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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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zdfphy.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r10721_KERNEL-02_Storkey_Coward_IMMERSE_first_steps/src/OCE/ZDF – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r10721_KERNEL-02_Storkey_Coward_IMMERSE_first_steps/src/OCE/ZDF/zdfphy.F90 @ 10883

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branches/2019/dev_r10721_KERNEL-02_Storkey_Coward_IMMERSE_first_steps: some of the ocean physics modules.

  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1MODULE zdfphy
2   !!======================================================================
3   !!                      ***  MODULE  zdfphy  ***
4   !! Vertical ocean physics :   manager of all vertical physics packages
5   !!======================================================================
6   !! History :  4.0  !  2017-04  (G. Madec)  original code
7   !!----------------------------------------------------------------------
8
9   !!----------------------------------------------------------------------
10   !!   zdf_phy_init  : initialization of all vertical physics packages
11   !!   zdf_phy       : upadate at each time-step the vertical mixing coeff.
12   !!----------------------------------------------------------------------
13   USE oce            ! ocean dynamics and tracers variables
14   USE zdf_oce        ! vertical physics: shared variables         
15   USE zdfdrg         ! vertical physics: top/bottom drag coef.
16   USE zdfsh2         ! vertical physics: shear production term of TKE
17   USE zdfric         ! vertical physics: RIChardson dependent vertical mixing   
18   USE zdftke         ! vertical physics: TKE vertical mixing
19   USE zdfgls         ! vertical physics: GLS vertical mixing
20   USE zdfosm         ! vertical physics: OSMOSIS vertical mixing
21   USE zdfddm         ! vertical physics: double diffusion mixing     
22   USE zdfevd         ! vertical physics: convection via enhanced vertical diffusion 
23   USE zdfiwm         ! vertical physics: internal wave-induced mixing 
24   USE zdfswm         ! vertical physics: surface  wave-induced mixing
25   USE zdfmxl         ! vertical physics: mixed layer
26   USE tranpc         ! convection: non penetrative adjustment
27   USE trc_oce        ! variables shared between passive tracer & ocean           
28   USE sbc_oce        ! surface module (only for nn_isf in the option compatibility test)
29   USE sbcrnf         ! surface boundary condition: runoff variables
30#if defined key_agrif
31   USE agrif_oce_interp   ! interpavm
32#endif
33   !
34   USE in_out_manager ! I/O manager
35   USE iom            ! IOM library
36   USE lbclnk         ! lateral boundary conditions
37   USE lib_mpp        ! distribued memory computing
38   USE timing         ! Timing
39
40   IMPLICIT NONE
41   PRIVATE
42
43   PUBLIC   zdf_phy_init  ! called by nemogcm.F90
44   PUBLIC   zdf_phy       ! called by step.F90
45
46   INTEGER ::   nzdf_phy   ! type of vertical closure used
47   !                       ! associated indicators
48   INTEGER, PARAMETER ::   np_CST = 1   ! Constant Kz
49   INTEGER, PARAMETER ::   np_RIC = 2   ! Richardson number dependent Kz
50   INTEGER, PARAMETER ::   np_TKE = 3   ! Turbulente Kinetic Eenergy closure scheme for Kz
51   INTEGER, PARAMETER ::   np_GLS = 4   ! Generic Length Scale closure scheme for Kz
52   INTEGER, PARAMETER ::   np_OSM = 5   ! OSMOSIS-OBL closure scheme for Kz
53
54   LOGICAL ::   l_zdfsh2   ! shear production term flag (=F for CST, =T otherwise (i.e. TKE, GLS, RIC))
55
56   !!----------------------------------------------------------------------
57   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
58   !! $Id$
59   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
60   !!----------------------------------------------------------------------
61CONTAINS
62
63   SUBROUTINE zdf_phy_init( Kmm )
64      !!----------------------------------------------------------------------
65      !!                  ***  ROUTINE zdf_phy_init  ***
66      !!
67      !! ** Purpose :   initializations of the vertical ocean physics
68      !!
69      !! ** Method  :   Read namelist namzdf, control logicals
70      !!                set horizontal shape and vertical profile of background mixing coef.
71      !!----------------------------------------------------------------------
72      INTEGER, INTENT(in)    :: Kmm ! time level index (middle)
73      !
74      INTEGER ::   jk            ! dummy loop indices
75      INTEGER ::   ioptio, ios   ! local integers
76      !!
77      NAMELIST/namzdf/ ln_zdfcst, ln_zdfric, ln_zdftke, ln_zdfgls,   &     ! type of closure scheme
78         &             ln_zdfosm,                                    &     ! type of closure scheme
79         &             ln_zdfevd, nn_evdm, rn_evd ,                  &     ! convection : evd
80         &             ln_zdfnpc, nn_npc , nn_npcp,                  &     ! convection : npc
81         &             ln_zdfddm, rn_avts, rn_hsbfr,                 &     ! double diffusion
82         &             ln_zdfswm,                                    &     ! surface  wave-induced mixing
83         &             ln_zdfiwm,                                    &     ! internal  -      -      -
84         &             ln_zad_Aimp,                                  &     ! apdative-implicit vertical advection
85         &             rn_avm0, rn_avt0, nn_avb, nn_havtb                  ! coefficients
86      !!----------------------------------------------------------------------
87      !
88      IF(lwp) THEN
89         WRITE(numout,*)
90         WRITE(numout,*) 'zdf_phy_init: ocean vertical physics'
91         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~'
92      ENDIF
93      !
94      !                           !==  Namelist  ==!
95      REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namzdf in reference namelist : Vertical mixing parameters
96      READ  ( numnam_ref, namzdf, IOSTAT = ios, ERR = 901)
97901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf in reference namelist', lwp )
98      !
99      REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namzdf in reference namelist : Vertical mixing parameters
100      READ  ( numnam_cfg, namzdf, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
101902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namzdf in configuration namelist', lwp )
102      IF(lwm)   WRITE ( numond, namzdf )
103      !
104      IF(lwp) THEN                      ! Parameter print
105         WRITE(numout,*) '   Namelist namzdf : set vertical mixing mixing parameters'
106         WRITE(numout,*) '      adaptive-implicit vertical advection'
107         WRITE(numout,*) '         Courant number targeted application   ln_zad_Aimp = ', ln_zad_Aimp
108         WRITE(numout,*) '      vertical closure scheme'
109         WRITE(numout,*) '         constant vertical mixing coefficient    ln_zdfcst = ', ln_zdfcst
110         WRITE(numout,*) '         Richardson number dependent closure     ln_zdfric = ', ln_zdfric
111         WRITE(numout,*) '         Turbulent Kinetic Energy closure (TKE)  ln_zdftke = ', ln_zdftke
112         WRITE(numout,*) '         Generic Length Scale closure (GLS)      ln_zdfgls = ', ln_zdfgls
113         WRITE(numout,*) '         OSMOSIS-OBL closure (OSM)               ln_zdfosm = ', ln_zdfosm
114         WRITE(numout,*) '      convection: '
115         WRITE(numout,*) '         enhanced vertical diffusion             ln_zdfevd = ', ln_zdfevd
116         WRITE(numout,*) '            applied on momentum (=1/0)             nn_evdm = ', nn_evdm
117         WRITE(numout,*) '            vertical coefficient for evd           rn_evd  = ', rn_evd
118         WRITE(numout,*) '         non-penetrative convection (npc)        ln_zdfnpc = ', ln_zdfnpc
119         WRITE(numout,*) '            npc call  frequency                    nn_npc  = ', nn_npc
120         WRITE(numout,*) '            npc print frequency                    nn_npcp = ', nn_npcp
121         WRITE(numout,*) '      double diffusive mixing                    ln_zdfddm = ', ln_zdfddm
122         WRITE(numout,*) '         maximum avs for dd mixing                 rn_avts = ', rn_avts
123         WRITE(numout,*) '         heat/salt buoyancy flux ratio             rn_hsbfr= ', rn_hsbfr
124         WRITE(numout,*) '      gravity wave-induced mixing'
125         WRITE(numout,*) '         surface  wave (Qiao et al 2010)         ln_zdfswm = ', ln_zdfswm                                          ! surface wave induced mixing
126         WRITE(numout,*) '         internal wave (de Lavergne et al 2017)  ln_zdfiwm = ', ln_zdfiwm
127         WRITE(numout,*) '      coefficients : '
128         WRITE(numout,*) '         vertical eddy viscosity                 rn_avm0   = ', rn_avm0
129         WRITE(numout,*) '         vertical eddy diffusivity               rn_avt0   = ', rn_avt0
130         WRITE(numout,*) '         constant background or profile          nn_avb    = ', nn_avb
131         WRITE(numout,*) '         horizontal variation for avtb           nn_havtb  = ', nn_havtb
132      ENDIF
133
134      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
135         IF( zdf_phy_alloc() /= 0 )   &
136        &       CALL ctl_stop( 'STOP', 'zdf_phy_init : unable to allocate adaptive-implicit z-advection arrays' )
137         wi(:,:,:) = 0._wp
138      ENDIF
139      !                          !==  Background eddy viscosity and diffusivity  ==!
140      IF( nn_avb == 0 ) THEN             ! Define avmb, avtb from namelist parameter
141         avmb(:) = rn_avm0
142         avtb(:) = rn_avt0                     
143      ELSE                               ! Background profile of avt (fit a theoretical/observational profile (Krauss 1990)
144         avmb(:) = rn_avm0
145         avtb(:) = rn_avt0 + ( 3.e-4_wp - 2._wp * rn_avt0 ) * 1.e-4_wp * gdepw_1d(:)   ! m2/s
146         IF(ln_sco .AND. lwp)   CALL ctl_warn( 'avtb profile not valid in sco' )
147      ENDIF
148      !                                  ! 2D shape of the avtb
149      avtb_2d(:,:) = 1._wp                   ! uniform
150      !
151      IF( nn_havtb == 1 ) THEN               ! decrease avtb by a factor of ten in the equatorial band
152           !                                 !   -15S -5S : linear decrease from avt0 to avt0/10.
153           !                                 !   -5S  +5N : cst value avt0/10.
154           !                                 !    5N  15N : linear increase from avt0/10, to avt0
155           WHERE(-15. <= gphit .AND. gphit < -5 )   avtb_2d = (1.  - 0.09 * (gphit + 15.))
156           WHERE( -5. <= gphit .AND. gphit <  5 )   avtb_2d =  0.1
157           WHERE(  5. <= gphit .AND. gphit < 15 )   avtb_2d = (0.1 + 0.09 * (gphit -  5.))
158      ENDIF
159      !
160      DO jk = 1, jpk                      ! set turbulent closure Kz to the background value (avt_k, avm_k)
161         avt_k(:,:,jk) = avtb_2d(:,:) * avtb(jk) * wmask (:,:,jk)
162         avm_k(:,:,jk) =                avmb(jk) * wmask (:,:,jk)
163      END DO
164!!gm  to be tested only the 1st & last levels
165!      avt  (:,:, 1 ) = 0._wp   ;   avs(:,:, 1 ) = 0._wp   ;   avm  (:,:, 1 ) = 0._wp
166!      avt  (:,:,jpk) = 0._wp   ;   avs(:,:,jpk) = 0._wp   ;   avm  (:,:,jpk) = 0._wp
167!!gm
168      avt  (:,:,:) = 0._wp   ;   avs(:,:,:) = 0._wp   ;   avm  (:,:,:) = 0._wp
169
170      !                          !==  Convection  ==!
171      !
172      IF( ln_zdfnpc .AND. ln_zdfevd )   CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: chose between ln_zdfnpc and ln_zdfevd' )
173      IF( ln_zdfosm .AND. ln_zdfevd )   CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: chose between ln_zdfosm and ln_zdfevd' )
174      IF( lk_top    .AND. ln_zdfnpc )   CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: npc scheme is not working with key_top' )
175      IF( lk_top    .AND. ln_zdfosm )   CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: osmosis scheme is not working with key_top' )
176      IF(lwp) THEN
177         WRITE(numout,*)
178         IF    ( ln_zdfnpc ) THEN  ;   WRITE(numout,*) '   ==>>>   convection: use non penetrative convective scheme'
179         ELSEIF( ln_zdfevd ) THEN  ;   WRITE(numout,*) '   ==>>>   convection: use enhanced vertical diffusion scheme'
180         ELSE                      ;   WRITE(numout,*) '   ==>>>   convection: no specific scheme used'
181         ENDIF
182      ENDIF
183
184      IF(lwp) THEN               !==  Double Diffusion Mixing parameterization  ==!   (ddm)
185         WRITE(numout,*)
186         IF( ln_zdfddm ) THEN   ;   WRITE(numout,*) '   ==>>>   use double diffusive mixing: avs /= avt'
187         ELSE                   ;   WRITE(numout,*) '   ==>>>   No  double diffusive mixing: avs = avt'
188         ENDIF
189      ENDIF
190
191      !                          !==  type of vertical turbulent closure  ==!    (set nzdf_phy)
192      ioptio = 0 
193      IF( ln_zdfcst ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;    nzdf_phy = np_CST   ;   ENDIF
194      IF( ln_zdfric ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;    nzdf_phy = np_RIC   ;   CALL zdf_ric_init   ;   ENDIF
195      IF( ln_zdftke ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;    nzdf_phy = np_TKE   ;   CALL zdf_tke_init   ;   ENDIF
196      IF( ln_zdfgls ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;    nzdf_phy = np_GLS   ;   CALL zdf_gls_init   ;   ENDIF
197      IF( ln_zdfosm ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;    nzdf_phy = np_OSM   ;   CALL zdf_osm_init( Kmm )   ;   ENDIF
198      !
199      IF( ioptio /= 1 )    CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: one and only one vertical diffusion option has to be defined ' )
200      IF( ln_isfcav ) THEN
201      IF( ln_zdfric .OR. ln_zdfgls )    CALL ctl_stop( 'zdf_phy_init: zdfric and zdfgls never tested with ice shelves cavities ' )
202      ENDIF
203      !                                ! shear production term flag
204      IF( ln_zdfcst ) THEN   ;   l_zdfsh2 = .FALSE.
205      ELSE                   ;   l_zdfsh2 = .TRUE.
206      ENDIF
207
208      !                          !== gravity wave-driven mixing  ==!
209      IF( ln_zdfiwm )   CALL zdf_iwm_init       ! internal wave-driven mixing
210      IF( ln_zdfswm )   CALL zdf_swm_init       ! surface  wave-driven mixing
211
212      !                          !== top/bottom friction  ==!
213      CALL zdf_drg_init
214      !
215      !                          !== time-stepping  ==!
216      ! Check/update of time stepping done in dynzdf_init/trazdf_init
217      !!gm move it here ?
218      !
219   END SUBROUTINE zdf_phy_init
220
221
222   SUBROUTINE zdf_phy( kt, Kbb, Kmm )
223      !!----------------------------------------------------------------------
224      !!                     ***  ROUTINE zdf_phy  ***
225      !!
226      !! ** Purpose :  Update ocean physics at each time-step
227      !!
228      !! ** Method  :
229      !!
230      !! ** Action  :   avm, avt vertical eddy viscosity and diffusivity at w-points
231      !!                nmld ??? mixed layer depth in level and meters   <<<<====verifier !
232      !!                bottom stress.....                               <<<<====verifier !
233      !!----------------------------------------------------------------------
234      INTEGER, INTENT(in) ::   kt         ! ocean time-step index
235      INTEGER, INTENT(in) ::   Kbb, Kmm   ! ocean time level indices
236      !
237      INTEGER ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indice
238      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zsh2   ! shear production
239      !! ---------------------------------------------------------------------
240      !
241      IF( ln_timing )   CALL timing_start('zdf_phy')
242      !
243      IF( l_zdfdrg ) THEN     !==  update top/bottom drag  ==!   (non-linear cases)
244         !
245         !                       !* bottom drag
246         CALL zdf_drg( kt, mbkt    , r_Cdmin_bot, r_Cdmax_bot,   &   ! <<== in
247            &              r_z0_bot,   r_ke0_bot,    rCd0_bot,   &
248            &                                        rCdU_bot  )     ! ==>> out : bottom drag [m/s]
249         IF( ln_isfcav ) THEN    !* top drag   (ocean cavities)
250            CALL zdf_drg( kt, mikt    , r_Cdmin_top, r_Cdmax_top,   &   ! <<== in
251               &              r_z0_top,   r_ke0_top,    rCd0_top,   &
252               &                                        rCdU_top  )     ! ==>> out : bottom drag [m/s]
253         ENDIF
254      ENDIF
255      !
256      !                       !==  Kz from chosen turbulent closure  ==!   (avm_k, avt_k)
257      !
258      IF( l_zdfsh2 )   &         !* shear production at w-points (energy conserving form)
259         CALL zdf_sh2( Kbb, Kmm, avm_k,   &     ! <<== in
260            &                     zsh2    )     ! ==>> out : shear production
261      !
262      SELECT CASE ( nzdf_phy )                  !* Vertical eddy viscosity and diffusivity coefficients at w-points
263      CASE( np_RIC )   ;   CALL zdf_ric( kt,      Kmm, zsh2, avm_k, avt_k )    ! Richardson number dependent Kz
264      CASE( np_TKE )   ;   CALL zdf_tke( kt, Kbb, Kmm, zsh2, avm_k, avt_k )    ! TKE closure scheme for Kz
265      CASE( np_GLS )   ;   CALL zdf_gls( kt, Kbb, Kmm, zsh2, avm_k, avt_k )    ! GLS closure scheme for Kz
266      CASE( np_OSM )   ;   CALL zdf_osm( kt, Kbb, Kmm      , avm_k, avt_k )    ! OSMOSIS closure scheme for Kz
267!     CASE( np_CST )                                  ! Constant Kz (reset avt, avm to the background value)
268!         ! avt_k and avm_k set one for all at initialisation phase
269!!gm         avt(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1) = rn_avt0 * wmask(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1)
270!!gm         avm(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1) = rn_avm0 * wmask(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1)
271      END SELECT
272     
273      !                          !==  ocean Kz  ==!   (avt, avs, avm)
274      !
275      !                                         !* start from turbulent closure values
276      avt(:,:,2:jpkm1) = avt_k(:,:,2:jpkm1)
277      avm(:,:,2:jpkm1) = avm_k(:,:,2:jpkm1)
278      !
279      IF( ln_rnf_mouth ) THEN                   !* increase diffusivity at rivers mouths
280         DO jk = 2, nkrnf
281            avt(:,:,jk) = avt(:,:,jk) + 2._wp * rn_avt_rnf * rnfmsk(:,:) * wmask(:,:,jk)
282         END DO
283      ENDIF
284      !
285      IF( ln_zdfevd )   CALL zdf_evd( kt, avm, avt )  !* convection: enhanced vertical eddy diffusivity
286      !
287      !                                         !* double diffusive mixing
288      IF( ln_zdfddm ) THEN                            ! update avt and compute avs
289                        CALL zdf_ddm( kt, avm, avt, avs )
290      ELSE                                            ! same mixing on all tracers
291         avs(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1) = avt(2:jpim1,2:jpjm1,1:jpkm1)
292      ENDIF
293      !
294      !                                         !* wave-induced mixing
295      IF( ln_zdfswm )   CALL zdf_swm( kt, avm, avt, avs )   ! surface  wave (Qiao et al. 2004)
296      IF( ln_zdfiwm )   CALL zdf_iwm( kt, avm, avt, avs )   ! internal wave (de Lavergne et al 2017)
297
298#if defined key_agrif 
299      ! interpolation parent grid => child grid for avm_k ( ex : at west border: update column 1 and 2)
300      IF( l_zdfsh2 )   CALL Agrif_avm
301#endif
302
303      !                                         !* Lateral boundary conditions (sign unchanged)
304      IF( l_zdfsh2 ) THEN
305         CALL lbc_lnk_multi( 'zdfphy', avm_k, 'W', 1. , avt_k, 'W', 1.,   &
306            &                avm  , 'W', 1. , avt  , 'W', 1. , avs , 'W', 1. )
307      ELSE
308         CALL lbc_lnk_multi( 'zdfphy', avm  , 'W', 1. , avt  , 'W', 1. , avs , 'W', 1. )
309      ENDIF
310      !
311      IF( l_zdfdrg ) THEN     ! drag  have been updated (non-linear cases)
312         IF( ln_isfcav ) THEN   ;  CALL lbc_lnk_multi( 'zdfphy', rCdU_top, 'T', 1. , rCdU_bot, 'T', 1. )   ! top & bot drag
313         ELSE                   ;  CALL lbc_lnk      ( 'zdfphy', rCdU_bot, 'T', 1. )                       ! bottom drag only
314         ENDIF
315      ENDIF
316      !
317      CALL zdf_mxl( kt )                        !* mixed layer depth, and level
318      !
319      IF( lrst_oce ) THEN                       !* write TKE, GLS or RIC fields in the restart file
320         IF( ln_zdftke )   CALL tke_rst( kt, 'WRITE' )
321         IF( ln_zdfgls )   CALL gls_rst( kt, 'WRITE' )
322         IF( ln_zdfric )   CALL ric_rst( kt, 'WRITE' ) 
323         ! NB. OSMOSIS restart (osm_rst) will be called in step.F90 after ww has been updated
324      ENDIF
325      !
326      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('zdf_phy')
327      !
328   END SUBROUTINE zdf_phy
329   INTEGER FUNCTION zdf_phy_alloc()
330      !!----------------------------------------------------------------------
331      !!                 ***  FUNCTION zdf_phy_alloc  ***
332      !!----------------------------------------------------------------------
333     ! Allocate wi array (declared in oce.F90) for use with the adaptive-implicit vertical velocity option
334     ALLOCATE(     wi(jpi,jpj,jpk), Cu_adv(jpi,jpj,jpk),  STAT= zdf_phy_alloc )
335     IF( zdf_phy_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('zdf_phy_alloc: failed to allocate ln_zad_Aimp=T required arrays')
336     CALL mpp_sum ( 'zdfphy', zdf_phy_alloc )
337   END FUNCTION zdf_phy_alloc
338
339   !!======================================================================
340END MODULE zdfphy
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.