source: NEMO/branches/2020/dev_r12563_ASINTER-06_ABL_improvement/src/OCE/step.F90 @ 13159

Last change on this file since 13159 was 13159, checked in by gsamson, 3 months ago

merge trunk@r13136 into ASINTER-06 branch; pass all SETTE tests; results identical to trunk@r13136; ticket #2419

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 22.5 KB
RevLine 
[3]1MODULE step
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE step  ***
[6140]4   !! Time-stepping   : manager of the ocean, tracer and ice time stepping
[3]5   !!======================================================================
[1438]6   !! History :  OPA  !  1991-03  (G. Madec)  Original code
[1492]7   !!             -   !  1991-11  (G. Madec)
8   !!             -   !  1992-06  (M. Imbard)  add a first output record
9   !!             -   !  1996-04  (G. Madec)  introduction of dynspg
10   !!             -   !  1996-04  (M.A. Foujols)  introduction of passive tracer
[1438]11   !!            8.0  !  1997-06  (G. Madec)  new architecture of call
12   !!            8.2  !  1997-06  (G. Madec, M. Imbard, G. Roullet)  free surface
13   !!             -   !  1999-02  (G. Madec, N. Grima)  hpg implicit
14   !!             -   !  2000-07  (J-M Molines, M. Imbard)  Open Bondary Conditions
15   !!   NEMO     1.0  !  2002-06  (G. Madec)  free form, suppress macro-tasking
16   !!             -   !  2004-08  (C. Talandier) New trends organization
[1492]17   !!             -   !  2005-01  (C. Ethe) Add the KPP closure scheme
18   !!             -   !  2005-11  (G. Madec)  Reorganisation of tra and dyn calls
19   !!             -   !  2006-01  (L. Debreu, C. Mazauric)  Agrif implementation
20   !!             -   !  2006-07  (S. Masson)  restart using iom
[1438]21   !!            3.2  !  2009-02  (G. Madec, R. Benshila)  reintroduicing z*-coordinate
[1533]22   !!             -   !  2009-06  (S. Masson, G. Madec)  TKE restart compatible with key_cpl
[2528]23   !!            3.3  !  2010-05  (K. Mogensen, A. Weaver, M. Martin, D. Lea) Assimilation interface
24   !!             -   !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase + merge TRC-TRA
[3294]25   !!            3.4  !  2011-04  (G. Madec, C. Ethe) Merge of dtatem and dtasal
[5836]26   !!            3.6  !  2012-07  (J. Simeon, G. Madec. C. Ethe)  Online coarsening of outputs
27   !!            3.6  !  2014-04  (F. Roquet, G. Madec) New equations of state
[7646]28   !!            3.6  !  2014-10  (E. Clementi, P. Oddo) Add Qiao vertical mixing in case of waves
[5836]29   !!            3.7  !  2014-10  (G. Madec)  LDF simplication
30   !!             -   !  2014-12  (G. Madec) remove KPP scheme
[9019]31   !!             -   !  2015-11  (J. Chanut) free surface simplification (remove filtered free surface)
32   !!            4.0  !  2017-05  (G. Madec)  introduction of the vertical physics manager (zdfphy)
[12377]33   !!            4.1  !  2019-08  (A. Coward, D. Storkey) rewrite in preparation for new timestepping scheme
[3]34   !!----------------------------------------------------------------------
[888]35
36   !!----------------------------------------------------------------------
[2528]37   !!   stp             : OPA system time-stepping
[3]38   !!----------------------------------------------------------------------
[3764]39   USE step_oce         ! time stepping definition modules
[6140]40   !
41   USE iom              ! xIOs server
[389]42
[3]43   IMPLICIT NONE
44   PRIVATE
45
[5836]46   PUBLIC   stp   ! called by nemogcm.F90
[3]47
48   !!----------------------------------------------------------------------
[12377]49   !! time level indices
50   !!----------------------------------------------------------------------
51   INTEGER, PUBLIC :: Nbb, Nnn, Naa, Nrhs          !! used by nemo_init
52
53   !!----------------------------------------------------------------------
[9598]54   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
[888]55   !! $Id$
[10068]56   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
[3]57   !!----------------------------------------------------------------------
58CONTAINS
59
[508]60#if defined key_agrif
[5656]61   RECURSIVE SUBROUTINE stp( )
[1438]62      INTEGER             ::   kstp   ! ocean time-step index
[508]63#else
[467]64   SUBROUTINE stp( kstp )
[1438]65      INTEGER, INTENT(in) ::   kstp   ! ocean time-step index
[467]66#endif
67      !!----------------------------------------------------------------------
[3]68      !!                     ***  ROUTINE stp  ***
[3764]69      !!
[9019]70      !! ** Purpose : - Time stepping of OPA  (momentum and active tracer eqs.)
[9570]71      !!              - Time stepping of SI3 (dynamic and thermodynamic eqs.)
[9019]72      !!              - Time stepping of TRC  (passive tracer eqs.)
[3764]73      !!
74      !! ** Method  : -1- Update forcings and data
75      !!              -2- Update ocean physics
76      !!              -3- Compute the t and s trends
77      !!              -4- Update t and s
[3]78      !!              -5- Compute the momentum trends
79      !!              -6- Update the horizontal velocity
[5836]80      !!              -7- Compute the diagnostics variables (rd,N2, hdiv,w)
[3]81      !!              -8- Outputs and diagnostics
82      !!----------------------------------------------------------------------
[9019]83      INTEGER ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indice
84!!gm kcall can be removed, I guess
85      INTEGER ::   kcall        ! optional integer argument (dom_vvl_sf_nxt)
[3]86      !! ---------------------------------------------------------------------
[392]87#if defined key_agrif
[13159]88      IF( nstop > 0 ) RETURN   ! avoid to go further if an error was detected during previous time step (child grid)
[389]89      kstp = nit000 + Agrif_Nb_Step()
[12377]90      Kbb_a = Nbb; Kmm_a = Nnn; Krhs_a = Nrhs   ! agrif_oce module copies of time level indices
[5836]91      IF( lk_agrif_debug ) THEN
92         IF( Agrif_Root() .and. lwp)   WRITE(*,*) '---'
93         IF(lwp)   WRITE(*,*) 'Grid Number', Agrif_Fixed(),' time step ', kstp, 'int tstep', Agrif_NbStepint()
[5656]94      ENDIF
[5836]95      IF( kstp == nit000 + 1 )   lk_agrif_fstep = .FALSE.
[1793]96# if defined key_iomput
[5407]97      IF( Agrif_Nbstepint() == 0 )   CALL iom_swap( cxios_context )
[3764]98# endif
99#endif
[9124]100      !
101      IF( ln_timing )   CALL timing_start('stp')
102      !
[5836]103      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[12489]104      ! model timestep
105      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
106      !
107      IF( l_1st_euler ) THEN 
108         ! start or restart with Euler 1st time-step
109         rDt =  rn_Dt   
110         r1_Dt = 1._wp / rDt
111      ENDIF
112      !
113      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[5836]114      ! update I/O and calendar
115      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
116      IF( kstp == nit000 ) THEN                       ! initialize IOM context (must be done after nemo_init for AGRIF+XIOS+OASIS)
[13159]117                             CALL iom_init( cxios_context, ld_closedef=.FALSE. )   ! for model grid (including possible AGRIF zoom)
[12377]118         IF( lk_diamlr   )   CALL dia_mlr_iom_init    ! with additional setup for multiple-linear-regression analysis
119                             CALL iom_init_closedef
[5836]120         IF( ln_crs      )   CALL iom_init( TRIM(cxios_context)//"_crs" )  ! for coarse grid
[4152]121      ENDIF
[1725]122      IF( kstp /= nit000 )   CALL day( kstp )         ! Calendar (day was already called at nit000 in day_init)
[5836]123                             CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1,      cxios_context          )   ! tell IOM we are at time step kstp
124      IF( ln_crs         )   CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1, TRIM(cxios_context)//"_crs" )   ! tell IOM we are at time step kstp
[3]125
126      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[12377]127      ! Update external forcing (tides, open boundaries, ice shelf interaction and surface boundary condition (including sea-ice)
[3]128      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[12377]129      IF( ln_tide    )   CALL tide_update( kstp )                     ! update tide potential
130      IF( ln_apr_dyn )   CALL sbc_apr ( kstp )                        ! atmospheric pressure (NB: call before bdy_dta which needs ssh_ib)
131      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dta ( kstp, Nnn )                   ! update dynamic & tracer data at open boundaries
132      IF( ln_isf     )   CALL isf_stp ( kstp, Nnn )
133                         CALL sbc     ( kstp, Nbb, Nnn )              ! Sea Boundary Condition (including sea-ice)
[5836]134
[3]135      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[5329]136      ! Update stochastic parameters and random T/S fluctuations
137      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[6464]138      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_par( kstp )          ! Stochastic parameters
[12377]139      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_pts( ts(:,:,:,:,Nnn)  )          ! Random T/S fluctuations
[5329]140
141      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[9490]142      ! Ocean physics update
[3]143      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[4990]144      !  THERMODYNAMICS
[12377]145                         CALL eos_rab( ts(:,:,:,:,Nbb), rab_b, Nnn )       ! before local thermal/haline expension ratio at T-points
146                         CALL eos_rab( ts(:,:,:,:,Nnn), rab_n, Nnn )       ! now    local thermal/haline expension ratio at T-points
147                         CALL bn2    ( ts(:,:,:,:,Nbb), rab_b, rn2b, Nnn ) ! before Brunt-Vaisala frequency
148                         CALL bn2    ( ts(:,:,:,:,Nnn), rab_n, rn2, Nnn  ) ! now    Brunt-Vaisala frequency
[5836]149
[3764]150      !  VERTICAL PHYSICS
[12377]151                         CALL zdf_phy( kstp, Nbb, Nnn, Nrhs )   ! vertical physics update (top/bot drag, avt, avs, avm + MLD)
[5836]152
[3764]153      !  LATERAL  PHYSICS
[1492]154      !
[5836]155      IF( l_ldfslp ) THEN                             ! slope of lateral mixing
[12377]156                         CALL eos( ts(:,:,:,:,Nbb), rhd, gdept_0(:,:,:) )               ! before in situ density
[5836]157
[12377]158         IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                                    &
159            &            CALL zps_hde    ( kstp, Nnn, jpts, ts(:,:,:,:,Nbb), gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient
160            &                                          rhd, gru , grv    )       ! of t, s, rd at the last ocean level
[5836]161
[12377]162         IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                                                &
163            &            CALL zps_hde_isf( kstp, Nnn, jpts, ts(:,:,:,:,Nbb), gtsu, gtsv, gtui, gtvi,  &  ! Partial steps for top cell (ISF)
164            &                                          rhd, gru , grv , grui, grvi   )       ! of t, s, rd at the first ocean level
[5836]165         IF( ln_traldf_triad ) THEN
[12377]166                         CALL ldf_slp_triad( kstp, Nbb, Nnn )             ! before slope for triad operator
[5836]167         ELSE     
[12377]168                         CALL ldf_slp     ( kstp, rhd, rn2b, Nbb, Nnn )   ! before slope for standard operator
[2528]169         ENDIF
[1481]170      ENDIF
[12377]171      !                                                                        ! eddy diffusivity coeff.
172      IF( l_ldftra_time .OR. l_ldfeiv_time )   CALL ldf_tra( kstp, Nbb, Nnn )  !       and/or eiv coeff.
173      IF( l_ldfdyn_time                    )   CALL ldf_dyn( kstp, Nbb )       ! eddy viscosity coeff.
174
[4369]175      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[5930]176      !  Ocean dynamics : hdiv, ssh, e3, u, v, w
[4369]177      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[5930]178
[12377]179                            CALL ssh_nxt       ( kstp, Nbb, Nnn, ssh, Naa )    ! after ssh (includes call to div_hor)
180      IF( .NOT.ln_linssh )  CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp, Nbb, Nnn,      Naa )    ! after vertical scale factors
181                            CALL wzv           ( kstp, Nbb, Nnn, ww,  Naa )    ! now cross-level velocity
182      IF( ln_zad_Aimp )     CALL wAimp         ( kstp,      Nnn           )  ! Adaptive-implicit vertical advection partitioning
183                            CALL eos    ( ts(:,:,:,:,Nnn), rhd, rhop, gdept(:,:,:,Nnn) )  ! now in situ density for hpg computation
[6140]184                           
[7753]185                           
[12377]186                         uu(:,:,:,Nrhs) = 0._wp            ! set dynamics trends to zero
187                         vv(:,:,:,Nrhs) = 0._wp
[4369]188
[5930]189      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. ln_dyninc )   &
[12377]190               &         CALL dyn_asm_inc   ( kstp, Nbb, Nnn, uu, vv, Nrhs )  ! apply dynamics assimilation increment
191      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dyn3d_dmp ( kstp, Nbb,      uu, vv, Nrhs )  ! bdy damping trends
[4369]192#if defined key_agrif
[5930]193      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
194               &         CALL Agrif_Sponge_dyn        ! momentum sponge
[4369]195#endif
[12377]196                         CALL dyn_adv( kstp, Nbb, Nnn      , uu, vv, Nrhs )  ! advection (VF or FF)   ==> RHS
197                         CALL dyn_vor( kstp,      Nnn      , uu, vv, Nrhs )  ! vorticity              ==> RHS
198                         CALL dyn_ldf( kstp, Nbb, Nnn      , uu, vv, Nrhs )  ! lateral mixing
199      IF( ln_zdfosm  )   CALL dyn_osm( kstp,      Nnn      , uu, vv, Nrhs )  ! OSMOSIS non-local velocity fluxes ==> RHS
200                         CALL dyn_hpg( kstp,      Nnn      , uu, vv, Nrhs )  ! horizontal gradient of Hydrostatic pressure
201                         CALL dyn_spg( kstp, Nbb, Nnn, Nrhs, uu, vv, ssh, uu_b, vv_b, Naa )  ! surface pressure gradient
[4369]202
[12377]203                                                      ! With split-explicit free surface, since now transports have been updated and ssh(:,:,Nrhs) as well
[5930]204      IF( ln_dynspg_ts ) THEN                         ! vertical scale factors and vertical velocity need to be updated
[12377]205                            CALL div_hor       ( kstp, Nbb, Nnn )                ! Horizontal divergence  (2nd call in time-split case)
206         IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp, Nbb, Nnn, Naa, kcall=2 )  ! after vertical scale factors (update depth average component)
[11287]207      ENDIF
[12377]208                            CALL dyn_zdf    ( kstp, Nbb, Nnn, Nrhs, uu, vv, Naa  )  ! vertical diffusion
209      IF( ln_dynspg_ts ) THEN                                                       ! vertical scale factors and vertical velocity need to be updated
210                            CALL wzv        ( kstp, Nbb, Nnn, ww, Naa )             ! now cross-level velocity
211         IF( ln_zad_Aimp )  CALL wAimp      ( kstp,      Nnn )                      ! Adaptive-implicit vertical advection partitioning
[4369]212      ENDIF
[12276]213     
[5930]214
[1482]215      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[6140]216      ! cool skin
217      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
[12377]218      IF ( ln_diurnal )  CALL diurnal_layers( kstp )
[6140]219     
220      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[9490]221      ! diagnostics and outputs
[1482]222      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[12377]223      IF( ln_floats  )   CALL flo_stp   ( kstp, Nbb, Nnn )      ! drifting Floats
224      IF( ln_diacfl  )   CALL dia_cfl   ( kstp,      Nnn )      ! Courant number diagnostics
225                         CALL dia_hth   ( kstp,      Nnn )      ! Thermocline depth (20 degres isotherm depth)
226      IF( ln_diadct  )   CALL dia_dct   ( kstp,      Nnn )      ! Transports
227                         CALL dia_ar5   ( kstp,      Nnn )      ! ar5 diag
228                         CALL dia_ptr   ( kstp,      Nnn )      ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics
229                         CALL dia_wri   ( kstp,      Nnn )      ! ocean model: outputs
230      IF( ln_crs     )   CALL crs_fld   ( kstp,      Nnn )      ! ocean model: online field coarsening & output
231      IF( lk_diadetide ) CALL dia_detide( kstp )                ! Weights computation for daily detiding of model diagnostics
232      IF( lk_diamlr  )   CALL dia_mlr                           ! Update time used in multiple-linear-regression analysis
[6140]233     
[923]234#if defined key_top
[3]235      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
236      ! Passive Tracer Model
237      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[12377]238                         CALL trc_stp       ( kstp, Nbb, Nnn, Nrhs, Naa )  ! time-stepping
[3]239#endif
240
241      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[5930]242      ! Active tracers                             
[3]243      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[12377]244                         ts(:,:,:,:,Nrhs) = 0._wp         ! set tracer trends to zero
[3]245
[5656]246      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. &
[12377]247         & ln_trainc )   CALL tra_asm_inc( kstp, Nbb, Nnn, ts, Nrhs )  ! apply tracer assimilation increment
248                         CALL tra_sbc    ( kstp,      Nnn, ts, Nrhs )  ! surface boundary condition
249      IF( ln_traqsr  )   CALL tra_qsr    ( kstp,      Nnn, ts, Nrhs )  ! penetrative solar radiation qsr
250      IF( ln_isf     )   CALL tra_isf    ( kstp,      Nnn, ts, Nrhs )  ! ice shelf heat flux
251      IF( ln_trabbc  )   CALL tra_bbc    ( kstp,      Nnn, ts, Nrhs )  ! bottom heat flux
252      IF( ln_trabbl  )   CALL tra_bbl    ( kstp, Nbb, Nnn, ts, Nrhs )  ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme
253      IF( ln_tradmp  )   CALL tra_dmp    ( kstp, Nbb, Nnn, ts, Nrhs )  ! internal damping trends
254      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_tra_dmp( kstp, Nbb,      ts, Nrhs )  ! bdy damping trends
[392]255#if defined key_agrif
[5930]256      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
257               &         CALL Agrif_Sponge_tra        ! tracers sponge
[389]258#endif
[12377]259                         CALL tra_adv    ( kstp, Nbb, Nnn, ts, Nrhs )  ! hor. + vert. advection ==> RHS
260      IF( ln_zdfosm  )   CALL tra_osm    ( kstp,      Nnn, ts, Nrhs )  ! OSMOSIS non-local tracer fluxes ==> RHS
[9019]261      IF( lrst_oce .AND. ln_zdfosm ) &
[12377]262           &             CALL osm_rst    ( kstp,      Nnn, 'WRITE'  )  ! write OSMOSIS outputs + ww (so must do here) to restarts
263                         CALL tra_ldf    ( kstp, Nbb, Nnn, ts, Nrhs )  ! lateral mixing
[1239]264
[12377]265                         CALL tra_zdf    ( kstp, Nbb, Nnn, Nrhs, ts, Naa  )  ! vertical mixing and after tracer fields
266      IF( ln_zdfnpc  )   CALL tra_npc    ( kstp,      Nnn, Nrhs, ts, Naa  )  ! update after fields by non-penetrative convection
[1481]267
[3]268      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[12377]269      ! Set boundary conditions, time filter and swap time levels
[3]270      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[5930]271!!jc1: For agrif, it would be much better to finalize tracers/momentum here (e.g. bdy conditions) and move the swap
272!!    (and time filtering) after Agrif update. Then restart would be done after and would contain updated fields.
273!!    If so:
274!!    (i) no need to call agrif update at initialization time
275!!    (ii) no need to update "before" fields
276!!
277!!    Apart from creating new tra_swp/dyn_swp routines, this however:
278!!    (i) makes boundary conditions at initialization time computed from updated fields which is not the case between
279!!    two restarts => restartability issue. One can circumvent this, maybe, by assuming "interface separation",
280!!    e.g. a shift of the feedback interface inside child domain.
281!!    (ii) requires that all restart outputs of updated variables by agrif (e.g. passive tracers/tke/barotropic arrays) are done at the same
282!!    place.
283!!
[12377]284!!jc2: dynnxt must be the latest call. e3t(:,:,:,Nbb) are indeed updated in that routine
285                         CALL tra_atf       ( kstp, Nbb, Nnn, Naa, ts )                      ! time filtering of "now" tracer arrays
286                         CALL dyn_atf       ( kstp, Nbb, Nnn, Naa, uu, vv, e3t, e3u, e3v  )  ! time filtering of "now" velocities and scale factors
287                         CALL ssh_atf       ( kstp, Nbb, Nnn, Naa, ssh )                     ! time filtering of "now" sea surface height
[5656]288      !
[12377]289      ! Swap time levels
290      Nrhs = Nbb
291      Nbb = Nnn
292      Nnn = Naa
293      Naa = Nrhs
294      !
295      IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_update( kstp, Nbb, Nnn, Naa )  ! recompute vertical scale factors
296      !
297      IF( ln_diahsb  )   CALL dia_hsb       ( kstp, Nbb, Nnn )  ! - ML - global conservation diagnostics
[5836]298
299!!gm : This does not only concern the dynamics ==>>> add a new title
300!!gm2: why ouput restart before AGRIF update?
[5930]301!!
302!!jc: That would be better, but see comment above
303!!
[12377]304      IF( lrst_oce   )   CALL rst_write    ( kstp, Nbb, Nnn )   ! write output ocean restart file
[9210]305      IF( ln_sto_eos )   CALL sto_rst_write( kstp )   ! write restart file for stochastic parameters
[593]306
[5656]307#if defined key_agrif
308      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[13159]309      ! AGRIF recursive integration
[5656]310      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
[12377]311                         Kbb_a = Nbb; Kmm_a = Nnn; Krhs_a = Nrhs      ! agrif_oce module copies of time level indices
312                         CALL Agrif_Integrate_ChildGrids( stp )       ! allows to finish all the Child Grids before updating
[5656]313
[9485]314#endif
[3]315      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[5656]316      ! Control
[3]317      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[13159]318                         CALL stp_ctl      ( kstp, Nnn )
319
320#if defined key_agrif
321      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
322      ! AGRIF update
323      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
324      IF( Agrif_NbStepint() == 0 .AND. nstop == 0 ) THEN
325                         CALL Agrif_update_all( )                  ! Update all components
326      ENDIF
327
328#endif
329      IF( ln_diaobs .AND. nstop == 0 )  CALL dia_obs( kstp, Nnn )  ! obs-minus-model (assimilation) diags (after dynamics update)
330
331      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
332      ! File manipulation at the end of the first time step
333      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<                         
[9210]334      IF( kstp == nit000 ) THEN                          ! 1st time step only
335                                        CALL iom_close( numror )   ! close input  ocean restart file
336         IF(lwm)                        CALL FLUSH    ( numond )   ! flush output namelist oce
337         IF(lwm .AND. numoni /= -1 )    CALL FLUSH    ( numoni )   ! flush output namelist ice (if exist)
[1482]338      ENDIF
[3]339
[508]340      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
[75]341      ! Coupled mode
342      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
[13159]343      IF( lk_oasis .AND. nstop == 0 )   CALL sbc_cpl_snd( kstp, Nbb, Nnn )     ! coupled mode : field exchanges
[508]344      !
[4153]345#if defined key_iomput
[13159]346      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
347      ! Finalize contextes if end of simulation or error detected
348      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<                         
349      IF( kstp == nitend .OR. nstop > 0 ) THEN
[5407]350                      CALL iom_context_finalize(      cxios_context          ) ! needed for XIOS+AGRIF
[13159]351         IF( lrxios ) CALL iom_context_finalize(      crxios_context         )
[5407]352         IF( ln_crs ) CALL iom_context_finalize( trim(cxios_context)//"_crs" ) !
[4152]353      ENDIF
[4153]354#endif
[3769]355      !
[12489]356      IF( l_1st_euler ) THEN         ! recover Leap-frog timestep
357         rDt = 2._wp * rn_Dt   
358         r1_Dt = 1._wp / rDt
359         l_1st_euler = .FALSE.     
360      ENDIF
361      !
[9210]362      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('stp')
[1481]363      !
[3]364   END SUBROUTINE stp
[12377]365   !
[9019]366   !!======================================================================
[3]367END MODULE step
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.