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diawri.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/src/OCE/DIA – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/src/OCE/DIA/diawri.F90 @ 11325

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dev_r10984_HPC-13 : bugfixes for sette with debug options
  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   !
46   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
47   USE in_out_manager ! I/O manager
48   USE diatmb         ! Top,middle,bottom output
49   USE dia25h         ! 25h Mean output
50   USE iom            !
51   USE ioipsl         !
52
53#if defined key_si3
54   USE ice 
55   USE icewri 
56#endif
57   USE lib_mpp         ! MPP library
58   USE timing          ! preformance summary
59   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
60   USE cool_skin       ! Cool skin
61
62   IMPLICIT NONE
63   PRIVATE
64
65   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
66   PUBLIC   dia_wri_state
67   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
68
69   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
70   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
71   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
72   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
73   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
74   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
75   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
77   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
78
79   !! * Substitutions
80#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
81   !!----------------------------------------------------------------------
82   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
83   !! $Id$
84   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
85   !!----------------------------------------------------------------------
86CONTAINS
87
88#if defined key_iomput
89   !!----------------------------------------------------------------------
90   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
91   !!----------------------------------------------------------------------
92   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
93      !
94      dia_wri_alloc = 0
95      !
96   END FUNCTION dia_wri_alloc
97
98   
99   SUBROUTINE dia_wri( kt )
100      !!---------------------------------------------------------------------
101      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
102      !!                   
103      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
104      !!      NETCDF format is used by default
105      !!
106      !! ** Method  :  use iom_put
107      !!----------------------------------------------------------------------
108      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
109      !!
110      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
111      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
112      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
113      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
116      !!----------------------------------------------------------------------
117      !
118      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
119      !
120      ! Output the initial state and forcings
121      IF( ninist == 1 ) THEN                       
122         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
123         ninist = 0
124      ENDIF
125
126      ! Output of initial vertical scale factor
127      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
128      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
129      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
130      !
131      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
132      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
133      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
134      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
135      IF( iom_use("e3tdef") )   &
136         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
137
138      IF( ll_wd ) THEN
139         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
140      ELSE
141         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
142      ENDIF
143
144      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
145         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
146     
147      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
148      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
149      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
150         DO jj = 1, jpj
151            DO ji = 1, jpi
152               ikbot = mbkt(ji,jj)
153               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
154            END DO
155         END DO
156         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
157      ENDIF
158     
159      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
160      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
161      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
162         DO jj = 1, jpj
163            DO ji = 1, jpi
164               ikbot = mbkt(ji,jj)
165               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
166            END DO
167         END DO
168         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
169      ENDIF
170
171      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
172         zztmp = rau0 * 0.25
173         z2d(:,:) = 0._wp
174         DO jj = 2, jpjm1
175            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
176               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
177                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
178                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
180               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
181               !
182            END DO
183         END DO
184         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
185         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
186      ENDIF
187         
188      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
189      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
190      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
191         DO jj = 1, jpj
192            DO ji = 1, jpi
193               ikbot = mbku(ji,jj)
194               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
195            END DO
196         END DO
197         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
198      ENDIF
199     
200      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
201      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
202      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
203         DO jj = 1, jpj
204            DO ji = 1, jpi
205               ikbot = mbkv(ji,jj)
206               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
207            END DO
208         END DO
209         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
210      ENDIF
211
212      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
213      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
214         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
215         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
216         DO jk = 1, jpk
217            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
218         END DO
219         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
220         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
221      ENDIF
222
223      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
224      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
225      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
226
227      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
228      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
229
230      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
231         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
232            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
233               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
234               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
235               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
236               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
237                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
238            END DO
239         END DO
240         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
241         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
242         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
243         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
244      ENDIF
245         
246      ! heat and salt contents
247      IF( iom_use("heatc") ) THEN
248         z2d(:,:)  = 0._wp 
249         DO jk = 1, jpkm1
250            DO jj = 1, jpj
251               DO ji = 1, jpi
252                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
253               END DO
254            END DO
255         END DO
256         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
257      ENDIF
258
259      IF( iom_use("saltc") ) THEN
260         z2d(:,:)  = 0._wp 
261         DO jk = 1, jpkm1
262            DO jj = 1, jpj
263               DO ji = 1, jpi
264                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
265               END DO
266            END DO
267         END DO
268         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
269      ENDIF
270      !
271      IF ( iom_use("eken") ) THEN
272         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
273         DO jk = 1, jpkm1
274            DO jj = 2, jpjm1
275               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
276                  zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk)
277                  z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  un(ji-1,jj,jk)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)   &
278                     &                     + un(ji  ,jj,jk)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)   &
279                     &                     + vn(ji,jj-1,jk)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)   &
280                     &                     + vn(ji,jj  ,jk)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)   )
281               END DO
282            END DO
283         END DO
284         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
285         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
286      ENDIF
287      !
288      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
289      !
290      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
291         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
292         z2d(:,:) = 0.e0
293         DO jk = 1, jpkm1
294            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
295            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
296         END DO
297         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
298         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
299      ENDIF
300     
301      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
302         z2d(:,:) = 0._wp 
303         DO jk = 1, jpkm1
304            DO jj = 2, jpjm1
305               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
306                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
307               END DO
308            END DO
309         END DO
310         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
311         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
312      ENDIF
313
314      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
315         z2d(:,:) = 0.e0 
316         DO jk = 1, jpkm1
317            DO jj = 2, jpjm1
318               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
319                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
320               END DO
321            END DO
322         END DO
323         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
324         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
325      ENDIF
326
327     
328      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
329         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
330         DO jk = 1, jpkm1
331            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
332         END DO
333         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
334      ENDIF
335     
336      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
337         z2d(:,:) = 0.e0 
338         DO jk = 1, jpkm1
339            DO jj = 2, jpjm1
340               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
341                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
342               END DO
343            END DO
344         END DO
345         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
346         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
347      ENDIF
348
349      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
350         z2d(:,:) = 0._wp 
351         DO jk = 1, jpkm1
352            DO jj = 2, jpjm1
353               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
354                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
355               END DO
356            END DO
357         END DO
358         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
359         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
360      ENDIF
361
362      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
363         z2d(:,:) = 0._wp
364         DO jk = 1, jpkm1
365            DO jj = 2, jpjm1
366               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
367                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
368               END DO
369            END DO
370         END DO
371         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
372         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
373      ENDIF
374      IF( iom_use("somint") ) THEN
375         z2d(:,:)=0._wp
376         DO jk = 1, jpkm1
377            DO jj = 2, jpjm1
378               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
379                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
380               END DO
381            END DO
382         END DO
383         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
384         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
385      ENDIF
386
387      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
388      !
389
390      IF (ln_diatmb)   CALL dia_tmb                   ! tmb values
391         
392      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
393
394      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
395      !
396   END SUBROUTINE dia_wri
397
398#else
399   !!----------------------------------------------------------------------
400   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
401   !!----------------------------------------------------------------------
402
403   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
404      !!----------------------------------------------------------------------
405      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
406      !!----------------------------------------------------------------------
407      ierr = 0
408      ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
409         &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
410         &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
411         !
412      dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
413      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
414      !
415   END FUNCTION dia_wri_alloc
416
417   
418   SUBROUTINE dia_wri( kt )
419      !!---------------------------------------------------------------------
420      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
421      !!                   
422      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
423      !!      NETCDF format is used by default
424      !!
425      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
426      !!      define all the NETCDF files and fields
427      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
428      !!      Each nwrite time step, output the instantaneous or mean fields
429      !!----------------------------------------------------------------------
430      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
431      !
432      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
433      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
434      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
435      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
436      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
437      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
438      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
439      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
440      !
441      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
442      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
443      !!----------------------------------------------------------------------
444      !
445      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
446      !
447      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
448         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
449         ninist = 0
450      ENDIF
451      !
452      ! 0. Initialisation
453      ! -----------------
454
455      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
456      ll_print = ll_print .AND. lwp
457
458      ! Define frequency of output and means
459      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
460#if defined key_diainstant
461      zsto = nwrite * rdt
462      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
463#else
464      zsto=rdt
465      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
466#endif
467      zout = nwrite * rdt
468      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
469
470      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
471      iimi = 1      ;      iima = jpi
472      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
473      ipk = jpk
474
475      ! define time axis
476      it = kt
477      itmod = kt - nit000 + 1
478
479
480      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
481      ! -----------------------------------------------------------------
482
483      IF( kt == nit000 ) THEN
484
485         ! Define the NETCDF files (one per grid)
486
487         ! Compute julian date from starting date of the run
488         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
489         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
490         IF(lwp)WRITE(numout,*)
491         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
492            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
493         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
494                                 ' limit storage in depth = ', ipk
495
496         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
497         IF(lwp) THEN
498            CALL dia_nam( clhstnam, nwrite,' ' )
499            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
500            WRITE(inum,*) clhstnam
501            CLOSE(inum)
502         ENDIF
503
504         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
505
506         CALL dia_nam( clhstnam, nwrite, 'grid_T' )
507         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
508         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
509            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
510            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
511         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
512            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
513         !                                                            ! Index of ocean points
514         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
515         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
516         !
517         IF( ln_icebergs ) THEN
518            !
519            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
520            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
521            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
522            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
523            IF( ierror /= 0 ) THEN
524               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
525               RETURN
526            ENDIF
527            !
528            !! iceberg vertical coordinate is class number
529            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
530               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
531            !
532            !! each class just needs the surface index pattern
533            ndim_bT = 3
534            DO jn = 1,nclasses
535               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
536            ENDDO
537            !
538         ENDIF
539
540         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
541
542         CALL dia_nam( clhstnam, nwrite, 'grid_U' )
543         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
544         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
545            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
546            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
547         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
548            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
549         !                                                            ! Index of ocean points
550         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
551         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
552
553         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
554
555         CALL dia_nam( clhstnam, nwrite, 'grid_V' )                   ! filename
556         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
557         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
558            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
559            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
560         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
561            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
562         !                                                            ! Index of ocean points
563         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
564         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
565
566         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
567
568         CALL dia_nam( clhstnam, nwrite, 'grid_W' )                   ! filename
569         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
570         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
571            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
572            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
573         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
574            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
575
576
577         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
578
579         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
580         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
581            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
582         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
583            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
584         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
585            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
586            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
587            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
588            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
589            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
590            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
591         ENDIF
592         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
593         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
594            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
595         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
596            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
597         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
598            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
599         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
600            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
601         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
602            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
603         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
604            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
605         IF(  ln_linssh  ) THEN
606            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
607            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
608            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
609            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
610            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
611            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
612         ENDIF
613         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
614            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
615         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
616            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
617         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
618            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
619         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
620            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
621         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
622            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
623         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
624            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
625!
626         IF( ln_icebergs ) THEN
627            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
628               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
629            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
630               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
631            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
632               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
633            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
634               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
635            IF( ln_bergdia ) THEN
636               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
637                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
638               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
639                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
640               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
641                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
642               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
643                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
644               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
645                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
646               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
647                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
648               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
649                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
650               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
651                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
652               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
653                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
654               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
655                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
656            ENDIF
657         ENDIF
658
659         IF( ln_ssr ) THEN
660            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
661               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
662            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
663               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
664            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
665               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
666         ENDIF
667       
668         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
669!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
670!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
671#if defined key_diahth
672         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
673            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
674         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
675            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
676         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
677            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
678         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
679            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
680#endif
681
682         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
683
684         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
685         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
686            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
687         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
688            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
689               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
690         ENDIF
691         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
692         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
693            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
694
695         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
696
697         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
698         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
699            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
700         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
701            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
702               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
703         ENDIF
704         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
705         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
706            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
707
708         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
709
710         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
711         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
712            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
713         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
714            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
715         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
716            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
717
718         IF( ln_zdfddm ) THEN
719            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
720               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
721         ENDIF
722         
723         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
724            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
725               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
726         ENDIF
727         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
728         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
729
730         IF(lwp) WRITE(numout,*)
731         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
732         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
733
734      ENDIF
735
736      ! 2. Start writing data
737      ! ---------------------
738
739      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
740      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
741      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
742
743      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nwrite ) == 0 ) THEN
744         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
745         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
746      ENDIF
747
748      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
749         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
750         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
751         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
752         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
753      ELSE
754         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
755         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
756         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
757         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
758      ENDIF
759      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
760         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
761         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
762         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
763         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
764      ENDIF
765      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
766      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
767      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
768      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
769                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
770                                                                                  ! in linear free surface case)
771      IF( ln_linssh ) THEN
772         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
773         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
774         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
775         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
776      ENDIF
777      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
778      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
779      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
780      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
781      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
782      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
783!
784      IF( ln_icebergs ) THEN
785         !
786         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
787         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
788         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
789         !
790         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
791         !
792         IF( ln_bergdia ) THEN
793            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
794            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
795            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
796            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
797            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
798            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
799            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
800            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
801            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
802            !
803            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
804         ENDIF
805      ENDIF
806
807      IF( ln_ssr ) THEN
808         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
809         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
810         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
811         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
812      ENDIF
813!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
814!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
815
816#if defined key_diahth
817      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
818      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
819      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
820      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
821#endif
822
823      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
824      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
825
826      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
827      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
828
829      CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn             , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
830      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
831      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
832      IF( ln_zdfddm ) THEN
833         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
834      ENDIF
835
836      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
837         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
838         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
839         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
840      ENDIF
841
842      ! 3. Close all files
843      ! ---------------------------------------
844      IF( kt == nitend ) THEN
845         CALL histclo( nid_T )
846         CALL histclo( nid_U )
847         CALL histclo( nid_V )
848         CALL histclo( nid_W )
849      ENDIF
850      !
851      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
852      !
853   END SUBROUTINE dia_wri
854#endif
855
856   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
857      !!---------------------------------------------------------------------
858      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
859      !!       
860      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
861      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
862      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
863      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
864      !!
865      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
866      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
867      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
868      !!----------------------------------------------------------------------
869      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
870      !!
871      INTEGER :: inum
872      !!----------------------------------------------------------------------
873      !
874      IF(lwp) WRITE(numout,*)
875      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
876      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
877      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
878
879#if defined key_si3
880     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
881#else
882     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
883#endif
884
885      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
886      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
887      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
888      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
889      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
890      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn                )    ! now k-velocity
891      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
892         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
893         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
894      ENDIF
895      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
896         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
897         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
898      ENDIF
899      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
900      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
901      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
902      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
903      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
904      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
905      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
906         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
907         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
908      END IF
909      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
910         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
911         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
912         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
913      ENDIF
914 
915#if defined key_si3
916      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
917         CALL ice_wri_state( inum )
918      ENDIF
919#endif
920      !
921      CALL iom_close( inum )
922      !
923   END SUBROUTINE dia_wri_state
924
925   !!======================================================================
926END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.