New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
bibliography.bib in NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/doc/latex/NEMO/main – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/doc/latex/NEMO/main/bibliography.bib @ 11263

Last change on this file since 11263 was 11263, checked in by smasson, 5 years ago

dev_r10984_HPC-13 : merge with trunk@11242, see #2285

File size: 103.9 KB
Line 
1
2@article{         adcroft.campin_OM04,
3  title         = "Rescaled height coordinates for accurate representation of
4                  free-surface flows in ocean circulation models",
5  pages         = "269--284",
6  journal       = "Ocean Modelling",
7  volume        = "7",
8  number        = "3-4",
9  author        = "A. Adcroft and J.-M. Campin",
10  year          = "2004",
11  month         = "jan",
12  publisher     = "Elsevier BV",
13  issn          = "1463-5003",
14  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.09.003"
15}
16
17@article{         arakawa.hsu_MWR90,
18  title         = "Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
19                  Schemes for the Shallow Water Equations",
20  pages         = "1960--1969",
21  journal       = "Monthly Weather Review",
22  volume        = "118",
23  number        = "10",
24  author        = "A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu",
25  year          = "1990",
26  month         = "oct",
27  publisher     = "American Meteorological Society",
28  issn          = "1520-0493",
29  doi           = "10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2"
30}
31
32@article{         arakawa.lamb_MWR81,
33  title         = "A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
34                  Shallow Water Equations",
35  pages         = "18--36",
36  journal       = "Monthly Weather Review",
37  volume        = "109",
38  number        = "1",
39  author        = "A. Arakawa and V. R. Lamb",
40  year          = "1981",
41  month         = "jan",
42  publisher     = "American Meteorological Society",
43  issn          = "1520-0493",
44  doi           = "10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2"
45}
46
47@article{         arakawa_JCP66,
48  title         = "Computational design for long-term numerical integration
49                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
50                  incompressible flow. Part {I}",
51  pages         = "119--143",
52  journal       = "Journal of Computational Physics",
53  volume        = "1",
54  number        = "1",
55  author        = "A. Arakawa",
56  year          = "1966",
57  month         = "Aug",
58  publisher     = "Elsevier BV",
59  issn          = "0021-9991",
60  doi           = "10.1016/0021-9991(66)90015-5"
61}
62
63@article{         arbic.garner.ea_DSR04,
64  title         = "The accuracy of surface elevations in forward global
65                  barotropic and baroclinic tide models",
66  pages         = "3069--3101",
67  journal       = "Deep Sea Research",
68  volume        = "51",
69  number        = "25-26",
70  author        = "B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
71                  Simmons",
72  year          = "2004",
73  month         = "dec",
74  publisher     = "Elsevier BV",
75  issn          = "0967-0645",
76  doi           = "10.1016/j.dsr2.2004.09.014"
77}
78
79@article{         artale.iudicone.ea_JGR02,
80  title         = "Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
81                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
82                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
83                  thermohaline circulation",
84  pages         = "2901--2924",
85  journal       = "Journal of Geophysical Research",
86  volume        = "107",
87  number        = "C8",
88  author        = "V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
89                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio",
90  year          = "2002",
91  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
92  issn          = "0148-0227",
93  doi           = "10.1029/2000jc000452"
94}
95
96@article{         asselin_MWR72,
97  title         = "Frequency Filter for Time Integrations",
98  pages         = "487--490",
99  journal       = "Monthly Weather Review",
100  volume        = "100",
101  number        = "6",
102  author        = "R. Asselin",
103  year          = "1972",
104  month         = "jun",
105  publisher     = "American Meteorological Society",
106  issn          = "1520-0493",
107  doi           = "10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2"
108}
109
110@article{         axell_JGR02,
111  title         = "Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
112                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea",
113  journal       = "Journal of Geophysical Research",
114  volume        = "107",
115  number        = "C11",
116  author        = "L. B. Axell",
117  year          = "2002",
118  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
119  issn          = "0148-0227",
120  doi           = "10.1029/2001jc000922"
121}
122
123@article{         barnier.madec.ea_OD06,
124  title         = "Impact of partial steps and momentum advection schemes in
125                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
126                  resolution",
127  pages         = "543--567",
128  journal       = "Ocean Dynamics",
129  volume        = "56",
130  number        = "5-6",
131  author        = "B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
132                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. {Le Sommer} and A. Beckmann
133                  and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and J. Dengg and C.
134                  Derval and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C.
135                  Talandier and S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and
136                  B. {de Cuevas}",
137  year          = "2006",
138  month         = "jun",
139  publisher     = "Springer Nature",
140  issn          = "1616-7228",
141  doi           = "10.1007/s10236-006-0082-1"
142}
143
144@article{         beckmann.doscher_JPO97,
145  title         = "A method for improved representation of dense water
146                  spreading over topography in geopotential-coordinate
147                  models",
148  pages         = "581--591",
149  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
150  volume        = "27",
151  number        = "4",
152  author        = "A. Beckmann and R. D{\"{o}}scher",
153  year          = "1997",
154  month         = "apr",
155  publisher     = "American Meteorological Society",
156  issn          = "1520-0485",
157  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2"
158}
159
160@article{         beckmann.goosse_OM03,
161  title         = "A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
162                  climate models",
163  pages         = "157--170",
164  journal       = "Ocean Modelling",
165  volume        = "5",
166  number        = "2",
167  author        = "A. Beckmann and H. Goosse",
168  year          = "2003",
169  month         = "jan",
170  publisher     = "Elsevier BV",
171  issn          = "1463-5003",
172  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00019-7"
173}
174
175@article{         beckmann.haidvogel_JPO93,
176  title         = "Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
177                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model Accuracy",
178  pages         = "1736--1753",
179  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
180  volume        = "23",
181  number        = "8",
182  author        = "A. Beckmann and D. B. Haidvogel",
183  year          = "1993",
184  month         = "aug",
185  publisher     = "American Meteorological Society",
186  issn          = "1520-0485",
187  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2"
188}
189
190@article{         bernie.guilyardi.ea_CD07,
191  title         = "Impact of resolving the diurnal cycle in an
192                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced {OGCM}",
193  pages         = "575--590",
194  journal       = "Climate Dynamics",
195  volume        = "29",
196  number        = "6",
197  author        = "D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
198                  Slingo and S. J. Woolnough",
199  year          = "2007",
200  month         = "may",
201  publisher     = "Springer Nature",
202  issn          = "1432-0894",
203  doi           = "10.1007/s00382-007-0249-6"
204}
205
206@article{         bernie.woolnough.ea_JC05,
207  title         = "Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
208                  ocean mixed layer",
209  pages         = "1190--1202",
210  journal       = "Journal of Climate",
211  volume        = "18",
212  number        = "8",
213  author        = "D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
214                  Guilyardi",
215  year          = "2005",
216  month         = "apr",
217  publisher     = "American Meteorological Society",
218  issn          = "1520-0442",
219  doi           = "10.1175/jcli3319.1"
220}
221
222@article{         blanke.delecluse_JPO93,
223  title         = "Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
224                  General Circulation Model with two different mixed-layer
225                  physics",
226  pages         = "1363--1388",
227  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
228  volume        = "23",
229  number        = "7",
230  author        = "B. Blanke and P. Del\'{e}cluse",
231  year          = "1993",
232  month         = "jul",
233  publisher     = "American Meteorological Society",
234  issn          = "1520-0485",
235  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2"
236}
237
238@article{         blanke.raynaud_JPO97,
239  title         = "Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
240                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results",
241  pages         = "1038--1053",
242  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
243  volume        = "27",
244  number        = "6",
245  author        = "B. Blanke and S. Raynaud",
246  year          = "1997",
247  month         = "jun",
248  publisher     = "American Meteorological Society",
249  issn          = "1520-0485",
250  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2"
251}
252
253@article{         bloom.takacs.ea_MWR96,
254  title         = "Data assimilation using incremental analysis updates",
255  pages         = "1256--1271",
256  journal       = "Monthly Weather Review",
257  volume        = "124",
258  number        = "6",
259  author        = "S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
260                  Ledvina",
261  year          = "1996",
262  month         = "jun",
263  publisher     = "American Meteorological Society",
264  issn          = "1520-0493",
265  doi           = "10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2"
266}
267
268@article{         bouffard.boegman_DAO13,
269  title         = "A diapycnal diffusivity model for stratified environmental
270                  flows",
271  pages         = "14--34",
272  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
273  volume        = "61-62",
274  author        = "D. Bouffard and L. Boegman",
275  year          = "2013",
276  month         = "jun",
277  publisher     = "Elsevier BV",
278  issn          = "0377-0265",
279  doi           = "10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002"
280}
281
282@article{         bougeault.lacarrere_MWR89,
283  title         = "Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
284                  Mesobeta--Scale Model",
285  pages         = "1872--1890",
286  journal       = "Monthly Weather Review",
287  volume        = "117",
288  number        = "8",
289  author        = "P. Bougeault and P. Lacarrere",
290  year          = "1989",
291  month         = "aug",
292  publisher     = "American Meteorological Society",
293  issn          = "1520-0493",
294  doi           = "10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2"
295}
296
297@article{         bouillon.maqueda.ea_OM09,
298  title         = "An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
299                  Arakawa {B} and {C} grids",
300  pages         = "174--184",
301  journal       = "Ocean Modelling",
302  volume        = "27",
303  number        = "3-4",
304  author        = "S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
305                  Fichefet",
306  year          = "2009",
307  month         = "jan",
308  publisher     = "Elsevier BV",
309  issn          = "1463-5003",
310  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.01.004"
311}
312
313@article{         brankart.candille.ea_GMD15,
314  title         = "A generic approach to explicit simulation of uncertainty
315                  in the {NEMO} ocean model",
316  pages         = "1285--1297",
317  journal       = "Geoscientific Model Development",
318  volume        = "8",
319  number        = "5",
320  author        = "J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
321                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
322                  J. Verron",
323  year          = "2015",
324  month         = "may",
325  publisher     = "Copernicus GmbH",
326  issn          = "1991-9603",
327  doi           = "10.5194/gmd-8-1285-2015"
328}
329
330@article{         brankart_OM13,
331  title         = "Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
332                  upon low resolution global ocean modelling",
333  pages         = "64--76",
334  journal       = "Ocean Modelling",
335  volume        = "66",
336  author        = "J.-M. Brankart",
337  year          = "2013",
338  month         = "jun",
339  publisher     = "Elsevier BV",
340  issn          = "1463-5003",
341  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.004"
342}
343
344@article{         breivik.bidlot.ea_OM16,
345  title         = "A Stokes drift approximation based on the Phillips
346                  spectrum",
347  pages         = "49--56",
348  journal       = "Ocean Modelling",
349  volume        = "100",
350  author        = "{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen",
351  year          = "2016",
352  month         = "apr",
353  publisher     = "Elsevier BV",
354  issn          = "1463-5003",
355  doi           = "10.1016/j.ocemod.2016.01.005"
356}
357
358@article{         breivik.janssen.ea_JPO14,
359  title         = "Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water",
360  pages         = "2433--2445",
361  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
362  volume        = "44",
363  number        = "9",
364  author        = "{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot",
365  year          = "2014",
366  month         = "sep",
367  publisher     = "American Meteorological Society",
368  issn          = "1520-0485",
369  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0020.1"
370}
371
372@article{         brodeau.barnier.ea_OM10,
373  title         = "An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
374                  circulation models",
375  pages         = "88--104",
376  journal       = "Ocean Modelling",
377  volume        = "31",
378  number        = "3-4",
379  author        = "L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
380                  Penduff and S. Gulev",
381  year          = "2010",
382  month         = "jan",
383  publisher     = "Elsevier BV",
384  issn          = "1463-5003",
385  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.10.005"
386}
387
388@article{         brown.campana_MWR78,
389  title         = "An economical time-differencing system for numerical
390                  weather prediction",
391  pages         = "1125--1136",
392  journal       = "Monthly Weather Review",
393  volume        = "106",
394  number        = "8",
395  author        = "J. A. Brown and K. A. Campana",
396  year          = "1978",
397  month         = "aug",
398  publisher     = "American Meteorological Society",
399  issn          = "1520-0493",
400  doi           = "10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2"
401}
402
403@article{         bryan_JCP97,
404  title         = "A numerical method for the study of the circulation of the
405                  world ocean",
406  pages         = "154--169",
407  journal       = "Journal of Computational Physics",
408  volume        = "135",
409  number        = "2",
410  author        = "K. Bryan",
411  year          = "1997",
412  month         = "Aug",
413  publisher     = "Elsevier BV",
414  issn          = "0021-9991",
415  doi           = "10.1006/jcph.1997.5699"
416}
417
418@article{         burchard_OM02,
419  title         = "Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
420                  buoyancy production",
421  pages         = "347--361",
422  journal       = "Ocean Modelling",
423  volume        = "4",
424  number        = "3-4",
425  author        = "H. Burchard",
426  year          = "2002",
427  month         = "jun",
428  publisher     = "Elsevier BV",
429  issn          = "1463-5003",
430  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00009-4"
431}
432
433@article{         campin.adcroft.ea_OM04,
434  title         = "Conservation of properties in a free-surface model",
435  pages         = "221--244",
436  journal       = "Ocean Modelling",
437  volume        = "6",
438  number        = "3-4",
439  author        = "J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall",
440  year          = "2004",
441  month         = "jan",
442  publisher     = "Elsevier BV",
443  issn          = "1463-5003",
444  doi           = "10.1016/s1463-5003(03)00009-x"
445}
446
447@article{         campin.goosse_T99,
448  title         = "Parameterization of density-driven downsloping flow for a
449                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate",
450  pages         = "412--430",
451  journal       = "Tellus A",
452  volume        = "51",
453  number        = "3",
454  author        = "J.-M. Campin and H. Goosse",
455  year          = "1999",
456  month         = "may",
457  publisher     = "Informa UK Limited",
458  issn          = "1600-0870",
459  doi           = "10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x"
460}
461
462@article{         campin.marshall.ea_OM08,
463  title         = "Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
464                  coordinate \zstar",
465  pages         = "1--14",
466  journal       = "Ocean Modelling",
467  volume        = "24",
468  number        = "1-2",
469  author        = "J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira",
470  year          = "2008",
471  month         = "jan",
472  publisher     = "Elsevier BV",
473  issn          = "1463-5003",
474  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.05.005"
475}
476
477@article{         canuto.howard.ea_JPO01,
478  title         = "Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
479                  model-momentum and heat vertical diffusivities",
480  pages         = "1413--1426",
481  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
482  volume        = "31",
483  number        = "6",
484  author        = "V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
485                  Dubovikov",
486  year          = "2001",
487  month         = "jun",
488  publisher     = "American Meteorological Society",
489  issn          = "1520-0485",
490  doi           = "10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2"
491}
492
493@article{         carrere.lyard_GRL03,
494  title         = "Modeling the barotropic response of the global ocean to
495                  atmospheric wind and pressure forcing - comparisons with
496                  observations",
497  journal       = "Geophysical Research Letters",
498  volume        = "30",
499  number        = "6",
500  author        = "L. Carr\`{e}re and F. Lyard",
501  year          = "2003",
502  month         = "mar",
503  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
504  issn          = "0094-8276",
505  doi           = "10.1029/2002gl016473"
506}
507
508@techreport{      chanut_rpt05,
509  title         = "Nesting code for {NEMO}",
510  pages         = "25",
511  author        = "J. Chanut",
512  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
513                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
514  year          = "2005",
515  month         = "may",
516  doi           = "10.5281/zenodo.3243409"
517}
518
519@article{         chassignet.smith.ea_JPO03,
520  title         = "North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
521                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
522                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity",
523  pages         = "2504--2526",
524  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
525  volume        = "33",
526  number        = "12",
527  author        = "E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
528                  R. Bleck",
529  year          = "2003",
530  month         = "dec",
531  publisher     = "American Meteorological Society",
532  issn          = "1520-0485",
533  doi           = "10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2"
534}
535
536@article{         cox_OM87,
537  title         = "Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model",
538  pages         = "1--9",
539  journal       = "Ocean Modelling",
540  volume        = "74",
541  author        = "M. D. Cox",
542  year          = "1987",
543  month         = "jan",
544  url           = "https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model"
545}
546
547@article{         craig.banner_JPO94,
548  title         = "Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
549                  layer",
550  pages         = "2546--2559",
551  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
552  volume        = "24",
553  number        = "12",
554  author        = "P. D. Craig and M. L. Banner",
555  year          = "1994",
556  month         = "dec",
557  publisher     = "American Meteorological Society",
558  issn          = "1520-0485",
559  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2"
560}
561
562@article{         craik.leibovich_JFM76,
563  title         = "A rational model for Langmuir circulations",
564  pages         = "401--426",
565  journal       = "Journal of Fluid Mechanics",
566  volume        = "73",
567  number        = "3",
568  author        = "A. D. D. Craik and S. Leibovich",
569  year          = "1976",
570  month         = "feb",
571  publisher     = "Cambridge University Press (CUP)",
572  issn          = "1469-7645",
573  doi           = "10.1017/s0022112076001420"
574}
575
576@article{         dalessio.abdella.ea_JPO98,
577  title         = "A new second-order turbulence closure scheme for modeling
578                  the oceanic mixed layer",
579  pages         = "1624--1641",
580  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
581  volume        = "28",
582  number        = "8",
583  author        = "S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane",
584  year          = "1998",
585  month         = "aug",
586  publisher     = "American Meteorological Society",
587  issn          = "1520-0485",
588  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2"
589}
590
591@book{            daley.barker_bk01,
592  pages         = "163",
593  booktitle     = "{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
594                  Data Assimilation System",
595  editor        = "Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division",
596  author        = "R. Daley and E. Barker",
597  year          = "2001",
598  month         = "jul",
599  publisher     = "Defense Technical Information Center",
600  doi           = "10.21236/ada396883"
601}
602
603@article{         danabasoglu.ferrari.ea_JC08,
604  title         = "Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
605                  parameterization of near-surface eddy fluxes",
606  pages         = "1192--1208",
607  journal       = "Journal of Climate",
608  volume        = "21",
609  number        = "6",
610  author        = "G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams",
611  year          = "2008",
612  month         = "mar",
613  publisher     = "American Meteorological Society",
614  issn          = "1520-0442",
615  doi           = "10.1175/2007jcli1508.1"
616}
617
618@article{         davies_QJRMS76,
619  title         = "A lateral boundary formulation for multi-level prediction
620                  models",
621  pages         = "405--418",
622  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
623  volume        = "102",
624  number        = "432",
625  author        = "H. C. Davies",
626  year          = "1976",
627  month         = "apr",
628  publisher     = "Wiley",
629  issn          = "0035-9009",
630  doi           = "10.1002/qj.49710243210"
631}
632
633@article{         de-boyer-montegut.madec.ea_JGR04,
634  title         = "Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
635                  profile data and a profile-based climatology",
636  pages         = "C12003",
637  journal       = "Journal of Geophysical Research",
638  volume        = "109",
639  number        = "C12",
640  author        = "C. {de Boyer Mont\'{e}gut} and G. Madec and A. S. Fischer
641                  and A. Lazar and D. Iudicone",
642  year          = "2004",
643  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
644  issn          = "0148-0227",
645  doi           = "10.1029/2004jc002378"
646}
647
648@article{         de-lavergne.madec.ea_JPO16,
649  title         = "The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
650                  overturning",
651  pages         = "663--681",
652  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
653  volume        = "46",
654  number        = "2",
655  author        = "C. {de Lavergne} and G. Madec and J. {Le Sommer} and A. J.
656                  G. Nurser and A. C. Naveira Garabato",
657  year          = "2016",
658  month         = "feb",
659  publisher     = "American Meteorological Society",
660  issn          = "1520-0485",
661  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0259.1"
662}
663
664@article{         debreu.vouland.ea_CG08,
665  title         = "{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran",
666  pages         = "8--13",
667  journal       = "Computers \& Geosciences",
668  volume        = "34",
669  number        = "1",
670  author        = "L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo",
671  year          = "2008",
672  month         = "jan",
673  publisher     = "Elsevier BV",
674  issn          = "0098-3004",
675  doi           = "10.1016/j.cageo.2007.01.009"
676}
677
678@incollection{    delecluse.madec_icol99,
679  title         = "Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
680                  system",
681  pages         = "237--313",
682  booktitle     = "Modeling the Earth's Climate and its Variability",
683  editor        = "W. R. Holland and S. Joussaume and F. David",
684  series        = "Les Houches",
685  volume        = "67",
686  author        = "P. Del\'{e}cluse and G. Madec",
687  year          = "1999",
688  publisher     = "North Holland",
689  isbn          = "978-0-444-50338-1"
690}
691
692@phdthesis{       demange_phd14,
693  title         = "Advection and gravity waves propagation numerical schemes
694                  for oceanic circulation models",
695  pages         = "138",
696  author        = "J. Demange",
697  school        = "Grenoble University, France",
698  year          = "2014",
699  url           = "https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf"
700}
701
702@article{         dobricic.pinardi.ea_OS07,
703  title         = "Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
704                  System at the basin scale",
705  pages         = "149--157",
706  journal       = "Ocean Science",
707  volume        = "3",
708  number        = "1",
709  author        = "S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
710                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez",
711  year          = "2007",
712  month         = "mar",
713  publisher     = "Copernicus GmbH",
714  issn          = "1812-0792",
715  doi           = "10.5194/os-3-149-2007"
716}
717
718@article{         drijfhout_JPO94,
719  title         = "Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
720                  Model",
721  pages         = "353--369",
722  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
723  volume        = "24",
724  number        = "2",
725  author        = "S. S. Drijfhout",
726  year          = "1994",
727  month         = "feb",
728  publisher     = "American Meteorological Society",
729  issn          = "1520-0485",
730  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2"
731}
732
733@article{         dukowicz.smith_JGR94,
734  title         = "Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
735                  ocean model",
736  pages         = "7991--8014",
737  journal       = "Journal of Geophysical Research",
738  volume        = "99",
739  number        = "C4",
740  author        = "J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
741  year          = "1994",
742  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
743  issn          = "0148-0227",
744  doi           = "10.1029/93jc03455"
745}
746
747@article{         egbert.ray_JGR01,
748  title         = "Estimates of {M2} tidal energy dissipation from
749                  {TOPEX}/Poseidon altimeter data",
750  pages         = "22475--22502",
751  journal       = "Journal of Geophysical Research",
752  volume        = "106",
753  number        = "C10",
754  author        = "G. D. Egbert and R. D. Ray",
755  year          = "2001",
756  month         = "oct",
757  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
758  issn          = "0148-0227",
759  doi           = "10.1029/2000jc000699"
760}
761
762@article{         egbert.ray_N00,
763  title         = "Significant dissipation of tidal energy in the deep ocean
764                  inferred from satellite altimeter data",
765  pages         = "775--778",
766  journal       = "Nature",
767  volume        = "405",
768  number        = "6788",
769  author        = "G. D. Egbert and R. D. Ray",
770  year          = "2000",
771  month         = "jun",
772  publisher     = "Springer Nature",
773  issn          = "1476-4687",
774  doi           = "10.1038/35015531"
775}
776
777@article{         eiseman.stone_SR80,
778  title         = "Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey",
779  pages         = "12--27",
780  journal       = "SIAM Review",
781  volume        = "22",
782  number        = "1",
783  author        = "P. R. Eiseman and A. P. Stone",
784  year          = "1980",
785  month         = "jan",
786  publisher     = "Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)",
787  issn          = "1095-7200",
788  doi           = "10.1137/1022002"
789}
790
791@article{         emile-geay.madec_OS09,
792  title         = "Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
793                  circulation",
794  pages         = "203--217",
795  journal       = "Ocean Science",
796  volume        = "5",
797  number        = "2",
798  author        = "J. Emile-Geay and G. Madec",
799  year          = "2009",
800  month         = "jun",
801  publisher     = "Copernicus GmbH",
802  issn          = "1812-0792",
803  doi           = "10.5194/os-5-203-2009"
804}
805
806@article{         engedahl_T95,
807  title         = "Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
808                  baroclinic ocean model with realistic topography",
809  pages         = "365--382",
810  journal       = "Tellus A",
811  volume        = "47",
812  number        = "3",
813  author        = "H. Engedahl",
814  year          = "1995",
815  month         = "jan",
816  publisher     = "Informa UK Limited",
817  issn          = "1600-0870",
818  doi           = "10.3402/tellusa.v47i3.11523"
819}
820
821@phdthesis{       farge-coulombier_phd87,
822  title         = "Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
823                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant",
824  pages         = "353",
825  author        = "M. {Farge Coulombier}",
826  school        = "Paris VI University, France",
827  year          = "1987",
828  url           = "http://www.theses.fr/1987PA066365"
829}
830
831@article{         farrow.stevens_JPO95,
832  title         = "A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
833                  General Circulation Models",
834  pages         = "1731--1741",
835  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
836  volume        = "25",
837  number        = "7",
838  author        = "D. E. Farrow and D. P. Stevens",
839  year          = "1995",
840  month         = "jul",
841  publisher     = "American Meteorological Society",
842  issn          = "1520-0485",
843  doi           = "10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2"
844}
845
846@article{         flather_JPO94,
847  title         = "A storm surge prediction model for the northern Bay of
848                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
849                  1991",
850  pages         = "172--190",
851  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
852  volume        = "24",
853  number        = "1",
854  author        = "R. A. Flather",
855  year          = "1994",
856  month         = "jan",
857  publisher     = "American Meteorological Society",
858  issn          = "1520-0485",
859  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2"
860}
861
862@book{            fofonoff.millard_bk83,
863  pages         = "53",
864  booktitle     = "Algorithms for computation of fundamental properties of
865                  seawater",
866  editor        = "UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO",
867  series        = "Technical Paper in Marine Science",
868  volume        = "44",
869  author        = "N P. Fofonoff and R. C. Millard",
870  year          = "1983",
871  publisher     = "UNESCO",
872  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en"
873}
874
875@article{         galperin.kantha.ea_JAS88,
876  title         = "A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
877                  flows",
878  pages         = "55--62",
879  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
880  volume        = "45",
881  number        = "1",
882  author        = "B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati",
883  year          = "1988",
884  month         = "jan",
885  publisher     = "American Meteorological Society",
886  issn          = "1520-0469",
887  doi           = "10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2"
888}
889
890@article{         gargett_JMR84,
891  title         = "Vertical eddy diffusivity in the ocean interior",
892  pages         = "359--393",
893  journal       = "Journal of Marine Research",
894  volume        = "42",
895  number        = "2",
896  author        = "A. E. Gargett",
897  year          = "1984",
898  month         = "may",
899  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
900  issn          = "1543-9542",
901  doi           = "10.1357/002224084788502756"
902}
903
904@article{         gaspar.gregoris.ea_JGR90,
905  title         = "A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
906                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
907                  long-term upper ocean study site",
908  pages         = "16179",
909  journal       = "Journal of Geophysical Research",
910  volume        = "95",
911  number        = "C9",
912  author        = "P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre",
913  year          = "1990",
914  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
915  issn          = "0148-0227",
916  doi           = "10.1029/jc095ic09p16179"
917}
918
919@article{         gent.mcwilliams_JPO90,
920  title         = "Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models",
921  pages         = "150--155",
922  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
923  volume        = "20",
924  number        = "1",
925  author        = "P. R. Gent and J. C. McWilliams",
926  year          = "1990",
927  month         = "jan",
928  publisher     = "American Meteorological Society",
929  issn          = "1520-0485",
930  doi           = "10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2"
931}
932
933@article{         gentemann.minnett.ea_JGR09,
934  title         = "Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
935                  of upper ocean diurnal warming",
936  pages         = "C07017",
937  journal       = "Journal of Geophysical Research",
938  volume        = "114",
939  number        = "C7",
940  author        = "C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward",
941  year          = "2009",
942  month         = "jul",
943  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
944  issn          = "0148-0227",
945  doi           = "10.1029/2008jc004825"
946}
947
948@article{         gerdes.koberle.ea_CD91,
949  title         = "The influence of numerical advection schemes on the
950                  results of Ocean General Circulation Models",
951  pages         = "211--226",
952  journal       = "Climate Dynamics",
953  volume        = "5",
954  number        = "4",
955  author        = "R. Gerdes and C. K{\"{o}}berle and J. Willebrand",
956  year          = "1991",
957  month         = "jun",
958  publisher     = "Springer Nature",
959  issn          = "1432-0894",
960  doi           = "10.1007/bf00210006"
961}
962
963@article{         gerdes_JGR93*a,
964  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
965                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
966                  and testing of the model",
967  pages         = "14683--14701",
968  journal       = "Journal of Geophysical Research",
969  volume        = "98",
970  number        = "C8",
971  author        = "R. Gerdes",
972  year          = "1993",
973  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
974  issn          = "0148-0227",
975  doi           = "10.1029/93jc00760"
976}
977
978@article{         gerdes_JGR93*b,
979  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
980                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
981                  to an overflow problem",
982  pages         = "14703--14726",
983  journal       = "Journal of Geophysical Research",
984  volume        = "98",
985  number        = "C8",
986  author        = "R. Gerdes",
987  year          = "1993",
988  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
989  issn          = "0148-0227",
990  doi           = "10.1029/93jc00788"
991}
992
993@techreport{      gibson_rpt86,
994  title         = "Standards for software development and maintenance",
995  pages         = "21",
996  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
997  number        = "120",
998  author        = "J. K. Gibson",
999  institution   = "ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom",
1000  year          = "1986",
1001  month         = "aug",
1002  doi           = "10.21957/gi113q4gn"
1003}
1004
1005@book{            gill_bk82,
1006  pages         = "662",
1007  booktitle     = "Atmosphere-Ocean Dynamics",
1008  series        = "International Geophysics",
1009  volume        = "30",
1010  author        = "A. E. Gill",
1011  year          = "1982",
1012  month         = "nov",
1013  publisher     = "Elsevier",
1014  issn          = "0074-6142",
1015  isbn          = "978-0-12-283522-3",
1016  doi           = "10.1016/s0074-6142(08)x6002-4"
1017}
1018
1019@article{         goff_JGR10,
1020  title         = "Global prediction of abyssal hill root-mean-square heights
1021                  from small-scale altimetric gravity variability",
1022  pages         = "B12104",
1023  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1024  volume        = "115",
1025  number        = "B12",
1026  author        = "J. A. Goff",
1027  year          = "2010",
1028  month         = "dec",
1029  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1030  issn          = "0148-0227",
1031  doi           = "10.1029/2010jb007867"
1032}
1033
1034@article{         goosse.deleersnijder.ea_JGR99,
1035  title         = "Sensitivity of a global coupled ocean-sea ice model to the
1036                  parameterization of vertical mixing",
1037  pages         = "13681--13695",
1038  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1039  volume        = "104",
1040  number        = "C6",
1041  author        = "H. Goosse and E. Deleersnijder and T. Fichefet and M. H.
1042                  England",
1043  year          = "1999",
1044  month         = "jun",
1045  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1046  issn          = "0148-0227",
1047  doi           = "10.1029/1999jc900099"
1048}
1049
1050@article{         graham.mcdougall_JPO13,
1051  title         = "Quantifying the nonconservative production of conservative
1052                  temperature, potential temperature, and entropy",
1053  pages         = "838--862",
1054  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1055  volume        = "43",
1056  number        = "5",
1057  author        = "F. S. Graham and T. J. McDougall",
1058  year          = "2013",
1059  month         = "may",
1060  publisher     = "American Meteorological Society",
1061  issn          = "1520-0485",
1062  doi           = "10.1175/jpo-d-11-0188.1"
1063}
1064
1065@article{         greatbatch_JGR94,
1066  title         = "A note on the representation of steric sea level in models
1067                  that conserve volume rather than mass",
1068  pages         = "12767--12771",
1069  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1070  volume        = "99",
1071  number        = "C6",
1072  author        = "R. J. Greatbatch",
1073  year          = "1994",
1074  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1075  issn          = "0148-0227",
1076  doi           = "10.1029/94jc00847"
1077}
1078
1079@article{         griffies.biastoch.ea_OM09,
1080  title         = "Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)",
1081  pages         = "1--46",
1082  journal       = "Ocean Modelling",
1083  volume        = "26",
1084  number        = "1-2",
1085  author        = "S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and F.
1086                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1087                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1088                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1089                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1090                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1091                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin",
1092  year          = "2009",
1093  month         = "jan",
1094  publisher     = "Elsevier BV",
1095  issn          = "1463-5003",
1096  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.08.007"
1097}
1098
1099@article{         griffies.gnanadesikan.ea_JPO98,
1100  title         = "Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model",
1101  pages         = "805--830",
1102  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1103  volume        = "28",
1104  number        = "5",
1105  author        = "S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1106                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
1107  year          = "1998",
1108  month         = "may",
1109  publisher     = "American Meteorological Society",
1110  issn          = "1520-0485",
1111  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2"
1112}
1113
1114@article{         griffies.pacanowski.ea_MWR01,
1115  title         = "Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1116                  for z-coordinate Ocean Models",
1117  pages         = "1081--1098",
1118  journal       = "Monthly Weather Review",
1119  volume        = "129",
1120  number        = "5",
1121  author        = "S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1122                  Balaji",
1123  year          = "2001",
1124  month         = "may",
1125  publisher     = "American Meteorological Society",
1126  issn          = "1520-0493",
1127  doi           = "10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2"
1128}
1129
1130@article{         griffies_JPO98,
1131  title         = "The Gent-McWilliams skew-flux",
1132  pages         = "831--841",
1133  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1134  volume        = "28",
1135  number        = "5",
1136  author        = "S. M. Griffies",
1137  year          = "1998",
1138  month         = "may",
1139  publisher     = "American Meteorological Society",
1140  issn          = "1520-0485",
1141  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2"
1142}
1143
1144@book{            griffies_bk04,
1145  pages         = "434",
1146  booktitle     = "Fundamentals of ocean climate models",
1147  author        = "S. M. Griffies",
1148  year          = "2004",
1149  month         = "dec",
1150  publisher     = "Princeton University Press",
1151  isbn          = "978-0-691-18712-9",
1152  doi           = "10.2307/j.ctv301gzg"
1153}
1154
1155@article{         guilyardi.madec.ea_CD01,
1156  title         = "The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1157                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}",
1158  pages         = "589--599",
1159  journal       = "Climate Dynamics",
1160  volume        = "17",
1161  number        = "8",
1162  author        = "E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray",
1163  year          = "2001",
1164  month         = "may",
1165  publisher     = "Springer Science and Business Media LLC",
1166  issn          = "0930-7575",
1167  doi           = "10.1007/pl00007930"
1168}
1169
1170@article{         haney_JPO91,
1171  title         = "On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
1172                  Sigma Coordinate Ocean Models",
1173  pages         = "610--619",
1174  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1175  volume        = "21",
1176  number        = "4",
1177  author        = "R. L. Haney",
1178  year          = "1991",
1179  month         = "apr",
1180  publisher     = "American Meteorological Society",
1181  issn          = "1520-0485",
1182  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2"
1183}
1184
1185@article{         hazeleger.drijfhout_JGR00,
1186  title         = "A model study on internally generated variability in
1187                  subtropical mode water formation",
1188  pages         = "13965--13979",
1189  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1190  volume        = "105",
1191  number        = "C6",
1192  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1193  year          = "2000",
1194  month         = "jun",
1195  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1196  issn          = "0148-0227",
1197  doi           = "10.1029/2000jc900041"
1198}
1199
1200@article{         hazeleger.drijfhout_JPO00,
1201  title         = "Eddy subduction in a model of the subtropical gyre",
1202  pages         = "677--695",
1203  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1204  volume        = "30",
1205  number        = "4",
1206  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1207  year          = "2000",
1208  month         = "apr",
1209  publisher     = "American Meteorological Society",
1210  issn          = "1520-0485",
1211  doi           = "10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2"
1212}
1213
1214@article{         hazeleger.drijfhout_JPO98,
1215  title         = "Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
1216                  response to anomalous forcing",
1217  pages         = "266--288",
1218  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1219  volume        = "28",
1220  number        = "2",
1221  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1222  year          = "1998",
1223  month         = "feb",
1224  publisher     = "American Meteorological Society",
1225  issn          = "1520-0485",
1226  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2"
1227}
1228
1229@article{         hazeleger.drijfhout_JPO99,
1230  title         = "Stochastically forced mode water variability",
1231  pages         = "1772--1786",
1232  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1233  volume        = "29",
1234  number        = "8",
1235  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1236  year          = "1999",
1237  month         = "aug",
1238  publisher     = "American Meteorological Society",
1239  issn          = "1520-0485",
1240  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2"
1241}
1242
1243@article{         he.ding_JS01,
1244  title         = "Using accurate arithmetics to improve numerical
1245                  reproducibility and stability in parallel applications",
1246  pages         = "259--277",
1247  journal       = "The Journal of Supercomputing",
1248  volume        = "18",
1249  number        = "3",
1250  author        = "Y. He and C. H. Q. Ding",
1251  year          = "2001",
1252  publisher     = "Springer Nature",
1253  issn          = "0920-8542",
1254  doi           = "10.1023/a:1008153532043"
1255}
1256
1257@article{         hirt.amsden.ea_JCP74,
1258  title         = "An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
1259                  flow speeds",
1260  pages         = "227--253",
1261  journal       = "Journal of Computational Physics",
1262  volume        = "14",
1263  number        = "3",
1264  author        = "C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook",
1265  year          = "1974",
1266  month         = "mar",
1267  publisher     = "Elsevier BV",
1268  issn          = "0021-9991",
1269  doi           = "10.1016/0021-9991(74)90051-5"
1270}
1271
1272@article{         hofmeister.burchard.ea_OM10,
1273  title         = "Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
1274                  ocean models",
1275  pages         = "70--86",
1276  journal       = "Ocean Modelling",
1277  volume        = "33",
1278  number        = "1-2",
1279  author        = "R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers",
1280  year          = "2010",
1281  month         = "jan",
1282  publisher     = "Elsevier BV",
1283  issn          = "1463-5003",
1284  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.12.003"
1285}
1286
1287@article{         holland.jenkins_JPO99,
1288  title         = "Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the base
1289                  of an ice shelf",
1290  pages         = "1787--1800",
1291  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1292  volume        = "29",
1293  number        = "8",
1294  author        = "D. M. Holland and A. Jenkins",
1295  year          = "1999",
1296  month         = "aug",
1297  publisher     = "American Meteorological Society",
1298  issn          = "1520-0485",
1299  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2"
1300}
1301
1302@techreport{      hunter_rpt06,
1303  title         = "Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities",
1304  pages         = "17",
1305  number        = "7",
1306  author        = "J. R. Hunter",
1307  institution   = "Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
1308                  Centre",
1309  year          = "2006",
1310  month         = "jun",
1311  url           = "http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf"
1312}
1313
1314@book{            ioc.iapso_bk10,
1315  title         = "The international thermodynamic equation of seawater -
1316                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties",
1317  pages         = "196",
1318  editor        = "Intergovernmental Oceanographic Commission",
1319  series        = "Manuals and Guides",
1320  volume        = "56",
1321  author        = "IOC, SCOR and IAPSO",
1322  year          = "2010",
1323  month         = "mar",
1324  publisher     = "UNESCO",
1325  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en"
1326}
1327
1328@article{         jackson.rehmann_JPO14,
1329  title         = "Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
1330                  a sheared, stratified flow",
1331  pages         = "2661--2680",
1332  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1333  volume        = "44",
1334  number        = "10",
1335  author        = "P. R. Jackson and C. R. Rehmann",
1336  year          = "2014",
1337  month         = "oct",
1338  publisher     = "American Meteorological Society",
1339  issn          = "1520-0485",
1340  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0027.1"
1341}
1342
1343@techreport{      janssen.breivik.ea_rpt13,
1344  title         = "Air-sea interaction and surface waves",
1345  pages         = "36",
1346  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
1347  volume        = "712",
1348  author        = "P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
1349                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
1350                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni",
1351  institution   = "ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom",
1352  year          = "2013",
1353  month         = "nov",
1354  doi           = "10.21957/0kg73joh"
1355}
1356
1357@article{         jenkins.nicholls.ea_JPO10,
1358  title         = "Observation and parameterization of ablation at the base
1359                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica",
1360  pages         = "2298--2312",
1361  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1362  volume        = "40",
1363  number        = "10",
1364  author        = "A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr",
1365  year          = "2010",
1366  month         = "oct",
1367  publisher     = "American Meteorological Society",
1368  issn          = "1520-0485",
1369  doi           = "10.1175/2010jpo4317.1"
1370}
1371
1372@article{         jenkins_JGR91,
1373  title         = "A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction",
1374  pages         = "20671--20677",
1375  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1376  volume        = "96",
1377  number        = "C11",
1378  author        = "A. Jenkins",
1379  year          = "1991",
1380  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1381  issn          = "0148-0227",
1382  doi           = "10.1029/91jc01842"
1383}
1384
1385@article{         kantha.carniel_JMR03,
1386  title         = "Comments on ``{A} generic length-scale equation for
1387                  geophysical turbulence models'' by {L}. Umlauf and {H}.
1388                  Burchard",
1389  pages         = "693--702",
1390  journal       = "Journal of Marine Research",
1391  volume        = "61",
1392  number        = "5",
1393  author        = "L. Kantha and S. Carniel",
1394  year          = "2003",
1395  month         = "sep",
1396  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1397  issn          = "1543-9542",
1398  doi           = "10.1357/002224003771816007"
1399}
1400
1401@article{         kantha.clayson_JGR94,
1402  title         = "An improved mixed layer model for geophysical
1403                  applications",
1404  pages         = "25235--25266",
1405  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1406  volume        = "99",
1407  number        = "C12",
1408  author        = "L. H. Kantha and C. A. Clayson",
1409  year          = "1994",
1410  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1411  issn          = "0148-0227",
1412  doi           = "10.1029/94jc02257"
1413}
1414
1415@article{         kasahara_MWR74,
1416  title         = "Various vertical coordinate systems used for numerical
1417                  weather prediction",
1418  pages         = "509--522",
1419  journal       = "Monthly Weather Review",
1420  volume        = "102",
1421  number        = "7",
1422  author        = "A. Kasahara",
1423  year          = "1974",
1424  month         = "jul",
1425  publisher     = "American Meteorological Society",
1426  issn          = "1520-0493",
1427  doi           = "10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2"
1428}
1429
1430@article{         killworth.webb.ea_JPO91,
1431  title         = "The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner ocean
1432                  model",
1433  pages         = "1333--1348",
1434  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1435  volume        = "21",
1436  number        = "9",
1437  author        = "P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
1438                  Paterson",
1439  year          = "1991",
1440  month         = "sep",
1441  publisher     = "American Meteorological Society",
1442  issn          = "1520-0485",
1443  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2"
1444}
1445
1446@article{         killworth_JPO92,
1447  title         = "An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
1448                  Antarctic model",
1449  pages         = "1379--1387",
1450  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1451  volume        = "22",
1452  number        = "11",
1453  author        = "P. D. Killworth",
1454  year          = "1992",
1455  month         = "nov",
1456  publisher     = "American Meteorological Society",
1457  issn          = "1520-0485",
1458  doi           = "10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2"
1459}
1460
1461@inproceedings{   killworth_iprc89,
1462  title         = "On the parameterization of deep convection in ocean
1463                  models",
1464  pages         = "59--74",
1465  booktitle     = "Parameterization of small-scale processes",
1466  editor        = "P. Muller and D. Henderson",
1467  author        = "P. D. Killworth",
1468  year          = "1989",
1469  month         = "jan",
1470  publisher     = "Hawaii Institute of Geophysics",
1471  url           = "http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf"
1472}
1473
1474@article{         koch-larrouy.lengaigne.ea_CD10,
1475  title         = "Tidal mixing in the Indonesian Seas and its effect on the
1476                  tropical climate system",
1477  pages         = "891--904",
1478  journal       = "Climate Dynamics",
1479  volume        = "34",
1480  number        = "6",
1481  author        = "A. Koch-Larrouy and M. Lengaigne and P. Terray and G.
1482                  Madec and S. Masson",
1483  year          = "2010",
1484  month         = "aug",
1485  publisher     = "Springer Nature",
1486  issn          = "1432-0894",
1487  doi           = "10.1007/s00382-009-0642-4"
1488}
1489
1490@article{         koch-larrouy.madec.ea_GRL07,
1491  title         = "On the transformation of Pacific water into Indonesian
1492                  ThroughFlow water by internal tidal mixing",
1493  pages         = "L04604",
1494  journal       = "Geophysical Research Letters",
1495  volume        = "34",
1496  number        = "4",
1497  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
1498                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard",
1499  year          = "2007",
1500  month         = "feb",
1501  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1502  issn          = "0094-8276",
1503  doi           = "10.1029/2006gl028405"
1504}
1505
1506@article{         koch-larrouy.madec.ea_OD08*a,
1507  title         = "Water mass transformation along the Indonesian ThroughFlow
1508                  in an {OGCM}",
1509  pages         = "289--309",
1510  journal       = "Ocean Dynamics",
1511  volume        = "58",
1512  number        = "3-4",
1513  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and B. Blanke and R. Molcard",
1514  year          = "2008",
1515  month         = "oct",
1516  publisher     = "Springer Nature",
1517  issn          = "1616-7228",
1518  doi           = "10.1007/s10236-008-0155-4"
1519}
1520
1521@article{         koch-larrouy.madec.ea_OD08*b,
1522  title         = "Physical processes contributing to the water mass
1523                  transformation of the Indonesian ThroughFlow",
1524  pages         = "275--288",
1525  journal       = "Ocean Dynamics",
1526  volume        = "58",
1527  number        = "3-4",
1528  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and D. Iudicone and A.
1529                  Atmadipoera and R. Molcard",
1530  year          = "2008",
1531  month         = "oct",
1532  publisher     = "Springer Nature",
1533  issn          = "1616-7228",
1534  doi           = "10.1007/s10236-008-0154-5"
1535}
1536
1537@article{         kolmogorov_IANS42,
1538  title         = "Equations of turbulent motion in an incompressible fluid",
1539  pages         = "56--58",
1540  journal       = "Izvestiya Akademiya Nauk SSSR",
1541  series        = "Fizika",
1542  volume        = "6",
1543  author        = "A. N. Kolmogorov",
1544  year          = "1942"
1545}
1546
1547@techreport{      large.yeager_rpt04,
1548  title         = "Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
1549                  models: the data sets and flux climatologies",
1550  author        = "W. G. Large and S. G. Yeager",
1551  institution   = "{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO,
1552                  United States",
1553  year          = "2004",
1554  month         = "may",
1555  doi           = "10.5065/d6kk98q6"
1556}
1557
1558@article{         lazar.madec.ea_JPO99,
1559  title         = "The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
1560                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}",
1561  pages         = "2945--2961",
1562  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1563  volume        = "29",
1564  number        = "11",
1565  author        = "A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
1566  year          = "1999",
1567  month         = "nov",
1568  publisher     = "American Meteorological Society",
1569  issn          = "1520-0485",
1570  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2"
1571}
1572
1573@phdthesis{       lazar_phd97,
1574  title         = "La branche froide de la circulation thermohaline -
1575                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
1576                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale
1577                  id\'{e}alis\'{e}e",
1578  pages         = "269",
1579  author        = "A. Lazar",
1580  school        = "Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France",
1581  year          = "1997",
1582  url           = "http://www.theses.fr/1997PA066680"
1583}
1584
1585@article{         le-sommer.penduff.ea_OM09,
1586  title         = "How momentum advection schemes influence
1587                  current-topography interactions at eddy permitting
1588                  resolution",
1589  pages         = "1--14",
1590  journal       = "Ocean Modelling",
1591  volume        = "29",
1592  number        = "1",
1593  author        = "J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
1594                  and B. Barnier",
1595  year          = "2009",
1596  month         = "jan",
1597  publisher     = "Elsevier BV",
1598  issn          = "1463-5003",
1599  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.11.007"
1600}
1601
1602@article{         leclair.madec_OM09,
1603  title         = "A conservative leapfrog time stepping method",
1604  pages         = "88--94",
1605  journal       = "Ocean Modelling",
1606  volume        = "30",
1607  number        = "2-3",
1608  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1609  year          = "2009",
1610  month         = "jan",
1611  publisher     = "Elsevier BV",
1612  issn          = "1463-5003",
1613  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.06.006"
1614}
1615
1616@article{         leclair.madec_OM11,
1617  title         = "$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
1618                  coordinate separating high and low frequency motions",
1619  pages         = "139--152",
1620  journal       = "Ocean Modelling",
1621  volume        = "37",
1622  number        = "3-4",
1623  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1624  year          = "2011",
1625  publisher     = "Elsevier BV",
1626  issn          = "1463-5003",
1627  doi           = "10.1016/j.ocemod.2011.02.001"
1628}
1629
1630@phdthesis{       leclair_phd10,
1631  title         = "Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
1632                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an
1633                  {NEMO}",
1634  pages         = "163",
1635  author        = "M. Leclair",
1636  school        = "Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France",
1637  year          = "2010",
1638  url           = "http://www.theses.fr/2010PA066728"
1639}
1640
1641@article{         lele_JCP92,
1642  title         = "Compact finite difference schemes with spectral-like
1643                  resolution",
1644  pages         = "16--42",
1645  journal       = "Journal of Computational Physics",
1646  volume        = "103",
1647  number        = "1",
1648  author        = "S. K. Lele",
1649  year          = "1992",
1650  month         = "nov",
1651  publisher     = "Elsevier BV",
1652  issn          = "0021-9991",
1653  doi           = "10.1016/0021-9991(92)90324-r"
1654}
1655
1656@article{         lemarie.debreu.ea_OM12,
1657  title         = "On the stability and accuracy of the harmonic and
1658                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models",
1659  pages         = "9--35",
1660  journal       = "Ocean Modelling",
1661  volume        = "52-53",
1662  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
1663                  C. McWilliams",
1664  year          = "2012",
1665  month         = "aug",
1666  publisher     = "Elsevier BV",
1667  issn          = "1463-5003",
1668  doi           = "10.1016/j.ocemod.2012.04.007"
1669}
1670
1671@article{         lemarie.debreu.ea_OM15,
1672  title         = "Stability constraints for oceanic numerical models:
1673                  implications for the formulation of time and space
1674                  discretizations",
1675  pages         = "124--148",
1676  journal       = "Ocean Modelling",
1677  volume        = "92",
1678  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
1679                  and J. M. Molines and M. Honnorat",
1680  year          = "2015",
1681  month         = "aug",
1682  publisher     = "Elsevier BV",
1683  issn          = "1463-5003",
1684  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.06.006"
1685}
1686
1687@article{         lengaigne.madec.ea_JGR03,
1688  title         = "Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
1689                  circulation",
1690  pages         = "3345",
1691  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1692  volume        = "108",
1693  number        = "C11",
1694  author        = "M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes",
1695  year          = "2003",
1696  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1697  issn          = "0148-0227",
1698  doi           = "10.1029/2002jc001704"
1699}
1700
1701@article{         lengaigne.menkes.ea_CD07,
1702  title         = "Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
1703                  climate in a Coupled General Circulation Model",
1704  pages         = "503--516",
1705  journal       = "Climate Dynamics",
1706  volume        = "28",
1707  number        = "5",
1708  author        = "M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
1709                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec",
1710  year          = "2007",
1711  month         = "nov",
1712  publisher     = "Springer Nature",
1713  issn          = "1432-0894",
1714  doi           = "10.1007/s00382-006-0200-2"
1715}
1716
1717@article{         leonard_CMAME79,
1718  title         = "A stable and accurate convective modelling procedure based
1719                  on quadratic upstream interpolation",
1720  pages         = "59--98",
1721  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1722  volume        = "19",
1723  number        = "1",
1724  author        = "B. P. Leonard",
1725  year          = "1979",
1726  month         = "jun",
1727  publisher     = "Elsevier BV",
1728  issn          = "0045-7825",
1729  doi           = "10.1016/0045-7825(79)90034-3"
1730}
1731
1732@article{         leonard_CMAME91,
1733  title         = "The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
1734                  unsteady one-dimensional advection",
1735  pages         = "17--74",
1736  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1737  volume        = "88",
1738  number        = "1",
1739  author        = "B. P. Leonard",
1740  year          = "1991",
1741  month         = "jun",
1742  publisher     = "Elsevier BV",
1743  issn          = "0045-7825",
1744  doi           = "10.1016/0045-7825(91)90232-u"
1745}
1746
1747@article{         lermusiaux_JMS01,
1748  title         = "Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
1749                  ocean variability: Massachusetts Bay",
1750  pages         = "385--422",
1751  journal       = "Journal of Marine Systems",
1752  volume        = "29",
1753  number        = "1-4",
1754  author        = "P. F. J. Lermusiaux",
1755  year          = "2001",
1756  month         = "may",
1757  publisher     = "Elsevier BV",
1758  issn          = "0924-7963",
1759  doi           = "10.1016/s0924-7963(01)00025-2"
1760}
1761
1762@techreport{      levier.treguier.ea_rpt07,
1763  title         = "Free surface and variable volume in the {NEMO} code",
1764  pages         = "47",
1765  author        = "B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
1766                  Garnier",
1767  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
1768                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
1769  year          = "2007",
1770  month         = "may",
1771  doi           = "10.5281/zenodo.3244182"
1772}
1773
1774@article{         levy.estublier.ea_GRL01,
1775  title         = "Choice of an advection scheme for biogeochemical models",
1776  pages         = "3725--3728",
1777  journal       = "Geophysical Research Letters",
1778  volume        = "28",
1779  number        = "19",
1780  author        = "M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec",
1781  year          = "2001",
1782  month         = "oct",
1783  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1784  issn          = "0094-8276",
1785  doi           = "10.1029/2001gl012947"
1786}
1787
1788@article{         levy.klein.ea_OM10,
1789  title         = "Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
1790                  physics",
1791  pages         = "1--15",
1792  journal       = "Ocean Modelling",
1793  volume        = "34",
1794  number        = "1-2",
1795  author        = "M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
1796                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi",
1797  year          = "2010",
1798  month         = "jan",
1799  publisher     = "Elsevier BV",
1800  issn          = "1463-5003",
1801  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.04.001"
1802}
1803
1804@article{         li.garrett_JMR93,
1805  title         = "Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
1806                  circulation",
1807  pages         = "737--769",
1808  journal       = "Journal of Marine Research",
1809  volume        = "51",
1810  number        = "4",
1811  author        = "M. Li and C. Garrett",
1812  year          = "1993",
1813  month         = "nov",
1814  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1815  issn          = "1543-9542",
1816  doi           = "10.1357/0022240933223945"
1817}
1818
1819@article{         losch_JGR08,
1820  title         = "Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
1821                  General Circulation Model",
1822  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1823  volume        = "113",
1824  number        = "C8",
1825  author        = "M. Losch",
1826  year          = "2008",
1827  month         = "aug",
1828  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1829  issn          = "0148-0227",
1830  doi           = "10.1029/2007jc004368"
1831}
1832
1833@article{         lott.madec.ea_OM90,
1834  title         = "Topographic experiments in an Ocean General Circulation
1835                  Model",
1836  pages         = "1--4",
1837  journal       = "Ocean Modelling",
1838  volume        = "88",
1839  author        = "F. Lott and G. Madec and J. Verron",
1840  year          = "1990"
1841}
1842
1843@article{         madec.chartier.ea_DAO91,
1844  title         = "The effect of thermohaline forcing variability on deep
1845                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
1846                  high-resolution three-dimensional numerical study",
1847  pages         = "301--332",
1848  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
1849  volume        = "15",
1850  number        = "3-5",
1851  author        = "G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon",
1852  year          = "1991",
1853  month         = "apr",
1854  publisher     = "Elsevier BV",
1855  issn          = "0377-0265",
1856  doi           = "10.1016/0377-0265(91)90024-a"
1857}
1858
1859@inproceedings{   madec.crepon_iprc91,
1860  title         = "Thermohaline-driven deep water formation in the
1861                  northwestern Mediterranean Sea",
1862  chapter       = "15",
1863  pages         = "241--265",
1864  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
1865                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
1866                  deep convection and deep water formation in the oceans",
1867  editor        = "P.C. Chu and J.C. Gascard",
1868  series        = "Elsevier Oceanography",
1869  volume        = "57",
1870  author        = "G. Madec and M. Cr\'{e}pon",
1871  year          = "1991",
1872  publisher     = "Elsevier",
1873  issn          = "0422-9894",
1874  isbn          = "978-0-444-88764-1",
1875  doi           = "10.1016/s0422-9894(08)70071-0"
1876}
1877
1878@article{         madec.delecluse.ea_JPO91,
1879  title         = "A three-dimensional numerical study of deep-water
1880                  formation in the northwestern Mediterranean Sea",
1881  pages         = "1349--1371",
1882  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1883  volume        = "21",
1884  number        = "9",
1885  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
1886                  Chartier",
1887  year          = "1991",
1888  month         = "sep",
1889  publisher     = "American Meteorological Society",
1890  issn          = "1520-0485",
1891  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2"
1892}
1893
1894@article{         madec.delecluse.ea_JPO96,
1895  title         = "Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
1896                  northwestern Mediterranean Sea",
1897  pages         = "1393--1408",
1898  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1899  volume        = "26",
1900  number        = "8",
1901  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
1902                  Lott",
1903  year          = "1996",
1904  month         = "aug",
1905  publisher     = "American Meteorological Society",
1906  issn          = "1520-0485",
1907  doi           = "10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2"
1908}
1909
1910@book{            madec.delecluse.ea_NPM98,
1911  title         = "{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
1912                  manual",
1913  pages         = "91",
1914  journal       = "Note du Pole de Mod\'{e}lisation",
1915  volume        = "11",
1916  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
1917                  L\'{e}vy",
1918  year          = "1998",
1919  publisher     = "Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})",
1920  issn          = "1288-1619",
1921  url           = "http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf"
1922}
1923
1924@article{         madec.delecluse_IWN97,
1925  title         = "The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
1926                  Coupled Model",
1927  pages         = "12--15",
1928  journal       = "International WOCE Newsletter",
1929  volume        = "26",
1930  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
1931  year          = "1997",
1932  month         = "apr",
1933  publisher     = "University of Southampton",
1934  url           = "https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf"
1935}
1936
1937@article{         madec.imbard_CD96,
1938  title         = "A global ocean mesh to overcome the North Pole
1939                  singularity",
1940  pages         = "381--388",
1941  journal       = "Climate Dynamics",
1942  volume        = "12",
1943  number        = "6",
1944  author        = "G. Madec and M. Imbard",
1945  year          = "1996",
1946  month         = "may",
1947  publisher     = "Springer Nature",
1948  issn          = "1432-0894",
1949  doi           = "10.1007/bf00211684"
1950}
1951
1952@article{         maltrud.smith.ea_JGR98,
1953  title         = "Global eddy-resolving ocean simulations driven by
1954                  1985-1995 atmospheric winds",
1955  pages         = "30825--30853",
1956  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1957  volume        = "103",
1958  number        = "C13",
1959  author        = "M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
1960                  Malone",
1961  year          = "1998",
1962  month         = "dec",
1963  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1964  issn          = "0148-0227",
1965  doi           = "10.1029/1998jc900013"
1966}
1967
1968@article{         marchesiello.mcwilliams.ea_OM01,
1969  title         = "Open boundary conditions for long-term integration of
1970                  regional oceanic models",
1971  pages         = "1--20",
1972  journal       = "Ocean Modelling",
1973  volume        = "3",
1974  number        = "1-2",
1975  author        = "P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin",
1976  year          = "2001",
1977  month         = "jan",
1978  publisher     = "Elsevier BV",
1979  issn          = "1463-5003",
1980  doi           = "10.1016/s1463-5003(00)00013-5"
1981}
1982
1983@article{         marsaleix.auclair.ea_OM08,
1984  title         = "Energy conservation issues in sigma-coordinate
1985                  free-surface ocean models",
1986  pages         = "61--89",
1987  journal       = "Ocean Modelling",
1988  volume        = "20",
1989  number        = "1",
1990  author        = "P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
1991                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses",
1992  year          = "2008",
1993  month         = "jan",
1994  publisher     = "Elsevier BV",
1995  issn          = "1463-5003",
1996  doi           = "10.1016/j.ocemod.2007.07.005"
1997}
1998
1999@article{         marsh.ivchenko.ea_GMD15,
2000  title         = "{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
2001                  ocean model globally configured at eddy-permitting
2002                  resolution",
2003  pages         = "1547--1562",
2004  journal       = "Geoscientific Model Development",
2005  volume        = "8",
2006  number        = "5",
2007  author        = "R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
2008                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
2009                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. {Le Sommer} and N.
2010                  Merino and V. B. Zalesny",
2011  year          = "2015",
2012  month         = "may",
2013  publisher     = "Copernicus GmbH",
2014  issn          = "1991-9603",
2015  doi           = "10.5194/gmd-8-1547-2015"
2016}
2017
2018@article{         marti.madec.ea_JGR92,
2019  title         = "Comment on ``{N}et diffusivity in ocean general
2020                  circulation models with nonuniform grids'' by {F}. {L}. Yin
2021                  and {I}. {Y}. Fung",
2022  pages         = "12763--12766",
2023  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2024  volume        = "97",
2025  number        = "C8",
2026  author        = "O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
2027  year          = "1992",
2028  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2029  issn          = "0148-0227",
2030  doi           = "10.1029/92jc00306"
2031}
2032
2033@article{         martin.adcroft_OM10,
2034  title         = "Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
2035                  with interactive icebergs in a coupled climate model",
2036  pages         = "111--124",
2037  journal       = "Ocean Modelling",
2038  volume        = "34",
2039  number        = "3-4",
2040  author        = "T. Martin and A. Adcroft",
2041  year          = "2010",
2042  month         = "jan",
2043  publisher     = "Elsevier BV",
2044  issn          = "1463-5003",
2045  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.05.001"
2046}
2047
2048@article{         mathiot.jenkins.ea_GMD17,
2049  title         = "Explicit representation and parametrised impacts of under
2050                  ice shelf seas in the \zstar coordinate ocean model {NEMO}
2051                  3.6",
2052  pages         = "2849--2874",
2053  journal       = "Geoscientific Model Development",
2054  volume        = "10",
2055  number        = "7",
2056  author        = "P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec",
2057  year          = "2017",
2058  month         = "jul",
2059  publisher     = "Copernicus GmbH",
2060  issn          = "1991-9603",
2061  doi           = "10.5194/gmd-10-2849-2017"
2062}
2063
2064@article{         mcdougall.taylor_JMR84,
2065  title         = "Flux measurements across a finger interface at low values
2066                  of the stability ratio",
2067  pages         = "1--14",
2068  journal       = "Journal of Marine Research",
2069  volume        = "42",
2070  number        = "1",
2071  author        = "T. J. McDougall and J. R. Taylor",
2072  year          = "1984",
2073  month         = "feb",
2074  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2075  issn          = "1543-9542",
2076  doi           = "10.1357/002224084788506095"
2077}
2078
2079@article{         mcdougall_JPO87,
2080  title         = "Neutral Surfaces",
2081  pages         = "1950--1964",
2082  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2083  volume        = "17",
2084  number        = "11",
2085  author        = "T. J. McDougall",
2086  year          = "1987",
2087  month         = "nov",
2088  publisher     = "American Meteorological Society",
2089  issn          = "1520-0485",
2090  doi           = "10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2"
2091}
2092
2093@article{         mellor.blumberg_JPO04,
2094  title         = "Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response",
2095  pages         = "693--698",
2096  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2097  volume        = "34",
2098  number        = "3",
2099  author        = "G. Mellor and A. Blumberg",
2100  year          = "2004",
2101  month         = "mar",
2102  publisher     = "American Meteorological Society",
2103  issn          = "1520-0485",
2104  doi           = "10.1175/2517.1"
2105}
2106
2107@article{         mellor.yamada_RG82,
2108  title         = "Development of a turbulence closure model for geophysical
2109                  fluid problems",
2110  pages         = "851--875",
2111  journal       = "Reviews of Geophysics",
2112  volume        = "20",
2113  number        = "4",
2114  author        = "G. L. Mellor and T. Yamada",
2115  year          = "1982",
2116  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2117  issn          = "8755-1209",
2118  doi           = "10.1029/rg020i004p00851"
2119}
2120
2121@article{         merryfield.holloway.ea_JPO99,
2122  title         = "A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing",
2123  pages         = "1124--1142",
2124  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2125  volume        = "29",
2126  number        = "6",
2127  author        = "W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett",
2128  year          = "1999",
2129  month         = "jun",
2130  publisher     = "American Meteorological Society",
2131  issn          = "1520-0485",
2132  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2"
2133}
2134
2135@book{            mesinger.arakawa_bk76,
2136  booktitle     = "Numerical methods used in atmospheric models",
2137  series        = "GARP Publication",
2138  volume        = "1",
2139  number        = "17",
2140  author        = "F. Mesinger and A. Arakawa",
2141  year          = "1976",
2142  month         = "aug",
2143  url           = "https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models"
2144}
2145
2146@article{         morel.berthon_LO89,
2147  title         = "Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
2148                  production of the euphotic layer: Relationships
2149                  reinvestigated in view of remote-sensing applications",
2150  pages         = "1545--1562",
2151  journal       = "Limnology and Oceanography",
2152  volume        = "34",
2153  number        = "8",
2154  author        = "A. Morel and J.-F. Berthon",
2155  year          = "1989",
2156  month         = "dec",
2157  publisher     = "Wiley",
2158  issn          = "0024-3590",
2159  doi           = "10.4319/lo.1989.34.8.1545"
2160}
2161
2162@article{         morel.maritorena_JGR01,
2163  title         = "Bio-optical properties of oceanic waters: {A} reappraisal",
2164  pages         = "7163--7180",
2165  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2166  volume        = "106",
2167  number        = "C4",
2168  author        = "A. Morel and S. Maritorena",
2169  year          = "2001",
2170  month         = "apr",
2171  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2172  issn          = "0148-0227",
2173  doi           = "10.1029/2000jc000319"
2174}
2175
2176@article{         morel_JGR88,
2177  title         = "Optical modeling of the upper ocean in relation to its
2178                  biogenous matter content (case {I} waters)",
2179  pages         = "10749--10768",
2180  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2181  volume        = "93",
2182  number        = "C9",
2183  author        = "A. Morel",
2184  year          = "1988",
2185  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2186  issn          = "0148-0227",
2187  doi           = "10.1029/jc093ic09p10749"
2188}
2189
2190@article{         murray_JCP96,
2191  title         = "Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models",
2192  pages         = "251--273",
2193  journal       = "Journal of Computational Physics",
2194  volume        = "126",
2195  number        = "2",
2196  author        = "R. J. Murray",
2197  year          = "1996",
2198  month         = "jul",
2199  publisher     = "Elsevier BV",
2200  issn          = "0021-9991",
2201  doi           = "10.1006/jcph.1996.0136"
2202}
2203
2204@article{         oey_OM06,
2205  title         = "An {OGCM} with movable land-sea boundaries",
2206  pages         = "176--195",
2207  journal       = "Ocean Modelling",
2208  volume        = "13",
2209  number        = "2",
2210  author        = "L.-Y. Oey",
2211  year          = "2006",
2212  month         = "jan",
2213  publisher     = "Elsevier BV",
2214  issn          = "1463-5003",
2215  doi           = "10.1016/j.ocemod.2006.01.001"
2216}
2217
2218@article{         osborn_JPO80,
2219  title         = "Estimates of the local rate of vertical diffusion from
2220                  dissipation measurements",
2221  pages         = "83--89",
2222  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2223  volume        = "10",
2224  number        = "1",
2225  author        = "T. R. Osborn",
2226  year          = "1980",
2227  month         = "jan",
2228  publisher     = "American Meteorological Society",
2229  issn          = "1520-0485",
2230  doi           = "10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2"
2231}
2232
2233@article{         pacanowski.gnanadesikan_MWR98,
2234  title         = "Transient response in a z-level ocean model that resolves
2235                  topography with partial-cells",
2236  pages         = "3248--3270",
2237  journal       = "Monthly Weather Review",
2238  volume        = "126",
2239  number        = "12",
2240  author        = "R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan",
2241  year          = "1998",
2242  month         = "dec",
2243  publisher     = "American Meteorological Society",
2244  issn          = "1520-0493",
2245  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2"
2246}
2247
2248@article{         pacanowski.philander_JPO81,
2249  title         = "Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
2250                  Tropical Oceans",
2251  pages         = "1443--1451",
2252  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2253  volume        = "11",
2254  number        = "11",
2255  author        = "R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander",
2256  year          = "1981",
2257  month         = "nov",
2258  publisher     = "American Meteorological Society",
2259  issn          = "1520-0485",
2260  doi           = "10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2"
2261}
2262
2263@article{         paulson.simpson_JPO77,
2264  title         = "Irradiance Measurements in the Upper Ocean",
2265  pages         = "952--956",
2266  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2267  volume        = "7",
2268  number        = "6",
2269  author        = "C. A. Paulson and J. J. Simpson",
2270  year          = "1977",
2271  month         = "nov",
2272  publisher     = "American Meteorological Society",
2273  issn          = "1520-0485",
2274  doi           = "10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2"
2275}
2276
2277@article{         penduff.le-sommer.ea_OS07,
2278  title         = "Influence of numerical schemes on current-topography
2279                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations",
2280  pages         = "509--524",
2281  journal       = "Ocean Science",
2282  volume        = "3",
2283  number        = "4",
2284  author        = "T. Penduff and J. {Le Sommer} and B. Barnier and A.-M.
2285                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec",
2286  year          = "2007",
2287  month         = "dec",
2288  publisher     = "Copernicus GmbH",
2289  issn          = "1812-0792",
2290  doi           = "10.5194/os-3-509-2007"
2291}
2292
2293@article{         phillips_TAMS59,
2294  title         = "Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
2295                  differential equations",
2296  pages         = "193--254",
2297  journal       = "Transactions of the American Mathematical Society",
2298  volume        = "90",
2299  number        = "2",
2300  author        = "R. S. Phillips",
2301  year          = "1959",
2302  month         = "feb",
2303  publisher     = "American Mathematical Society (AMS)",
2304  issn          = "0002-9947",
2305  doi           = "10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1"
2306}
2307
2308@article{         redi_JPO82,
2309  title         = "Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation",
2310  pages         = "1154--1158",
2311  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2312  volume        = "12",
2313  number        = "10",
2314  author        = "M. H. Redi",
2315  year          = "1982",
2316  month         = "oct",
2317  publisher     = "American Meteorological Society",
2318  issn          = "1520-0485",
2319  doi           = "10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2"
2320}
2321
2322@article{         reffray.guillaume.ea_GMD15,
2323  title         = "Modelling turbulent vertical mixing sensitivity using
2324                   a 1-D version of NEMO",
2325  pages         = "69--86",
2326  journal       = "Geoscientific Model Development",
2327  volume        = "8",
2328  number        = "1",
2329  author        = "G. Reffray. and R. Bourdalle-Badie and C. Calone",
2330  year          = "2015",
2331  month         = "jan",
2332  publisher     = "Copernicus GmbH",
2333  issn          = "1991-9603",
2334  doi           = "10.5194/gmd-8-69-2015"
2335}
2336
2337@book{            richtmyer.morton_bk67,
2338  pages         = "405",
2339  booktitle     = "Difference methods for initial-value problems",
2340  edition       = "2",
2341  series        = "Interscience tracts in pure and applied mathematics",
2342  author        = "R. D. Richtmyer and K. W. Morton",
2343  year          = "1967",
2344  publisher     = "Interscience",
2345  issn          = "0074-994X",
2346  isbn          = "9780470720400",
2347  url           = "https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ"
2348}
2349
2350@article{         robert_JMSJ66,
2351  title         = "The integration of a low order spectral form of the
2352                  primitive meteorological equations",
2353  pages         = "237--245",
2354  journal       = "Journal of the Meteorological Society of Japan",
2355  volume        = "44",
2356  number        = "5",
2357  author        = "A. J. Robert",
2358  year          = "1966",
2359  publisher     = "Meteorological Society of Japan",
2360  issn          = "2186-9057",
2361  doi           = "10.2151/jmsj1965.44.5\_237"
2362}
2363
2364@article{         rodgers.aumont.ea_B14,
2365  title         = "Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
2366                  nutrient cycling to wind stirring",
2367  pages         = "4077--4098",
2368  journal       = "Biogeosciences",
2369  volume        = "11",
2370  number        = "15",
2371  author        = "K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
2372                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. {de Boyer
2373                  Mont\'{e}gut} and D. Iudicone and R. F. Keeling and G.
2374                  Madec and R. Wanninkhof",
2375  year          = "2014",
2376  month         = "aug",
2377  publisher     = "Copernicus GmbH",
2378  issn          = "1726-4189",
2379  doi           = "10.5194/bg-11-4077-2014"
2380}
2381
2382@article{         rodi_JGR87,
2383  title         = "Examples of calculation methods for flow and mixing in
2384                  stratified fluids",
2385  pages         = "5305--5328",
2386  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2387  volume        = "92",
2388  number        = "C5",
2389  author        = "W. Rodi",
2390  year          = "1987",
2391  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2392  issn          = "0148-0227",
2393  doi           = "10.1029/jc092ic05p05305"
2394}
2395
2396@article{         roquet.madec.ea_JPO15,
2397  title         = "Defining a simplified yet ``realistic'' equation of state
2398                  for seawater",
2399  pages         = "2564--2579",
2400  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2401  volume        = "45",
2402  number        = "10",
2403  author        = "F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander",
2404  year          = "2015",
2405  month         = "oct",
2406  publisher     = "American Meteorological Society",
2407  issn          = "1520-0485",
2408  doi           = "10.1175/jpo-d-15-0080.1"
2409}
2410
2411@article{         roquet.madec.ea_OM15,
2412  title         = "Accurate polynomial expressions for the density and
2413                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard",
2414  pages         = "29--43",
2415  journal       = "Ocean Modelling",
2416  volume        = "90",
2417  author        = "F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
2418                  Barker",
2419  year          = "2015",
2420  month         = "jun",
2421  publisher     = "Elsevier BV",
2422  issn          = "1463-5003",
2423  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.04.002"
2424}
2425
2426@article{         roullet.madec_JGR00,
2427  title         = "Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
2428                  new formulation for Ocean General Circulation Models",
2429  pages         = "23927--23942",
2430  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2431  volume        = "105",
2432  number        = "C10",
2433  author        = "G. Roullet and G. Madec",
2434  year          = "2000",
2435  month         = "oct",
2436  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2437  issn          = "0148-0227",
2438  doi           = "10.1029/2000jc900089"
2439}
2440
2441@article{         sarmiento.bryan_JGR82,
2442  title         = "An ocean transport model for the North Atlantic",
2443  pages         = "394--409",
2444  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2445  volume        = "87",
2446  number        = "C1",
2447  author        = "J. L. Sarmiento and K. Bryan",
2448  year          = "1982",
2449  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2450  issn          = "0148-0227",
2451  doi           = "10.1029/jc087ic01p00394"
2452}
2453
2454@article{         saunders_JAS67,
2455  title         = "The temperature at the ocean-air interface",
2456  pages         = "269--273",
2457  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2458  volume        = "24",
2459  number        = "3",
2460  author        = "P. M. Saunders",
2461  year          = "1967",
2462  month         = "may",
2463  publisher     = "American Meteorological Society",
2464  issn          = "1520-0469",
2465  doi           = "10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2"
2466}
2467
2468@article{         shchepetkin.mcwilliams_OM05,
2469  title         = "The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
2470                  split-explicit, free-surface,
2471                  topography-following-coordinate oceanic model",
2472  pages         = "347--404",
2473  journal       = "Ocean Modelling",
2474  volume        = "9",
2475  number        = "4",
2476  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2477  year          = "2005",
2478  month         = "jan",
2479  publisher     = "Elsevier BV",
2480  issn          = "1463-5003",
2481  doi           = "10.1016/j.ocemod.2004.08.002"
2482}
2483
2484@inbook{          shchepetkin.mcwilliams_ibk09,
2485  title         = "Computational kernel algorithms for fine-scale,
2486                  multiprocess, longtime oceanic simulations",
2487  chapter       = "2",
2488  pages         = "121--183",
2489  booktitle     = "Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans",
2490  editor        = "R. M. Temam and J. J. Tribbia",
2491  series        = "Handbook of Numerical Analysis",
2492  volume        = "14",
2493  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2494  year          = "2009",
2495  publisher     = "Elsevier",
2496  issn          = "1570-8659",
2497  isbn          = "9780444518934",
2498  doi           = "10.1016/s1570-8659(08)01202-0"
2499}
2500
2501@article{         shchepetkin_OM15,
2502  title         = "An Adaptive, Courant-number-dependent implicit
2503       scheme for vertical advection in oceanic modeling",
2504  pages         = "38--69",
2505  journal       = "Ocean Modelling",
2506  volume        = "91",
2507  author        = "A. F. Shchepetkin",
2508  year          = "2015",
2509  month         = "july",
2510  publisher     = "Elsevier BV",
2511  issn          = "1463-5003",
2512  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.03.006"
2513}
2514
2515@article{         siddorn.furner_OM13,
2516  title         = "An analytical stretching function that combines the best
2517                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
2518                  coordinates",
2519  pages         = "1--13",
2520  journal       = "Ocean Modelling",
2521  volume        = "66",
2522  author        = "J. R. Siddorn and R. Furner",
2523  year          = "2013",
2524  month         = "jun",
2525  publisher     = "Elsevier BV",
2526  issn          = "1463-5003",
2527  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.001"
2528}
2529
2530@article{         simmons.jayne.ea_OM04,
2531  title         = "Tidally driven mixing in a numerical model of the ocean
2532                  general circulation",
2533  pages         = "245--263",
2534  journal       = "Ocean Modelling",
2535  volume        = "6",
2536  number        = "3-4",
2537  author        = "H. L. Simmons and S. R. Jayne and L. C. {St Laurent} and
2538                  A. J. Weaver",
2539  year          = "2004",
2540  month         = "jan",
2541  publisher     = "Elsevier BV",
2542  issn          = "1463-5003",
2543  doi           = "10.1016/s1463-5003(03)00011-8"
2544}
2545
2546@article{         song.haidvogel_JCP94,
2547  title         = "A semi-implicit ocean circulation model using a
2548                  generalized topography-following coordinate system",
2549  pages         = "228--244",
2550  journal       = "Journal of Computational Physics",
2551  volume        = "115",
2552  number        = "1",
2553  author        = "Y. Song and D. Haidvogel",
2554  year          = "1994",
2555  month         = "nov",
2556  publisher     = "Elsevier BV",
2557  issn          = "0021-9991",
2558  doi           = "10.1006/jcph.1994.1189"
2559}
2560
2561@article{         song_MWR98,
2562  title         = "A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
2563                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis",
2564  pages         = "3213--3230",
2565  journal       = "Monthly Weather Review",
2566  volume        = "126",
2567  number        = "12",
2568  author        = "Y. T. Song",
2569  year          = "1998",
2570  month         = "dec",
2571  publisher     = "American Meteorological Society",
2572  issn          = "1520-0493",
2573  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2"
2574}
2575
2576@article{         st-laurent.nash_DSR04,
2577  title         = "An examination of the radiative and dissipative properties
2578                  of deep ocean internal tides",
2579  pages         = "3029--3042",
2580  journal       = "Deep Sea Research",
2581  volume        = "51",
2582  number        = "25-26",
2583  author        = "L. C. {St Laurent} and J. D. Nash",
2584  year          = "2004",
2585  month         = "dec",
2586  publisher     = "Elsevier BV",
2587  issn          = "0967-0645",
2588  doi           = "10.1016/j.dsr2.2004.09.008"
2589}
2590
2591@article{         st-laurent.simmons.ea_GRL02,
2592  title         = "Estimating tidally driven mixing in the deep ocean",
2593  pages         = "2101--2104",
2594  journal       = "Geophysical Research Letters",
2595  volume        = "29",
2596  number        = "23",
2597  author        = "L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne",
2598  year          = "2002",
2599  month         = "dec",
2600  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2601  issn          = "0094-8276",
2602  doi           = "10.1029/2002gl015633"
2603}
2604
2605@article{         stacey_JPO99,
2606  title         = "Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
2607                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness length",
2608  pages         = "1363--1367",
2609  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2610  volume        = "29",
2611  number        = "6",
2612  author        = "M. W. Stacey",
2613  year          = "1999",
2614  month         = "jun",
2615  publisher     = "American Meteorological Society",
2616  issn          = "1520-0485",
2617  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2"
2618}
2619
2620@article{         steele.morley.ea_JC01,
2621  title         = "{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
2622                  Arctic Ocean",
2623  pages         = "2079--2087",
2624  journal       = "Journal of Climate",
2625  volume        = "14",
2626  number        = "9",
2627  author        = "M. Steele and R. Morley and W. Ermold",
2628  year          = "2001",
2629  month         = "may",
2630  publisher     = "American Meteorological Society",
2631  issn          = "1520-0442",
2632  doi           = "10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2"
2633}
2634
2635@article{         stein.stein_N92,
2636  title         = "A model for the global variation in oceanic depth and heat
2637                  flow with lithospheric age",
2638  pages         = "123--129",
2639  journal       = "Nature",
2640  volume        = "359",
2641  number        = "6391",
2642  author        = "C. A. Stein and S. Stein",
2643  year          = "1992",
2644  month         = "sep",
2645  publisher     = "Springer Nature",
2646  issn          = "1476-4687",
2647  doi           = "10.1038/359123a0"
2648}
2649
2650@inbook{          stokes_ibk09,
2651  title         = "On the theory of oscillatory waves",
2652  chapter       = "12",
2653  pages         = "197--229",
2654  booktitle     = "Mathematical and Physical Papers",
2655  series        = "Cambridge Library Collection - Mathematics",
2656  volume        = "1",
2657  author        = "G. G. Stokes",
2658  year          = "2009",
2659  publisher     = "Cambridge University Press",
2660  isbn          = "9780511702242",
2661  doi           = "10.1017/cbo9780511702242.013"
2662}
2663
2664@article{         takaya.bidlot.ea_JGR10,
2665  title         = "Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
2666                  temperature",
2667  pages         = "C06009",
2668  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2669  volume        = "115",
2670  number        = "C6",
2671  author        = "Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
2672                  E. M. Janssen",
2673  year          = "2010",
2674  month         = "jun",
2675  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2676  issn          = "0148-0227",
2677  doi           = "10.1029/2009jc005985"
2678}
2679
2680@article{         talagrand_JAS72,
2681  title         = "On the damping of high-frequency motions in
2682                  four-dimensional assimilation of meteorological data",
2683  pages         = "1571--1574",
2684  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2685  volume        = "29",
2686  number        = "8",
2687  author        = "O. Talagrand",
2688  year          = "1972",
2689  month         = "nov",
2690  publisher     = "American Meteorological Society",
2691  issn          = "1520-0469",
2692  doi           = "10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2"
2693}
2694
2695@article{         treguier.dukowicz.ea_JGR96,
2696  title         = "Properties of nonuniform grids used in ocean general
2697                  circulation models",
2698  pages         = "20877--20881",
2699  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2700  volume        = "101",
2701  number        = "C9",
2702  author        = "A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan",
2703  year          = "1996",
2704  month         = "sep",
2705  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2706  issn          = "0148-0227",
2707  doi           = "10.1029/96jc01753"
2708}
2709
2710@article{         treguier.held.ea_JPO97,
2711  title         = "Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
2712                  Equation Ocean Models",
2713  pages         = "567--580",
2714  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2715  volume        = "27",
2716  number        = "4",
2717  author        = "A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev",
2718  year          = "1997",
2719  month         = "apr",
2720  publisher     = "American Meteorological Society",
2721  issn          = "1520-0485",
2722  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2"
2723}
2724
2725@article{         treguier_JGR92,
2726  title         = "Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
2727                  equation model of the North Atlantic",
2728  pages         = "687--701",
2729  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2730  volume        = "97",
2731  number        = "C1",
2732  author        = "A. M. Tr\'{e}guier",
2733  year          = "1992",
2734  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2735  issn          = "0148-0227",
2736  doi           = "10.1029/91jc02350"
2737}
2738
2739@article{         tu.tsuang_GRL05,
2740  title         = "Cool-skin simulation by a one-column ocean model",
2741  pages         = "L22602",
2742  journal       = "Geophysical Research Letters",
2743  volume        = "32",
2744  number        = "22",
2745  author        = "C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang",
2746  year          = "2005",
2747  month         = "nov",
2748  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2749  issn          = "0094-8276",
2750  doi           = "10.1029/2005gl024252"
2751}
2752
2753@article{         umlauf.burchard_CSR05,
2754  title         = "Second-order turbulence closure models for geophysical
2755                  boundary layers. {A} review of recent work",
2756  pages         = "795--827",
2757  journal       = "Continental Shelf Research",
2758  volume        = "25",
2759  number        = "7-8",
2760  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2761  year          = "2005",
2762  month         = "may",
2763  publisher     = "Elsevier BV",
2764  issn          = "0278-4343",
2765  doi           = "10.1016/j.csr.2004.08.004"
2766}
2767
2768@article{         umlauf.burchard_JMR03,
2769  title         = "A generic length-scale equation for geophysical turbulence
2770                  models",
2771  pages         = "235--265",
2772  journal       = "Journal of Marine Research",
2773  volume        = "61",
2774  number        = "2",
2775  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2776  year          = "2003",
2777  month         = "mar",
2778  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2779  issn          = "0022-2402",
2780  doi           = "10.1357/002224003322005087"
2781}
2782
2783@book{            vallis_bk06,
2784  booktitle     = "Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics",
2785  author        = "G. K. Vallis",
2786  year          = "2006",
2787  publisher     = "Cambridge University Press",
2788  isbn          = "9780511790447",
2789  doi           = "10.1017/cbo9780511790447"
2790}
2791
2792@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_OM09*a,
2793  title         = "Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2794                  Antarctic sea ice. 1. Model description and validation",
2795  pages         = "33--53",
2796  journal       = "Ocean Modelling",
2797  volume        = "27",
2798  number        = "1-2",
2799  author        = "M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse and S.
2800                  Bouillon and G. Madec and M. A. Morales Maqueda",
2801  year          = "2009",
2802  month         = "jan",
2803  publisher     = "Elsevier BV",
2804  issn          = "1463-5003",
2805  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.10.005"
2806}
2807
2808@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_OM09*b,
2809  title         = "Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2810                  Antarctic sea ice. 2. Importance of sea ice salinity
2811                  variations",
2812  pages         = "54--69",
2813  journal       = "Ocean Modelling",
2814  volume        = "27",
2815  number        = "1-2",
2816  author        = "M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse",
2817  year          = "2009",
2818  month         = "jan",
2819  publisher     = "Elsevier BV",
2820  issn          = "1463-5003",
2821  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.11.003"
2822}
2823
2824@article{         warner.defne.ea_CG13,
2825  title         = "A wetting and drying scheme for {ROMS}",
2826  pages         = "54--61",
2827  journal       = "Computers \& Geosciences",
2828  volume        = "58",
2829  author        = "J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango",
2830  year          = "2013",
2831  month         = "aug",
2832  publisher     = "Elsevier BV",
2833  issn          = "0098-3004",
2834  doi           = "10.1016/j.cageo.2013.05.004"
2835}
2836
2837@article{         warner.sherwood.ea_OM05,
2838  title         = "Performance of four turbulence closure models implemented
2839                  using a generic length scale method",
2840  pages         = "81--113",
2841  journal       = "Ocean Modelling",
2842  volume        = "8",
2843  number        = "1-2",
2844  author        = "J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
2845                  Signell",
2846  year          = "2005",
2847  month         = "jan",
2848  publisher     = "Elsevier BV",
2849  issn          = "1463-5003",
2850  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.12.003"
2851}
2852
2853@article{         weatherly_JMR84,
2854  title         = "An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
2855                  Stream fluctuations",
2856  pages         = "289--301",
2857  journal       = "Journal of Marine Research",
2858  volume        = "42",
2859  number        = "2",
2860  author        = "G. L. Weatherly",
2861  year          = "1984",
2862  month         = "may",
2863  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2864  issn          = "1543-9542",
2865  doi           = "10.1357/002224084788502729"
2866}
2867
2868@article{         weaver.eby_JPO97,
2869  title         = "On the numerical implementation of advection schemes for
2870                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
2871                  the {GFDL} ocean model",
2872  pages         = "369--377",
2873  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2874  volume        = "27",
2875  number        = "2",
2876  author        = "A. J. Weaver and M. Eby",
2877  year          = "1997",
2878  month         = "feb",
2879  publisher     = "American Meteorological Society",
2880  issn          = "1520-0485",
2881  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2"
2882}
2883
2884@article{         webb.de-cuevas.ea_JAOT98,
2885  title         = "Improved Advection Schemes for Ocean Models",
2886  pages         = "1171--1187",
2887  journal       = "Journal of Atmospheric and Oceanic Technology",
2888  volume        = "15",
2889  number        = "5",
2890  author        = "D. J. Webb and B. A. {de Cuevas} and C. S. Richmond",
2891  year          = "1998",
2892  month         = "oct",
2893  publisher     = "American Meteorological Society",
2894  issn          = "1520-0426",
2895  doi           = "10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2"
2896}
2897
2898@article{         white.adcroft.ea_JCP09,
2899  title         = "High-order regridding-remapping schemes for continuous
2900                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models",
2901  pages         = "8665--8692",
2902  journal       = "Journal of Computational Physics",
2903  volume        = "228",
2904  number        = "23",
2905  author        = "L. White and A. Adcroft and R. Hallberg",
2906  year          = "2009",
2907  month         = "dec",
2908  publisher     = "Elsevier BV",
2909  issn          = "0021-9991",
2910  doi           = "10.1016/j.jcp.2009.08.016"
2911}
2912
2913@article{         wilcox_AJ88,
2914  title         = "Reassessment of the scale-determining equation for
2915                  advanced turbulence models",
2916  pages         = "1299--1310",
2917  journal       = "AIAA Journal",
2918  volume        = "26",
2919  number        = "11",
2920  author        = "D. C. Wilcox",
2921  year          = "1988",
2922  month         = "nov",
2923  publisher     = "American Institute of Aeronautics and Astronautics (AIAA)",
2924  issn          = "1533-385X",
2925  doi           = "10.2514/3.10041"
2926}
2927
2928@article{         willebrand.barnier.ea_PO01,
2929  title         = "Circulation characteristics in three eddy-permitting
2930                  models of the North Atlantic",
2931  pages         = "123--161",
2932  journal       = "Progress in Oceanography",
2933  volume        = "48",
2934  number        = "2-3",
2935  author        = "J. Willebrand and B. Barnier and C. B{\"{o}}ning and C.
2936                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
2937                  and J.-M. Molines and A. L. New",
2938  year          = "2001",
2939  month         = "jan",
2940  publisher     = "Elsevier BV",
2941  issn          = "0079-6611",
2942  doi           = "10.1016/s0079-6611(01)00003-9"
2943}
2944
2945@article{         zalesak_JCP79,
2946  title         = "Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
2947                  for fluids",
2948  pages         = "335--362",
2949  journal       = "Journal of Computational Physics",
2950  volume        = "31",
2951  number        = "3",
2952  author        = "S. T. Zalesak",
2953  year          = "1979",
2954  month         = "jun",
2955  publisher     = "Elsevier BV",
2956  issn          = "0021-9991",
2957  doi           = "10.1016/0021-9991(79)90051-2"
2958}
2959
2960@article{         zhang.endoh_JGR92,
2961  title         = "A free surface General Circulation Model for the tropical
2962                  Pacific Ocean",
2963  pages         = "11237--11255",
2964  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2965  volume        = "97",
2966  number        = "C7",
2967  author        = "R.-H. Zhang and M. Endoh",
2968  year          = "1992",
2969  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2970  issn          = "0148-0227",
2971  doi           = "10.1029/92jc00911"
2972}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.