New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
bibliography.bib in NEMO/branches/2019/dev_r11643_ENHANCE-11_CEthe_Shaconemo_diags/doc/latex/NEMO/main – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r11643_ENHANCE-11_CEthe_Shaconemo_diags/doc/latex/NEMO/main/bibliography.bib @ 11712

Last change on this file since 11712 was 11336, checked in by jchanut, 5 years ago

Update LDF chapter, #2216

File size: 108.8 KB
Line 
1
2@article{         adcroft.campin_OM04,
3  title         = "Rescaled height coordinates for accurate representation of
4                  free-surface flows in ocean circulation models",
5  pages         = "269--284",
6  journal       = "Ocean Modelling",
7  volume        = "7",
8  number        = "3-4",
9  author        = "A. Adcroft and J.-M. Campin",
10  year          = "2004",
11  month         = "jan",
12  publisher     = "Elsevier BV",
13  issn          = "1463-5003",
14  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.09.003"
15}
16
17@article{         arakawa.hsu_MWR90,
18  title         = "Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
19                  Schemes for the Shallow Water Equations",
20  pages         = "1960--1969",
21  journal       = "Monthly Weather Review",
22  volume        = "118",
23  number        = "10",
24  author        = "A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu",
25  year          = "1990",
26  month         = "oct",
27  publisher     = "American Meteorological Society",
28  issn          = "1520-0493",
29  doi           = "10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2"
30}
31
32@article{         arakawa.lamb_MWR81,
33  title         = "A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
34                  Shallow Water Equations",
35  pages         = "18--36",
36  journal       = "Monthly Weather Review",
37  volume        = "109",
38  number        = "1",
39  author        = "A. Arakawa and V. R. Lamb",
40  year          = "1981",
41  month         = "jan",
42  publisher     = "American Meteorological Society",
43  issn          = "1520-0493",
44  doi           = "10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2"
45}
46
47@article{         arakawa_JCP66,
48  title         = "Computational design for long-term numerical integration
49                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
50                  incompressible flow. Part {I}",
51  pages         = "119--143",
52  journal       = "Journal of Computational Physics",
53  volume        = "1",
54  number        = "1",
55  author        = "A. Arakawa",
56  year          = "1966",
57  month         = "Aug",
58  publisher     = "Elsevier BV",
59  issn          = "0021-9991",
60  doi           = "10.1016/0021-9991(66)90015-5"
61}
62
63@article{         arbic.garner.ea_DSR04,
64  title         = "The accuracy of surface elevations in forward global
65                  barotropic and baroclinic tide models",
66  pages         = "3069--3101",
67  journal       = "Deep Sea Research",
68  volume        = "51",
69  number        = "25-26",
70  author        = "B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
71                  Simmons",
72  year          = "2004",
73  month         = "dec",
74  publisher     = "Elsevier BV",
75  issn          = "0967-0645",
76  doi           = "10.1016/j.dsr2.2004.09.014"
77}
78
79@article{         artale.iudicone.ea_JGR02,
80  title         = "Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
81                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
82                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
83                  thermohaline circulation",
84  pages         = "2901--2924",
85  journal       = "Journal of Geophysical Research",
86  volume        = "107",
87  number        = "C8",
88  author        = "V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
89                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio",
90  year          = "2002",
91  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
92  issn          = "0148-0227",
93  doi           = "10.1029/2000jc000452"
94}
95
96@article{         asselin_MWR72,
97  title         = "Frequency Filter for Time Integrations",
98  pages         = "487--490",
99  journal       = "Monthly Weather Review",
100  volume        = "100",
101  number        = "6",
102  author        = "R. Asselin",
103  year          = "1972",
104  month         = "jun",
105  publisher     = "American Meteorological Society",
106  issn          = "1520-0493",
107  doi           = "10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2"
108}
109
110@article{         axell_JGR02,
111  title         = "Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
112                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea",
113  journal       = "Journal of Geophysical Research",
114  volume        = "107",
115  number        = "C11",
116  author        = "L. B. Axell",
117  year          = "2002",
118  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
119  issn          = "0148-0227",
120  doi           = "10.1029/2001jc000922"
121}
122
123@article{         barnier.madec.ea_OD06,
124  title         = "Impact of partial steps and momentum advection schemes in
125                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
126                  resolution",
127  pages         = "543--567",
128  journal       = "Ocean Dynamics",
129  volume        = "56",
130  number        = "5-6",
131  author        = "B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
132                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. {Le Sommer} and A. Beckmann
133                  and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and J. Dengg and C.
134                  Derval and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C.
135                  Talandier and S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and
136                  B. {de Cuevas}",
137  year          = "2006",
138  month         = "jun",
139  publisher     = "Springer Nature",
140  issn          = "1616-7228",
141  doi           = "10.1007/s10236-006-0082-1"
142}
143
144@article{         beckmann.doscher_JPO97,
145  title         = "A method for improved representation of dense water
146                  spreading over topography in geopotential-coordinate
147                  models",
148  pages         = "581--591",
149  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
150  volume        = "27",
151  number        = "4",
152  author        = "A. Beckmann and R. D{\"{o}}scher",
153  year          = "1997",
154  month         = "apr",
155  publisher     = "American Meteorological Society",
156  issn          = "1520-0485",
157  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2"
158}
159
160@article{         beckmann.goosse_OM03,
161  title         = "A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
162                  climate models",
163  pages         = "157--170",
164  journal       = "Ocean Modelling",
165  volume        = "5",
166  number        = "2",
167  author        = "A. Beckmann and H. Goosse",
168  year          = "2003",
169  month         = "jan",
170  publisher     = "Elsevier BV",
171  issn          = "1463-5003",
172  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00019-7"
173}
174
175@article{         beckmann.haidvogel_JPO93,
176  title         = "Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
177                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model Accuracy",
178  pages         = "1736--1753",
179  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
180  volume        = "23",
181  number        = "8",
182  author        = "A. Beckmann and D. B. Haidvogel",
183  year          = "1993",
184  month         = "aug",
185  publisher     = "American Meteorological Society",
186  issn          = "1520-0485",
187  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2"
188}
189
190@article{ beljaars_QJRMS95,
191title = "The parametrization of surface fluxes in large-scale models under free convection",
192pages = "255--270",
193journal = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
194volume = "121",
195number = "522",
196author = "Beljaars, Anton C. M.",
197year = "1995",
198month = "jan",
199 publisher     = "Wiley",
200issn = "00359009",
201doi = "10.1002/qj.49712152203"
202}
203
204@article{         bernie.guilyardi.ea_CD07,
205  title         = "Impact of resolving the diurnal cycle in an
206                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced {OGCM}",
207  pages         = "575--590",
208  journal       = "Climate Dynamics",
209  volume        = "29",
210  number        = "6",
211  author        = "D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
212                  Slingo and S. J. Woolnough",
213  year          = "2007",
214  month         = "may",
215  publisher     = "Springer Nature",
216  issn          = "1432-0894",
217  doi           = "10.1007/s00382-007-0249-6"
218}
219
220@article{         bernie.woolnough.ea_JC05,
221  title         = "Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
222                  ocean mixed layer",
223  pages         = "1190--1202",
224  journal       = "Journal of Climate",
225  volume        = "18",
226  number        = "8",
227  author        = "D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
228                  Guilyardi",
229  year          = "2005",
230  month         = "apr",
231  publisher     = "American Meteorological Society",
232  issn          = "1520-0442",
233  doi           = "10.1175/jcli3319.1"
234}
235
236@article{         blanke.delecluse_JPO93,
237  title         = "Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
238                  General Circulation Model with two different mixed-layer
239                  physics",
240  pages         = "1363--1388",
241  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
242  volume        = "23",
243  number        = "7",
244  author        = "B. Blanke and P. Del\'{e}cluse",
245  year          = "1993",
246  month         = "jul",
247  publisher     = "American Meteorological Society",
248  issn          = "1520-0485",
249  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2"
250}
251
252@article{         blanke.raynaud_JPO97,
253  title         = "Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
254                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results",
255  pages         = "1038--1053",
256  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
257  volume        = "27",
258  number        = "6",
259  author        = "B. Blanke and S. Raynaud",
260  year          = "1997",
261  month         = "jun",
262  publisher     = "American Meteorological Society",
263  issn          = "1520-0485",
264  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2"
265}
266
267@article{         bloom.takacs.ea_MWR96,
268  title         = "Data assimilation using incremental analysis updates",
269  pages         = "1256--1271",
270  journal       = "Monthly Weather Review",
271  volume        = "124",
272  number        = "6",
273  author        = "S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
274                  Ledvina",
275  year          = "1996",
276  month         = "jun",
277  publisher     = "American Meteorological Society",
278  issn          = "1520-0493",
279  doi           = "10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2"
280}
281
282@article{         bouffard.boegman_DAO13,
283  title         = "A diapycnal diffusivity model for stratified environmental
284                  flows",
285  pages         = "14--34",
286  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
287  volume        = "61-62",
288  author        = "D. Bouffard and L. Boegman",
289  year          = "2013",
290  month         = "jun",
291  publisher     = "Elsevier BV",
292  issn          = "0377-0265",
293  doi           = "10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002"
294}
295
296@article{         bougeault.lacarrere_MWR89,
297  title         = "Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
298                  Mesobeta--Scale Model",
299  pages         = "1872--1890",
300  journal       = "Monthly Weather Review",
301  volume        = "117",
302  number        = "8",
303  author        = "P. Bougeault and P. Lacarrere",
304  year          = "1989",
305  month         = "aug",
306  publisher     = "American Meteorological Society",
307  issn          = "1520-0493",
308  doi           = "10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2"
309}
310
311@article{         bouillon.maqueda.ea_OM09,
312  title         = "An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
313                  Arakawa {B} and {C} grids",
314  pages         = "174--184",
315  journal       = "Ocean Modelling",
316  volume        = "27",
317  number        = "3-4",
318  author        = "S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
319                  Fichefet",
320  year          = "2009",
321  month         = "jan",
322  publisher     = "Elsevier BV",
323  issn          = "1463-5003",
324  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.01.004"
325}
326
327@article{         brankart.candille.ea_GMD15,
328  title         = "A generic approach to explicit simulation of uncertainty
329                  in the {NEMO} ocean model",
330  pages         = "1285--1297",
331  journal       = "Geoscientific Model Development",
332  volume        = "8",
333  number        = "5",
334  author        = "J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
335                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
336                  J. Verron",
337  year          = "2015",
338  month         = "may",
339  publisher     = "Copernicus GmbH",
340  issn          = "1991-9603",
341  doi           = "10.5194/gmd-8-1285-2015"
342}
343
344@article{         brankart_OM13,
345  title         = "Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
346                  upon low resolution global ocean modelling",
347  pages         = "64--76",
348  journal       = "Ocean Modelling",
349  volume        = "66",
350  author        = "J.-M. Brankart",
351  year          = "2013",
352  month         = "jun",
353  publisher     = "Elsevier BV",
354  issn          = "1463-5003",
355  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.004"
356}
357
358@article{         breivik.bidlot.ea_OM16,
359  title         = "A Stokes drift approximation based on the Phillips
360                  spectrum",
361  pages         = "49--56",
362  journal       = "Ocean Modelling",
363  volume        = "100",
364  author        = "{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen",
365  year          = "2016",
366  month         = "apr",
367  publisher     = "Elsevier BV",
368  issn          = "1463-5003",
369  doi           = "10.1016/j.ocemod.2016.01.005"
370}
371
372@article{         breivik.janssen.ea_JPO14,
373  title         = "Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water",
374  pages         = "2433--2445",
375  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
376  volume        = "44",
377  number        = "9",
378  author        = "{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot",
379  year          = "2014",
380  month         = "sep",
381  publisher     = "American Meteorological Society",
382  issn          = "1520-0485",
383  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0020.1"
384}
385
386@article{         brodeau.barnier.ea_OM10,
387  title         = "An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
388                  circulation models",
389  pages         = "88--104",
390  journal       = "Ocean Modelling",
391  volume        = "31",
392  number        = "3-4",
393  author        = "L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
394                  Penduff and S. Gulev",
395  year          = "2010",
396  month         = "jan",
397  publisher     = "Elsevier BV",
398  issn          = "1463-5003",
399  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.10.005"
400}
401
402@article{         brodeau.barnier.ea_JPO16,
403  title         = "Climatologically Significant Effects of Some Approximations in the Bulk Parameterizations of Turbulent Air–Sea Fluxes",
404  pages         = "5--28",
405  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
406  volume        = "47",
407  number        = "1",
408  author        = "Brodeau, Laurent and Barnier, Bernard and Gulev, Sergey K. and Woods, Cian",
409  year          = "2016",
410  month         = "jan",
411  publisher     = "American Meteorological Society",
412  issn          = "0022-3670",
413  doi           = "10.1175/jpo-d-16-0169.1",
414}
415
416@article{         brown.campana_MWR78,
417  title         = "An economical time-differencing system for numerical
418                  weather prediction",
419  pages         = "1125--1136",
420  journal       = "Monthly Weather Review",
421  volume        = "106",
422  number        = "8",
423  author        = "J. A. Brown and K. A. Campana",
424  year          = "1978",
425  month         = "aug",
426  publisher     = "American Meteorological Society",
427  issn          = "1520-0493",
428  doi           = "10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2"
429}
430
431@article{         bryan_JCP97,
432  title         = "A numerical method for the study of the circulation of the
433                  world ocean",
434  pages         = "154--169",
435  journal       = "Journal of Computational Physics",
436  volume        = "135",
437  number        = "2",
438  author        = "K. Bryan",
439  year          = "1997",
440  month         = "Aug",
441  publisher     = "Elsevier BV",
442  issn          = "0021-9991",
443  doi           = "10.1006/jcph.1997.5699"
444}
445
446@article{         burchard_OM02,
447  title         = "Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
448                  buoyancy production",
449  pages         = "347--361",
450  journal       = "Ocean Modelling",
451  volume        = "4",
452  number        = "3-4",
453  author        = "H. Burchard",
454  year          = "2002",
455  month         = "jun",
456  publisher     = "Elsevier BV",
457  issn          = "1463-5003",
458  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00009-4"
459}
460
461@article{         campin.adcroft.ea_OM04,
462  title         = "Conservation of properties in a free-surface model",
463  pages         = "221--244",
464  journal       = "Ocean Modelling",
465  volume        = "6",
466  number        = "3-4",
467  author        = "J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall",
468  year          = "2004",
469  month         = "jan",
470  publisher     = "Elsevier BV",
471  issn          = "1463-5003",
472  doi           = "10.1016/s1463-5003(03)00009-x"
473}
474
475@article{         campin.goosse_T99,
476  title         = "Parameterization of density-driven downsloping flow for a
477                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate",
478  pages         = "412--430",
479  journal       = "Tellus A",
480  volume        = "51",
481  number        = "3",
482  author        = "J.-M. Campin and H. Goosse",
483  year          = "1999",
484  month         = "may",
485  publisher     = "Informa UK Limited",
486  issn          = "1600-0870",
487  doi           = "10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x"
488}
489
490@article{         campin.marshall.ea_OM08,
491  title         = "Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
492                  coordinate \zstar",
493  pages         = "1--14",
494  journal       = "Ocean Modelling",
495  volume        = "24",
496  number        = "1-2",
497  author        = "J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira",
498  year          = "2008",
499  month         = "jan",
500  publisher     = "Elsevier BV",
501  issn          = "1463-5003",
502  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.05.005"
503}
504
505@article{         canuto.howard.ea_JPO01,
506  title         = "Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
507                  model-momentum and heat vertical diffusivities",
508  pages         = "1413--1426",
509  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
510  volume        = "31",
511  number        = "6",
512  author        = "V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
513                  Dubovikov",
514  year          = "2001",
515  month         = "jun",
516  publisher     = "American Meteorological Society",
517  issn          = "1520-0485",
518  doi           = "10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2"
519}
520
521@article{         carrere.lyard_GRL03,
522  title         = "Modeling the barotropic response of the global ocean to
523                  atmospheric wind and pressure forcing - comparisons with
524                  observations",
525  journal       = "Geophysical Research Letters",
526  volume        = "30",
527  number        = "6",
528  author        = "L. Carr\`{e}re and F. Lyard",
529  year          = "2003",
530  month         = "mar",
531  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
532  issn          = "0094-8276",
533  doi           = "10.1029/2002gl016473"
534}
535
536@techreport{      chanut_rpt05,
537  title         = "Nesting code for {NEMO}",
538  pages         = "25",
539  author        = "J. Chanut",
540  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
541                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
542  year          = "2005",
543  month         = "may",
544  doi           = "10.5281/zenodo.3243409"
545}
546
547@article{         chassignet.smith.ea_JPO03,
548  title         = "North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
549                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
550                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity",
551  pages         = "2504--2526",
552  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
553  volume        = "33",
554  number        = "12",
555  author        = "E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
556                  R. Bleck",
557  year          = "2003",
558  month         = "dec",
559  publisher     = "American Meteorological Society",
560  issn          = "1520-0485",
561  doi           = "10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2"
562}
563
564@article{         cox_OM87,
565  title         = "Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model",
566  pages         = "1--9",
567  journal       = "Ocean Modelling",
568  volume        = "74",
569  author        = "M. D. Cox",
570  year          = "1987",
571  month         = "jan",
572  url           = "https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model"
573}
574
575@article{         craig.banner_JPO94,
576  title         = "Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
577                  layer",
578  pages         = "2546--2559",
579  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
580  volume        = "24",
581  number        = "12",
582  author        = "P. D. Craig and M. L. Banner",
583  year          = "1994",
584  month         = "dec",
585  publisher     = "American Meteorological Society",
586  issn          = "1520-0485",
587  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2"
588}
589
590@article{         craik.leibovich_JFM76,
591  title         = "A rational model for Langmuir circulations",
592  pages         = "401--426",
593  journal       = "Journal of Fluid Mechanics",
594  volume        = "73",
595  number        = "3",
596  author        = "A. D. D. Craik and S. Leibovich",
597  year          = "1976",
598  month         = "feb",
599  publisher     = "Cambridge University Press (CUP)",
600  issn          = "1469-7645",
601  doi           = "10.1017/s0022112076001420"
602}
603
604@article{         dalessio.abdella.ea_JPO98,
605  title         = "A new second-order turbulence closure scheme for modeling
606                  the oceanic mixed layer",
607  pages         = "1624--1641",
608  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
609  volume        = "28",
610  number        = "8",
611  author        = "S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane",
612  year          = "1998",
613  month         = "aug",
614  publisher     = "American Meteorological Society",
615  issn          = "1520-0485",
616  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2"
617}
618
619@book{            daley.barker_bk01,
620  pages         = "163",
621  booktitle     = "{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
622                  Data Assimilation System",
623  editor        = "Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division",
624  author        = "R. Daley and E. Barker",
625  year          = "2001",
626  month         = "jul",
627  publisher     = "Defense Technical Information Center",
628  doi           = "10.21236/ada396883"
629}
630
631@article{         danabasoglu.ferrari.ea_JC08,
632  title         = "Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
633                  parameterization of near-surface eddy fluxes",
634  pages         = "1192--1208",
635  journal       = "Journal of Climate",
636  volume        = "21",
637  number        = "6",
638  author        = "G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams",
639  year          = "2008",
640  month         = "mar",
641  publisher     = "American Meteorological Society",
642  issn          = "1520-0442",
643  doi           = "10.1175/2007jcli1508.1"
644}
645
646@article{         davies_QJRMS76,
647  title         = "A lateral boundary formulation for multi-level prediction
648                  models",
649  pages         = "405--418",
650  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
651  volume        = "102",
652  number        = "432",
653  author        = "H. C. Davies",
654  year          = "1976",
655  month         = "apr",
656  publisher     = "Wiley",
657  issn          = "0035-9009",
658  doi           = "10.1002/qj.49710243210"
659}
660
661@article{         de-boyer-montegut.madec.ea_JGR04,
662  title         = "Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
663                  profile data and a profile-based climatology",
664  pages         = "C12003",
665  journal       = "Journal of Geophysical Research",
666  volume        = "109",
667  number        = "C12",
668  author        = "C. {de Boyer Mont\'{e}gut} and G. Madec and A. S. Fischer
669                  and A. Lazar and D. Iudicone",
670  year          = "2004",
671  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
672  issn          = "0148-0227",
673  doi           = "10.1029/2004jc002378"
674}
675
676@article{         de-lavergne.madec.ea_JPO16,
677  title         = "The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
678                  overturning",
679  pages         = "663--681",
680  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
681  volume        = "46",
682  number        = "2",
683  author        = "C. {de Lavergne} and G. Madec and J. {Le Sommer} and A. J.
684                  G. Nurser and A. C. Naveira Garabato",
685  year          = "2016",
686  month         = "feb",
687  publisher     = "American Meteorological Society",
688  issn          = "1520-0485",
689  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0259.1"
690}
691
692@article{         debreu.vouland.ea_CG08,
693  title         = "{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran",
694  pages         = "8--13",
695  journal       = "Computers \& Geosciences",
696  volume        = "34",
697  number        = "1",
698  author        = "L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo",
699  year          = "2008",
700  month         = "jan",
701  publisher     = "Elsevier BV",
702  issn          = "0098-3004",
703  doi           = "10.1016/j.cageo.2007.01.009"
704}
705
706@incollection{    delecluse.madec_icol99,
707  title         = "Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
708                  system",
709  pages         = "237--313",
710  booktitle     = "Modeling the Earth's Climate and its Variability",
711  editor        = "W. R. Holland and S. Joussaume and F. David",
712  series        = "Les Houches",
713  volume        = "67",
714  author        = "P. Del\'{e}cluse and G. Madec",
715  year          = "1999",
716  publisher     = "North Holland",
717  isbn          = "978-0-444-50338-1"
718}
719
720@phdthesis{       demange_phd14,
721  title         = "Advection and gravity waves propagation numerical schemes
722                  for oceanic circulation models",
723  pages         = "138",
724  author        = "J. Demange",
725  school        = "Grenoble University, France",
726  year          = "2014",
727  url           = "https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf"
728}
729
730@article{         dobricic.pinardi.ea_OS07,
731  title         = "Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
732                  System at the basin scale",
733  pages         = "149--157",
734  journal       = "Ocean Science",
735  volume        = "3",
736  number        = "1",
737  author        = "S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
738                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez",
739  year          = "2007",
740  month         = "mar",
741  publisher     = "Copernicus GmbH",
742  issn          = "1812-0792",
743  doi           = "10.5194/os-3-149-2007"
744}
745
746@article{         drijfhout_JPO94,
747  title         = "Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
748                  Model",
749  pages         = "353--369",
750  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
751  volume        = "24",
752  number        = "2",
753  author        = "S. S. Drijfhout",
754  year          = "1994",
755  month         = "feb",
756  publisher     = "American Meteorological Society",
757  issn          = "1520-0485",
758  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2"
759}
760
761@article{         dukowicz.smith_JGR94,
762  title         = "Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
763                  ocean model",
764  pages         = "7991--8014",
765  journal       = "Journal of Geophysical Research",
766  volume        = "99",
767  number        = "C4",
768  author        = "J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
769  year          = "1994",
770  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
771  issn          = "0148-0227",
772  doi           = "10.1029/93jc03455"
773}
774
775@article{ edson.jampana.ea_JPO13,
776title = "On the Exchange of Momentum over the Open Ocean",
777pages = "1589--1610",
778journal = "Journal of Physical Oceanography",
779volume = "43",
780number = "8",
781author = "Edson, James B. and Jampana, Venkata and Weller, Robert A. and Bigorre, Sebastien P. and Plueddemann, Albert J. and Fairall, Christopher W. and Miller, Scott D. and Mahrt, Larry and Vickers, Dean and Hersbach, Hans",
782year = "2013",
783month = "aug",
784publisher = "American Meteorological Society",
785issn = "0022-3670",
786doi = "10.1175/JPO-D-12-0173.1"
787}
788
789@article{         egbert.ray_JGR01,
790  title         = "Estimates of {M2} tidal energy dissipation from
791                  {TOPEX}/Poseidon altimeter data",
792  pages         = "22475--22502",
793  journal       = "Journal of Geophysical Research",
794  volume        = "106",
795  number        = "C10",
796  author        = "G. D. Egbert and R. D. Ray",
797  year          = "2001",
798  month         = "oct",
799  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
800  issn          = "0148-0227",
801  doi           = "10.1029/2000jc000699"
802}
803
804@article{         egbert.ray_N00,
805  title         = "Significant dissipation of tidal energy in the deep ocean
806                  inferred from satellite altimeter data",
807  pages         = "775--778",
808  journal       = "Nature",
809  volume        = "405",
810  number        = "6788",
811  author        = "G. D. Egbert and R. D. Ray",
812  year          = "2000",
813  month         = "jun",
814  publisher     = "Springer Nature",
815  issn          = "1476-4687",
816  doi           = "10.1038/35015531"
817}
818
819@article{         eiseman.stone_SR80,
820  title         = "Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey",
821  pages         = "12--27",
822  journal       = "SIAM Review",
823  volume        = "22",
824  number        = "1",
825  author        = "P. R. Eiseman and A. P. Stone",
826  year          = "1980",
827  month         = "jan",
828  publisher     = "Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)",
829  issn          = "1095-7200",
830  doi           = "10.1137/1022002"
831}
832
833@article{         emile-geay.madec_OS09,
834  title         = "Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
835                  circulation",
836  pages         = "203--217",
837  journal       = "Ocean Science",
838  volume        = "5",
839  number        = "2",
840  author        = "J. Emile-Geay and G. Madec",
841  year          = "2009",
842  month         = "jun",
843  publisher     = "Copernicus GmbH",
844  issn          = "1812-0792",
845  doi           = "10.5194/os-5-203-2009"
846}
847
848@article{         engedahl_T95,
849  title         = "Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
850                  baroclinic ocean model with realistic topography",
851  pages         = "365--382",
852  journal       = "Tellus A",
853  volume        = "47",
854  number        = "3",
855  author        = "H. Engedahl",
856  year          = "1995",
857  month         = "jan",
858  publisher     = "Informa UK Limited",
859  issn          = "1600-0870",
860  doi           = "10.3402/tellusa.v47i3.11523"
861}
862
863@article{ fairall.bradley.ea_JC03,
864title = "Bulk parameterization of air-sea fluxes: Updates and verification for the COARE algorithm",
865pages = "571--591",
866journal = "Journal of Climate",
867volume = "16",
868number = "4",
869author = "Fairall, C. W. and Bradley, E. F. and Hare, J. E. and Grachev, A. A. and Edson, J. B.",
870year = "2003",
871publisher = "American Meteorological Society",
872issn = "08948755",
873doi = "10.1175/1520-0442(2003)016<0571:BPOASF>2.0.CO;2"
874}
875
876@phdthesis{       farge-coulombier_phd87,
877  title         = "Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
878                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant",
879  pages         = "353",
880  author        = "M. {Farge Coulombier}",
881  school        = "Paris VI University, France",
882  year          = "1987",
883  url           = "http://www.theses.fr/1987PA066365"
884}
885
886@article{         farrow.stevens_JPO95,
887  title         = "A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
888                  General Circulation Models",
889  pages         = "1731--1741",
890  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
891  volume        = "25",
892  number        = "7",
893  author        = "D. E. Farrow and D. P. Stevens",
894  year          = "1995",
895  month         = "jul",
896  publisher     = "American Meteorological Society",
897  issn          = "1520-0485",
898  doi           = "10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2"
899}
900
901@article{         flather_JPO94,
902  title         = "A storm surge prediction model for the northern Bay of
903                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
904                  1991",
905  pages         = "172--190",
906  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
907  volume        = "24",
908  number        = "1",
909  author        = "R. A. Flather",
910  year          = "1994",
911  month         = "jan",
912  publisher     = "American Meteorological Society",
913  issn          = "1520-0485",
914  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2"
915}
916
917@book{            fofonoff.millard_bk83,
918  pages         = "53",
919  booktitle     = "Algorithms for computation of fundamental properties of
920                  seawater",
921  editor        = "UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO",
922  series        = "Technical Paper in Marine Science",
923  volume        = "44",
924  author        = "N P. Fofonoff and R. C. Millard",
925  year          = "1983",
926  publisher     = "UNESCO",
927  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en"
928}
929
930@article{         foxkemper.ferrari_JPO08,
931  title         = "Parameterization of Mixed Layer Eddies. Part I: Theory and Diagnosis",
932  pages         = "1145--1165",
933  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
934  volume        = "38",
935  number        = "6",
936  author        = "B. Fox-Kemper and R. Ferrari and B. Hallberg",
937  year          = "2008",
938  month         = "jun",
939  publisher     = "American Meteorological Society",
940  issn          = "1520-0485",
941  doi           = "10.1175/2007JPO3792.1"
942}
943
944@article{         galperin.kantha.ea_JAS88,
945  title         = "A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
946                  flows",
947  pages         = "55--62",
948  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
949  volume        = "45",
950  number        = "1",
951  author        = "B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati",
952  year          = "1988",
953  month         = "jan",
954  publisher     = "American Meteorological Society",
955  issn          = "1520-0469",
956  doi           = "10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2"
957}
958
959@article{         gargett_JMR84,
960  title         = "Vertical eddy diffusivity in the ocean interior",
961  pages         = "359--393",
962  journal       = "Journal of Marine Research",
963  volume        = "42",
964  number        = "2",
965  author        = "A. E. Gargett",
966  year          = "1984",
967  month         = "may",
968  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
969  issn          = "1543-9542",
970  doi           = "10.1357/002224084788502756"
971}
972
973@article{         gaspar.gregoris.ea_JGR90,
974  title         = "A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
975                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
976                  long-term upper ocean study site",
977  pages         = "16179",
978  journal       = "Journal of Geophysical Research",
979  volume        = "95",
980  number        = "C9",
981  author        = "P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre",
982  year          = "1990",
983  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
984  issn          = "0148-0227",
985  doi           = "10.1029/jc095ic09p16179"
986}
987
988@article{         gent.mcwilliams_JPO90,
989  title         = "Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models",
990  pages         = "150--155",
991  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
992  volume        = "20",
993  number        = "1",
994  author        = "P. R. Gent and J. C. McWilliams",
995  year          = "1990",
996  month         = "jan",
997  publisher     = "American Meteorological Society",
998  issn          = "1520-0485",
999  doi           = "10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2"
1000}
1001
1002@article{         gentemann.minnett.ea_JGR09,
1003  title         = "Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
1004                  of upper ocean diurnal warming",
1005  pages         = "C07017",
1006  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1007  volume        = "114",
1008  number        = "C7",
1009  author        = "C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward",
1010  year          = "2009",
1011  month         = "jul",
1012  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1013  issn          = "0148-0227",
1014  doi           = "10.1029/2008jc004825"
1015}
1016
1017@article{         gerdes.koberle.ea_CD91,
1018  title         = "The influence of numerical advection schemes on the
1019                  results of Ocean General Circulation Models",
1020  pages         = "211--226",
1021  journal       = "Climate Dynamics",
1022  volume        = "5",
1023  number        = "4",
1024  author        = "R. Gerdes and C. K{\"{o}}berle and J. Willebrand",
1025  year          = "1991",
1026  month         = "jun",
1027  publisher     = "Springer Nature",
1028  issn          = "1432-0894",
1029  doi           = "10.1007/bf00210006"
1030}
1031
1032@article{         gerdes_JGR93*a,
1033  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
1034                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
1035                  and testing of the model",
1036  pages         = "14683--14701",
1037  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1038  volume        = "98",
1039  number        = "C8",
1040  author        = "R. Gerdes",
1041  year          = "1993",
1042  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1043  issn          = "0148-0227",
1044  doi           = "10.1029/93jc00760"
1045}
1046
1047@article{         gerdes_JGR93*b,
1048  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
1049                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
1050                  to an overflow problem",
1051  pages         = "14703--14726",
1052  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1053  volume        = "98",
1054  number        = "C8",
1055  author        = "R. Gerdes",
1056  year          = "1993",
1057  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1058  issn          = "0148-0227",
1059  doi           = "10.1029/93jc00788"
1060}
1061
1062@techreport{      gibson_rpt86,
1063  title         = "Standards for software development and maintenance",
1064  pages         = "21",
1065  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
1066  number        = "120",
1067  author        = "J. K. Gibson",
1068  institution   = "ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom",
1069  year          = "1986",
1070  month         = "aug",
1071  doi           = "10.21957/gi113q4gn"
1072}
1073
1074@book{            gill_bk82,
1075  pages         = "662",
1076  booktitle     = "Atmosphere-Ocean Dynamics",
1077  series        = "International Geophysics",
1078  volume        = "30",
1079  author        = "A. E. Gill",
1080  year          = "1982",
1081  month         = "nov",
1082  publisher     = "Elsevier",
1083  issn          = "0074-6142",
1084  isbn          = "978-0-12-283522-3",
1085  doi           = "10.1016/s0074-6142(08)x6002-4"
1086}
1087
1088@article{         goff_JGR10,
1089  title         = "Global prediction of abyssal hill root-mean-square heights
1090                  from small-scale altimetric gravity variability",
1091  pages         = "B12104",
1092  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1093  volume        = "115",
1094  number        = "B12",
1095  author        = "J. A. Goff",
1096  year          = "2010",
1097  month         = "dec",
1098  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1099  issn          = "0148-0227",
1100  doi           = "10.1029/2010jb007867"
1101}
1102
1103@article{         goosse.deleersnijder.ea_JGR99,
1104  title         = "Sensitivity of a global coupled ocean-sea ice model to the
1105                  parameterization of vertical mixing",
1106  pages         = "13681--13695",
1107  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1108  volume        = "104",
1109  number        = "C6",
1110  author        = "H. Goosse and E. Deleersnijder and T. Fichefet and M. H.
1111                  England",
1112  year          = "1999",
1113  month         = "jun",
1114  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1115  issn          = "0148-0227",
1116  doi           = "10.1029/1999jc900099"
1117}
1118
1119@article{         graham.mcdougall_JPO13,
1120  title         = "Quantifying the nonconservative production of conservative
1121                  temperature, potential temperature, and entropy",
1122  pages         = "838--862",
1123  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1124  volume        = "43",
1125  number        = "5",
1126  author        = "F. S. Graham and T. J. McDougall",
1127  year          = "2013",
1128  month         = "may",
1129  publisher     = "American Meteorological Society",
1130  issn          = "1520-0485",
1131  doi           = "10.1175/jpo-d-11-0188.1"
1132}
1133
1134@article{         greatbatch_JGR94,
1135  title         = "A note on the representation of steric sea level in models
1136                  that conserve volume rather than mass",
1137  pages         = "12767--12771",
1138  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1139  volume        = "99",
1140  number        = "C6",
1141  author        = "R. J. Greatbatch",
1142  year          = "1994",
1143  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1144  issn          = "0148-0227",
1145  doi           = "10.1029/94jc00847"
1146}
1147
1148@article{         griffies.biastoch.ea_OM09,
1149  title         = "Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)",
1150  pages         = "1--46",
1151  journal       = "Ocean Modelling",
1152  volume        = "26",
1153  number        = "1-2",
1154  author        = "S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and F.
1155                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1156                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1157                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1158                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1159                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1160                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin",
1161  year          = "2009",
1162  month         = "jan",
1163  publisher     = "Elsevier BV",
1164  issn          = "1463-5003",
1165  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.08.007"
1166}
1167
1168@article{         griffies.gnanadesikan.ea_JPO98,
1169  title         = "Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model",
1170  pages         = "805--830",
1171  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1172  volume        = "28",
1173  number        = "5",
1174  author        = "S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1175                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
1176  year          = "1998",
1177  month         = "may",
1178  publisher     = "American Meteorological Society",
1179  issn          = "1520-0485",
1180  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2"
1181}
1182
1183@article{         griffies.pacanowski.ea_MWR01,
1184  title         = "Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1185                  for z-coordinate Ocean Models",
1186  pages         = "1081--1098",
1187  journal       = "Monthly Weather Review",
1188  volume        = "129",
1189  number        = "5",
1190  author        = "S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1191                  Balaji",
1192  year          = "2001",
1193  month         = "may",
1194  publisher     = "American Meteorological Society",
1195  issn          = "1520-0493",
1196  doi           = "10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2"
1197}
1198
1199@article{         griffies_JPO98,
1200  title         = "The Gent-McWilliams skew-flux",
1201  pages         = "831--841",
1202  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1203  volume        = "28",
1204  number        = "5",
1205  author        = "S. M. Griffies",
1206  year          = "1998",
1207  month         = "may",
1208  publisher     = "American Meteorological Society",
1209  issn          = "1520-0485",
1210  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2"
1211}
1212
1213@book{            griffies_bk04,
1214  pages         = "434",
1215  booktitle     = "Fundamentals of ocean climate models",
1216  author        = "S. M. Griffies",
1217  year          = "2004",
1218  month         = "dec",
1219  publisher     = "Princeton University Press",
1220  isbn          = "978-0-691-18712-9",
1221  doi           = "10.2307/j.ctv301gzg"
1222}
1223
1224@article{         guilyardi.madec.ea_CD01,
1225  title         = "The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1226                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}",
1227  pages         = "589--599",
1228  journal       = "Climate Dynamics",
1229  volume        = "17",
1230  number        = "8",
1231  author        = "E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray",
1232  year          = "2001",
1233  month         = "may",
1234  publisher     = "Springer Science and Business Media LLC",
1235  issn          = "0930-7575",
1236  doi           = "10.1007/pl00007930"
1237}
1238
1239@article{         haney_JPO91,
1240  title         = "On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
1241                  Sigma Coordinate Ocean Models",
1242  pages         = "610--619",
1243  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1244  volume        = "21",
1245  number        = "4",
1246  author        = "R. L. Haney",
1247  year          = "1991",
1248  month         = "apr",
1249  publisher     = "American Meteorological Society",
1250  issn          = "1520-0485",
1251  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2"
1252}
1253
1254@article{         hazeleger.drijfhout_JGR00,
1255  title         = "A model study on internally generated variability in
1256                  subtropical mode water formation",
1257  pages         = "13965--13979",
1258  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1259  volume        = "105",
1260  number        = "C6",
1261  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1262  year          = "2000",
1263  month         = "jun",
1264  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1265  issn          = "0148-0227",
1266  doi           = "10.1029/2000jc900041"
1267}
1268
1269@article{         hazeleger.drijfhout_JPO00,
1270  title         = "Eddy subduction in a model of the subtropical gyre",
1271  pages         = "677--695",
1272  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1273  volume        = "30",
1274  number        = "4",
1275  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1276  year          = "2000",
1277  month         = "apr",
1278  publisher     = "American Meteorological Society",
1279  issn          = "1520-0485",
1280  doi           = "10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2"
1281}
1282
1283@article{         hazeleger.drijfhout_JPO98,
1284  title         = "Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
1285                  response to anomalous forcing",
1286  pages         = "266--288",
1287  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1288  volume        = "28",
1289  number        = "2",
1290  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1291  year          = "1998",
1292  month         = "feb",
1293  publisher     = "American Meteorological Society",
1294  issn          = "1520-0485",
1295  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2"
1296}
1297
1298@article{         hazeleger.drijfhout_JPO99,
1299  title         = "Stochastically forced mode water variability",
1300  pages         = "1772--1786",
1301  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1302  volume        = "29",
1303  number        = "8",
1304  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1305  year          = "1999",
1306  month         = "aug",
1307  publisher     = "American Meteorological Society",
1308  issn          = "1520-0485",
1309  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2"
1310}
1311
1312@article{         he.ding_JS01,
1313  title         = "Using accurate arithmetics to improve numerical
1314                  reproducibility and stability in parallel applications",
1315  pages         = "259--277",
1316  journal       = "The Journal of Supercomputing",
1317  volume        = "18",
1318  number        = "3",
1319  author        = "Y. He and C. H. Q. Ding",
1320  year          = "2001",
1321  publisher     = "Springer Nature",
1322  issn          = "0920-8542",
1323  doi           = "10.1023/a:1008153532043"
1324}
1325
1326@article{         hirt.amsden.ea_JCP74,
1327  title         = "An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
1328                  flow speeds",
1329  pages         = "227--253",
1330  journal       = "Journal of Computational Physics",
1331  volume        = "14",
1332  number        = "3",
1333  author        = "C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook",
1334  year          = "1974",
1335  month         = "mar",
1336  publisher     = "Elsevier BV",
1337  issn          = "0021-9991",
1338  doi           = "10.1016/0021-9991(74)90051-5"
1339}
1340
1341@article{         hofmeister.burchard.ea_OM10,
1342  title         = "Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
1343                  ocean models",
1344  pages         = "70--86",
1345  journal       = "Ocean Modelling",
1346  volume        = "33",
1347  number        = "1-2",
1348  author        = "R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers",
1349  year          = "2010",
1350  month         = "jan",
1351  publisher     = "Elsevier BV",
1352  issn          = "1463-5003",
1353  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.12.003"
1354}
1355
1356@article{         holland.jenkins_JPO99,
1357  title         = "Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the base
1358                  of an ice shelf",
1359  pages         = "1787--1800",
1360  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1361  volume        = "29",
1362  number        = "8",
1363  author        = "D. M. Holland and A. Jenkins",
1364  year          = "1999",
1365  month         = "aug",
1366  publisher     = "American Meteorological Society",
1367  issn          = "1520-0485",
1368  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2"
1369}
1370
1371@techreport{      hunter_rpt06,
1372  title         = "Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities",
1373  pages         = "17",
1374  number        = "7",
1375  author        = "J. R. Hunter",
1376  institution   = "Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
1377                  Centre",
1378  year          = "2006",
1379  month         = "jun",
1380  url           = "http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf"
1381}
1382
1383@book{            ioc.iapso_bk10,
1384  title         = "The international thermodynamic equation of seawater -
1385                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties",
1386  pages         = "196",
1387  editor        = "Intergovernmental Oceanographic Commission",
1388  series        = "Manuals and Guides",
1389  volume        = "56",
1390  author        = "IOC, SCOR and IAPSO",
1391  year          = "2010",
1392  month         = "mar",
1393  publisher     = "UNESCO",
1394  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en"
1395}
1396
1397@article{         jackson.rehmann_JPO14,
1398  title         = "Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
1399                  a sheared, stratified flow",
1400  pages         = "2661--2680",
1401  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1402  volume        = "44",
1403  number        = "10",
1404  author        = "P. R. Jackson and C. R. Rehmann",
1405  year          = "2014",
1406  month         = "oct",
1407  publisher     = "American Meteorological Society",
1408  issn          = "1520-0485",
1409  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0027.1"
1410}
1411
1412@techreport{      janssen.breivik.ea_rpt13,
1413  title         = "Air-sea interaction and surface waves",
1414  pages         = "36",
1415  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
1416  volume        = "712",
1417  author        = "P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
1418                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
1419                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni",
1420  institution   = "ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom",
1421  year          = "2013",
1422  month         = "nov",
1423  doi           = "10.21957/0kg73joh"
1424}
1425
1426@article{         jenkins.nicholls.ea_JPO10,
1427  title         = "Observation and parameterization of ablation at the base
1428                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica",
1429  pages         = "2298--2312",
1430  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1431  volume        = "40",
1432  number        = "10",
1433  author        = "A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr",
1434  year          = "2010",
1435  month         = "oct",
1436  publisher     = "American Meteorological Society",
1437  issn          = "1520-0485",
1438  doi           = "10.1175/2010jpo4317.1"
1439}
1440
1441@article{         jenkins_JGR91,
1442  title         = "A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction",
1443  pages         = "20671--20677",
1444  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1445  volume        = "96",
1446  number        = "C11",
1447  author        = "A. Jenkins",
1448  year          = "1991",
1449  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1450  issn          = "0148-0227",
1451  doi           = "10.1029/91jc01842"
1452}
1453
1454@article{         kantha.carniel_JMR03,
1455  title         = "Comments on ``{A} generic length-scale equation for
1456                  geophysical turbulence models'' by {L}. Umlauf and {H}.
1457                  Burchard",
1458  pages         = "693--702",
1459  journal       = "Journal of Marine Research",
1460  volume        = "61",
1461  number        = "5",
1462  author        = "L. Kantha and S. Carniel",
1463  year          = "2003",
1464  month         = "sep",
1465  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1466  issn          = "1543-9542",
1467  doi           = "10.1357/002224003771816007"
1468}
1469
1470@article{         kantha.clayson_JGR94,
1471  title         = "An improved mixed layer model for geophysical
1472                  applications",
1473  pages         = "25235--25266",
1474  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1475  volume        = "99",
1476  number        = "C12",
1477  author        = "L. H. Kantha and C. A. Clayson",
1478  year          = "1994",
1479  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1480  issn          = "0148-0227",
1481  doi           = "10.1029/94jc02257"
1482}
1483
1484@article{         kasahara_MWR74,
1485  title         = "Various vertical coordinate systems used for numerical
1486                  weather prediction",
1487  pages         = "509--522",
1488  journal       = "Monthly Weather Review",
1489  volume        = "102",
1490  number        = "7",
1491  author        = "A. Kasahara",
1492  year          = "1974",
1493  month         = "jul",
1494  publisher     = "American Meteorological Society",
1495  issn          = "1520-0493",
1496  doi           = "10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2"
1497}
1498
1499@article{         killworth.webb.ea_JPO91,
1500  title         = "The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner ocean
1501                  model",
1502  pages         = "1333--1348",
1503  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1504  volume        = "21",
1505  number        = "9",
1506  author        = "P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
1507                  Paterson",
1508  year          = "1991",
1509  month         = "sep",
1510  publisher     = "American Meteorological Society",
1511  issn          = "1520-0485",
1512  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2"
1513}
1514
1515@article{         killworth_JPO92,
1516  title         = "An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
1517                  Antarctic model",
1518  pages         = "1379--1387",
1519  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1520  volume        = "22",
1521  number        = "11",
1522  author        = "P. D. Killworth",
1523  year          = "1992",
1524  month         = "nov",
1525  publisher     = "American Meteorological Society",
1526  issn          = "1520-0485",
1527  doi           = "10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2"
1528}
1529
1530@inproceedings{   killworth_iprc89,
1531  title         = "On the parameterization of deep convection in ocean
1532                  models",
1533  pages         = "59--74",
1534  booktitle     = "Parameterization of small-scale processes",
1535  editor        = "P. Muller and D. Henderson",
1536  author        = "P. D. Killworth",
1537  year          = "1989",
1538  month         = "jan",
1539  publisher     = "Hawaii Institute of Geophysics",
1540  url           = "http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf"
1541}
1542
1543@article{         koch-larrouy.lengaigne.ea_CD10,
1544  title         = "Tidal mixing in the Indonesian Seas and its effect on the
1545                  tropical climate system",
1546  pages         = "891--904",
1547  journal       = "Climate Dynamics",
1548  volume        = "34",
1549  number        = "6",
1550  author        = "A. Koch-Larrouy and M. Lengaigne and P. Terray and G.
1551                  Madec and S. Masson",
1552  year          = "2010",
1553  month         = "aug",
1554  publisher     = "Springer Nature",
1555  issn          = "1432-0894",
1556  doi           = "10.1007/s00382-009-0642-4"
1557}
1558
1559@article{         koch-larrouy.madec.ea_GRL07,
1560  title         = "On the transformation of Pacific water into Indonesian
1561                  ThroughFlow water by internal tidal mixing",
1562  pages         = "L04604",
1563  journal       = "Geophysical Research Letters",
1564  volume        = "34",
1565  number        = "4",
1566  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
1567                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard",
1568  year          = "2007",
1569  month         = "feb",
1570  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1571  issn          = "0094-8276",
1572  doi           = "10.1029/2006gl028405"
1573}
1574
1575@article{         koch-larrouy.madec.ea_OD08*a,
1576  title         = "Water mass transformation along the Indonesian ThroughFlow
1577                  in an {OGCM}",
1578  pages         = "289--309",
1579  journal       = "Ocean Dynamics",
1580  volume        = "58",
1581  number        = "3-4",
1582  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and B. Blanke and R. Molcard",
1583  year          = "2008",
1584  month         = "oct",
1585  publisher     = "Springer Nature",
1586  issn          = "1616-7228",
1587  doi           = "10.1007/s10236-008-0155-4"
1588}
1589
1590@article{         koch-larrouy.madec.ea_OD08*b,
1591  title         = "Physical processes contributing to the water mass
1592                  transformation of the Indonesian ThroughFlow",
1593  pages         = "275--288",
1594  journal       = "Ocean Dynamics",
1595  volume        = "58",
1596  number        = "3-4",
1597  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and D. Iudicone and A.
1598                  Atmadipoera and R. Molcard",
1599  year          = "2008",
1600  month         = "oct",
1601  publisher     = "Springer Nature",
1602  issn          = "1616-7228",
1603  doi           = "10.1007/s10236-008-0154-5"
1604}
1605
1606@article{         kolmogorov_IANS42,
1607  title         = "Equations of turbulent motion in an incompressible fluid",
1608  pages         = "56--58",
1609  journal       = "Izvestiya Akademiya Nauk SSSR",
1610  series        = "Fizika",
1611  volume        = "6",
1612  author        = "A. N. Kolmogorov",
1613  year          = "1942"
1614}
1615
1616@techreport{      large.yeager_rpt04,
1617  title         = "Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
1618                  models: the data sets and flux climatologies",
1619  author        = "W. G. Large and S. G. Yeager",
1620  institution   = "{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO,
1621                  United States",
1622  year          = "2004",
1623  month         = "may",
1624  doi           = "10.5065/d6kk98q6"
1625}
1626
1627@article{         lazar.madec.ea_JPO99,
1628  title         = "The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
1629                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}",
1630  pages         = "2945--2961",
1631  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1632  volume        = "29",
1633  number        = "11",
1634  author        = "A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
1635  year          = "1999",
1636  month         = "nov",
1637  publisher     = "American Meteorological Society",
1638  issn          = "1520-0485",
1639  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2"
1640}
1641
1642@phdthesis{       lazar_phd97,
1643  title         = "La branche froide de la circulation thermohaline -
1644                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
1645                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale
1646                  id\'{e}alis\'{e}e",
1647  pages         = "269",
1648  author        = "A. Lazar",
1649  school        = "Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France",
1650  year          = "1997",
1651  url           = "http://www.theses.fr/1997PA066680"
1652}
1653
1654@article{         le-sommer.penduff.ea_OM09,
1655  title         = "How momentum advection schemes influence
1656                  current-topography interactions at eddy permitting
1657                  resolution",
1658  pages         = "1--14",
1659  journal       = "Ocean Modelling",
1660  volume        = "29",
1661  number        = "1",
1662  author        = "J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
1663                  and B. Barnier",
1664  year          = "2009",
1665  month         = "jan",
1666  publisher     = "Elsevier BV",
1667  issn          = "1463-5003",
1668  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.11.007"
1669}
1670
1671@article{         leclair.madec_OM09,
1672  title         = "A conservative leapfrog time stepping method",
1673  pages         = "88--94",
1674  journal       = "Ocean Modelling",
1675  volume        = "30",
1676  number        = "2-3",
1677  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1678  year          = "2009",
1679  month         = "jan",
1680  publisher     = "Elsevier BV",
1681  issn          = "1463-5003",
1682  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.06.006"
1683}
1684
1685@article{         leclair.madec_OM11,
1686  title         = "$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
1687                  coordinate separating high and low frequency motions",
1688  pages         = "139--152",
1689  journal       = "Ocean Modelling",
1690  volume        = "37",
1691  number        = "3-4",
1692  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1693  year          = "2011",
1694  publisher     = "Elsevier BV",
1695  issn          = "1463-5003",
1696  doi           = "10.1016/j.ocemod.2011.02.001"
1697}
1698
1699@phdthesis{       leclair_phd10,
1700  title         = "Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
1701                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an
1702                  {NEMO}",
1703  pages         = "163",
1704  author        = "M. Leclair",
1705  school        = "Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France",
1706  year          = "2010",
1707  url           = "http://www.theses.fr/2010PA066728"
1708}
1709
1710@article{         lele_JCP92,
1711  title         = "Compact finite difference schemes with spectral-like
1712                  resolution",
1713  pages         = "16--42",
1714  journal       = "Journal of Computational Physics",
1715  volume        = "103",
1716  number        = "1",
1717  author        = "S. K. Lele",
1718  year          = "1992",
1719  month         = "nov",
1720  publisher     = "Elsevier BV",
1721  issn          = "0021-9991",
1722  doi           = "10.1016/0021-9991(92)90324-r"
1723}
1724
1725@article{         lemarie.debreu.ea_OM12,
1726  title         = "On the stability and accuracy of the harmonic and
1727                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models",
1728  pages         = "9--35",
1729  journal       = "Ocean Modelling",
1730  volume        = "52-53",
1731  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
1732                  C. McWilliams",
1733  year          = "2012",
1734  month         = "aug",
1735  publisher     = "Elsevier BV",
1736  issn          = "1463-5003",
1737  doi           = "10.1016/j.ocemod.2012.04.007"
1738}
1739
1740@article{         lemarie.debreu.ea_OM15,
1741  title         = "Stability constraints for oceanic numerical models:
1742                  implications for the formulation of time and space
1743                  discretizations",
1744  pages         = "124--148",
1745  journal       = "Ocean Modelling",
1746  volume        = "92",
1747  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
1748                  and J. M. Molines and M. Honnorat",
1749  year          = "2015",
1750  month         = "aug",
1751  publisher     = "Elsevier BV",
1752  issn          = "1463-5003",
1753  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.06.006"
1754}
1755
1756@article{         lengaigne.madec.ea_JGR03,
1757  title         = "Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
1758                  circulation",
1759  pages         = "3345",
1760  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1761  volume        = "108",
1762  number        = "C11",
1763  author        = "M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes",
1764  year          = "2003",
1765  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1766  issn          = "0148-0227",
1767  doi           = "10.1029/2002jc001704"
1768}
1769
1770@article{         lengaigne.menkes.ea_CD07,
1771  title         = "Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
1772                  climate in a Coupled General Circulation Model",
1773  pages         = "503--516",
1774  journal       = "Climate Dynamics",
1775  volume        = "28",
1776  number        = "5",
1777  author        = "M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
1778                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec",
1779  year          = "2007",
1780  month         = "nov",
1781  publisher     = "Springer Nature",
1782  issn          = "1432-0894",
1783  doi           = "10.1007/s00382-006-0200-2"
1784}
1785
1786@article{         leonard_CMAME79,
1787  title         = "A stable and accurate convective modelling procedure based
1788                  on quadratic upstream interpolation",
1789  pages         = "59--98",
1790  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1791  volume        = "19",
1792  number        = "1",
1793  author        = "B. P. Leonard",
1794  year          = "1979",
1795  month         = "jun",
1796  publisher     = "Elsevier BV",
1797  issn          = "0045-7825",
1798  doi           = "10.1016/0045-7825(79)90034-3"
1799}
1800
1801@article{         leonard_CMAME91,
1802  title         = "The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
1803                  unsteady one-dimensional advection",
1804  pages         = "17--74",
1805  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1806  volume        = "88",
1807  number        = "1",
1808  author        = "B. P. Leonard",
1809  year          = "1991",
1810  month         = "jun",
1811  publisher     = "Elsevier BV",
1812  issn          = "0045-7825",
1813  doi           = "10.1016/0045-7825(91)90232-u"
1814}
1815
1816@article{         lermusiaux_JMS01,
1817  title         = "Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
1818                  ocean variability: Massachusetts Bay",
1819  pages         = "385--422",
1820  journal       = "Journal of Marine Systems",
1821  volume        = "29",
1822  number        = "1-4",
1823  author        = "P. F. J. Lermusiaux",
1824  year          = "2001",
1825  month         = "may",
1826  publisher     = "Elsevier BV",
1827  issn          = "0924-7963",
1828  doi           = "10.1016/s0924-7963(01)00025-2"
1829}
1830
1831@techreport{      levier.treguier.ea_rpt07,
1832  title         = "Free surface and variable volume in the {NEMO} code",
1833  pages         = "47",
1834  author        = "B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
1835                  Garnier",
1836  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
1837                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
1838  year          = "2007",
1839  month         = "may",
1840  doi           = "10.5281/zenodo.3244182"
1841}
1842
1843@article{         levy.estublier.ea_GRL01,
1844  title         = "Choice of an advection scheme for biogeochemical models",
1845  pages         = "3725--3728",
1846  journal       = "Geophysical Research Letters",
1847  volume        = "28",
1848  number        = "19",
1849  author        = "M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec",
1850  year          = "2001",
1851  month         = "oct",
1852  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1853  issn          = "0094-8276",
1854  doi           = "10.1029/2001gl012947"
1855}
1856
1857@article{         levy.klein.ea_OM10,
1858  title         = "Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
1859                  physics",
1860  pages         = "1--15",
1861  journal       = "Ocean Modelling",
1862  volume        = "34",
1863  number        = "1-2",
1864  author        = "M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
1865                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi",
1866  year          = "2010",
1867  month         = "jan",
1868  publisher     = "Elsevier BV",
1869  issn          = "1463-5003",
1870  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.04.001"
1871}
1872
1873@article{         li.garrett_JMR93,
1874  title         = "Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
1875                  circulation",
1876  pages         = "737--769",
1877  journal       = "Journal of Marine Research",
1878  volume        = "51",
1879  number        = "4",
1880  author        = "M. Li and C. Garrett",
1881  year          = "1993",
1882  month         = "nov",
1883  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1884  issn          = "1543-9542",
1885  doi           = "10.1357/0022240933223945"
1886}
1887
1888@article{         losch_JGR08,
1889  title         = "Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
1890                  General Circulation Model",
1891  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1892  volume        = "113",
1893  number        = "C8",
1894  author        = "M. Losch",
1895  year          = "2008",
1896  month         = "aug",
1897  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1898  issn          = "0148-0227",
1899  doi           = "10.1029/2007jc004368"
1900}
1901
1902@article{         lott.madec.ea_OM90,
1903  title         = "Topographic experiments in an Ocean General Circulation
1904                  Model",
1905  pages         = "1--4",
1906  journal       = "Ocean Modelling",
1907  volume        = "88",
1908  author        = "F. Lott and G. Madec and J. Verron",
1909  year          = "1990"
1910}
1911
1912@article{     lupkes.gryanik.ea_JGR12,
1913  author    = "L{\"{u}}pkes, Christof and Gryanik, Vladimir M. and Hartmann, J{\"{o}}rg and Andreas, Edgar L.",
1914  doi       = "10.1029/2012JD017630",
1915  issn      = "01480227",
1916  journal   = "Journal of Geophysical Research Atmospheres",
1917  number    = "13",
1918  pages  = "1--18",
1919  title  = "A parametrization, based on sea ice morphology, of the neutral atmospheric drag coefficients for weather prediction and climate models",
1920  volume    = "117",
1921  year      = "2012"
1922}
1923
1924@article{     lupkes.gryanik_JGR15,
1925  author    = "L{\"{u}}pkes, Christof and Gryanik, Vladimir M.",
1926  doi       = "10.1002/2014JD022418",
1927  issn      = "21562202",
1928  journal   = "Journal of Geophysical Research",
1929  number    = "2",
1930  pages  = "552--581",
1931  title  = "A stability-dependent parametrization of transfer coefficients formomentum and heat over polar sea ice to be used in climate models",
1932  volume    = "120",
1933  year      = "2015"
1934}
1935
1936@article{         madec.chartier.ea_DAO91,
1937  title         = "The effect of thermohaline forcing variability on deep
1938                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
1939                  high-resolution three-dimensional numerical study",
1940  pages         = "301--332",
1941  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
1942  volume        = "15",
1943  number        = "3-5",
1944  author        = "G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon",
1945  year          = "1991",
1946  month         = "apr",
1947  publisher     = "Elsevier BV",
1948  issn          = "0377-0265",
1949  doi           = "10.1016/0377-0265(91)90024-a"
1950}
1951
1952@inproceedings{   madec.crepon_iprc91,
1953  title         = "Thermohaline-driven deep water formation in the
1954                  northwestern Mediterranean Sea",
1955  chapter       = "15",
1956  pages         = "241--265",
1957  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
1958                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
1959                  deep convection and deep water formation in the oceans",
1960  editor        = "P.C. Chu and J.C. Gascard",
1961  series        = "Elsevier Oceanography",
1962  volume        = "57",
1963  author        = "G. Madec and M. Cr\'{e}pon",
1964  year          = "1991",
1965  publisher     = "Elsevier",
1966  issn          = "0422-9894",
1967  isbn          = "978-0-444-88764-1",
1968  doi           = "10.1016/s0422-9894(08)70071-0"
1969}
1970
1971@article{         madec.delecluse.ea_JPO91,
1972  title         = "A three-dimensional numerical study of deep-water
1973                  formation in the northwestern Mediterranean Sea",
1974  pages         = "1349--1371",
1975  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1976  volume        = "21",
1977  number        = "9",
1978  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
1979                  Chartier",
1980  year          = "1991",
1981  month         = "sep",
1982  publisher     = "American Meteorological Society",
1983  issn          = "1520-0485",
1984  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2"
1985}
1986
1987@article{         madec.delecluse.ea_JPO96,
1988  title         = "Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
1989                  northwestern Mediterranean Sea",
1990  pages         = "1393--1408",
1991  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1992  volume        = "26",
1993  number        = "8",
1994  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
1995                  Lott",
1996  year          = "1996",
1997  month         = "aug",
1998  publisher     = "American Meteorological Society",
1999  issn          = "1520-0485",
2000  doi           = "10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2"
2001}
2002
2003@book{            madec.delecluse.ea_NPM98,
2004  title         = "{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
2005                  manual",
2006  pages         = "91",
2007  journal       = "Note du Pole de Mod\'{e}lisation",
2008  volume        = "11",
2009  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
2010                  L\'{e}vy",
2011  year          = "1998",
2012  publisher     = "Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})",
2013  issn          = "1288-1619",
2014  url           = "http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf"
2015}
2016
2017@article{         madec.delecluse_IWN97,
2018  title         = "The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
2019                  Coupled Model",
2020  pages         = "12--15",
2021  journal       = "International WOCE Newsletter",
2022  volume        = "26",
2023  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
2024  year          = "1997",
2025  month         = "apr",
2026  publisher     = "University of Southampton",
2027  url           = "https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf"
2028}
2029
2030@article{         madec.imbard_CD96,
2031  title         = "A global ocean mesh to overcome the North Pole
2032                  singularity",
2033  pages         = "381--388",
2034  journal       = "Climate Dynamics",
2035  volume        = "12",
2036  number        = "6",
2037  author        = "G. Madec and M. Imbard",
2038  year          = "1996",
2039  month         = "may",
2040  publisher     = "Springer Nature",
2041  issn          = "1432-0894",
2042  doi           = "10.1007/bf00211684"
2043}
2044
2045@article{         maltrud.smith.ea_JGR98,
2046  title         = "Global eddy-resolving ocean simulations driven by
2047                  1985-1995 atmospheric winds",
2048  pages         = "30825--30853",
2049  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2050  volume        = "103",
2051  number        = "C13",
2052  author        = "M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
2053                  Malone",
2054  year          = "1998",
2055  month         = "dec",
2056  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2057  issn          = "0148-0227",
2058  doi           = "10.1029/1998jc900013"
2059}
2060
2061@article{         marchesiello.mcwilliams.ea_OM01,
2062  title         = "Open boundary conditions for long-term integration of
2063                  regional oceanic models",
2064  pages         = "1--20",
2065  journal       = "Ocean Modelling",
2066  volume        = "3",
2067  number        = "1-2",
2068  author        = "P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin",
2069  year          = "2001",
2070  month         = "jan",
2071  publisher     = "Elsevier BV",
2072  issn          = "1463-5003",
2073  doi           = "10.1016/s1463-5003(00)00013-5"
2074}
2075
2076@article{         marsaleix.auclair.ea_OM08,
2077  title         = "Energy conservation issues in sigma-coordinate
2078                  free-surface ocean models",
2079  pages         = "61--89",
2080  journal       = "Ocean Modelling",
2081  volume        = "20",
2082  number        = "1",
2083  author        = "P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
2084                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses",
2085  year          = "2008",
2086  month         = "jan",
2087  publisher     = "Elsevier BV",
2088  issn          = "1463-5003",
2089  doi           = "10.1016/j.ocemod.2007.07.005"
2090}
2091
2092@article{         marsh.ivchenko.ea_GMD15,
2093  title         = "{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
2094                  ocean model globally configured at eddy-permitting
2095                  resolution",
2096  pages         = "1547--1562",
2097  journal       = "Geoscientific Model Development",
2098  volume        = "8",
2099  number        = "5",
2100  author        = "R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
2101                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
2102                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. {Le Sommer} and N.
2103                  Merino and V. B. Zalesny",
2104  year          = "2015",
2105  month         = "may",
2106  publisher     = "Copernicus GmbH",
2107  issn          = "1991-9603",
2108  doi           = "10.5194/gmd-8-1547-2015"
2109}
2110
2111@article{         marti.madec.ea_JGR92,
2112  title         = "Comment on ``{N}et diffusivity in ocean general
2113                  circulation models with nonuniform grids'' by {F}. {L}. Yin
2114                  and {I}. {Y}. Fung",
2115  pages         = "12763--12766",
2116  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2117  volume        = "97",
2118  number        = "C8",
2119  author        = "O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
2120  year          = "1992",
2121  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2122  issn          = "0148-0227",
2123  doi           = "10.1029/92jc00306"
2124}
2125
2126@article{         martin.adcroft_OM10,
2127  title         = "Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
2128                  with interactive icebergs in a coupled climate model",
2129  pages         = "111--124",
2130  journal       = "Ocean Modelling",
2131  volume        = "34",
2132  number        = "3-4",
2133  author        = "T. Martin and A. Adcroft",
2134  year          = "2010",
2135  month         = "jan",
2136  publisher     = "Elsevier BV",
2137  issn          = "1463-5003",
2138  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.05.001"
2139}
2140
2141@article{         mathiot.jenkins.ea_GMD17,
2142  title         = "Explicit representation and parametrised impacts of under
2143                  ice shelf seas in the \zstar coordinate ocean model {NEMO}
2144                  3.6",
2145  pages         = "2849--2874",
2146  journal       = "Geoscientific Model Development",
2147  volume        = "10",
2148  number        = "7",
2149  author        = "P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec",
2150  year          = "2017",
2151  month         = "jul",
2152  publisher     = "Copernicus GmbH",
2153  issn          = "1991-9603",
2154  doi           = "10.5194/gmd-10-2849-2017"
2155}
2156
2157@article{         mcdougall.taylor_JMR84,
2158  title         = "Flux measurements across a finger interface at low values
2159                  of the stability ratio",
2160  pages         = "1--14",
2161  journal       = "Journal of Marine Research",
2162  volume        = "42",
2163  number        = "1",
2164  author        = "T. J. McDougall and J. R. Taylor",
2165  year          = "1984",
2166  month         = "feb",
2167  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2168  issn          = "1543-9542",
2169  doi           = "10.1357/002224084788506095"
2170}
2171
2172@article{         mcdougall_JPO87,
2173  title         = "Neutral Surfaces",
2174  pages         = "1950--1964",
2175  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2176  volume        = "17",
2177  number        = "11",
2178  author        = "T. J. McDougall",
2179  year          = "1987",
2180  month         = "nov",
2181  publisher     = "American Meteorological Society",
2182  issn          = "1520-0485",
2183  doi           = "10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2"
2184}
2185
2186@article{         mellor.blumberg_JPO04,
2187  title         = "Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response",
2188  pages         = "693--698",
2189  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2190  volume        = "34",
2191  number        = "3",
2192  author        = "G. Mellor and A. Blumberg",
2193  year          = "2004",
2194  month         = "mar",
2195  publisher     = "American Meteorological Society",
2196  issn          = "1520-0485",
2197  doi           = "10.1175/2517.1"
2198}
2199
2200@article{         mellor.yamada_RG82,
2201  title         = "Development of a turbulence closure model for geophysical
2202                  fluid problems",
2203  pages         = "851--875",
2204  journal       = "Reviews of Geophysics",
2205  volume        = "20",
2206  number        = "4",
2207  author        = "G. L. Mellor and T. Yamada",
2208  year          = "1982",
2209  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2210  issn          = "8755-1209",
2211  doi           = "10.1029/rg020i004p00851"
2212}
2213
2214@article{         merryfield.holloway.ea_JPO99,
2215  title         = "A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing",
2216  pages         = "1124--1142",
2217  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2218  volume        = "29",
2219  number        = "6",
2220  author        = "W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett",
2221  year          = "1999",
2222  month         = "jun",
2223  publisher     = "American Meteorological Society",
2224  issn          = "1520-0485",
2225  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2"
2226}
2227
2228@book{            mesinger.arakawa_bk76,
2229  booktitle     = "Numerical methods used in atmospheric models",
2230  series        = "GARP Publication",
2231  volume        = "1",
2232  number        = "17",
2233  author        = "F. Mesinger and A. Arakawa",
2234  year          = "1976",
2235  month         = "aug",
2236  url           = "https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models"
2237}
2238
2239@article{         morel.berthon_LO89,
2240  title         = "Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
2241                  production of the euphotic layer: Relationships
2242                  reinvestigated in view of remote-sensing applications",
2243  pages         = "1545--1562",
2244  journal       = "Limnology and Oceanography",
2245  volume        = "34",
2246  number        = "8",
2247  author        = "A. Morel and J.-F. Berthon",
2248  year          = "1989",
2249  month         = "dec",
2250  publisher     = "Wiley",
2251  issn          = "0024-3590",
2252  doi           = "10.4319/lo.1989.34.8.1545"
2253}
2254
2255@article{         morel.maritorena_JGR01,
2256  title         = "Bio-optical properties of oceanic waters: {A} reappraisal",
2257  pages         = "7163--7180",
2258  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2259  volume        = "106",
2260  number        = "C4",
2261  author        = "A. Morel and S. Maritorena",
2262  year          = "2001",
2263  month         = "apr",
2264  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2265  issn          = "0148-0227",
2266  doi           = "10.1029/2000jc000319"
2267}
2268
2269@article{         morel_JGR88,
2270  title         = "Optical modeling of the upper ocean in relation to its
2271                  biogenous matter content (case {I} waters)",
2272  pages         = "10749--10768",
2273  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2274  volume        = "93",
2275  number        = "C9",
2276  author        = "A. Morel",
2277  year          = "1988",
2278  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2279  issn          = "0148-0227",
2280  doi           = "10.1029/jc093ic09p10749"
2281}
2282
2283@article{         murray_JCP96,
2284  title         = "Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models",
2285  pages         = "251--273",
2286  journal       = "Journal of Computational Physics",
2287  volume        = "126",
2288  number        = "2",
2289  author        = "R. J. Murray",
2290  year          = "1996",
2291  month         = "jul",
2292  publisher     = "Elsevier BV",
2293  issn          = "0021-9991",
2294  doi           = "10.1006/jcph.1996.0136"
2295}
2296
2297@article{         oey_OM06,
2298  title         = "An {OGCM} with movable land-sea boundaries",
2299  pages         = "176--195",
2300  journal       = "Ocean Modelling",
2301  volume        = "13",
2302  number        = "2",
2303  author        = "L.-Y. Oey",
2304  year          = "2006",
2305  month         = "jan",
2306  publisher     = "Elsevier BV",
2307  issn          = "1463-5003",
2308  doi           = "10.1016/j.ocemod.2006.01.001"
2309}
2310
2311@article{         osborn_JPO80,
2312  title         = "Estimates of the local rate of vertical diffusion from
2313                  dissipation measurements",
2314  pages         = "83--89",
2315  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2316  volume        = "10",
2317  number        = "1",
2318  author        = "T. R. Osborn",
2319  year          = "1980",
2320  month         = "jan",
2321  publisher     = "American Meteorological Society",
2322  issn          = "1520-0485",
2323  doi           = "10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2"
2324}
2325
2326@article{         pacanowski.gnanadesikan_MWR98,
2327  title         = "Transient response in a z-level ocean model that resolves
2328                  topography with partial-cells",
2329  pages         = "3248--3270",
2330  journal       = "Monthly Weather Review",
2331  volume        = "126",
2332  number        = "12",
2333  author        = "R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan",
2334  year          = "1998",
2335  month         = "dec",
2336  publisher     = "American Meteorological Society",
2337  issn          = "1520-0493",
2338  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2"
2339}
2340
2341@article{         pacanowski.philander_JPO81,
2342  title         = "Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
2343                  Tropical Oceans",
2344  pages         = "1443--1451",
2345  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2346  volume        = "11",
2347  number        = "11",
2348  author        = "R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander",
2349  year          = "1981",
2350  month         = "nov",
2351  publisher     = "American Meteorological Society",
2352  issn          = "1520-0485",
2353  doi           = "10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2"
2354}
2355
2356@article{         paulson.simpson_JPO77,
2357  title         = "Irradiance Measurements in the Upper Ocean",
2358  pages         = "952--956",
2359  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2360  volume        = "7",
2361  number        = "6",
2362  author        = "C. A. Paulson and J. J. Simpson",
2363  year          = "1977",
2364  month         = "nov",
2365  publisher     = "American Meteorological Society",
2366  issn          = "1520-0485",
2367  doi           = "10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2"
2368}
2369
2370@article{         penduff.le-sommer.ea_OS07,
2371  title         = "Influence of numerical schemes on current-topography
2372                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations",
2373  pages         = "509--524",
2374  journal       = "Ocean Science",
2375  volume        = "3",
2376  number        = "4",
2377  author        = "T. Penduff and J. {Le Sommer} and B. Barnier and A.-M.
2378                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec",
2379  year          = "2007",
2380  month         = "dec",
2381  publisher     = "Copernicus GmbH",
2382  issn          = "1812-0792",
2383  doi           = "10.5194/os-3-509-2007"
2384}
2385
2386@article{         phillips_TAMS59,
2387  title         = "Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
2388                  differential equations",
2389  pages         = "193--254",
2390  journal       = "Transactions of the American Mathematical Society",
2391  volume        = "90",
2392  number        = "2",
2393  author        = "R. S. Phillips",
2394  year          = "1959",
2395  month         = "feb",
2396  publisher     = "American Mathematical Society (AMS)",
2397  issn          = "0002-9947",
2398  doi           = "10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1"
2399}
2400
2401@article{         qiao.yuan.ea_OD10,
2402  title         = "A three-dimensional surface wave–ocean circulation coupled
2403                  model and its initial testing",
2404  pages         = "1339--1335",
2405  journal       = "Ocean Dynamics",
2406  volume        = "60",
2407  number        = "5",
2408  author        = "F. Qiao and Y. Yuan and T. Ezer and C. Xia and
2409                   Y. Yang and X. Lu and Z. Song ",
2410  year          = "2010",
2411  month         = "oct",
2412  publisher     = "Springer-Verlag",
2413  issn          = "1616-7341",
2414  doi           = "10.1007/s10236-010-0326-y"
2415}
2416
2417@article{         redi_JPO82,
2418  title         = "Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation",
2419  pages         = "1154--1158",
2420  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2421  volume        = "12",
2422  number        = "10",
2423  author        = "M. H. Redi",
2424  year          = "1982",
2425  month         = "oct",
2426  publisher     = "American Meteorological Society",
2427  issn          = "1520-0485",
2428  doi           = "10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2"
2429}
2430
2431@article{         reffray.guillaume.ea_GMD15,
2432  title         = "Modelling turbulent vertical mixing sensitivity using
2433                   a 1-D version of NEMO",
2434  pages         = "69--86",
2435  journal       = "Geoscientific Model Development",
2436  volume        = "8",
2437  number        = "1",
2438  author        = "G. Reffray. and R. Bourdalle-Badie and C. Calone",
2439  year          = "2015",
2440  month         = "jan",
2441  publisher     = "Copernicus GmbH",
2442  issn          = "1991-9603",
2443  doi           = "10.5194/gmd-8-69-2015"
2444}
2445
2446@book{            richtmyer.morton_bk67,
2447  pages         = "405",
2448  booktitle     = "Difference methods for initial-value problems",
2449  edition       = "2",
2450  series        = "Interscience tracts in pure and applied mathematics",
2451  author        = "R. D. Richtmyer and K. W. Morton",
2452  year          = "1967",
2453  publisher     = "Interscience",
2454  issn          = "0074-994X",
2455  isbn          = "9780470720400",
2456  url           = "https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ"
2457}
2458
2459@article{         robert_JMSJ66,
2460  title         = "The integration of a low order spectral form of the
2461                  primitive meteorological equations",
2462  pages         = "237--245",
2463  journal       = "Journal of the Meteorological Society of Japan",
2464  volume        = "44",
2465  number        = "5",
2466  author        = "A. J. Robert",
2467  year          = "1966",
2468  publisher     = "Meteorological Society of Japan",
2469  issn          = "2186-9057",
2470  doi           = "10.2151/jmsj1965.44.5\_237"
2471}
2472
2473@article{         rodgers.aumont.ea_B14,
2474  title         = "Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
2475                  nutrient cycling to wind stirring",
2476  pages         = "4077--4098",
2477  journal       = "Biogeosciences",
2478  volume        = "11",
2479  number        = "15",
2480  author        = "K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
2481                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. {de Boyer
2482                  Mont\'{e}gut} and D. Iudicone and R. F. Keeling and G.
2483                  Madec and R. Wanninkhof",
2484  year          = "2014",
2485  month         = "aug",
2486  publisher     = "Copernicus GmbH",
2487  issn          = "1726-4189",
2488  doi           = "10.5194/bg-11-4077-2014"
2489}
2490
2491@article{         rodi_JGR87,
2492  title         = "Examples of calculation methods for flow and mixing in
2493                  stratified fluids",
2494  pages         = "5305--5328",
2495  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2496  volume        = "92",
2497  number        = "C5",
2498  author        = "W. Rodi",
2499  year          = "1987",
2500  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2501  issn          = "0148-0227",
2502  doi           = "10.1029/jc092ic05p05305"
2503}
2504
2505@article{         roquet.madec.ea_JPO15,
2506  title         = "Defining a simplified yet ``realistic'' equation of state
2507                  for seawater",
2508  pages         = "2564--2579",
2509  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2510  volume        = "45",
2511  number        = "10",
2512  author        = "F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander",
2513  year          = "2015",
2514  month         = "oct",
2515  publisher     = "American Meteorological Society",
2516  issn          = "1520-0485",
2517  doi           = "10.1175/jpo-d-15-0080.1"
2518}
2519
2520@article{         roquet.madec.ea_OM15,
2521  title         = "Accurate polynomial expressions for the density and
2522                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard",
2523  pages         = "29--43",
2524  journal       = "Ocean Modelling",
2525  volume        = "90",
2526  author        = "F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
2527                  Barker",
2528  year          = "2015",
2529  month         = "jun",
2530  publisher     = "Elsevier BV",
2531  issn          = "1463-5003",
2532  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.04.002"
2533}
2534
2535@article{         roullet.madec_JGR00,
2536  title         = "Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
2537                  new formulation for Ocean General Circulation Models",
2538  pages         = "23927--23942",
2539  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2540  volume        = "105",
2541  number        = "C10",
2542  author        = "G. Roullet and G. Madec",
2543  year          = "2000",
2544  month         = "oct",
2545  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2546  issn          = "0148-0227",
2547  doi           = "10.1029/2000jc900089"
2548}
2549
2550@article{         sarmiento.bryan_JGR82,
2551  title         = "An ocean transport model for the North Atlantic",
2552  pages         = "394--409",
2553  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2554  volume        = "87",
2555  number        = "C1",
2556  author        = "J. L. Sarmiento and K. Bryan",
2557  year          = "1982",
2558  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2559  issn          = "0148-0227",
2560  doi           = "10.1029/jc087ic01p00394"
2561}
2562
2563@article{         saunders_JAS67,
2564  title         = "The temperature at the ocean-air interface",
2565  pages         = "269--273",
2566  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2567  volume        = "24",
2568  number        = "3",
2569  author        = "P. M. Saunders",
2570  year          = "1967",
2571  month         = "may",
2572  publisher     = "American Meteorological Society",
2573  issn          = "1520-0469",
2574  doi           = "10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2"
2575}
2576
2577@article{         shchepetkin.mcwilliams_OM05,
2578  title         = "The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
2579                  split-explicit, free-surface,
2580                  topography-following-coordinate oceanic model",
2581  pages         = "347--404",
2582  journal       = "Ocean Modelling",
2583  volume        = "9",
2584  number        = "4",
2585  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2586  year          = "2005",
2587  month         = "jan",
2588  publisher     = "Elsevier BV",
2589  issn          = "1463-5003",
2590  doi           = "10.1016/j.ocemod.2004.08.002"
2591}
2592
2593@inbook{          shchepetkin.mcwilliams_ibk09,
2594  title         = "Computational kernel algorithms for fine-scale,
2595                  multiprocess, longtime oceanic simulations",
2596  chapter       = "2",
2597  pages         = "121--183",
2598  booktitle     = "Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans",
2599  editor        = "R. M. Temam and J. J. Tribbia",
2600  series        = "Handbook of Numerical Analysis",
2601  volume        = "14",
2602  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2603  year          = "2009",
2604  publisher     = "Elsevier",
2605  issn          = "1570-8659",
2606  isbn          = "9780444518934",
2607  doi           = "10.1016/s1570-8659(08)01202-0"
2608}
2609
2610@article{         shchepetkin_OM15,
2611  title         = "An Adaptive, Courant-number-dependent implicit
2612       scheme for vertical advection in oceanic modeling",
2613  pages         = "38--69",
2614  journal       = "Ocean Modelling",
2615  volume        = "91",
2616  author        = "A. F. Shchepetkin",
2617  year          = "2015",
2618  month         = "july",
2619  publisher     = "Elsevier BV",
2620  issn          = "1463-5003",
2621  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.03.006"
2622}
2623
2624@article{         siddorn.furner_OM13,
2625  title         = "An analytical stretching function that combines the best
2626                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
2627                  coordinates",
2628  pages         = "1--13",
2629  journal       = "Ocean Modelling",
2630  volume        = "66",
2631  author        = "J. R. Siddorn and R. Furner",
2632  year          = "2013",
2633  month         = "jun",
2634  publisher     = "Elsevier BV",
2635  issn          = "1463-5003",
2636  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.001"
2637}
2638
2639@article{         simmons.jayne.ea_OM04,
2640  title         = "Tidally driven mixing in a numerical model of the ocean
2641                  general circulation",
2642  pages         = "245--263",
2643  journal       = "Ocean Modelling",
2644  volume        = "6",
2645  number        = "3-4",
2646  author        = "H. L. Simmons and S. R. Jayne and L. C. {St Laurent} and
2647                  A. J. Weaver",
2648  year          = "2004",
2649  month         = "jan",
2650  publisher     = "Elsevier BV",
2651  issn          = "1463-5003",
2652  doi           = "10.1016/s1463-5003(03)00011-8"
2653}
2654
2655@article{         smagorinsky_MW63,
2656  title         = "General circulation experiments with the primitive equations: I. The basic experiment ",
2657  pages         = "99--164",
2658  journal       = "Monthly Weather Review",
2659  volume        = "91",
2660  number        = "3",
2661  author        = "J. Smagorinsky",
2662  year          = "1963",
2663  month         = "mar",
2664  publisher     = "American Meteorological Society",
2665  issn          = "1520-0493",
2666  doi           = "10.1175/1520-0493(1963)091<0099:GCEWTP>2.3.CO;2"
2667}
2668
2669@article{         song.haidvogel_JCP94,
2670  title         = "A semi-implicit ocean circulation model using a
2671                  generalized topography-following coordinate system",
2672  pages         = "228--244",
2673  journal       = "Journal of Computational Physics",
2674  volume        = "115",
2675  number        = "1",
2676  author        = "Y. Song and D. Haidvogel",
2677  year          = "1994",
2678  month         = "nov",
2679  publisher     = "Elsevier BV",
2680  issn          = "0021-9991",
2681  doi           = "10.1006/jcph.1994.1189"
2682}
2683
2684@article{         song_MWR98,
2685  title         = "A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
2686                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis",
2687  pages         = "3213--3230",
2688  journal       = "Monthly Weather Review",
2689  volume        = "126",
2690  number        = "12",
2691  author        = "Y. T. Song",
2692  year          = "1998",
2693  month         = "dec",
2694  publisher     = "American Meteorological Society",
2695  issn          = "1520-0493",
2696  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2"
2697}
2698
2699@article{         st-laurent.nash_DSR04,
2700  title         = "An examination of the radiative and dissipative properties
2701                  of deep ocean internal tides",
2702  pages         = "3029--3042",
2703  journal       = "Deep Sea Research",
2704  volume        = "51",
2705  number        = "25-26",
2706  author        = "L. C. {St Laurent} and J. D. Nash",
2707  year          = "2004",
2708  month         = "dec",
2709  publisher     = "Elsevier BV",
2710  issn          = "0967-0645",
2711  doi           = "10.1016/j.dsr2.2004.09.008"
2712}
2713
2714@article{         st-laurent.simmons.ea_GRL02,
2715  title         = "Estimating tidally driven mixing in the deep ocean",
2716  pages         = "2101--2104",
2717  journal       = "Geophysical Research Letters",
2718  volume        = "29",
2719  number        = "23",
2720  author        = "L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne",
2721  year          = "2002",
2722  month         = "dec",
2723  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2724  issn          = "0094-8276",
2725  doi           = "10.1029/2002gl015633"
2726}
2727
2728@article{         stacey_JPO99,
2729  title         = "Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
2730                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness length",
2731  pages         = "1363--1367",
2732  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2733  volume        = "29",
2734  number        = "6",
2735  author        = "M. W. Stacey",
2736  year          = "1999",
2737  month         = "jun",
2738  publisher     = "American Meteorological Society",
2739  issn          = "1520-0485",
2740  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2"
2741}
2742
2743@article{         steele.morley.ea_JC01,
2744  title         = "{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
2745                  Arctic Ocean",
2746  pages         = "2079--2087",
2747  journal       = "Journal of Climate",
2748  volume        = "14",
2749  number        = "9",
2750  author        = "M. Steele and R. Morley and W. Ermold",
2751  year          = "2001",
2752  month         = "may",
2753  publisher     = "American Meteorological Society",
2754  issn          = "1520-0442",
2755  doi           = "10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2"
2756}
2757
2758@article{         stein.stein_N92,
2759  title         = "A model for the global variation in oceanic depth and heat
2760                  flow with lithospheric age",
2761  pages         = "123--129",
2762  journal       = "Nature",
2763  volume        = "359",
2764  number        = "6391",
2765  author        = "C. A. Stein and S. Stein",
2766  year          = "1992",
2767  month         = "sep",
2768  publisher     = "Springer Nature",
2769  issn          = "1476-4687",
2770  doi           = "10.1038/359123a0"
2771}
2772
2773@inbook{          stokes_ibk09,
2774  title         = "On the theory of oscillatory waves",
2775  chapter       = "12",
2776  pages         = "197--229",
2777  booktitle     = "Mathematical and Physical Papers",
2778  series        = "Cambridge Library Collection - Mathematics",
2779  volume        = "1",
2780  author        = "G. G. Stokes",
2781  year          = "2009",
2782  publisher     = "Cambridge University Press",
2783  isbn          = "9780511702242",
2784  doi           = "10.1017/cbo9780511702242.013"
2785}
2786
2787@article{         takaya.bidlot.ea_JGR10,
2788  title         = "Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
2789                  temperature",
2790  pages         = "C06009",
2791  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2792  volume        = "115",
2793  number        = "C6",
2794  author        = "Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
2795                  E. M. Janssen",
2796  year          = "2010",
2797  month         = "jun",
2798  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2799  issn          = "0148-0227",
2800  doi           = "10.1029/2009jc005985"
2801}
2802
2803@article{         talagrand_JAS72,
2804  title         = "On the damping of high-frequency motions in
2805                  four-dimensional assimilation of meteorological data",
2806  pages         = "1571--1574",
2807  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2808  volume        = "29",
2809  number        = "8",
2810  author        = "O. Talagrand",
2811  year          = "1972",
2812  month         = "nov",
2813  publisher     = "American Meteorological Society",
2814  issn          = "1520-0469",
2815  doi           = "10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2"
2816}
2817
2818@article{         treguier.dukowicz.ea_JGR96,
2819  title         = "Properties of nonuniform grids used in ocean general
2820                  circulation models",
2821  pages         = "20877--20881",
2822  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2823  volume        = "101",
2824  number        = "C9",
2825  author        = "A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan",
2826  year          = "1996",
2827  month         = "sep",
2828  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2829  issn          = "0148-0227",
2830  doi           = "10.1029/96jc01753"
2831}
2832
2833@article{         treguier.held.ea_JPO97,
2834  title         = "Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
2835                  Equation Ocean Models",
2836  pages         = "567--580",
2837  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2838  volume        = "27",
2839  number        = "4",
2840  author        = "A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev",
2841  year          = "1997",
2842  month         = "apr",
2843  publisher     = "American Meteorological Society",
2844  issn          = "1520-0485",
2845  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2"
2846}
2847
2848@article{         treguier_JGR92,
2849  title         = "Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
2850                  equation model of the North Atlantic",
2851  pages         = "687--701",
2852  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2853  volume        = "97",
2854  number        = "C1",
2855  author        = "A. M. Tr\'{e}guier",
2856  year          = "1992",
2857  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2858  issn          = "0148-0227",
2859  doi           = "10.1029/91jc02350"
2860}
2861
2862@article{         tu.tsuang_GRL05,
2863  title         = "Cool-skin simulation by a one-column ocean model",
2864  pages         = "L22602",
2865  journal       = "Geophysical Research Letters",
2866  volume        = "32",
2867  number        = "22",
2868  author        = "C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang",
2869  year          = "2005",
2870  month         = "nov",
2871  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2872  issn          = "0094-8276",
2873  doi           = "10.1029/2005gl024252"
2874}
2875
2876@article{         umlauf.burchard_CSR05,
2877  title         = "Second-order turbulence closure models for geophysical
2878                  boundary layers. {A} review of recent work",
2879  pages         = "795--827",
2880  journal       = "Continental Shelf Research",
2881  volume        = "25",
2882  number        = "7-8",
2883  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2884  year          = "2005",
2885  month         = "may",
2886  publisher     = "Elsevier BV",
2887  issn          = "0278-4343",
2888  doi           = "10.1016/j.csr.2004.08.004"
2889}
2890
2891@article{         umlauf.burchard_JMR03,
2892  title         = "A generic length-scale equation for geophysical turbulence
2893                  models",
2894  pages         = "235--265",
2895  journal       = "Journal of Marine Research",
2896  volume        = "61",
2897  number        = "2",
2898  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2899  year          = "2003",
2900  month         = "mar",
2901  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2902  issn          = "0022-2402",
2903  doi           = "10.1357/002224003322005087"
2904}
2905
2906@book{            vallis_bk06,
2907  booktitle     = "Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics",
2908  author        = "G. K. Vallis",
2909  year          = "2006",
2910  publisher     = "Cambridge University Press",
2911  isbn          = "9780511790447",
2912  doi           = "10.1017/cbo9780511790447"
2913}
2914
2915@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_OM09*a,
2916  title         = "Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2917                  Antarctic sea ice. 1. Model description and validation",
2918  pages         = "33--53",
2919  journal       = "Ocean Modelling",
2920  volume        = "27",
2921  number        = "1-2",
2922  author        = "M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse and S.
2923                  Bouillon and G. Madec and M. A. Morales Maqueda",
2924  year          = "2009",
2925  month         = "jan",
2926  publisher     = "Elsevier BV",
2927  issn          = "1463-5003",
2928  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.10.005"
2929}
2930
2931@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_OM09*b,
2932  title         = "Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2933                  Antarctic sea ice. 2. Importance of sea ice salinity
2934                  variations",
2935  pages         = "54--69",
2936  journal       = "Ocean Modelling",
2937  volume        = "27",
2938  number        = "1-2",
2939  author        = "M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse",
2940  year          = "2009",
2941  month         = "jan",
2942  publisher     = "Elsevier BV",
2943  issn          = "1463-5003",
2944  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.11.003"
2945}
2946
2947@article{         warner.defne.ea_CG13,
2948  title         = "A wetting and drying scheme for {ROMS}",
2949  pages         = "54--61",
2950  journal       = "Computers \& Geosciences",
2951  volume        = "58",
2952  author        = "J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango",
2953  year          = "2013",
2954  month         = "aug",
2955  publisher     = "Elsevier BV",
2956  issn          = "0098-3004",
2957  doi           = "10.1016/j.cageo.2013.05.004"
2958}
2959
2960@article{         warner.sherwood.ea_OM05,
2961  title         = "Performance of four turbulence closure models implemented
2962                  using a generic length scale method",
2963  pages         = "81--113",
2964  journal       = "Ocean Modelling",
2965  volume        = "8",
2966  number        = "1-2",
2967  author        = "J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
2968                  Signell",
2969  year          = "2005",
2970  month         = "jan",
2971  publisher     = "Elsevier BV",
2972  issn          = "1463-5003",
2973  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.12.003"
2974}
2975
2976@article{         weatherly_JMR84,
2977  title         = "An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
2978                  Stream fluctuations",
2979  pages         = "289--301",
2980  journal       = "Journal of Marine Research",
2981  volume        = "42",
2982  number        = "2",
2983  author        = "G. L. Weatherly",
2984  year          = "1984",
2985  month         = "may",
2986  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2987  issn          = "1543-9542",
2988  doi           = "10.1357/002224084788502729"
2989}
2990
2991@article{         weaver.eby_JPO97,
2992  title         = "On the numerical implementation of advection schemes for
2993                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
2994                  the {GFDL} ocean model",
2995  pages         = "369--377",
2996  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2997  volume        = "27",
2998  number        = "2",
2999  author        = "A. J. Weaver and M. Eby",
3000  year          = "1997",
3001  month         = "feb",
3002  publisher     = "American Meteorological Society",
3003  issn          = "1520-0485",
3004  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2"
3005}
3006
3007@article{         webb.de-cuevas.ea_JAOT98,
3008  title         = "Improved Advection Schemes for Ocean Models",
3009  pages         = "1171--1187",
3010  journal       = "Journal of Atmospheric and Oceanic Technology",
3011  volume        = "15",
3012  number        = "5",
3013  author        = "D. J. Webb and B. A. {de Cuevas} and C. S. Richmond",
3014  year          = "1998",
3015  month         = "oct",
3016  publisher     = "American Meteorological Society",
3017  issn          = "1520-0426",
3018  doi           = "10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2"
3019}
3020
3021@article{         white.hoskins.ea_QJRMS05,
3022  title         = "Consistent approximate models of the global atmosphere: shallow, deep,
3023                  hydrostatic, quasi-hydrostatic and non-hydrostatic",
3024  pages         = "2081--2107",
3025  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
3026  volume        = "131",
3027  author        = "A. A. White and B. J. Hoskins and I. Roulstone and A. Staniforth",
3028  year          = "2005",
3029  doi           = "10.1256/qj.04.49"
3030}
3031
3032@article{         white.adcroft.ea_JCP09,
3033  title         = "High-order regridding-remapping schemes for continuous
3034                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models",
3035  pages         = "8665--8692",
3036  journal       = "Journal of Computational Physics",
3037  volume        = "228",
3038  number        = "23",
3039  author        = "L. White and A. Adcroft and R. Hallberg",
3040  year          = "2009",
3041  month         = "dec",
3042  publisher     = "Elsevier BV",
3043  issn          = "0021-9991",
3044  doi           = "10.1016/j.jcp.2009.08.016"
3045}
3046
3047@article{         wilcox_AJ88,
3048  title         = "Reassessment of the scale-determining equation for
3049                  advanced turbulence models",
3050  pages         = "1299--1310",
3051  journal       = "AIAA Journal",
3052  volume        = "26",
3053  number        = "11",
3054  author        = "D. C. Wilcox",
3055  year          = "1988",
3056  month         = "nov",
3057  publisher     = "American Institute of Aeronautics and Astronautics (AIAA)",
3058  issn          = "1533-385X",
3059  doi           = "10.2514/3.10041"
3060}
3061
3062@article{         willebrand.barnier.ea_PO01,
3063  title         = "Circulation characteristics in three eddy-permitting
3064                  models of the North Atlantic",
3065  pages         = "123--161",
3066  journal       = "Progress in Oceanography",
3067  volume        = "48",
3068  number        = "2-3",
3069  author        = "J. Willebrand and B. Barnier and C. B{\"{o}}ning and C.
3070                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
3071                  and J.-M. Molines and A. L. New",
3072  year          = "2001",
3073  month         = "jan",
3074  publisher     = "Elsevier BV",
3075  issn          = "0079-6611",
3076  doi           = "10.1016/s0079-6611(01)00003-9"
3077}
3078
3079@article{         zalesak_JCP79,
3080  title         = "Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
3081                  for fluids",
3082  pages         = "335--362",
3083  journal       = "Journal of Computational Physics",
3084  volume        = "31",
3085  number        = "3",
3086  author        = "S. T. Zalesak",
3087  year          = "1979",
3088  month         = "jun",
3089  publisher     = "Elsevier BV",
3090  issn          = "0021-9991",
3091  doi           = "10.1016/0021-9991(79)90051-2"
3092}
3093
3094@article{         zhang.endoh_JGR92,
3095  title         = "A free surface General Circulation Model for the tropical
3096                  Pacific Ocean",
3097  pages         = "11237--11255",
3098  journal       = "Journal of Geophysical Research",
3099  volume        = "97",
3100  number        = "C7",
3101  author        = "R.-H. Zhang and M. Endoh",
3102  year          = "1992",
3103  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
3104  issn          = "0148-0227",
3105  doi           = "10.1029/92jc00911"
3106}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.