2020WP/ENHANCE-10_acc_fix_traqsr: traqsr_lomem_v2.F90

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Line 
1MODULE traqsr
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE  traqsr  ***
4   !! Ocean physics:   solar radiation penetration in the top ocean levels
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  !  1990-10  (B. Blanke)  Original code
7   !!            7.0  !  1991-11  (G. Madec)
8   !!                 !  1996-01  (G. Madec)  s-coordinates
9   !!   NEMO     1.0  !  2002-06  (G. Madec)  F90: Free form and module
10   !!             -   !  2005-11  (G. Madec) zco, zps, sco coordinate
11   !!            3.2  !  2009-04  (G. Madec & NEMO team)
12   !!            3.6  !  2012-05  (C. Rousset) store attenuation coef for use in ice model
13   !!            3.6  !  2015-12  (O. Aumont, J. Jouanno, C. Ethe) use vertical profile of chlorophyll
14   !!            3.7  !  2015-11  (G. Madec, A. Coward)  remove optimisation for fix volume
15   !!----------------------------------------------------------------------
16
17   !!----------------------------------------------------------------------
18   !!   tra_qsr       : temperature trend due to the penetration of solar radiation
19   !!   tra_qsr_init  : initialization of the qsr penetration
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   USE oce            ! ocean dynamics and active tracers
22   USE phycst         ! physical constants
23   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
24   USE sbc_oce        ! surface boundary condition: ocean
25   USE trc_oce        ! share SMS/Ocean variables
26   USE trd_oce        ! trends: ocean variables
27   USE trdtra         ! trends manager: tracers
28   !
29   USE in_out_manager ! I/O manager
30   USE prtctl         ! Print control
31   USE iom            ! I/O library
32   USE fldread        ! read input fields
33   USE restart        ! ocean restart
34   USE lib_mpp        ! MPP library
35   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
36   USE timing         ! Timing
37
38   IMPLICIT NONE
39   PRIVATE
40
41   PUBLIC   tra_qsr       ! routine called by step.F90 (ln_traqsr=T)
42   PUBLIC   tra_qsr_init  ! routine called by nemogcm.F90
43
44   !                                 !!* Namelist namtra_qsr: penetrative solar radiation
45   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_traqsr    !: light absorption (qsr) flag
46   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_qsr_rgb   !: Red-Green-Blue light absorption flag 
47   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_qsr_2bd   !: 2 band         light absorption flag
48   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_qsr_bio   !: bio-model      light absorption flag
49   INTEGER , PUBLIC ::   nn_chldta    !: use Chlorophyll data (=1) or not (=0)
50   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_abs       !: fraction absorbed in the very near surface (RGB & 2 bands)
51   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_si0       !: very near surface depth of extinction      (RGB & 2 bands)
52   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_si1       !: deepest depth of extinction (water type I)       (2 bands)
53   !
54   INTEGER , PUBLIC ::   nksr         !: levels below which the light cannot penetrate (depth larger than 391 m)
55 
56   INTEGER, PARAMETER ::   np_RGB  = 1   ! R-G-B     light penetration with constant Chlorophyll
57   INTEGER, PARAMETER ::   np_RGBc = 2   ! R-G-B     light penetration with Chlorophyll data
58   INTEGER, PARAMETER ::   np_2BD  = 3   ! 2 bands   light penetration
59   INTEGER, PARAMETER ::   np_BIO  = 4   ! bio-model light penetration
60   !
61   INTEGER  ::   nqsr    ! user choice of the type of light penetration
62   REAL(wp) ::   xsi0r   ! inverse of rn_si0
63   REAL(wp) ::   xsi1r   ! inverse of rn_si1
64   !
65   REAL(wp) , DIMENSION(3,61)           ::   rkrgb    ! tabulated attenuation coefficients for RGB absorption
66   TYPE(FLD), ALLOCATABLE, DIMENSION(:) ::   sf_chl   ! structure of input Chl (file informations, fields read)
67
68   !! * Substitutions
69#  include "do_loop_substitute.h90"
70   !!----------------------------------------------------------------------
71   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
72   !! $Id: traqsr.F90 12489 2020-02-28 15:55:11Z davestorkey $
73   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
74   !!----------------------------------------------------------------------
75CONTAINS
76
77   SUBROUTINE tra_qsr( kt, Kmm, pts, Krhs )
78      !!----------------------------------------------------------------------
79      !!                  ***  ROUTINE tra_qsr  ***
80      !!
81      !! ** Purpose :   Compute the temperature trend due to the solar radiation
82      !!              penetration and add it to the general temperature trend.
83      !!
84      !! ** Method  : The profile of the solar radiation within the ocean is defined
85      !!      through 2 wavebands (rn_si0,rn_si1) or 3 wavebands (RGB) and a ratio rn_abs
86      !!      Considering the 2 wavebands case:
87      !!         I(k) = Qsr*( rn_abs*EXP(z(k)/rn_si0) + (1.-rn_abs)*EXP(z(k)/rn_si1) )
88      !!         The temperature trend associated with the solar radiation penetration
89      !!         is given by : zta = 1/e3t dk[ I ] / (rho0*Cp)
90      !!         At the bottom, boudary condition for the radiation is no flux :
91      !!      all heat which has not been absorbed in the above levels is put
92      !!      in the last ocean level.
93      !!         The computation is only done down to the level where
94      !!      I(k) < 1.e-15 W/m2 (i.e. over the top nksr levels) .
95      !!
96      !! ** Action  : - update ta with the penetrative solar radiation trend
97      !!              - send  trend for further diagnostics (l_trdtra=T)
98      !!
99      !! Reference  : Jerlov, N. G., 1968 Optical Oceanography, Elsevier, 194pp.
100      !!              Lengaigne et al. 2007, Clim. Dyn., V28, 5, 503-516.
101      !!              Morel, A. et Berthon, JF, 1989, Limnol Oceanogr 34(8), 1545-1562
102      !!----------------------------------------------------------------------
103      INTEGER,                                   INTENT(in   ) :: kt            ! ocean time-step
104      INTEGER,                                   INTENT(in   ) :: Kmm, Krhs     ! time level indices
105      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts,jpt), INTENT(inout) :: pts           ! active tracers and RHS of tracer equation
106      !
107      INTEGER  ::   ji, jj, jk               ! dummy loop indices
108      INTEGER  ::   irgb                     ! local integers
109      REAL(wp) ::   zchl, zcoef, z1_2        ! local scalars
110      REAL(wp) ::   zc0 , zc1 , zc2 , zc3    !    -         -
111      REAL(wp) ::   zzc0, zzc1, zzc2, zzc3   !    -         -
112      REAL(wp) ::   zz0 , zz1 , ze3t, zlui   !    -         -
113      REAL(wp) ::   zCb, zCmax, zze, zpsi, zpsimax, zdelpsi, zCtot, zCze
114      REAL(wp) ::   zlogc, zlogze, zlogCtot, zlogCze
115      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)   :: ze0, ze1, ze2, ze3
116      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:) :: ztrdt, zetot, ztmp3d
117      !!----------------------------------------------------------------------
118      !
119      IF( ln_timing )   CALL timing_start('tra_qsr')
120      !
121      IF( kt == nit000 ) THEN
122         IF(lwp) WRITE(numout,*)
123         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'tra_qsr : penetration of the surface solar radiation'
124         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
125      ENDIF
126      !
127      IF( l_trdtra ) THEN      ! trends diagnostic: save the input temperature trend
128         ALLOCATE( ztrdt(jpi,jpj,jpk) ) 
129         ztrdt(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_tem,Krhs)
130      ENDIF
131      !
132      !                         !-----------------------------------!
133      !                         !  before qsr induced heat content  !
134      !                         !-----------------------------------!
135      IF( kt == nit000 ) THEN          !==  1st time step  ==!
136         IF( ln_rstart .AND. iom_varid( numror, 'qsr_hc_b', ldstop = .FALSE. ) > 0  .AND. .NOT.l_1st_euler ) THEN    ! read in restart
137            IF(lwp) WRITE(numout,*) '          nit000-1 qsr tracer content forcing field read in the restart file'
138            z1_2 = 0.5_wp
139            CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'qsr_hc_b', qsr_hc_b, ldxios = lrxios )   ! before heat content trend due to Qsr flux
140         ELSE                                           ! No restart or restart not found: Euler forward time stepping
141            z1_2 = 1._wp
142            qsr_hc_b(:,:,:) = 0._wp
143         ENDIF
144      ELSE                             !==  Swap of qsr heat content  ==!
145         z1_2 = 0.5_wp
146         qsr_hc_b(:,:,:) = qsr_hc(:,:,:)
147      ENDIF
148      !
149      !                         !--------------------------------!
150      SELECT CASE( nqsr )       !  now qsr induced heat content  !
151      !                         !--------------------------------!
152      !
153      CASE( np_BIO )                   !==  bio-model fluxes  ==!
154         !
155         DO jk = 1, nksr
156            qsr_hc(:,:,jk) = r1_rho0_rcp * ( etot3(:,:,jk) - etot3(:,:,jk+1) )
157         END DO
158         !
159      CASE( np_RGB , np_RGBc )         !==  R-G-B fluxes  ==!
160         !
161         ALLOCATE( ze0 (jpi,jpj)           , ze1 (jpi,jpj) ,   &
162            &      ze2 (jpi,jpj)           , ze3 (jpi,jpj) ,   &
163            &      ztmp3d(jpi,jpj,nksr + 1)                     )
164         !
165         IF( nqsr == np_RGBc ) THEN          !*  Variable Chlorophyll
166            CALL fld_read( kt, 1, sf_chl )         ! Read Chl data and provides it at the current time step
167            ! Separation in R-G-B depending of the surface Chl
168            ze0(:,:) = MIN( 10. , MAX( 0.03, sf_chl(1)%fnow(:,:,1) ) )
169            DO_3D_00_00 ( 1, nksr + 1 )
170               ! zchl    = ze0(ji,jj)
171               zlogc   = LOG( ze0(ji,jj) )
172               zlogCze = 0.113328685307 + 0.803 * zlogc   ! log(zCze  = 1.12  * zchl**0.803)
173               zlogCtot= 3.703768066608 + 0.459 * zlogc   ! log(zCtot = 40.6  * zchl**0.459)
174               !
175               zCb     = 0.768 + zlogc * ( 0.087 - zlogc * ( 0.179 + zlogc * 0.025 ) )
176               zCmax   = 0.299 - zlogc * ( 0.289 - zlogc * 0.579 )
177               zpsimax = 0.6   - zlogc * ( 0.640 - zlogc * ( 0.021 + zlogc * 0.115 ) )
178               zdelpsi = 0.710 + zlogc * ( 0.159 + zlogc * 0.021 )
179               !
180               zlogze  = 6.34247346942 - 0.746 * zlogCtot ! log(zze = 568.2 * zCtot**(-0.746))
181               IF( zlogze > 4.62497281328 ) zlogze = 5.298317366548 - 0.293 * zlogCtot
182                                                          ! log(IF( zze > 102. ) zze = 200.0 * zCtot**(-0.293))
183               zze  = EXP( zlogze ) 
184               zpsi = gdepw(ji,jj,jk,Kmm) / zze
185               zCze = EXP( zlogCze )
186               !
187               ! NB. make sure zchl value is such that: zchl = MIN( 10. , MAX( 0.03, zchl ) )
188               zchl = MIN( 10. , MAX( 0.03, zCze * ( zCb + zCmax * EXP( -( (zpsi - zpsimax) / zdelpsi )**2 ) ) ) )
189               ! Convert chlorophyll value to attenuation coefficient look-up table index
190               ztmp3d(ji,jj,jk) = 41 + 20.*LOG10(zchl) + 1.e-15
191            END_3D
192         ELSE                                !* constant chlorophyll
193            zchl = 0.05
194            ! NB. make sure constant value is such that:
195            zchl = MIN( 10. , MAX( 0.03, zchl ) )
196            ! Convert chlorophyll value to attenuation coefficient look-up table index
197            zlui = 41 + 20.*LOG10(zchl) + 1.e-15
198            DO jk = 1, nksr + 1
199               ztmp3d(:,:,jk) = zlui 
200            END DO
201         ENDIF
202         !
203         zcoef  = ( 1. - rn_abs ) / 3._wp    !* surface equi-partition in R-G-B
204         DO_2D_00_00
205            ze0(ji,jj) = rn_abs * qsr(ji,jj)
206            ze1(ji,jj) = zcoef  * qsr(ji,jj)
207            ze2(ji,jj) = zcoef  * qsr(ji,jj)
208            ze3(ji,jj) = zcoef  * qsr(ji,jj)
209            ! store the surface SW radiation; re-use the surface ztmp3d array
210            ! since the surface attenuation coefficient is not used
211            ztmp3d(ji,jj,1) =       qsr(ji,jj)
212         END_2D
213         !
214         !* interior equi-partition in R-G-B depending on vertical profile of Chl
215         DO_3D_00_00 ( 2, nksr + 1 )
216            ze3t = e3t(ji,jj,jk-1,Kmm)
217            irgb = NINT( ztmp3d(ji,jj,jk) )
218            zc0 = ze0(ji,jj) * EXP( - ze3t * xsi0r )
219            zc1 = ze1(ji,jj) * EXP( - ze3t * rkrgb(1,irgb) )
220            zc2 = ze2(ji,jj) * EXP( - ze3t * rkrgb(2,irgb) )
221            zc3 = ze3(ji,jj) * EXP( - ze3t * rkrgb(3,irgb) )
222            ze0(ji,jj) = zc0
223            ze1(ji,jj) = zc1
224            ze2(ji,jj) = zc2
225            ze3(ji,jj) = zc3
226            ztmp3d(ji,jj,jk) = ( zc0 + zc1 + zc2 + zc3 ) * wmask(ji,jj,jk)
227         END_3D
228         !
229         DO_3D_00_00( 1, nksr )
230            qsr_hc(ji,jj,jk) = r1_rho0_rcp * ( ztmp3d(ji,jj,jk) - ztmp3d(ji,jj,jk+1) )
231         END_3D
232         !
233         DEALLOCATE( ze0 , ze1 , ze2 , ze3 , ztmp3d ) 
234         !
235      CASE( np_2BD  )            !==  2-bands fluxes  ==!
236         !
237         zz0 =        rn_abs   * r1_rho0_rcp      ! surface equi-partition in 2-bands
238         zz1 = ( 1. - rn_abs ) * r1_rho0_rcp
239         DO_3D_00_00( 1, nksr )
240            zc0 = zz0 * EXP( -gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm)*xsi0r ) + zz1 * EXP( -gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm)*xsi1r )
241            zc1 = zz0 * EXP( -gdepw(ji,jj,jk+1,Kmm)*xsi0r ) + zz1 * EXP( -gdepw(ji,jj,jk+1,Kmm)*xsi1r )
242            qsr_hc(ji,jj,jk) = qsr(ji,jj) * ( zc0 * wmask(ji,jj,jk) - zc1 * wmask(ji,jj,jk+1) ) 
243         END_3D
244         !
245      END SELECT
246      !
247      !                          !-----------------------------!
248      DO_3D_00_00( 1, nksr )
249         pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs)   &
250            &                      + z1_2 * ( qsr_hc_b(ji,jj,jk) + qsr_hc(ji,jj,jk) ) / e3t(ji,jj,jk,Kmm)
251      END_3D
252      !
253      ! sea-ice: store the 1st ocean level attenuation coefficient
254      DO_2D_00_00
255         IF( qsr(ji,jj) /= 0._wp ) THEN   ;   fraqsr_1lev(ji,jj) = qsr_hc(ji,jj,1) / ( r1_rho0_rcp * qsr(ji,jj) )
256         ELSE                             ;   fraqsr_1lev(ji,jj) = 1._wp
257         ENDIF
258      END_2D
259      CALL lbc_lnk( 'traqsr', fraqsr_1lev(:,:), 'T', 1._wp )
260      !
261      IF( iom_use('qsr3d') ) THEN      ! output the shortwave Radiation distribution
262         ALLOCATE( zetot(jpi,jpj,jpk) )
263         zetot(:,:,nksr+1:jpk) = 0._wp     ! below ~400m set to zero
264         DO jk = nksr, 1, -1
265            zetot(:,:,jk) = zetot(:,:,jk+1) + qsr_hc(:,:,jk) * rho0_rcp
266         END DO         
267         CALL iom_put( 'qsr3d', zetot )   ! 3D distribution of shortwave Radiation
268         DEALLOCATE( zetot ) 
269      ENDIF
270      !
271      IF( lrst_oce ) THEN     ! write in the ocean restart file
272         IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          )
273         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'qsr_hc_b'   , qsr_hc     , ldxios = lwxios )
274         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'fraqsr_1lev', fraqsr_1lev, ldxios = lwxios ) 
275         IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          )
276      ENDIF
277      !
278      IF( l_trdtra ) THEN     ! qsr tracers trends saved for diagnostics
279         ztrdt(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_tem,Krhs) - ztrdt(:,:,:)
280         CALL trd_tra( kt, Kmm, Krhs, 'TRA', jp_tem, jptra_qsr, ztrdt )
281         DEALLOCATE( ztrdt ) 
282      ENDIF
283      !                       ! print mean trends (used for debugging)
284      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Krhs), clinfo1=' qsr  - Ta: ', mask1=tmask, clinfo3='tra-ta' )
285      !
286      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('tra_qsr')
287      !
288   END SUBROUTINE tra_qsr
289
290
291   SUBROUTINE tra_qsr_init
292      !!----------------------------------------------------------------------
293      !!                  ***  ROUTINE tra_qsr_init  ***
294      !!
295      !! ** Purpose :   Initialization for the penetrative solar radiation
296      !!
297      !! ** Method  :   The profile of solar radiation within the ocean is set
298      !!      from two length scale of penetration (rn_si0,rn_si1) and a ratio
299      !!      (rn_abs). These parameters are read in the namtra_qsr namelist. The
300      !!      default values correspond to clear water (type I in Jerlov'
301      !!      (1968) classification.
302      !!         called by tra_qsr at the first timestep (nit000)
303      !!
304      !! ** Action  : - initialize rn_si0, rn_si1 and rn_abs
305      !!
306      !! Reference : Jerlov, N. G., 1968 Optical Oceanography, Elsevier, 194pp.
307      !!----------------------------------------------------------------------
308      INTEGER  ::   ji, jj, jk                  ! dummy loop indices
309      INTEGER  ::   ios, irgb, ierror, ioptio   ! local integer
310      REAL(wp) ::   zz0, zc0 , zc1, zcoef      ! local scalars
311      REAL(wp) ::   zz1, zc2 , zc3, zchl       !   -      -
312      !
313      CHARACTER(len=100) ::   cn_dir   ! Root directory for location of ssr files
314      TYPE(FLD_N)        ::   sn_chl   ! informations about the chlorofyl field to be read
315      !!
316      NAMELIST/namtra_qsr/  sn_chl, cn_dir, ln_qsr_rgb, ln_qsr_2bd, ln_qsr_bio,  &
317         &                  nn_chldta, rn_abs, rn_si0, rn_si1
318      !!----------------------------------------------------------------------
319      !
320      READ  ( numnam_ref, namtra_qsr, IOSTAT = ios, ERR = 901)
321901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtra_qsr in reference namelist' )
322      !
323      READ  ( numnam_cfg, namtra_qsr, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
324902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtra_qsr in configuration namelist' )
325      IF(lwm) WRITE ( numond, namtra_qsr )
326      !
327      IF(lwp) THEN                ! control print
328         WRITE(numout,*)
329         WRITE(numout,*) 'tra_qsr_init : penetration of the surface solar radiation'
330         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~'
331         WRITE(numout,*) '   Namelist namtra_qsr : set the parameter of penetration'
332         WRITE(numout,*) '      RGB (Red-Green-Blue) light penetration       ln_qsr_rgb = ', ln_qsr_rgb
333         WRITE(numout,*) '      2 band               light penetration       ln_qsr_2bd = ', ln_qsr_2bd
334         WRITE(numout,*) '      bio-model            light penetration       ln_qsr_bio = ', ln_qsr_bio
335         WRITE(numout,*) '      RGB : Chl data (=1) or cst value (=0)        nn_chldta  = ', nn_chldta
336         WRITE(numout,*) '      RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1)    rn_abs     = ', rn_abs
337         WRITE(numout,*) '      RGB & 2 bands: shortess depth of extinction  rn_si0     = ', rn_si0
338         WRITE(numout,*) '      2 bands: longest depth of extinction         rn_si1     = ', rn_si1
339         WRITE(numout,*)
340      ENDIF
341      !
342      ioptio = 0                    ! Parameter control
343      IF( ln_qsr_rgb  )   ioptio = ioptio + 1
344      IF( ln_qsr_2bd  )   ioptio = ioptio + 1
345      IF( ln_qsr_bio  )   ioptio = ioptio + 1
346      !
347      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'Choose ONE type of light penetration in namelist namtra_qsr',  &
348         &                               ' 2 bands, 3 RGB bands or bio-model light penetration' )
349      !
350      IF( ln_qsr_rgb .AND. nn_chldta == 0 )   nqsr = np_RGB 
351      IF( ln_qsr_rgb .AND. nn_chldta == 1 )   nqsr = np_RGBc
352      IF( ln_qsr_2bd                      )   nqsr = np_2BD
353      IF( ln_qsr_bio                      )   nqsr = np_BIO
354      !
355      !                             ! Initialisation
356      xsi0r = 1._wp / rn_si0
357      xsi1r = 1._wp / rn_si1
358      !
359      SELECT CASE( nqsr )
360      !                               
361      CASE( np_RGB , np_RGBc )         !==  Red-Green-Blue light penetration  ==!
362         !                             
363         IF(lwp)   WRITE(numout,*) '   ==>>>   R-G-B   light penetration '
364         !
365         CALL trc_oce_rgb( rkrgb )                 ! tabulated attenuation coef.
366         !                                   
367         nksr = trc_oce_ext_lev( r_si2, 33._wp )   ! level of light extinction
368         !
369         IF(lwp) WRITE(numout,*) '        level of light extinction = ', nksr, ' ref depth = ', gdepw_1d(nksr+1), ' m'
370         !
371         IF( nqsr == np_RGBc ) THEN                ! Chl data : set sf_chl structure
372            IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   Chlorophyll read in a file'
373            ALLOCATE( sf_chl(1), STAT=ierror )
374            IF( ierror > 0 ) THEN
375               CALL ctl_stop( 'tra_qsr_init: unable to allocate sf_chl structure' )   ;   RETURN
376            ENDIF
377            ALLOCATE( sf_chl(1)%fnow(jpi,jpj,1)   )
378            IF( sn_chl%ln_tint )   ALLOCATE( sf_chl(1)%fdta(jpi,jpj,1,2) )
379            !                                        ! fill sf_chl with sn_chl and control print
380            CALL fld_fill( sf_chl, (/ sn_chl /), cn_dir, 'tra_qsr_init',   &
381               &           'Solar penetration function of read chlorophyll', 'namtra_qsr' , no_print )
382         ENDIF
383         IF( nqsr == np_RGB ) THEN                 ! constant Chl
384            IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   Constant Chlorophyll concentration = 0.05'
385         ENDIF
386         !
387      CASE( np_2BD )                   !==  2 bands light penetration  ==!
388         !
389         IF(lwp)  WRITE(numout,*) '   ==>>>   2 bands light penetration'
390         !
391         nksr = trc_oce_ext_lev( rn_si1, 100._wp )    ! level of light extinction
392         IF(lwp) WRITE(numout,*) '        level of light extinction = ', nksr, ' ref depth = ', gdepw_1d(nksr+1), ' m'
393         !
394      CASE( np_BIO )                   !==  BIO light penetration  ==!
395         !
396         IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   bio-model light penetration'
397         IF( .NOT.lk_top )   CALL ctl_stop( 'No bio model : ln_qsr_bio = true impossible ' )
398         !
399      END SELECT
400      !
401      qsr_hc(:,:,:) = 0._wp     ! now qsr heat content set to zero where it will not be computed
402      !
403      ! 1st ocean level attenuation coefficient (used in sbcssm)
404      IF( iom_varid( numror, 'fraqsr_1lev', ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
405         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'fraqsr_1lev'  , fraqsr_1lev, ldxios = lrxios  )
406      ELSE
407         fraqsr_1lev(:,:) = 1._wp   ! default : no penetration
408      ENDIF
409      !
410      IF( lwxios ) THEN
411         CALL iom_set_rstw_var_active('qsr_hc_b')
412         CALL iom_set_rstw_var_active('fraqsr_1lev')
413      ENDIF
414      !
415   END SUBROUTINE tra_qsr_init
416
417   !!======================================================================
418END MODULE traqsr