New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iom.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r11756_SI3restart_XIOS/src/OCE/IOM – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r11756_SI3restart_XIOS/src/OCE/IOM/iom.F90 @ 11893

Last change on this file since 11893 was 11893, checked in by andmirek, 4 years ago

Ticket #2323 read/write SI3 restart file

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 150.3 KB
Line 
1MODULE iom
2   !!======================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files
5   !!======================================================================
6   !! History :  2.0  ! 2005-12  (J. Belier) Original code
7   !!            2.0  ! 2006-02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!            3.0  ! 2007-07  (D. Storkey) Changes to iom_gettime
9   !!            3.4  ! 2012-12  (R. Bourdalle-Badie and G. Reffray)  add C1D case 
10   !!            3.6  ! 2014-15  DIMG format removed
11   !!            3.6  ! 2015-15  (J. Harle) Added procedure to read REAL attributes
12   !!            4.0  ! 2017-11  (M. Andrejczuk) Extend IOM interface to write any 3D fields
13   !!----------------------------------------------------------------------
14
15   !!----------------------------------------------------------------------
16   !!   iom_open       : open a file read only
17   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
18   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
19   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
20   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
21   !!----------------------------------------------------------------------
22   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
23   USE c1d             ! 1D vertical configuration
24   USE flo_oce         ! floats module declarations
25   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
26   USE iom_def         ! iom variables definitions
27   USE iom_nf90        ! NetCDF format with native NetCDF library
28   USE in_out_manager  ! I/O manager
29   USE lib_mpp           ! MPP library
30#if defined key_iomput
31   USE sbc_oce  , ONLY :   nn_fsbc         ! ocean space and time domain
32   USE trc_oce  , ONLY :   nn_dttrc        !  !: frequency of step on passive tracers
33   USE icb_oce  , ONLY :   nclasses, class_num       !  !: iceberg classes
34#if defined key_si3
35   USE ice      , ONLY :   jpl
36#endif
37   USE domngb          ! ocean space and time domain
38   USE phycst          ! physical constants
39   USE dianam          ! build name of file
40   USE xios
41# endif
42   USE ioipsl, ONLY :  ju2ymds    ! for calendar
43   USE crs             ! Grid coarsening
44#if defined key_top
45   USE trc, ONLY    :  profsed
46#endif
47   USE lib_fortran 
48   USE diurnal_bulk, ONLY : ln_diurnal_only, ln_diurnal
49#if defined key_si3
50   USE ice, ONLY: nlay_i, nlay_s, cn_icerst_outdir, cn_icerst_out
51#endif
52
53
54   IMPLICIT NONE
55   PUBLIC   !   must be public to be able to access iom_def through iom
56   
57#if defined key_iomput
58   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .TRUE.        !: iom_put flag
59#else
60   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .FALSE.       !: iom_put flag
61#endif
62   PUBLIC iom_init, iom_swap, iom_open, iom_close, iom_setkt, iom_varid, iom_get
63   PUBLIC iom_chkatt, iom_getatt, iom_putatt, iom_getszuld, iom_rstput, iom_delay_rst, iom_put
64   PUBLIC iom_use, iom_context_finalize, iom_miss_val
65
66   PRIVATE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d, iom_rp4d
67   PRIVATE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d, iom_g4d, iom_get_123d
68   PRIVATE iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
69#if defined key_iomput
70   PRIVATE iom_set_domain_attr, iom_set_axis_attr, iom_set_field_attr, iom_set_file_attr, iom_get_file_attr, iom_set_grid_attr
71   PRIVATE set_grid, set_grid_bounds, set_scalar, set_xmlatt, set_mooring, iom_update_file_name, iom_sdate
72   PRIVATE iom_set_rst_context, iom_set_rstw_active, iom_set_rstr_active
73# endif
74   PRIVATE iom_define_restartw, iom_set_rstw_validate
75   PUBLIC iom_set_rstw_var_active, iom_set_rstw_core, iom_set_rst_vars
76   PRIVATE iom_add
77   INTEGER,           PRIVATE    :: numrst
78   CHARACTER(len=12), PRIVATE    :: snr
79
80
81   INTERFACE iom_get
82      MODULE PROCEDURE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d, iom_g4d
83   END INTERFACE
84   INTERFACE iom_getatt
85      MODULE PROCEDURE iom_g0d_iatt, iom_g1d_iatt, iom_g0d_ratt, iom_g1d_ratt, iom_g0d_catt
86   END INTERFACE
87   INTERFACE iom_putatt
88      MODULE PROCEDURE iom_p0d_iatt, iom_p1d_iatt, iom_p0d_ratt, iom_p1d_ratt, iom_p0d_catt
89   END INTERFACE
90   INTERFACE iom_rstput
91      MODULE PROCEDURE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d, iom_rp4d
92   END INTERFACE
93   INTERFACE iom_put
94      MODULE PROCEDURE iom_p0d, iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
95   END INTERFACE iom_put
96 
97   !!----------------------------------------------------------------------
98   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
99   !! $Id$
100   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
101   !!----------------------------------------------------------------------
102CONTAINS
103
104   SUBROUTINE iom_init( cdname, fname, ld_tmppatch ) 
105      !!----------------------------------------------------------------------
106      !!                     ***  ROUTINE   ***
107      !!
108      !! ** Purpose :   
109      !!
110      !!----------------------------------------------------------------------
111      CHARACTER(len=*),           INTENT(in)  :: cdname
112      CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(in)  :: fname
113      LOGICAL         , OPTIONAL, INTENT(in)  :: ld_tmppatch
114#if defined key_iomput
115      !
116      TYPE(xios_duration) :: dtime    = xios_duration(0, 0, 0, 0, 0, 0)
117      TYPE(xios_date)     :: start_date
118      CHARACTER(len=lc) :: clname
119      INTEGER           :: ji, jkmin
120      LOGICAL :: llrst_context              ! is context related to restart
121      !
122      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zt_bnds, zw_bnds
123      LOGICAL ::   ll_tmppatch = .TRUE.    !: seb: patch before we remove periodicity
124      INTEGER ::   nldi_save, nlei_save    !:      and close boundaries in output files
125      INTEGER ::   nldj_save, nlej_save    !:
126      !!----------------------------------------------------------------------
127      !
128      ! seb: patch before we remove periodicity and close boundaries in output files
129      IF( PRESENT(ld_tmppatch) ) THEN   ;   ll_tmppatch = ld_tmppatch
130      ELSE                              ;   ll_tmppatch = .TRUE.
131      ENDIF
132      IF ( ll_tmppatch ) THEN
133         nldi_save = nldi   ;   nlei_save = nlei
134         nldj_save = nldj   ;   nlej_save = nlej
135         IF( nimpp           ==      1 ) nldi = 1
136         IF( nimpp + jpi - 1 == jpiglo ) nlei = jpi
137         IF( njmpp           ==      1 ) nldj = 1
138         IF( njmpp + jpj - 1 == jpjglo ) nlej = jpj
139      ENDIF
140      !
141      ALLOCATE( zt_bnds(2,jpk), zw_bnds(2,jpk) )
142      !
143      clname = cdname
144      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname)
145      CALL xios_context_initialize(TRIM(clname), mpi_comm_oce)
146      CALL iom_swap( cdname )
147      llrst_context =  (TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) .OR. TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context))
148
149      ! Calendar type is now defined in xml file
150      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
151      CASE ( 1)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "Gregorian", time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
152          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
153      CASE ( 0)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "NoLeap"   , time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
154          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
155      CASE (30)   ; CALL xios_define_calendar( TYPE = "D360"     , time_origin = xios_date(1900,01,01,00,00,00), &
156          &                                    start_date = xios_date(nyear,nmonth,nday,0,0,0) )
157      END SELECT
158
159      ! horizontal grid definition
160      IF(.NOT.llrst_context) CALL set_scalar
161      !
162      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context) ) THEN 
163         CALL set_grid( "T", glamt, gphit, .FALSE., .FALSE. ) 
164         CALL set_grid( "U", glamu, gphiu, .FALSE., .FALSE. )
165         CALL set_grid( "V", glamv, gphiv, .FALSE., .FALSE. )
166         CALL set_grid( "W", glamt, gphit, .FALSE., .FALSE. )
167         CALL set_grid_znl( gphit )
168         !
169         IF( ln_cfmeta ) THEN   ! Add additional grid metadata
170            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e1e2t(nldi:nlei, nldj:nlej))
171            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e1e2u(nldi:nlei, nldj:nlej))
172            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e1e2v(nldi:nlei, nldj:nlej))
173            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e1e2t(nldi:nlei, nldj:nlej))
174            CALL set_grid_bounds( "T", glamf, gphif, glamt, gphit )
175            CALL set_grid_bounds( "U", glamv, gphiv, glamu, gphiu )
176            CALL set_grid_bounds( "V", glamu, gphiu, glamv, gphiv )
177            CALL set_grid_bounds( "W", glamf, gphif, glamt, gphit )
178         ENDIF
179      ENDIF
180      !
181      IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context)//"_crs" ) THEN 
182         CALL dom_grid_crs   ! Save the parent grid information  & Switch to coarse grid domain
183         !
184         CALL set_grid( "T", glamt_crs, gphit_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
185         CALL set_grid( "U", glamu_crs, gphiu_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
186         CALL set_grid( "V", glamv_crs, gphiv_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
187         CALL set_grid( "W", glamt_crs, gphit_crs, .FALSE., .FALSE. ) 
188         CALL set_grid_znl( gphit_crs )
189          !
190         CALL dom_grid_glo   ! Return to parent grid domain
191         !
192         IF( ln_cfmeta .AND. .NOT. llrst_context) THEN   ! Add additional grid metadata
193            CALL iom_set_domain_attr("grid_T", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
194            CALL iom_set_domain_attr("grid_U", area = e1u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2u_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
195            CALL iom_set_domain_attr("grid_V", area = e1v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej) * e2v_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
196            CALL iom_set_domain_attr("grid_W", area = e1e2t_crs(nldi:nlei, nldj:nlej))
197            CALL set_grid_bounds( "T", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
198            CALL set_grid_bounds( "U", glamv_crs, gphiv_crs, glamu_crs, gphiu_crs )
199            CALL set_grid_bounds( "V", glamu_crs, gphiu_crs, glamv_crs, gphiv_crs )
200            CALL set_grid_bounds( "W", glamf_crs, gphif_crs, glamt_crs, gphit_crs )
201         ENDIF
202      ENDIF
203      !
204      ! vertical grid definition
205      IF(.NOT.llrst_context) THEN
206          CALL iom_set_axis_attr( "deptht",  paxis = gdept_1d )
207          CALL iom_set_axis_attr( "depthu",  paxis = gdept_1d )
208          CALL iom_set_axis_attr( "depthv",  paxis = gdept_1d )
209          CALL iom_set_axis_attr( "depthw",  paxis = gdepw_1d )
210
211          ! Add vertical grid bounds
212          jkmin = MIN(2,jpk)  ! in case jpk=1 (i.e. sas2D)
213          zt_bnds(2,:        ) = gdept_1d(:)
214          zt_bnds(1,jkmin:jpk) = gdept_1d(1:jpkm1)
215          zt_bnds(1,1        ) = gdept_1d(1) - e3w_1d(1)
216          zw_bnds(1,:        ) = gdepw_1d(:)
217          zw_bnds(2,1:jpkm1  ) = gdepw_1d(jkmin:jpk)
218          zw_bnds(2,jpk:     ) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk)
219          CALL iom_set_axis_attr( "deptht", bounds=zw_bnds )
220          CALL iom_set_axis_attr( "depthu", bounds=zw_bnds )
221          CALL iom_set_axis_attr( "depthv", bounds=zw_bnds )
222          CALL iom_set_axis_attr( "depthw", bounds=zt_bnds )
223          CALL iom_set_axis_attr( "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpnfl) /) )
224# if defined key_si3
225          CALL iom_set_axis_attr( "ncatice", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) )
226          ! SIMIP diagnostics (4 main arctic straits)
227          CALL iom_set_axis_attr( "nstrait", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,4) /) )
228# endif
229#if defined key_top
230          IF( ALLOCATED(profsed) ) CALL iom_set_axis_attr( "profsed", paxis = profsed )
231#endif
232          CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num )
233          CALL iom_set_axis_attr( "iax_20C", (/ REAL(20,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea...
234          CALL iom_set_axis_attr( "iax_28C", (/ REAL(28,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea...
235      ENDIF
236      !
237      ! automatic definitions of some of the xml attributs
238      IF( TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) .OR. TRIM(cdname) == TRIM(crixios_context) ) THEN
239          numrst = numror
240          IF(TRIM(cdname) == TRIM(crixios_context)) numrst = numrir 
241!set names of the fields in restart file IF using XIOS to read data
242          CALL iom_set_rst_context(.TRUE.)
243          CALL iom_set_rst_vars(rst_rfields)
244!set which fields are to be read from restart file
245          CALL iom_set_rstr_active(fname)
246      ELSE IF( TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context)) THEN
247!validate output for issues
248          CALL iom_set_rstw_validate()
249!set names of the fields in restart file IF using XIOS to write data
250          CALL iom_set_rst_context(.FALSE.)   ! grid definition
251!set which fields are to be written to a restart file
252          CALL iom_define_restartw()          ! fields and files definition
253      ELSE
254          CALL set_xmlatt
255      ENDIF
256      !
257      ! end file definition
258      dtime%second = rdt
259      CALL xios_set_timestep( dtime )
260      CALL xios_close_context_definition()
261      CALL xios_update_calendar( 0 )
262      !
263      DEALLOCATE( zt_bnds, zw_bnds )
264      !
265      IF ( ll_tmppatch ) THEN
266         nldi = nldi_save   ;   nlei = nlei_save
267         nldj = nldj_save   ;   nlej = nlej_save
268      ENDIF
269#endif
270      !
271   END SUBROUTINE iom_init
272
273   SUBROUTINE iom_define_restartw()
274      !!---------------------------------------------------------------------
275      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_define_restatw  ***
276      !!
277      !! ** Purpose :  Add files in nemo context to write restart (one and si3)
278      !!---------------------------------------------------------------------
279      INTEGER :: kt
280      CHARACTER(LEN=50)   ::   clname   ! ocean output restart file name
281      CHARACTER(lc)       ::   clpath   ! full path to ocean output restart file
282      CHARACTER(LEN=52)   ::   clpname   ! ocean output restart file name including prefix for AGRIF
283      CHARACTER(LEN=20)   ::   clkt     ! ocean time-step deine as a character
284      INTEGER             ::   iterx, nitrstx, nrst_lstx
285      LOGICAL             ::   lrst_icex, lrst_ocex
286#if defined key_iomput
287
288      IF( ln_rst_list ) THEN
289         nrst_lstx = 1
290         nitrstx = nn_stocklist( nrst_lst )
291      ELSE
292         nitrstx = nitend
293      ENDIF
294
295      IF( .NOT. ln_rst_list .AND. nn_stock == -1 )   RETURN   ! we will never do any restart
296
297      DO kt = nit000, nitend
298         IF( .NOT. ln_rst_list .AND. MOD( kt - 1, nn_stock ) == 0 ) THEN
299            ! we use kt - 1 and not kt - nit000 to keep the same periodicity from the beginning of the experiment
300            nitrstx = kt + nn_stock - 1                  ! define the next value of nitrst for restart writing
301            IF( nitrstx > nitend )   nitrstx = nitend   ! make sure we write a restart at the end of the run
302         ENDIF
303         IF( kt == nitrstx .OR. nn_stock == 1 .OR. kt == nitend ) THEN
304            IF( nitrstx <= nitend .AND. nitrstx > 0 ) THEN
305
306               IF( nitrst > 999999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrstx
307               ELSE                            ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrstx
308               ENDIF
309               ! create the file
310               clname = TRIM(cexper)//"_"//TRIM(ADJUSTL(clkt))//"_"//TRIM(cn_ocerst_out)
311               clpath = TRIM(cn_ocerst_outdir)
312               IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/'
313               IF(lwp) THEN
314                  write(numout, *) 'Create restart file at the step: ', kt
315               ENDIF
316               CALL iom_set_rstw_active(rst_wfields, TRIM(clpath)//TRIM(clname), nitrstx)
317            ENDIF
318         ENDIF
319#if defined key_si3
320         IF( kt == nitrstx - 2*nn_fsbc + 1 .OR. nn_stock == nn_fsbc    &
321         &                             .OR. ( kt == nitend - nn_fsbc + 1 .AND. .NOT. lrst_icex ) ) THEN
322            IF( nitrst <= nitend .AND. nitrst > 0 ) THEN
323               ! beware of the format used to write kt (default is i8.8, that should be large enough...)
324               IF( nitrst > 99999999 ) THEN   ;   WRITE(clkt, *       ) nitrstx
325               ELSE                           ;   WRITE(clkt, '(i8.8)') nitrstx
326               ENDIF
327               ! create the file
328               clname = TRIM(cexper)//"_"//TRIM(ADJUSTL(clkt))//"_"//TRIM(cn_icerst_out)
329               clpath = TRIM(cn_icerst_outdir) 
330               IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath)//'/'
331               IF(lwp) THEN
332                  WRITE(numout,*)
333                  WRITE(numout,*) '             Create ice restart NetCDF file: ',TRIM(clpath)//clname
334                  IF( kt == nitrstx - 2*nn_fsbc + 1 ) THEN
335                     WRITE(numout,*) '             kt = nitrst - 2*nn_fsbc + 1 = ', kt,' date= ', ndastp
336                  ELSE
337                     WRITE(numout,*) '             kt = '                         , kt,' date= ', ndastp
338                  ENDIF
339               ENDIF
340               lrst_icex = .TRUE.
341               CALL iom_set_rstw_active(rsti_wfields, TRIM(clpath)//TRIM(clname), nitrstx)
342            ENDIF
343         ENDIF
344         iterx = kt + nn_fsbc - 1
345         IF( iterx == nitrstx ) THEN
346            lrst_icex = .FALSE.
347            lrst_ocex = .FALSE.
348         ENDIF
349#endif
350         IF( ln_rst_list .AND. kt == nitrst) THEN
351            nrst_lstx = MIN(nrst_lst + 1, SIZE(nn_stocklist,1))
352            nitrstx = nn_stocklist( nrst_lst )
353         ENDIF
354      ENDDO
355#endif
356   END SUBROUTINE iom_define_restartw
357
358   SUBROUTINE iom_set_rstw_validate()
359      !!---------------------------------------------------------------------
360      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rst_validate   ***
361      !!
362      !! ** Purpose :  validate restart files. This routine is only used if
363      !!               restart is written with XIOS. It will check if the same variable
364      !!               is written into more than 1 file. Currently with XIOS
365      !!               the same variable can't be written into 2 different files. Print
366      !!               warning if it's a case.
367      !!---------------------------------------------------------------------
368   INTEGER                        :: ik, jk
369   CHARACTER(LEN=256)             :: clinfo      ! info character
370
371#if defined key_si3
372     DO ik =1, max_rst_fields
373        IF(rst_wfields(ik)%active) THEN
374           DO jk = 1, max_rst_fields
375            IF(rsti_wfields(jk)%active .AND. (TRIM(rsti_wfields(jk)%vname) == TRIM(rst_wfields(ik)%vname))) THEN
376                clinfo = 'Varaible '//TRIM(rsti_wfields(jk)%vname)//' will be written in NEMO and SI3 restart file!'
377                CALL ctl_warn( 'From iom_set_rstw_validate: ',                                                &
378                     trim(clinfo), 'This will cause problems with XIOS; use iom interface instead or rename', &
379                     & 'in one of the restart files')
380            ENDIF
381           ENDDO
382        ENDIF
383     ENDDO
384#endif
385
386   END SUBROUTINE iom_set_rstw_validate
387
388   SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, field)
389      !!---------------------------------------------------------------------
390      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_var_active  ***
391      !!
392      !! ** Purpose :  enable variable in restart file when writing with XIOS
393      !!---------------------------------------------------------------------
394   CHARACTER(len = *), INTENT(IN) :: field
395   TYPE(RST_FIELD),    INTENT(INOUT) :: drst_wfields(max_rst_fields)
396   INTEGER :: i
397   LOGICAL :: llis_set
398   CHARACTER(LEN=256) :: clinfo    ! info character
399
400#if defined key_iomput
401   llis_set = .FALSE.
402
403   DO i = 1, max_rst_fields
404       IF(TRIM(drst_wfields(i)%vname) == field) THEN
405          drst_wfields(i)%active = .TRUE.
406          llis_set = .TRUE.
407          EXIT
408       ENDIF
409   ENDDO
410!Warn if variable is not in defined in drst_wfields
411   IF(.NOT.llis_set) THEN
412      WRITE(ctmp1,*) 'iom_set_rstw_var_active: variable ', field ,' is available for writing but not defined' 
413      CALL ctl_stop( 'iom_set_rstw_var_active:', ctmp1 )
414   ENDIF
415#else
416        clinfo = 'iom_set_rstw_var_active: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality'
417        CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo))
418#endif
419
420   END SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active
421
422   SUBROUTINE iom_set_rstr_active(rst_file)
423      !!---------------------------------------------------------------------
424      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstr_active  ***
425      !!
426      !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for reading restart file,
427      !!               enable variables present in restart file for reading with XIOS
428      !!---------------------------------------------------------------------
429
430!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file
431   CHARACTER(len=256) :: rst_file
432
433#if defined key_iomput
434   TYPE(xios_field) :: field_hdl
435   TYPE(xios_file) :: file_hdl
436   TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl
437   INTEGER :: i
438
439!set name of the restart file and enable available fields
440        if(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS) to: ',rst_file
441        CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl )
442        CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'rrestart')
443        CALL xios_set_file_attr( "rrestart", name=trim(rst_file), type="one_file", &
444             par_access="collective", enabled=.TRUE., mode="read",                 &
445             output_freq=xios_timestep)
446!define variables for restart context
447        DO i = 1, max_rst_fields
448         IF( TRIM(rst_rfields(i)%vname) /= "NO_NAME") THEN
449           IF( iom_varid( numrst, TRIM(rst_rfields(i)%vname), ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN
450                IF(TRIM(rst_rfields(i)%vname) == "e_s") lrsi3_nemo = .FALSE.       ! SI3 restart written by XIOS
451                CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_rfields(i)%vname))
452                SELECT CASE (TRIM(rst_rfields(i)%grid))
453#if defined key_si3
454                 CASE ("grid_Ni_4D")
455                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
456                         grid_ref="grid_Ni_4D", operation = "instant")
457                 CASE ("grid_Ns_4D")
458                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
459                         grid_ref="grid_Ns_4D", operation = "instant")
460                 CASE ("grid_Ni_3D")
461                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
462                         domain_ref="grid_N", axis_ref="numcat", operation = "instant")
463#endif
464                 CASE ("grid_N_3D")
465                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
466                         domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", operation = "instant")
467                 CASE ("grid_N")
468                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
469                         domain_ref="grid_N", operation = "instant") 
470                CASE ("grid_vector")
471                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
472                         axis_ref="nav_lev", operation = "instant")
473                 CASE ("grid_scalar")
474                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), &
475                         scalar_ref = "grid_scalar", operation = "instant")
476                END SELECT
477                IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS read: ', TRIM(rst_rfields(i)%vname), ' enabled in ', TRIM(rst_file)
478           ENDIF
479         ENDIF
480        END DO
481#endif
482   END SUBROUTINE iom_set_rstr_active
483
484   SUBROUTINE iom_set_rstw_core(drst_wfields, cdmdl)
485      !!---------------------------------------------------------------------
486      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_core  ***
487      !!
488      !! ** Purpose :  set variables which are always in restart file
489      !!---------------------------------------------------------------------
490   CHARACTER (len=*), INTENT (IN)   :: cdmdl ! model OPA, SAS or SI3
491   TYPE(RST_FIELD),   INTENT(INOUT) :: drst_wfields(max_rst_fields)
492   CHARACTER(LEN=256)               :: clinfo    ! info character
493   CHARACTER(len=25) ::   znam
494   CHARACTER(len=2)  ::   zchar1
495   INTEGER           ::   jk
496#if defined key_iomput
497   IF(cdmdl == "OPA") THEN
498!from restart.F90
499   CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, "rdt")
500   IF ( .NOT. ln_diurnal_only ) THEN
501        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'ub'  )
502        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'vb'  )
503        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'tb'  )
504        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sb'  )
505        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sshb')
506        !
507        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'un'  )
508        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'vn'  )
509        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'tn'  )
510        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sn'  )
511        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sshn')
512        CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'rhop')
513     ! extra variable needed for the ice sheet coupling
514        IF ( ln_iscpl ) THEN
515             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'tmask')
516             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'umask')
517             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'vmask')
518             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'smask')
519             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'e3t_n')
520             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'e3u_n')
521             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'e3v_n')
522             CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'gdepw_n')
523        END IF
524      ENDIF
525      IF(ln_diurnal) CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'Dsst')
526!from trasbc.F90
527         CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sbc_hc_b')
528         CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sbc_sc_b')
529   ELSE IF(cdmdl == "SI3") THEN
530#if defined key_si3
531      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'nn_fsbc_ice')
532      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'kt_ice'     )
533      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'v_i'        )
534      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'v_s'        )
535      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'sv_i'       )
536      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'a_i'        )
537      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 't_su'       )
538      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'u_ice'      )
539      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'v_ice'      )
540      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'oa_i'       )
541      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'a_ip'       )
542      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'v_ip'       )
543      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'e_s'        )
544      CALL iom_set_rstw_var_active(drst_wfields, 'e_i'        )
545#endif
546   ENDIF
547#else
548        clinfo = 'iom_set_rstw_core: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality'
549        CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo))
550#endif
551   END SUBROUTINE iom_set_rstw_core
552
553   SUBROUTINE iom_set_rst_vars(fields)
554      !!---------------------------------------------------------------------
555      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rst_vars   ***
556      !!
557      !! ** Purpose :  Fill array fields with the information about all
558      !!               possible variables and corresponding grids definition
559      !!               for reading/writing restart with XIOS
560      !!---------------------------------------------------------------------
561   TYPE(RST_FIELD), INTENT(INOUT) :: fields(max_rst_fields)
562   INTEGER :: i, jk
563   CHARACTER(len=2)  ::   zchar
564   CHARACTER(len=25) ::   znam
565
566        i = 0
567        i = iom_add(i); fields(i)%vname="rdt";            fields(i)%grid="grid_scalar"
568        i = iom_add(i); fields(i)%vname="un";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
569        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ub";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
570        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
571        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vb";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
572        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
573        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tb";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
574        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
575        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sb";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
576        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sshn";           fields(i)%grid="grid_N"
577        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sshb";           fields(i)%grid="grid_N"
578        i = iom_add(i); fields(i)%vname="rhop";           fields(i)%grid="grid_N_3D"
579        i = iom_add(i); fields(i)%vname="kt";             fields(i)%grid="grid_scalar"
580        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ndastp";         fields(i)%grid="grid_scalar"
581        i = iom_add(i); fields(i)%vname="adatrj";         fields(i)%grid="grid_scalar"
582        i = iom_add(i); fields(i)%vname="utau_b";         fields(i)%grid="grid_N"
583        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vtau_b";         fields(i)%grid="grid_N"
584        i = iom_add(i); fields(i)%vname="qns_b";          fields(i)%grid="grid_N"
585        i = iom_add(i); fields(i)%vname="emp_b";          fields(i)%grid="grid_N"
586        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sfx_b";          fields(i)%grid="grid_N"
587        i = iom_add(i); fields(i)%vname="en" ;            fields(i)%grid="grid_N_3D" 
588        i = iom_add(i); fields(i)%vname="avt_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D"
589        i = iom_add(i); fields(i)%vname="avm_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D"
590        i = iom_add(i); fields(i)%vname="dissl";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
591        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sbc_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
592        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sbc_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
593        i = iom_add(i); fields(i)%vname="qsr_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N_3D"
594        i = iom_add(i); fields(i)%vname="fraqsr_1lev";    fields(i)%grid="grid_N"
595        i = iom_add(i); fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass"
596                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
597        i = iom_add(i); fields(i)%vname="greenland_icesheet_timelapsed"
598                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
599        i = iom_add(i); fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass_roc"
600                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
601        i = iom_add(i); fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass"
602                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
603        i = iom_add(i); fields(i)%vname="antarctica_icesheet_timelapsed"
604                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
605        i = iom_add(i); fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass_roc"
606                                               fields(i)%grid="grid_scalar"
607        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_v";          fields(i)%grid="grid_scalar"
608        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_t";          fields(i)%grid="grid_scalar"
609        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_s";          fields(i)%grid="grid_scalar"
610        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_wn_t";       fields(i)%grid="grid_scalar"
611        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_wn_s";       fields(i)%grid="grid_scalar"
612        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssh_ini";        fields(i)%grid="grid_N"
613        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3t_ini";        fields(i)%grid="grid_N_3D"
614        i = iom_add(i); fields(i)%vname="hc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D"
615        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D"
616        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssh_hc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N"
617        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssh_sc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N"
618        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tilde_e3t_b";    fields(i)%grid="grid_N"
619        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tilde_e3t_n";    fields(i)%grid="grid_N"
620        i = iom_add(i); fields(i)%vname="hdiv_lf";        fields(i)%grid="grid_N"
621        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ub2_b";          fields(i)%grid="grid_N"
622        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vb2_b";          fields(i)%grid="grid_N"
623        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sshbb_e";        fields(i)%grid="grid_N"
624        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ubb_e";          fields(i)%grid="grid_N"
625        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vbb_e";          fields(i)%grid="grid_N"
626        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sshb_e";         fields(i)%grid="grid_N"
627        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ub_e";           fields(i)%grid="grid_N"
628        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vb_e";           fields(i)%grid="grid_N"
629        i = iom_add(i); fields(i)%vname="fwf_isf_b";      fields(i)%grid="grid_N"
630        i = iom_add(i); fields(i)%vname="isf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
631        i = iom_add(i); fields(i)%vname="isf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
632        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssh_ibb";        fields(i)%grid="grid_N"
633        i = iom_add(i); fields(i)%vname="rnf_b";          fields(i)%grid="grid_N"
634        i = iom_add(i); fields(i)%vname="rnf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
635        i = iom_add(i); fields(i)%vname="rnf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N"
636        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssu_m";          fields(i)%grid="grid_N"
637        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssv_m";          fields(i)%grid="grid_N"
638        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sst_m";          fields(i)%grid="grid_N"
639        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sss_m";          fields(i)%grid="grid_N"
640        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ssh_m";          fields(i)%grid="grid_N"
641        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3t_m";          fields(i)%grid="grid_N"
642        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frq_m";          fields(i)%grid="grid_N"
643        i = iom_add(i); fields(i)%vname="avmb";           fields(i)%grid="grid_vector"
644        i = iom_add(i); fields(i)%vname="avtb";           fields(i)%grid="grid_vector"
645        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ub2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N"
646        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vb2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N"
647        i = iom_add(i); fields(i)%vname="ntime";          fields(i)%grid="grid_scalar"
648        i = iom_add(i); fields(i)%vname="Dsst";           fields(i)%grid="grid_scalar"
649        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
650        i = iom_add(i); fields(i)%vname="umask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
651        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
652        i = iom_add(i); fields(i)%vname="smask";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
653        i = iom_add(i); fields(i)%vname="gdepw_n";        fields(i)%grid="grid_N_3D"
654        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3t_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
655        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3u_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
656        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3v_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
657        i = iom_add(i); fields(i)%vname="surf_ini";       fields(i)%grid="grid_N"
658        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e3t_b";          fields(i)%grid="grid_N_3D"
659        i = iom_add(i); fields(i)%vname="hmxl_n";         fields(i)%grid="grid_N_3D"
660        i = iom_add(i); fields(i)%vname="un_bf";          fields(i)%grid="grid_N"
661        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vn_bf";          fields(i)%grid="grid_N"
662        i = iom_add(i); fields(i)%vname="hbl";            fields(i)%grid="grid_N"
663        i = iom_add(i); fields(i)%vname="hbli";           fields(i)%grid="grid_N"
664        i = iom_add(i); fields(i)%vname="wn";             fields(i)%grid="grid_N_3D"
665        i = iom_add(i); fields(i)%vname="nn_fsbc";       fields(i)%grid="grid_scalar"
666#ifdef key_si3
667!ICE/icedia.F90
668        i = iom_add(i); fields(i)%vname="kt_ice";         fields(i)%grid="grid_scalar"
669        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_voltop";     fields(i)%grid="grid_scalar"
670        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_volbot";     fields(i)%grid="grid_scalar"
671        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_temtop";     fields(i)%grid="grid_scalar"
672        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_tembot";     fields(i)%grid="grid_scalar" 
673        i = iom_add(i); fields(i)%vname="frc_sal";        fields(i)%grid="grid_scalar"
674        i = iom_add(i); fields(i)%vname="vol_loc_ini";    fields(i)%grid="grid_N"
675        i = iom_add(i); fields(i)%vname="tem_loc_ini";    fields(i)%grid="grid_N"
676        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sal_loc_ini";    fields(i)%grid="grid_N"
677        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sal_loc_ini";    fields(i)%grid="grid_N"
678!ICE/icedyn_adv_pra.F90 grid_Ni_3D - jpi,jpj,jpl
679        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxice";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
680        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syice";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
681        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxice";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
682        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syyice";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
683        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxyice";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
684        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxsn";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
685        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sysn";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
686        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxsn";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
687        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syysn";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
688        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxysn";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
689        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxa";            fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
690        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sya";            fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
691        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxa";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
692        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syya";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
693        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxya";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
694        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxsal";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
695        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sysal";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
696        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxsal";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
697        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syysal";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
698        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxysal";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
699        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxage";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
700        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syage";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
701        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxage";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
702        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syyage";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
703        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxyage";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
704!this part is in addition to 4D grids, to handle old format for SI3 resart
705!NEMO format restart
706        DO jk = 1, nlay_s
707           WRITE(zchar,'(I2.2)') jk
708           znam = 'sxc0'//'_l'//zchar
709           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
710           znam = 'syc0'//'_l'//zchar
711           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
712           znam = 'sxxc0'//'_l'//zchar
713           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
714           znam = 'syyc0'//'_l'//zchar
715           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
716           znam = 'sxyc0'//'_l'//zchar
717           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
718        END DO
719!XIOS format restart
720        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxc0";           fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
721        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syc0";           fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
722        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxc0";          fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
723        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syyc0";          fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
724        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxyc0";          fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
725        !
726!NEMO format restart
727        DO jk = 1, nlay_i
728           WRITE(zchar,'(I2.2)') jk
729           znam = 'sxe'//'_l'//zchar
730           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
731           znam = 'sye'//'_l'//zchar 
732           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
733           znam = 'sxxe'//'_l'//zchar
734           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
735           znam = 'syye'//'_l'//zchar
736           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
737           znam = 'sxye'//'_l'//zchar
738           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
739        ENDDO
740!XIOS format restart
741        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxe";           fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
742        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sye";           fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
743        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxe";          fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
744        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syye";          fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
745        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxye";          fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
746!common for both
747        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxap";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
748        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syap";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
749        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxap";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
750        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syyap";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
751        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxyap";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
752        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxvp";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
753        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syvp";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
754        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxxvp";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
755        i = iom_add(i); fields(i)%vname="syyvp";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
756        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sxyvp";         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
757        i = iom_add(i); fields(i)%vname="stress1_i";     fields(i)%grid="grid_N"
758        i = iom_add(i); fields(i)%vname="stress2_i";     fields(i)%grid="grid_N"
759        i = iom_add(i); fields(i)%vname="stress12_i";    fields(i)%grid="grid_N"
760        i = iom_add(i); fields(i)%vname="nn_fsbc_ice";   fields(i)%grid="grid_scalar"
761        i = iom_add(i); fields(i)%vname="kt_ice";        fields(i)%grid="grid_scalar"
762        i = iom_add(i); fields(i)%vname="v_i";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
763        i = iom_add(i); fields(i)%vname="v_s";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
764        i = iom_add(i); fields(i)%vname="sv_i";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
765        i = iom_add(i); fields(i)%vname="a_i";           fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
766        i = iom_add(i); fields(i)%vname="t_su";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
767        i = iom_add(i); fields(i)%vname="u_ice";         fields(i)%grid="grid_N"
768        i = iom_add(i); fields(i)%vname="v_ice";         fields(i)%grid="grid_N"
769!NEMO format restat
770        DO jk = 1, nlay_s
771           WRITE(zchar,'(I2.2)') jk
772           znam = 'e_s'//'_l'//zchar
773           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
774        END DO
775!XIOS format restart
776        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e_s";           fields(i)%grid="grid_Ns_4D"
777!NEMO format restat
778        DO jk = 1, nlay_i
779           WRITE(zchar,'(I2.2)') jk
780           znam = 'e_i'//'_l'//zchar
781           i = iom_add(i); fields(i)%vname=znam;         fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
782        END DO
783!XIOS format restart
784        i = iom_add(i); fields(i)%vname="e_i";           fields(i)%grid="grid_Ni_4D"
785!common for both
786        i = iom_add(i); fields(i)%vname="oa_i";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
787        i = iom_add(i); fields(i)%vname="a_ip";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
788        i = iom_add(i); fields(i)%vname="v_ip";          fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
789        i = iom_add(i); fields(i)%vname="cnd_ice";       fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
790        i = iom_add(i); fields(i)%vname="t1_ice";        fields(i)%grid="grid_Ni_3D"
791        i = iom_add(i); fields(i)%vname="snwice_mass";   fields(i)%grid="grid_N"
792        i = iom_add(i); fields(i)%vname="snwice_mass_b"; fields(i)%grid="grid_N"
793#endif
794   END SUBROUTINE iom_set_rst_vars
795
796
797   SUBROUTINE iom_set_rstw_active(drst_wfields, cdrst_file, kdstep)
798      !!---------------------------------------------------------------------
799      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rstw_active   ***
800      !!
801      !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for writing restart
802      !!               enable variables present in restart file for writing
803      !!---------------------------------------------------------------------
804!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file
805   CHARACTER(len=*), INTENT(IN) :: cdrst_file
806   TYPE(RST_FIELD),  INTENT(IN) :: drst_wfields(max_rst_fields)
807   INTEGER        ,  INTENT(IN) :: kdstep
808#if defined key_iomput
809   TYPE(xios_field)     :: field_hdl
810   TYPE(xios_file)      :: file_hdl
811   TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl
812   TYPE(XIOS_DURATION)  :: freq
813   INTEGER              :: i
814   CHARACTER(lc)        :: clpath
815
816   write(snr, *) kdstep
817!set name of the restart file and enable available fields
818        IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS write) to: ',cdrst_file
819        CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl )
820        CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl)
821        IF(nxioso.eq.1) THEN
822           CALL xios_set_attr( file_hdl, type="one_file", enabled=.TRUE.,& 
823                                    mode="write", output_freq=kdstep*xios_timestep) 
824           if(lwp) write(numout,*) 'Define ', trim(cdrst_file), ' in one_file mode' 
825        ELSE 
826           CALL xios_set_attr( file_hdl, type="multiple_file", enabled=.TRUE.,& 
827                                    mode="write", output_freq=xios_timestep) 
828           if(lwp) write(numout,*) 'Define ', trim(cdrst_file), ' in multiple_file mode' 
829        ENDIF
830        CALL xios_set_attr( file_hdl, name=trim(cdrst_file))
831!define fields for restart context
832        DO i = 1, max_rst_fields
833         IF( drst_wfields(i)%active ) THEN
834                CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(drst_wfields(i)%vname)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)))
835                SELECT CASE (TRIM(drst_wfields(i)%grid))
836#if defined key_si3
837                 CASE ("grid_Ni_4D")
838                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
839                         grid_ref="grid_Ni_4D", prec = 8, operation = "instant")
840                 CASE ("grid_Ns_4D")
841                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
842                         grid_ref="grid_Ns_4D", prec = 8, operation = "instant")
843                 CASE ("grid_Ni_3D")
844                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
845                         domain_ref="grid_N", axis_ref="numcat", prec = 8, operation = "instant")
846#endif
847                 CASE ("grid_N_3D")
848                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
849                         domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant")
850                 CASE ("grid_N")
851                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
852                         domain_ref="grid_N", prec = 8, operation = "instant")
853                 CASE ("grid_vector")
854                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
855                         axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant")
856                 CASE ("grid_scalar")
857                    CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(drst_wfields(i)%vname), &
858                         scalar_ref = "grid_scalar", prec = 8, operation = "instant")
859                END SELECT
860         ENDIF
861        END DO
862#endif
863   END SUBROUTINE iom_set_rstw_active
864
865   SUBROUTINE iom_set_rst_context(ld_rstr) 
866     !!---------------------------------------------------------------------
867      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rst_context  ***
868      !!
869      !! ** Purpose : Define domain, axis and grid for restart (read/write)
870      !!              context
871      !!               
872      !!---------------------------------------------------------------------
873   LOGICAL, INTENT(IN)               :: ld_rstr
874!ld_rstr is true for restart context. There is no need to define grid for
875!restart read, because it's read from file
876#if defined key_iomput
877   TYPE(xios_domaingroup)            :: domaingroup_hdl 
878   TYPE(xios_domain)                 :: domain_hdl 
879   TYPE(xios_axisgroup)              :: axisgroup_hdl 
880   TYPE(xios_axis)                   :: axis_hdl 
881   TYPE(xios_scalar)                 :: scalar_hdl 
882   TYPE(xios_scalargroup)            :: scalargroup_hdl 
883   INTEGER                           :: ji
884
885     CALL xios_get_handle("domain_definition",domaingroup_hdl) 
886     CALL xios_add_child(domaingroup_hdl, domain_hdl, "grid_N") 
887     CALL set_grid("N", glamt, gphit, .TRUE., ld_rstr) 
888 
889     CALL xios_get_handle("axis_definition",axisgroup_hdl) 
890     CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nav_lev") 
891!AGRIF fails to compile when unit= is in call to xios_set_axis_attr
892!    CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels",  unit="m", positive="down")
893     CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels in meters", positive="down")
894     CALL iom_set_axis_attr( "nav_lev", paxis = gdept_1d ) 
895
896     CALL xios_get_handle("scalar_definition", scalargroup_hdl) 
897     CALL xios_add_child(scalargroup_hdl, scalar_hdl, "grid_scalar") 
898#if defined key_si3
899     CALL xios_get_handle("axis_definition",axisgroup_hdl) 
900     CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "numcat")
901     CALL iom_set_axis_attr( "numcat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) )
902     CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nlay_i")
903     CALL iom_set_axis_attr( "nlay_i", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nlay_i) /) )
904     CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nlay_s")
905     CALL iom_set_axis_attr( "nlay_s", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nlay_s) /) )
906#endif
907#endif
908   END SUBROUTINE iom_set_rst_context
909
910   SUBROUTINE iom_swap( cdname )
911      !!---------------------------------------------------------------------
912      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_swap  ***
913      !!
914      !! ** Purpose :  swap context between different agrif grid for xmlio_server
915      !!---------------------------------------------------------------------
916      CHARACTER(len=*), INTENT(in) :: cdname
917#if defined key_iomput
918      TYPE(xios_context) :: nemo_hdl
919     
920      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
921        CALL xios_get_handle(TRIM(cdname),nemo_hdl)
922      ELSE
923        CALL xios_get_handle(TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(cdname),nemo_hdl)
924      ENDIF
925      !
926      CALL xios_set_current_context(nemo_hdl)
927#endif
928      !
929   END SUBROUTINE iom_swap
930
931
932   SUBROUTINE iom_open( cdname, kiomid, ldwrt, kdom, ldstop, ldiof, kdlev )
933      !!---------------------------------------------------------------------
934      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
935      !!
936      !! ** Purpose :  open an input file (return 0 if not found)
937      !!---------------------------------------------------------------------
938      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )           ::   cdname   ! File name
939      INTEGER         , INTENT(  out)           ::   kiomid   ! iom identifier of the opened file
940      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldwrt    ! open in write modeb          (default = .FALSE.)
941      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdom     ! Type of domain to be written (default = jpdom_local_noovlap)
942      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if open to read a non-existing file (default = .TRUE.)
943      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldiof    ! Interp On the Fly, needed for AGRIF (default = .FALSE.)
944      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdlev    ! number of vertical levels
945      !
946      CHARACTER(LEN=256)    ::   clname    ! the name of the file based on cdname [[+clcpu]+clcpu]
947      CHARACTER(LEN=256)    ::   cltmpn    ! tempory name to store clname (in writting mode)
948      CHARACTER(LEN=10)     ::   clsuffix  ! ".nc"
949      CHARACTER(LEN=15)     ::   clcpu     ! the cpu number (max jpmax_digits digits)
950      CHARACTER(LEN=256)    ::   clinfo    ! info character
951      LOGICAL               ::   llok      ! check the existence
952      LOGICAL               ::   llwrt     ! local definition of ldwrt
953      LOGICAL               ::   llnoov    ! local definition to read overlap
954      LOGICAL               ::   llstop    ! local definition of ldstop
955      LOGICAL               ::   lliof     ! local definition of ldiof
956      INTEGER               ::   icnt      ! counter for digits in clcpu (max = jpmax_digits)
957      INTEGER               ::   iln, ils  ! lengths of character
958      INTEGER               ::   idom      ! type of domain
959      INTEGER               ::   istop     !
960      INTEGER, DIMENSION(2,5) ::   idompar ! domain parameters:
961      ! local number of points for x,y dimensions
962      ! position of first local point for x,y dimensions
963      ! position of last local point for x,y dimensions
964      ! start halo size for x,y dimensions
965      ! end halo size for x,y dimensions
966      !---------------------------------------------------------------------
967      ! Initializations and control
968      ! =============
969      kiomid = -1
970      clinfo = '                    iom_open ~~~  '
971      istop = nstop
972      ! if iom_open is called for the first time: initialize iom_file(:)%nfid to 0
973      ! (could be done when defining iom_file in f95 but not in f90)
974      IF( Agrif_Root() ) THEN
975         IF( iom_open_init == 0 ) THEN
976            iom_file(:)%nfid = 0
977            iom_open_init = 1
978         ENDIF
979      ENDIF
980      ! do we read or write the file?
981      IF( PRESENT(ldwrt) ) THEN   ;   llwrt = ldwrt
982      ELSE                        ;   llwrt = .FALSE.
983      ENDIF
984      ! do we call ctl_stop if we try to open a non-existing file in read mode?
985      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
986      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
987      ENDIF
988      ! are we using interpolation on the fly?
989      IF( PRESENT(ldiof) ) THEN   ;   lliof = ldiof
990      ELSE                        ;   lliof = .FALSE.
991      ENDIF
992      ! do we read the overlap
993      ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
994      llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif
995      ! create the file name by added, if needed, TRIM(Agrif_CFixed()) and TRIM(clsuffix)
996      ! =============
997      clname   = trim(cdname)
998      IF ( .NOT. Agrif_Root() .AND. .NOT. lliof ) THEN
999!FUS         iln    = INDEX(clname,'/')
1000         iln    = INDEX(clname,'/',BACK=.true.)  ! FUS: to insert the nest index at the right location within the string, the last / has to be found (search from the right to left)
1001         cltmpn = clname(1:iln)
1002         clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
1003         clname=TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
1004      ENDIF
1005      ! which suffix should we use?
1006      clsuffix = '.nc'
1007      ! Add the suffix if needed
1008      iln = LEN_TRIM(clname)
1009      ils = LEN_TRIM(clsuffix)
1010      IF( iln <= ils .OR. INDEX( TRIM(clname), TRIM(clsuffix), back = .TRUE. ) /= iln - ils + 1 )   &
1011         &   clname = TRIM(clname)//TRIM(clsuffix)
1012      cltmpn = clname   ! store this name
1013      ! try to find if the file to be opened already exist
1014      ! =============
1015      INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
1016      IF( .NOT.llok ) THEN
1017         ! we try to add the cpu number to the name
1018         WRITE(clcpu,*) narea-1
1019
1020         clcpu  = TRIM(ADJUSTL(clcpu))
1021         iln = INDEX(clname,TRIM(clsuffix), back = .TRUE.)
1022         clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
1023         icnt = 0
1024         INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok ) 
1025         ! we try different formats for the cpu number by adding 0
1026         DO WHILE( .NOT.llok .AND. icnt < jpmax_digits )
1027            clcpu  = "0"//trim(clcpu)
1028            clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
1029            INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
1030            icnt = icnt + 1
1031         END DO
1032      ELSE
1033         lxios_sini = .TRUE.
1034      ENDIF
1035      IF( llwrt ) THEN
1036         ! check the domain definition
1037! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1038!         idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
1039         IF( llnoov ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
1040         ELSE                ;   idom = jpdom_local_full      ! default definition
1041         ENDIF
1042         IF( PRESENT(kdom) )   idom = kdom
1043         ! create the domain informations
1044         ! =============
1045         SELECT CASE (idom)
1046         CASE (jpdom_local_full)
1047            idompar(:,1) = (/ jpi             , jpj              /)
1048            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
1049            idompar(:,3) = (/ nimpp + jpi - 1 , njmpp + jpj - 1  /)
1050            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
1051            idompar(:,5) = (/ jpi - nlei      , jpj - nlej       /)
1052         CASE (jpdom_local_noextra)
1053            idompar(:,1) = (/ nlci            , nlcj             /)
1054            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
1055            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlci - 1, njmpp + nlcj - 1 /)
1056            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
1057            idompar(:,5) = (/ nlci - nlei     , nlcj - nlej      /)
1058         CASE (jpdom_local_noovlap)
1059            idompar(:,1) = (/ nlei  - nldi + 1, nlej  - nldj + 1 /)
1060            idompar(:,2) = (/ nimpp + nldi - 1, njmpp + nldj - 1 /)
1061            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlei - 1, njmpp + nlej - 1 /)
1062            idompar(:,4) = (/ 0               , 0                /)
1063            idompar(:,5) = (/ 0               , 0                /)
1064         CASE DEFAULT
1065            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'wrong value of kdom, only jpdom_local* cases are accepted' )
1066         END SELECT
1067      ENDIF
1068      ! Open the NetCDF file
1069      ! =============
1070      ! do we have some free file identifier?
1071      IF( MINVAL(iom_file(:)%nfid) /= 0 )   &
1072         &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'No more free file identifier', 'increase jpmax_files in iom_def' )
1073      ! if no file was found...
1074      IF( .NOT. llok ) THEN
1075         IF( .NOT. llwrt ) THEN   ! we are in read mode
1076            IF( llstop ) THEN   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'File '//TRIM(cltmpn)//'* not found' )
1077            ELSE                ;   istop = nstop + 1   ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
1078            ENDIF
1079         ELSE                     ! we are in write mode so we
1080            clname = cltmpn       ! get back the file name without the cpu number
1081         ENDIF
1082      ELSE
1083         IF( llwrt .AND. .NOT. ln_clobber ) THEN   ! we stop as we want to write in a new file
1084            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'We want to write in a new file but '//TRIM(clname)//' already exists...' )
1085            istop = nstop + 1                      ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
1086         ELSEIF( llwrt ) THEN     ! the file exists and we are in write mode with permission to
1087            clname = cltmpn       ! overwrite so get back the file name without the cpu number
1088         ENDIF
1089      ENDIF
1090      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
1091         CALL iom_nf90_open( clname, kiomid, llwrt, llok, idompar, kdlev = kdlev )
1092      ENDIF
1093      !
1094   END SUBROUTINE iom_open
1095
1096
1097   SUBROUTINE iom_close( kiomid )
1098      !!--------------------------------------------------------------------
1099      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_close  ***
1100      !!
1101      !! ** Purpose : close an input file, or all files opened by iom
1102      !!--------------------------------------------------------------------
1103      INTEGER, INTENT(inout), OPTIONAL ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
1104      !                                              ! return 0 when file is properly closed
1105      !                                              ! No argument: all files opened by iom are closed
1106
1107      INTEGER ::   jf         ! dummy loop indices
1108      INTEGER ::   i_s, i_e   ! temporary integer
1109      CHARACTER(LEN=100)    ::   clinfo    ! info character
1110      !---------------------------------------------------------------------
1111      !
1112      clinfo = '                    iom_close ~~~  '
1113      IF( PRESENT(kiomid) ) THEN
1114         i_s = kiomid
1115         i_e = kiomid
1116      ELSE
1117         i_s = 1
1118         i_e = jpmax_files
1119      ENDIF
1120
1121      IF( i_s > 0 ) THEN
1122         DO jf = i_s, i_e
1123            IF( iom_file(jf)%nfid > 0 ) THEN
1124               CALL iom_nf90_close( jf )
1125               iom_file(jf)%nfid       = 0          ! free the id
1126               IF( PRESENT(kiomid) )   kiomid = 0   ! return 0 as id to specify that the file was closed
1127               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' close file: '//TRIM(iom_file(jf)%name)//' ok'
1128            ELSEIF( PRESENT(kiomid) ) THEN
1129               WRITE(ctmp1,*) '--->',  kiomid
1130               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' Invalid file identifier', ctmp1 )
1131            ENDIF
1132         END DO
1133      ENDIF
1134      !   
1135   END SUBROUTINE iom_close
1136
1137
1138   FUNCTION iom_varid ( kiomid, cdvar, kdimsz, kndims, lduld, ldstop ) 
1139      !!-----------------------------------------------------------------------
1140      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
1141      !!
1142      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file (return 0 if not found)
1143      !!-----------------------------------------------------------------------
1144      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
1145      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
1146      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of each dimension
1147      INTEGER              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! number of dimensions
1148      LOGICAL              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   lduld    ! true if the last dimension is unlimited (time)
1149      LOGICAL              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if looking for non-existing variable (default = .TRUE.)
1150      !
1151      INTEGER                        ::   iom_varid, iiv, i_nvd
1152      LOGICAL                        ::   ll_fnd
1153      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo                   ! info character
1154      LOGICAL                        ::   llstop                   ! local definition of ldstop
1155      !!-----------------------------------------------------------------------
1156      iom_varid = 0                         ! default definition
1157      ! do we call ctl_stop if we look for non-existing variable?
1158      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
1159      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
1160      ENDIF
1161      !
1162      IF( kiomid > 0 ) THEN
1163         clinfo = 'iom_varid, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(cdvar)
1164         IF( iom_file(kiomid)%nfid == 0 ) THEN
1165            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the file is not open' )
1166         ELSE
1167            ll_fnd  = .FALSE.
1168            iiv = 0
1169            !
1170            DO WHILE ( .NOT.ll_fnd .AND. iiv < iom_file(kiomid)%nvars )
1171               iiv = iiv + 1
1172               ll_fnd  = ( TRIM(cdvar) == TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(iiv)) )
1173            END DO
1174            !
1175            IF( .NOT.ll_fnd ) THEN
1176               iiv = iiv + 1
1177               IF( iiv <= jpmax_vars ) THEN
1178                  iom_varid = iom_nf90_varid( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz, kndims, lduld )
1179               ELSE
1180                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'Too many variables in the file '//iom_file(kiomid)%name,   &
1181                        &                      'increase the parameter jpmax_vars')
1182               ENDIF
1183               IF( llstop .AND. iom_varid == -1 )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' not found' ) 
1184            ELSE
1185               iom_varid = iiv
1186               IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
1187                  i_nvd = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
1188                  IF( i_nvd <= size(kdimsz) ) THEN
1189                     kdimsz(1:i_nvd) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,iiv)
1190                  ELSE
1191                     WRITE(ctmp1,*) i_nvd, size(kdimsz)
1192                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'error in kdimsz size'//trim(ctmp1) )
1193                  ENDIF
1194               ENDIF
1195               IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
1196               IF( PRESENT( lduld) )  lduld  = iom_file(kiomid)%luld( iiv)
1197            ENDIF
1198         ENDIF
1199      ENDIF
1200      !
1201   END FUNCTION iom_varid
1202
1203
1204   !!----------------------------------------------------------------------
1205   !!                   INTERFACE iom_get
1206   !!----------------------------------------------------------------------
1207   SUBROUTINE iom_g0d( kiomid, cdvar, pvar, ktime, ldxios )
1208      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
1209      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable
1210      REAL(wp)        , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
1211      INTEGER         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ktime     ! record number
1212      LOGICAL         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ldxios    ! use xios to read restart
1213      !
1214      INTEGER                                         ::   idvar     ! variable id
1215      INTEGER                                         ::   idmspc    ! number of spatial dimensions
1216      INTEGER         , DIMENSION(1)                  ::   itime     ! record number
1217      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clinfo    ! info character
1218      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clname    ! file name
1219      CHARACTER(LEN=1)                                ::   cldmspc   !
1220      LOGICAL                                         ::   llxios
1221      !
1222      llxios = .FALSE.
1223      IF( PRESENT(ldxios) ) llxios = ldxios
1224
1225      IF(.NOT.llxios) THEN  ! read data using default library
1226         itime = 1
1227         IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
1228         !
1229         clname = iom_file(kiomid)%name
1230         clinfo = '          iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
1231         !
1232         IF( kiomid > 0 ) THEN
1233            idvar = iom_varid( kiomid, cdvar )
1234            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 .AND. idvar > 0 ) THEN
1235               idmspc = iom_file ( kiomid )%ndims( idvar )
1236               IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )  idmspc = idmspc - 1
1237               WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
1238               IF( idmspc > 0 )  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'When reading to a 0D array, we do not accept data', &
1239                                    &                         'with 1 or more spatial dimensions: '//cldmspc//' were found.' , &
1240                                    &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
1241               CALL iom_nf90_get( kiomid, idvar, pvar, itime )
1242            ENDIF
1243         ENDIF
1244      ELSE
1245#if defined key_iomput
1246         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (0D): ', trim(cdvar)
1247         CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pvar)
1248#else
1249         WRITE(ctmp1,*) 'Can not use XIOS in iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar)
1250         CALL ctl_stop( 'iom_g0d', ctmp1 )
1251#endif
1252      ENDIF
1253   END SUBROUTINE iom_g0d
1254
1255   SUBROUTINE iom_g1d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, ldxios )
1256      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file
1257      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read
1258      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                         ::   cdvar     ! Name of the variable
1259      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:)           ::   pvar      ! read field
1260      INTEGER         , INTENT(in   )              , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
1261      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
1262      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
1263      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS
1264      !
1265      IF( kiomid > 0 ) THEN
1266         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=pvar,   &
1267              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
1268              &                                                     ldxios=ldxios )
1269      ENDIF
1270   END SUBROUTINE iom_g1d
1271
1272   SUBROUTINE iom_g2d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, ldxios)
1273      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1274      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kdom      ! Type of domain to be read
1275      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                           ::   cdvar     ! Name of the variable
1276      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:)           ::   pvar      ! read field
1277      INTEGER         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
1278      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
1279      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
1280      LOGICAL         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
1281                                                                               ! look for and use a file attribute
1282                                                                               ! called open_ocean_jstart to set the start
1283                                                                               ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1284      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios      ! read data using XIOS
1285      !
1286      IF( kiomid > 0 ) THEN
1287         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r2d=pvar,   &
1288              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
1289              &                                                     lrowattr=lrowattr,  ldxios=ldxios)
1290      ENDIF
1291   END SUBROUTINE iom_g2d
1292
1293   SUBROUTINE iom_g3d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, ldxios )
1294      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kiomid    ! Identifier of the file
1295      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kdom      ! Type of domain to be read
1296      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                             ::   cdvar     ! Name of the variable
1297      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:,:)           ::   pvar      ! read field
1298      INTEGER         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
1299      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
1300      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
1301      LOGICAL         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
1302                                                                                 ! look for and use a file attribute
1303                                                                                 ! called open_ocean_jstart to set the start
1304                                                                                 ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1305      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios        ! read data using XIOS
1306      !
1307      IF( kiomid > 0 ) THEN
1308         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r3d=pvar,   &
1309              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
1310              &                                                     lrowattr=lrowattr, ldxios=ldxios )
1311      ENDIF
1312   END SUBROUTINE iom_g3d
1313
1314   SUBROUTINE iom_g4d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, lrowattr, ldxios )
1315      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kiomid    ! Identifier of the file
1316      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kdom      ! Type of domain to be read
1317      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                             ::   cdvar     ! Name of the variable
1318      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:,:,:)         ::   pvar      ! read field
1319      INTEGER         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
1320      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(4)    , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
1321      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(4)    , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
1322      LOGICAL         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   lrowattr  ! logical flag telling iom_get to
1323                                                                                 ! look for and use a file attribute
1324                                                                                 ! called open_ocean_jstart to set the start
1325                                                                                 ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1326      LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios        ! read data using XIOS
1327      !
1328      IF( kiomid > 0 ) THEN
1329         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r4d=pvar,   &
1330              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, &
1331              &                                                     lrowattr=lrowattr, ldxios=ldxios )
1332      ENDIF
1333   END SUBROUTINE iom_g4d
1334   !!----------------------------------------------------------------------
1335
1336   SUBROUTINE iom_get_123d( kiomid, kdom  , cdvar ,   &
1337         &                  pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d, pv_r4d,  &
1338         &                  ktime , kstart, kcount,   &
1339         &                  lrowattr, ldxios        )
1340      !!-----------------------------------------------------------------------
1341      !!                  ***  ROUTINE  iom_get_123d  ***
1342      !!
1343      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable
1344      !!
1345      !! ** Method : read ONE record at each CALL
1346      !!-----------------------------------------------------------------------
1347      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid     ! Identifier of the file
1348      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kdom       ! Type of domain to be read
1349      CHARACTER(len=*)           , INTENT(in   )           ::   cdvar      ! Name of the variable
1350      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d     ! read field (1D case)
1351      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d     ! read field (2D case)
1352      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d     ! read field (3D case)
1353      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:,:),INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r4d     ! read field (4D case)
1354      INTEGER                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ktime      ! record number
1355      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kstart     ! start position of the reading in each axis
1356      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kcount     ! number of points to be read in each axis
1357      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   lrowattr   ! logical flag telling iom_get to
1358                                                                           ! look for and use a file attribute
1359                                                                           ! called open_ocean_jstart to set the start
1360                                                                           ! value for the 2nd dimension (netcdf only)
1361      LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldxios     ! use XIOS to read restart
1362      !
1363      LOGICAL                        ::   llxios       ! local definition for XIOS read
1364      LOGICAL                        ::   llnoov      ! local definition to read overlap
1365      LOGICAL                        ::   luse_jattr  ! local definition to read open_ocean_jstart file attribute
1366      INTEGER                        ::   jstartrow   ! start point for 2nd dimension optionally set by file attribute
1367      INTEGER                        ::   jl          ! loop on number of dimension
1368      INTEGER                        ::   idom        ! type of domain
1369      INTEGER                        ::   idvar       ! id of the variable
1370      INTEGER                        ::   inbdim      ! number of dimensions of the variable
1371      INTEGER                        ::   idmspc      ! number of spatial dimensions
1372      INTEGER                        ::   itime       ! record number
1373      INTEGER                        ::   istop       ! temporary value of nstop
1374      INTEGER                        ::   ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes
1375      INTEGER                        ::   ji, jj      ! loop counters
1376      INTEGER                        ::   irankpv     !
1377      INTEGER                        ::   ind1, ind2  ! substring index
1378      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   istart      ! starting point to read for each axis
1379      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   icnt        ! number of value to read along each axis
1380      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimsz      ! size of the dimensions of the variable
1381      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   ishape      ! size of the dimensions of the variable
1382      REAL(wp)                       ::   zscf, zofs  ! sacle_factor and add_offset
1383      INTEGER                        ::   itmp        ! temporary integer
1384      CHARACTER(LEN=256)             ::   clinfo      ! info character
1385      CHARACTER(LEN=256)             ::   clname      ! file name
1386      CHARACTER(LEN=1)               ::   clrankpv, cldmspc      !
1387      LOGICAL                        ::   ll_depth_spec ! T => if kstart, kcount present then *only* use values for 3rd spatial dimension.
1388      INTEGER                        ::   inlev       ! number of levels for 3D data
1389      REAL(wp)                       ::   gma, gmi
1390      !---------------------------------------------------------------------
1391      !
1392      inlev = -1
1393      IF( PRESENT(pv_r3d) )   inlev = SIZE(pv_r3d, 3)
1394      !
1395      llxios = .FALSE.
1396      if(PRESENT(ldxios)) llxios = ldxios
1397      idvar = iom_varid( kiomid, cdvar ) 
1398      idom = kdom
1399      !
1400      IF(.NOT.llxios) THEN
1401         clname = iom_file(kiomid)%name   !   esier to read
1402         clinfo = '          iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
1403         ! local definition of the domain ?
1404         ! do we read the overlap
1405         ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
1406         llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
1407         ! check kcount and kstart optionals parameters...
1408         IF( PRESENT(kcount) .AND. (.NOT. PRESENT(kstart)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kcount present needs kstart present')
1409         IF( PRESENT(kstart) .AND. (.NOT. PRESENT(kcount)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kcount present')
1410         IF( PRESENT(kstart) .AND. idom /= jpdom_unknown .AND.  idom /= jpdom_autoglo_xy  ) &
1411     &          CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kdom = jpdom_unknown or kdom = jpdom_autoglo_xy')
1412
1413         luse_jattr = .false.
1414         IF( PRESENT(lrowattr) ) THEN
1415            IF( lrowattr .AND. idom /= jpdom_data   ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'lrowattr present and true needs kdom = jpdom_data')
1416            IF( lrowattr .AND. idom == jpdom_data   ) luse_jattr = .true.
1417         ENDIF
1418
1419         ! Search for the variable in the data base (eventually actualize data)
1420         istop = nstop
1421         !
1422         IF( idvar > 0 ) THEN
1423            ! to write iom_file(kiomid)%dimsz in a shorter way !
1424            idimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(:, idvar) 
1425            inbdim = iom_file(kiomid)%ndims(idvar)            ! number of dimensions in the file
1426            idmspc = inbdim                                   ! number of spatial dimensions in the file
1427            IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   idmspc = inbdim - 1
1428            IF( idmspc > 3 )   CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'the file has more than 3 spatial dimensions this case is not coded...') 
1429            !
1430            ! update idom definition...
1431            ! Identify the domain in case of jpdom_auto(glo/dta) definition
1432            IF( idom == jpdom_autoglo_xy ) THEN
1433               ll_depth_spec = .TRUE.
1434               idom = jpdom_autoglo
1435            ELSE
1436               ll_depth_spec = .FALSE.
1437            ENDIF
1438            IF( idom == jpdom_autoglo .OR. idom == jpdom_autodta ) THEN           
1439               IF( idom == jpdom_autoglo ) THEN   ;   idom = jpdom_global 
1440               ELSE                               ;   idom = jpdom_data
1441               ENDIF
1442               ind1 = INDEX( clname, '_', back = .TRUE. ) + 1
1443               ind2 = INDEX( clname, '.', back = .TRUE. ) - 1
1444               IF( ind2 > ind1 ) THEN   ;   IF( VERIFY( clname(ind1:ind2), '0123456789' ) == 0 )   idom = jpdom_local   ;   ENDIF
1445            ENDIF
1446            ! Identify the domain in case of jpdom_local definition
1447            IF( idom == jpdom_local ) THEN
1448               IF(     idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN   ;   idom = jpdom_local_full
1449               ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noextra
1450               ELSEIF( idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap
1451               ELSE   ;   CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'impossible to identify the local domain' )
1452               ENDIF
1453            ENDIF
1454            !
1455            ! check the consistency between input array and data rank in the file
1456            !
1457            ! initializations
1458            itime = 1
1459            IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
1460            !
1461            irankpv = 1 * COUNT( (/PRESENT(pv_r1d)/) ) + 2 * COUNT( (/PRESENT(pv_r2d)/) ) + 3 * COUNT( (/PRESENT(pv_r3d)/) )
1462            WRITE(clrankpv, fmt='(i1)') irankpv
1463            WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
1464            !
1465            IF(     idmspc <  irankpv ) THEN
1466               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'The file has only '//cldmspc//' spatial dimension',   &
1467                  &                         'it is impossible to read a '//clrankpv//'D array from this file...' )
1468            ELSEIF( idmspc == irankpv ) THEN
1469               IF( PRESENT(pv_r1d) .AND. idom /= jpdom_unknown )   &
1470                  &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'case not coded...You must use jpdom_unknown' )
1471            ELSEIF( idmspc >  irankpv ) THEN
1472                  IF( PRESENT(pv_r2d) .AND. itime == 1 .AND. idimsz(3) == 1 .AND. idmspc == 3 ) THEN
1473                     CALL ctl_warn( trim(clinfo), '2D array but 3 spatial dimensions for the data...'              ,   &
1474                           &         'As the size of the z dimension is 1 and as we try to read the first record, ',   &
1475                           &         'we accept this case, even if there is a possible mix-up between z and time dimension' )   
1476                     idmspc = idmspc - 1
1477                  ELSE
1478                     CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'To keep iom lisibility, when reading a '//clrankpv//'D array,'         ,   &
1479                        &                         'we do not accept data with '//cldmspc//' spatial dimensions',   &
1480                        &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
1481                  ENDIF
1482            ENDIF
1483            !
1484            ! definition of istart and icnt
1485            !
1486            icnt  (:) = 1
1487            istart(:) = 1
1488            istart(idmspc+1) = itime
1489   
1490            IF( PRESENT(kstart) .AND. .NOT. ll_depth_spec ) THEN
1491               istart(1:idmspc) = kstart(1:idmspc) 
1492               icnt  (1:idmspc) = kcount(1:idmspc)
1493            ELSE
1494               IF(idom == jpdom_unknown ) THEN
1495                  icnt(1:idmspc) = idimsz(1:idmspc)
1496               ELSE
1497                  IF( .NOT. PRESENT(pv_r1d) ) THEN   !   not a 1D array
1498                     IF(     idom == jpdom_data    ) THEN
1499                        jstartrow = 1
1500                        IF( luse_jattr ) THEN
1501                           CALL iom_getatt(kiomid, 'open_ocean_jstart', jstartrow ) ! -999 is returned if the attribute is not found
1502                           jstartrow = MAX(1,jstartrow)
1503                        ENDIF
1504                        istart(1:2) = (/ mig(1), mjg(1) + jstartrow - 1 /)  ! icnt(1:2) done below
1505                     ELSEIF( idom == jpdom_global  ) THEN ; istart(1:2) = (/ nimpp , njmpp  /)  ! icnt(1:2) done below
1506                     ENDIF
1507                     ! we do not read the overlap                     -> we start to read at nldi, nldj
1508! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1509!                  IF( idom /= jpdom_local_noovlap )   istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1510                     IF( llnoov .AND. idom /= jpdom_local_noovlap ) istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
1511                  ! we do not read the overlap and the extra-halos -> from nldi to nlei and from nldj to nlej
1512! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1513!                  icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1514                     IF( llnoov ) THEN   ;   icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
1515                     ELSE                ;   icnt(1:2) = (/ nlci           , nlcj            /)
1516                     ENDIF
1517                     IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1518                        IF( idom == jpdom_data ) THEN                        ;                               icnt(3) = inlev
1519                        ELSEIF( ll_depth_spec .AND. PRESENT(kstart) ) THEN   ;   istart(3) = kstart(3)   ;   icnt(3) = kcount(3)
1520                        ELSE                                                 ;                               icnt(3) = inlev
1521                        ENDIF
1522                     ENDIF
1523                  ENDIF
1524               ENDIF
1525            ENDIF
1526
1527            ! check that istart and icnt can be used with this file
1528            !-
1529            DO jl = 1, jpmax_dims
1530               itmp = istart(jl)+icnt(jl)-1
1531               IF( itmp > idimsz(jl) .AND. idimsz(jl) /= 0 ) THEN
1532                  WRITE( ctmp1, FMT="('(istart(', i1, ') + icnt(', i1, ') - 1) = ', i5)" ) jl, jl, itmp
1533                  WRITE( ctmp2, FMT="(' is larger than idimsz(', i1,') = ', i5)"         ) jl, idimsz(jl)
1534                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'start and count too big regarding to the size of the data, ', ctmp1, ctmp2 )     
1535               ENDIF
1536            END DO
1537
1538            ! check that icnt matches the input array
1539            !-     
1540            IF( idom == jpdom_unknown ) THEN
1541               IF( irankpv == 1 )        ishape(1:1) = SHAPE(pv_r1d)
1542               IF( irankpv == 2 )        ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d)
1543               IF( irankpv == 3 )        ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d)
1544               ctmp1 = 'd'
1545            ELSE
1546               IF( irankpv == 2 ) THEN
1547! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1548!               ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  ))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1549                  IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  )) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej)'
1550                  ELSE              ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(1   :nlci,1   :nlcj  )) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj)'
1551                  ENDIF
1552               ENDIF
1553               IF( irankpv == 3 ) THEN 
1554! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1555!               ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1556                  IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
1557                  ELSE              ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(1   :nlci,1   :nlcj,:)) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj,:)'
1558                  ENDIF
1559               ENDIF
1560            ENDIF
1561         
1562            DO jl = 1, irankpv
1563               WRITE( ctmp2, FMT="(', ', i1,'): ', i5,' /= icnt(', i1,'):', i5)" ) jl, ishape(jl), jl, icnt(jl)
1564               IF( ishape(jl) /= icnt(jl) )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'size(pv_r'//clrankpv//TRIM(ctmp1)//TRIM(ctmp2) )
1565            END DO
1566
1567         ENDIF
1568
1569         ! read the data
1570         !-     
1571         IF( idvar > 0 .AND. istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1572            !
1573         ! find the right index of the array to be read
1574! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
1575!         IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1576!         ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1577!         ENDIF
1578            IF( llnoov ) THEN
1579               IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
1580               ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1581               ENDIF
1582            ELSE
1583               IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = 1      ;   ix2 = nlci      ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
1584               ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
1585               ENDIF
1586            ENDIF
1587     
1588            CALL iom_nf90_get( kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
1589
1590            IF( istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
1591               IF(lwp) WRITE(numout,"(10x,' read ',a,' (rec: ',i6,') in ',a,' ok')") TRIM(cdvar), itime, TRIM(iom_file(kiomid)%name)
1592             
1593               !--- overlap areas and extra hallows (mpp)
1594               IF(     PRESENT(pv_r2d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1595                  CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r2d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing )
1596               ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
1597                  ! this if could be simplified with the new lbc_lnk that works with any size of the 3rd dimension
1598                  IF( icnt(3) == inlev ) THEN
1599                     CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing )
1600                  ELSE   ! put some arbitrary value (a call to lbc_lnk will be done later...)
1601                     DO jj = nlcj+1, jpj   ;   pv_r3d(1:nlci, jj, :) = pv_r3d(1:nlci, nlej, :)   ;   END DO
1602                     DO ji = nlci+1, jpi   ;   pv_r3d(ji    , : , :) = pv_r3d(nlei  , :   , :)   ;   END DO
1603                  ENDIF
1604               ENDIF
1605               !
1606            ELSE
1607               ! return if istop == nstop is false
1608               RETURN
1609            ENDIF
1610         ELSE
1611            ! return if statment idvar > 0 .AND. istop == nstop is false
1612            RETURN
1613         ENDIF
1614         !
1615      ELSE        ! read using XIOS. Only if KEY_IOMPUT is defined
1616#if defined key_iomput
1617!would be good to be able to check which context is active and swap only if current is not restart
1618         IF( PRESENT(pv_r4d) ) THEN
1619            pv_r4d(:, :, :, :) = 0.
1620            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (4D): ',trim(cdvar)
1621            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r4d)
1622            IF(idom /= jpdom_unknown ) then
1623                CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r4d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing)
1624            ENDIF
1625         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1626            pv_r3d(:, :, :) = 0.
1627            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (3D): ',trim(cdvar)
1628            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r3d)
1629            IF(idom /= jpdom_unknown ) then
1630                CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing)
1631            ENDIF
1632         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1633            pv_r2d(:, :) = 0.
1634            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (2D): ', trim(cdvar)
1635            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r2d)
1636            IF(idom /= jpdom_unknown ) THEN
1637                CALL lbc_lnk('iom', pv_r2d,'Z',-999., kfillmode = jpfillnothing)
1638            ENDIF
1639         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1640            pv_r1d(:) = 0.
1641            if(lwp) write(numout,*) 'XIOS RST READ (1D): ', trim(cdvar)
1642            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r1d)
1643         ENDIF
1644#else
1645         istop = istop + 1 
1646         clinfo = 'Can not use XIOS in iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar)
1647#endif
1648      ENDIF
1649!some final adjustments
1650      ! C1D case : always call lbc_lnk to replicate the central value over the whole 3X3 domain
1651      IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r2d) )   CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r2d,'Z',1. )
1652      IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r3d) )   CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z',1. )
1653
1654      !--- Apply scale_factor and offset
1655      zscf = iom_file(kiomid)%scf(idvar)      ! scale factor
1656      zofs = iom_file(kiomid)%ofs(idvar)      ! offset
1657      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
1658         IF( zscf /= 1. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf 
1659         IF( zofs /= 0. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs
1660      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
1661         IF( zscf /= 1.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf
1662         IF( zofs /= 0.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs
1663      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
1664         IF( zscf /= 1.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf
1665         IF( zofs /= 0.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs
1666      ELSEIF( PRESENT(pv_r4d) ) THEN
1667         IF( zscf /= 1.)   pv_r4d(:,:,:,:) = pv_r4d(:,:,:,:) * zscf
1668         IF( zofs /= 0.)   pv_r4d(:,:,:,:) = pv_r4d(:,:,:,:) + zofs
1669      ENDIF
1670      !
1671   END SUBROUTINE iom_get_123d
1672
1673
1674   FUNCTION iom_getszuld ( kiomid ) 
1675      !!-----------------------------------------------------------------------
1676      !!                  ***  FUNCTION  iom_getszuld  ***
1677      !!
1678      !! ** Purpose : get the size of the unlimited dimension in a file
1679      !!              (return -1 if not found)
1680      !!-----------------------------------------------------------------------
1681      INTEGER, INTENT(in   ) ::   kiomid   ! file Identifier
1682      !
1683      INTEGER                ::   iom_getszuld
1684      !!-----------------------------------------------------------------------
1685      iom_getszuld = -1
1686      IF( kiomid > 0 ) THEN
1687         IF( iom_file(kiomid)%iduld > 0 )   iom_getszuld = iom_file(kiomid)%lenuld
1688      ENDIF
1689   END FUNCTION iom_getszuld
1690   
1691
1692   !!----------------------------------------------------------------------
1693   !!                   INTERFACE iom_chkatt
1694   !!----------------------------------------------------------------------
1695   SUBROUTINE iom_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize, cdvar )
1696      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
1697      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdatt     ! Name of the attribute
1698      LOGICAL         , INTENT(  out)                 ::   llok      ! Error code
1699      INTEGER         , INTENT(  out), OPTIONAL       ::   ksize     ! Size of the attribute array
1700      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ), OPTIONAL       ::   cdvar     ! Name of the variable
1701      !
1702      IF( kiomid > 0 ) THEN
1703         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize=ksize, cdvar=cdvar )
1704      ENDIF
1705      !
1706   END SUBROUTINE iom_chkatt
1707
1708   !!----------------------------------------------------------------------
1709   !!                   INTERFACE iom_getatt
1710   !!----------------------------------------------------------------------
1711   SUBROUTINE iom_g0d_iatt( kiomid, cdatt, katt0d, cdvar )
1712      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1713      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1714      INTEGER               , INTENT(  out)           ::   katt0d    ! read field
1715      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1716      !
1717      IF( kiomid > 0 ) THEN
1718         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  katt0d =  katt0d, cdvar=cdvar )
1719      ENDIF
1720   END SUBROUTINE iom_g0d_iatt
1721
1722   SUBROUTINE iom_g1d_iatt( kiomid, cdatt, katt1d, cdvar )
1723      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1724      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1725      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(  out)           ::   katt1d    ! read field
1726      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1727      !
1728      IF( kiomid > 0 ) THEN
1729         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  katt1d =  katt1d, cdvar=cdvar )
1730      ENDIF
1731   END SUBROUTINE iom_g1d_iatt
1732
1733   SUBROUTINE iom_g0d_ratt( kiomid, cdatt, patt0d, cdvar )
1734      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1735      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1736      REAL(wp)              , INTENT(  out)           ::   patt0d    ! read field
1737      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1738      !
1739      IF( kiomid > 0 ) THEN
1740         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  patt0d =  patt0d, cdvar=cdvar )
1741      ENDIF
1742   END SUBROUTINE iom_g0d_ratt
1743
1744   SUBROUTINE iom_g1d_ratt( kiomid, cdatt, patt1d, cdvar )
1745      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1746      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1747      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(  out)           ::   patt1d    ! read field
1748      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1749      !
1750      IF( kiomid > 0 ) THEN
1751         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt,  patt1d =  patt1d, cdvar=cdvar )
1752      ENDIF
1753   END SUBROUTINE iom_g1d_ratt
1754   
1755   SUBROUTINE iom_g0d_catt( kiomid, cdatt, cdatt0d, cdvar )
1756      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1757      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1758      CHARACTER(len=*)      , INTENT(  out)           ::   cdatt0d   ! read field
1759      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1760      !
1761      IF( kiomid > 0 ) THEN
1762         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, cdatt0d = cdatt0d, cdvar=cdvar )
1763      ENDIF
1764   END SUBROUTINE iom_g0d_catt
1765
1766
1767   !!----------------------------------------------------------------------
1768   !!                   INTERFACE iom_putatt
1769   !!----------------------------------------------------------------------
1770   SUBROUTINE iom_p0d_iatt( kiomid, cdatt, katt0d, cdvar )
1771      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1772      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1773      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   katt0d    ! written field
1774      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1775      !
1776      IF( kiomid > 0 ) THEN
1777         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  katt0d =  katt0d, cdvar=cdvar )
1778      ENDIF
1779   END SUBROUTINE iom_p0d_iatt
1780
1781   SUBROUTINE iom_p1d_iatt( kiomid, cdatt, katt1d, cdvar )
1782      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1783      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1784      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(in   )           ::   katt1d    ! written field
1785      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1786      !
1787      IF( kiomid > 0 ) THEN
1788         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  katt1d =  katt1d, cdvar=cdvar )
1789      ENDIF
1790   END SUBROUTINE iom_p1d_iatt
1791
1792   SUBROUTINE iom_p0d_ratt( kiomid, cdatt, patt0d, cdvar )
1793      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1794      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1795      REAL(wp)              , INTENT(in   )           ::   patt0d    ! written field
1796      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1797      !
1798      IF( kiomid > 0 ) THEN
1799         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  patt0d =  patt0d, cdvar=cdvar )
1800      ENDIF
1801   END SUBROUTINE iom_p0d_ratt
1802
1803   SUBROUTINE iom_p1d_ratt( kiomid, cdatt, patt1d, cdvar )
1804      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1805      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1806      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in   )           ::   patt1d    ! written field
1807      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1808      !
1809      IF( kiomid > 0 ) THEN
1810         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt,  patt1d =  patt1d, cdvar=cdvar )
1811      ENDIF
1812   END SUBROUTINE iom_p1d_ratt
1813   
1814   SUBROUTINE iom_p0d_catt( kiomid, cdatt, cdatt0d, cdvar )
1815      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! Identifier of the file
1816      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt     ! Name of the attribute
1817      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt0d   ! written field
1818      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar     ! Name of the variable
1819      !
1820      IF( kiomid > 0 ) THEN
1821         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 )   CALL iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt, cdatt0d = cdatt0d, cdvar=cdvar )
1822      ENDIF
1823   END SUBROUTINE iom_p0d_catt
1824
1825
1826   !!----------------------------------------------------------------------
1827   !!                   INTERFACE iom_rstput
1828   !!----------------------------------------------------------------------
1829   SUBROUTINE iom_rp0d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1830      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1831      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1832      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1833      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1834      REAL(wp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field
1835      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1836      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1837      LOGICAL :: llx                ! local xios write flag
1838      INTEGER :: ivid   ! variable id
1839
1840      llx = .FALSE.
1841      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1842      IF( llx ) THEN
1843#ifdef key_iomput
1844      IF( kt == kwrite ) THEN
1845          IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar)
1846          write(snr, *) nitrst
1847          CALL xios_send_field(trim(cdvar)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)), pvar)
1848      ENDIF
1849#endif
1850      ELSE
1851         IF( kiomid > 0 ) THEN
1852            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1853               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1854               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
1855            ENDIF
1856         ENDIF
1857      ENDIF
1858   END SUBROUTINE iom_rp0d
1859
1860   SUBROUTINE iom_rp1d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1861      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1862      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1863      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1864      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1865      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(          :) ::   pvar     ! written field
1866      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1867      LOGICAL, OPTIONAL                                    ::   ldxios   ! xios write flag
1868      LOGICAL :: llx                ! local xios write flag
1869      INTEGER :: ivid   ! variable id
1870
1871      llx = .FALSE.
1872      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1873      IF( llx ) THEN
1874#ifdef key_iomput
1875      IF( kt == kwrite ) THEN
1876         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 1D) ',trim(cdvar)
1877         write(snr, *) nitrst
1878         CALL xios_send_field(trim(cdvar)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)), pvar)
1879      ENDIF
1880#endif
1881      ELSE
1882         IF( kiomid > 0 ) THEN
1883            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1884               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1885               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
1886            ENDIF
1887         ENDIF
1888      ENDIF
1889   END SUBROUTINE iom_rp1d
1890
1891   SUBROUTINE iom_rp2d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1892      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1893      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1894      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1895      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1896      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(:,    :    ) ::   pvar     ! written field
1897      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1898      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1899      LOGICAL :: llx
1900      INTEGER :: ivid   ! variable id
1901
1902      llx = .FALSE.
1903      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1904      IF( llx ) THEN
1905#ifdef key_iomput
1906      IF( kt == kwrite ) THEN
1907         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 2D) ',trim(cdvar)
1908         write(snr, *) nitrst
1909         CALL xios_send_field(trim(cdvar)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)), pvar)
1910      ENDIF
1911#endif
1912      ELSE
1913         IF( kiomid > 0 ) THEN
1914            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1915               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1916               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
1917            ENDIF
1918         ENDIF
1919      ENDIF
1920   END SUBROUTINE iom_rp2d
1921
1922   SUBROUTINE iom_rp3d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1923      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1924      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1925      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1926      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1927      REAL(wp)        , INTENT(in),       DIMENSION(:,:,:) ::   pvar     ! written field
1928      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1929      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1930      LOGICAL :: llx                 ! local xios write flag
1931      INTEGER :: ivid   ! variable id
1932
1933      llx = .FALSE.
1934      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1935      IF( llx ) THEN
1936#ifdef key_iomput
1937      IF( kt == kwrite ) THEN
1938         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 3D) ',trim(cdvar)
1939         write(snr, *) nitrst
1940         CALL xios_send_field(trim(cdvar)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)), pvar)
1941      ENDIF
1942#endif
1943      ELSE
1944         IF( kiomid > 0 ) THEN
1945            IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
1946               ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
1947               CALL iom_nf90_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
1948            ENDIF
1949         ENDIF
1950      ENDIF
1951   END SUBROUTINE iom_rp3d
1952
1953   SUBROUTINE iom_rp4d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios )
1954      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
1955      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
1956      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
1957      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
1958      REAL(wp)        , INTENT(in),     DIMENSION(:,:,:,:) ::   pvar     ! written field
1959      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
1960      LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag
1961      LOGICAL :: llx                 ! local xios write flag
1962      INTEGER :: ivid   ! variable id
1963
1964      llx = .FALSE.
1965      IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios
1966      IF( llx ) THEN
1967#ifdef key_iomput
1968      IF( kt == kwrite ) THEN
1969         IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 4D) ',trim(cdvar)
1970         write(snr, *) nitrst
1971         CALL xios_send_field(trim(cdvar)//"_"//TRIM(ADJUSTL(snr)), pvar)
1972      ENDIF
1973#endif
1974      ELSE
1975        CALL ctl_stop('Error in the name  iom_rp4d for variable '//TRIM(cdvar),   &
1976           & 'Restart with iom_nf90_rstput can not handle 4D cases' )
1977      ENDIF
1978   END SUBROUTINE iom_rp4d
1979
1980   SUBROUTINE iom_delay_rst( cdaction, cdcpnt, kncid )
1981      !!---------------------------------------------------------------------
1982      !!   Routine iom_delay_rst: used read/write restart related to mpp_delay
1983      !!
1984      !!---------------------------------------------------------------------
1985      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdaction        !
1986      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdcpnt
1987      INTEGER         , INTENT(in   ) ::   kncid
1988      !
1989      INTEGER  :: ji
1990      INTEGER  :: indim
1991      LOGICAL  :: llattexist
1992      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:) ::   zreal1d
1993      !!---------------------------------------------------------------------
1994      !
1995      !return for now. When XIOS is used to write restart it also should be used to write this attribute
1996      IF(lwxios) THEN
1997         CALL ctl_warn( 'From iom_delay_rst: ', 'Can not '//cdaction//' mpp_delay information with XIOS')
1998         RETURN
1999      ENDIF
2000
2001      !                                      ===================================
2002      IF( TRIM(cdaction) == 'READ' ) THEN   ! read restart related to mpp_delay !
2003         !                                   ===================================
2004         DO ji = 1, nbdelay
2005            IF ( c_delaycpnt(ji) == cdcpnt ) THEN
2006               CALL iom_chkatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), llattexist, indim )
2007               IF( llattexist )  THEN
2008                  ALLOCATE( todelay(ji)%z1d(indim) )
2009                  CALL iom_getatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), todelay(ji)%z1d(:) )
2010                  ndelayid(ji) = 0   ! set to 0 to specify that the value was read in the restart
2011               ENDIF
2012           ENDIF
2013         END DO
2014         !                                   ====================================
2015      ELSE                                  ! write restart related to mpp_delay !
2016         !                                   ====================================
2017         DO ji = 1, nbdelay   ! save only ocean delayed global communication variables
2018            IF ( c_delaycpnt(ji) == cdcpnt ) THEN
2019               IF( ASSOCIATED(todelay(ji)%z1d) ) THEN
2020                  CALL mpp_delay_rcv(ji)   ! make sure %z1d is received
2021                  CALL iom_putatt( kncid, 'DELAY_'//c_delaylist(ji), todelay(ji)%z1d(:) )
2022               ENDIF
2023            ENDIF
2024         END DO
2025         !
2026      ENDIF
2027     
2028   END SUBROUTINE iom_delay_rst
2029 
2030   
2031
2032   !!----------------------------------------------------------------------
2033   !!                   INTERFACE iom_put
2034   !!----------------------------------------------------------------------
2035   SUBROUTINE iom_p0d( cdname, pfield0d )
2036      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2037      REAL(wp)        , INTENT(in) ::   pfield0d
2038!!      REAL(wp)        , DIMENSION(jpi,jpj) ::   zz     ! masson
2039#if defined key_iomput
2040!!clem      zz(:,:)=pfield0d
2041!!clem      CALL xios_send_field(cdname, zz)
2042      CALL xios_send_field(cdname, (/pfield0d/)) 
2043#else
2044      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield0d   ! useless test to avoid compilation warnings
2045#endif
2046   END SUBROUTINE iom_p0d
2047
2048   SUBROUTINE iom_p1d( cdname, pfield1d )
2049      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdname
2050      REAL(wp),     DIMENSION(:), INTENT(in) ::   pfield1d
2051#if defined key_iomput
2052      CALL xios_send_field( cdname, RESHAPE( (/pfield1d/), (/1,1,SIZE(pfield1d)/) ) )
2053#else
2054      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield1d   ! useless test to avoid compilation warnings
2055#endif
2056   END SUBROUTINE iom_p1d
2057
2058   SUBROUTINE iom_p2d( cdname, pfield2d )
2059      CHARACTER(LEN=*)            , INTENT(in) ::   cdname
2060      REAL(wp),     DIMENSION(:,:), INTENT(in) ::   pfield2d
2061#if defined key_iomput
2062      CALL xios_send_field(cdname, pfield2d)
2063#else
2064      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield2d   ! useless test to avoid compilation warnings
2065#endif
2066   END SUBROUTINE iom_p2d
2067
2068   SUBROUTINE iom_p3d( cdname, pfield3d )
2069      CHARACTER(LEN=*)                , INTENT(in) ::   cdname
2070      REAL(wp),       DIMENSION(:,:,:), INTENT(in) ::   pfield3d
2071#if defined key_iomput
2072      CALL xios_send_field( cdname, pfield3d )
2073#else
2074      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield3d   ! useless test to avoid compilation warnings
2075#endif
2076   END SUBROUTINE iom_p3d
2077
2078#if defined key_iomput
2079   !!----------------------------------------------------------------------
2080   !!   'key_iomput'                                         XIOS interface
2081   !!----------------------------------------------------------------------
2082
2083   SUBROUTINE iom_set_domain_attr( cdid, ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj,                                               &
2084      &                                    data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj, lonvalue, latvalue, mask,     &
2085      &                                    nvertex, bounds_lon, bounds_lat, area )
2086      !!----------------------------------------------------------------------
2087      !!----------------------------------------------------------------------
2088      CHARACTER(LEN=*)                  , INTENT(in) ::   cdid
2089      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj
2090      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj
2091      INTEGER                 , OPTIONAL, INTENT(in) ::   nvertex
2092      REAL(wp), DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   lonvalue, latvalue
2093      REAL(wp), DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds_lon, bounds_lat, area
2094      LOGICAL , DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
2095      !!----------------------------------------------------------------------
2096      !
2097      IF( xios_is_valid_domain     (cdid) ) THEN
2098         CALL xios_set_domain_attr     ( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
2099            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
2100            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,      &
2101            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear')
2102      ENDIF
2103      IF( xios_is_valid_domaingroup(cdid) ) THEN
2104         CALL xios_set_domaingroup_attr( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
2105            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
2106            &    lonvalue_1D=lonvalue, latvalue_1D=latvalue, mask_1D=mask, nvertex=nvertex, bounds_lon_1D=bounds_lon,      &
2107            &    bounds_lat_1D=bounds_lat, area=area, type='curvilinear' )
2108      ENDIF
2109      !
2110      CALL xios_solve_inheritance()
2111      !
2112   END SUBROUTINE iom_set_domain_attr
2113
2114
2115   SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr( cdid, ibegin, jbegin, ni, nj )
2116      !!----------------------------------------------------------------------
2117      !!----------------------------------------------------------------------
2118      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdid
2119      INTEGER         , INTENT(in) ::   ibegin, jbegin, ni, nj
2120      !
2121      TYPE(xios_gridgroup) :: gridgroup_hdl
2122      TYPE(xios_grid)      :: grid_hdl
2123      TYPE(xios_domain)    :: domain_hdl 
2124      TYPE(xios_axis)      :: axis_hdl 
2125      CHARACTER(LEN=64)    :: cldomrefid   ! domain_ref name
2126      CHARACTER(len=1)     :: cl1          ! last character of this name
2127      !!----------------------------------------------------------------------
2128      !
2129      IF( xios_is_valid_zoom_domain(cdid) ) THEN
2130         ! define the zoom_domain attributs
2131         CALL xios_set_zoom_domain_attr( cdid, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj )
2132         ! define a new 2D grid with this new domain
2133         CALL xios_get_handle("grid_definition", gridgroup_hdl )
2134         CALL xios_add_child(gridgroup_hdl, grid_hdl, TRIM(cdid)//'_2D' )   ! add a new 2D grid to grid_definition
2135         CALL xios_add_child(grid_hdl, domain_hdl, TRIM(cdid) )             ! add its domain
2136         ! define a new 3D grid with this new domain
2137         CALL xios_add_child(gridgroup_hdl, grid_hdl, TRIM(cdid)//'_3D' )   ! add a new 3D grid to grid_definition
2138         CALL xios_add_child(grid_hdl, domain_hdl, TRIM(cdid) )             ! add its domain
2139         ! vertical axis
2140         cl1 = cdid(LEN_TRIM(cdid):)                                        ! last letter of cdid
2141         cl1 = CHAR(ICHAR(cl1)+32)                                          ! from upper to lower case
2142         CALL xios_add_child(grid_hdl, axis_hdl, 'depth'//cl1)              ! add its axis
2143      ENDIF
2144      !     
2145   END SUBROUTINE iom_set_zoom_domain_attr
2146
2147
2148   SUBROUTINE iom_set_axis_attr( cdid, paxis, bounds )
2149      !!----------------------------------------------------------------------
2150      !!----------------------------------------------------------------------
2151      CHARACTER(LEN=*)      , INTENT(in) ::   cdid
2152      REAL(wp), DIMENSION(:)  , OPTIONAL, INTENT(in) ::   paxis
2153      REAL(wp), DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   bounds
2154      !!----------------------------------------------------------------------
2155      IF( PRESENT(paxis) ) THEN
2156         IF( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
2157         IF( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, n_glo=SIZE(paxis), value=paxis )
2158      ENDIF
2159      IF( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, bounds=bounds )
2160      IF( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, bounds=bounds )
2161      CALL xios_solve_inheritance()
2162   END SUBROUTINE iom_set_axis_attr
2163
2164
2165   SUBROUTINE iom_set_field_attr( cdid, freq_op, freq_offset )
2166      !!----------------------------------------------------------------------
2167      !!----------------------------------------------------------------------
2168      CHARACTER(LEN=*)             , INTENT(in) ::   cdid
2169      TYPE(xios_duration), OPTIONAL, INTENT(in) ::   freq_op
2170      TYPE(xios_duration), OPTIONAL, INTENT(in) ::   freq_offset
2171      !!----------------------------------------------------------------------
2172      IF( xios_is_valid_field     (cdid) )   CALL xios_set_field_attr     ( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
2173      IF( xios_is_valid_fieldgroup(cdid) )   CALL xios_set_fieldgroup_attr( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
2174      CALL xios_solve_inheritance()
2175   END SUBROUTINE iom_set_field_attr
2176
2177
2178   SUBROUTINE iom_set_file_attr( cdid, name, name_suffix )
2179      !!----------------------------------------------------------------------
2180      !!----------------------------------------------------------------------
2181      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
2182      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   name, name_suffix
2183      !!----------------------------------------------------------------------
2184      IF( xios_is_valid_file     (cdid) )   CALL xios_set_file_attr     ( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
2185      IF( xios_is_valid_filegroup(cdid) )   CALL xios_set_filegroup_attr( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
2186      CALL xios_solve_inheritance()
2187   END SUBROUTINE iom_set_file_attr
2188
2189
2190   SUBROUTINE iom_get_file_attr( cdid, name, name_suffix, output_freq )
2191      !!----------------------------------------------------------------------
2192      !!----------------------------------------------------------------------
2193      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in ) ::   cdid
2194      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(out) ::   name, name_suffix
2195      TYPE(xios_duration), OPTIONAL , INTENT(out) :: output_freq
2196      LOGICAL                                 ::   llexist1,llexist2,llexist3
2197      !---------------------------------------------------------------------
2198      IF( PRESENT( name        ) )   name = ''          ! default values
2199      IF( PRESENT( name_suffix ) )   name_suffix = ''
2200      IF( PRESENT( output_freq ) )   output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
2201      IF( xios_is_valid_file     (cdid) ) THEN
2202         CALL xios_solve_inheritance()
2203         CALL xios_is_defined_file_attr     ( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
2204         IF(llexist1)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name = name )
2205         IF(llexist2)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name_suffix = name_suffix )
2206         IF(llexist3)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, output_freq = output_freq )
2207      ENDIF
2208      IF( xios_is_valid_filegroup(cdid) ) THEN
2209         CALL xios_solve_inheritance()
2210         CALL xios_is_defined_filegroup_attr( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
2211         IF(llexist1)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name = name )
2212         IF(llexist2)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name_suffix = name_suffix )
2213         IF(llexist3)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, output_freq = output_freq )
2214      ENDIF
2215   END SUBROUTINE iom_get_file_attr
2216
2217
2218   SUBROUTINE iom_set_grid_attr( cdid, mask )
2219      !!----------------------------------------------------------------------
2220      !!----------------------------------------------------------------------
2221      CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
2222      LOGICAL, DIMENSION(:,:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
2223      !!----------------------------------------------------------------------
2224      IF( xios_is_valid_grid     (cdid) )   CALL xios_set_grid_attr     ( cdid, mask_3D=mask )
2225      IF( xios_is_valid_gridgroup(cdid) )   CALL xios_set_gridgroup_attr( cdid, mask_3D=mask )
2226      CALL xios_solve_inheritance()
2227   END SUBROUTINE iom_set_grid_attr
2228
2229   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
2230      !!----------------------------------------------------------------------
2231      !!----------------------------------------------------------------------
2232      INTEGER         , INTENT(in) ::   kt 
2233      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2234      !!----------------------------------------------------------------------
2235      CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
2236      CALL xios_update_calendar(kt)
2237      IF( cdname /= TRIM(cxios_context) )   CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
2238   END SUBROUTINE iom_setkt
2239
2240   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
2241      !!----------------------------------------------------------------------
2242      !!----------------------------------------------------------------------
2243      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdname
2244      CHARACTER(LEN=120)           :: clname
2245      !!----------------------------------------------------------------------
2246      clname = cdname
2247      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) .NE. '0' ) clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//clname 
2248      IF( xios_is_valid_context(clname) ) THEN
2249         CALL iom_swap( cdname )   ! swap to cdname context
2250         CALL xios_context_finalize() ! finalize the context
2251         IF( cdname /= TRIM(cxios_context) ) CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) )   ! return back to nemo context
2252      ENDIF
2253      !
2254   END SUBROUTINE iom_context_finalize
2255
2256
2257   SUBROUTINE set_grid( cdgrd, plon, plat, ldxios, ldrxios )
2258      !!----------------------------------------------------------------------
2259      !!                     ***  ROUTINE set_grid  ***
2260      !!
2261      !! ** Purpose :   define horizontal grids
2262      !!----------------------------------------------------------------------
2263      CHARACTER(LEN=1)            , INTENT(in) ::   cdgrd
2264      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plon
2265      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
2266      !
2267      INTEGER  :: ni, nj
2268      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zmask
2269      LOGICAL, INTENT(IN) :: ldxios, ldrxios
2270      !!----------------------------------------------------------------------
2271      !
2272      ni = nlei-nldi+1
2273      nj = nlej-nldj+1
2274      !
2275      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
2276      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
2277!don't define lon and lat for restart reading context.
2278      IF ( .NOT.ldrxios ) &
2279         CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, lonvalue = RESHAPE(plon(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /)),   &
2280         &                                     latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
2281      !
2282      IF ( ln_mskland .AND. (.NOT.ldxios) ) THEN
2283         ! mask land points, keep values on coast line -> specific mask for U, V and W points
2284         SELECT CASE ( cdgrd )
2285         CASE('T')   ;   zmask(:,:,:)       = tmask(:,:,:)
2286         CASE('U')   ;   zmask(2:jpim1,:,:) = tmask(2:jpim1,:,:) + tmask(3:jpi,:,:)   ;   CALL lbc_lnk( 'iom', zmask, 'U', 1. )
2287         CASE('V')   ;   zmask(:,2:jpjm1,:) = tmask(:,2:jpjm1,:) + tmask(:,3:jpj,:)   ;   CALL lbc_lnk( 'iom', zmask, 'V', 1. )
2288         CASE('W')   ;   zmask(:,:,2:jpk  ) = tmask(:,:,1:jpkm1) + tmask(:,:,2:jpk)   ;   zmask(:,:,1) = tmask(:,:,1)
2289         END SELECT
2290         !
2291         CALL iom_set_domain_attr( "grid_"//cdgrd       , mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ni*nj    /)) /= 0. )
2292         CALL iom_set_grid_attr  ( "grid_"//cdgrd//"_3D", mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,:),(/ni,nj,jpk/)) /= 0. )
2293      ENDIF
2294      !
2295   END SUBROUTINE set_grid
2296
2297
2298   SUBROUTINE set_grid_bounds( cdgrd, plon_cnr, plat_cnr, plon_pnt, plat_pnt )
2299      !!----------------------------------------------------------------------
2300      !!                   ***  ROUTINE set_grid_bounds  ***
2301      !!
2302      !! ** Purpose :   define horizontal grid corners
2303      !!
2304      !!----------------------------------------------------------------------
2305      CHARACTER(LEN=1)                      , INTENT(in) :: cdgrd
2306      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)          , INTENT(in) :: plon_cnr, plat_cnr  ! Lat/lon coord. of a contiguous vertex of cell (i,j)
2307      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), OPTIONAL, INTENT(in) :: plon_pnt, plat_pnt  ! Lat/lon coord. of the point of cell (i,j)
2308      !
2309      INTEGER :: ji, jj, jn, ni, nj
2310      INTEGER :: icnr, jcnr                                    ! Offset such that the vertex coordinate (i+icnr,j+jcnr)
2311      !                                                        ! represents the bottom-left corner of cell (i,j)
2312      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:,:,:) :: z_bnds      ! Lat/lon coordinates of the vertices of cell (i,j)
2313      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)     :: z_fld       ! Working array to determine where to rotate cells
2314      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:)     :: z_rot       ! Lat/lon working array for rotation of cells
2315      !!----------------------------------------------------------------------
2316      !
2317      ALLOCATE( z_bnds(4,jpi,jpj,2), z_fld(jpi,jpj), z_rot(4,2)  )
2318      !
2319      ! Offset of coordinate representing bottom-left corner
2320      SELECT CASE ( TRIM(cdgrd) )
2321      CASE ('T', 'W')   ;   icnr = -1   ;   jcnr = -1
2322      CASE ('U')        ;   icnr =  0   ;   jcnr = -1
2323      CASE ('V')        ;   icnr = -1   ;   jcnr =  0
2324      END SELECT
2325      !
2326      ni = nlei-nldi+1   ! Dimensions of subdomain interior
2327      nj = nlej-nldj+1
2328      !
2329      z_fld(:,:) = 1._wp
2330      CALL lbc_lnk( 'iom', z_fld, cdgrd, -1. )    ! Working array for location of northfold
2331      !
2332      ! Cell vertices that can be defined
2333      DO jj = 2, jpjm1
2334         DO ji = 2, jpim1
2335            z_bnds(1,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
2336            z_bnds(2,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
2337            z_bnds(3,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
2338            z_bnds(4,ji,jj,1) = plat_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
2339            z_bnds(1,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr  ) ! Bottom-left
2340            z_bnds(2,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr  ) ! Bottom-right
2341            z_bnds(3,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr+1,jj+jcnr+1) ! Top-right
2342            z_bnds(4,ji,jj,2) = plon_cnr(ji+icnr,  jj+jcnr+1) ! Top-left
2343         END DO
2344      END DO
2345      !
2346      ! Cell vertices on boundries
2347      DO jn = 1, 4
2348         CALL lbc_lnk( 'iom', z_bnds(jn,:,:,1), cdgrd, 1., pfillval=999._wp )
2349         CALL lbc_lnk( 'iom', z_bnds(jn,:,:,2), cdgrd, 1., pfillval=999._wp )
2350      END DO
2351      !
2352      ! Zero-size cells at closed boundaries if cell points provided,
2353      ! otherwise they are closed cells with unrealistic bounds
2354      IF( PRESENT(plon_pnt) .AND. PRESENT(plat_pnt) ) THEN
2355         IF( (nbondi == -1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
2356            DO jn = 1, 4        ! (West or jpni = 1), closed E-W
2357               z_bnds(jn,1,:,1) = plat_pnt(1,:)  ;  z_bnds(jn,1,:,2) = plon_pnt(1,:)
2358            END DO
2359         ENDIF
2360         IF( (nbondi == 1 .OR. nbondi == 2) .AND. .NOT. (jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6) ) THEN
2361            DO jn = 1, 4        ! (East or jpni = 1), closed E-W
2362               z_bnds(jn,nlci,:,1) = plat_pnt(nlci,:)  ;  z_bnds(jn,nlci,:,2) = plon_pnt(nlci,:)
2363            END DO
2364         ENDIF
2365         IF( nbondj == -1 .OR. (nbondj == 2 .AND. jperio /= 2) ) THEN
2366            DO jn = 1, 4        ! South or (jpnj = 1, not symmetric)
2367               z_bnds(jn,:,1,1) = plat_pnt(:,1)  ;  z_bnds(jn,:,1,2) = plon_pnt(:,1)
2368            END DO
2369         ENDIF
2370         IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio  < 3 ) THEN
2371            DO jn = 1, 4        ! (North or jpnj = 1), no north fold
2372               z_bnds(jn,:,nlcj,1) = plat_pnt(:,nlcj)  ;  z_bnds(jn,:,nlcj,2) = plon_pnt(:,nlcj)
2373            END DO
2374         ENDIF
2375      ENDIF
2376      !
2377      IF( (nbondj == 1 .OR. nbondj == 2) .AND. jperio >= 3 ) THEN    ! Rotate cells at the north fold
2378         DO jj = 1, jpj
2379            DO ji = 1, jpi
2380               IF( z_fld(ji,jj) == -1. ) THEN
2381                  z_rot(1,:) = z_bnds(3,ji,jj,:) ; z_rot(2,:) = z_bnds(4,ji,jj,:)
2382                  z_rot(3,:) = z_bnds(1,ji,jj,:) ; z_rot(4,:) = z_bnds(2,ji,jj,:)
2383                  z_bnds(:,ji,jj,:) = z_rot(:,:)
2384               ENDIF
2385            END DO
2386         END DO
2387      ELSE IF( nbondj == 2 .AND. jperio == 2 ) THEN                  ! Invert cells at the symmetric equator
2388         DO ji = 1, jpi
2389            z_rot(1:2,:) = z_bnds(3:4,ji,1,:)
2390            z_rot(3:4,:) = z_bnds(1:2,ji,1,:)
2391            z_bnds(:,ji,1,:) = z_rot(:,:)
2392         END DO
2393      ENDIF
2394      !
2395      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, bounds_lat = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ 4,ni*nj /)),           &
2396          &                                    bounds_lon = RESHAPE(z_bnds(:,nldi:nlei,nldj:nlej,2),(/ 4,ni*nj /)), nvertex=4 )
2397      !
2398      DEALLOCATE( z_bnds, z_fld, z_rot ) 
2399      !
2400   END SUBROUTINE set_grid_bounds
2401
2402
2403   SUBROUTINE set_grid_znl( plat )
2404      !!----------------------------------------------------------------------
2405      !!                     ***  ROUTINE set_grid_znl  ***
2406      !!
2407      !! ** Purpose :   define grids for zonal mean
2408      !!
2409      !!----------------------------------------------------------------------
2410      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
2411      !
2412      INTEGER  :: ni, nj, ix, iy
2413      REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE  ::   zlon
2414      !!----------------------------------------------------------------------
2415      !
2416      ni=nlei-nldi+1       ! define zonal mean domain (jpj*jpk)
2417      nj=nlej-nldj+1
2418      ALLOCATE( zlon(ni*nj) )       ;       zlon(:) = 0._wp
2419      !
2420      CALL dom_ngb( -168.53, 65.03, ix, iy, 'T' ) !  i-line that passes through Bering Strait: Reference latitude (used in plots)
2421!      CALL dom_ngb( 180., 90., ix, iy, 'T' ) !  i-line that passes near the North Pole : Reference latitude (used in plots)
2422      CALL iom_set_domain_attr("gznl", ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-2, jbegin=njmpp+nldj-2, ni=ni, nj=nj)
2423      CALL iom_set_domain_attr("gznl", data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
2424      CALL iom_set_domain_attr("gznl", lonvalue = zlon,   &
2425         &                             latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
2426      CALL iom_set_zoom_domain_attr("znl_T", ibegin=ix-1, jbegin=0, ni=1, nj=jpjglo)
2427      CALL iom_set_zoom_domain_attr("znl_W", ibegin=ix-1, jbegin=0, ni=1, nj=jpjglo)
2428      !
2429      CALL iom_update_file_name('ptr')
2430      !
2431   END SUBROUTINE set_grid_znl
2432
2433
2434   SUBROUTINE set_scalar
2435      !!----------------------------------------------------------------------
2436      !!                     ***  ROUTINE set_scalar  ***
2437      !!
2438      !! ** Purpose :   define fake grids for scalar point
2439      !!
2440      !!----------------------------------------------------------------------
2441      REAL(wp), DIMENSION(1)   ::   zz = 1.
2442      !!----------------------------------------------------------------------
2443      !
2444      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', ni_glo=jpnij, nj_glo=1, ibegin=narea-1, jbegin=0, ni=1, nj=1)
2445      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', data_dim=2, data_ibegin = 1, data_ni = 1, data_jbegin = 1, data_nj = 1)
2446      !
2447      zz = REAL( narea, wp )
2448      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', lonvalue=zz, latvalue=zz)
2449      !
2450   END SUBROUTINE set_scalar
2451
2452
2453   SUBROUTINE set_xmlatt
2454      !!----------------------------------------------------------------------
2455      !!                     ***  ROUTINE set_xmlatt  ***
2456      !!
2457      !! ** Purpose :   automatic definitions of some of the xml attributs...
2458      !!
2459      !!----------------------------------------------------------------------
2460      CHARACTER(len=1),DIMENSION( 3) ::   clgrd                    ! suffix name
2461      CHARACTER(len=256)             ::   clsuff                   ! suffix name
2462      CHARACTER(len=1)               ::   cl1                      ! 1 character
2463      CHARACTER(len=2)               ::   cl2                      ! 2 characters
2464      CHARACTER(len=3)               ::   cl3                      ! 3 characters
2465      INTEGER                        ::   ji, jg                   ! loop counters
2466      INTEGER                        ::   ix, iy                   ! i-,j- index
2467      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlontao                  ! longitudes of tao    moorings
2468      REAL(wp)        ,DIMENSION( 7) ::   zlattao                  ! latitudes  of tao    moorings
2469      REAL(wp)        ,DIMENSION( 4) ::   zlonrama                 ! longitudes of rama   moorings
2470      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlatrama                 ! latitudes  of rama   moorings
2471      REAL(wp)        ,DIMENSION( 3) ::   zlonpira                 ! longitudes of pirata moorings
2472      REAL(wp)        ,DIMENSION( 9) ::   zlatpira                 ! latitudes  of pirata moorings
2473      TYPE(xios_duration)            ::   f_op, f_of
2474      !!----------------------------------------------------------------------
2475      !
2476      ! frequency of the call of iom_put (attribut: freq_op)
2477      f_op%timestep = 1        ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('field_definition', freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2478      f_op%timestep = 2        ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('trendT_even'     , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2479      f_op%timestep = 2        ;  f_of%timestep = -1  ; CALL iom_set_field_attr('trendT_odd'      , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2480      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC'             , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2481      f_op%timestep = nn_fsbc  ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('SBC_scalar'      , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2482      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('ptrc_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2483      f_op%timestep = nn_dttrc ;  f_of%timestep =  0  ; CALL iom_set_field_attr('diad_T'          , freq_op=f_op, freq_offset=f_of)
2484
2485      ! output file names (attribut: name)
2486      DO ji = 1, 9
2487         WRITE(cl1,'(i1)') ji 
2488         CALL iom_update_file_name('file'//cl1)
2489      END DO
2490      DO ji = 1, 99
2491         WRITE(cl2,'(i2.2)') ji 
2492         CALL iom_update_file_name('file'//cl2)
2493      END DO
2494      DO ji = 1, 999
2495         WRITE(cl3,'(i3.3)') ji 
2496         CALL iom_update_file_name('file'//cl3)
2497      END DO
2498
2499      ! Zooms...
2500      clgrd = (/ 'T', 'U', 'W' /) 
2501      DO jg = 1, SIZE(clgrd)                                                                   ! grid type
2502         cl1 = clgrd(jg)
2503         ! Equatorial section (attributs: jbegin, ni, name_suffix)
2504         CALL dom_ngb( 0., 0., ix, iy, cl1 )
2505         CALL iom_set_zoom_domain_attr('Eq'//cl1, ibegin=0, jbegin=iy-1, ni=jpiglo, nj=1 )
2506         CALL iom_get_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = clsuff             )
2507         CALL iom_set_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_Eq')
2508         CALL iom_update_file_name('Eq'//cl1)
2509      END DO
2510      ! TAO moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2511      zlontao = (/ 137.0, 147.0, 156.0, 165.0, -180.0, -170.0, -155.0, -140.0, -125.0, -110.0, -95.0 /)
2512      zlattao = (/  -8.0,  -5.0,  -2.0,   0.0,    2.0,    5.0,    8.0 /)
2513      CALL set_mooring( zlontao, zlattao )
2514      ! RAMA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2515      zlonrama = (/  55.0,  67.0, 80.5, 90.0 /)
2516      zlatrama = (/ -16.0, -12.0, -8.0, -4.0, -1.5, 0.0, 1.5, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0 /)
2517      CALL set_mooring( zlonrama, zlatrama )
2518      ! PIRATA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
2519      zlonpira = (/ -38.0, -23.0, -10.0 /)
2520      zlatpira = (/ -19.0, -14.0,  -8.0, 0.0, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0, 20.0 /)
2521      CALL set_mooring( zlonpira, zlatpira )
2522      !
2523   END SUBROUTINE set_xmlatt
2524
2525
2526   SUBROUTINE set_mooring( plon, plat )
2527      !!----------------------------------------------------------------------
2528      !!                     ***  ROUTINE set_mooring  ***
2529      !!
2530      !! ** Purpose :   automatic definitions of moorings xml attributs...
2531      !!
2532      !!----------------------------------------------------------------------
2533      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in) ::   plon, plat   ! longitudes/latitudes oft the mooring
2534      !
2535!!$      CHARACTER(len=1),DIMENSION(4) ::   clgrd = (/ 'T', 'U', 'V', 'W' /)   ! suffix name
2536      CHARACTER(len=1),DIMENSION(1) ::   clgrd = (/ 'T' /)        ! suffix name
2537      CHARACTER(len=256)            ::   clname                   ! file name
2538      CHARACTER(len=256)            ::   clsuff                   ! suffix name
2539      CHARACTER(len=1)              ::   cl1                      ! 1 character
2540      CHARACTER(len=6)              ::   clon,clat                ! name of longitude, latitude
2541      INTEGER                       ::   ji, jj, jg               ! loop counters
2542      INTEGER                       ::   ix, iy                   ! i-,j- index
2543      REAL(wp)                      ::   zlon, zlat
2544      !!----------------------------------------------------------------------
2545      DO jg = 1, SIZE(clgrd)
2546         cl1 = clgrd(jg)
2547         DO ji = 1, SIZE(plon)
2548            DO jj = 1, SIZE(plat)
2549               zlon = plon(ji)
2550               zlat = plat(jj)
2551               ! modifications for RAMA moorings
2552               IF( zlon ==  67. .AND. zlat ==  15. )   zlon =  65.
2553               IF( zlon ==  90. .AND. zlat <=  -4. )   zlon =  95.
2554               IF( zlon ==  95. .AND. zlat ==  -4. )   zlat =  -5.
2555               ! modifications for PIRATA moorings
2556               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -19. )   zlon = -34.
2557               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -14. )   zlon = -32.
2558               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==  -8. )   zlon = -30.
2559               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==   0. )   zlon = -35.
2560               IF( zlon == -23. .AND. zlat ==  20. )   zlat =  21.
2561               IF( zlon == -10. .AND. zlat == -14. )   zlat = -10.
2562               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==  -8. )   zlat =  -6.
2563               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==   4. ) THEN   ;   zlon = 0.   ;   zlat = 0.   ;   ENDIF
2564               CALL dom_ngb( zlon, zlat, ix, iy, cl1 )
2565               IF( zlon >= 0. ) THEN 
2566                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT( zlon), 'e'
2567                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')       zlon , 'e'
2568                  ENDIF
2569               ELSE             
2570                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT(-zlon), 'w'
2571                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')      -zlon , 'w'
2572                  ENDIF
2573               ENDIF
2574               IF( zlat >= 0. ) THEN 
2575                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT( zlat), 'n'
2576                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')       zlat , 'n'
2577                  ENDIF
2578               ELSE             
2579                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT(-zlat), 's'
2580                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')      -zlat , 's'
2581                  ENDIF
2582               ENDIF
2583               clname = TRIM(ADJUSTL(clat))//TRIM(ADJUSTL(clon))
2584               CALL iom_set_zoom_domain_attr(TRIM(clname)//cl1, ibegin= ix-1, jbegin= iy-1, ni=1, nj=1)
2585
2586               CALL iom_get_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = clsuff                         )
2587               CALL iom_set_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_'//TRIM(clname))
2588               CALL iom_update_file_name(TRIM(clname)//cl1)
2589            END DO
2590         END DO
2591      END DO
2592     
2593   END SUBROUTINE set_mooring
2594
2595   
2596   SUBROUTINE iom_update_file_name( cdid )
2597      !!----------------------------------------------------------------------
2598      !!                     ***  ROUTINE iom_update_file_name  ***
2599      !!
2600      !! ** Purpose :   
2601      !!
2602      !!----------------------------------------------------------------------
2603      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
2604      !
2605      CHARACTER(LEN=256) ::   clname
2606      CHARACTER(LEN=20)  ::   clfreq
2607      CHARACTER(LEN=20)  ::   cldate
2608      CHARACTER(LEN=256) ::   cltmpn                 !FUS needed for correct path with AGRIF
2609      INTEGER            ::   iln                    !FUS needed for correct path with AGRIF
2610      INTEGER            ::   idx
2611      INTEGER            ::   jn
2612      INTEGER            ::   itrlen
2613      INTEGER            ::   iyear, imonth, iday, isec
2614      REAL(wp)           ::   zsec
2615      LOGICAL            ::   llexist
2616      TYPE(xios_duration)   ::   output_freq 
2617      !!----------------------------------------------------------------------
2618      !
2619      DO jn = 1, 2
2620         !
2621         output_freq = xios_duration(0,0,0,0,0,0)
2622         IF( jn == 1 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name        = clname, output_freq = output_freq )
2623         IF( jn == 2 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2624         !
2625         IF ( TRIM(clname) /= '' ) THEN 
2626            !
2627            idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2628            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2629               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cexper)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2630               idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
2631            END DO
2632            !
2633            idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2634            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2635              IF ( output_freq%timestep /= 0) THEN
2636                  WRITE(clfreq,'(I18,A2)')INT(output_freq%timestep),'ts' 
2637                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2638              ELSE IF ( output_freq%second /= 0 ) THEN
2639                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%second),'s' 
2640                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2641              ELSE IF ( output_freq%minute /= 0 ) THEN
2642                  WRITE(clfreq,'(I18,A2)')INT(output_freq%minute),'mi' 
2643                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2644              ELSE IF ( output_freq%hour /= 0 ) THEN
2645                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%hour),'h' 
2646                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2647              ELSE IF ( output_freq%day /= 0 ) THEN
2648                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%day),'d' 
2649                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2650              ELSE IF ( output_freq%month /= 0 ) THEN   
2651                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%month),'m' 
2652                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2653              ELSE IF ( output_freq%year /= 0 ) THEN   
2654                  WRITE(clfreq,'(I19,A1)')INT(output_freq%year),'y' 
2655                  itrlen = LEN_TRIM(ADJUSTL(clfreq))
2656              ELSE
2657                  CALL ctl_stop('error in the name of file id '//TRIM(cdid),   &
2658                     & ' attribute output_freq is undefined -> cannot replace @freq@ in '//TRIM(clname) )
2659              ENDIF
2660              clname = clname(1:idx-1)//TRIM(ADJUSTL(clfreq))//clname(idx+6:LEN_TRIM(clname))
2661              idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
2662            END DO
2663            !
2664            idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2665            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2666               cldate = iom_sdate( fjulday - rdt / rday )
2667               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+11:LEN_TRIM(clname))
2668               idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
2669            END DO
2670            !
2671            idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2672            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2673               cldate = iom_sdate( fjulday - rdt / rday, ldfull = .TRUE. )
2674               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+15:LEN_TRIM(clname))
2675               idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
2676            END DO
2677            !
2678            idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2679            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2680               cldate = iom_sdate( fjulday + rdt / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE. )
2681               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
2682               idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
2683            END DO
2684            !
2685            idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2686            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
2687               cldate = iom_sdate( fjulday + rdt / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE., ldfull = .TRUE. )
2688               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+13:LEN_TRIM(clname))
2689               idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
2690            END DO
2691            !
2692!FUS            IF( jn == 1 .AND. TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname)
2693!FUS see comment line 700
2694            IF( jn == 1 .AND. TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' ) THEN
2695             iln    = INDEX(clname,'/',BACK=.true.)
2696             cltmpn = clname(1:iln)
2697             clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
2698             clname = TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
2699            ENDIF
2700!FUS
2701            IF( jn == 1 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name        = clname )
2702            IF( jn == 2 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
2703            !
2704         ENDIF
2705         !
2706      END DO
2707      !
2708   END SUBROUTINE iom_update_file_name
2709
2710
2711   FUNCTION iom_sdate( pjday, ld24, ldfull )
2712      !!----------------------------------------------------------------------
2713      !!                     ***  ROUTINE iom_sdate  ***
2714      !!
2715      !! ** Purpose :   send back the date corresponding to the given julian day
2716      !!----------------------------------------------------------------------
2717      REAL(wp), INTENT(in   )           ::   pjday    ! julian day
2718      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ld24     ! true to force 24:00 instead of 00:00
2719      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldfull   ! true to get the compleate date: yyyymmdd_hh:mm:ss
2720      !
2721      CHARACTER(LEN=20) ::   iom_sdate
2722      CHARACTER(LEN=50) ::   clfmt                         !  format used to write the date
2723      INTEGER           ::   iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec
2724      REAL(wp)          ::   zsec
2725      LOGICAL           ::   ll24, llfull
2726      !!----------------------------------------------------------------------
2727      !
2728      IF( PRESENT(ld24) ) THEN   ;   ll24 = ld24
2729      ELSE                       ;   ll24 = .FALSE.
2730      ENDIF
2731      !
2732      IF( PRESENT(ldfull) ) THEN   ;   llfull = ldfull
2733      ELSE                         ;   llfull = .FALSE.
2734      ENDIF
2735      !
2736      CALL ju2ymds( pjday, iyear, imonth, iday, zsec )
2737      isec = NINT(zsec)
2738      !
2739      IF ( ll24 .AND. isec == 0 ) THEN   ! 00:00 of the next day -> move to 24:00 of the current day
2740         CALL ju2ymds( pjday - 1., iyear, imonth, iday, zsec )
2741         isec = 86400
2742      ENDIF
2743      !
2744      IF( iyear < 10000 ) THEN   ;   clfmt = "i4.4,2i2.2"                ! format used to write the date
2745      ELSE                       ;   WRITE(clfmt, "('i',i1,',2i2.2')") INT(LOG10(REAL(iyear,wp))) + 1
2746      ENDIF
2747      !
2748!$AGRIF_DO_NOT_TREAT     
2749      ! needed in the conv
2750      IF( llfull ) THEN
2751         clfmt = TRIM(clfmt)//",'_',i2.2,':',i2.2,':',i2.2"
2752         ihour   = isec / 3600
2753         isec    = MOD(isec, 3600)
2754         iminute = isec / 60
2755         isec    = MOD(isec, 60)
2756         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec    ! date of the end of run
2757      ELSE
2758         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday                          ! date of the end of run
2759      ENDIF
2760!$AGRIF_END_DO_NOT_TREAT     
2761      !
2762   END FUNCTION iom_sdate
2763
2764   INTEGER FUNCTION iom_add(idm)
2765   INTEGER :: idm
2766
2767   iom_add = idm + 1
2768   IF( iom_add > max_rst_fields) THEN
2769     WRITE(ctmp1,*) 'E R R O R : iom_set_rst_vars SIZE of RST_FIELD array is too small'
2770     CALL ctl_stop( 'iom_add:', ctmp1, 'Increase parameter max_rst_fields')
2771   ENDIF
2772
2773   END FUNCTION iom_add
2774
2775#else
2776   !!----------------------------------------------------------------------
2777   !!   NOT 'key_iomput'                               a few dummy routines
2778   !!----------------------------------------------------------------------
2779   SUBROUTINE iom_setkt( kt, cdname )
2780      INTEGER         , INTENT(in)::   kt 
2781      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2782      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) kt, cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2783   END SUBROUTINE iom_setkt
2784
2785   SUBROUTINE iom_context_finalize( cdname )
2786      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2787      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*)  cdname   ! useless test to avoid compilation warnings
2788   END SUBROUTINE iom_context_finalize
2789
2790#endif
2791
2792   LOGICAL FUNCTION iom_use( cdname )
2793      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
2794#if defined key_iomput
2795      iom_use = xios_field_is_active( cdname )
2796#else
2797      iom_use = .FALSE.
2798#endif
2799   END FUNCTION iom_use
2800
2801   SUBROUTINE iom_miss_val( cdname, pmiss_val )
2802      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in ) ::   cdname
2803      REAL(wp)        , INTENT(out) ::   pmiss_val   
2804#if defined key_iomput
2805      ! get missing value
2806      CALL xios_get_field_attr( cdname, default_value = pmiss_val )
2807#else
2808      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pmiss_val   ! useless test to avoid compilation warnings
2809#endif
2810   END SUBROUTINE iom_miss_val
2811 
2812   !!======================================================================
2813END MODULE iom
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.