New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
trazdf.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r11351_fldread_with_XIOS/tests/CANAL/MY_SRC – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r11351_fldread_with_XIOS/tests/CANAL/MY_SRC/trazdf.F90 @ 13463

Last change on this file since 13463 was 13463, checked in by andmirek, 4 years ago

Ticket #2195:update to trunk 13461

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 12.6 KB
Line 
1MODULE trazdf
2   !!==============================================================================
3   !!                 ***  MODULE  trazdf  ***
4   !! Ocean active tracers:  vertical component of the tracer mixing trend
5   !!==============================================================================
6   !! History :  1.0  !  2005-11  (G. Madec)  Original code
7   !!            3.0  !  2008-01  (C. Ethe, G. Madec)  merge TRC-TRA
8   !!            4.0  !  2017-06  (G. Madec)  remove explict time-stepping option
9   !!----------------------------------------------------------------------
10
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!   tra_zdf       : Update the tracer trend with the vertical diffusion
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   USE oce            ! ocean dynamics and tracers variables
15   USE dom_oce        ! ocean space and time domain variables
16   USE domvvl         ! variable volume
17   USE phycst         ! physical constant
18   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics variables
19   USE sbc_oce        ! surface boundary condition: ocean
20   USE ldftra         ! lateral diffusion: eddy diffusivity
21   USE ldfslp         ! lateral diffusion: iso-neutral slope
22   USE trd_oce        ! trends: ocean variables
23   USE trdtra         ! trends: tracer trend manager
24   !
25   USE in_out_manager ! I/O manager
26   USE prtctl         ! Print control
27   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
28   USE lib_mpp        ! MPP library
29   USE timing         ! Timing
30
31   IMPLICIT NONE
32   PRIVATE
33
34   PUBLIC   tra_zdf       ! called by step.F90
35   PUBLIC   tra_zdf_imp   ! called by trczdf.F90
36
37   !! * Substitutions
38#  include "do_loop_substitute.h90"
39   !!----------------------------------------------------------------------
40   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
41   !! $Id$
42   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
43   !!----------------------------------------------------------------------
44CONTAINS
45
46   SUBROUTINE tra_zdf( kt, Kbb, Kmm, Krhs, pts, Kaa )
47      !!----------------------------------------------------------------------
48      !!                  ***  ROUTINE tra_zdf  ***
49      !!
50      !! ** Purpose :   compute the vertical ocean tracer physics.
51      !!---------------------------------------------------------------------
52      INTEGER                                  , INTENT(in)    :: kt                  ! ocean time-step index
53      INTEGER                                  , INTENT(in)    :: Kbb, Kmm, Krhs, Kaa ! time level indices
54      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts,jpt), INTENT(inout) :: pts                 ! active tracers and RHS of tracer equation
55      !
56      INTEGER  ::   jk   ! Dummy loop indices
57      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::   ztrdt, ztrds   ! 3D workspace
58      !!---------------------------------------------------------------------
59      !
60      IF( ln_timing )   CALL timing_start('tra_zdf')
61      !
62      IF( kt == nit000 )  THEN
63         IF(lwp)WRITE(numout,*)
64         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'tra_zdf : implicit vertical mixing on T & S'
65         IF(lwp)WRITE(numout,*) '~~~~~~~ '
66      ENDIF
67      !
68      IF( l_trdtra )   THEN                  !* Save ta and sa trends
69         ALLOCATE( ztrdt(jpi,jpj,jpk) , ztrds(jpi,jpj,jpk) )
70         ztrdt(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_tem,Kaa)
71         ztrds(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_sal,Kaa)
72      ENDIF
73      !
74      !                                      !* compute lateral mixing trend and add it to the general trend
75      CALL tra_zdf_imp( kt, nit000, 'TRA', rDt, Kbb, Kmm, Krhs, pts, Kaa, jpts ) 
76
77!!gm WHY here !   and I don't like that !
78      ! DRAKKAR SSS control {
79      ! JMM avoid negative salinities near river outlet ! Ugly fix
80      ! JMM : restore negative salinities to small salinities:
81!!$      WHERE( pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) < 0._wp )   pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) = 0.1_wp
82!!gm
83
84      IF( l_trdtra )   THEN                      ! save the vertical diffusive trends for further diagnostics
85         DO jk = 1, jpkm1
86            ztrdt(:,:,jk) = ( ( pts(:,:,jk,jp_tem,Kaa)*e3t(:,:,jk,Kaa) - pts(:,:,jk,jp_tem,Kbb)*e3t(:,:,jk,Kbb) ) &
87               &          / (e3t(:,:,jk,Kmm)*rDt) ) - ztrdt(:,:,jk)
88            ztrds(:,:,jk) = ( ( pts(:,:,jk,jp_sal,Kaa)*e3t(:,:,jk,Kaa) - pts(:,:,jk,jp_sal,Kbb)*e3t(:,:,jk,Kbb) ) &
89              &           / (e3t(:,:,jk,Kmm)*rDt) ) - ztrds(:,:,jk)
90         END DO
91!!gm this should be moved in trdtra.F90 and done on all trends
92         CALL lbc_lnk_multi( 'trazdf', ztrdt, 'T', 1. , ztrds, 'T', 1. )
93!!gm
94         CALL trd_tra( kt, Kmm, Krhs, 'TRA', jp_tem, jptra_zdf, ztrdt )
95         CALL trd_tra( kt, Kmm, Krhs, 'TRA', jp_sal, jptra_zdf, ztrds )
96         DEALLOCATE( ztrdt , ztrds )
97      ENDIF
98      !                                          ! print mean trends (used for debugging)
99      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Kaa), clinfo1=' zdf  - Ta: ', mask1=tmask,               &
100         &                                  tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Kaa), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' )
101      !
102      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('tra_zdf')
103      !
104   END SUBROUTINE tra_zdf
105
106 
107   SUBROUTINE tra_zdf_imp( kt, kit000, cdtype, p2dt, Kbb, Kmm, Krhs, pt, Kaa, kjpt ) 
108      !!----------------------------------------------------------------------
109      !!                  ***  ROUTINE tra_zdf_imp  ***
110      !!
111      !! ** Purpose :   Compute the after tracer through a implicit computation
112      !!     of the vertical tracer diffusion (including the vertical component
113      !!     of lateral mixing (only for 2nd order operator, for fourth order
114      !!     it is already computed and add to the general trend in traldf)
115      !!
116      !! ** Method  :  The vertical diffusion of a tracer ,t , is given by:
117      !!          difft = dz( avt dz(t) ) = 1/e3t dk+1( avt/e3w dk(t) )
118      !!      It is computed using a backward time scheme (t=after field)
119      !!      which provide directly the after tracer field.
120      !!      If ln_zdfddm=T, use avs for salinity or for passive tracers
121      !!      Surface and bottom boundary conditions: no diffusive flux on
122      !!      both tracers (bottom, applied through the masked field avt).
123      !!      If iso-neutral mixing, add to avt the contribution due to lateral mixing.
124      !!
125      !! ** Action  : - pt(:,:,:,:,Kaa)  becomes the after tracer
126      !!---------------------------------------------------------------------
127      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kt       ! ocean time-step index
128      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   Kbb, Kmm, Krhs, Kaa  ! ocean time level indices
129      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kit000   ! first time step index
130      CHARACTER(len=3)                         , INTENT(in   ) ::   cdtype   ! =TRA or TRC (tracer indicator)
131      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kjpt     ! number of tracers
132      REAL(wp)                                 , INTENT(in   ) ::   p2dt     ! tracer time-step
133      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,kjpt,jpt), INTENT(inout) ::   pt       ! tracers and RHS of tracer equation
134      !
135      INTEGER  ::  ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices
136      REAL(wp) ::  zrhs, zzwi, zzws ! local scalars
137      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zwi, zwt, zwd, zws
138      !!---------------------------------------------------------------------
139      !
140      !                                               ! ============= !
141      DO jn = 1, kjpt                                 !  tracer loop  !
142         !                                            ! ============= !
143         !  Matrix construction
144         ! --------------------
145         ! Build matrix if temperature or salinity (only in double diffusion case) or first passive tracer
146         !
147         IF(  ( cdtype == 'TRA' .AND. ( jn == jp_tem .OR. ( jn == jp_sal .AND. ln_zdfddm ) ) ) .OR.   &
148            & ( cdtype == 'TRC' .AND. jn == 1 )  )  THEN
149            !
150            ! vertical mixing coef.: avt for temperature, avs for salinity and passive tracers
151            IF( cdtype == 'TRA' .AND. jn == jp_tem ) THEN   ;   zwt(:,:,2:jpk) = avt(:,:,2:jpk)
152            ELSE                                            ;   zwt(:,:,2:jpk) = avs(:,:,2:jpk)
153            ENDIF
154            zwt(:,:,1) = 0._wp
155            !
156            IF( l_ldfslp ) THEN            ! isoneutral diffusion: add the contribution
157               IF( ln_traldf_msc  ) THEN     ! MSC iso-neutral operator
158                  DO_3D( 0, 0, 0, 0, 2, jpkm1 )
159                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + akz(ji,jj,jk) 
160                  END_3D
161               ELSE                          ! standard or triad iso-neutral operator
162                  DO_3D( 0, 0, 0, 0, 2, jpkm1 )
163                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + ah_wslp2(ji,jj,jk)
164                  END_3D
165               ENDIF
166            ENDIF
167            !
168            ! Diagonal, lower (i), upper (s)  (including the bottom boundary condition since avt is masked)
169            IF( ln_zad_Aimp ) THEN         ! Adaptive implicit vertical advection
170               DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 )
171                  zzwi = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk  ,Kmm)
172                  zzws = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm)
173                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zzwi - zzws   &
174                     &                 + p2dt * ( MAX( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) - MIN( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) )
175                  zwi(ji,jj,jk) = zzwi + p2dt *   MIN( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp )
176                  zws(ji,jj,jk) = zzws - p2dt *   MAX( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp )
177               END_3D
178            ELSE
179               DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 )
180                  zwi(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk,Kmm)
181                  zws(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm)
182                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zwi(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk)
183               END_3D
184            ENDIF
185            !
186            !! Matrix inversion from the first level
187            !!----------------------------------------------------------------------
188            !   solve m.x = y  where m is a tri diagonal matrix ( jpk*jpk )
189            !
190            !        ( zwd1 zws1   0    0    0  )( zwx1 ) ( zwy1 )
191            !        ( zwi2 zwd2 zws2   0    0  )( zwx2 ) ( zwy2 )
192            !        (  0   zwi3 zwd3 zws3   0  )( zwx3 )=( zwy3 )
193            !        (        ...               )( ...  ) ( ...  )
194            !        (  0    0    0   zwik zwdk )( zwxk ) ( zwyk )
195            !
196            !   m is decomposed in the product of an upper and lower triangular matrix.
197            !   The 3 diagonal terms are in 3d arrays: zwd, zws, zwi.
198            !   Suffices i,s and d indicate "inferior" (below diagonal), diagonal
199            !   and "superior" (above diagonal) components of the tridiagonal system.
200            !   The solution will be in the 4d array pta.
201            !   The 3d array zwt is used as a work space array.
202            !   En route to the solution pt(:,:,:,:,Kaa) is used a to evaluate the rhs and then
203            !   used as a work space array: its value is modified.
204            !
205            DO_2D( 0, 0, 0, 0 )
206               zwt(ji,jj,1) = zwd(ji,jj,1)
207            END_2D
208            DO_3D( 0, 0, 0, 0, 2, jpkm1 )
209               zwt(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwt(ji,jj,jk-1)
210            END_3D
211            !
212         ENDIF 
213         !         
214         DO_2D( 0, 0, 0, 0 )
215            pt(ji,jj,1,jn,Kaa) = e3t(ji,jj,1,Kbb) * pt(ji,jj,1,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,1,Kmm) * pt(ji,jj,1,jn,Krhs)
216         END_2D
217         DO_3D( 0, 0, 0, 0, 2, jpkm1 )
218            zrhs = e3t(ji,jj,jk,Kbb) * pt(ji,jj,jk,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,jk,Kmm) * pt(ji,jj,jk,jn,Krhs)   ! zrhs=right hand side
219            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = zrhs - zwi(ji,jj,jk) / zwt(ji,jj,jk-1) * pt(ji,jj,jk-1,jn,Kaa)
220         END_3D
221         !
222         DO_2D( 0, 0, 0, 0 )
223            pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) = pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) / zwt(ji,jj,jpkm1) * tmask(ji,jj,jpkm1)
224         END_2D
225         DO_3DS( 0, 0, 0, 0, jpk-2, 1, -1 )
226            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = ( pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) - zws(ji,jj,jk) * pt(ji,jj,jk+1,jn,Kaa) )   &
227               &             / zwt(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk)
228         END_3D
229         !                                            ! ================= !
230      END DO                                          !  end tracer loop  !
231      !                                               ! ================= !
232   END SUBROUTINE tra_zdf_imp
233
234   !!==============================================================================
235END MODULE trazdf
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.