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diawri.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/src/OCE/DIA – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r10984_HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization/src/OCE/DIA/diawri.F90 @ 11358

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dev_r10984_HPC-13 : supress output files with nn_stock and nn_write = -1, see #2285
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 48.5 KB
Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   !
46   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
47   USE in_out_manager ! I/O manager
48   USE diatmb         ! Top,middle,bottom output
49   USE dia25h         ! 25h Mean output
50   USE iom            !
51   USE ioipsl         !
52
53#if defined key_si3
54   USE ice 
55   USE icewri 
56#endif
57   USE lib_mpp         ! MPP library
58   USE timing          ! preformance summary
59   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
60   USE cool_skin       ! Cool skin
61
62   IMPLICIT NONE
63   PRIVATE
64
65   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
66   PUBLIC   dia_wri_state
67   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
68
69   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
70   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
71   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
72   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
73   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
74   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
75   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
77   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
78
79   !! * Substitutions
80#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
81   !!----------------------------------------------------------------------
82   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
83   !! $Id$
84   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
85   !!----------------------------------------------------------------------
86CONTAINS
87
88#if defined key_iomput
89   !!----------------------------------------------------------------------
90   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
91   !!----------------------------------------------------------------------
92   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
93      !
94      dia_wri_alloc = 0
95      !
96   END FUNCTION dia_wri_alloc
97
98   
99   SUBROUTINE dia_wri( kt )
100      !!---------------------------------------------------------------------
101      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
102      !!                   
103      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
104      !!      NETCDF format is used by default
105      !!
106      !! ** Method  :  use iom_put
107      !!----------------------------------------------------------------------
108      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
109      !!
110      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
111      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
112      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
113      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
116      !!----------------------------------------------------------------------
117      !
118      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
119      !
120      ! Output the initial state and forcings
121      IF( ninist == 1 ) THEN                       
122         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
123         ninist = 0
124      ENDIF
125
126      ! Output of initial vertical scale factor
127      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
128      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
129      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
130      !
131      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
132      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
133      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
134      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
135      IF( iom_use("e3tdef") )   &
136         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
137
138      IF( ll_wd ) THEN
139         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
140      ELSE
141         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
142      ENDIF
143
144      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
145         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
146     
147      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
148      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
149      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
150         DO jj = 1, jpj
151            DO ji = 1, jpi
152               ikbot = mbkt(ji,jj)
153               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
154            END DO
155         END DO
156         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
157      ENDIF
158     
159      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
160      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
161      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
162         DO jj = 1, jpj
163            DO ji = 1, jpi
164               ikbot = mbkt(ji,jj)
165               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
166            END DO
167         END DO
168         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
169      ENDIF
170
171      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
172         zztmp = rau0 * 0.25
173         z2d(:,:) = 0._wp
174         DO jj = 2, jpjm1
175            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
176               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
177                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
178                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
180               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
181               !
182            END DO
183         END DO
184         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
185         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
186      ENDIF
187         
188      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
189      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
190      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
191         DO jj = 1, jpj
192            DO ji = 1, jpi
193               ikbot = mbku(ji,jj)
194               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
195            END DO
196         END DO
197         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
198      ENDIF
199     
200      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
201      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
202      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
203         DO jj = 1, jpj
204            DO ji = 1, jpi
205               ikbot = mbkv(ji,jj)
206               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
207            END DO
208         END DO
209         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
210      ENDIF
211
212      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
213      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
214         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
215         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
216         DO jk = 1, jpk
217            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
218         END DO
219         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
220         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
221      ENDIF
222
223      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
224      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
225      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
226
227      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
228      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
229
230      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
231         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
232            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
233               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
234               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
235               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
236               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
237                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
238            END DO
239         END DO
240         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
241         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
242         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
243         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
244      ENDIF
245         
246      ! heat and salt contents
247      IF( iom_use("heatc") ) THEN
248         z2d(:,:)  = 0._wp 
249         DO jk = 1, jpkm1
250            DO jj = 1, jpj
251               DO ji = 1, jpi
252                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
253               END DO
254            END DO
255         END DO
256         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
257      ENDIF
258
259      IF( iom_use("saltc") ) THEN
260         z2d(:,:)  = 0._wp 
261         DO jk = 1, jpkm1
262            DO jj = 1, jpj
263               DO ji = 1, jpi
264                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
265               END DO
266            END DO
267         END DO
268         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
269      ENDIF
270      !
271      IF ( iom_use("eken") ) THEN
272         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
273         DO jk = 1, jpkm1
274            DO jj = 2, jpjm1
275               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
276                  zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk)
277                  z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  un(ji-1,jj,jk)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)   &
278                     &                     + un(ji  ,jj,jk)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)   &
279                     &                     + vn(ji,jj-1,jk)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)   &
280                     &                     + vn(ji,jj  ,jk)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)   )
281               END DO
282            END DO
283         END DO
284         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
285         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
286      ENDIF
287      !
288      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
289      !
290      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
291         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
292         z2d(:,:) = 0.e0
293         DO jk = 1, jpkm1
294            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
295            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
296         END DO
297         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
298         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
299      ENDIF
300     
301      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
302         z2d(:,:) = 0._wp 
303         DO jk = 1, jpkm1
304            DO jj = 2, jpjm1
305               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
306                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
307               END DO
308            END DO
309         END DO
310         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
311         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
312      ENDIF
313
314      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
315         z2d(:,:) = 0.e0 
316         DO jk = 1, jpkm1
317            DO jj = 2, jpjm1
318               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
319                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
320               END DO
321            END DO
322         END DO
323         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
324         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
325      ENDIF
326
327     
328      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
329         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
330         DO jk = 1, jpkm1
331            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
332         END DO
333         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
334      ENDIF
335     
336      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
337         z2d(:,:) = 0.e0 
338         DO jk = 1, jpkm1
339            DO jj = 2, jpjm1
340               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
341                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
342               END DO
343            END DO
344         END DO
345         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
346         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
347      ENDIF
348
349      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
350         z2d(:,:) = 0._wp 
351         DO jk = 1, jpkm1
352            DO jj = 2, jpjm1
353               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
354                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
355               END DO
356            END DO
357         END DO
358         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
359         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
360      ENDIF
361
362      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
363         z2d(:,:) = 0._wp
364         DO jk = 1, jpkm1
365            DO jj = 2, jpjm1
366               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
367                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
368               END DO
369            END DO
370         END DO
371         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
372         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
373      ENDIF
374      IF( iom_use("somint") ) THEN
375         z2d(:,:)=0._wp
376         DO jk = 1, jpkm1
377            DO jj = 2, jpjm1
378               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
379                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
380               END DO
381            END DO
382         END DO
383         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
384         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
385      ENDIF
386
387      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
388      !
389
390      IF (ln_diatmb)   CALL dia_tmb                   ! tmb values
391         
392      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
393
394      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
395      !
396   END SUBROUTINE dia_wri
397
398#else
399   !!----------------------------------------------------------------------
400   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
401   !!----------------------------------------------------------------------
402
403   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
404      !!----------------------------------------------------------------------
405      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
406      !!----------------------------------------------------------------------
407      ierr = 0
408      ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
409         &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
410         &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
411         !
412      dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
413      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
414      !
415   END FUNCTION dia_wri_alloc
416
417   
418   SUBROUTINE dia_wri( kt )
419      !!---------------------------------------------------------------------
420      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
421      !!                   
422      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
423      !!      NETCDF format is used by default
424      !!
425      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
426      !!      define all the NETCDF files and fields
427      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
428      !!      Each nn_write time step, output the instantaneous or mean fields
429      !!----------------------------------------------------------------------
430      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
431      !
432      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
433      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
434      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
435      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
436      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
437      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
438      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
439      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
440      !
441      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
442      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
443      !!----------------------------------------------------------------------
444      !
445      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
446         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
447         ninist = 0
448      ENDIF
449      !
450      IF( nn_write == -1 )   RETURN   ! we will never do any output
451      !
452      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
453      !
454      ! 0. Initialisation
455      ! -----------------
456
457      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
458      ll_print = ll_print .AND. lwp
459
460      ! Define frequency of output and means
461      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
462#if defined key_diainstant
463      zsto = nn_write * rdt
464      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
465#else
466      zsto=rdt
467      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
468#endif
469      zout = nn_write * rdt
470      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
471
472      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
473      iimi = 1      ;      iima = jpi
474      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
475      ipk = jpk
476
477      ! define time axis
478      it = kt
479      itmod = kt - nit000 + 1
480
481
482      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
483      ! -----------------------------------------------------------------
484
485      IF( kt == nit000 ) THEN
486
487         ! Define the NETCDF files (one per grid)
488
489         ! Compute julian date from starting date of the run
490         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
491         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
492         IF(lwp)WRITE(numout,*)
493         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
494            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
495         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
496                                 ' limit storage in depth = ', ipk
497
498         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
499         IF(lwp) THEN
500            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write,' ' )
501            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
502            WRITE(inum,*) clhstnam
503            CLOSE(inum)
504         ENDIF
505
506         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
507
508         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_T' )
509         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
510         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
511            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
512            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
513         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
514            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
515         !                                                            ! Index of ocean points
516         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
517         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
518         !
519         IF( ln_icebergs ) THEN
520            !
521            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
522            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
523            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
524            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
525            IF( ierror /= 0 ) THEN
526               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
527               RETURN
528            ENDIF
529            !
530            !! iceberg vertical coordinate is class number
531            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
532               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
533            !
534            !! each class just needs the surface index pattern
535            ndim_bT = 3
536            DO jn = 1,nclasses
537               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
538            ENDDO
539            !
540         ENDIF
541
542         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
543
544         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_U' )
545         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
546         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
547            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
548            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
549         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
550            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
551         !                                                            ! Index of ocean points
552         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
553         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
554
555         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
556
557         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_V' )                   ! filename
558         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
559         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
560            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
561            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
562         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
563            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
564         !                                                            ! Index of ocean points
565         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
566         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
567
568         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
569
570         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_W' )                   ! filename
571         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
572         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
573            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
574            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
575         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
576            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
577
578
579         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
580
581         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
582         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
583            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
584         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
585            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
586         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
587            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
588            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
589            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
590            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
591            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
592            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
593         ENDIF
594         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
595         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
596            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
597         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
598            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
599         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
600            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
601         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
602            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
603         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
604            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
605         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
606            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
607         IF(  ln_linssh  ) THEN
608            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
609            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
610            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
611            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
612            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
613            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
614         ENDIF
615         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
616            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
617         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
618            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
619         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
620            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
621         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
622            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
623         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
624            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
625         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
626            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
627!
628         IF( ln_icebergs ) THEN
629            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
630               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
631            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
632               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
633            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
634               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
635            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
636               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
637            IF( ln_bergdia ) THEN
638               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
639                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
640               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
641                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
642               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
643                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
644               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
645                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
646               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
647                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
648               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
649                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
650               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
651                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
652               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
653                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
654               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
655                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
656               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
657                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
658            ENDIF
659         ENDIF
660
661         IF( ln_ssr ) THEN
662            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
663               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
664            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
665               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
666            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
667               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
668         ENDIF
669       
670         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
671!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
672!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
673#if defined key_diahth
674         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
675            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
676         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
677            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
678         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
679            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
680         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
681            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
682#endif
683
684         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
685
686         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
687         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
688            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
689         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
690            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
691               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
692         ENDIF
693         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
694         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
695            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
696
697         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
698
699         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
700         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
701            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
702         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
703            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
704               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
705         ENDIF
706         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
707         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
708            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
709
710         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
711
712         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
713         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
714            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
715         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
716            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
717         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
718            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
719
720         IF( ln_zdfddm ) THEN
721            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
722               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
723         ENDIF
724         
725         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
726            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
727               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
728         ENDIF
729         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
730         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
731
732         IF(lwp) WRITE(numout,*)
733         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
734         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
735
736      ENDIF
737
738      ! 2. Start writing data
739      ! ---------------------
740
741      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
742      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
743      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
744
745      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nn_write ) == 0 ) THEN
746         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
747         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
748      ENDIF
749
750      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
751         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
752         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
753         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
754         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
755      ELSE
756         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
757         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
758         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
759         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
760      ENDIF
761      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
762         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
763         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
764         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
765         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
766      ENDIF
767      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
768      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
769      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
770      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
771                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
772                                                                                  ! in linear free surface case)
773      IF( ln_linssh ) THEN
774         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
775         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
776         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
777         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
778      ENDIF
779      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
780      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
781      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
782      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
783      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
784      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
785!
786      IF( ln_icebergs ) THEN
787         !
788         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
789         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
790         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
791         !
792         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
793         !
794         IF( ln_bergdia ) THEN
795            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
796            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
797            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
798            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
799            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
800            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
801            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
802            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
803            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
804            !
805            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
806         ENDIF
807      ENDIF
808
809      IF( ln_ssr ) THEN
810         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
811         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
812         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
813         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
814      ENDIF
815!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
816!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
817
818#if defined key_diahth
819      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
820      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
821      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
822      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
823#endif
824
825      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
826      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
827
828      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
829      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
830
831      CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn             , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
832      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
833      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
834      IF( ln_zdfddm ) THEN
835         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
836      ENDIF
837
838      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
839         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
840         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
841         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
842      ENDIF
843
844      ! 3. Close all files
845      ! ---------------------------------------
846      IF( kt == nitend ) THEN
847         CALL histclo( nid_T )
848         CALL histclo( nid_U )
849         CALL histclo( nid_V )
850         CALL histclo( nid_W )
851      ENDIF
852      !
853      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
854      !
855   END SUBROUTINE dia_wri
856#endif
857
858   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
859      !!---------------------------------------------------------------------
860      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
861      !!       
862      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
863      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
864      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
865      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
866      !!
867      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
868      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
869      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
870      !!----------------------------------------------------------------------
871      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
872      !!
873      INTEGER :: inum
874      !!----------------------------------------------------------------------
875      !
876      IF(lwp) WRITE(numout,*)
877      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
878      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
879      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
880
881#if defined key_si3
882     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
883#else
884     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
885#endif
886
887      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
888      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
889      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
890      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
891      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
892      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn                )    ! now k-velocity
893      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
894         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
895         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
896      ENDIF
897      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
898         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
899         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
900      ENDIF
901      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
902      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
903      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
904      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
905      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
906      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
907      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
908         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
909         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
910      END IF
911      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
912         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
913         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
914         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
915      ENDIF
916 
917#if defined key_si3
918      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
919         CALL ice_wri_state( inum )
920      ENDIF
921#endif
922      !
923      CALL iom_close( inum )
924      !
925   END SUBROUTINE dia_wri_state
926
927   !!======================================================================
928END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.