New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
restart.F90 in NEMO/branches/2019/ENHANCE-02_ISF_nemo/src/OCE/IOM – NEMO

source: NEMO/branches/2019/ENHANCE-02_ISF_nemo/src/OCE/IOM/restart.F90 @ 11523

Last change on this file since 11523 was 11523, checked in by mathiot, 5 years ago

ENHANCE-02_ISF: rm debug print + simplification + rm remaining old namelist parameter (ticket #2142))
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 14.7 KB
Line 
1MODULE restart
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  restart  ***
4   !! Ocean restart :  write the ocean restart file
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  !  1999-11  (M. Imbard)  Original code
7   !!   NEMO     1.0  !  2002-08  (G. Madec)  F90: Free form
8   !!            2.0  !  2006-07  (S. Masson)  use IOM for restart
9   !!            3.3  !  2010-04  (M. Leclair, G. Madec)  modified LF-RA
10   !!            - -  !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) TRC-TRA merge (T-S in 4D)
11   !!            3.7  !  2014-01  (G. Madec) suppression of curl and hdiv from the restart
12   !!             -   !  2014-12  (G. Madec) remove KPP scheme
13   !!----------------------------------------------------------------------
14
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   !!   rst_opn    : open the ocean restart file
17   !!   rst_write  : write the ocean restart file
18   !!   rst_read   : read the ocean restart file
19   !!----------------------------------------------------------------------
20   USE oce             ! ocean dynamics and tracers
21   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
22   USE sbc_ice         ! only lk_si3
23   USE phycst          ! physical constants
24   USE eosbn2          ! equation of state            (eos bn2 routine)
25   USE trdmxl_oce      ! ocean active mixed layer tracers trends variables
26   !
27   USE in_out_manager  ! I/O manager
28   USE iom             ! I/O module
29   USE diurnal_bulk
30   USE lib_mpp         ! distribued memory computing library
31
32   IMPLICIT NONE
33   PRIVATE
34
35   PUBLIC   rst_opn         ! routine called by step module
36   PUBLIC   rst_write       ! routine called by step module
37   PUBLIC   rst_read        ! routine called by istate module
38   PUBLIC   rst_read_open   ! routine called in rst_read and (possibly) in dom_vvl_init
39
40   !! * Substitutions
41#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
42   !!----------------------------------------------------------------------
43   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
44   !! $Id$
45   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
46   !!----------------------------------------------------------------------
47CONTAINS
48
49   SUBROUTINE rst_opn( kt )
50      !!---------------------------------------------------------------------
51      !!                   ***  ROUTINE rst_opn  ***
52      !!                     
53      !! ** Purpose : + initialization (should be read in the namelist) of nitrst
54      !!              + open the restart when we are one time step before nitrst
55      !!                   - restart header is defined when kt = nitrst-1
56      !!                   - restart data  are written when kt = nitrst
57      !!              + define lrst_oce to .TRUE. when we need to define or write the restart
58      !!----------------------------------------------------------------------
59      INTEGER, INTENT(in) ::   kt     ! ocean time-step
60      !!
61      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character
62      CHARACTER(LEN=50)   ::   clname   ! ocean output restart file name
63      CHARACTER(lc)       ::   clpath   ! full path to ocean output restart file
64      CHARACTER(LEN=52)   ::   clpname   ! ocean output restart file name including prefix for AGRIF
65      CHARACTER(LEN=256)  ::   clinfo    ! info character
66      !!----------------------------------------------------------------------
67      !
68      IF( kt == nit000 ) THEN   ! default definitions
69         lrst_oce = .FALSE.   
70         IF( ln_rst_list ) THEN
71            nrst_lst = 1
72            nitrst = nstocklist( nrst_lst )
73         ELSE
74            nitrst = nitend
75         ENDIF
76      ENDIF
77
78      ! frequency-based restart dumping (nn_stock)
79      IF( .NOT. ln_rst_list .AND. MOD( kt - 1, nstock ) == 0 ) THEN   
80         ! we use kt - 1 and not kt - nit000 to keep the same periodicity from the beginning of the experiment
81         nitrst = kt + nstock - 1                  ! define the next value of nitrst for restart writing
82         IF( nitrst > nitend )   nitrst = nitend   ! make sure we write a restart at the end of the run
83      ENDIF
84      ! to get better performances with NetCDF format:
85      ! we open and define the ocean restart file one time step before writing the data (-> at nitrst - 1)
86      ! except if we write ocean restart files every time step or if an ocean restart file was writen at nitend - 1
87      IF( kt == nitrst - 1 .OR. nstock == 1 .OR. ( kt == nitend .AND. .NOT. lrst_oce ) ) THEN
88         IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN 
89            ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...)
90            IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrst
91            ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrst
92            ENDIF
93            ! create the file
94            clname = TRIM(cexper)//"_"//TRIM(ADJUSTL(clkt))//"_"//TRIM(cn_ocerst_out)
95            clpath = TRIM(cn_ocerst_outdir)
96            IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/'
97            IF(lwp) THEN
98               WRITE(numout,*)
99               IF(.NOT.lwxios) THEN
100                  WRITE(numout,*) '             open ocean restart NetCDF file: ',TRIM(clpath)//TRIM(clname)
101                  IF ( snc4set%luse )      WRITE(numout,*) '             opened for NetCDF4 chunking and compression'
102                  IF( kt == nitrst - 1 ) THEN   ;   WRITE(numout,*) '             kt = nitrst - 1 = ', kt
103                  ELSE                          ;   WRITE(numout,*) '             kt = '             , kt
104                  ENDIF
105               ENDIF
106            ENDIF
107            !
108            IF(.NOT.lwxios) THEN
109               CALL iom_open( TRIM(clpath)//TRIM(clname), numrow, ldwrt = .TRUE. )
110            ELSE
111#if defined key_iomput
112               cwxios_context = "rstw_"//TRIM(ADJUSTL(clkt))
113               IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
114                  clpname = clname
115               ELSE
116                  clpname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//clname   
117               ENDIF
118               CALL iom_init( cwxios_context, TRIM(clpath)//TRIM(clpname), .false. )
119               CALL xios_update_calendar(nitrst)
120               CALL iom_swap(      cxios_context          )
121#else
122               clinfo = 'Can not use XIOS in rst_opn'
123               CALL ctl_stop(TRIM(clinfo))
124#endif
125            ENDIF
126            lrst_oce = .TRUE.
127         ENDIF
128      ENDIF
129      !
130   END SUBROUTINE rst_opn
131
132
133   SUBROUTINE rst_write( kt )
134      !!---------------------------------------------------------------------
135      !!                   ***  ROUTINE rstwrite  ***
136      !!                     
137      !! ** Purpose :   Write restart fields in NetCDF format
138      !!
139      !! ** Method  :   Write in numrow when kt == nitrst in NetCDF
140      !!              file, save fields which are necessary for restart
141      !!----------------------------------------------------------------------
142      INTEGER, INTENT(in) ::   kt   ! ocean time-step
143      !!----------------------------------------------------------------------
144                     IF(lwxios) CALL iom_swap(      cwxios_context          )
145                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'rdt'    , rdt       , ldxios = lwxios)   ! dynamics time step
146                     CALL iom_delay_rst( 'WRITE', 'OCE', numrow )   ! save only ocean delayed global communication variables
147
148      IF ( .NOT. ln_diurnal_only ) THEN
149                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub'     , ub, ldxios = lwxios        )     ! before fields
150                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb'     , vb, ldxios = lwxios        )
151                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tb'     , tsb(:,:,:,jp_tem), ldxios = lwxios )
152                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sb'     , tsb(:,:,:,jp_sal), ldxios = lwxios )
153                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshb'   , sshb, ldxios = lwxios      )
154                     !
155                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'un'     , un, ldxios = lwxios        )     ! now fields
156                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vn'     , vn, ldxios = lwxios        )
157                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tn'     , tsn(:,:,:,jp_tem), ldxios = lwxios )
158                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sn'     , tsn(:,:,:,jp_sal), ldxios = lwxios )
159                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshn'   , sshn, ldxios = lwxios      )
160                     CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'rhop'   , rhop, ldxios = lwxios      )
161      ENDIF
162     
163      IF (ln_diurnal) CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'Dsst', x_dsst, ldxios = lwxios ) 
164      IF(lwxios) CALL iom_swap(      cxios_context          )
165      IF( kt == nitrst ) THEN
166         IF(.NOT.lwxios) THEN
167            CALL iom_close( numrow )     ! close the restart file (only at last time step)
168         ELSE
169            CALL iom_context_finalize(      cwxios_context          )
170         ENDIF
171!!gm         IF( .NOT. lk_trdmld )   lrst_oce = .FALSE.
172!!gm  not sure what to do here   ===>>>  ask to Sebastian
173         lrst_oce = .FALSE.
174            IF( ln_rst_list ) THEN
175               nrst_lst = MIN(nrst_lst + 1, SIZE(nstocklist,1))
176               nitrst = nstocklist( nrst_lst )
177            ENDIF
178      ENDIF
179      !
180   END SUBROUTINE rst_write
181
182
183   SUBROUTINE rst_read_open
184      !!----------------------------------------------------------------------
185      !!                   ***  ROUTINE rst_read_open  ***
186      !!
187      !! ** Purpose :   Open read files for NetCDF restart
188      !!
189      !! ** Method  :   Use a non-zero, positive value of numror to assess whether or not
190      !!                the file has already been opened
191      !!----------------------------------------------------------------------
192      LOGICAL        ::   llok
193      CHARACTER(lc)  ::   clpath   ! full path to ocean output restart file
194      !!----------------------------------------------------------------------
195      !
196      IF( numror <= 0 ) THEN
197         IF(lwp) THEN                                             ! Contol prints
198            WRITE(numout,*)
199            WRITE(numout,*) 'rst_read : read oce NetCDF restart file'
200            IF ( snc4set%luse )      WRITE(numout,*) 'rst_read : configured with NetCDF4 support'
201            WRITE(numout,*) '~~~~~~~~'
202         ENDIF
203         lxios_sini = .FALSE.
204         clpath = TRIM(cn_ocerst_indir)
205         IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/'
206         CALL iom_open( TRIM(clpath)//cn_ocerst_in, numror )
207! are we using XIOS to read the data? Part above will have to modified once XIOS
208! can handle checking if variable is in the restart file (there will be no need to open
209! restart)
210         IF(.NOT.lxios_set) lrxios = lrxios.AND.lxios_sini
211         IF( lrxios) THEN
212             crxios_context = 'nemo_rst'
213             IF( .NOT.lxios_set ) THEN
214                 IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Enable restart reading by XIOS'
215                 CALL iom_init( crxios_context, ld_tmppatch = .false. )
216                 lxios_set = .TRUE.
217             ENDIF
218         ENDIF
219         IF( TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' .AND. lrxios) THEN
220             CALL iom_init( crxios_context, ld_tmppatch = .false. )
221             IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Enable restart reading by XIOS for AGRIF'
222             lxios_set = .TRUE.
223         ENDIF
224      ENDIF
225
226   END SUBROUTINE rst_read_open
227
228
229   SUBROUTINE rst_read
230      !!----------------------------------------------------------------------
231      !!                   ***  ROUTINE rst_read  ***
232      !!
233      !! ** Purpose :   Read files for NetCDF restart
234      !!
235      !! ** Method  :   Read in restart.nc file fields which are necessary for restart
236      !!----------------------------------------------------------------------
237      REAL(wp) ::   zrdt
238      INTEGER  ::   jk
239      REAL(wp), DIMENSION(jpi, jpj, jpk) :: w3d
240      !!----------------------------------------------------------------------
241
242      CALL rst_read_open           ! open restart for reading (if not already opened)
243
244      ! Check dynamics and tracer time-step consistency and force Euler restart if changed
245      IF( iom_varid( numror, 'rdt', ldstop = .FALSE. ) > 0 )   THEN
246         CALL iom_get( numror, 'rdt', zrdt, ldxios = lrxios )
247         IF( zrdt /= rdt )   neuler = 0
248      ENDIF
249
250      CALL iom_delay_rst( 'READ', 'OCE', numror )   ! read only ocean delayed global communication variables
251     
252      ! Diurnal DSST
253      IF( ln_diurnal ) CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'Dsst' , x_dsst, ldxios = lrxios ) 
254      IF ( ln_diurnal_only ) THEN
255         IF(lwp) WRITE( numout, * ) &
256         &   "rst_read:- ln_diurnal_only set, setting rhop=rau0" 
257         rhop = rau0
258         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'tn'     , w3d, ldxios = lrxios ) 
259         tsn(:,:,1,jp_tem) = w3d(:,:,1)
260         RETURN
261      ENDIF 
262     
263      IF( iom_varid( numror, 'ub', ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
264         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'ub'     , ub, ldxios = lrxios                )   ! before fields
265         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'vb'     , vb, ldxios = lrxios                )
266         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'tb'     , tsb(:,:,:,jp_tem), ldxios = lrxios )
267         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'sb'     , tsb(:,:,:,jp_sal), ldxios = lrxios )
268         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'sshb'   , sshb, ldxios = lrxios              )
269      ELSE
270         neuler = 0
271      ENDIF
272      !
273      CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'un'     , un, ldxios = lrxios )   ! now    fields
274      CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'vn'     , vn, ldxios = lrxios )
275      CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'tn'     , tsn(:,:,:,jp_tem), ldxios = lrxios )
276      CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'sn'     , tsn(:,:,:,jp_sal), ldxios = lrxios )
277      CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'sshn'   , sshn, ldxios = lrxios )
278      IF( iom_varid( numror, 'rhop', ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
279         CALL iom_get( numror, jpdom_autoglo, 'rhop'   , rhop, ldxios = lrxios )   ! now    potential density
280      ELSE
281         CALL eos( tsn, rhd, rhop, gdept_n(:,:,:) )   
282      ENDIF
283      !
284      IF( neuler == 0 ) THEN                                  ! Euler restart (neuler=0)
285         tsb  (:,:,:,:) = tsn  (:,:,:,:)                             ! all before fields set to now values
286         ub   (:,:,:)   = un   (:,:,:)
287         vb   (:,:,:)   = vn   (:,:,:)
288         sshb (:,:)     = sshn (:,:)
289         !
290         IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
291            DO jk = 1, jpk
292               e3t_b(:,:,jk) = e3t_n(:,:,jk)
293            END DO
294         ENDIF
295         !
296      ENDIF
297      !
298   END SUBROUTINE rst_read
299
300   !!=====================================================================
301END MODULE restart
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.