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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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trazdf.F90 in NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src/OCE/TRA – NEMO

source: NEMO/branches/2019/dev_r11943_MERGE_2019/src/OCE/TRA/trazdf.F90 @ 12353

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Branch 2019/dev_r11943_MERGE_2019. Additions to the do loop macro implementation: converted a few loops previously missed because they used jpi-1 instead of jpim1 etc.; changed internal macro names in do_loop_substitute.h90 to strings that are much more unlikely to appear in any future code elsewhere and removed the key_vectopt_loop option (and all related code) since the do loop macros have suppressed this option. These changes have been fully SETTE-tested and this branch should now be ready to go back to the trunk.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 12.7 KB
Line 
1MODULE trazdf
2   !!==============================================================================
3   !!                 ***  MODULE  trazdf  ***
4   !! Ocean active tracers:  vertical component of the tracer mixing trend
5   !!==============================================================================
6   !! History :  1.0  !  2005-11  (G. Madec)  Original code
7   !!            3.0  !  2008-01  (C. Ethe, G. Madec)  merge TRC-TRA
8   !!            4.0  !  2017-06  (G. Madec)  remove explict time-stepping option
9   !!----------------------------------------------------------------------
10
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!   tra_zdf       : Update the tracer trend with the vertical diffusion
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   USE oce            ! ocean dynamics and tracers variables
15   USE dom_oce        ! ocean space and time domain variables
16   USE domvvl         ! variable volume
17   USE phycst         ! physical constant
18   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics variables
19   USE sbc_oce        ! surface boundary condition: ocean
20   USE ldftra         ! lateral diffusion: eddy diffusivity
21   USE ldfslp         ! lateral diffusion: iso-neutral slope
22   USE trd_oce        ! trends: ocean variables
23   USE trdtra         ! trends: tracer trend manager
24   !
25   USE in_out_manager ! I/O manager
26   USE prtctl         ! Print control
27   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
28   USE lib_mpp        ! MPP library
29   USE timing         ! Timing
30
31   IMPLICIT NONE
32   PRIVATE
33
34   PUBLIC   tra_zdf       ! called by step.F90
35   PUBLIC   tra_zdf_imp   ! called by trczdf.F90
36
37   !! * Substitutions
38#  include "do_loop_substitute.h90"
39   !!----------------------------------------------------------------------
40   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
41   !! $Id$
42   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
43   !!----------------------------------------------------------------------
44CONTAINS
45
46   SUBROUTINE tra_zdf( kt, Kbb, Kmm, Krhs, pts, Kaa )
47      !!----------------------------------------------------------------------
48      !!                  ***  ROUTINE tra_zdf  ***
49      !!
50      !! ** Purpose :   compute the vertical ocean tracer physics.
51      !!---------------------------------------------------------------------
52      INTEGER                                  , INTENT(in)    :: kt                  ! ocean time-step index
53      INTEGER                                  , INTENT(in)    :: Kbb, Kmm, Krhs, Kaa ! time level indices
54      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts,jpt), INTENT(inout) :: pts                 ! active tracers and RHS of tracer equation
55      !
56      INTEGER  ::   jk   ! Dummy loop indices
57      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::   ztrdt, ztrds   ! 3D workspace
58      !!---------------------------------------------------------------------
59      !
60      IF( ln_timing )   CALL timing_start('tra_zdf')
61      !
62      IF( kt == nit000 )  THEN
63         IF(lwp)WRITE(numout,*)
64         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'tra_zdf : implicit vertical mixing on T & S'
65         IF(lwp)WRITE(numout,*) '~~~~~~~ '
66      ENDIF
67      !
68      IF( neuler == 0 .AND. kt == nit000 ) THEN   ;   r2dt =      rdt   ! at nit000, =   rdt (restarting with Euler time stepping)
69      ELSEIF( kt <= nit000 + 1           ) THEN   ;   r2dt = 2. * rdt   ! otherwise, = 2 rdt (leapfrog)
70      ENDIF
71      !
72      IF( l_trdtra )   THEN                  !* Save ta and sa trends
73         ALLOCATE( ztrdt(jpi,jpj,jpk) , ztrds(jpi,jpj,jpk) )
74         ztrdt(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_tem,Kaa)
75         ztrds(:,:,:) = pts(:,:,:,jp_sal,Kaa)
76      ENDIF
77      !
78      !                                      !* compute lateral mixing trend and add it to the general trend
79      CALL tra_zdf_imp( kt, nit000, 'TRA', r2dt, Kbb, Kmm, Krhs, pts, Kaa, jpts ) 
80
81!!gm WHY here !   and I don't like that !
82      ! DRAKKAR SSS control {
83      ! JMM avoid negative salinities near river outlet ! Ugly fix
84      ! JMM : restore negative salinities to small salinities:
85      WHERE( pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) < 0._wp )   pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) = 0.1_wp
86!!gm
87
88      IF( l_trdtra )   THEN                      ! save the vertical diffusive trends for further diagnostics
89         DO jk = 1, jpkm1
90            ztrdt(:,:,jk) = ( ( pts(:,:,jk,jp_tem,Kaa)*e3t(:,:,jk,Kaa) - pts(:,:,jk,jp_tem,Kbb)*e3t(:,:,jk,Kbb) ) &
91               &          / (e3t(:,:,jk,Kmm)*r2dt) ) - ztrdt(:,:,jk)
92            ztrds(:,:,jk) = ( ( pts(:,:,jk,jp_sal,Kaa)*e3t(:,:,jk,Kaa) - pts(:,:,jk,jp_sal,Kbb)*e3t(:,:,jk,Kbb) ) &
93              &           / (e3t(:,:,jk,Kmm)*r2dt) ) - ztrds(:,:,jk)
94         END DO
95!!gm this should be moved in trdtra.F90 and done on all trends
96         CALL lbc_lnk_multi( 'trazdf', ztrdt, 'T', 1. , ztrds, 'T', 1. )
97!!gm
98         CALL trd_tra( kt, Kmm, Krhs, 'TRA', jp_tem, jptra_zdf, ztrdt )
99         CALL trd_tra( kt, Kmm, Krhs, 'TRA', jp_sal, jptra_zdf, ztrds )
100         DEALLOCATE( ztrdt , ztrds )
101      ENDIF
102      !                                          ! print mean trends (used for debugging)
103      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Kaa), clinfo1=' zdf  - Ta: ', mask1=tmask,               &
104         &                                  tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Kaa), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' )
105      !
106      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('tra_zdf')
107      !
108   END SUBROUTINE tra_zdf
109
110 
111   SUBROUTINE tra_zdf_imp( kt, kit000, cdtype, p2dt, Kbb, Kmm, Krhs, pt, Kaa, kjpt ) 
112      !!----------------------------------------------------------------------
113      !!                  ***  ROUTINE tra_zdf_imp  ***
114      !!
115      !! ** Purpose :   Compute the after tracer through a implicit computation
116      !!     of the vertical tracer diffusion (including the vertical component
117      !!     of lateral mixing (only for 2nd order operator, for fourth order
118      !!     it is already computed and add to the general trend in traldf)
119      !!
120      !! ** Method  :  The vertical diffusion of a tracer ,t , is given by:
121      !!          difft = dz( avt dz(t) ) = 1/e3t dk+1( avt/e3w dk(t) )
122      !!      It is computed using a backward time scheme (t=after field)
123      !!      which provide directly the after tracer field.
124      !!      If ln_zdfddm=T, use avs for salinity or for passive tracers
125      !!      Surface and bottom boundary conditions: no diffusive flux on
126      !!      both tracers (bottom, applied through the masked field avt).
127      !!      If iso-neutral mixing, add to avt the contribution due to lateral mixing.
128      !!
129      !! ** Action  : - pt(:,:,:,:,Kaa)  becomes the after tracer
130      !!---------------------------------------------------------------------
131      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kt       ! ocean time-step index
132      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   Kbb, Kmm, Krhs, Kaa  ! ocean time level indices
133      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kit000   ! first time step index
134      CHARACTER(len=3)                         , INTENT(in   ) ::   cdtype   ! =TRA or TRC (tracer indicator)
135      INTEGER                                  , INTENT(in   ) ::   kjpt     ! number of tracers
136      REAL(wp)                                 , INTENT(in   ) ::   p2dt     ! tracer time-step
137      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,kjpt,jpt), INTENT(inout) ::   pt       ! tracers and RHS of tracer equation
138      !
139      INTEGER  ::  ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices
140      REAL(wp) ::  zrhs, zzwi, zzws ! local scalars
141      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zwi, zwt, zwd, zws
142      !!---------------------------------------------------------------------
143      !
144      !                                               ! ============= !
145      DO jn = 1, kjpt                                 !  tracer loop  !
146         !                                            ! ============= !
147         !  Matrix construction
148         ! --------------------
149         ! Build matrix if temperature or salinity (only in double diffusion case) or first passive tracer
150         !
151         IF(  ( cdtype == 'TRA' .AND. ( jn == jp_tem .OR. ( jn == jp_sal .AND. ln_zdfddm ) ) ) .OR.   &
152            & ( cdtype == 'TRC' .AND. jn == 1 )  )  THEN
153            !
154            ! vertical mixing coef.: avt for temperature, avs for salinity and passive tracers
155            IF( cdtype == 'TRA' .AND. jn == jp_tem ) THEN   ;   zwt(:,:,2:jpk) = avt(:,:,2:jpk)
156            ELSE                                            ;   zwt(:,:,2:jpk) = avs(:,:,2:jpk)
157            ENDIF
158            zwt(:,:,1) = 0._wp
159            !
160            IF( l_ldfslp ) THEN            ! isoneutral diffusion: add the contribution
161               IF( ln_traldf_msc  ) THEN     ! MSC iso-neutral operator
162                  DO_3D_00_00( 2, jpkm1 )
163                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + akz(ji,jj,jk) 
164                  END_3D
165               ELSE                          ! standard or triad iso-neutral operator
166                  DO_3D_00_00( 2, jpkm1 )
167                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + ah_wslp2(ji,jj,jk)
168                  END_3D
169               ENDIF
170            ENDIF
171            !
172            ! Diagonal, lower (i), upper (s)  (including the bottom boundary condition since avt is masked)
173            IF( ln_zad_Aimp ) THEN         ! Adaptive implicit vertical advection
174               DO_3D_00_00( 1, jpkm1 )
175                  zzwi = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk  ,Kmm)
176                  zzws = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm)
177                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zzwi - zzws   &
178                     &                 + p2dt * ( MAX( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) - MIN( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) )
179                  zwi(ji,jj,jk) = zzwi + p2dt *   MIN( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp )
180                  zws(ji,jj,jk) = zzws - p2dt *   MAX( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp )
181               END_3D
182            ELSE
183               DO_3D_00_00( 1, jpkm1 )
184                  zwi(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk,Kmm)
185                  zws(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm)
186                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zwi(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk)
187               END_3D
188            ENDIF
189            !
190            !! Matrix inversion from the first level
191            !!----------------------------------------------------------------------
192            !   solve m.x = y  where m is a tri diagonal matrix ( jpk*jpk )
193            !
194            !        ( zwd1 zws1   0    0    0  )( zwx1 ) ( zwy1 )
195            !        ( zwi2 zwd2 zws2   0    0  )( zwx2 ) ( zwy2 )
196            !        (  0   zwi3 zwd3 zws3   0  )( zwx3 )=( zwy3 )
197            !        (        ...               )( ...  ) ( ...  )
198            !        (  0    0    0   zwik zwdk )( zwxk ) ( zwyk )
199            !
200            !   m is decomposed in the product of an upper and lower triangular matrix.
201            !   The 3 diagonal terms are in 3d arrays: zwd, zws, zwi.
202            !   Suffices i,s and d indicate "inferior" (below diagonal), diagonal
203            !   and "superior" (above diagonal) components of the tridiagonal system.
204            !   The solution will be in the 4d array pta.
205            !   The 3d array zwt is used as a work space array.
206            !   En route to the solution pt(:,:,:,:,Kaa) is used a to evaluate the rhs and then
207            !   used as a work space array: its value is modified.
208            !
209            DO_2D_00_00
210               zwt(ji,jj,1) = zwd(ji,jj,1)
211            END_2D
212            DO_3D_00_00( 2, jpkm1 )
213               zwt(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwt(ji,jj,jk-1)
214            END_3D
215            !
216         ENDIF 
217         !         
218         DO_2D_00_00
219            pt(ji,jj,1,jn,Kaa) = e3t(ji,jj,1,Kbb) * pt(ji,jj,1,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,1,Kmm) * pt(ji,jj,1,jn,Krhs)
220         END_2D
221         DO_3D_00_00( 2, jpkm1 )
222            zrhs = e3t(ji,jj,jk,Kbb) * pt(ji,jj,jk,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,jk,Kmm) * pt(ji,jj,jk,jn,Krhs)   ! zrhs=right hand side
223            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = zrhs - zwi(ji,jj,jk) / zwt(ji,jj,jk-1) * pt(ji,jj,jk-1,jn,Kaa)
224         END_3D
225         !
226         DO_2D_00_00
227            pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) = pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) / zwt(ji,jj,jpkm1) * tmask(ji,jj,jpkm1)
228         END_2D
229         DO_3DS_00_00( jpk-2, 1, -1 )
230            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = ( pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) - zws(ji,jj,jk) * pt(ji,jj,jk+1,jn,Kaa) )   &
231               &             / zwt(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk)
232         END_3D
233         !                                            ! ================= !
234      END DO                                          !  end tracer loop  !
235      !                                               ! ================= !
236   END SUBROUTINE tra_zdf_imp
237
238   !!==============================================================================
239END MODULE trazdf
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.