source: NEMO/branches/2019/dev_r12072_MERGE_OPTION2_2019/src/OCE/IOM/iom_nf90.F90 @ 12154

Last change on this file since 12154 was 12154, checked in by cetlod, 10 months ago

commit

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 44.2 KB
Line 
1MODULE iom_nf90
2   !!======================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom_nf90 ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files with NF90 (only fliocom module)
5   !!======================================================================
6   !! History :  9.0  ! 05 12  (J. Belier) Original code
7   !!            9.0  ! 06 02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!             "   ! 07 07  (D. Storkey) Changes to iom_nf90_gettime
9   !!            3.6  ! 2015-15  (J. Harle) Added procedure to read REAL attributes
10   !!            4.0  ! 2017-11 (M. Andrejczuk) Extend IOM interface to write any 3D fields
11   !!----------------------------------------------------------------------
12
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   !!   iom_open       : open a file read only
15   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
16   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
17   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
18   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
19   !!----------------------------------------------------------------------
20   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
21   USE sbc_oce, ONLY: jpka, ght_abl ! abl vertical level number and height
22   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
23   USE iom_def         ! iom variables definitions
24   USE netcdf          ! NetCDF library
25   USE in_out_manager  ! I/O manager
26   USE lib_mpp         ! MPP library
27
28   IMPLICIT NONE
29   PRIVATE
30
31   PUBLIC iom_nf90_open  , iom_nf90_close, iom_nf90_varid, iom_nf90_get, iom_nf90_rstput
32   PUBLIC iom_nf90_chkatt, iom_nf90_getatt, iom_nf90_putatt
33
34   INTERFACE iom_nf90_get
35      MODULE PROCEDURE iom_nf90_g0d, iom_nf90_g123d
36   END INTERFACE
37   INTERFACE iom_nf90_rstput
38      MODULE PROCEDURE iom_nf90_rp0123d
39   END INTERFACE
40
41   !!----------------------------------------------------------------------
42   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
43   !! $Id$
44   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
45   !!----------------------------------------------------------------------
46CONTAINS
47
48   SUBROUTINE iom_nf90_open( cdname, kiomid, ldwrt, ldok, kdompar, kdlev )
49      !!---------------------------------------------------------------------
50      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
51      !!
52      !! ** Purpose : open an input file with NF90
53      !!---------------------------------------------------------------------
54      CHARACTER(len=*)       , INTENT(inout)           ::   cdname      ! File name
55      INTEGER                , INTENT(  out)           ::   kiomid      ! nf90 identifier of the opened file
56      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldwrt       ! read or write the file?
57      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldok        ! check the existence
58      INTEGER, DIMENSION(2,5), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdompar     ! domain parameters:
59      INTEGER                , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdlev       ! size of the ice/abl third dimension
60
61      CHARACTER(LEN=256) ::   clinfo           ! info character
62      CHARACTER(LEN=256) ::   cltmp            ! temporary character
63      INTEGER            ::   iln              ! lengths of character
64      INTEGER            ::   istop            ! temporary storage of nstop
65      INTEGER            ::   if90id           ! nf90 identifier of the opened file
66      INTEGER            ::   idmy             ! dummy variable
67      INTEGER            ::   jl               ! loop variable
68      INTEGER            ::   ichunk           ! temporary storage of nn_chunksz
69      INTEGER            ::   imode            ! creation mode flag: NF90_CLOBBER or NF90_NOCLOBBER or NF90_HDF5
70      INTEGER            ::   ihdf5            ! local variable for retrieval of value for NF90_HDF5
71      LOGICAL            ::   llclobber        ! local definition of ln_clobber
72      INTEGER            ::   ilevels          ! vertical levels
73      !---------------------------------------------------------------------
74      !
75      clinfo = '                    iom_nf90_open ~~~  '
76      istop = nstop     ! store the actual value of nstop
77      !
78      !                 !number of vertical levels
79      IF( PRESENT(kdlev) )   THEN   ;   ilevels = kdlev    ! use input value (useful for sea-ice and abl)
80      ELSE                          ;   ilevels = jpk      ! by default jpk
81      ENDIF
82      !
83      IF( nn_chunksz > 0 ) THEN   ;   ichunk = nn_chunksz
84      ELSE                        ;   ichunk = NF90_SIZEHINT_DEFAULT
85      ENDIF
86      !
87      llclobber = ldwrt .AND. ln_clobber
88      IF( ldok .AND. .NOT. llclobber ) THEN      !==  Open existing file ==!
89         !                                       !=========================!
90         IF( ldwrt ) THEN  ! ... in write mode
91            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
92            IF( snc4set%luse ) THEN
93               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id ), clinfo)
94            ELSE
95               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
96            ENDIF
97            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL, idmy                          ), clinfo)
98         ELSE              ! ... in read mode
99            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in READ mode'
100            CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_NOWRITE, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
101         ENDIF
102      ELSE                                       !== the file doesn't exist ==!   (or we overwrite it)
103         !                                       !============================!
104         iln = INDEX( cdname, '.nc' )
105         IF( ldwrt ) THEN              !* the file should be open in write mode so we create it...
106            IF( jpnij > 1 ) THEN
107               WRITE(cltmp,'(a,a,i4.4,a)') cdname(1:iln-1), '_', narea-1, '.nc'
108               cdname = TRIM(cltmp)
109            ENDIF
110            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' create new file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
111
112            IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_CLOBBER   )
113            ELSE                   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_NOCLOBBER ) 
114            ENDIF
115            IF( snc4set%luse ) THEN
116               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' creating file: '//TRIM(cdname)//' in hdf5 (netcdf4) mode'
117               CALL GET_NF90_SYMBOL("NF90_HDF5", ihdf5)
118               IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_CLOBBER)
119               ELSE                   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_NOCLOBBER)
120               ENDIF
121               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id ), clinfo)
122            ELSE
123               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
124            ENDIF
125            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL,                   idmy ), clinfo)
126            ! define dimensions
127            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'x',   kdompar(1,1), idmy ), clinfo)
128            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'y',   kdompar(2,1), idmy ), clinfo)
129            IF( PRESENT(kdlev) ) THEN
130              IF( kdlev == jpka ) THEN
131                 CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'nav_lev',          kdlev, idmy ), clinfo)
132                 CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'time_counter', NF90_UNLIMITED, idmy ), clinfo)
133              ELSE
134                 CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'nav_lev',            jpk, idmy ), clinfo)
135                 CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'time_counter', NF90_UNLIMITED, idmy ), clinfo)
136                 CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,  'numcat',          kdlev, idmy ), clinfo)
137              ENDIF
138            ELSE
139               CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'nav_lev',            jpk, idmy ), clinfo)
140               CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'time_counter', NF90_UNLIMITED, idmy ), clinfo)
141            ENDIF
142            ! global attributes
143            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number_total'   , jpnij              ), clinfo)
144            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number'         , narea-1            ), clinfo)
145            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_dimensions_ids' , (/1     , 2     /) ), clinfo)
146            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_global'    , (/jpiglo, jpjglo/) ), clinfo)
147            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_local'     , kdompar(:,1)       ), clinfo)
148            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_first' , kdompar(:,2)       ), clinfo)
149            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_last'  , kdompar(:,3)       ), clinfo)
150            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_start', kdompar(:,4)       ), clinfo)
151            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_end'  , kdompar(:,5)       ), clinfo)
152            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_type'           , 'BOX'              ), clinfo)
153         ELSE                          !* the file should be open for read mode so it must exist...
154            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), ' should be impossible case...' )
155         ENDIF
156      ENDIF
157      !
158      ! start to fill file informations
159      ! =============
160      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
161!does not work with some compilers         kiomid = MINLOC(iom_file(:)%nfid, dim = 1)
162         kiomid = 0
163         DO jl = jpmax_files, 1, -1
164            IF( iom_file(jl)%nfid == 0 )   kiomid = jl
165         ENDDO
166         iom_file(kiomid)%name   = TRIM(cdname)
167         iom_file(kiomid)%nfid   = if90id
168         iom_file(kiomid)%nvars  = 0
169         iom_file(kiomid)%irec   = -1   ! useless for NetCDF files, used to know if the file is in define mode
170         iom_file(kiomid)%nlev   = ilevels
171         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire(if90id, unlimitedDimId = iom_file(kiomid)%iduld), clinfo)
172         IF( iom_file(kiomid)%iduld .GE. 0 ) THEN
173            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, iom_file(kiomid)%iduld,    & 
174               &                                       name = iom_file(kiomid)%uldname,   &
175               &                                       len  = iom_file(kiomid)%lenuld ), clinfo )
176         ENDIF
177         IF(lwp) WRITE(numout,*) '                   ---> '//TRIM(cdname)//' OK'
178      ELSE
179         kiomid = 0               ! return error flag
180      ENDIF
181      !
182   END SUBROUTINE iom_nf90_open
183
184
185   SUBROUTINE iom_nf90_close( kiomid )
186      !!--------------------------------------------------------------------
187      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_close  ***
188      !!
189      !! ** Purpose : close an input file with NF90
190      !!--------------------------------------------------------------------
191      INTEGER, INTENT(in) ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
192      CHARACTER(LEN=100)  ::   clinfo   ! info character
193      !---------------------------------------------------------------------
194      clinfo = '      iom_nf90_close    , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)
195      CALL iom_nf90_check(NF90_CLOSE(iom_file(kiomid)%nfid), clinfo)
196   END SUBROUTINE iom_nf90_close
197
198
199   FUNCTION iom_nf90_varid ( kiomid, cdvar, kiv, kdimsz, kndims, lduld ) 
200      !!-----------------------------------------------------------------------
201      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
202      !!
203      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file with NF90
204      !!-----------------------------------------------------------------------
205      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
206      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
207      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiv   !
208      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of each dimension
209      INTEGER              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! number of dimensions
210      LOGICAL              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   lduld    ! true if the last dimension is unlimited (time)
211      !
212      INTEGER                        ::   iom_nf90_varid   ! iom variable Id
213      INTEGER                        ::   if90id           ! nf90 file identifier
214      INTEGER                        ::   ji               ! dummy loop index
215      INTEGER                        ::   ivarid           ! NetCDF  variable Id
216      INTEGER                        ::   i_nvd            ! number of dimension of the variable
217      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimid           ! dimension ids of the variable
218      LOGICAL                        ::   llok             ! ok  test
219      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo           ! info character
220      !!-----------------------------------------------------------------------
221      clinfo = '          iom_nf90_varid, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
222      iom_nf90_varid = 0                    ! default definition
223      IF( PRESENT(kdimsz) ) kdimsz(:) = 0   ! default definition
224      if90id = iom_file(kiomid)%nfid        ! get back NetCDF file id
225      !
226      llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! does the variable exist in the file
227      IF( llok ) THEN
228         iom_nf90_varid = kiv
229         iom_file(kiomid)%nvars       = kiv
230         iom_file(kiomid)%nvid(kiv)   = ivarid
231         iom_file(kiomid)%cn_var(kiv) = TRIM(cdvar)
232         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, ndims = i_nvd), clinfo)   ! number of dimensions
233         iom_file(kiomid)%ndims(kiv)  = i_nvd
234         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, dimids = idimid(1:i_nvd)), clinfo)   ! dimensions ids
235         iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .FALSE.   ! default value
236         iom_file(kiomid)%dimsz(:,kiv) = 0      ! reset dimsz in case previously used
237         DO ji = 1, i_nvd                       ! dimensions size
238            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, idimid(ji), len = iom_file(kiomid)%dimsz(ji,kiv)), clinfo)   
239            IF( idimid(ji) == iom_file(kiomid)%iduld ) iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .TRUE.   ! unlimited dimension?
240         END DO
241         !---------- Deal with scale_factor and add_offset
242         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'scale_factor') == nf90_noerr
243         IF( llok) THEN
244            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'scale_factor', iom_file(kiomid)%scf(kiv)), clinfo)
245         ELSE
246            iom_file(kiomid)%scf(kiv) = 1.
247         END IF
248         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'add_offset') == nf90_noerr
249         IF( llok ) THEN
250            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'add_offset', iom_file(kiomid)%ofs(kiv)), clinfo)
251         ELSE
252            iom_file(kiomid)%ofs(kiv) = 0.
253         END IF
254         ! return the simension size
255         IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
256            IF( i_nvd <= SIZE(kdimsz) ) THEN
257               kdimsz(1:i_nvd) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,kiv)
258            ELSE
259               WRITE(ctmp1,*) i_nvd, SIZE(kdimsz)
260               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'error in kdimsz size'//TRIM(ctmp1) )
261            ENDIF
262         ENDIF
263         IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(kiv)
264         IF( PRESENT( lduld) )  lduld  = iom_file(kiomid)%luld(kiv)
265      ELSE 
266         iom_nf90_varid = -1   !   variable not found, return error code: -1
267      ENDIF
268      !
269   END FUNCTION iom_nf90_varid
270
271   !!----------------------------------------------------------------------
272   !!                   INTERFACE iom_nf90_get
273   !!----------------------------------------------------------------------
274
275   SUBROUTINE iom_nf90_g0d( kiomid, kvid, pvar, kstart )
276      !!-----------------------------------------------------------------------
277      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g0d  ***
278      !!
279      !! ** Purpose : read a scalar with NF90
280      !!-----------------------------------------------------------------------
281      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kiomid   ! Identifier of the file
282      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kvid     ! variable id
283      REAL(wp),               INTENT(  out)            ::   pvar     ! read field
284      INTEGER , DIMENSION(1), INTENT(in   ), OPTIONAL  ::   kstart   ! start position of the reading in each axis
285      !
286      CHARACTER(LEN=100)      ::   clinfo   ! info character
287      !---------------------------------------------------------------------
288      clinfo = 'iom_nf90_g0d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
289      CALL iom_nf90_check(NF90_GET_VAR(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), pvar, start = kstart), clinfo )
290   END SUBROUTINE iom_nf90_g0d
291
292
293   SUBROUTINE iom_nf90_g123d( kiomid, kvid, knbdim, kstart, kcount, kx1, kx2, ky1, ky2,   &
294         &                    pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
295      !!-----------------------------------------------------------------------
296      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g123d  ***
297      !!
298      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable with NF90
299      !!
300      !! ** Method : read ONE record at each CALL
301      !!-----------------------------------------------------------------------
302      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! iom identifier of the file
303      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kvid      ! Name of the variable
304      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   knbdim    ! number of dimensions of the variable
305      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kstart    ! start position of the reading in each axis
306      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kcount    ! number of points to be read in each axis
307      INTEGER ,                    INTENT(in   )           ::   kx1, kx2, ky1, ky2   ! subdomain indexes
308      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d    ! read field (1D case)
309      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d    ! read field (2D case)
310      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d    ! read field (3D case)
311      !
312      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo               ! info character
313      INTEGER            ::   if90id               ! nf90 identifier of the opened file
314      INTEGER            ::   ivid                 ! nf90 variable id
315      !---------------------------------------------------------------------
316      clinfo = 'iom_nf90_g123d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
317      if90id = iom_file(kiomid)%nfid         ! get back NetCDF file id
318      ivid   = iom_file(kiomid)%nvid(kvid)   ! get back NetCDF var id
319      !
320      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
321         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r1d(:                ), start = kstart(1:knbdim),   &
322            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
323      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
324         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r2d(kx1:kx2,ky1:ky2  ), start = kstart(1:knbdim),   &
325            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
326      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
327         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r3d(kx1:kx2,ky1:ky2,:), start = kstart(1:knbdim),   &
328            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
329      ENDIF
330      !
331   END SUBROUTINE iom_nf90_g123d
332
333
334   SUBROUTINE iom_nf90_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize, cdvar )
335      !!-----------------------------------------------------------------------
336      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_chkatt  ***
337      !!
338      !! ** Purpose : check existence of attribute with NF90
339      !!              (either a global attribute (default) or a variable
340      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
341      !!-----------------------------------------------------------------------
342      INTEGER         , INTENT(in   ) ::   kiomid   ! Identifier of the file
343      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdatt    ! attribute name
344      LOGICAL         , INTENT(  out) ::   llok     ! error code
345      INTEGER         , INTENT(  out), OPTIONAL     &
346                      &               ::   ksize    ! attribute size
347      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ), OPTIONAL     &
348                      &               ::   cdvar    ! name of the variable
349      !
350      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
351      INTEGER                         ::   isize    ! temporary integer
352      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
353      !---------------------------------------------------------------------
354      !
355      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
356      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
357         ! check the variable exists in the file
358         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
359         IF( llok ) &
360            ! check the variable has the attribute required
361            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
362      ELSE
363         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
364      ENDIF
365      !
366      IF( PRESENT(ksize) ) ksize = isize
367      !
368      IF( .not. llok) &
369         CALL ctl_warn('iom_nf90_chkatt: no attribute '//cdatt//' found')
370      !
371   END SUBROUTINE iom_nf90_chkatt
372
373
374   !!----------------------------------------------------------------------
375   !!                   INTERFACE iom_nf90_getatt
376   !!----------------------------------------------------------------------
377
378   SUBROUTINE iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
379      !!-----------------------------------------------------------------------
380      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_getatt  ***
381      !!
382      !! ** Purpose : read an attribute with NF90
383      !!              (either a global attribute (default) or a variable
384      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
385      !!-----------------------------------------------------------------------
386      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
387      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
388      INTEGER               , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
389      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
390      REAL(wp)              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
391      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
392      CHARACTER(len=*)      , INTENT(  out), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
393      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
394      !
395      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
396      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
397      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
398      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
399      !---------------------------------------------------------------------
400      !
401      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
402      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
403         ! check the variable exists in the file
404         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
405         IF( llok ) THEN
406            ! check the variable has the attribute required
407            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt) == nf90_noerr
408         ELSE
409            CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found')
410         ENDIF
411      ELSE
412         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt) == nf90_noerr
413         ivarid = NF90_GLOBAL
414      ENDIF
415      !
416      IF( llok) THEN
417         clinfo = 'iom_nf90_getatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
418         IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt0d), clinfo)
419         IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt1d), clinfo)
420         IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt0d), clinfo)
421         IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt1d), clinfo)
422         IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = cdatt0d), clinfo)
423      ELSE
424         CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no attribute '//TRIM(cdatt)//' found')
425         IF(PRESENT( katt0d))    katt0d    = -999
426         IF(PRESENT( katt1d))    katt1d(:) = -999
427         IF(PRESENT( patt0d))    patt0d    = -999._wp
428         IF(PRESENT( patt1d))    patt1d(:) = -999._wp
429         IF(PRESENT(cdatt0d))   cdatt0d    = '!'
430      ENDIF
431      !
432   END SUBROUTINE iom_nf90_getatt
433
434
435   SUBROUTINE iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
436      !!-----------------------------------------------------------------------
437      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_putatt  ***
438      !!
439      !! ** Purpose : write an attribute with NF90
440      !!              (either a global attribute (default) or a variable
441      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
442      !!-----------------------------------------------------------------------
443      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
444      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
445      INTEGER               , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
446      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
447      REAL(wp)              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
448      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
449      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
450      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
451      !
452      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
453      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
454      INTEGER                         ::   isize    ! Attribute size
455      INTEGER                         ::   itype    ! Attribute type
456      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
457      LOGICAL                         ::   llatt     ! temporary logical
458      LOGICAL                         ::   lldata   ! temporary logical
459      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
460      !---------------------------------------------------------------------
461      !
462      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
463      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
464         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! is the variable in the file?
465         IF( .NOT. llok ) THEN
466            CALL ctl_warn('iom_nf90_putatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found'   &
467               &        , '                 no attribute '//cdatt//' written' )
468            RETURN
469         ENDIF
470      ELSE
471         ivarid = NF90_GLOBAL
472      ENDIF
473      llatt = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len = isize, xtype = itype ) == nf90_noerr
474      !
475      ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
476      lldata = iom_file(kiomid)%irec /= -1   ! default: go back in define mode if in data mode
477      IF( lldata .AND. llatt ) THEN          ! attribute already there. Do we really need to go back in define mode?
478         ! do we have the appropriate type?
479         IF(PRESENT( katt0d) .OR. PRESENT( katt1d))   llok = itype == NF90_INT
480         IF(PRESENT( patt0d) .OR. PRESENT( patt1d))   llok = itype == NF90_DOUBLE
481         IF(PRESENT(cdatt0d)                      )   llok = itype == NF90_CHAR
482         ! and do we have the appropriate size?
483         IF(PRESENT( katt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
484         IF(PRESENT( katt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(katt1d)
485         IF(PRESENT( patt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
486         IF(PRESENT( patt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(patt1d)
487         IF(PRESENT(cdatt0d))   llok = llok .AND. isize == LEN_TRIM(cdatt0d)
488         !
489         lldata = .NOT. llok
490      ENDIF
491      !
492      clinfo = 'iom_nf90_putatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
493      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ! leave data mode to define mode
494      !
495      IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt0d) , clinfo)
496      IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt1d) , clinfo)
497      IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt0d) , clinfo)
498      IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt1d) , clinfo)
499      IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = trim(cdatt0d)), clinfo)
500      !
501      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ! leave define mode to data mode
502      !
503   END SUBROUTINE iom_nf90_putatt
504
505
506   SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d( kt, kwrite, kiomid, cdvar , kvid  , ktype,   &
507         &                                  pv_r0d, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
508      !!--------------------------------------------------------------------
509      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_rstput  ***
510      !!
511      !! ** Purpose : read the time axis cdvar in the file
512      !!--------------------------------------------------------------------
513      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kt       ! ocean time-step
514      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kwrite   ! writing time-step
515      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kiomid   ! Identifier of the file
516      CHARACTER(len=*)            , INTENT(in)           ::   cdvar    ! variable name
517      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kvid     ! variable id
518      INTEGER                     , INTENT(in), OPTIONAL ::   ktype    ! variable type (default R8)
519      REAL(wp)                    , INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r0d   ! written Od field
520      REAL(wp), DIMENSION(      :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r1d   ! written 1d field
521      REAL(wp), DIMENSION(:, :   ), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r2d   ! written 2d field
522      REAL(wp), DIMENSION(:, :, :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r3d   ! written 3d field
523      !
524      INTEGER               :: idims                ! number of dimension
525      INTEGER               :: idvar                ! variable id
526      INTEGER               :: jd                   ! dimension loop counter   
527      INTEGER               :: ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes   
528      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimsz               ! dimensions size 
529      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimid               ! dimensions id
530      CHARACTER(LEN=256)    :: clinfo               ! info character
531      CHARACTER(LEN= 12), DIMENSION(5) :: cltmp     ! temporary character
532      INTEGER               :: if90id               ! nf90 file identifier
533      INTEGER               :: idmy                 ! dummy variable
534      INTEGER               :: itype                ! variable type
535      INTEGER, DIMENSION(4) :: ichunksz             ! NetCDF4 chunk sizes. Will be computed using
536      !                                             ! nn_nchunks_[i,j,k,t] namelist parameters
537      INTEGER               :: ichunkalg, ishuffle, ideflate, ideflate_level
538      !                                             ! NetCDF4 internally fixed parameters
539      LOGICAL               :: lchunk               ! logical switch to activate chunking and compression
540      !                                             ! when appropriate (currently chunking is applied to 4d fields only)
541      INTEGER               :: idlv                 ! local variable
542      INTEGER               :: idim3                ! id of the third dimension
543      !---------------------------------------------------------------------
544      !
545      clinfo = '          iom_nf90_rp0123d, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
546      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
547      !
548      ! define dimension variables if it is not already done
549      ! ==========================
550      IF( iom_file(kiomid)%nvars == 0 ) THEN
551         ! are we in define mode?
552         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
553            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
554         ENDIF
555         ! define the dimension variables if it is not already done
556         ! Warning: we must use the same character length in an array constructor (at least for gcc compiler)
557         cltmp = (/ 'nav_lon     ', 'nav_lat     ', 'nav_lev     ', 'time_counter', 'numcat      ' /)   
558         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(1)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(1) ), clinfo)
559         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(2)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(2) ), clinfo)
560         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(3)), NF90_FLOAT , (/ 3    /), iom_file(kiomid)%nvid(3) ), clinfo)
561         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(4)), NF90_DOUBLE, (/ 4    /), iom_file(kiomid)%nvid(4) ), clinfo)
562         ! update informations structure related the dimension variable we just added...
563         iom_file(kiomid)%nvars       = 4
564         iom_file(kiomid)%luld(1:4)   = (/ .FALSE., .FALSE., .FALSE., .TRUE. /)
565         iom_file(kiomid)%cn_var(1:4) = cltmp(1:4)
566         iom_file(kiomid)%ndims(1:4)  = (/ 2, 2, 1, 1 /)
567         IF( NF90_INQ_DIMID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN   ! add a 5th variable corresponding to the 5th dimension
568            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(5)), NF90_FLOAT , (/ 5 /), iom_file(kiomid)%nvid(5) ), clinfo)
569            iom_file(kiomid)%nvars     = 5
570            iom_file(kiomid)%luld(5)   = .FALSE.
571            iom_file(kiomid)%cn_var(5) = cltmp(5)
572            iom_file(kiomid)%ndims(5)  = 1
573         ENDIF
574         ! trick: defined to 0 to say that dimension variables are defined but not yet written
575         iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1)  = 0   
576         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' define dimension variables done'
577      ENDIF
578      ! define the data if it is not already done
579      ! ===============
580      IF( kvid <= 0 ) THEN
581         !
582         ! NetCDF4 chunking and compression fixed settings
583         ichunkalg = 0
584         ishuffle = 1
585         ideflate = 1
586         ideflate_level = 1
587         !
588         idvar = iom_file(kiomid)%nvars + 1
589         ! are we in define mode?
590         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
591            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
592         ENDIF
593         ! variable definition
594         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   idims = 0
595         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
596            IF(( SIZE(pv_r1d,1) == jpk ).OR.( SIZE(pv_r1d,1) == jpka )) THEN   ;   idim3 = 3
597            ELSE                                                               ;   idim3 = 5
598            ENDIF
599                                              idims = 2   ;   idimid(1:idims) = (/idim3,4/)
600         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN   ;   idims = 3   ;   idimid(1:idims) = (/1,2  ,4/)
601         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
602            IF(( SIZE(pv_r3d,3) == jpk ).OR.( SIZE(pv_r3d,3) == jpka )) THEN   ;   idim3 = 3
603            ELSE                                                               ;   idim3 = 5
604            ENDIF
605                                              idims = 4   ;   idimid(1:idims) = (/1,2,idim3,4/)
606         ENDIF
607         IF( PRESENT(ktype) ) THEN   ! variable external type
608            SELECT CASE (ktype)
609            CASE (jp_r8)   ;   itype = NF90_DOUBLE
610            CASE (jp_r4)   ;   itype = NF90_FLOAT
611            CASE (jp_i4)   ;   itype = NF90_INT
612            CASE (jp_i2)   ;   itype = NF90_SHORT
613            CASE (jp_i1)   ;   itype = NF90_BYTE
614            CASE DEFAULT   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' unknown variable type' )
615            END SELECT
616         ELSE
617            itype = NF90_DOUBLE
618         ENDIF
619         IF( PRESENT(pv_r0d) ) THEN
620            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype,                    &
621               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
622         ELSE
623            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype, idimid(1:idims),   &
624               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
625         ENDIF
626         lchunk = .false.
627         IF( snc4set%luse .AND. idims == 4 )   lchunk = .true.
628         ! update informations structure related the new variable we want to add...
629         iom_file(kiomid)%nvars         = idvar
630         iom_file(kiomid)%cn_var(idvar) = TRIM(cdvar)
631         iom_file(kiomid)%scf(idvar)    = 1.
632         iom_file(kiomid)%ofs(idvar)    = 0.
633         iom_file(kiomid)%ndims(idvar)  = idims
634         IF( .NOT. PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .TRUE.
635         ELSE                               ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .FALSE.
636         ENDIF
637         DO jd = 1, idims
638            CALL iom_nf90_check(NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, idimid(jd), len = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar) ), clinfo)
639            IF ( lchunk ) ichunksz(jd) = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar)
640         END DO
641         IF ( lchunk ) THEN
642            ! Calculate chunk sizes by partitioning each dimension as requested in namnc4 namelist
643            ! Disallow very small chunk sizes and prevent chunk sizes larger than each individual dimension
644            ichunksz(1) = MIN( ichunksz(1),MAX( (ichunksz(1)-1)/snc4set%ni + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%ni=4
645            ichunksz(2) = MIN( ichunksz(2),MAX( (ichunksz(2)-1)/snc4set%nj + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%nj=2
646            ichunksz(3) = MIN( ichunksz(3),MAX( (ichunksz(3)-1)/snc4set%nk + 1 , 1 ) ) ! Suggested default nc4set%nk=6
647            ichunksz(4) = 1                                                            ! Do not allow chunks to span the
648            !                                                                          ! unlimited dimension
649            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_CHUNKING(if90id, idvar, ichunkalg, ichunksz), clinfo)
650            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_DEFLATE(if90id, idvar, ishuffle, ideflate, ideflate_level), clinfo)
651            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' chunked ok. Chunks sizes: ', ichunksz
652         ENDIF
653         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' defined ok'
654      ELSE
655         idvar = kvid
656      ENDIF
657      !
658      ! time step kwrite : write the variable
659      IF( kt == kwrite ) THEN
660         ! are we in write mode?
661         IF( iom_file(kiomid)%irec == -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
662            CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = 0
663         ENDIF
664         ! on what kind of domain must the data be written?
665         IF( PRESENT(pv_r2d) .OR. PRESENT(pv_r3d) ) THEN
666            idimsz(1:2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2,idvar)
667            IF(     idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN
668               ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei   ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
669            ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN
670               ix1 = 1      ;   ix2 = nlci   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
671            ELSEIF( idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN
672               ix1 = 1      ;   ix2 = jpi    ;   iy1 = 1      ;   iy2 = jpj
673            ELSE
674               CALL ctl_stop( 'iom_nf90_rp0123d: should have been an impossible case...' )
675            ENDIF
676
677            ! write dimension variables if it is not already done
678            ! =============
679            ! trick: is defined to 0 => dimension variable are defined but not yet written
680            IF( iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1) == 0 ) THEN
681               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lon'     , idmy )         , clinfo )
682               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, glamt(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
683               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lat'     , idmy )         , clinfo )
684               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gphit(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
685               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lev'     , idmy ), clinfo )
686               IF (iom_file(kiomid)%nlev == jpka) THEN   ;   CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy,  ght_abl), clinfo )
687               ELSE                                      ;   CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gdept_1d), clinfo )
688               ENDIF
689               IF( NF90_INQ_VARID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN
690                  CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, (/ (idlv, idlv = 1,iom_file(kiomid)%nlev) /)), clinfo )
691               ENDIF
692               ! +++ WRONG VALUE: to be improved but not really useful...
693               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'time_counter', idmy ), clinfo )
694               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idmy, kt                      ), clinfo )   
695               ! update the values of the variables dimensions size
696               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 1, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,1) ), clinfo )
697               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 2, len = iom_file(kiomid)%dimsz(2,1) ), clinfo )
698               iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 1)
699               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 3, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,3) ), clinfo )
700               iom_file(kiomid)%dimsz(1  , 4) = 1   ! unlimited dimension
701               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' write dimension variables done'
702            ENDIF
703         ENDIF
704
705         ! write the data
706         ! =============
707         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN
708            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r0d                    ), clinfo )
709         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
710            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r1d(:)                 ), clinfo )
711         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
712            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r2d(ix1:ix2,iy1:iy2)   ), clinfo )
713         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
714            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r3d(ix1:ix2,iy1:iy2,:) ), clinfo )
715         ENDIF
716         ! add 1 to the size of the temporal dimension (not really useful...)
717         IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar)    &
718               &                            = iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar) + 1
719         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' written ok'
720      ENDIF
721      !     
722   END SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d
723
724
725   SUBROUTINE iom_nf90_check( kstatus, cdinfo )
726      !!--------------------------------------------------------------------
727      !!                   ***  SUBROUTINE iom_nf90_check  ***
728      !!
729      !! ** Purpose :   check nf90 errors
730      !!--------------------------------------------------------------------
731      INTEGER,          INTENT(in) :: kstatus
732      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdinfo
733      !---------------------------------------------------------------------
734      IF(kstatus /= nf90_noerr)   CALL ctl_stop( 'iom_nf90_check : '//TRIM(nf90_strerror(kstatus)), TRIM(cdinfo) )
735   END SUBROUTINE iom_nf90_check
736
737   !!======================================================================
738END MODULE iom_nf90
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.