bn_u3d  =    'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'vozocrtx' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
717   bn_v3d  =    'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'vomecrty' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
718   bn_tem  =    'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'votemper' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
719   bn_sal  =    'REUNION12_obcdta_east'  , 24   , 'vosaline' ,     .true.     , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   '' ,   ''
720   cn_dir  =    'bdy_forcing/'
721   ln_full_vel = .true.
722/
723!!======================================================================
724!!                 ***  Bottom boundary condition  ***
725!!======================================================================
726!!   nambfr        bottom friction
727!!   nambbc        bottom temperature boundary condition
728!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl")
729!!======================================================================
730!
731!-----------------------------------------------------------------------
732&nambfr        !   bottom friction
733!-----------------------------------------------------------------------
734   nn_bfr      =    2      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction
735                           !                              = 2 : nonlinear friction
736   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case)
737   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T
738   rn_bfri2_max =   1.e-1  !  max. bottom drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T)
739   rn_bfeb2    =   2.5e-3  !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2)
740   rn_bfrz0    =   3.5e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T
741   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file )
742   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T)
743   rn_tfri1    =    4.e-4  !  top drag coefficient (linear case)
744   rn_tfri2    =    2.5e-3 !  top drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T
745   rn_tfri2_max =   1.e-1  !  max. top drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T)
746   rn_tfeb2    =    0.0    !  top turbulent kinetic energy background  (m2/s2)
747   rn_tfrz0    =    3.e-3  !  top roughness [m] if ln_loglayer=T
748   ln_tfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the top friction coef (read a 2D mask file )
749   rn_tfrien   =    50.    !  local multiplying factor of tfr (ln_tfr2d=T)
750
751   ln_bfrimp   = .true.    !  implicit bottom friction (requires ln_zdfexp = .false. if true)
752   ln_loglayer = .true.    !  logarithmic formulation (non linear case)
753/
754!-----------------------------------------------------------------------
755&nambbc        !   bottom temperature boundary condition
756!-----------------------------------------------------------------------
757   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom
758   nn_geoflx   =    0      !  geothermal heat flux: = 0 no flux
759                           !     = 1 constant flux
760                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2)
761   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2]
762/
763!-----------------------------------------------------------------------
764&nambbl        !   bottom boundary layer scheme
765!-----------------------------------------------------------------------
766   nn_bbl_ldf  =  0      !  diffusive bbl (=1)   or not (=0)
767   nn_bbl_adv  =  0      !  advective bbl (=1/2) or not (=0)
768   rn_ahtbbl   =  1000.  !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s]
769   rn_gambbl   =  10.    !  advective bbl coefficient                 [s]
770/
771
772!!======================================================================
773!!                        Tracer (T & S ) namelists
774!!======================================================================
775!!   nameos        equation of state
776!!   namtra_adv    advection scheme
777!!   namtra_adv_mle   mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.)
778!!   namtra_ldf    lateral diffusion scheme
779!!   namtra_dmp    T & S newtonian damping
780!!======================================================================
781!
782!-----------------------------------------------------------------------
783&nameos        !   ocean physical parameters
784!-----------------------------------------------------------------------
785   nn_eos      =  0     !  type of equation of state and Brunt-Vaisala frequency
786                                 !  =-1, TEOS-10
787                                 !  = 0, EOS-80
788                                 !  = 1, S-EOS   (simplified eos)
789   ln_useCT    = .false. ! use of Conservative Temp. ==> surface CT converted in Pot. Temp. in sbcssm
790   !                             !
791   !                     ! S-EOS coefficients :
792   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS
793   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1)
794   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1)
795   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos)
796   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos)
797   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos)
798   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos)
799   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos)
800/
801!-----------------------------------------------------------------------
802&namtra_adv    !   advection scheme for tracer
803!-----------------------------------------------------------------------
804   ln_traadv_cen2   =  .false.   !  2nd order centered scheme
805   ln_traadv_tvd    =  .true.    !  TVD scheme
806   ln_traadv_tvd_qck=  .false.   !  TVD QCK scheme
807   ln_traadv_muscl  =  .false.   !  MUSCL scheme
808   ln_traadv_muscl2 =  .false.   !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries
809   ln_traadv_ubs    =  .false.   !  UBS scheme
810   ln_traadv_qck    =  .false.   !  QUICKEST scheme
811   ln_traadv_msc_ups=  .false.   !  use upstream scheme within muscl
812   ln_traadv_tvd_zts=  .false.   !  TVD scheme with sub-timestepping of vertical tracer advection
813/
814!-----------------------------------------------------------------------
815&namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param)
816!-----------------------------------------------------------------------
817   ln_mle    = .false.     ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation
818   rn_ce     = 0.06        ! magnitude of the MLE (typical value: 0.06 to 0.08)
819   nn_mle    = 1           ! MLE type: =0 standard Fox-Kemper ; =1 new formulation
820   rn_lf     = 5.e+3       ! typical scale of mixed layer front (meters)                      (case rn_mle=0)
821   rn_time   = 172800.     ! time scale for mixing momentum across the mixed layer (seconds)  (case rn_mle=0)
822   rn_lat    = 20.         ! reference latitude (degrees) of MLE coef.                        (case rn_mle=1)
823   nn_mld_uv = 0           ! space interpolation of MLD at u- & v-pts (0=min,1=averaged,2=max)
824   nn_conv   = 0           ! =1 no MLE in case of convection ; =0 always MLE
825   rn_rho_c_mle  = 0.01    ! delta rho criterion used to calculate MLD for FK
826/
827!----------------------------------------------------------------------------------
828&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers
829!----------------------------------------------------------------------------------
830   !                       !  Operator type:
831   ln_traldf_lap    =  .true.  !  laplacian operator
832   ln_traldf_bilap  =  .false. !  bilaplacian operator
833   !                       !  Direction of action:
834   ln_traldf_level  =  .false.  !  iso-level
835   ln_traldf_hor    =  .false.  !  horizontal (geopotential)   (needs "key_ldfslp" when ln_sco=T)
836   ln_traldf_iso    =  .true.  !  iso-neutral                 (needs "key_ldfslp")
837   !                 !  Griffies parameters              (all need "key_ldfslp")
838   ln_traldf_grif   =  .false.  !  use griffies triads
839   ln_traldf_gdia   =  .false.  !  output griffies eddy velocities
840   ln_triad_iso     =  .false.  !  pure lateral mixing in ML
841   ln_botmix_grif   =  .false.  !  lateral mixing on bottom
842   !                       !  Coefficients
843   ! Eddy-induced (GM) advection always used with Griffies; otherwise needs "key_traldf_eiv"
844   ! Value rn_aeiv_0 is ignored unless = 0 with Held-Larichev spatially varying aeiv
845   !                                  (key_traldf_c2d & key_traldf_eiv & key_orca_r2, _r1 or _r05)
846   rn_aeiv_0        =     0.    !  eddy induced velocity coefficient [m2/s]
847   rn_aht_0         =    85.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s]
848   rn_ahtb_0        =     0.    !  background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s]
849   !                                           (normally=0; not used with Griffies)
850   rn_slpmax        =     0.01  !  slope limit
851   rn_chsmag        =     1.    !  multiplicative factor in Smagorinsky diffusivity
852   rn_smsh          =     1.    !  Smagorinsky diffusivity: = 0 - use only sheer
853   rn_aht_m         =  2000.    !  upper limit or stability criteria for lateral eddy diffusivity (m2/s)
854/
855!-----------------------------------------------------------------------
856&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping
857!-----------------------------------------------------------------------
858   ln_tradmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F)
859   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column
860                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria)
861                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria)
862   cn_resto    = 'resto.nc' ! Name of file containing restoration coefficient field (use dmp_tools to create this)
863/
864!-----------------------------------------------------------------------
865&namnudg       !   Spectral Nudging
866!-----------------------------------------------------------------------
867   ln_nudg_ana = .FALSE.  !  Forecast (F) or Analysis (T)
868/
869!!======================================================================
870!!                      ***  Dynamics namelists  ***
871!!======================================================================
872!!   namdyn_adv    formulation of the momentum advection
873!!   namdyn_vor    advection scheme
874!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient
875!!   namdyn_spg    surface pressure gradient                            (CPP key only)
876!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme
877!!======================================================================
878!
879!-----------------------------------------------------------------------
880&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection
881!-----------------------------------------------------------------------
882   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F)
883   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme
884   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme
885   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection
886/
887!-----------------------------------------------------------------------
888&nam_vvl    !   vertical coordinate options
889!-----------------------------------------------------------------------
890   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate                   
891   ln_vvl_ztilde = .false.          !  ztilde vertical coordinate: only high frequency variations
892   ln_vvl_layer  = .false.          !  full layer vertical coordinate
893   ln_vvl_ztilde_as_zstar = .false. !  ztilde vertical coordinate emulating zstar
894   ln_vvl_zstar_at_eqtor = .false.  !  ztilde near the equator
895   rn_ahe3       = 0.0e0            !  thickness diffusion coefficient
896   rn_rst_e3t    = 30.e0            !  ztilde to zstar restoration timescale [days]
897   rn_lf_cutoff  = 5.0e0            !  cutoff frequency for low-pass filter  [days]
898   rn_zdef_max   = 0.9e0            !  maximum fractional e3t deformation
899   ln_vvl_dbg    = .false.          !  debug prints    (T/F)
900/
901!-----------------------------------------------------------------------
902&namdyn_vor    !   option of physics/algorithm (not control by CPP keys)
903!-----------------------------------------------------------------------
904   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme
905   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme
906   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme
907   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme
908   ln_dynvor_een_old = .true.  !  energy & enstrophy scheme - original formulation
909/
910!-----------------------------------------------------------------------
911&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option
912!-----------------------------------------------------------------------
913   ln_hpg_zco  = .false.   !  z-coordinate - full steps
914   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation)
915   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation)
916   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial)
917   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme)
918   ln_dynhpg_imp = .false. !  time stepping: semi-implicit time scheme  (T)
919                                 !           centered      time scheme  (F)
920/
921!-----------------------------------------------------------------------
922!namdyn_spg    !   surface pressure gradient   (CPP key only)
923!-----------------------------------------------------------------------
924!                          !  explicit free surface                     ("key_dynspg_exp")
925!                          !  filtered free surface                     ("key_dynspg_flt")
926!                          !  split-explicit free surface               ("key_dynspg_ts")
927
928!-----------------------------------------------------------------------
929&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum
930!-----------------------------------------------------------------------
931   !                       !  Type of the operator :
932   ln_dynldf_lap    =  .false.  !  laplacian operator
933   ln_dynldf_bilap  =  .true.   !  bilaplacian operator
934   !                       !  Direction of action  :
935   ln_dynldf_level  =  .false.  !  iso-level
936   ln_dynldf_hor    =  .true.   !  horizontal (geopotential)            (require "key_ldfslp" in s-coord.)
937   ln_dynldf_iso    =  .false.  !  iso-neutral                          (require "key_ldfslp")
938   !                       !  Coefficient
939   rn_ahm_0_lap     =    -1.e10 !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s]
940   rn_ahmb_0        =     0.    !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s]
941   rn_ahm_0_blp     =  -1.25e10 !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]
942   rn_cmsmag_1      =     3.    !  constant in laplacian Smagorinsky viscosity
943   rn_cmsmag_2      =     3     !  constant in bilaplacian Smagorinsky viscosity
944   rn_cmsh          =     1.    !  1 or 0 , if 0 -use only shear for Smagorinsky viscosity
945   rn_ahm_m_blp     =    -1.e12 !  upper limit for bilap  abs(ahm) < min( dx^4/128rdt, rn_ahm_m_blp)
946   rn_ahm_m_lap     = 40000.    !  upper limit for lap  ahm < min(dx^2/16rdt, rn_ahm_m_lap)
947/
948
949!!======================================================================
950!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists
951!!======================================================================
952!!    namzdf        vertical physics
953!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric")
954!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke")
955!!    namzdf_kpp    KPP dependent vertical mixing                       ("key_zdfkpp")
956!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm")
957!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx")
958!!======================================================================
959!
960!-----------------------------------------------------------------------
961&namzdf        !   vertical physics
962!-----------------------------------------------------------------------
963   rn_avm0     =   1.e-4   !  vertical eddy viscosity   [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst")
964   rn_avt0     =   1.e-5   !  vertical eddy diffusivity [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst")
965   nn_avb      =    0      !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0)
966   nn_havtb    =    0      !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0)
967   ln_zdfevd   = .false.   !  enhanced vertical diffusion (evd) (T) or not (F)
968   nn_evdm     =    0      !  evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1)
969   rn_avevd    =   10.     !  evd mixing coefficient [m2/s]
970   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative Convective algorithm (T) or not (F)
971   nn_npc      =    1            !  frequency of application of npc
972   nn_npcp     =  365            !  npc control print frequency
973   ln_zdfexp   = .false.   !  time-stepping: split-explicit (T) or implicit (F) time stepping
974   nn_zdfexp   =    3            !  number of sub-timestep for ln_zdfexp=T
975/
976!-----------------------------------------------------------------------
977&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       ("key_zdfric" )
978!-----------------------------------------------------------------------
979   rn_avmri    = 100.e-4   !  maximum value of the vertical viscosity
980   rn_alp      =   5.      !  coefficient of the parameterization
981   nn_ric      =   2       !  coefficient of the parameterization
982   rn_ekmfc    =   0.7     !  Factor in the Ekman depth Equation
983   rn_mldmin   =   1.0     !  minimum allowable mixed-layer depth estimate (m)
984   rn_mldmax   =1000.0     !  maximum allowable mixed-layer depth estimate (m)
985   rn_wtmix    =  10.0     !  vertical eddy viscosity coeff [m2/s] in the mixed-layer
986   rn_wvmix    =  10.0     !  vertical eddy diffusion coeff [m2/s] in the mixed-layer
987   ln_mldw     = .true.    !  Flag to use or not the mized layer depth param.
988/
989!-----------------------------------------------------------------------
990&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  ("key_zdftke")
991!-----------------------------------------------------------------------
992   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) )
993   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation
994   rn_ebb      =  60.00    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T)
995   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2]
996   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2]
997   rn_bshear   =   1.e-20  ! background shear (>0) currently a numerical threshold (do not change it)
998   nn_mxl      =   3       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom
999                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor
1000                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1
1001                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale
1002   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm)
1003   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F)
1004   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value
1005   ln_lc       = .false.   !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002)
1006   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells
1007   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to internal & intertial waves
1008                           !        = 0 no penetration
1009                           !        = 1 add a tke source below the ML
1010                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML
1011                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress    ("key_coupled")
1012   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2)
1013   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML
1014                           !        = 0  constant 10 m length scale
1015                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees
1016/
1017!------------------------------------------------------------------------
1018&namzdf_kpp    !   K-Profile Parameterization dependent vertical mixing  ("key_zdfkpp", and optionally:
1019!------------------------------------------------------------------------ "key_kppcustom" or "key_kpplktb")
1020   ln_kpprimix = .true.    !  shear instability mixing
1021   rn_difmiw   =  1.0e-04  !  constant internal wave viscosity [m2/s]
1022   rn_difsiw   =  0.1e-04  !  constant internal wave diffusivity [m2/s]
1023   rn_riinfty  =  0.8      !  local Richardson Number limit for shear instability
1024   rn_difri    =  0.0050   !  maximum shear mixing at Rig = 0    [m2/s]
1025   rn_bvsqcon  = -0.01e-07 !  Brunt-Vaisala squared for maximum convection [1/s2]
1026   rn_difcon   =  1.       !  maximum mixing in interior convection [m2/s]
1027   nn_avb      =  0        !  horizontal averaged (=1) or not (=0) on avt and amv
1028   nn_ave      =  1        !  constant (=0) or profile (=1) background on avt
1029/
1030!-----------------------------------------------------------------------
1031&namzdf_gls                !   GLS vertical diffusion                   ("key_zdfgls")
1032!-----------------------------------------------------------------------
1033   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2]
1034   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3]
1035   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988)
1036   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit
1037   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case
1038   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux
1039   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length
1040   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness
1041   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2)
1042   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2)
1043   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum)
1044   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum)
1045   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB)
1046   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen)
1047/
1048!-----------------------------------------------------------------------
1049&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm")
1050!-----------------------------------------------------------------------
1051   rn_avts     = 1.e-4     !  maximum avs (vertical mixing on salinity)
1052   rn_hsbfr    = 1.6       !  heat/salt buoyancy flux ratio
1053/
1054!-----------------------------------------------------------------------
1055&namzdf_tmx    !   tidal mixing parameterization                        ("key_zdftmx")
1056!-----------------------------------------------------------------------
1057   rn_htmx     = 500.      !  vertical decay scale for turbulence (meters)
1058   rn_n2min    = 1.e-8     !  threshold of the Brunt-Vaisala frequency (s-1)
1059   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency
1060   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency
1061   ln_tmx_itf  = .true.    !  ITF specific parameterisation
1062   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency
1063/
1064
1065!!======================================================================
1066!!                  ***  Miscellaneous namelists  ***
1067!!======================================================================
1068!!   namsol            elliptic solver / island / free surface
1069!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi)
1070!!   namctl            Control prints & Benchmark
1071!!   namc1d            1D configuration options                         ("key_c1d")
1072!!   namc1d_uvd        data: U & V currents                             ("key_c1d")
1073!!   namc1d_dyndmp     U & V newtonian damping                          ("key_c1d")
1074!!======================================================================
1075!
1076!-----------------------------------------------------------------------
1077&namsol        !   elliptic solver / island / free surface
1078!-----------------------------------------------------------------------
1079   nn_solv     =      2    !  elliptic solver: =1 preconditioned conjugate gradient (pcg)
1080                           !                   =2 successive-over-relaxation (sor)
1081   nn_sol_arp  =      0    !  absolute/relative (0/1) precision convergence test
1082   rn_eps      =  1.e-10   !  absolute precision of the solver
1083   nn_nmin     =    340    !  minimum of iterations for the SOR solver
1084   nn_nmax     =  15000    !  maximum of iterations for the SOR solver
1085   nn_nmod     =     10    !  frequency of test for the SOR solver
1086   rn_resmax   =  1.e-10   !  absolute precision for the SOR solver
1087   rn_sor      =  1.9803   !  optimal coefficient for SOR solver (to be adjusted with the domain)
1088/
1089!-----------------------------------------------------------------------
1090&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi)
1091!-----------------------------------------------------------------------
1092   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send,
1093                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp.
1094   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation
1095   ln_nnogather=  .false.  !  activate code to avoid mpi_allgather use at the northfold
1096   jpni        =  JJPNI    !  jpni   number of processors following i (set automatically if < 1)
1097   jpnj        =  JJPNJ    !  jpnj   number of processors following j (set automatically if < 1)
1098   jpnij       =  JJPNIJ   !  jpnij  number of local domains (set automatically if < 1)
1099/
1100!-----------------------------------------------------------------------
1101&namctl        !   Control prints & Benchmark
1102!-----------------------------------------------------------------------
1103   ln_ctl      = .false.   !  trends control print (expensive!)
1104   nn_print    =    0      !  level of print (0 no extra print)
1105   nn_ictls    =    0      !  start i indice of control sum (use to compare mono versus
1106   nn_ictle    =    0      !  end   i indice of control sum        multi processor runs
1107   nn_jctls    =    0      !  start j indice of control               over a subdomain)
1108   nn_jctle    =    0      !  end   j indice of control
1109   nn_isplt    =    1      !  number of processors in i-direction
1110   nn_jsplt    =    1      !  number of processors in j-direction
1111   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench
1112                           !     (no physical validity of the results)
1113   nn_timing   =    0      !  timing by routine activated (=1) creates timing.output file, or not (=0)
1114/
1115!-----------------------------------------------------------------------
1116&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d")
1117!-----------------------------------------------------------------------
1118!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
1119!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
1120   sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , ''
1121   sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , ''
1122!
1123   cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files
1124   ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F)
1125   ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F)
1126/
1127!-----------------------------------------------------------------------
1128&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d")
1129!-----------------------------------------------------------------------
1130   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F)
1131/
1132
1133!!======================================================================
1134!!                  ***  Diagnostics namelists  ***
1135!!======================================================================
1136!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4")
1137!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends
1138!!   namflo       float parameters                                      ("key_float")
1139!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics
1140!!   namhsb       Heat and salt budgets
1141!!======================================================================
1142!
1143!-----------------------------------------------------------------------
1144&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings            ("key_netcdf4")
1145!-----------------------------------------------------------------------
1146   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension
1147   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension
1148   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension
1149                           !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which
1150                           !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs
1151   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression
1152                           !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files
1153/
1154!-----------------------------------------------------------------------
1155&namtrd        !   diagnostics on dynamics and/or tracer trends
1156!              !       and/or mixed-layer trends and/or barotropic vorticity
1157!-----------------------------------------------------------------------
1158   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE
1159   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output
1160   ln_dyn_mxl  = .FALSE.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet)
1161   ln_vor_trd  = .FALSE.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet)
1162   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends
1163   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends
1164   ln_tra_trd  = .FALSE.   ! (T) 3D tracer trend output
1165   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet)
1166   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step)
1167/
1168!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk)
1169!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day)
1170!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input)
1171!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output)
1172!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics
1173!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S
1174!!gm
1175!-----------------------------------------------------------------------
1176&namflo       !   float parameters                                      ("key_float")
1177!-----------------------------------------------------------------------
1178   jpnfl         = 1          !  total number of floats during the run
1179   jpnnewflo     = 0          !  number of floats for the restart
1180   ln_rstflo     = .false.    !  float restart (T) or not (F)
1181   nn_writefl    =      75    !  frequency of writing in float output file
1182   nn_stockfl    =    5475    !  frequency of creation of the float restart file
1183   ln_argo       = .false.    !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days)
1184   ln_flork4     = .false.    !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T)
1185                              !  or computed with Blanke' scheme (F)
1186   ln_ariane     = .true.     !  Input with Ariane tool convention(T)
1187   ln_flo_ascii  = .true.     !  Output with Ariane tool netcdf convention(F) or ascii file (T)
1188/
1189!-----------------------------------------------------------------------
1190&namptr       !   Poleward Transport Diagnostic
1191!-----------------------------------------------------------------------
1192   ln_diaptr  = .false.    !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F)
1193   ln_subbas  = .false.    !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not
1194/
1195!-----------------------------------------------------------------------
1196&namhsb       !  Heat and salt budgets
1197!-----------------------------------------------------------------------
1198   ln_diahsb  = .false.    !  check the heat and salt budgets (T) or not (F)
1199/
1200!-----------------------------------------------------------------------
1201&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents ('key_diaharm')
1202!-----------------------------------------------------------------------
1203    nit000_han = 1         ! First time step used for harmonic analysis
1204    nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis
1205    nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis
1206    tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents
1207    tname(2)   = 'K1'
1208/
1209!-----------------------------------------------------------------------
1210&namdct        ! transports through sections
1211!-----------------------------------------------------------------------
1212    nn_dct      = 60       !  time step frequency for transports computing
1213    nn_dctwri   = 240      !  time step frequency for transports writing
1214    nn_secdebug = 0        !      0 : no section to debug
1215                           !     -1 : debug all section
1216                           !  0 < n : debug section number n
1217/
1218!-----------------------------------------------------------------------
1219&nammoor        ! moorings outputs
1220!-----------------------------------------------------------------------
1221    ln_diamoor  =  .FALSE.    ! flag to activate the moorings
1222    path_moor   =  "PATH_MOOR/"
1223    nwmoor      =     20      ! Frequency of computation
1224/
1225
1226!!======================================================================
1227!!            ***  Observation & Assimilation namelists ***
1228!!======================================================================
1229!!   namobs       observation and model comparison                      ('key_diaobs')
1230!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc')
1231!!======================================================================
1232!
1233!-----------------------------------------------------------------------
1234&namobs       !  observation usage switch                               ('key_diaobs')
1235!-----------------------------------------------------------------------
1236   ln_t3d     = .false.    ! Logical switch for T profile observations
1237   ln_s3d     = .false.    ! Logical switch for S profile observations
1238   ln_ena     = .false.    ! Logical switch for ENACT insitu data set
1239   !                       !     ln_cor                  Logical switch for Coriolis insitu data set
1240   ln_profb   = .false.    ! Logical switch for feedback insitu data set
1241   ln_sla     = .false.    ! Logical switch for SLA observations
1242
1243   ln_sladt   = .false.    ! Logical switch for AVISO SLA data
1244
1245   ln_slafb   = .false.    ! Logical switch for feedback SLA data
1246                           !     ln_ssh                  Logical switch for SSH observations
1247
1248   ln_sst     = .false.     ! Logical switch for SST observations
1249   ln_reysst  = .false.     !     ln_reysst               Logical switch for Reynolds observations
1250   ln_ghrsst  = .false.    !     ln_ghrsst               Logical switch for GHRSST observations     
1251
1252   ln_sstfb   = .false.    ! Logical switch for feedback SST data
1253                           !     ln_sss                  Logical switch for SSS observations
1254   ln_seaice  = .false.    ! Logical switch for Sea Ice observations
1255                           !     ln_vel3d                Logical switch for velocity observations
1256                           !     ln_velavcur             Logical switch for velocity daily av. cur.
1257                           !     ln_velhrcur             Logical switch for velocity high freq. cur.
1258                           !     ln_velavadcp            Logical switch for velocity daily av. ADCP
1259                           !     ln_velhradcp            Logical switch for velocity high freq. ADCP
1260                           !     ln_velfb                Logical switch for feedback velocity data
1261                           !     ln_grid_global          Global distribtion of observations
1262                           !     ln_grid_search_lookup   Logical switch for obs grid search w/lookup table
1263                           !     grid_search_file        Grid search lookup file header
1264                           !     enactfiles              ENACT input observation file names
1265                           !     coriofiles              Coriolis input observation file name
1266   !                       ! profbfiles: Profile feedback input observation file name
1267   profbfiles = 'profiles_01.nc'
1268                           !     ln_profb_enatim         Enact feedback input time setting switch
1269                           !     slafilesact             Active SLA input observation file name
1270                           !     slafilespas             Passive SLA input observation file name
1271   !                       ! slafbfiles: Feedback SLA input observation file name
1272   slafbfiles = 'sla_01.nc'
1273                           !     sstfiles                GHRSST input observation file name
1274   !                       ! sstfbfiles: Feedback SST input observation file name
1275   sstfbfiles = 'sst_01.nc'
1276                           !     seaicefiles             Sea Ice input observation file names
1277   seaicefiles = 'seaice_01.nc' 
1278                           !     velavcurfiles           Vel. cur. daily av. input file name
1279                           !     velhvcurfiles           Vel. cur. high freq. input file name
1280                           !     velavadcpfiles          Vel. ADCP daily av. input file name
1281                           !     velhvadcpfiles          Vel. ADCP high freq. input file name
1282                           !     velfbfiles              Vel. feedback input observation file name
1283                           !     dobsini                 Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS
1284                           !     dobsend                 Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS
1285                           !     n1dint                  Type of vertical interpolation method
1286                           !     n2dint                  Type of horizontal interpolation method
1287                           !     ln_nea                  Rejection of observations near land switch
1288   nmsshc     = 0          ! MSSH correction scheme
1289                           !     mdtcorr                 MDT  correction
1290                           !     mdtcutoff               MDT cutoff for computed correction
1291   ln_altbias = .false.    ! Logical switch for alt bias
1292   ln_ignmis  = .true.     ! Logical switch for ignoring missing files
1293                           !     endailyavtypes   ENACT daily average types
1294   ln_grid_global = .true.
1295   ln_grid_search_lookup = .false.
1296/
1297!-----------------------------------------------------------------------
1298&nam_asminc   !   assimilation increments                               ('key_asminc')
1299!-----------------------------------------------------------------------
1300    ln_bkgwri = .false.    !  Logical switch for writing out background state
1301    ln_trainc = .false.    !  Logical switch for applying tracer increments
1302    ln_dyninc = .false.    !  Logical switch for applying velocity increments
1303    ln_sshinc = .false.    !  Logical switch for applying SSH increments
1304    ln_asmdin = .false.    !  Logical switch for Direct Initialization (DI)
1305    ln_asmiau = .false.    !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU)
1306    nitbkg    = 0          !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1]
1307    nitdin    = 0          !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1]
1308    nitiaustr = 1          !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1]
1309    nitiaufin = 15         !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1]
1310    niaufn    = 0          !  Type of IAU weighting function
1311    ln_salfix = .false.    !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin
1312    salfixmin = -9999      !  Minimum salinity after applying the increments
1313    nn_divdmp = 0          !  Number of iterations of divergence damping operator
1314/
1315!-----------------------------------------------------------------------
1316&namsbc_wave   ! External fields from wave model
1317!-----------------------------------------------------------------------
1318!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable     ! time interp. !  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
1319!              !             !  (if <0  months)  !   name       !   (logical)  !  (T/F)  ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
1320   sn_cdg      =  'cdg_wave' ,        1          , 'drag_coeff' ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , ''
1321   sn_usd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'u_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , ''
1322   sn_vsd      =  'sdw_wave' ,        1          , 'v_sd2d'     ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , ''
1323   sn_wn       =  'sdw_wave' ,        1          , 'wave_num'   ,     .true.   , .false. , 'daily'   ,  ''      , ''       , ''
1324!
1325   cn_dir_cdg  = './'  !  root directory for the location of drag coefficient files
1326/
1327!-----------------------------------------------------------------------
1328&namdyn_nept  !   Neptune effect (simplified: lateral and vertical diffusions removed)
1329!-----------------------------------------------------------------------
1330   ! Suggested lengthscale values are those of Eby & Holloway (1994) for a coarse model
1331   ln_neptsimp       = .false.  ! yes/no use simplified neptune
1332
1333   ln_smooth_neptvel = .false.  ! yes/no smooth zunep, zvnep
1334   rn_tslse          =  1.2e4   ! value of lengthscale L at the equator
1335   rn_tslsp          =  3.0e3   ! value of lengthscale L at the pole
1336   ! Specify whether to ramp down the Neptune velocity in shallow
1337   ! water, and if so the depth range controlling such ramping down
1338   ln_neptramp       = .true.   ! ramp down Neptune velocity in shallow water
1339   rn_htrmin         =  100.0   ! min. depth of transition range
1340   rn_htrmax         =  200.0   ! max. depth of transition range
1341/
1342!-----------------------------------------------------------------------
1343&namsto       ! Stochastic parametrization of EOS
1344!-----------------------------------------------------------------------
1345   ln_rststo = .false.           ! start from mean parameter (F) or from restart file (T)
1346   ln_rstseed = .true.           ! read seed of RNG from restart file
1347   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input)
1348   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output)
1349
1350   ln_sto_eos = .false.          ! stochastic equation of state
1351   nn_sto_eos = 1                ! number of independent random walks
1352   rn_eos_stdxy = 1.4            ! random walk horz. standard deviation (in grid points)
1353   rn_eos_stdz  = 0.7            ! random walk vert. standard deviation (in grid points)
1354   rn_eos_tcor  = 1440.0         ! random walk time correlation (in timesteps)
1355   nn_eos_ord  = 1               ! order of autoregressive processes
1356   nn_eos_flt  = 0               ! passes of Laplacian filter
1357   rn_eos_lim  = 2.0             ! limitation factor (default = 3.0)
1358/